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GrainGenes Sequence Report: AA029618

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Sequence
AA029618
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029618
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCACGTGCTGCTGGCTGCGCTGCGGCCGAGTTGAGGATGGACACTTCAT
CGTCGGGCGCCGCCAAGGCGCGGCGGGAGAGCGGCAGCGGCAGCTGGGGC
AACGCCGGTGGCGGCAGCGCCGACCCGTTCGACATCCCCGCCAAGGGCGC
CCCCGTCGAGCGCCTGAAGAAGTGGAGGGTAAGCTCCCGCTCCTTCCTCT
ACCTTGTCTGCCTGCCTGATGCGAGCTTCGGCGAGTTTTTGGGTGGTTTT
ACGGGGAAAGCGAGTTCGTATTTTGGAAACCGAGGGTTTCTACTGCCCCT
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AAAATTTTGTTCCAACTTGTCTACTATTTGACAATGTTCGCTTCATTCAG
TACAGCACTCCCAGATATTGCAAACGACACATTTCTGTTGTTACCATGTG
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ATCCGGGGCCAGTGACCACAGCTGTTGTACCCCATTCAGAAATTTAATAA
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GCAGCGTATCGTTTTAAAGCGGCGGCCCAAGTCAATGTTCAGCCAAAGGA
GACAACAGGTACTCTTTCTCTTGTTATCTAGTCACCTGTTATTATTTTTG
CTTGTGCTCCTCCATATAATTGCCCTTAGGGTTTGAGGTGCTCATGTATT
CCATCCAAGCAGACCATTTGTGAATGCTATGCTGGTGTACTGTTGCTAAT
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ACATGTCGATGGTGCACTTGGTTTTGGAATTAAAGAAGAAGAGCTCACTG
CACTGTCCAGAGATCACAACTTCTCTGCTCTACAGCAGTATGGAGGGGTG
AGCTAATTCTGCTTTTGCTGCGTTTGACATCCATCTGTGATAGATTCCAC
CTTTTAACTTCCCTACAGATTTCAGGGGTAGCAAATATGCTAAAGACAGA
TACAGAGAAGGGAATAAGTGGAGACGAGCCAGATCTGAAGGCAAGGCAAA
ATGCATTTGGGTCCAATACATACCCCCGCAAAAAAGGGAGAAGCTTCCTG
GTATGCAGATGGTTCTCTTATTAATTGTATGGGAGTTCTCATCTCTCTGG
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CACTATCTTTGGGCATATATACAGAGGTGTGCATCACATCTTTAGTTCTT
TCCTTACATCTGAATTGGCCAAGCATCATTTCTTGTTCAATTTACCTCCT
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GCTGTTCTCCTTGTTGTATTTGTTACAGGTATTGCCAGCGCCAATCACAT
TTCCTAAGGTTATAGTTGTGAGCAGTTGTAAACTTGTAATACATATTGAT
TTCATTGCAGCTACTACTGATTACAAACAGTCACTGCAGTTCCAAAATTT
GAATGAAGAGAAACAAAATATCAACTTAGAGGTAAACTTGTGGCACACCA
TATTATAGATAGTTTATTCATTCCCAAATAACGGCCCGAATAATCTCATT
CAGGTAGTTAGAGCTGGAAGGCGAATCAAGGTATCAATATATGATTTGGT
TGTTGGCGATGTCGTACCTCTTAAGATTGGTGACCAGGTAAAAGACAGTT
GACCATCATTTTATACCAACTGGCTGCAAGCAGTTTAGAAATATGAGGGA
CAATTTCATTGTTCAGGTACCTGCTGATGGTATCCTTATCAGTGGTCATT
CCTTCTCGATAGATGAATCAAGTATGACAGGGGAAAGCAAAATCGTGAGT
TGCCCTCATACATACTTTAAGAACATACTTTAGGAACTAACTTACTTGGA
AAGTTCTAAGCTTATACTGCAAGGACGTGGTTCATTTTAGGTAAACAAAG
ACCAGAAGTCACCGTTCATGATGTCTGGTTGCAAAGTTGCTGATGGCTAC
GGTACAATGCTGGTGAGTTTGTCCCTGTTCCTACAAAATGGAGAATGAAA
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TGGAGCGAATCTCAATACAGTTAACTGATATGATTATAAGATGACCAATT
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ACATTAGTTGGTAGTATGTGCTGATTTTGGAAGTTTATTGTAGTCAATAA
AAGTTGCATCTATTAATTTTTTTGTAAGTTAATCATGCATACCTCATGTA
CTAAAATGTTAATCTGTAACGAGTCTTATGATTTACATCTGTAAAGCCCA
GCTTGGAATAGAGCGTAGTTTAACTGGTGAATATAATTGACTCGCACCTG
AGTGAGCTTGAGCTCATAGCGCAGTTATTTTGGGTTTCGTAGTATGTATT
TTGAATAAGCTCTTTAATCAGTATATAATGTAAGGGCTGGCGACACGCTA
GTGAGGGCTCTTACATGAACATTGATCATGAGACTTATAATATCCAGGTG
ACCGCTGTGGGTATTAATACTGAATGGGGATTGCTAATGGCCAGCATATC
AGAAGATTCTGGTGAAGAAACACCTTTGCAGGTTTGATCTCATAATTCTT
ACTAACCTTGCATGAGCACATGCGTTGGCATGCTTTTTTGAGCACATGCG
TTGGCATTCTTGTATTCTCATGTAGGTCCGCTTGAATGGTGTCGCTACCT
TTATTGGAATAATTGGACTTTCTGTTGCTGTTCTTGTTCTTGTTGTCCTC
GTGGCCAGGTATAATCGATGCATGTTTTAGTTTGCCAAGTACCTTTTTGG
CTTATCTGTGTCACTGCGCTTTCTTCTAGGTACTTCACTGGGCATACGTA
CAATCCAGACGGGTCTCCGCAATATGTGAAAGGAAAGATGGGTGTAGGTG
CAACAATACGTGGAATAGTTAAAATCTTCACAGTGGCGGTAGGTATTAGC
TTTACTGTTCATGGCTGCCAGTTCAGTTTTGACATTTTCTGTTACCTTAC
CATCTTGGGATGTTATTAGGTCACCATTGTGGTTGTGGCTGTTCCTGAAG
GACTTCCTTTGGCTGTCACGTTGACGTAAGCATGAATTTACTATAATTTA
CTAGTAGCACTACTAGCAATAATTTACGCTGAATATTTCTTCCAGGCTTG
CTTTTTCAATGCGTAAAATGATGCGGGACAAAGCTCTGGTATGTTGCCAT
TGCTTGCATGCTTTGGGGTACTTGTTGTGACTTGCAACAGGCTGTCTGAT
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TAATACTTGGAAATATAAGATAAGGAATTGTGATTCTTCAAATATGCTTG
GCCTTGACTTTCCTCTTTCTTCACTGTCAATGTTAAAGATGACTGTTGTC
GAGGCATACTTTGGTGGGAAGAAGATGGTTCCTACTGATAACACTGAGAT
GTTATCTGCTACTGTATCGACCAAGGTTATTGAAGGAATTGCTCAGAATA
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CCTTTTCTTCCATGAAACCAAACATCAGTTTTGTTTTTCGCTCTTGTGGT
ATGGATTAACCTGGTGGCTACTGACTTTTGTTCAATGTTGCAGGGTGGTC
AAGCTCCAGAGGTGACTGGATCGCCAACTGAAAAGGCTATATTGTCTTGG
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TTATCTGGAGCAATGTCAACTCGCTTCTGGATATAAGCAATAATGTTTCA
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ATGTCTCGTTCCAATGGTGTTAGTATGTACATTTACAACTGACTACAACT
AACCATGCACATCCTCGCCTTCAAAGGCTCTAACAAAATATGAAAAGAGG
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TTGGTGAATTTAAGAAATTTATAGAAGACATGGCCGTTGCTAGCCTTCGA
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GGATCAGAGGGCTGAGTGGGTATTACCTGAAGACAACCTGATTATGCTTG
GTATTGTAGGAATAAAGGTAATTAGTGAACATGCATTTTATGCTTTTAAT
GACTGCTATTGATGGATTATTTTTATTTGATCGACGATCATTACTTGTCG
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TTACTGTAACATTTGCTGACATAACGCAGCAGCTTTAATGAGGCATTAGT
CATCTAGAACGGTGCTTTCAAGAAAATAACTGCATTAGTCTTCAAGAAAT
TTACTACTAGTTTGAATTATAGGATCCCTGCCGCCCAGGAGTTCAAGATT
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GTTTTAGCCGTACAATTAAGTGTACTCTATGTAACTTGTAACAGGTGATG
GGGAGGTCTTCACCAAATGATAAGCTTTTATTTGTTAAGGCACTGAGGAA
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ATTTTTCAGTTCTCTGCTGTTGTTTCTGTATGTTAACTGTAATTTTTTAA
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TGGTTTCTTGAGATAATATTTGAATCGATTTACCAATTTTTCTGGGCTTG
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TTTTTTGGATGTAGCTGTCAACCACTGCAGTAGTGACTGTATATGAACAA
TTTTGTGAAGAACGGATACACTGCGGTAGTGACTGTATACGAACAATTTT
GTGAAGAATGGATATACAATATTGTTTTTCATTTTTCTTTATTGGATGTA
GCTGTGAACGGACCGAGGTTGAGTGAGCCTGGAGCTGGGCTCAAACTTGG
CTGTTCTATACTTTTTTTAACAGAACTTCTGCATTCCATTGAACCACCCA
CAAAATAAAGAAAAGAATCTGGCATAGCCTCTGGCCCAGGGTCGTTTTCG
CTTGGTAACAAAATCACGCATGGTTCATATGAGTACTAGAAATTGTAGGG
ATTCATCTCTGATCACTCCAGGACACCAAGGCTAAAAGATTCACCAAGAC
TAGGAGTCGGTGCTCCTTCCTTGACATCTTTTGGGAGCCAGGTCACCGGG
GAAATCGTACTGCTAATTCATCCAGACCATTAAGATCTTTATCTGCCCAT
CGTTAATCTATCAAGACCAAAAGTTGGGACGTGTGTGGTATGTTGTTACT
TGGTTCTGCGCGCTGTGCTGCCATAGTGTAGTGTAGATGTGACGGTTTGT
GTGGGGTTACTCGTCTTGCTGGGCTTGCGTAACTTCTTGTCAGGCTTGAG
CTCGGGTTGAATCTAGACCAGTGAGCTCAAGTAGTTTGTGTTAGTACTAG
TTGCATAAAACTGCTTGATGACTTGCAGTTGTACTAAACATCTTCCAATA
CGTTTGTGTTGACACTAGTGGTAGCTTAATGATATTTATTACTTCACAAA
CGCATTTGTATCACGTGCTGTGTCGGCAGCTTCTATTCTGCAAGTACCAA
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TCTCACTCTTAACTTCAAGGGTCAGAGCCTTCTGCAGTTGAAACATGATA
ACGCAGCACATGCTGAAACATTGAAAAATACCTTCATATTCAACACATTC
GTTCTGTGCCAAGTGAGTTCTTTCCTTCTGCGCTAATCTGACTAGGAGAT
ATGCATACAGTTGATGCGTGGGGTTAAACTTGGTCACTCAATCTTGTCTT
CCTCAGGTGTTCAATGAGTTCAATGCTAGGAAACCAGATGAGCTAAATGT
ATTCAAGGGTATTACTGGCAACCATCTCTTCATGGCCATTATAGCGATAA
CAGTTGTACTCCAGGTAAAGGCGCTAAAATAGTGTTTCTTTATGTCACAT
GTGGCTATCTTGGTTTTTGCTGTTGTCATGGGCTTATATTCCTATATTGT
GTCCAGGTACTTATCATCGAGTTCCTTGGCAAGTTCACATCAACAGTCCA
GCTGAGCTGGCAGCTGTGGTTGGTGTCAATAGGTCTTGCTTTTGTCAGGT
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TGTTGTGGAATGATTTTTTGGTATTATACAGTCAATTTTTATGAAGATTT
TGTTGGCACTTTTGTTTTGATGAAAATTAGCTAATGAATTTCTTGTATTT
TATGCAGCTGGCCATTGGCACTCCTGGGAAAGCTTATCCCTGTTCCTGAC
CGTCCGTTGTCAGATTTTTTTGCGTGCTGCTGCCCTGGGAAGAAACCGGG
TATGTTTGAATTGCATCTAACAGTGTACTCCCTCTGTTCCATAATATAAG
ATGTTTTAGCTTGTGTGAAACGAATGAACACCCCATTAGGGTACCCTTTA
CCCACTTAGTACAAAAAAATGAACTAAGTTTTGGCAAAACACCACTTTTT
GAGAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACTAGGCTAAACTAGAGGGTATCCTA
AAGGTTCCAAAGTTTCATCTCTACTGAACCTACACTAAAAGAAGTCTAGA
TACATTCGTTTCACAAAAGCTAAAACAACTTTTATTTTGAAATGGCGGGA
GTACTTGTTTGCCGGTTCTCTAGGGAGTGGAGTTCATACTTGTGCCATGG
GGCAACCATCTTGTACAAATCTTCCCCTAATGACAATTTTCTTGTGCAGC
TGACGATGCGAAGGAGGAGGGCAGTGCTAAGCATAGTGAAGTATGAATGA
AGGATCGGCGTCGAGGACCTTATGCAGTTTTTTTGGTCGAGGTTTAACAT
GATTGAGCTGTAGTTATGTGGTGATTTGTTGCTCCTGTAGATACTCTAGG
CTTCATGTGGATAGGTCCTCACTTTTGGAAACTTTTCACGCTATCTTAAC
CTCACGCGTCACTCCCGAACGCTGACTTGGAAACTGGAATTAATCCTGTT
TGTGTAGACGAAGCTGGAATTTCGCTTAAATGGATGTTTGAGAGGAGTAC
TTATGATTCTCCTTTGCGTTTGTTCCACAAGCCCATCAATCTGGTTTTGT
CATCTCTTGGCGGCTTGCTTGTGCTTTCTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.