Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA000631

[Submit comment/correction]

Sequence	AA000631
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA000631
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCAGAACCACAAATAAGTAAGGAAAACTAAATTCAAGGGGCGAAAGTGC AAAATCACAGCCCCTGGATAGATATCAATTCGCCACTCTCCTCTCGTTTC GTCCATTTGGAAAGCAAGTGGAAGCTCCGGGTTTCAAGTCCCCCCAGCGG AGTAAGAGTAGTACCTCACATGTCACAATTAGTGCCGCTTCTAGCTTAGT TAATCAGCACCCCTCTGTTTGTTTATATCTATCTCCCATTCTCCCTCCTC TCTCATCTCCACCTCCACCTCTGCTGGCTGCCTCCGGGGCCAATCCGATC CCATCGCCGCCACCGAGCTCCTTCCAGATCCACCTCCGCCGCCGCCGCCG AGCTCCAGCGAGGTAAGCCCCACTCCCCGGACCCCACCACCCGCTCCCCA GTCCCGTTCCGTTCCAGCCGACCTCCAAGCCCGCCGCCGCCTCCTGCTCT CTCTGCTGCTGCTACTCGCATTGGGCTGGCCGGCTTCGTAGCTGGGAAGC TGGCTGGGGTTCCCCCCCGGATGGTTCGGCGCGTCTGTTCTCCCTTGCTG CTCGACTTCGAATTCCTAGCTCTGTTAGCGAATTCTGCGTGGGGCTTCCG TTGGTGCGCGCGGGGTGCTCGGGGGATTGAATCGAGCTCGTAATGCGGCG GGGCCGTAGCGGGCTGGGATCGGGCGACGATTCGGTCAGAGTTTGACCTT TTCCGTAGCCGCCGCCGCCGTGGACTTCACCCGCGGCTGCCTATTCCCGA GGAATTCCCCTGATTTGGACGTCTACTGGATCACCTACCGCGGACCAATT CCACGGCCTTGCTCGGGAAGCTACCCCATCCAGTCCAAGAGCTAGCGTAG GCTTTTATTGAATGATTGGTGTCTTTGTTTTAGTCCAAGTAGCTTGCTTC AGGACTTGCCATATCTGGATCACATCTCTTTGCATCGTAATTTGTGCTTC CCAGGAAAAAAAACAGCCGCCGGGGCGCTGCTGCTGTGTTGTAACTCTGT AGTAGGGCCGAATCTTGGTAGATCGCCGTATATAGAATGTCAGCACAGAA CCTAATAACTAGGAGCTTGCTCGATTGTTGCTTTATCATGATCTCTTGGA TCAACGTCTGTGCTTACCTACCTTGTACAATTGCAAATGCAGGGGAAAGT GCCAGTTAAACTGAAGTTTCGCCAGGCCCTGAAAGTGCTGTGCTTACCTT CACAAGAAAAAAACCAGTAGATGATCCCGAGATGGTGAGGAGCTGAAAGT GCCTGGGGAGTGCGACAGCCGGGGTGCAGCAGCAAGGACATGACTGTCAT GCCGCCTGTGCGCCAGCGGCCCGCGGCCAAGAAGAAGCCCATGTGGATAA TCGTGCTCCTGTGCCTCGTCTGCGTCGTGCTGATCGGGGCCTACGCCTAC CCGCCGCACCACTACTCGCAGTGCTACCTCTCTGGTTCGAGCGTCTGTGC TCCTTTCAAGGACTGGCTGCCTTCGATCGGCCGCCGGGAGCGCACGGACG AGGAGATCATTTCAGCCGCGGTTATCAGGGATATCCTTGCGATGCCCATG TCGGCGTCTAAGAATCCGAAGATCGCTCTTATGTTCCTGACACCTGGTTC GTTGCCCTTTGAGAAATTGTGGGAGAAATTTTTGCAGGTTTGCCTCGATT CACCTTCTGTCGTTGTGCAATTTAAGGAGTATAGATCATTTAATGTTCCT TTGGGTTTTCATTATTGCCAATGCATCATCAGTATTTTTCAGTTTTAAAT ATATGGAGACGTTTCTGAGAAACAACACAGTGGTTGATACTTACCATTAA TTAAAAAATTAATGCATATTGTTGAAAATATTAGCTTCCTGTAAGCATTC ATCTTCGAGTGGTGAAACATTGAGAGATTCCTTATCTGCATTAATAAATT TAAACTGATCCTCTTTATACCAAGCTAATAACACTATCCTGCTAGCATGC ACTTGTCACTGTAATTACCTCCCTCCTTGTTACTAACCCTCTCTGCATGT CTACATAATGTAATACTACCTATTGTTTATATAATTCATGTAATTTTAAA AAAAAATCACTTTGACTCTACACAGGGTCATGACGGGCGATACTCCATCT ATGTGCACGCGTCGCGTCAGAAGCCTGTGCATACCAGTTCCCTCTTTGTT GGCCGAGATATTCATAGTGATGCGGTAATAACTCTGCCCTTCAGTACTTT GTAGCCTTGCATGGTTGTTTCGTGTAAACTTTGTACTCTCCCAGAGACTT GTCAAGTGAAATATATTTGTTATATTTTCAAAGCCAAAGCCTATGTGTAG AAGATAATTTTCTCTCTCAATGAGTGCTGAATGTGTTAATGACTTGAGGA ATAGATATTGGTGCCATAGAAATTTCTGTTTCTGTTAAGGTGTGTACTTC GATGTAGGAGCAGTAAGCAATGACTAAGCAGTTGTTATAGACCCCATGAC ATAGCAGTGAACTCATTGATTTATTGAGAACATATTACTTGATCAAGATC GCTTGCATTTAAGGAGTATTAGTATCATTATTACTACCAATTTCCATGCT GTACTATGTTGGAGATAGATTATAACATACAGTTCTTTCTAAAAGTAGCG TGTTGCATTACTTGTATCCTCAAGGCCAGTACTAGTATCATGAGGTACAA CTCTTCTGACAGAAGACCACTATTAGCAGTTCGGATTGAGATGCCTAACT TTTGCAAATCGAAGGACTGCTTACATTGCATATATTCTTTAGGTTTCTCT TCTAACAGCTATTATATTGATTTGTGTTGCATGCTCGCGGTCGTTAAATC TGAATAACGTATGTAATTGCTATGCAGGTTGTATGGGGAAAGATTTCAAT GATAGATGCAGAGAAGAGGCTATTAGCAAATGCACTGGAAGACGCTGATA ACCAATTTTTTGTCTTGCTTTCTGATAGGTATGAATTTCTGAGTATGGAT TACTTCAATTTTTCTACCAATTCTGTAACCATACTGAAACCAGAATTTCC TTTATGTCACAGCTGTGTTCCGCTGCATTCATTTGACTATGTCTTTAATT ACCTGATGGGAACCAACATCAGCTTTGTTGATTGGTAAGAACACTAAACT TCTATTGCATTACCATTTTTAAAATAAATAAATAATGAGTGAAACAAGTG GTGTTGGCCAATTCCACAAGGGCATTGTTGATTATTTTTTTACATTGTGT TATCACTTGCATATGTCCATGTCTTACTATTTTGAATTTTTTGCTGCCTT TATTATCATTTGTAGCTTCCAGGATCCTGGTCCACATGGAAATGGAAGGT ATTCTCTTGAGATGCTTCCTGAAATAGAGGAGAGAGACTTCAGAAAGGGT GCCCAGGTACAGATTTTTCTGTAGTTTTTATTCTTGTTGTGATAAGTACT AATTTGCTAGCTATATAGTACTTGTGGGTCCAACTTTTGTCATTTCAGTT GTATATTATTTCTTATTAGTTTTTCCATGATATAAAGTTGACATGTTCAG AAGTGTGATTATTGAGTATTAGACTCTTGCCTCACATGCTTTCTTGTGTA ATTGTTGCTCTTGTTATAGTGGTTTGCAATCACGCGGAGACATGCTTTAA TGATTCTGGCCGACAACCTTTACTACAAGAAGTTCAAGCTATATTGCAAG GTGTGTTTCTTTTCTAGAGTTGCAATCTTGGTTAATGGAAAGGAGATATA CTTGATGTTTACTGTATTAATACCTTGTTTTACTGTAAGGTTGACTGTGA ACTCTGTATATATCTTTTTTAACATAAAGTCCAGAGTTGTTATAGTAGAA CTATAGTGTAGAAATTCAGTAATTACCTCTAGTTGGCAAAATGGTCTTCA TACCCCTCCAACTGCCTCACAAATAGGCCATAATGAACTGAAGAATACTT TTGATAAACACTTCCATAAACATCAGAAATTAATTTGTAAACTTTGTTGC AAAATAGTTTTTTTTCTTCCTTACCAAAAAGGTAAAATATTGTAATAAGC TCAATATAAGCATGAGAACTCCATAGTTTCCTTGTATAACTCCTGAGATA TATTTGAGTGACTGCGCTTGCCCTTGTAATCATCATTCCTGAAGTCTGAA CCAATACCTGTGATTTTTTTCTTTTCTAGTTTTCTCTGTTATTTTTCTGT TAAGTTTAGTTTTGGAAAGTAATCTGTCTATATCATTTGATTTGCAGCCA GCAGATGGGCGCAATTGTATTGCTGACGAGCATTATTTGCCAACCCTATT CAATGTTGGTATTTACATTCTATGGAAGTTGTATTTATATCTTGTTTCTT TGAGTTGCTTGCTAACTGCCATGTCCATTTACGAAACATCAGATGGTAGA TCCAGGTGGAATAGCTAATTGGTCAGTTACACATGTTGATTGGTCCGAGG GGAAATGGCATCCAAGATCCTATGGAGCTGCTGATGTCAGCTACGATCTC TTAAAGAATATAACAGTATGTTTTTTTTGCCTTGCTTTACTTCTTTCCTG AGATAATCTTTACATATTTGTTTTTCCCATTTAGCGCATCTATACTAATG TAACATTACCATTGAGCAGGCTGTTGATGAGAACTTCCATGTAACAAGTG ATGACAAGGTATGTCCAACAATTTGTCATCAATATTTGACTGTCAAAGAA AAAAGAAATTAAATTTTCATGCTAGATCTAGCCTGTTTCCTTTTTCGTGG ATTACTGCTACATATTTGGAATGATTTGTTTTGCAGTACTTTCCTGTTTA CCGCAAACCAGTAACTGATTTTTTACATGAAAATACTGAAATTTGCAACT TTAAACATCCACGCCTTTTATTGTGCCATGGTTAACAACTAATATGAGAT ACTGATTTCTACCTCTCGTTCTCTTTACAGAAACTTCTGACACAGAAGCC ATGTTTGTGGAACGGATCAAAGAGTCCCTGCTATCTTTTTGCTAGAAAAT TTTACCCCGAAACTCTTGACAGCTTACTGAAGATATTCACCAGTTACACG TCGGTTTGACCTCACCTGATTCTTTGCCCTCAACGACACATGGACACGCT CTCACTCGTCATGTAAAAATTGTGAAGTCAATCAACACTTCGCCTCGTAA CACGGATCTGGGCCTCGAGAGACAGGTTGTTGCTGCAGCGATTGCGATGA CCTGTAGTCCATTCAGTTCATGGGTAGGGATGCGGCGATATCGATAGCAA TGATACTGCCCTCGTTGTAAACTATTGTGCTTTCTTGTATGTTCCTGTCA GTCCTTCAGCCCCATTTACTCTCTTATCTTAGCCTCATTAGTTCCTGGCT CCTGGAGATCATATTTTTGTCAATATGTTGTTATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.