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GrainGenes Sequence Report: AA028643

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Sequence
AA028643
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028643
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAATGGAGAGGCATCTGTGAGATGGCAGCAGGACAGGAGAGAAGGTTGA
CTATTATCTGTCATCTCAGTGTGTCATCGCGTCGGGCAACGTGCCGCCGC
TAATGATTCTCTCTCTCTCTTCAGCCATTACTAATTAATGGGTTGTACTG
TTCTACAGTACTAGTATAATTGATTAATTAACTGATCGGTTTTCATTAGT
AGCGCAGGCAGCTGCTGACAGCAGCTCCCGTTTGGATTCGTGCGCAGCAC
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ATCACAGTGGCGCCACCTCTCGAATCCTCCCCGCATCTCATCTCATCTCG
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TCGAAAACTGAGAGACGCCAACAAGATAATGATCCTGTTAAACAGTTATT
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ATTCCCAAGCATCAGATGCACTGATTTCTGTCTGGCTGCCCAAAGTTTTT
TCTCTCTTTTAATAATCCCCTTTGTATCCAACTTCACACAGCTCAAAATG
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AGACCTCCTATGCAGATTGTTATACTTATTGTGGGAACAAGGGGAGATGT
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ATGAATATTAATTCCATTGGTATATTCGCACTCTGAGCAGATATGGTGAA
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GATCCTGACACTGGCATTCCTTTCAAAGTGGATGCTATTATTGCTAATCC
ACCAGCATATGGTTAGTGTATCTTGCTTACTTTGGATTATTTTCTTACGA
TGTGCTTTAGTTTCCCTAAAGCATAGGGTGGAAAGGCAAATTTCACTTAC
TAATAATACTACACAACCTTAGGGTCTATTTCTTGGCAAAGAAAAAAATC
TGTATTCTGTACATACTCATTTACATCGCTGTTAGGATGAGGATCCTCTT
AGAATTGTACCTTGAAATCTTTGTTATCACCACTACAAGTTGCAGAACAC
TATTCTACATGGTTCTTCTCAATCAAGATCCTATGTATAGTCGGGATTGA
ATTCTCCCACATTATCATAGGATTCTATGATAACAATTAACTATAATATT
AATCGAATCCTGACAACCTTTCTCATGCACGGCTCAATCTTGCAACTTTC
AGTTTAATTTACCTATACAGACCAAATTGTTGTAGCGACAGCTCAATTAC
TTACTTTATGCTTTACATGGTGATGGTTTACTTTGTTTTGCCATTAATTA
GGAGATTGGCTTAGTAATAAACTCATGAATTTCTCTTCTATTTCACCTTT
TCTCTAGAGGCTTCTCTTTTGTGCCAGGGCTTGAAAATGGTTATTTTTTA
CTGAAAAATCATGCTGCTGTAACATGTTGTATGGCCTTTCATTTGCCAAA
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ATCACTTCATGGATAAAATTGATTGACACAACTAAAAGAGGACCATTTTT
TTATGAGATTATTTTCCGACAAATAAACACTTGCCTGTTTTTTGTTGTAA
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AGGATTTAAAACCTTACATGACCACTGTAAACCTATCAGAATAGTGCATC
TTGAAAACCAGTGCCATGTTATAATTTGACCTGTTTAAGTTTAGGGGCTA
AACGTCTGCTTAAAGCAGAGGGTGTTATACGGAACTATACACAAAGTATG
GACCTGTTCCTTTTTCAAAATAGGGCCTGTCAGTTGTGAGGAGATAAAAG
ATATACTGAACCTTTGTTTTTTAGCTGGAAATGGAACAACCACAATGGGG
TGGCTATAGTCTCATTGAATTCAAGAGTTTTAGTCCATGCCTTATTACAT
TTAATAAATGGTACCACTGCCCTCTAATGTCCACATGATGGGGTGATAAA
ATGTCTTGCATAGGTGTTTATATGTGCCTTTGGATCACTTTATTTATTAT
TCATATTTTTCTCTTTTATGATCCAGATAACCATGTTAATATACTTTATT
ACGATATGTAAAATTACGAATTTTCTGATCCTGCTGACCTCAATGTTTAT
TCAGGACATGAACACGTGGCAGAAGCACTAAAAGTACCCATTCATATATT
CTTTACCATGCCATGGACGTGAGTACTGTTGTTATGCTTCCTTTTTGAAG
ACAGTTGCTGAGGAATATTCATTTGGAGATCTAACTTATGCTGCTTGTTC
AGGCCAACTAGTGAATATCCTCATCTTCTTTCTCGCGTGAAAACACCAGC
TGCATATCGAGTGAGTTTATGTTGTATTTACTATTTGTCCAGAGCATCGG
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CTGCTATCTATTATTATTTATCTTTCGTGTCGTCAATGGGTTGAGTTAAA
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TGGTTATATTTGAAATGTATAGTTGGTTATAGCTCATATGCATTGAGGCA
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GTATTAACTTCTTGCACATGTATGTTCTCTTGCTATGTACATTGCTTTAG
TTTTCCTAATTCATGCGGAGTTCTTTACAACAACTGGATTCTTTCTTTAT
TGGTGCTGCCTTCAGGACCATATAGTCGCAGTATAAGCATCAAGTCTGAG
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CGGTATGGCTGACTTCAGCTTTTGCAATCATAATCAATAGCCTAAACCTT
ATTGGCCGCAAGCATTTGTCTGAAGATCTACTTGAACTGGATGCCCTAGA
TGTTATTTCTTGAAATAGTATCATTTCCCCTGCTGATCTGTTACCTTCTA
ATGTCTGTCAACATTTACAGCTTTCTTACCAAATTGTTGACTCTATGATT
TGGCTTGGGATACGGGATATGATAAATGAATTCAGGAAAAAGAAGTTGAA
GCTGCGCCCAGTAACATACCTAAGTGGTTCACAGGGTTCTGGAAGTGACA
TTCCTCATGGATACATCTGGAGTCCTCATCTTGCCCCAAAACCAAAAGGT
CTTCGATTATATTAATTTGAGCTGAAATTGGATCATGTTTGACGTTGTCA
TTCTTGATTGCGTTAATTGCCATTTACCAACATTTAGGCATTTATATGGT
CAAATGATTTTGTTTCTACTCCATTTTCTGTATACAAATTACAAATGGGC
AAAGTTAAGATAGTACCAGGTCCATTTGGTTTCCCTGCTTCAACCTTGTA
TCTTTCATGAATCCATCCCTCCTAGTCTTTATGAAATATAAATCTGGTGA
CTTAAGTAGTTAACTAGATAGTGGTGATGGCACTAGTGAATTAGTGATGT
AGCATACACAGAACCATTGCAGCACTCCTTCAAACTTCTCAATAGGTTGT
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CTCATATTGAGATTGTAATTGCAGTTGTGATGCACAAATGGAGTAGTTTA
TTGAGAAAACTATAGCATTGAAATTTTCTGATGAAGTTTATCCTGGACCC
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CCTTGATCTTGCTTCTGATTACGTACCACCTGAAGAACTTGTGAAATGGC
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TCAGTTTGACCTTCTTATATTTACTGCATGTCGTTTTCAGCTCCATTTTC
TTATTCTGTTATGGTGCATTAGTTGACCTATTGTGTCTCAACTTGTTTTT
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AACTGGTTTGTCACTTGGAAGCTTTGCAGTGTCTCATAGCTTCTCATAGC
AGAAGCTATTTGTGTGCTTGAGGCCGTGGTACCAATGTTTAGCTGCGTTA
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TGCTGTTGCATCTAAATAGACTCTCAATTAACTGTGAAATCTAAAAATTG
TAATGCTATCTCCTTTTGGAAAGCTACAGCAATTCCTTAAGCCCTTAACT
AATTTTACATTTTTTTCATGATATACTAGCCAGTTCAAGATCCAGCAAAG
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TGAATCTTGAACCTTTTGCAGTGGCAGAACCAAAAGATTCCATATATGTA
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AAGCCATTGCTTGTTACTCTTGGTTCATGAATCACACTATCTTTTATTAA
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TTAATTGATAATTTTGGTGAAAGCACTCTAGTGTGATCACTATAGTGATA
ATAATGTCTGTGTGTTCAATTGTGGGTAGGTCTCAAACTTTCTTTTTACA
TCCATAGGTGCACCATGGTGGAGCTGGAACGACAGCTGCCGGCCTGAAAG
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GACTTTCACAGTATTCTCGATACAAATACTGTATTACAAGTAAATTTTTG
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TCTTCTCAGTGCATGCCTGCAGTTATTTGTAGTCTCTCTGATAAAGGACC
TATTACTGTCTAACTGGCTCTGCAACTGACTATTAGCACCTGATCATAAT
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GGGTAGGCCCTGCGCCTATACCAGTTGATCAATTCAATTTGCAGAAGCTG
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CAGATGTATTTATTCATTTAAGTTACGTATAATGACCATATTAAAATCAT
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ATCTGATGAAACAAAAATATACACTGTTGCAGATCTGTTTATCCATTCGT
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TGTTTATCAGATTATTTGCCTGCATGCTAGAATTTATGAAGAAAGAAAAA
CGGTAGGAAAAATTTACACCGGGAGACATCAACCAAACGAATGTGTAAAT
ATATACCCCATTACATAGAACTCATTTCGTAGTAAATGCAGAAATAAAGC
CAGTGGATTAGCACCATCAGATTTAGTAATTTACCATGAAAATTTTGGTA
CAATGGAATGGCATGCCCTTCCAAAACAATAATAGAACGAAATTTACTTT
AATGCTACTACTGAATCGCTGATACATATCAAGGTCTCCAGAAAATTCAG
CGCAGGAACTATCCAGCGGGAATGTTGCTTCTAGCCCTCTCAAGCAGAGC
AACCTGAAGCAGCACGCATTGCATATAGCTTCTAGAACAGAATATCCACA
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AAGCACAAGGAAGGATTTTGTTTCTTAAAACAAAAGTATGAGCAGCAGTA
CATTTTTCTGGTCCAAAGAAAAGTAATAGATGATAGGGGTCCGTCTTTGG
ATCTTTGGTGCCACCAACAGGGGCTCGTGACACAGCGTAAGCAGGGTTTG
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CCAAACCTGTAGGTGCATCGTTCGGGAGGAGGCTTGTTCACAATGAGCTT
CTGTACGACGTGACGCGCGCGCGTCGGACAACCAGGAAGGGGGTGACACC
GCGGTGGCGTTCGCACAGTCTCCTACGCAGGCACCGATGCTGCACGGCTG
TGGAGTTGACGACCAGTAGATGACCGGCCCGGTAGGACGGTCCTGCCTCA
GCAGCTGCCTGGGGTCTGAATCTGGGCAGGGGTTGACGAGTGGTTCGTGC
ACGGCGGCAGCTCCCCCGACCCGGCTGGCATCGTGCAGGAGCCTCCGATG
GTCCCCACAGCTGAAATGAAACAACCGACCTCCAATCCTTCTGGTCAGAC
CCAAGTGAGCGATGCTTACTCAACGGAGATGATATCCCAAATGGCCGCTT
ACCCACCAGCATTGGACTAACAGCCCTCCATGCATGGCTGCAGCTCCCAT
GACCGGGCCGGCGTTGTGCAGGAGCCTCCGATGGTCCCTGCAGCTGAACC
GAAACAACCGCCCTCCAATCCTTCTGGTCGGACCCAAGTGAGCGATGCTT
ACTCGATGGAGATGATATCCCAGATGGCTGCTTACCCGCCGGTTCGCGCT
GCCACCGGTCGTGCGTCGTTTCCGCCCATAAGCTCCAGGATCTTGCGGAA
AGAATTGACCTCCTCCTCCCTGTTCTATATTCTCGCATGCCAAGGCCAAG
GAAGCAAGAGCGACCAGCGCCAGCACCATCGCGGAAGTCCTCGGCATCAT
GGCCCGTGCGCCATCCCAGATCTTACTGAGATATTTGTGGAATTAGGTAA
ATGAGGGCTGGGATTACTCAGATTAGGGCAGCGCTGTTTGGCTCCGACTG
GAACGGGAGAGTGAACCTCGCCGGCAGCGGAAAGGATTTGTAAGCTCGCG
GGCCCTGACCCGGTGGCTATCGCGCAAGAACGATTTGTGAACACCGCCGG
TGGAGGAGGCAGGGGGAGGGGATTCAGTGGCTTTTCCTGAAGGAACCATT
TGGTTTGACTTAGGCGGTGGTAGTGTCCATAAGAGCAGCAATCTATAGGG
GCAAATTCGTCCAAAAAAGTGTAGGAAGGATTTATTATTAGTTATAGATT
TGCTGGTTAACGAGCACCCTTGTACTCGTATGATTACCTCCCTTCCCCCC
ATCTTATAGCTTTTCACACACGCAGAAAAGAAATATGGACAGGTTTATTA
CTTAGTGTGTTTAGTGAGTATCAAGTCCTCGACAAAACCTTCTTTACTTA
AAACAATGTCCAAGTATTTAGGACGAATGATCATTTACTTTATGTTTTGT
TAAGATTTTGTTGTCAGCTGTGACTCACCACTATATCGAGGGTTCCAAAA
GCCAGTAACCTACTAGTTACTGCCAAGAAGCAGGAACTGGTCTGGACCCA
TTCCCTTAATTTGGATCTTTAGAATGTTATTTAGATCTTAGTTTTCAATT
GGATTGGCTTTTGGGAAATACACAAACTAGCACTGAACTAAAATTTCCAT
GTTTGGAATTTGCTGGTTTGTACAGTACATGATCTATTGGTTAGAAAATT
ACACGTAACCGACTTCCCATGTGATTCTAGGTAAAAGAAAAGGCCGTGGA
GCTTGCCAAGGCCATGGAAAATGAGGATGGTGTAACCGGTGCAGTTAAGG
CATTCCTCAAACATCTGCCTACTTCAAAAGAAGATGAAAATTCACCCCCG
CCTACGCCGCCTGGCTTCGTAGATTTCCTAGGCCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.