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GrainGenes Sequence Report: AA039591

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Sequence
AA039591
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039591
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCATTTTCGCCGGCGGAAGAGAAGACAGGAGATGGCGGCGGACGAAGCG
GACGGTGACCACTTTATCGAGATGGTGTCCGCAGGGGCTCTCTACCGCGG
CGGCGCCCGATGGGAGCGCAAGTACTGGAGCTGCTCCAGGGTTTGCACTT
CCTCCCCGTCTCTCTCTCTCTAGGGTTTGCACCCTGTTCCAAATTGGGCA
TCGCCCTCACGGCTTCACCTTTGCCCGTTGATTACCGCGTGGTTGTGATG
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AGCTGTACCTGCCGAATACTGATAATTCTGAACTACCGAATACAGTTAGT
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CAAGGGCAAAGATCGCTACCCATACCCTGTGGGTTACCATGCCGTCCGCC
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TGATGGGCTCAATCCGCAGGTCACATCCACCGAAGGAGATTCCGCAACAG
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TCCAAAGAGTTGTTCCAACAGTAGTCAGCAACCTGTACTAAGTAATTGTA
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GACCATAATTGCATGCCTGCACTGTTTACCATAGCAAGATTACAATGTTT
AGTTTTCTATTGTCTTATGCAGCTTTTTGGGTTTAAAAATGCATCTGTTC
AGAGACTGCTTCGTCAGCTTCTAGTAGATTCAACTGGATTTGGAATAGAC
ATGTCTTCTCCAAACATTTCTGGTGCTGCTTCACAGTCAACTGATAAGGT
TGCAACTGATGTTTCTGATGACTATGAAGAGCAGCATGTTTGTCTGGACA
AGACAGATGGAACTGCTAAGAGATTTATGAACCCAGTCCAGGAGGAGGCT
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GAGATTGATTTTTTTTTTCATTTGCAGAATAGTTAGTGTTTGATTACCGT
TGCCATAATATTTTTTTTGGTTCAACTGCAAAAATAAACTACATCACAGC
TTACCATGGATGAAACTACACTGTATTGTGCAATAGAGATTGCCATTTGT
TGCACAGGGTGCGATCCACATCAGATATTTGGTATACATCCTACAAAGGA
ATTATATTTGGAAGTTACATCACTTGTCCCAGCTGGATGGACAGAGAGAG
AAAACAGACCACTACTGCCATATGATTTGTTTCAATCTTCTGCTGGCTAA
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TTGAGGTAATTCTTTGTAGCTTCACGAATCAGGACTGCACTCTAGAAAAC
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ACATATTTCTTTTGCAATCCTATGGTTATGCACAAATAATATCTTAAATT
GCAATTAAGAAATTAGTCTACCCCAGCAGGATTTTAAGGATCTAATATTG
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TTAAAGGCCAGTGGCTGATAACGATTTTATTTCCAATGTTCAAGGGAGGT
CTTGGAAGTAATGCACAGTTGTGGGATTCTTCTACTTCAATATGTATGCC
TCTGTTGCTGGAAAAAGTACCCTTTGATTCAAAATGCACTCTGGTTAATG
ATAGTTTGGGAGATTATGCCCCAAGTTCATCTCAAGAAGATGGGTTATCT
TCGAGTTCTTATTTAGGCTCTGAAAAGTCTGATCTGGATTTAGCAGAGAA
GGAAGTAGCTAGGTCTATGATGGCATTTTTGCTTCCCCAAGCGATACCCC
TTCTGACAAAAACTTACAAAAGAAGGAAGATTAAGAAAAAGAAAGAAGAA
CATGAAGTTTTAGCGAGAAGTGCTTCAGCTCAAAATCCCTCTGCTGATGG
GGGCCAAGGTAACTATTGTTCGTTCTGTGGAAAATATACGTTCCATTCTG
CAAAAAAAGAAAAGAAATATACACTTTGTAGAAATTGATTCATCATAATC
AAGAAATGTTCCTCTCTTTCTGGAAAAATAATTTTTTCTTTGGCCAAGCA
GCTTACAGAAATGATGCTTTAGAGTTTCACCACCTTTGACCAATAATTTT
GTCCCAATGTGTAAGAATGGTATGGTCCTTCTGAACAGTCTCTTGCCTTC
TACAGGTGCCACTTTGCCTACAAGTATGGGTGAAGGGAATATGAATGGTC
CTCAAACACATGTCAGTGAGAAGCCTCTGTGTGAAACAGTTAAATATAGC
AGCACTAATGGTGAACAAATTGCTAAACCAGATGACATGAAAGCTGTTGT
CGCAGATAGTTTCGAGGATGATGGACAGATTTGGGGTGACAACACATCCA
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CCTAATGAGGACTCAAAGTTGCTACAGCGCAGAAGGGAAAATCATGCTGA
ATTTTCTGAGTGTCAGGTTGAGATTCACAACAGCAAAGATATACCTGATG
TGCTATACGATCATGAGAAGGGTCAGTATATTTTGTCCGATTCGCTCCTT
GCTTGCCTAGAGGAAGAGTTTGGCATGGATGATAGTTCCCATCCCGCCCA
CTGCAATCATGGTAACAGCGATGTTAAACCAACGCAGGCCCAGCAGCAGT
TGAAGGACCCAAAAGAAGGTATCAACAATAGCTCATCAATATCCGCAGAT
GGGTCAGACCACAAGAACATGGGCAATGTACACAATGTTTCTGATCACCA
CACTGATCACGTACTTTCCAACATTAGTCATGTAAATGGCCTACTATCCA
AACACTCAGAAACAACAACAAAAGGATCAGATCATAATTTAAAGCTTATG
GGCTGCTACCTGCACCCGATGCCTGTCTTGTCTATCATGCTAAACACCAA
AAACAATAGTAGCTTACACGTTTATGTACTTTGTGGTTTTTCTGAGAGCT
GTGAGAGATTCCTCTATGTGTACAACATCACTCCTAAGGATCACCATGAA
GAACCACCTTATTTTGCTGGCTACACATCCCTTCTACTTCCCTCATTGGA
GCAGGCTTCTACAGGGAATGTAAGAGTATGCAACCTTTTGTTAGTTAAAG
CGCATTATATTCGTTTGTTTGATACTTGTTTTTTGGTTCAGTCTACATTT
GGACGATCCGGGATACAGTTTACACCTGATGGCCAGTTTCTGGTCCTCCT
TAGCAGTATAAGATTACCTTGTTGCAGGTTGTAATCTTATCCCTTAGAGC
CATGCAGGACATGTTGGATGTACCTCCTTTATTGATTCTAATCACGTAAC
TTATTGACAGGATGCAAAGCATTGATTGTTCATGCTCCATATGCAAATTG
GATCAGTGCGACGACAATTCTCTGAAGATTGTATCTGTTAACTTTGGCTA
CATTTCACTGTTGACCAAATTGATGCCTCATGGGACAGTTTCTTGCTTTT
TGATATGTGAACCAAATTATGTTGTAGCGGCTGAAGACAGCAGAAACTTG
CATATATGGATGATGGTCACTGGATGGAGGTACAATTGCTGTATTATAAG
CATTAAATGTTTCATTCTCTCAAATTTTACTGCCAGCATGGTATGAGACA
TTCCGGTGTTACATACTCACGTTGTCATGTTATTGGTTATATTGTTGGAA
CTTGGAAGCGTAATTATCCCTTAACATTTCAGAGCAACCTATTTTTATTA
CTCCCTCTGTCCAGAAATAAGTAACTTGGATTTGTCTAGATTCTTATGTA
TATATACACTAAAACATGTCTAGATACATGCGAATCTAGACAAATCCAAG
TCACTTATTTCCGGACGCAGGGAGTATATGATTAAAACAATGGAAGTCGA
AGGCATCGCATTTTCACTCTGAGATGGATATTCTTGCACTCATATTAAAA
GAAGGATGCACATTTGTACATTCATAAAACAATACATAACTTATTTGGTG
GACCCACATACAATGTTGTAAATTCATCATGTATAAGGAAAAACAAAGCT
CGGCCTTGGGGAGAAGAAACCCAAAGGCATTCTTCTTTAGGTCAAGGGAA
GGCCCTGAATGCCGGCTCCACCCTTTGTGGTGGCATGGTTGGCAACCAGG
CACGAGCGGGGAACAATCTCAGTGAGGGGCCTTTTTTTTGTGAGAACCAG
GGTTCGAGCCCTGGTCGTCAGCCTCCCAACTGAATGCTATTTCATGTATA
AGAAAACATTAGTATTCAGTAACAACTACACAATTAGAGTAATATGCTTT
GCAATTATCTATTTTTTTAGTTTTTACTGTACAAGCCGTGAAAGATAACT
CTAACCATCAATATGATACACCCCAATGTACCTGGAATTGCTTACTTGAA
GAGACAGCATCTATGTTGTATATTGCATTAATTTATTCATTTTTTCATAT
GCCTCCTCTTGGGAGCCGGGTGCCACTACCAGAAGGATAACAGAACACAC
GCCCCATATATACATCCAGTACAAAAACCAGAAAAAAGGTTATGTGCTGC
TTGACAGCTTACACGACCTAGGTATTTCTGAAAGAGCAATTAAGACATTG
CTTTATTAGCTTTGGCGTATTTGTTTCTGCCCTGTGGATGCCCTAGTCCT
GTAGATGAATACTTGTTTTGTTAGCTGAACTCTTTCATACTTCGGAAGTA
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ATTCTCTGTATTTACAATACTTTCAGTATTGTTGCAATGCAACTAAGTTC
ATGTTGATATTGCCTTTTCTTAGACATTCCTACCAGGGATTCACATGTCG
TCCCTGTGAGACTTATGATGTACTAAATTTGAAGATTTCCTGTACTACTC
ATTTTTTTCGATAAAGGGAATATATTAATATTAAGAAAATATCAATTACA
CCCGACCTCTGCGACAACATAGGGTGCACACAGCCAAAAAGGAAGAAAAA
TAAAAAAATAAACAAAAAACCTGCCAAAACAATCGGCGACTCACAACAGC
AATAACACTGCTGCAAAGCGTCGATACCAGGCTCACAGCCCCCATGCGCA
CAGTTTTAACGTGAACATCGCCACACAAATGTAACTGTATATGCACGCCA
TGCTGTGAAGCATCATCTTCTCCTCATCCATGGATGGACACCATTTAATC
TCAGTATTCCTTGTGTTATTTGCAGCGCAATCTCTGAGGAATATGTCATC
TCTAGTTTGGGTAATGTGGGTCCTTCAATACTGGAGCTCAGAAAAATACC
AAAAAGCAGCTCTCTAATTATTGGTCATGATGGTGCAGGTGGCTTTTGTT
TGTGGTAAGTTAGGATCCATCCCTCTTGACACCATTATCTTTATTTTGTG
AGTAAATTCCACTTTTAACCCCCTAGTTTGATTTTTTTGACACTAATTAC
CCTATTTATCAAGTTTTCATTCTAATTACCCCATTTAGCAAAAGTTGTGC
CAAATTTTACCCCTTTTAAAGTTTTGTGAGTGTTTTGACCGGTGGGTTCT
AGCAGTTAGGTACATGTGGTGACCACTGCAGTTTTTCTTCTTGTGGTTCT
TTTCTGAATCTTGCGGTTTTCTCCTAGCGGTCAAAATTTATATGCACGAG
CTCAGCTAGGACGCTTCCTTTTCACCTTTTTGCGTACGTCGCTTTGCGAG
TGAAGCAGATACAACGCGATTGGCAGCGGTGGGCTGAATATTTTGATCCT
CAGCTAGCTCTTTTGGGATTTGAAACAGATCATGTAGTACTTCATTTTGC
ACATTATTCTACTAGTAAATGCTGGTATATAGGAGGAGCTACATTCAAAC
ACTCTACTTGTTGCAAGCTCTACGTACGTACCCATCTAGGTTCCTCATCT
AAGATTTCTAGCTACAATGGACTATATTTCACAAGTAACAAGCGTAGTTA
GCATGGACATTCTGTACTGGCATACTGTGTGTGCTTTCGAAGCGCTAAAT
CAAATGCAATGACATGAGAGGGACTAAAACTTGAAACCAAAAAGCAGGTA
CATACTGAAATAGATTAGCCACGCGGATGACTCTCTCCAGATCGGAATGC
TCACAAAATTTTAGAAGGGGTAGAATTTGGCACAACTTTTGCTAAATGGG
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AAGTGAGGGCCGAATTCAAGGTTTACAGCGATGTCTCTGAATACAATATT
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AAGAATTCAGTGACCGTAGAACTAGCCACAAGCTGTAGTAGATAAGGACA
GACTTAAACTAGGAGCAGCCGAGCAGGGAGTAGGTTAGAAACTTAGAATT
ATGGAAGACTTTTCCCTGATAAGGTGAATCAAAACCATTATGTGCTTCGA
AATATTTACTCTCTCTATATTCCGGAAAAATGATTCGAAAAATAATATTC
AGTGTTGGGCGGCTCTCCTCTCTGCTGCCAGTTCTCTGCTCTGTTCTCCC
ATGCTGTTGACCCAGAGGTCTCCGTGCACCATGTTCTCTCGGTTGGTCTG
AGGTCCACCTTGGTTCCGAGGCTCACCAGCTCCGGTGAGCGTCAGCTATC
CCTGCTCTCCGCTACGCTTGCCGGCATGTCTCTGTCTGACGCGATTGATC
GTTGGGAGCTTCTGCGCTGTGCCAAACCCAATGGCACCCTCGACCGGCTG
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GCTGGTTCAGGCTTGGATTCAGTCTCAAAGTGAGTTGGTCAAGAAGAATA
TTCTGAAACCGGATGAAGGCACCTGCCCTATCTGCAGTTTCCCCCGCGAA
TCAGCAAATCATCTGGTCTTCAGCTGCCATTTTCCTCTGCAGTTCTGGCG
ATCGATCAGCTGCGTCTTCCCTAGCCAGCCTGACGTCTGTCAGCTTCACT
CTTACCGCTGGACAACCACGATGGCACAGGCGAAGGCTTCCACCTTCCTC
CTGCTCTGCTTATGGAAACACCGCAATGGGGTCGTTTTTCAGGGGCTCAC
GCCGAACCTCCCTATTCTCACCGAAACTGCAAAGATGATGGCCACCTGCG
GCATGCACGTTTACCTCAGAGACATGCTCATGAGGCAGACATCTGGCTGC
AATGCCTACATCAGGGCGTTGGCTGAAAAACTCCTTGTAATCTTGCCCCT
CCCCCCCTTTTCCCCTGTAAACAGTACGACCATTTGGGTCTTCGGGTACG
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AGTTCTATTGCATAAGCATTCTGCTGGGTTCTTTTGTCAGCTCTACTTTC
TCTGTTAAGAAAAGAACTACTAGAAAATGGATGCTCATTATCAATGTAAT
CCTTCTGTGTGATAACATTTCTACCTTTTTGATTTTCTTTAATCATGGTT
GTTTTGCTGATCTACTAATGTTTATGTGTTCCCTCAGTAAACATCTGATT
TTCAGTCAATAATTTTCTTAGGGACATCTCCAAGAGAACACTTTTGTCAA
CTTTTGCAGCTCCAGGGAATATCATGTTCCAGATTCTCCCTGTAGGCCTC
TGCAGTTTACAAGAGGATATCGTTCATGCTTCAGTCAATGACATAGAGAG
AAGGTTACGAGAGATCACAGTGAGTGACAAGTCTGCAAAAGATGACAAGG
AGTCCATTCTGATGTTATCAGGAAAAGATATAGCTGTTTGGATTATGGTG
TCTTCTGCTTCAGTTGCTGAGTATCAACACGACCTTCGAGCAAAAGAACA
CAATGCTCGATGGAGGCTAGCTCTGCTGGCAAATAAGAAAGTTTTTATGG
GAAATATTTTTGATCCAAGGTATCTTCACTTCTCCATGTCCAGTTATAGA
ATGTTAGATTTTGATTGTTGCACTCAACCTTGTCAACTAGTTTGAATAAG
TACCATCTTATGTTTGATGGGTTCCCTTTAATTGCAGTCCCTAGGGTATC
TAGGCATGGTTATTGATCCGTATCTAGGGTTGCTCGTGTGCCCCCTTGGC
GAAAATCACATAAAAAGGCATTAAACAAATAATGGCAAAATTGACATAAT
ACTCATACAATTTCAGCATCCTTGCCCAGGTTGACCTTTTATGACAACTT
CACACAGATGATATTCTGGAGGAAAGTTTCATAGGCTATCTCTCCTCTTT
CAAAGTTTGAAAATTTCTTTTCAAGATTTAATGTTTGGGTCATGTTTAAG
AAGTAATGATACATCTATTGTTTCATGCATTAGTTAGGGGCATTCATATA
AGGGATACGATCTCGCTAGTCAGGATTGTTAGGATTTGATCCCAAGGGAC
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GTATTTCTGGAGTGGTGGAACCTAGTTTCATCTATCTCCTAATAAATATG
CATACGTCGCATCTATTTCACCATAAACAGGGATCCAATGGGTGACATTT
GGGCCATAATTGGACCTAAAAGTCAGACAGGACTGGCTTTAGCTATTCTT
GTTTTTTAATCCCCGCCCCAGATCCAGCATCCCCTATTTACAGAGGAATG
ACTGGCCATATGGTCTACTTGATAGACTCAAATGCCATATCAAGCTTTCA
TCTCCTGCTCCAGAGGACATGACAATTTAACGCAACTCCCCTGATTCTAC
CTGAACACAAGAATTTCTGCACTAGTCTCTATTTTAGTGAACAACACAAT
TAGTTGACTACTAATATTTAGCTAATATGCATGACACCATTGAGCTGAAA
ATGGAACTCGATGCTATTGCATAAAACGGGGACAGCAGATGATCCTTGTA
ACTGACTTATATAGAGCTTCATCCCATGCGGAAACTAGTTGACGGAGTTA
TTGACTTATCTTCAAGCTTAAAGCCCCTCATCAAGAAAGAAAGGGTTGGA
AAGCAAAGAAGATGAATATCTTGACGAGTCATTAATCTTTGATCTCAATG
TGCAACAGCATATGGAGTACAATGTGTTACTTATACCTAGTCCACAAAGA
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TTACCTAGGTGCATACCATCAATTATCCTCAGGTTTCAGTAATTCACATT
TTTGCTTTTCAGGGCTACTTCTGTAGATGCCACTGGTAACTATGGATTTG
CTGGAACATATGAAGGTCTCTTGTATATGTGGGAATTGTCTTCTGGGAGA
AAACTTACCAGCACACAGTGCTTCAACAGTAAGTGAACATATCTTCTTAA
ATATGTGCTAATAGTTTTGCGAAGAAAATTTGTAAGGGAAGCCCTGACAA
CAAAAAATGGAACATAAATTCATGCCAATTTGAACCCAGGTACATGGATT
GTACGTCCACTCCCTCAACCAAGTGAGCTAGGCTCACTTATCTGTGCTAG
TAGTTAACTAGTTTGACATCTCTAAAAGGTTTAGCAGTTGGGATGAAAGC
GCAAAGTATTAATCTGTTTGTACCAGATGATTGAGATAACGAGGGTTGCA
CCTTTTATCTTGAATGAACAATTATTCTGTACTTACAGCTTCAAAGTAAA
TAAATAATTCTGTAATTTAACTTAAATATGCTTTGTTCTGTACTTTTCTG
GTTCCACATTTATAATTATGCTTCTAATAGTACTGTCAAATAGTTCACTG
TTCAAGGACCTTGGTACTTTAACTATGATTATTTCTCAACTGCTGCTATT
TTAGTATGGTGCTGTTTTGCTTTGAAAGATTTAGCTGTTTTATGTTACAA
TGCTGCATGTTCCTCTGTAAATAACATTTTCATCTTTCCAACTTTTACAA
TCAGCAGGTGTTCGAGTTTCCCGTGTTGCTGTTGATGCCAAATCAAGTGT
AGTGGCAGTAGCTGACAATGGTTGTGAGTTGTTACTTTACACTCAAACCA
GGGTGTAATGCAGTTGTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.