Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA013017

[Submit comment/correction]

Sequence	AA013017
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA013017
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAACCGCACGACACGACACGACACGGCGCAACGCGCCACCGCCACCCCCC ATCGGGAGGTCCGACCCTCGCGCCCCCGGCCGTCTCCGCGCCGGCCACCG CCCGCCCGCACGATCCGCTCGCCGGCAGGGGATCGGGCCCTGGATCTGTG GCCGCCGCCGGGATCCCCGCGCCTCGCCGCCATGTTCTGGCCCACCACCC GCCTCTCCGCGGGGTCGTCCGTGAGTGCTCCTCCCTCCCTCTCATTGCTG TCGTAAATGTAACGGAATGGATTGCAATGGCTCGGTCATCCAGCCATTTC GGACCTGGGATTCATTGCTCGGTGGCCATCCAGCCATTCTAGATTGCTCC GCGGCCTGCTCGCTCCGATCACGTCTGGGTTTCCTGCTGCCCTGTTTGCA GAATTCGGGAGCCATGAATTCCTAGAGAGGCCGTCGGCCGTTTCCTATTG CTTTGCTAACGACCGTTTAATCCGAGCTTTGAAATTGGCACGGACATTTT TCTGCCATTTTTGGTGGTGTGGAGAAGTTGGGACCATTTCAGGGTGTAGT GCACTCTAGGACTGCGTTCTCTCGTCCCATTGTTCAATGATCCCAAAATC AAATGGTAGGCCGCCGTTTAAAGGAATCGGGTAAGCAGGGCAGGGGCCAC CTAGACTGGTTTCCCCAAATAAATGAAAAAAAACTACAGTAGGTTAATAA TTTTCTTGTGTTGGTTGAGCATGATTACTGGTATGGGTTTGATTATGAGA ACGCTACTTTCCTCATTAGTTGATACATGGCAGGAGTGAAATGTTGTTGG TACATAGCTGGAAGCTCCCACCTCAATCGCCTGACTCCATGTTGTAATTA AATCATCAGGTGGATATGATTTTAAACAAGGAGAATTTCACATTGGAAGA GCTTCTTGACGACGATGAGATTATCCAGGAGTGCAAAGCGCTCAACTCTC GTCTCATAAATTTGTGAGCCCCTTTCCTCTCTGCAGACTTTTTAATGTTC TGAGTCCAAGTTATCATGGTTTCAGAGTTTTTTTTTAGAACAACGCCTTC TGAGTTAGCAAGATCATAGTTCCATGTTGAATGTTGCAACTTTTTTAGCG CTTGCGAACTGTTCTATGACATGTTTAGACCCCTTTCGCTTCTACTAATG GTCATTAACTTGTGTTCTTATTCACTTCTATGGTTTTCAGTAGTGTCAGC TGCCAATAACTGATGATAGTGTCTTATGGTGAACTAGAATATTTATTTAA ACTTATACCATGTTTAAAAGGCACAAAACACACAGATGTCCTATCTTAAA AGGAAAGAGTTGATAACTGTGTTAATTCATGGAAATTAGAACACAACTTT GTTTACTTGACATTTTCACTGCGAGTTGCTTATTTCATCTGATTGTAGCT CTGTTTTCCTAGCTTGCGGGGTAAGGCCCAAGTGGAGCAATTGCTTCATT ACATTGTGGAAGAAGTTCCTGAGGATTCCGAAAAGCAACAGTCTTCCAAG TATGCTATGGGTTTTGTTGTCTGCTACCATGCTGTGCAAAACAGCTCACT AGTCAAGCCTTTTGATCTTCACATCTACAACTCTTGCAGGTTTCCTTTCA TTGCCTGCGAGATATTGACTTGTGAAATTGACATCATAGTGAGGACCTTA GTAGAAGATGAACAGGTGCATATATTCCTGCCAACGTAGTAGTATGGAAC ATTTTATCTCGTTATAGCTAACCATCTGCACTTCTTCTGGTATTTGACGC AGCTAATGGATTTGCTTTTCTCATTTGTAAAACCCGACTATCCACATGCC CCCCTGTTAGCTGGGTACTTCAGTAAGGTACATTTTTTCCTCCTGTATTG CAAGTGGCTCATTTATTGAACTTTGTTCATGTTTCATTGTTCTCTGCTAT GGTTTAACTTCTTCGGTTTTGGCATGATTGATACATTGGGTATCATGTCA TTGCTCAATTCTTTGTGATGGCTTGTGGAGCTTTAGTTTGGCAATTTATT TATTGTAGGTGGTAGCATGTTTGATGCAGCGGAAGGCTGCTCCTCTTATA AGTTATATTCAGGTATTGCTTGTGTCTCTTTAGAAGATTCTGGATTGTTG ACAATATGTATACATTCTCAGTCATTATTTGGTGATCTTAACCTTGACAT GTTTTTCTTGCTTTGTACTCCAACTCTTCTTGATAGATTATTAGCTCCTT CGGGTAAAAGTAATTATAGCTTAGTTATGCCAGCATGCTTGCGCAACCTA GCTTACTGGAGCTTAAAATATGTTTTGCAGTAAATGACTATGGAAGTTTA TGATAGGGAACACTATGATAAGCAAACAATTGATCTGTTTTTTTCTTTGT GTTGGAGATCTTGTTCCACCCAATGAGCCCACTATATTTTCTTTGGACAT GTGTCTTTATCCTAGTTCCATTAATCAGATTTTTTTGTTTTACTTGTAAA TTTTGTATATATGAGAAGCTTGTATTTGGGGATAATCCAATTTATGTCCT CGTTTTCTCTTTAGGAGCACCCTGACATCGTTGTTCAACTTGTTGATCTC ATTGGCATCACATCAATAATGGAGGTCAGCTCTTACTAATTTATACCCAG TCTATTTTGGTGGAGTGCATTGGATTGATGTTCATGAATCTCTTGGAAAA AACAGGTGCTGATCAGATTAATCTGTGCTGACGAGACCATATTCTCAAAT TATGCCGATGTATTGAAGTGGATAGAAAATGTAGACGTCTTGGAAATGAT TGCAGATAAATTTAGTTCATCTGTAAGTTTCGAAGCTTGATTAATCATCA ATGTACGTAGTTATTTACAGCATGTCTATTTTTTTAATCTATGTCATCGA TATGTCAAATTACCTTGCGTTGGGATCTTCTTGCTATATTTTTTCAGTAC CATATATACATTGGTAAAGCTATCTTCAAGAAATTTATCTAGATATTTTC TATCATAGAGGTTTTATTTAATATTGCTGCTATGACCAAGCAGGATTCCC CTGAAGTACATGCCAATGCTGCAGAAATCCTCTCTGTCGTGGCTCGATGT GCTCCTCCTGCTCTTGCTGCAAAAATATGCAGCCCAAGGTTTGTTTGGTT CTAACTTCTTCCATAAGAAATATGTGCCCCTCCTGCTGTTTGTTAAATAC CTGCTTCACGGCATTTCAGTTTTATTGGAAGGCTGTTTCAACATGCTCTT GAAGAATCAAGACCAAAGTCTATCTTGGTTCATTCATTGTCAGTGTGTAT ATCCTTGTTAGATCCCAAAAGGCTAGCATCAGCATCAGCGTCAGCATCAG CATCATACCAAGTATTTAGAAGTAATTTAAGTCACGGGATGTTATTCACT GCCACTCCAGAGATAGTTGATGCTATGCTGGATAGTCTTGGTGAGTGTTC TGTGTTTAGTCATAATGCTAGTTATATTCTTGTGTTTTATACCTTCTGTT GATGCTATATATTGCCTAGCTCATGCATGCACTAATTAATGAGGCATATT TAGTGAATTGTTTGAGTGCATTTTTGGAAGGGAATTAATCATATGCTTTA AATCACATCTTAGGTGGTTTGCTGAAGTTGATGGATATCTCTTCTTCTGA CAATGTTTTGCTGACAACATATGGGTGTTTGCGCCCTCCTCTTGGAAAAC ACCGTTTGAAGGTAATAGTTTCATGTTGTGAAGCTTACAAATTGATGATT TGGGCATATGTGATTATTATTATTATTGTTGTTGTTGTTAAGTTTCATGC ACCAGCCAGTATGTGGAACCAGATCCTCTCATGTGTGACTTGATGAGGCT ATTAGGCCTACACATGAGTAGAATCTCACATATGACTCCATAATTATGTG GAAAGAAAGAGGGCGAGGGCAATTTTCTATTAAATTGCAAAAACCGAGAC TTGAAACAAAGACCTTACGTAATATACTTAACACCCTTCACATCCGACTG GATAACACCTCCCCTCACGCCCGACATGTGCGTGAATAAATTGGGGAATA AGGGTGGGGGAACTGAAACTTGAATCCAAGACATGGGCGCTCTGATACCA TGTTAAGTTTCATGCACCAACCAGTAGAACCAAAAGCCAGAACTGATGGG AAGAATGTGGGAAATCCACATATACTGTAACAACTATTATTATTGTTATT ATTATTACTATTGTTTTTGTTTTTCTTTCTTTTAGTTGACCCATCTTAAG CTTCTAGTTTCATAGGATCATTAGTCTTGCTTAGGACAATTCAGGTTTTA CTATCATTAATCTCGACTCGGATTATCTAGTGTGGTAATTTCTAAGATGT CATGCAATATGAATCCTGATAACCTCAACTATATTCCACAACTTGCATAA CTCTTTGCCGTTAGGCTAGGTTTGGAAGGTCCCGATTGATAATTTCTTCT CTGGCATGCTACTTTATGGTCCTTTCTCCTTTGCTGTCCCATTTTGGCTG TAATGTTTTTTTTTTCTTTTCAGATTGTGGAGTTCATCTCCGTTTTGCTG AAAATTGATAGTGGAGCTGCTGAAAAGGAGCTAATTAGACAATCAGCGAT AAAGCATTCCATTGATTTGTTCTTTCAGTATGTAGCCTGTGATATGTCTT TTATCTGTGTTATCATTGGGGAAACATTTGTGACATGTTGTTTGGTTCTG CAGGTACCCTTATAATAACTTCTTGCATCATCATGTTGAAAATATTATTT TTTCTTGCCTGGAGGTTATACAAGTGCGACTGATTGACCATGTTTTAATT GATTGTGATCTTGTTGGTAAAATTCTTGCCACAGAAAAAAATGCTTCCTT ATTAACGGACTCCAATTTGGTAATTTACTCCTTGATTCTTGAGTACTTGT TTATCCTTTGAAGACTAGAAAAATCATGTGTCATATTATTATATCTTCTC CTTGCAGCCAACATTACCATCAGAAGGGAAAGCACCTCTGAAAATTGGGA ACATTGGGCACATAACTCGGATAGCAAATAAGCTCATCCAATTGGCAAAT AATAATAGCACAATCCGGTCTCACTTGCAGGTGATTCAAGTTTCTCTTGT TTCATTAGCCTAGCAATGGCACACTGTATTTTGTATGTGTTGTTGGTATG TTCTGTCTTCACCTACGTTATCATCTCTATAGGAGAATAAGGAGTGGGTT GAATGGAAAACAAGTGTCCTAGTGAAACGCAATGACGTGGAGAACATTTA TCATTGGGCCTGTGGGTAGGTTCTTAGTTTCTGATGCTGTGTTGTGCCAG TATTTAAATTTTTGCGCATTCTGGAAACTCAGGGTAATTTCTTATTGTGC TAGATTCTGTACATGCATATTTCTCTTTTGATTGTTGGCTACTGATGTTT TCTGTTGCAGACGTCCAACATTGCTGCGTGATCGTGGTAGGGACAGTGAT GAAGATGACTTCCGAGAAAGGGACTATGATCTGCAAGAAGTTGCTAATAG CCTGAGCCAGGTATTTCGAAATGGGACATACAACACTGGTGACATTGAAA AGGTGACTATCTGAACTTGCAACAGATTTGAGCTTTGGTACCGTGCTACT TTCATGGATTTTTGAGGATATGAAGTTGATTACGTAACTAATCTCCACTG GTTTTCCTTACCATCTAAAGTTTAAATTTGTAGCTTCAGTAGGTTCTCCA GTACGCATGGTTGTGCGACGTTGAACTATTGATAATAATATGATGATTAG AGATAGCTTGACACTTTGGCTCACTCTAATTTTCCATGACCATGTGATGA TCAATTGAAATTGTTGGAAATCCATGTTTCAAATTTGAAAGGTTTTCATA TATCTTCTGAAAAGTTGTACTTGCCAGACTGCCTTAGTAGCACCGTAAAT CTGGTGGACCCATCTTGACTCAGTCATACAAGTTGTGGATCTTTTTTTGC GAGACAACTTTATATGGACTGGACCTAAATGTGCAGTTCTCGAGTTTAAG GGGGCAAGTAACACCACCATGCAAGTTTAGGGACCTATGATAAGTTTCGC CCATTTAGCTATACGCAAACTCTAGAGGTTCTTGAGCCATATTATGTTAC TTATGAGCTGATGTGGTGTTGTATGATAATTGCAGGCGCAAGGATCCAAT GAACGAGATGATGAGGTACGTTAGAGTGTTATTTATGTTGCATTTGCTGG TTATTTGTTCCCATTATAATATGGCTATATAGTGTGTTCATGGGAACCAA TATGTTAAGCTGTAGTGAATACCTCCACAGTAACCTATAGCAAGCATACC CAGTGATGGGTTTTCTGCGAGTCTGAATGGTGTTTGTACTCTGATTCAGG ATGATGAAGCAGCCGAAGCCATAATATGTTCTATCCCTCTCGGCGAGGAC AGGTAATCCCGCCGATATGTCTCAGCAACCTGGTTATGTTAAAATAAGCA TTGAGGGAGTGGCTTATAGAGAGTGTGTGCTGTTACAGCGGCGCCTCCCT CTTCACGGATTCGGGCTGGTTCTTGCTCGACGGTGATGAAGGAATTAGCG ACCGTTTAGCTGCTATGTTCCCTTCCTTGGCTCCCTCTTCCGAAGAGACT GACACGGAGGGACCCGATGAAGTGGGAACCGGCGAAGCAACCGCTGTATG TTCAGGAGTTCCTGAACATACAGCGCGCAGTGCAGACGACGAGGGGCTGG TGTGCACAGAAGAGGAAGACCGATCGAAAGGAGCCGAAATGTCTGAGCGT CGTCCGGACGCTCGTGATGACCAGGCTGGCACTCCAGAGGAAGATGCCGA GGAAGCGTCGCGCGTCGAGGCAGGTACAGAGAGGGCAGTGGATGAACCTG CCAAGTCGTCTGCCAGTAACGGCACGCCCGCTCAGTCTGCTGGGTTAGCG GCCTCTGACGACCAAGGTGTCGATGCTTCAGATCCAGACAGAGGCTCGCT GTTGCAGGTCAAGGAGGGAGGCTCGCCGGTGGAGGTCCATGGCGAGAAGA ATCCAGCGAGCCGATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.