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GrainGenes Sequence Report: AA036800

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Sequence
AA036800
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA036800
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCGAGTACAAAGTCCAAGGCAAAATTCCCTTCTCCTCCAGTTCCACGTG
ACACACGAGACCACGAATTGGCTGCGTGGCTCGTGTTACTTTCGCTCCCG
GACAACCGTCACGTACGTGCCGGCTTCTTCACCGTTCAGTCCCAACAGCG
CCTATATTTTACACTTCCCAAAACAAAACTACCCGTACTTATTAACGATC
TAGCAGTCCCCTTCCGTTGTTACCGCGATTCGAGCCGCTGCGAACCCAGC
AAAAAACGGAAGCGACCTCAATTCCCCGAATCCCGATCGAACTAGGGAGA
AAGCTTTTCTTCCCCCGCAATCCAAATCTCGCGAGACAAGCGCGCGCTGC
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GTGTGTAATGGTTCTGAAGGATTTGAATCTATTATACTTTGCAACCTTTT
GTAGTTTGCTATTGATGTATATCTTCCAAATGCCTCCACATCATAATTTG
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GTTCATCATGTGGTTCATTTACAAGTAGCTAATTTGGATACATAGTTACG
CTGTGGGATTGGCTGCATGACTTAGAAATGCCATTCTTTTTTTGATAGAA
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TGCACCTTGTCCAAACCGACCACTTTAGGAATGCCATTCTAGGTTATAGA
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CACAAACTTTGTATGGATGGCTTAAATAGGTTGAAATGTGTTCGCTCCTC
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ACACTTACTGCATTCCCCAGTGGGTAGGCAGCAACCTTTTCATTACTGCT
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GCAGCTGCGGAGTATCTGGTTTCCAGAGGCCTGATTTTCGATCAAGGAGG
ACATGACATGGAAGGCATATGGAATGAAGTTGGAGCCAAGATCCCGCAGC
GGCACTACAAGAGGCTGAAGATGGAGATGAAGGGTAAAGGTAAAAGATGA
GGAGGCCTTGTAGAACTTGGAGGAGGCAGACTGAACTCTTGAAGGAGATG
GAAATTTAGAGGCAGGACCCTACCGGGGAAGGTCTGGTTGCTGCAGCTCT
TGTAGGAAACCATGTAGAGGCCGGCACACGTCCTGAGATAGAGAAAAGCA
GCCATCCTTATAATAGTGTCATAGCTTATTGATTTTGCACCCTTCGGTGA
AGACAAATGGGCCGAGTGGTCCGCCTCACTCTAGCAGGCTGCTGCAGTGC
TGGGTGGGTCCAGGAGCAATAGCAGCTGCACAAGTAAGCACCAATCCACA
TATCAGCAGCTCAATTAGCAATACTAGCAAAAGGCTCTCCCTCTCCCTGC
TAGATCAGAGAGAGCAGCGAGACATGAGAAATACAGTGAGGAGGAATGGA
TAGGCGGAGAAGTAAGGAATTTCCATCTCCATGCCATGCCACCACCTTGT
TCCACATAGATGGCAGGTCAACTAGGTAAATAACTTACAAAAAAATAATC
CTAGGTAGAAACCCTTTTCAGACCCTTTTTTAAAGCTACACATGTTTTTT
CCGAGAAAACGCAAGATTTTTGCGTTTCATTTCACTGAAAAGGTAGAGTT
GTTACACGCCTCCTAAGAGGTACACACATTATTACAAAGAAGATGGGGGC
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ATGTCTGCATGTTTTAGCGTGCCCACCCTTCAATCCCAGGCCTAATCACC
TATACATGTTTGCGGACATAGATGTCCAGTTTGCAAAATTATGGACCTAT
GTTCACCCAACTAGGAAGTGTAAAGCATTTATACTTTGAATTCTGCAAGG
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AGCAGGGTTAGAGTAAGTGAGCAAGAAATCGTGTTACCATTTAGCATCCA
GTGGTAGTGATAACCTATTTTTTTGTCTTGTAATAATGATATAGTTCAAT
ATCTTACATAATTGCTAAAAAATTCCACTTCTGTGATTAGAATATCTTTG
CAAACCCAACAGCATAACAAGTTGCTACTTCACCTTATACGATCCATGAA
AACAATAACAATATAACTTGGGTCCATATGGTTACAGCTTTCAGGTGCAA
TGGAGTTTTTCTTTCCTCGTCATTAGCTTTCACAATCCCGCAACTTCCAC
TTGTAGGATGATTTACGGATGCTGAGGAAAGTCTATGTTCAAGTTTGTGT
ACTAGTTCAATCAACTTACTCACATCAGTCATTCAATTTCAAACACTAAA
ATAATTGGAGTGGAAATGTGAATCTAGGATCTTCAGGAGAGTTACTCTTG
CCCCCCGCGTCGCTCCGTCTGGAGCTACTCAGGAGGTGACTAATCCTAGA
CACCAAACCACAGTCCGTCTTCCTCTCTGTGCTGTGCCGCCGCCAGAGTG
ACAGGCCGGCCAAGCCCGTGTGGCTCATGAGGACGGCGGCTGCGGGGCAG
TCTCCAAGCGCTACGTGTTGTGAAGGTGGCGGGTGCGCGCCGGAGGTCCA
GACCAAGCCAGCCGGAAGCCCTCGGATGTTCGGCGCCCTCCAGGTCGGTG
GCCCGGTGTGGATCCTGGCCGCTTGAGCGGGGAGCTGCGGCTCAGGGGAT
GGTGCAGGGCGTGCTCGTTCCCCTCGGGAGTTGGCTGAGAGGGCTCACCC
ACTCCCATCTGAGCGTTTTGTGGCTCGCAGGTGGTGCTGCATTTGGGGAT
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GGCCCTGGATGGCGAGGCAGAGTCGACCTGTGGCTGGTGACGTCTGCACT
GCTGGCCGATGGTCTTGGTCACGTGGACGGAAAGGAGTCGGTGGGTTCTG
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CAGTCCCCTCCTTCCTCTGGCTTGCTTCTCCCACTGGATGTAGCTGCTGG
TGTTTCGCGGGCTCTGGAGAAGGCTGGGTGTCGGTGTGGTTCATTTGGCA
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TTTGGGCGCCTCTCTCCTCCCTTGAGGTGCCGTCGAGGTCCCTCATCCCC
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GCGGCGGCGCTGTTGGTTTCGCTTTCTCTCTTGGGGACGCTGCTTGGGGG
TGCTGGTTCTGTGATTGAGTTAGTCAAGGAGGGTCGGTGGCTGTTGGTGC
CTGAGTCTTGTAAGTGGTGGCGGTGCTTTGGTGCGGCAGGTCCAATGTGT
ATCTTGTGGGGTGCTTGCCACCGTCATGTGTTGCTGACGGGGTCAGCGCC
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TGGTGGCGATTGCCCATACTCTTCCTCCGCGGTGGCTGTTCTTGGTCCAT
GTGTTCTGCTACAGGCTCCCGGTCTCTTCACATCTTCATCAATGATTGGT
CCTAAGCTTCCTGGAGGGCACAGTCGGTGGCAATCGGAGCTCATTTTCTT
ATTATTATGTGGTTGCTGTATGAGTTTCGTTGTAAGATGATTTGACCAGC
ACCCTTGTACCCTTTGAGCTGTTCGGGGCTTTATTAATTTAAAGCCAGGC
CTTTGGCCTTCTGTCTAAAAAAATGTGAATCTAGGGTTCGTCGCATGGTC
TGTGCCTGAATTTGAAGGACAGACAGAAGCGGTCTTAGTGCTCTAGTTAA
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AAATCATCAGAATGATTGTAGCTGAAGTGTTGATTCTCTCTTTGTCTTGG
ATATCGTTCCTTGAATTTCCAAGTTGTGTGTAATGTGTTTTGAACTATCT
GCTCATCTCTTTTTTTTTGTACCTTTCAGAGTTGGGAGAAGACAGTGGAT
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TGTGCCTTTAGATGGAAACAATGAAGCATTTGAGGAGGTTCTTGACCCTG
ACTTTGGAGAATCGGCCATTGGGCGTGTAGCACCTGTTGACTCTGGTGAG
TATGCTGGGTGGGATTGTGCTATAAATTCGAAGATAAATTTTGTTTTCAT
GGATTTTCACATTAAGTTCTATTTTCTTAGGCCTTTGGTGGATAATTCTA
TTGAGGGCATATGGTAAAATTACTGGAGACTATGCACTACAAGAAAGAGT
TGACGTGCAGACAGGCATCAGACTAATCCTGAATTTGTGCTTGTCTGATG
GATTTGACATGTTTCCTACATTGTTAGTCACTGATGGATCTTGCATGATT
GATCGGAGGATGGGAATCCATGGGCATCCTCTTGAGATCCAAGTAAGCTA
ATCTTGGACACTTGATCTTGACATATTCAAGTACTATATAGTAGTTATGG
CCTGATGGGGATCAAGAATATTGTTCTAACCTTTTCTGATAACACTCAAC
TGGCAACTTAAATGGAATGGCCAGTGGATTTTGAACCTTCACTTTGTATA
TGCAATACTCACAGACGGAAATAAACTGCATAAAGAGTCTTCTCACCAGC
CACCTAACAGGATGTCTTTTCGCAGGCTCTGTTTTATTCTGCTTTGCGCT
GTGCCCGTGAAATGGTCAATATAGATGAGGGGTCTAAGAACTTGATCCGT
GTTATCAACAACAGGCTCAGTGCTCTGTCATTTCACATAAGAGAGTACTA
TTGGGTGGACATGAAGAAAATAAATGAGATTTATCGCTACAAGACTGAGG
AGTACTCACATGATGCTATCAATAAGTTCAACATCTACCCAGAGCAAATC
CCATCCTGGCTTGCAGACTGGATTCCTGAGAAAGGTGGTTATCTTATAGG
AAACCTACAACCAGCTCACATGGATTTCAGGTTCTTTTCTCTAGGAAATC
TCTGGGCGATTGTTTCCTCTTTAGCCACTCCAAAGCAAGCAGAGTCTATC
CTGAACCTCATTGAAACCAAATGGGATGATATAGTTGCCAATATGCCTCT
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GTTGTGACCCCAAAAACACGTGAGCAACTGAAACTTCTTCTATATGCTGT
ATGAATTCAGTTGTTTGAGCGTTCTTGAGAACTTGATACATCTTATTATG
CTTTGCTTGAGAACTGGATCTTTCGATCTTTCTAAGTCCCAAAATACAAA
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TGGCGTCGAGTCTTACTTATGTTAGTCAACTTCATTTTTAGTATTGAGCT
ATTGAGCCAAGTTGTATTGTTTTGATGTTTTTCCCGCCAAAAAACTACCG
TTTCGATATTTGAGGACTTCGTGTAAGATTTTCTTCGTCGAGTGCAGGCC
CTGGTCGTATCATAATGGTGGATCTTGGCCTACATTGCTATGGCAGGTAT
AGATATCATTTTTTCTTGCTCTGTTTATTGTTTCAATAGATCCTTTTCTT
CTACGATTGTAAGATCACTTATTTGTCTCCGTTAATTCAGTTTACCCTAG
CCTGTATCAAGATGGGTAGGCCCGACTTGGCAAGGAGGGCTGTTGAGGCC
GTGGAGAAGAAGCTCTCGGATGATAAATGGCCAGAATATTATGACACCAG
GAATGGAAGGTTTATTGGAAAACAGTCGAGGCTATATCAAACTTGGACAA
TTGCAGGGTTTCTTAGCTCTAAAATGCTTTTGGAATGTCCAGAGATGGCA
TCAATATTAATATGTGACGAAGATCTTGATCTACTGGAAGGATGTGCTTG
TGGCCTGAACAAGAGTGCACGCGGCAAGTGCTCCCGTCGCGCTGCCAGGT
CTCAAGTCCTTGTGTAGTTCCATACTTTTGCTTGACAGCGAAGATCTGCC
GTGCTCCATCTAATTTGCTGGATTTTTAAGTCACAGAAGTTGACACTTGT
TACTTTACTAGGGGGTGACCACCTCCTGTGCCGGTTATTTTGGCGAGTTT
GTGGCCCCTTGATCTATTGATACGAAAGTATACTTTGTTGTATAGATTTC
GCGTAATCATGGTTGTGTACATGAAGCCAATTAACTCAAGTTGATTGGCA
GTTTTATAAACAGATAGCATGTAAATATTACCACTTGTAATGTACTTACT
CGGTGAAATGTAAACTTCTTATTGTTTCTATTTCTTGCTGCCTGCATCCA
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TCTCCGTAATACCTGATTCTAATTTCTACTGTAACTTGTTGTGGCTCTGA
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GCATTTAACTTCTGGACGAACTGACTTGACAATGGAGACCACTGAGTCTG
CCTGACCACCTTTTTAATGCGCTTCAGTCGCGCTATTTTACTTATTATTA
TTATTATTATGTACTGTAGGTGTTTTGTTACTGTTTGTCGATCAGAACAC
AATCATGGGCTTTGCCTGGTAGCGATAGGGTCTCCCTGCCTTGTCTTTCA
ACCTGCGCCGGGAGGGCACAGACGCCACCTCCCTGCTCATCTAGTCTGCC
ATTTTGTGTCTTGTACACATCGCTCGTAGGAGCCAGGCGGTTCCTGGAAC
TCGCTTGCAGGCAGGAATGAGATCCGGGCAAGATCTTTAGCTTGGCAACC
TGTTTATTTTGAATGAGTGGTAGGGGCTGTAGGATCTGCAGTATTTATGG
CGTAATCTTACGGTCATACGCTACCCATTTATGGTCATTTTATGATGTAT
CACTGGGCTGCTCTGCAGAGTTCAGGTAGTCGTAGTAACACAGTGGTCCA
GGCAGAGGGCCTTTAACAAAACCTGGCAGATTTCAGAACAAAAAAGGGCA
GAGTAGAAAACTTGTGACTGTAACTCTGTAAGTAGATGTCCAAGAACATA
CGAGATATTCCCTAGGAATTACTAGGATTATCCAGTATGCTGACCTGAGT
TGGTATATCGAGCTATAGCAATGTTAATCGCATTTTCAAATACTGCTTTA
CATGGAATTCTATTCTAATCTAAAATCTTGAATCGTCGTAGCCGTCGAGT
AGTACTAATATTTGGGCCGGGTAGTTCGTGGCTGTGCGCCTATACCTATC
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AGGTTTTGACTAGTCAGGTTGCTGCAGTAGCAATACCCACCCCAGCCATG
CATATGCCTTCAATGCCCTGCTCTGAGCCTTTTCCCTGTTGGGCAAAGTT
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TACTGCTTCCCTTTGCTTGCTACTGGTTCTACTACGCTCATCGACTGCTC
CTGTTCTCGCAACTGTTTCTGGACATGGCGTGGATTCCTGCCTATCTGTT
GCTTGCCCACAGGCGCTGCTCGCTTCACTGTTTGAAATTCAAGTCCATTT
TGTCCACTTACCACTAACTTTCTGAGCTGTGAAAACTGAGGCTTTGCGCC
CTTAGCGAGCATGCATGCATGACAAGCCTTCAAACGTTTTGTGAGGCGTA
AATGCTGCTGCGCTTCAAACGAGCAGGCAGGGTGGGAGAGAGAAGAGAGC
GCGGAAAAAAGCATTTAAGGACAAAACTATACCCCCTGCGTCGAGCAGCT
GTCCAATTGCGCCAGGGTACATAGGTGCAGATTGTTATTTTTCTTTCTTC
TCTTTGGAGGGGACAGATGGAGGTGGTGGGCACCTCATAAATGTCCAATT
GTCCATACCAAATGGTAGTAGAGGAAACATGAGAATAGAGCTGCGTGGTT
GTCATGTAAACCTGTTGCTCTCCATCATCCACACACACACCTTAGCGAAA
CAAGATATTCATGGCCTGATAGTGAGATAGTATCTGATATCAGGGGTTGG
GCCACAACAGACCGATTCAGTTGAAGATTGATATAAACTGTAGTTGTGTA
TTATATATCAAAGGAGGCATGCGATGAGCATTTGAGACGAACACTATCGA
AAACTGATACTATTTCATCCTTGACATCAATAGCTAGCATGTGTGTCTAC
ACTAAGGTTCGCCCCTAGTTATGCATTGACACATTGTCCGTCTCCTTTGT
TGCCTAGAGAAGAAAAAATGTTCTTCCTTATTATTCCTTAGGAGTATTAT
TTTTAGTTTTCGGAGGTGAGTAGACCATGGTGGAAGAAAAGTCTAGGATG
CAATGATACTCGCATAGCCTTAGCCTTTGGGCTCTGGTGCCCTTCTAGTA
GTCCCTTACACTAGAAAGGCTACCCATGTGAAGAGCACCAACTGAAGCAG
CTCCTTGATCAATGCATACAGTAACGCCATGCATGCAATAAAGCATGTGT
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TTGCAGGCATGCATATATGAGTATGTTTGTGTCGATCGTGCACGAATGGT
AGGTTGATCCATTTGATGCCTTTCAATGGCTCATTTACTGTACAGAGAGA
CTCGTGCGTGCGTAAGTGCCCCTACCAATCTGATCTGCCGCTATGATACG
AGGCTTCAATGGAGCAGTAGCTGTGGTCGTATTATTATTTGCATCCAGAC
CTGTCCTCCAAGATTGATAAAAAAGTACTCCATCATGTTACTCCTACATA
ACCCGGTGCCGGTAATAATAACGAAATGAGGGTTAGCTGGAGTGTTACTA
CACCTGCTACCAGTGTACAAGGCACTAGCATGCATATAAGAGCTGCTTTT
TGGCATTTTGCTCTACGTTCCCATTTCCTGTAGCTGTGGTCAGGGGTGTC
AATGATTTGTGAATTGACTCAAGCGGCTCGTGGAGCAACCTCTGTCTCCA
CCTTTTCCTTCTTTTCCTAAAGTGATGTGAGTGTGTATCCCCTAATTTGC
TGACCTATTAATGTTCCTTGTCCTTGCTTAAGTTATCCACAACTTGTTCA
TATCTTTCGTGTCATCTAAGTATTTGCTTAACCTAACTAATTTAATTCTC
GTTTACATGTGCAGGATTATTTCCGAGACCTCCTGCATCTTAAACTGTGC
TAATTGTGGAGTAAATCCATCAGCATGTATGTACAGTTGACAAGATCTCA
AGTCATGAGTTTTGTAGGTGCACAGAAAGAGAGAGGTAGTGATGCGCTAC
TTGATTTAATACTCTGGCAGCTCCATAAATTTCCATACATTGAGTAATGA
TTTTCATACTAGAGTATACACCACCCTGAATCCGACTTGAACTATTCCTA
TTTGTTTAGACTCTTTAGCTGGAACTGTTGGCCTAACTTTCCAGACTGTT
TAACTGAAACTACACTGCTAGCTGTCCAGGATTGTGCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.