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GrainGenes Sequence Report: AA013320

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Sequence
AA013320
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013320
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTGCGCCGACCCCAGCGCCGCCGCTCCCCGGGCCCACCCCGCAGCGACC
CGGGCTCCGAATCGCTCCCTCCCCACACGAATCCTCCGCGCAGATCCGCG
ATTGGTCGACGTCCCCCATTCTCCTCTCCCCTTCCTCCTCCTCCCCTCCT
CTCCCCGCGTCGATAATCTCGTCCCCAAATCCCCAATCCCCCCCGACTCC
GGCCACCGCCGCCCGCCCTCCCGCCGTCGTACGGATTCCGCCTCCACAGC
CGGGTCCCGAGCCCAATCGCCGTTTTACCCTAGGCGGGGCCACCTCCTGA
CGGCCCCGACAAGCCCGACCCGGGATTCTAGGGTTTCGGGAGAGGGTGCT
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TTTATTTTTGCGAGTATCTAAAAATATAGGTTTCCTGCCACAGCTGATGG
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TAGAAAATTCCCAAGCAAGGTGTTGTTCTCTCTTGCCCTTTTCATTTTTT
TGGTTCTGGTTTGGAGCAATCAAACCCTTAGCCGAGCAAAAGCTAACCTT
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ACCTGGTATCACACAAGGTGCAAGTGGAAACTCTAGAATGTCTTATGACA
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GGGTTCTAGCCTAGGCATCTCATGCCAGCAGTAAATTTGGCAAAATTCAA
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ATTTTCAAGCAACCAGGGTAACCATCAAATCCAGAATATTGGGGGCCACC
GAAATTCTGCAATACACTCAAGCATGCTAGAGAATTCTTCTGCATTTGGT
TTATCAGATGGACATGTGAATGGTGGAATGGGATTGCATGGATCAAATAC
GCAAATTACGAACAGAAATGCAGCACCAGAATCATACATGAACATGTCCT
CTTTTGGCAGTTCACCTAGACCTTTGCAGCAGCAGTTCAATCAGCTTAAT
ACACAGAGAATACCAAGTACGCTCGCTGATGCGTCCTATCTTTTATTGCT
TTATCATTGCGACTTGTGCCATAAACTTGATGTCATGTTTGTTAAGTACA
AATCATAAGCTAGTGATGGCTCGATTATTCCTTAGCAATATGTTCAATGT
CTAATTACCTAAGTCATATATTGCACAAACAAACTTTGTTAGAGAATTTG
TTGTTAGCAAACAGATAAAAATAGCACACAACTGCTTACTTTAGTTTCTT
GTTGTTGAGTCACTGGCTTCATAATCAATGTATTGGCTAGAGTCCTTTAA
CCCATGGAGGGTTGAAGTGATATTGCTTCTACTTGGTACCAGTGGCATGA
GCGTACGTATTGACAGACATACATGCAGATTCATGCATAGTGAAATGCAA
ATTTCGTATTATTACCGACAGCATTTTGACAAAGTAGATTGTGTTTTTTT
GTTGTGCAGCTTCAGCTGACATGGGTGGTTCTGGAAGTTTCTATGGTACT
GGTTCTTCCGCTTTAACAACAGCAAATAATCCGAGCATGGGTGCTGCAAA
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AATTTCTGCAAAACCAGTATCATCTCAATCAGCAGCTGCCAAATTCCCAG
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GAATTCTAGCCATTCTATGCAAATGTCAGAACAGGGATCTCTGCCACACA
CTGAGTTGATATCTTCACAAGGTACTGAGCATGCTCCACTTTCTAATTTC
CAGGGTCAATACCAGCAAAGAAGTGCTCATGATAATGTCAAAGGAGCACA
GCTGTTTGGACATCTTTCTGGATCTCAAAACTTCACTGCTTCTGGCTCTC
ACGATTCTCAGCCATTGTTGCCCTCTAATCAGCAGCTTGATGTCAGCTCG
AATGATGTCAGTTATGTCTTGAAAGGATCACAGCCAGAGCAGATGCAGCA
GCCCCAGTGGCGGCCTCAAACAATGGAGAAGGCTTCTATCACTAGCAATC
CGTCTCTTGAAAAGCAAATACAGGACGACTTTTGTCAAAGAACAATGGGC
CAGGACGGAGCACAGCAGCCATTTTCATCTGACTGGCGTGTTTCTGGTTG
CACTGTTGCCTCAGTTGATCCTGCGTTGCCGAAGCTCCCCACCAGTGGAT
TGGAACAGTCCGCTGGAAATATCAACTATCTTCTTCAGTTGAAGTGGCTA
CTGTTGCTGTTTCATGCGAAAGGATGTTCATCGCCTCTCGGAAGTTGTAA
ATTCCCTCACTGTGTTTCCCTGCAGGATTTTGTGAAGCATTTGGACAACT
GCCAAAGAAAAGATTGTCCGCAGAAGAAGTGCAGTACGTCAAGAAAGCTA
ATTCATCATTATAAGACATGTCTTGATGAGCAGTGTCCTGTATGTAGTAA
TGTAAAGAAATTTTTGCGCCTCTCAACTGAACTGGCAAGTAAGCAAAAGG
TCCCTGAGCCTAAAGTTGCTCAACAGAGCATGACTCAAAGAATAATGAAT
AGGGTAGAAGGTGATATAATGGACATTGACCCGGTGTCTGTTGAATCCTT
TGATGGTCAGCCATCTGTTCCAAAACGATTGAAGATGCGGCCTGCATCAC
CCAGTGTCCCAGAGCATGAAATACTTAGAGCTTCCAATCCTAATGTGAAC
CCAGGGTTTGTACCTCAGGAAACGCATCCTGAGCTGCTTGAGCAAACTAA
AAAGTTGGCGTACCTGAAACGAGAGGTGGATGTAAAGACTGATGTCCGAC
CTCTGCAGAATCCTGTAAAGATTGGTTATGGTACTGACGGAAATGTGCCT
ACAGCGAGGCATAATGTGATTCCTGGTGTTTCAAATGAGATAAAATCTCA
TGTCAAGCAAGAAATCTTGTCAATTGACAAAGAATCAAGTCAAAATGTCC
CTGAAGTTAAGAATGAAACAAATGATTCAACAGATATCGCAGCAAAATCA
GGAAAACCAAAGATAAAAGGTGTTTCATTGACTGAGTTGTTCACTCCAGA
ACAAATTGGTGCACATATAGACAGTCTAAGGCTGTGGGTTGGGCAGGTAT
GTCTTTTACTTGGAAATAACCTTCTTTACTTTGGGTGTTCTTTCCAAAAT
CACCAGATTAGTTATTATGTTTGTGCCTTTTATTGTCCTTAGACGCAATC
ATCCGAGAGTGTACTGTTCGTTTGTTTTTCCAGTGGGCAAACACTAATTT
CCCTCCCTCACTTTCTCACATAAAATCTAATTACTGTAAGCTTACACAAG
AATTTACCAGCCGGTTGCTTTACCAAACATAATTTAGTTGCACCTGAAAA
GTTCCACTTCTCTGTGTGATAAATGTTATCTATTTTGTTGCATGTGGCAG
TGCATTGTGGTTTTGTGCAAATACTCATATTATACAATTGTTGTGATGAA
ACTTGTACTGTAACCCTAATATGTGTGTTTAGAAGGAACCATTTTACATG
TTTTGCCATTTGACAGAGCAAAGCTAAAGCTGAAAAGAATCAATTGATGG
TGTCTTCTGAAAATGAGAATTCATGCCAGCTCTGCAAAGTGGAAAAACTT
ACTTTTGAGCCCCCACCAATATATTGCTCCCCTTGTGGTGCTCGGATAAA
GCGAAATGCACCATACTATACTGTTGGTACTGGTGATACCCGCCACTTCT
TCTGTATTCCATGTTACAATGAGTCCCGTGGTGACACCATTGAGGTTGAA
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AACAGTGGGTTCAGTGTGACATATGTGAATGCTGGCAGCATCAGATATGT
GCTCTGTTCAATGGCAGAAGAAATGATGGCGGACAAGCAGAATATACTTG
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TCGGGCATCTCAGTCAGGACGTAGTTTTGACGAGGTTAGTGAAACTAAGT
CCTGGTGGAACTACATGTGTACTTTAATTATGTTTCTCAGTAATAAGTGG
TGGTACCCTAATGTGCATTGGTATATTGTATTGCCTTTGTGACAAAATAT
GCTGAAAGTGTTTTATAAGTGCCTACACACCAAATAAATATTTACACCTA
CTATTATGATTGTGCTGCCATGGTTCGCATATACAAGGAAACAAAGCAGA
CCAAATGCGGGGCCTGTTTGAATTTTCTTCCAGACCCCACTGGAACTTTT
TCCCTTACAAATTTAGTTCAAATGGAATAGATCAACCAGGATGAACTAGC
AGTTTATCTAACCGTGTACTCCCACATGGTATTTAATAAGGTGTACCATG
TTGGAGAATTAACTAGTCTAATGACGATACATTGTATAAATTACCCATAT
ACTGGTCGGAAGGTGTTGCGTCAACTTCAGATTAAAGGCTATATGGAAAT
ATACAAAATTGTATTCCCTTTAAAGTTTGCAGTGCTGTCATACAGTGCAA
ACTTGTTTCAGCTGATTGTTCATGTCCCAGTAAAAAAGTATAGCAACAAA
ATTGGGCTGCAAAAATGAGGGATGGCATGAAAAATCAATAACTATTGATT
TTTGGCAGTAGCATATATGAGCTTTGTGTAGTTGAAGTATATTCATATAT
CTTAATGATTTAAGTTCATATGTCTTGTTGAATTCTGATTATGTATTATA
AGAGAGACATGGACTTGCTGTAATTTGGTTTAAGTGAGACACCACACCAT
TCATTTTGGCATCATTGTGCACACCATTTTGATAGGAATTTTCCCTCCCA
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GTCTTGTGGTCAGAGTTGTTTCATCTGTGGATAAGAAGGTTGAAGTTAAA
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CAGACTTTAATATCCATTATTCTGTTCCTATGAATGTTTGGCAGGCTGTT
CTTCTGTTCCAGAAAATAGAAGGTGTAGAAGTGTGCTTATTTGGAATGTA
TGTTCAAGAATTTGGTGCTGAATGTGCTTATCCGAACCAACGTCGTGTTT
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CTCTTTGAGCTAGCATTTTCCCGATCTTACCAGTTCTCTGTGAGTGCAGA
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TGGGCTTGCCCACCTTTGAAAGGCGAAGATTACATTTTATATTGCCATCC
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TTAGATTGACGTGTGTGCTAGTCTGCTTACATTTAGCCCCTGGTTTCCTG
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GGGAATGCATCGAAGGATGCTATGCTAATGCAAAAGGTAGGCTTACCCAG
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TTTCTCTAAATCCCCTCTGTCTTTTTGAAAATGTAATTATTTGTCTCAGT
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AAGCCACAGTAGATCCTTGGTCGTTTTGTTGCAACAAATCGTATCCATAT
CATTGAGAAACCTCCCAGTAAATTAGGAAATGGAAAAACATACAGGCAAA
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ACTTCTCCTTGCCAATCCCGTAGTGGCCATATCTCCTCCCCTCACTCTCC
TTGATCCTATCAGGCCTCTCATGGAGCGATGCCATCTCATCAAGCAAGTT
TCTTAGGCGTTGATGAGGCCGACAGCCTATGGGCAAAGGCTCAGCAGCGG
TCATTGCCTCAAATCTAGCGTTCTGAAGGGGCTAATCCTCCCCAGACCCC
TGGTGACTTGCATTGAATTGGGGTGACTCTTGGAAACCCTATATGACCTT
GTGATCCTCCTCTGGAAAGGCAAGGGGGCCTGATGTCCACCCCAACCATG
GCATCACACTAGGTCATGCCTTAATAACCCAGCTGTACTCGTGAGATTGG
GATGAAATTAACTAGATATGATAAAAAAAGGTTATATAAGAGATATCTTT
GGGACAAGTTGTAGATATCTTTGGAACGAGTTGTTTTGAAGTATGCAGAT
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TTGTTGCAGGTGTTACAGTATAGAACAACAGCTTGAAGATAGGGAAAGGC
ATCCGAGTAATAGTAGAGACACGCATAAGCTCCATCCGGTAAATAACTAA
AACTCCTTTTTGTCAAAAAAGAGGAAAAGAGGAAATCACTAACATATAAC
TTGATGTTTGTCAGGTTGACATTGTTGGGATACCTGACGATACAAAGGAC
AGAGATGATATCCTAGAGAGTGAGTTTTTTGACACCAGGCAGGCATTTCT
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AGGCTGGCGGTGCGAAGTTTGTCCAGATTTTGATGTCTGCAATGGTTGTT
ACCAAAAAGGAGCAGTCAATCATCCTCACAAGTTGACAAACCATCCATCT
GCTGCCGACCGTGATGCCCAGAACAAGGAAGCCCGGCAAATGCGTGTTTC
TCAGGTACAAACTTTTAGATGGTTCCGACTAGTAATTTGTTCCTGACCTG
CCATTGTTAAACTCGTGAGTTTCTCTTATTTAATACAAAAGGGAGGTGAA
CAAAAAGAGGTGCTTCATAGTGAATCTCTTGACAGCTGTCTAAACTTAAA
TAATCTTTCTAAATCTATGGAAAATAATGGTATACTAGATGAGCTAGTAT
ACATTCAGTTTCACTTGTTGGGACATGTACTTGAAGGATGCATCAAATTA
TCAGGATATATCTGAATTGATTAGCACTGGCCGGTTTGTGCCATTACTGT
GTAGGTCCACTTTCATCCATAGTTGGGAAATGACCATGACCTGCATCCCT
AATTGCGATTCCGTCCAGTTATTCTTCGATACGTGTATATAGTAGGCACT
AGGCAGACATCCAGGCATTGCAATTAACTAAGCTGGAGCTTCACAAATTG
GAAAGTATAAGCATTCTTTTTCAAACGTTCAACACAAACTCTGTATTTAT
GATCCGGTGATACACATTGTGGATTCAATCAACATGTGCATCTTTTATTC
TTGGGGCTGCAGTTTGTGAAGTACAGCTATTGTGCAAAGACTGCTTCAGT
TTGCAGTTTTTGTGTGGAGAGACTCAATAGTTACGTGTTCCGCTATCTAC
ATCCATTTGTTACGTATCCCATTATGATATATTTTTTATGATGGTTCTGC
AGCTAAGGAAAATGCTCGATCTTCTGGTACATGCCTCGACCTGCCGCTCC
GGTAGCTGCCAGTATCCTAACTGCCGTAAAGTCAAGGGGCTATTTAGGCA
TGGGATGCAGTGCAAAACGCGTGCTTCAGGAGGGTGCGCCCTGTGCAAGA
AAATGTGGTACATGCTTCAGCTCCATGCCCGAGCTTGCAGGGATTCAGGA
TGCAGTGTGCCGAGGTGCAGGTGTGTTGGCGCGTCTAAATTTTGTCCTGC
TACCCCCCACCTCTCTTGTGATTATATGCATATAGTATTTCAATATGTTG
AGTAACACCTGACTACCACCTGTGGAAATCATACAGGGATCTCAAAGAGC
ATCTTAGAAGATTGCAACAGCAATCCGACTCGAGAAGGCGAGCTGCTGTC
AATGAGATGATGAGACAAAGAGCAGCAGAAGTTGCTTCGACATGATTAGT
TGCGTCTGTACAGGTATACTGTTGTGGAAAGAAGATAGGAAAGTTATCCA
GGTTTTCGGTCCTCTCACGCCCCCCACACCAAGGAGAAGGCTTGGGATGG
TTGAACTGGAGGATCTAGGGAAGAAGCTGCTCAGATGGATTCGTTCAACC
TATTGTTTATCCTGGAGATGGAAGAAGACGCTGGGCATTCTTCGCCGATG
GTTAACATATTGGGCTCGGAAGCCCGCCCTTTTCCAAAGGAAGGGCGAAG
GGGGCGCATGCACGCACCACAGTAGGTGGTAACTGTTTGCGCCCGTGCTG
ACTGTGCCGCTGATATCGTCAATAGGAACCGGCCCGACCCCCTTGGGGTG
TGGTGATTCTTTTGTTTGACCTGTACTAGTCGGACTAATCTCTGTTTTGC
TGCTTTGCTTCGTCGTCATCGTCCATGTATAATAGTTTTCTGGACCCTCT
ATTGTTGAAAAACAATGGTGTAGCTGTTTTGTGTTACCCCTCCATTTTAG
TTTATTTTTACCTTGGTCTGGAGGGGGTATAGTAGGAAGTTAAGGACGAG
GGGGATGGGCATGAATCTGTTTATTTCTGCACCCCCTCCCATTTTGTAGG
ACCAATCTTTATTTGAAAGTATAAATGAAAGTAAATCCTGCTCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.