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GrainGenes Sequence Report: AA009319

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Sequence
AA009319
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009319
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCACATCGGCTCCATAAGGCAGACCGAAAGTGCCATCCGAAAGACGATT
TCGTTTTGCCCTCCGCTGTTATATCGACGCCCACCATTAGCAGCCTACCA
CCACCATCTTCCGCTCTCCCCCGTCTCCTCTGCTGTCGTTCGCTTGTCCC
GGCCTAGGGTTTCGCCTTCGCCCGCACAGGCCCCGGCCCACGCATCAGAT
CCCGACACCGGCGACCCCCGATCCTCCTCCGTTGCCCGCCTCCGACCCCG
CCGAGCTCCGATTTGTCACTCCCTCACGCTACACCACATCGGCCTCCAGC
CTCTTGACGCGCTCGCCCGGGAACAGATCTAGGGTTTGGGGCCTTGCTTG
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AGGAGGGATGCGTCGGCGCTTGACCCGGAGCTGCTTCAGCTGCCGGACCT
CGCGCCGGGCGCGCTCCGGGAGAACTCAAGCATAGCAGATGCACTCTACG
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TGCTCAATGGTTTTAGTGAGATGGCTGAATTGCTGCTTGACGCACATATT
TTTTCAGCACTCTTTGGATGCTAACTTTATGCATGCCTGTGCACAGTGGC
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GTATTTCCTTTTTGATATCATTTCCAGGAGTGGATGCTGCAGATACAATG
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TGGTCTCGAGCCTTTACCGCTAGTTTTTGTTGCTGTCCCAAATGATGCTA
GTATTTTGTCTTGCTTTGTCTGCTTTCTTATGTTGTATGTTGTCTTGGGT
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CTTGACTGGCAATAATCCAGGAGACAGAGAGACTCCATCGCCTCTGGTTG
TCAGCACTCTTTAGTTTGCAAACGTGTGCATAATCACCTCCCTGCTCACT
GCTGTCGCTTTGCATATACTCTTCTAACCTCAGCTTTCTTCTCAGCTCCT
TCCTCTCCCTGATACAATGTGCTGCTTGTTGCTCATCTCTCTTGCTAGTT
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TGATTGATCTACTATATTGGCTGGCTTCTTGCATCTTGTATTTCAGGCAT
TCTACAATATGGAGCAACATGAAGATCTTCCAAATTTTAATCTGGTTTCA
TTCTGCAAATAATACATGTTTGAAATAGCTGAATCTTCTAGGAATTTGCA
ACATGTGTTGATGTTTGTTCTGTAGCTCAATAGCTGTGTTGCCTGTATGG
GCGAGTGTAGTCTTGTGTAGACTGCCCTGAACATAGATTAGTCCAACATT
TTTTAATTTCGAAGAGACTAATCCAACCAGTATGGCATAATGGTTAAATC
CCAGAATGATCAAGCGGCATATTAAGTGGTGCAAGAACTGTTACAACAGT
CAATTGAGGCACTAGAACTGCTTCTTTTTTTCATAATTTAAGGCAGTACA
CTTACAGTTATAATTAAATGGCCACTGAGCTGACCTTGCATCTGATACAT
AAAGATTAGCATGATCAATGTTAGTCACATCTATTAATACCTTCAGTCTG
AAGTATGTATCCGCGCTTGCTGCTTAGGCTATTTAAATCATTATATAACC
CTTTCATGATCTGCTGAAGAGACAACATGATATTTTTCTGCATTGTTAGT
GGTTGAAGTTACTTCTCTTTATCTGATCGACTGATACTATGAAGAGGGAT
GCTACTTTTTTTGTAGAGTAAACTACATAGGAAATTGTTGTGTGAGTAGC
AACAAATTTGTTTCTATGACATACTTCCGTGGGACATATCATTCCTCACA
ATATTTGTTTTGTTGGCTGCTAGGTGAAGTCTTTGATTGAAGAAGCAAAA
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TTCAAGTAGTTCTTTGCCATCAATGTTCCCTGCTGGTAGTGCTCCCCCAC
TTTCTCCTAGGAGCACTGCTGGCTCCCCCCGTGTTATGCGACGAGGATCT
GGAGCTGGACCATCAACCTTGGGATCTCCTCTAAAATTAGTCAGTGAACC
CGTGAGAGAGGTTATACCTCAGGTGCTTTCCATCTGCTCTTGCTATTCTT
AGTGTAATACTTGTTTCTACTCTAATTATTTTAGCGTCTTTCTTGGTACG
CTTAGTTCATGTATTCAATATATATGCAGTTTTACTTCAAAAAGGGCCGC
CCTCCACCAAAAGATTTGAAGGAGCAATGTTTGTCTAGGCTAGACCACCT
ATTTTTTGCCGGCGAGGGACTGCAAATACACGGTGACTTTTATAAGGGTT
TCATTTGTTTGTTCACATTAAGTGCATTCTTAAGTTTGAATGTTTCATTT
GTCCATATCAGAATTCAGACCAGTCATAAAAGATATATGCAAATTACCAT
CGTTCCTCTCTGGTGTGCTTTTCAAGAAGATCGATGCTGCTTGCTCTGGA
ACTGTAACAAGGTATGATGTTTATTCAATATCTCAACCATGGGTACATTA
GCATATTTTTAAATATTTTGGATCTTAGTTGTCCGGTCATGTTTTGAGGA
TATGAAAAATACTTCATGTTGCTTATTAGTACATGGACTTGACAACTGTA
GCCAATTTTTTTGTCTAACACTAATTCATTATTGGATATTAACTTTTTTT
TAAGTATATACTGTGTATTCTTTGAGATATTGGGACTTTCATCATAGTAA
ATTTAGCCTCTGATTGCACAACCAGTGTTAAAAACCTGTGGTTCCTTGTT
ATTTTCTACCGAGGTTGGCTCCCTGATGGGTTAGAGGAGCAGTAAGTGCA
ATGGACTGAGGTTGTAAACTGACAATGGGCTGAGTGCGGAAACCACACGG
GGGGATTGGAGTGGTTTGAAATTCCATCTGATCTGTTCTGGGTTTGGTTC
TGTGGAAATATTAATGTTTCAGTTTTGGACATGGCAGCATGTTGCTGAGG
GTTGGTCTGCAGATGGGTTGGTTTTTAAACCATTACCAGGCTGAAGCCTT
TGTCTAGTATAATTAGGCAGTGCATAAGCAATTAGAAACTGGCCTGTCCA
GTTTTTTGTAGCCTGCATTACTCTATGCTTAGGCTCCATCATCTTCTCCA
CTCCAGCAGGCATGCTTCTCGATTATTTTCTTGCTCACGTTTGTACATTG
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CCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACGTAC
GTTGGCATTCTATGTTTCAGTTTGACACGAGCACTTTTTTGTGTAAACTC
AGGGATGCGTTTATTGAGTACTGGATTAATGACAACAAGATAACAATGGA
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TCACTCAGGTCAGCATTTCTTCTTTCCTCTGTTTGTTCTTGGCGTATGCG
TATATATGCCTACAACTGGACAATATAATGATTCTACATTACAGTTTTTT
CTTTGAACAGAATGCTAATTTTACATAATTTGTGCAGGAGGACTTTAAGC
CTATCCTAAAAGAACTCTTGGCAACTCACCCAGGTTTAGAGTTTCTACAG
GGCACTCCTGAGTTTCAGGAGAGATACGGTAACTTTATGCAAGTTACCTG
GTAGCTGTTAGCTCTTCAACCAGTATTCTTCATTTGTATTGTGCTTGGAT
GTACATTTTGAGTCATCTGTTCTATCAAAAACCAATGCCACCTGTAGTTT
CTATAATGAAAATAATTTATCCCTAGCAAGATGGTTTCATTTGCAAATTG
TTATGTTTCTTCAGCCCACCTTTTCAGTATCCTTTGCCATATATTTTCCA
GACATATATCCTTTTACGTTGCTTATTATTAGTTTTCAGGGAGATGGAGT
ATATAATTTGTTAATGAGGCCTAACAATGTAAAAGAATAAGGCATCAAGT
CCTTCATTCTTCTGTTCACTTGGAGCTGATGAGAATTAAATTATTGGGCC
TGACGTGGTAGTCGGGAAGTTCTGTACCTGATTGTAGATCGGCACCCAAA
TTTGTTATTAGAAAGTTAAAACTGAATGGGTTTTGCTAGAAGTTGATATC
TATACTTATTCTATGTCGGTGTCAAAAATATATAAACATCTAAGCGATGA
GCTGTCTGTTTGACTATTTGAAGAAGTCGTAATGGTTCGCCATCCTCTAC
TATATTCCCTCTGTTCCAAAATATAAGGTTTTTTTAGCCTTTTTCTGGAA
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AACCTTTCAGAAAAAGGCGTCTAGATACATGTGTTTCAGAAAAAGGCTGT
AAAACATCTTATAATTTGAAACGGAGGGTATGATTACAAAACTGAATGTC
CCAGACCTGCAGAGCTATTCTAATGTCAAAAATTAATGGGGGAATGATGT
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ATCTGCTATTTTTTTCTTCTGCCAAGCAGCATATGAAACGAAATATTATA
GTCATGAATGTCGGTATGCAAATATAAGCTGCTTGCAGAGCATTCTCCTT
TTTGTCCAATGTCATTAATTTGATTAAAAAAATGGAAATTATGAACTAAT
ACAGGTGATGTTGAATCTCATTCCTATGCTAATCATGTTTTAATGTATTT
TTCAGCGGAGACTGTAATATACAGAATCTTTTACTCCATAAATAGATGTG
GAAATGGCCATCTTACCCTTCGAGAGCTAAAACGTGGGAATTTAGTAGCT
GCGATGCAGCAGCTGGATGAGGAAGAGGACATCAACAAAGTGCTGAGGTA
ATTGATGTATAGAACTGCATGCTCATTTTGCATGCATTCCCCAAGATCTC
TCAGTGTGATGGGTGTTTCCATTAGAATTATGTTTTAGCTCGTTACATGT
TTTTTACATGTGCTCCTCCATTATGGTGTTACGATTTTCAGTCGATGCTA
CTTTACGTAGCAAATAATGAAGATTTTACATGTTTTTTGTATGAGTTTCT
CAGCTCGTCATATCTGCTGCAGATATTTCTCATATGAGCATTTTTATGTG
ATCTACTGCAAATTCTGGGAGCTGGACACAGATCATGATTTCCTGATTGA
CAAAGAGAACCTTATTAGATATGGAAATCATTCGTTGACCTACAGAATAG
TTGATAGAGTCTTCTCACAGGTTAGTCTGTTCCTAGTTTATATTGAGAAC
CTAGATGCTTGTTTGCGGTACTGTTAAGGTTTGTGTATTTACAGTGGCTG
TTGTACCACTACTCAGGTCCCAAGGAAGTTCACAAGCGTTACCGAAGGAA
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TCATCTGAACCTAGCCTTGAGTACTGGTAATTGTGTTCTCCTGTCTGACA
TGACTTCTATATTACCTGTAACTTCTTGTCTTTGGGATTGCTTTAATTAA
TTGTAAAGAAGTTTCATCCTTTGAATGTGTTCTCAAATGCGTCATGGTTC
CTGTTCTCTCCTATTGGATATCCAGGCATTGAACTTCCATGTAAATTCCC
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GTGAAACATGTTGCTTCAAATTTCCAACATGGTGGTATCCCCTGTGGTAA
ACCTGCGCACATGCATATAATTAAGTTGCGAAGTTCACTCAATTTGATCT
GTATATAGTCCACACTTAAATATCTAAAGCATCTTATAATTGTGAACGGA
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AATTTTTACAGGTTTAAGTGCATTGATCTTGATGGCAATGGCATTTTAAC
TACCAATGAAATGCAGTTTTTCTATGAGGAGCAGTTGCATCGTATGGAGT
GCATGGCACAGGAACCTGTGCTTTTTGAGGACATATTGTGCCAAATGATT
GATATGATTGGGCCAGAGGTATGTCATCCTAAATATAATTTTGTTTTGTG
GAGAGTGGATTGCAAAGAGGTCGAAAGGTTATGTGGAGGAATCACATTTT
TTTTGTTAAAGAAACACGCATTCAAAGCACACCCTTAACTAAATTTCACC
TTTCTGCAGAATGAGACCTATTTTACATTGCGGGACTTAAAAAGGTGTAA
ACTCTCAGGAAATATATTCAATATCCTATTCAATCTCAACAAATTCATGG
CATTTGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTCGCCAGGTAATGTTGCTTGCC
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CCCATAGGGAATATATTAGGCTGTCGATGGAAGAGGATGGGGAAGATGCT
TCAAATGGAAGTGGTGATGTGTGGGACGAGTCACTTGAAGCTCCATTTTG
AATTATGTGAGTTTTGTATTTTTGGACGAACTTCCATAAGTTGAGGCGTA
TTGCTAATTGAATCATGAAAACTAGGGCATAGGATATTACCAGCATTGAT
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GACTGCATGAAGCTTTGCCTTTCAGTCACACACTTCTCCATTTCCCGTTC
TGAAAAAATGCTTTTAGTTCTCAACAGAATAAGTAATAAGTTGTTTTAAT
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ATGTATGTTGCAATTTATTGTCACAATCAGAGTATTTTGATTATGGTAAG
CCAGCTGCATGCTATCAAGTTTCATAATCACCCCTTCCCAAGCAGCCACA
TGGCTCCTCTTTATATCATATAAGCTGGACAGTGGTTTCTTCAGATCATT
TCAACTTCCCTGCATCTTTGTGACCTTAGCCCAAAATAGATGTCTCAAGT
TTGTTAAAATTTGGATGAATCTATATAGCAGCCACATGGCTCCTCTTTAT
ATCATATAAGCTGGACAGTGGTTTCTTCAGATCATTTCAACTTCCCTGCA
TCTTTGTGACCTTAGTTACTATACTACTACCTCCATCCCAAAATAGATGT
CTCAAGTTTGTTAAAATTTGGATGAATCTATATACTAAATAGTGTCTAGA
TTCATCTAAATCTTGACAAATCTGAGACATCTATTTTGAGACGGAGGGAG
TACTATGTTTATTAAATCTAAAGCTTGCATACTGTGGGTGTCCCATGGGA
TTGTTTTTGAACTGGTAATATTTATGGGATGTTTATTAAGTCTTAAGTTC
TTCTCAACTTCCGAGATAAGACAAAATTTATTGATGTAAAAATCATGTTA
GGGTGGGTGTAGAATAACTATTTTTGCCACCCTGGTGGTCAAATAGCGCC
AGGGTAATGAGATGGTACTCTTGGGCGTACATACTCCCACATTCAATATA
CCACATAGATGAGTTAATTATACCTCTTTATAATTTTTAATAATATGCTT
CATTACTAAATATTAGATACCTCAAAGTGAGTTTCATGAAATTTTTCACT
TTAGTCTCTATAACTTATGGTTTTTTGCGATATACTGCTTTTTTCTGCAC
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TACTAGTATTAAGGTATCTTAGAATAATTAATGAAGTATATTGAGAATGA
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AATTGCTGTGCTCAAATTTTGGAGCTGAACTGTCAATGTTTACTGTTTGG
CTGCCATTTTCTTTGTTAATTTGTGGATGTGCAAGCCAGCAAAATTCCAT
CAGTAACTTTGATCATGGCATGTAACTTTCTGGTTCTGCTTTCTGTTTAG
TCCACTGCGTCGTTTTGGTGTGATTCTTGGTACATTTTGGAAGGATAGAC
CTCAAGACATGGCTGTGCTATGTCATTTGTAACATTAACAAGTATAACTG
TGCATTGGGTGCATAAATCTGAAATAAGGATATTACATTCGCAATCTGAT
C

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.