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GrainGenes Sequence Report: AA025110

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Sequence
AA025110
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA025110
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTTCCCCACTCGGTTAGCCCTATGCCATAGAAGGTGCTCACAAAGTCTCC
TTCCTTGCGAAATCACACTGAATGCAACACACTGACATAGCATGCCCACA
CCTCAGATGACGTTCGAACTACCAAACAACTAGAGAGAATATCACCAAAC
TTAGCAGCTAAGAGCGATCTGTCGCCAAAATTTCTCACGGTCGCAGAAAG
CTACCAATCCTAGCATACGGAACCACCTAGTCACGCAGAAGCAAGTACCA
CGGAGCTCCTAAGCTACGGAATCGAAGCGAGCGGCGTGGTCAGAACTCGG
CTCACCTCCCGATCTCGCCGGCGGGAAGGAGCGCCCCGCGGAGCCTCCGG
ACGCCGAAGTGCTCGCCTCGTCCATCACGCCCCGAGAGCTCGCCGCACAG
GCCCCGCCCGCTCGCCGGAGTCCGTGCTTCGCTGGGGATCGGAGTTGTGG
ACGAGAGCCGGAAGAAAAGAAGAATAGAATGCAGGTATTTTTTTTTTGGA
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AAGGGAAGCTCGATTTGTTTTGGGCACGATTCGACCAAGACCTAGGATAG
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GTGAAAAGTGCCACCAGCAAAACATAGGGTAACGAAAGGAAGAGACAGCA
AGCAAACACAACTAGCCATATTACACATCTGAAACCATCAAAAGAAGTAT
CGCCGCCATCTTAAACAGGGGTTTCAGTAGAGTCCTGAGCATCCTGATCA
TGAACTAGTTGCAGCACCTTCTGCATCTGCTGTTCTGACCTGGTTGTGAA
CCCAAGGGTTTGTGCTGTCTAATGGTATATTGCCTCTGTAAAGTTGGAAA
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ACGCTTTGCTTGTTAGAATTTTTAAGCTATGCAAGTTATTTTCATATATT
TGTTTCATGGGAAACCTGACTCTGTTATCACCCTTCTGCAATCTAGAGTC
TAGCCAGAATACTTTGTTAACAATCTTGTCATATACTCGTGATTTTCCAC
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ACCTGCTATGCAAATTAATATAGTAAGCATAGATTGGTTGGGTAGCAAAC
AAGCTTCCAGGGTTGATTCCTCGTCACACGTTGCACCACATGCCTATGGG
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CTGTCGACCATGGGAGCGTGGAGATTTACTTCGTCGACTGGCAACATTTA
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TGCAGTTGTATGAATTTTGTATTTTTATATTTAAATTTGCGATAAGAGAT
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TTTGCTGTGATATCACTTATGATGCTTACTGCTAGCTTGGATATAGTGAA
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TTCTACTCCTGTTATCATAATTTGAGCCAAATTTAACTTTTTGCAGGCTG
CTAGTTCATTGGCTTGCGCTCAAAGAGGCTGGGTGAATGCTGATATGAAC
AAGATTGAATGTGAATCGTGTGGTGCACATCTTATATTCAGTGTGCTGGC
ATCCTGGTCTCCAGCTGAAGGTATGTTCTCAGTTAGTATGCTTTTGTTGA
AATTTGTTTGAGAGGTAGCTGCTATCTTGCCATCTTTCTGATTTGTCACC
TTCCAGCCTTATTAAATAGATTTGACTTGATATCATTGGTAGTTGAAAAA
TTGAGATGGATCATGTTATGTGTTGGCTCCTTCATCTTCCAGCCTTATTA
AATAGATTTGACTTGGTATCATTGGTAGTTGAAATTTTGAGATGGATCAT
GTTATGTGTTGTGCTGCTTCATGAAAATATATATATATATGTTTATAGGC
CATGCTCCTCACTTGACAAGAATTGATAGTTTGATTTACCGGCTGTTTAA
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GATAACATCTATGCCCAGTGCTGTAATTTTTCGTAAATCTAACTGATGTT
ACTTATGTTTCGATGGTGTGCTAGGCTGGATTGTTTTATTGCTACACCTC
CTCTTTGCAAACTGAATTTTATTCAGCTGTGAAACCTTTCTTTGTGTGTT
GTGTATTAGTTGCAAATGCTGGAGAAGCCTTTGCAGAGCAGCTTGATGCA
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GATTCAGCTCCACCTTACACAGTCCGCGCTTATTGGAGGCTTTAAAGATC
GTTGTGATGGACTTCTACAGTTTCTCTCTCTTCCTGTGATTGCTTCATCT
GCAATTGAGAATATGAGGTTGACCAGGTCTGCACAGATTAACCGCCTATT
AACCCAGTCGATTACCTTCTTATCTGGAGAACTTGGTTACAAAGCTGAGA
GTACACCAGGAGTTGACATCCATCAAGGTTCCTCATGTGGCTACTCACGA
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CTACTATAGTATTATTCTTCGATCGTGTAGCTTTCTTTAATTCAATTGCT
GTTTCTGTTTTACTTCTTAGGCGCAGAAGCTTATAAGCCTTTGTGGATGG
GAGCCTAGGTGGCTTCCAAATGTTCAAGACTGTGAAGAAAATTCAACCCG
CTCGGCCAAAAATGCACTCTCAAATGAACCCGATGAACATCAGAAAAGTT
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AAAGATTCTGGATGCAGCATGAGCTCACCTTTATTAGATTGTAGCCTGTG
TGGAGCTACAGTTAGGATCTGGGACTTCAGATCTGTGTCACGTCCTACTC
GTTTTAGTCCAAATAACATTGATGCACCAGAAACAGGCAAAAAGCTAACA
CTGACACGTGGAATTAGTGCAGCCAGTGGGATCAATGGATGGGTTAATGA
TGGGGTGGTAAGAGATCAAGCTGACGGGCGTGATGAAGCAGCAACTTATG
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GGAGGACTACCACCAATTCATTCTGCAGTCCCTACTGCATCTGAGGGCTT
TAATGGAGGAATGGGAAGAGACCTGATGATTGCACAGCCCACTGGAAGTG
AAGTTGGTGATCGTGCAACGTCATATGAGTCTCGGGGTCCAAGCTCGCGG
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GGCTCAGCATGCTGACAGCATAGAAGGTACTGTCATTGATCGTGACGGTG
AAGAAGTTGACGATGATGTGCAAGATTCAGACATCCAGAATAAAAGATCC
CGTGGGTTCAACTTTTTTGATGCCAATCTTCCATCTTCTTCTGGAGCGGG
TCCTAGTAGAAACTTTTGCATTGACTCTGATGTAGATACCAGTATATTTG
GTCACTCTAGAGCTGTTGGTCTTGGTCCTGTTGAGCATCCATCTGCTAGA
GATTCTATGAGGGCATCTTCTGTTATTGCAATGGATATTCGCAGCGCTGA
CGAAGATTCGATGGAGAGTGTTGAGTACCATCCAGATGCTGGCATTGATA
TTAATATGCCTTCATCTAGTGGGCACAGGAATGTCGATATGCATGATGCA
TTCGATCTCAATGATAGCAACCAAGCACAGCAAAGTGCTTGTGCACAACC
TGCTGCTGGAAGTGACGGAAGGGAGATAGGAGGAAGCAGTACAAATGAAG
GGGAGGAAGTACTTAATGCAGGCACAACTTCTGCTTTTGCAAGGGATCAA
CTTAGCTTAGGAATTAGTGGTGGGAGTGTTGGCATGGGTGTTAGTCACGA
GGCCGAAATTCATGGCATTGATGTTTCTTTGCAAAGAACTGAGAGTGTTG
TAGGCGATGCAGAACCTATTACTGACCTTACTGAGACAATGGGTCATACT
GGTGAATCAGTTCCAGGACCTGGATTAACGGATGAGTTTGTACCTGAAGA
AGTTGATCGGGAAGAACCTCATGGAGACAGCCAAGATACAGTGTTCCGTT
CAGCAGGCCGTGCTGACAGTGGATCAAAAATGTATGGTTCTAATAAAGCT
GATTCTGGTGAGAGTGGGAAAAAGATTGGTCATGAAAGCAGCATGCATCC
CTCTCTTTCTTGCAATGCTGTGATGTATAACGGTTTTGATGCATCTAAAG
AGGAAGTGACACAGGCTGGCAAAGTACCGACTACAGATGATGTGTTAATG
GGGTTAGAATATGATCCGCAGAATGAATTGGGTAATTATTATCAACCCTT
TTTCCTGCTACACATAACCTAAATGATATTCTTATACCAGACGCATTTTT
GCTTCTGTGGTTGCATGCTATGCTTTTCCTATTAAACTGTGTTTATCGGA
CTACTAGAGATACTTGCTAGGCATGTTTTCATTGAAGTTATAATTTATTC
AACATGATTCCTTGGTGACCAAGGAGCGGCCAGCTAAACCTTTCAGTTTT
CACTTTTCAGCACAGGTGGTATTGATCTCATATCTGTAGTTCAGCTTTAG
CATCCACTATTCCTAGTTGTCCTATACCGACTGCTCCCACATCCCACACA
CATGCTTTTATTATATTCCTTACCCTCTGTTTCTAATGTGCTTATTCGAT
TATATGTGCTTTGCTCATATCAATAGTCCATTATCTGTTTCTCAGGAGCA
ACAAATGGAGAAAACGACTATGAACCAGGTCTTCCAGATTTTGATCCTAT
TAAGCATCACAAAAGTTACTGTCCATGGGTAAATGGAACTGTTGCAGCAG
GTTGTTGTTATGATACTAGTTCCAGCTCAAGCAGTTCAGAACTTTCTGGT
TGGCAGCTAACAGTAGATGCGCTGGATACATTCCAGTCTCTTGGTCAAAA
TCAAACAATGCAGTCTGAATCTGCGGCCTCGCTAAATATGGTAACCTTCG
TCATGCTCATCTTTCTTTCGACTTCTTTGCAGCTCTTTGGAATTCACCAT
GAATCCTTGAAAGTTGGTAGCCGTGGTCCATATTTGAAAACCTGATTTAA
TGATCTTCGTTAGTTGTGATGCATAGATTGCCCTACGTACAATACTAGTG
TGCCTTGCAGAGTTCAAGTGCTCACGTAGTGTGTTTTGTTGTGCACCAAA
CTATCCTTACGGACCTCGTGTTTGTGTGTGGCACAGGATGATCAAGTAGC
TTCTAACCGCAAGCTGGTGAGAAGAGCTTCAGTGAGCAAAAGCCATGGGA
AATGTTGAGCGAAGCTCCATCATACCGTCCAGCTAGCATGGATAGCATTC
GGCCAAGTTCCAGATTGGCGTATCTCGGCGCTTAAATTACATGCAGTGCT
GCTGCTGCCTGATGTACACCTTCCTAAATTAGGCTCTGTGTCGGAGGAAG
AAAACCAGTTAATAATCCATTTCAGCTAGTCTGTAGAGTTGTTGTCACCT
ATGGTTGCACAGAATCTGGCAATTCGATGTGTCGTGTATTTACCCCGAAG
GAGTCTATATTCAACTAGTCACCCCTCATTCCAAAAGGAACATTTGCAGA
ATTTGCAAATGAATCGATTGTTTTCAACCCCAGGTTAAACCTGTAAGCCA
CTCTTTATATTTGGGGATAGGCCTGGCAAATAATTCAAAGGAAAATATGT
TAAAGAGTTAGTCAGCCTTGACCTTCGGAATGAATAACTCACTCCATTTA
CATTTCAGAACTCTGTGGGATATATTTGGCTGAAGTTTAGTGCCCATTAT
TCACTCTCTGTGATGCAAAATATCTGGCAGCCTTTTCCATTTTTGTTGTG
CTCTGATATTTTTTGCGAACAAGAAATACTATCAGTATTGGTTTATTATT
TCTGTTTTGGCTGTTGCTGGCTAGCCAGCCAGCAGTCTCATTCTGGTTCA
AAATCTGACCACCCAATGAGCAGCACCCAGATTGCCAGGTCATGACCAAC
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TCAATCAAGAAAGGGAGGCAAAAGCTAGCTAGGGAGAAGCTTAGCTACGG
CCGGTGACAATGCCGCTCTGCAGCTTCTACGCCTCCACCTCCCTCCCGGT
AGCTAAGCCCCACTCCTTGCCCTCCTCCGCCAAGCTCCCTTCCACAGCTG
CGGCCGCGATCGCCACCACCACGATCCCGATCCCGGCCTTGGCGGCAGCG
ACAACGATTTTACCAGGGACGGCGTCGGAGACTCTGTCGCTGCACCTGCC
GGAGCTGCCGTCGGACATGCGGGACAAGATCCTGAGCCTGGAGCTGATGG
GGGTGGACTACGGGCGTGCGCTGTCCCTGAACCCGGCCATCCGCGACGCG
TCGCCGGAGTCCATCCACGCGGTGGTGACCTTCCTCCAGTCGCGCGGGCT
CCTCTTCAAGGACCTGGGCCGCGTCTTCGGCATGTGCCCCTCCGTCCTCA
CCGCCAGCGTCCGCGCCGACCTCCGCCCCGTCTTCGCCTTCCTCACCGAG
CACCTGGGCGTGGCCGAGGACGCCTACCGCCGCGTGGTCGTCAAGTGCCC
GCGCCTGCTGGCCTGCAGCGTCCGCGACCAGCTCCGCCCTGCGCTCATCT
ACCTGCGCCGCCTGGGGTTCCGGGACAACCGCGCCCTGGCCTTCCAGGAC
CCGATCCTCCTGGTGTCCAGCGTGGAGCGCACCATGGCGCCCAAGCTGGA
GTACCTGCGGACGGAGCTGGGCATGTCGAAAGACGAGGCCGTGGCCATGG
CGCTCCGGTGCCCGGCCCTGTTCACCTTCAACGTGGAGCGCAACTTCAGG
CCCAAGTTCGAGTACCTGGTGGCGGAGATGGGCGGCGGCGTGGAGGACGT
CAAGGCCTTCCCGCAGTACTTCACCTTCAGCCTCGAGAAGCGGATCGCGC
CGCGGCACCGCGCAGCTGTCGAGGCTGGCGTGGCCCTGCCGCTGCCGGAC
ATGCTCAAGGCCACCGACGAGGAGTTCAATGAGCTGTTGAAGCAGACGGC
GGTGTGACCAGCCGGCAGCTGAGCGCGCGAGCGCGCCATCCGCCACCGCC
GGCCGTGCTCATGCACGCACACGGCACACTGGCGCTCTGTACACTTGCCA
CCGAGCTACTACTGCGGTAGTGATCGCCTGCACCTGATCGATCCGAGTGC
GTTTAACCAGTGTTCGTGGCGACCAGAGTTGTACTGTACATAAGGGTCGA
TGTTTGGTGCCACGGCTCGTGACTCACATTGTGAAGTGATATTCCTTTTT
AGAGATGTGTAAGTATTACCAAGTAGTCGTTGCTGCATAATTGGGGATGT
AAATAAAGCCATGGAGTATCAACGAGTGTGAATCAGACTGAGCATTAAAC
TTTGGATGATAGTGTCATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.