Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006109

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006109
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006109
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAAGGCCGCGGCCGTGCCGTGTCCGCCGCGGATCTGCAGAAGAGGGA
GGAGAAGGGCGAGGCCGTGGTGCACGAGGTGGAGGTGGCCGTGGTGGTTC
CGGAGGAGAAGGAGGCGGGGGTGGAGGTGATGGCGCCCGCTGCTGATCTG
GAGCGGAAGCGGGCGAGGGAGGAGGATGTGGGGGGCTCTTCTTCTTGCAA
GAGGAAGAAGGAGGCGGGAGACGAGCTCGAGGTGGTGCCGGAGGAGGGCG
GTGCCGAGTCCGCTCTCGGTGCTGATCTGAATCAGGTGGTGTCGGAGGAG
GACCGGGCGGTCGTGGATCTGGTGGTGGGCGACGATATCCTGGCGGGCGG
CGATCTCGTTGTGGCGGATGTGGGGGAGCAGATGGCGGTGCAGGACGTGG
AGGTCACTTCCGTGGTGGTGCCTGGCGTCATGGAGCCTGGCACCGCGGAG
CCTGCAGTGCATGTTGCCGAGCCTCAGGTGAGTTAAATTTGACGCTCTCT
TTTAGATTGTACGGTTCATATTTATGGTTTTGATTTGTACTTTGGTTTGT
GGTTAGGGTTTTGATTTGTAGTTAGGGTTTGTACTTAGGCAGGGGCAAAT
CTACCGGCTATGCATCATTTTTCTAGATTGATTGAAACCATAGTTTTTCC
CCTTCATCTTGTATTTATCTATTAGCCGCGTGATCCGGAATCGGTGATAT
GTTAGATGATGGAATTTCCTGTTGTAAGGAATTTGGTTGGATTGGATGAA
AGCCAGATATTGTTAAACGATGTAATGTGATATATTTATCATTTAGGAGT
TCACAGTTATTCTTAAAAATAGCGTTTGAAGGCCATTTTCGGCTATCTCT
CCATTCACAGAGGAGCAAATCCCACTGTTGAACCCTCAGTAATCATAATT
TTCCAATTTATCGTTAAACAAAAACTTTTTGATTATCCTATTTCCATATG
TTGCTAGCTATCTAGTGTAGATACTTGTGATCTGTCTATGTAAAGTTAGA
TGAACTGCTGCTACAAACTTGATATAGCTAATCAACCATGTTGTTGAATT
GTAGCTTGTGTTTTTGGATGTTGAATAGCCTACCTTTTAAGGTTATTGTA
CATCCCCTAGATATTTGGCATGTTTCCAAGTTTCTCTAGCTCACCATCTT
GCTGTAAATCAATTATTGGGTGTTTCTAGATTCCTTGTTTGTGTGTAGAT
GTGAAACCTTGCTTTCAAAGTCTCTTGTATGATGGCCAGTGTTGCTTATA
TGTTGTTCATGATGTTTTCTCTAGGTTGATGCCTAGATAAGTTGCATGGT
GCTTGTGTGTTTGTACCACATGTCCTAGTTGTATCAAGTTTGTAGCAGCA
GTGGTTTACTCATGTCCTAGTTGTATCATGTTGCCTGGTGCTTATATGTT
GTGATAAACAAGTTACCACATGTCCTAGTTTACTCTTTCCTAGTGGTTTG
TTTCATATGATGCATGTTAATCCATCTTCAGCTAAATTTTGTGGGTTTTG
AAGTGGAATATGTTATTGGTTTATTGCTTAAAGCCTGTGATTTTATCTAT
GGGCTTGTCAAGATTATCCTTTGATAGGAAATGCATATTGTTGACCAATT
ATGTCCATATATATTTGTGTTATCCATTTGTTTTTTCATATATATAGTTT
ATTATAAAGTCTGAAACAATTAACTTTGCATCTGTTTGTTTTAATATGGA
TGTACATTACATTGATCCATATGGTTTCCAGGAGGATGGAAGCCCACTTT
CGGTGATACATTCAACTTTTTACATATTATATTACATTGCACATTCATTT
TGTAATATTTTTTTTGCATTTTGTAAGATTGAATGTTTTTTGTGTGCATT
GTAGTTTGACTCGCAGGACAGTGATGAGTCTGTGGACAAGAGGAATGAAA
CTTCCTTCATTAAGAAGGAAGTGATCCAGCTGCTAGCAAACAACCGCGAC
CCATATGTGGTGAACAACAGGTACAGGTGCCCATACCATCCTAGGAAGCC
TAGGGGTGGGATGCTTGTGAACCTGCTACAGCACGTTCAGCAGCTCGCCA
TTGGCAGTTCGGATGGTCGTGAGAAGGCTCAGCATAAGGCTCTGTGGGAG
GTGCTTGTCCAGGCAGACTTGGTGTAGTTAGTTATCTGGAATGTTATGTA
TGGTATGTAAGAATATCTAGTCTATGTTTGCTAGTTCTGGACATGATAGG
TATGATCTTCTGGTGCACTTTGCTGTGATGAAGGTGCTCTTTTGCTTTGG
ATGTTGTGAACAATCTAACGTTTTAGTTATCTATGACGGTCTGAATCTGT
GCTGTTAAAATGTGTGTGAAAATACCATTTAGTTTGCACTTTTGCCATTA
TGTTTGAATTTGTTATTTGAAAAATATGTAATGTTTTTTGAGAAACACAT
ATGAGTTTTGAAATCATTTGATTTGAATTGAAACAGAAATTAGAATTGAA
AAAACGAAAAACAAATAAGAGGAAAAAATAAATAAGCGTACCTGATAACC
AGGCCCAGCGAGACAATCTAAGCATTGGGCCAGCTCCCGTGCCCGTGGCA
GCTCAGCATCGCTGTGGGCCAGCAGTAAATCGGCCCGTTTACGCGTGCTG
CCCGCGGTGCCGATGAGGGTGGAAGTTTTAGTCCCACCTCGCTAATTGGA
GGCGAGGAGGACCAGCTTATATACCCCGTTCGATGCTCACCCTCGAGCTC
CTCTCAAAAAACAACTCCGATTCACCTGCTATCCTGTCCCTGTAATGGGC
TGACCTCTGGGGCCGTCAGGCTGTACTACTCTGGTCTAGTTCGCTTGTAA
TGGGCTTGAGCTAGGCCAGTGTGTGGAACCCAACCTCCAGAGTGTCAAAA
GTTTTTTCATGATTTTTTTTTTGCCAATTAATGTACTGCGTATGTCGGCC
AAAACAGGGCCTTTAGGGTCGTTTTCACATTTTTTTTAGTCATACGCGCA
GCGACAAATATGAATTTTGAACAAGAAAACTTATAAATCTTGAACAAGCA
AAATTTTGAACTAAAGCTACATAATTGAACAAGCAAACTTATAAATATTT
CTCAGAATTGACTCAAACATGGCAGGGAGGTGTGTATTGGCATGGCATAC
ATTTCATCTTTTGATGTCTGTCAGCAAGGATGCCTTTAAATACCATTTTC
TATTTTAAAATTCAAAATTCAGCTATATTTTGTGAAGGAAGTACAAAATT
TATAGTTGAAACCTTTGTTTCACCAGCATGTTTAGGTAGATGGGGACATT
TGGTGGGAACATAACCACTTTGGTGGTTTTTAATTTCTATCTTGGTCAAT
TTGTAGCACAAGTCAAAGTTTGGTCAAATATGAGAAAACATGGAAAATTT
GAACCATAGCTACACAATTGGAACCTGTAATATTTTGGGAAAAATCATTT
TTAGGCCCACAGGATGTGGTTTAACCATGGATCTATTGGTAGATCATCTA
GGTTCATCCCTATGGCTACTCGGTGTTCGACGCAAAATTTGACCAGACTT
TGACCTGGCAGTATAAAATCACAAAAATTCAAAAAATTGTGAAACCTTGT
CCATTGGTCTTAGATTGTACCCTATTTAGAATGAAAAATATTAAACCTTG
AGTTTGTGGAAGCAAAGATGAGTTTGTTGTCTCACTCTTGGTTCCAAGTG
TGAGTCTCATGGGCGTGTACCCAAATTTCATAGGACATGGCCAGCTCCAT
GTCATACTTCCTCAGAATTGACTCAAACTTGGCAGGGAGGTGTGTCTTGG
CATGGCATACATTTCATCTTTTGGTGTCTGTCAGCAAGGATGCCTTTAAA
TACCATTTTCCATTTTAAAATTCAAAATTCAGCTATATTTTGTGAAGGAA
GTACAAAATTTATAGTTGAAACCTTTGTTTCACCAGCATGTTTAGGTAGA
TGGGGACATTTGGTGAGAACATAACCACTTTGGTGGTCTTTAATTTCTAT
CTTGGTCAATTTGTAGCACAAGTCAAAGTTTGGTCAAATATGAGAAAACA
TGGAAAATTTGAACCATAGCTACACAATTGGAACCTGTAATATTTTGGGA
AAAATCATTTTTAGGCCCACAGGATGTGGTTTAACCATGGATCTATTGGT
AGATCAGCTAGGATTATTTGGAAAAAATTATATGGGTTTGAATCATTTTA
AATGTAACTTGGAAAAAGAGAAAATACCTAATCATAGATAAATATTAAAT
AACAACAAAATTATAATTGAGTGGATTTAATAACACAGTAAAAAATAATA
TGAAACCTACTTAAAAGGTTTCGTAATGGTTTAAAATCAAATTGAGTTTT
GAAATCATTTGATTTGAATTGAAACAGAAATTAGAATTGAAAAAACGAAA
AACAAATAAGAGGAAAAAATAAATAAACGTACCTGATAACCAGGCCCAGC
GAGACAATCTAAGCACTGGGCCAGCTCCCGTGCCCGTGGTAGCTCAGCAT
CGCTGTGGGCCGGCAGTAAATCGGCCCGTGTACGCGTGCTGCCCGCGGTC
CCGATGTGGGTGGGAGGTTTAGCCCCACCTCGCTAGTTGGAGGCGAGGAG
GACCAGCTTATATACCCGGGTCGATGCTCACCCTCGAGCTCCTCTCAAAA
AACAAATCTGGTTCACCTGCTATCCTGCCCCTGTAATGGGCTGACCTCTG
GGGCCGCCAGGCTGTACTACTCTGGTCTAGTTCGTTTGTAATGGGCTTGA
GCTAGGCCAGTGTGTGGAACCCAACCTCCAGAGTGTCAAAAAAATTTCAT
GATTTTTTTTGCCAATTAATGTATACGTCGGTCTAAACTGGGCCTTTAGG
GTCGTTTTCACATTTTTTTATTCATACGCGCAGCGACGTGGTGGGTCCGA
TAGACACGACCGCGTCGTGGCTACATCGTCGCCCTACCGCCGTCTTCTCT
GTCCCAGTTTACAACCGTGTTTCGCGTTGACTCCTTCGAGGAGCGGCCGT
CTGTACGTTGCGGCGACTCGGCGGAGTGCGCCATTCGTATAACGGCGGCG
CGCGGGAGAAGTACAGTGGCGGCGCGCGGGAGAAGTACAACGGCGACCGT
CTCAGGTAAGATCGCATGGATCTATGATCGCATGCACCCTATCGCTTTGT
GCCTAGATCTATGATCATGTAGATCTACGATCATGCTGCAGATCTATGAT
CGCATGGTTTCGCGGTGTGCAGAGAGGGGTTGGCGGGGCCAGGGGACGTT
TTGATCTGTGGCGGCGGAGGTAACATGGTAGGGTGCAGCGGTGGTGTGAA
TTACTAGGGTGCCAGGGGGACGTTTTGATCTGTGGCGGCGGAGGTAACAT
GATCGCATGGTATGATCGCATGGATCATGAGCAGCTGATTGAGTTGAGAG
TCAAGCCTGACGACTCTTTTGGTTTTCCAATATGACCATAACGATTAGTT
AGAACGAGCATACTTATTTTTTAAATTAGCATTGTTTACACTTGTTTTTA
ATGTAGACTTTTGTTCAATTTTTTCTTTATGCCAACAATTTCCTTTACAT
AGTATAAACATGTGCATGCACTAAGTTGACAATTGTTTTTTATTGTCATG
TTGATTTTTCATGCAGCGTGATGGAACTGGATGGTGATATTGCTTGCTCT
GTTGAAACATGGTGTAGACTTATGGGCAATTTTACAAGTCAACAACATAG
CAAATTTTTGGAATCAAATATGCGAAGTATGTTACAAATTCCACCAATTC
GGATGCGAGTTGTCTTGCTGCAGTACATGTTTCACATTTATGATCATGAC
TCTAGCACTTTTGTCCTGCATAATAAAGGCAAATTTGCATTGACTGCACA
AGATGCAGAGTGCATTTATGGGTTACGAAACTACGGTCTGTCTGCTAATC
GTATAATTGATGAGGAAGGTGAAGACGGAAAGTCCCGTATTCCACCACAT
TTTCTCAGCGCAACTACTGGCAACATTGTTATTGAAGATTTAATAGCTGA
TATTGTCATGAGCAAAGCTGCGGACGATGACTTTCTCCGCAAATCTTCTC
TTGTTCTCCTTGGTATAGTTCTGGCGCCTATTACTAAGAGGATTGTACCG
AAGGATTATTGGGTACTAGTGGAGGACATAGACCGTATGTCTACCATTAA
TTGGAGTGAGTTCACGGTAGATCATCTCATGGTATACTTCAGGCTTGTAA
CTAGATATAAACAAATTAGGCAGTGGCCTAAGGGAAATTTGTCTTTAATA
CAGGTATTAAATCTGTTCTCAACATTATTTTTAATATGGTAGTCTTCTCA
TTTTATGATGCACTAACATTACACTTGGTTCACATGCAGTATGTTTATTG
GGAGAAGGTCAAGCATGTAGATGATCCTTGTAGGATAAATCCAAGTTTGT
CCTTGAGACCACTCATGCGTAATTGGACAGATGATGCTGCTAGGATCAGG
GATACAATGGACTGTGATCATGGTCGGGGTGAAGGACCTATTCTGGTAAC
GATCCATGTTTCTAATATCATCTGTATATATATCATGTGGTTATGTTAAC
AAACTTACGCCTCTAGTTTGATTAATAACATTGAGTTATACTAATGTGTA
TGTATCAGGTTGAAGATAATATAACGTTGGAGTATAGGATTGAAATGCTA
AATAAACCGGCGCCTGTTCTCAAGCCAAAGGCAAGTTCGGCTAGGAAGGC
TGTAGCCAGAAATTCAAACCAAAAAATTACTAAAAACGTGCAGGAGGTAC
AGACGGAGTCTATGATGGAGCGAGTGATGGATCGAGTGATGGAGCGAACA
ATGAATAGGATGGAGTCAACAATGGAGAAAATCGTCAAAAAAATGATGGA
CTCATATGCACAGGTAATCACCATGTTATTGCATGTACTATTGGGAGTTT
CTATTTTTATATCTGATAGCCTACGAGTATATTATATATTTCCATTTAAT
TTTTCAGGAACTAATTGTCAAGTTGAATAAAAATGGCATTATGTACAAAA
GCAAATAAGTTGAAAATGGAGATGACAACCTATCATTGAATAATGGATCC
TCTAGTACGGGAAAAGAATTTTGGCATGGGAAAGAGAGTGCAGGTGCTTA
TGCTGATCAGATTATTAAGGAAACTATTGATTCAATGAAACACACTGGGT
TGAACGGTAATGCAACGCCCGACGATGGCGCACATAAGGATGGTTGTAAA
GATGCAATAGGCAGCACACCTTCCAACCCAGAGTTAGTGCTTGATATTTC
TACAAAAGCCGTGTCAGACCTTCCATCGGAAATGTACGGAATTAGCAAAA
ATGGGAAAGAGCTGGATGGAGCAACTGCGTTAGACGATTCCAACAGCATC
GGTAGTAAGTTGGACGTTAACAATGAGCCGGAACAAGGTTTGGGGAAACG
TAAGCACAAAATTTCTACAAAACTTGAAGGTTTCGTGGGATATGAGCCCC
CCAAACGTCGTGCACTTAAGAAAGGTACTCCCTCAGGTTCAGTTTACACG
ACACTTTTATTTTTCATGCAGTTTCACTAGGAATGCTGATTTAGGCGCAT
AGCCATTTATTACTGAATAATTGTGGCGTTTTAGCCTAGTACTCCCTCCG
CTCCGGATTAAAGGGCCCCTAGTGATTTTGGGGTTGTTCCGAATTGTATT
GCATGGAAGGCGAGAGAAAAAATAATTAGCTAAGTTACTATCCTCCTAAA
AACGCTCCTGTCCTCTTCTTTTGAACTCGGGCATGCATTGCCAGCATGCA
GAGGTGGAAACTGTCGCATGCAATGTGAGAAATCAAGCGAGCATGCAACA
CACTCCATTTACACGAGCATGCATTGTATGTGTACCTACTAATTACATCT
GTATGTAGTTCTAACGAGTTTTTTTTAACCATTTTCATAGGATTATTTGT
AAACCAAGATGATGATACACGAGTCCTGAGTGCTAAGCAAATACAAGCAG
CCGTGACATTGGTTGAAAACGCATGTAAGGATGAATCGAATGGTAAAAAG
GTTGTTTACCAACATGCAAATGGAATTATGTTGAATTCATTAAAGCTTAA
AGATGTGTTGGACCATGAGTGGGTTAGCGATCGTGTAAGTTCTACTGTGT
TATGATTATTTTATATCATGCTAATACATAATAATGTTATCACTCTGATA
AAATTAATTCCTCTTATGGTTACAGTTAATAGACAGTTACATTGGAGATT
TGTCACTTCGTGTGGGACATGATCGGTACCTTTTCAGTGCATTAAGAACA
ACGTTCCTTGTGAAGAAGGGTACAACTTTGGAAGAAGCGAAAAAATCCAA
GCATAACATGGACTTCACTATGTCCAAAAGTGGCTCAATTGGAAGAGTCA
TGGATGAATATTTCTTGCGAAATAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.