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GrainGenes Sequence Report: AA005200

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Sequence
AA005200
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005200
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACCGATTTCGAAATCCCGCCTCCCTCACACTCCACTCCCAGCCCATCGT
CGGTTCCTACCCCTCGTCGCCCCTCGCCAGCGACGCGATGGCGCGGCGCC
GGCGCCGTCGCGCGTTCGGAGGCCGCACGGAACTCCGCCTGGCCTACGGG
ACTCGCGCCCGCCCGCTCGGCCGCGCGATACTCGCCCTCCTGCCCCCGCC
GCCGCCTCCCGGCACCCCCTGCCCAACCTGCCGCGGCGCAGCCTCCGGGT
GCCTCGCGTGCCGCCGCTGGGCGCACCTCCTCCGCGACGGCGACCCAGTC
GCGTACCGCCGCCTCGTCACCCGCGCCGTCTGCGCCGTGGCCCTCGCGCC
CGCGGCGCCCCCGCCGCCGCGGTACACCCCGGGGAATGCCGGCCACTCGC
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TTTGCTATCTATTAATATGTTCAAAAGTAAAAGGTAAGCTGCAGCTTAAA
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TAGTTATAAATCCTTCTCTGATTGGAAGAGTCACATGTTTAATCCATTGA
TATATATATTTTATGCTCTTTTGTTATATGTTTTATTAATTTTCTTAATC
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TGTTCATCCTGGGACATCCTCTTGCATAGAGTAAGTGTAATGGAAATATT
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CCACTGAACATTGTTCTGCAAAAGCGTATATCCTCAAGTACAATGGCAAG
AAGTCAACAATCTGGATCCATAAAAGTCAATTGCACCACGGTAATCATTT
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TTAATTTTAACTTGGCTATGATTCACTAGGCAAACAGACTACCACCTGTC
TGGACTGGCATATACACAATGAACACCACTTGGATGTACTGTGGATTGTT
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TGGAAAAAGTATCATATCAGTACTACCCCCTATAGTATAAGGTTTTTATA
TGGTGTATACAATTGGTAGTTTATATCAGTCTTGTTTTATAGCTGTATTT
TAAAGTGAAACAACTGGCTAAGCATTTAAATACAAATAATCCAGATGCAT
AGCACCCAGTTTGTCGTAGACTTCATTTCCATCTCTCGAGTCTTCTTCAC
TGTAACCAGGGAATGGGATTTCTTAATAATATCCTTTGACGCTACATCCC
TAAAAGTTCTGTGGGACCTCACTGCTGAATGTTTTTTAGCAAATAAGCAC
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ATGTCTTTGTGATCTCAGTGCTACATGTGGCGTAATGCACAGATGGCACA
AAACATATCTGGAGGCAATCTCGTCAGCAGTTTAAAATCTGGGCTTAACT
GCTCAGATAACACTCAGAAAATTGATGCTCTACCAAGTCCTGCAAGTTGT
GATGCTGTAAGAATTATAAAGCCTAAATGTTCAAGTGATGAATGTAAATG
TTCCAATTGCTTTACCCAGAAGCCTAGGAAAAGAAAAAGGTTGTACAGTT
GGCAACGGCGCAGTAAGCAGAAGCAATTATGTTCTGAAGATAGGTCAACA
GAGTTAAGTAAATTGAATGAGAGTAAGTACACTGTGGGTAATCTCTTATC
AGATGACTCAGCTGCTGAAGTGAACGATCAAAGGCACTCCTTGGAGCCTA
CTGCAGATACCACTTCTTTTGGAGTGAACAATGATACTAATTTTCCACAA
TCTGAAGAGCAATGCAATGTACCTGCCCTGTCATCTGAGAAGTCACCCAG
TTCTCTGTTGGATATTATGGTTTTCCAGGGTCTATCTAGTGGTTACAATA
CATCAGAAGATCAATATACAAGTCCCCAAGTAGGACTCTCCAGCTACTTA
CAACCGTATCTCAATTCTCTCCCAATCTCTTGATATTTGTTTTGTATTGT
CTTTATTTGTGCTGACACTTTAAGTTCTTCAACCCCCTGAATATTTATTT
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TTTCCTTTTTGGCACAAAGTTATGTAGTTAGAAAATGTCAAGAGAGCAAT
AACTTGGACGAGAGGGATTGACACTTGAAGAATTTCAACATAGTGTCTCA
CTGACATGCTAATCTAGGTTCACATGTCAGTGAGTCAATGCACTGGCAAA
TCCTCAATACCACCTCTTGTGGTGAATTGCATATTTTACCAGGTGTGGGG
TGAACAACAGTGCAACAAATGGCTTGTGCCAGAAAACCACATTTTGTTTT
AGTATTTCTAAAATTTAGTCTTGCACAAATCCTAAAATTGGGATTTTGCT
ACTCCTAAAATTGGAACTATGATGTCCTGCTGGAGGGTACCATTTATGAT
TCTAGTCAAGTCCATGTCTTCAGGATTATATGCATTCCTTCCATTCTTGT
TTTATTTGCTACCTTTACTCTGCTTGATAATTATGGGAATGTTTCTCGTG
ATTATTACTGGTTTGGTCACATTTTCTTTTGGCAAAATACCCTTGTCATT
GGGCTTATACACTACCCTTTCATATAATGCCCCTATTGTTGTGCACACAA
ATGAGCCTTTCTACATAATTTGTACAGTGGCATCTGCGGTAGAATTCATC
AGCCCATCTGATAGTAAATATTTAATGTCTGCCAGAATATCTTCTGAATT
AGTCATGTGCTGCTGCATGCCCAGTTAGGCTTGGTGACCTATCTCCATGT
CTGCCAGAATTTCTTCCGAATTAGTCTGATTAGCCTGAGTATGTTTCCAA
GTAAATAGCTGCTTGCCATATCCTGAAGATTCGTTCATGTTTTTTATCTG
TATAGATTCTACCATTGTATTTTTTATCAAGAAAACCAAAAATGATATGA
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ACCAAAGGTGACTGCTGTACACCCTGAAACTCACAAAAACTAAAACATAC
AAAGTGCAGCACATGGCGATTTTTTGTTGTTTTGTGCACATTGCTATCTG
CCTTTGGATAATGGGCTTTGCAGTTTCCTTTCTGTCTGGCGTTTTACTGA
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TAAGTTGCTGTAGTTTCTTCAACATATTTTTTTACCTGCAGAGTGGTCCC
ATCTGCTTCAATTGCTTAATGTTGAATGCTTCGAAATGTGTATCAGTAGA
CTCTCTCATACGAAGACATGGTGTTTTCTACAACAAAAGAATATCCAAGA
ACGTCTTCCATCACAACAGTATCCTTTTGTGATTTCTGTTGTTGCCAAAA
CTTGAAGTGTGTCAATCTCCGTAACAACCAGAGTTATTATTAACAAAATT
GTTCCGAATTAGCAGTAAGTGGAGAACTCGATTGAGTCTAAACCAATTAT
CATTTTTTTTCTTACTGAAGCAAGAGCATTAGCAGAGGGGAGCAAGGTTC
TGTGCAGAAGTGATATAGATTAGCAGTGACTTACATTGCAATATGGGACC
TTCTTTGCTGTTGTGTCGCTACATGCCCACTATCGCAGCACGGATTTGGT
GTGATATTGGTAGTATGTTAGTGTCATTGTCTTGAAAGTGTTGCTGCCTT
ATCTCGTATATATTCACTTTAATGTTTCTAGTTGCCATTGATTATATCAT
CTTATTTACAGACATTAATACATTTTGTAAATAAAATATGGCGTTCCTTT
TTTAGAGATGCTCTGCACATATTTTCATTACATACGAAATTTGCAACTAT
GAATCTGGAGGTGAATTAGTTGAAAATTTTGGATGCACAACTAATATCTT
GCTGCATCTTTTTATTATATAACATGCTATTTGGAGGAAACTTTTGAATT
GTTCAAAACAACTGTAAATACATTTATCAGTTTCTTCATGGCCTCTTTGA
AACAATATGGACTAATGCAGGATATTTGAAAATCAAAATCAATTTGATTT
AAGGCTATTTTTTTTTCTGGTAACTAGCACTGGCCTTATGTATATTGTTT
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GTTTCCTCTATAATTTATGGGATGTGTTCTGAACATTAACATTTTACAGT
ATGTACAATAAAAAACCTTAGATACTAGTTTGTTGAATACTGGCATTTGG
AGGTTTACAGTTGGTATTTGGCAACCCTTACCACGTCTTAATATGTTAAT
TCATTTGTTTTCACATATTAACTTTGTGTTGTAATCTGCACTGTACATAT
TATTTCTCATCATACTGTCATCTTTCAAATTTCCTTAATACGGTTAGAAT
TGACTAATAAAAGGAAAGGAACTGATGCACTATCTCTTATAAAGCGCATA
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ATCTTCCACAAAAAATTCTAATTGCCTGTGAGTCGACATATTTGATTCGT
ACTATTTTGCCAGTAAAGTTCATTAGCCAACTTGACTTTTCAGAATTTCG
TGTTAATTTGCTCCTTACTTTAGACTGTACGTGATGATCTCGATTTCATG
ATTCACATTTCTCTGTTTAACACACATTACTACTAACTTCTCTGTTTGAT
GTATTTATTTTACTTACTAATCCAAATGTATTGATAATGTTTTAGTGACC
TACTGCCAGGCGAATAAATACCTACTCCCTCCGTCCCAAACTATAAGGCG
CCTAAGGATTAGTTGAAAGTCAAATCTTACTAACTTTGACCAAATATTTA
GGAAAAAATATCTACATCTAAAATATTAAATTGACACATTAGTAAAATAT
ACTTTATGGTGAATCTATTGATATTGATTCAGTATTGTGAATATTCATAT
TTTTGTGTATAAATCTGGTCAAACTTAGAAAACGTTGACTTTTGACTAAA
CCTTAGGCGCCTTATATTTTGGGACGGAGGAAGTATCTCGTAATGGCTTA
TTAAATTTTGTTCCTGTGCCAGGAAAGAACGATACAGTTTTCCTCTATTG
CAGAGAGATGCATGTACAGAATTACATTAGTCTTTAGATGTTAAGCTAAA
GAGCCTATACTGCTATATACATTATACTCTACTTCTATAGATTCTTTCCA
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ATGCAGGCTCATATATTCATCCTTTCAACTTTTACCAGGTGTCACTGGCT
GCTTCAACAAGTGAAAAATCTCACAAGGAACGCCAAACGATGTCAGTATA
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AATTAAACCACTTTTGAGTAATATTATCCAGAATCACACAACGAAACAGT
TTATGGCTGTTTTTTCTTCACTTCTCCTTTTTGCTGAAGTATCCCTATAT
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GTATTGTAAATATTAATATTTTTCTCTAAAAACTTGGTCAAACTTTAGGT
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GTATATGTGTTTAGAAGATTCATTCTACACATGCTGGTACATTATTTACT
TGGCCAAAATATCACAAATTTGTCAATGTGAAACTAGAAGAATGATGTAA
TATTCTCTTTCAATATAAAGCAGGCAGCAGAGGATGGGTTCCCTTCAGCT
AATGTAGCCAAGAACCAAGAAAGCATACAATATTCATTGAAAGGAAAATC
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CCTTTGCTTGGCAATCCTTCCAGTAAGAGATCTTTAAGGATAAACATTTG
GAAGTTCATAAGGTTACGAAGGTATGAAACGTTTCAAGTAACTGATTGTA
TTGGTGAGCTGAAAGTATCATATTATTCTTGGCTATCAAAAATTGGATTC
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TGGCATGGAGGAGCAGAAACAGAACAACCTCTTGCGTTGTTGGATTAGCT
GGTTATTTTCTGATATTGTGATACCATTGATCAATACCTACTTTTATGTT
ACAGAAAGGGAAACAAAGCGATATGATGTTTTCTATTATCCAAAGTCAGT
TTGGAGGAATCTTACTATCAATGCTATTGCTTCCTTAAATGCACAGAGCT
TCAGGACTTTGTGTGGTACATCAAGGAGAGCAATAAGACATTTGTACCGT
TCTTCAACAGTGAGATTTCTCCCAAAAGCAAAAGATATGAGACCATTAGT
AAATTTTAAAGCTCAATCAAAGGATGGCCTTCTCAGTAAGTGTCACTTAG
TTATTAAAAAAGCAAGGGATGAGAATCCAGAGATGTTTGGTTCTTCCGTT
TTTGATTACGATAGTGTTTACAAGAACCTTTATAGTTTTATTGCTCCAGT
AAGAAGACAGTTGAAGGAGCTTAAGATATATATCGTTGTTGCTGATGTAT
CCAAGGCATTTGATTGTGTTAATCATGACCTGCTACTTAAAATTATGGAT
GATGTTCTGAAAGGTGATGAGTATGTCCTGAGGAAATGTATGAAAGTAAT
ATATAGTAGGTCTAAGAATGCGATTTACCGCTTTCATACAAATGTCTCTG
TCAGCAATGGAAGCGATATCCATGATTTCTCAATTCAGCCATTGTCAAGT
GGTGGCATTCTTGTTGATCAGGTACTGTATCAGAGCTCATTTCATTTGTT
CTCCTTGGGTTGACTACTTAGTGAACGTGACTGCTATTAAAATTTCTGTA
ACAACGACTGAAAGAATATTATAATGCTTGTCACTGGAAAGTCAAATCTA
CTCAAATCATAATATTTTGTTTGTCTTGTTTAATTGTGGGGTTGATTTTG
CTTTTTCACTCTTTTTTCTATAGAAGTCTTAGACCAGTTAATACAAAATA
CAACCCTAAATTCAAATACATGTATTGTTGTAGCAGCTAGCCACACAATT
ACTTAAACTAGTTTTTGAAGTAGACTGGTTCATCATTAGCCATATGCTGA
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AATTGATATGTCGCATCGTATGACATTTTTCTTAAACCAGAATAACATCA
GGGACTATTTTTTTCTGTTGTTGGCTTGTTGCTGAAGTGCTGTAGGGCAA
ATTTTTATAATGCAAATATGTAATTCATCTGGTGGATAAAGCTGTGATGA
CACAAATGCATTGGTGTATCTTGCCAATATTTGCTTCTAAAAGGGCTACA
CATGGCATATGGCCAATCAGATTTCTAGGTTAGGTGTCTTGCCTTTGCAA
GGATGGTGAACAATGGCAATGGCTATTTTCTATTAAAGTGTTTGTTAGTA
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TTGTGCTGTGCATTAAAAAAATTTGGTCTATTTAATAGCTTTCACTGTAT
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ATATTGTTCTTTGGACATGAGTCACGTAGCATGGTGTCCAGTTATCTGAG
AGAAGCCAAGGGTAGTAGAAAGTGACTTGCCCAAAAATTCCTAACAAAAT
AAAATATCTTATGTTATAAGAAAATATCCTAATATGAGAAATGGTAAAGT
TGGAACTAACTGGTTGATAACTTGACAGGTAAGAAAACAATACAAGAGAA
AACATCCTTGCCTCTCGGTCAGGTCCTAAGAATATTAAAATTATCAGGAA
AGGGAGCCTGTAACTCCTATGCTGCCACTCTATCTTTTTTTTTTTGACAA
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CTTGCTTTCTTTGTGGGAAATCAGGGAACTCTTCATACAATCCGGAAGGA
GGAGCTTCATCGTGTCCTTTTTGAACAAGTCAAGTGCAATATTCTGAAGA
TTCGGCAAAACTTTTACTTGCAACAAGTAGGGATTGCTCAAGGAAACAAG
TTATCTCCCAACCTTTGTTCCCTATACTATGGCCACCTTGAAAATTCTGT
GGTACTGAATTTTCTGCGTGATGGAAAGATTAATTCAGGAGATGCTGTTT
CAGTACCGGAGTATTTATTGATGAGGTTCACTGATGATTTCATGTTTATC
TCTTTCTCAAAGGAGCATGCTTTAAATTTCTTTAATAGGATGAGAAGAGG
CTTTGTGTACTACAACAGCTACATGAATGACAGAAAATATGGTTTTAACT
TCAACATTGGAAGTAGCGAGCAGTGCCATAATAGACTCTACAGGGGAGAT
GATGGAGTCGCTTTCATACCATGGAGTGGTTTGCTTATAAATTGTGAAAA
TCTAGAAATTCAAGCTGATTATACAAGGTACAGCTGTTTGTATTGTATCT
AGTTTTAGTTTTGTTGATTCAATTCATCAATACAGTGACGGACTTCATTG
ATGTAGATCAAGGATCTAGGATAGTCAACCTGTTTATAACCCTGAGAACA
AAATCAACCAGTGCTCTTGTTTTGCCATCTTTCCCTTGGCATTTGGATTA
ATCATTAGTCATGAATTTCTTTTAAACCAGAGCAAATTATATAATTTAAA
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TTCGTGGACACTTATTCTAACCTTGTCTTGAAGCTGAAATTTGATCACTT
AGTATCCACCAGGAGTATAATATTAGTATTTAGGAGGGTGGGGGGCTTCA
TATTTTAGAACGTTTTGGCAAACAAATTTAGTTTGCCAAAACATTCTATA
CTATGCAACAGATTAAGTAAATATTACAAAGATGTTCATATGTTTAATTG
CCTAAAATTGGCATTGTTTTTCTTACTTGTTAGCAGTTCCAACACCCCCT
CATTTTGTTCAGCAAGTATCATGAACTAATTTTCCTGACAGAAAGATTGT
TGAAGAATTAGTAATGAGCATGCACATTTTTTAACAGGTATCTGGACATC
ACAATCATCTCCACGATCACTGTGAAGTTGCATTCTTCGATGAAGTGCCT
TAGCAGCAAGCTATGTCATTATATGCGTCCAAAGTGTCATCCAATTTTCT
ACGACTCCAACATCAACTCACCAGGAACTGTAAGACTGAATATATATCAA
GCCTTCCTGTTATGTGCGATGAAGTTCCATTGCTACATTCGATGCTTGCC
GTATTCCAGCATGAGCAAACCAGAGTTGCTACATATCATTAAGAGTACCT
TCAGGTATTAGATTTTTCTCTACGTGTATTATCTTACAAAAAGCTGCGGT
CGCAGATATTTTTCTAGCCTATTGCCTTACTATCTCTCCAAATCGTATCA
AGACAGGTATAATTTAGTAAATCAAATTTGACCTTCTCAGTGACTTGCCT
TTTTTTTCCCGTTCAATAGATACATGCATAATCTCATTATGAGACGTATG
CAAGACATGGAGCTGCAATCCAATACGCGCCCGGTTCTAAAGCTAAGGCG
CAGAGAAACTATCTGGCTCGGACTATCTGCATACATTCGCGTTCTTCAGA
AGAAGCAATCACGGCACAGGGATTTGTTGGCGCTGTTGATAGCAGAGGTC
GGGGGATACGGCCATATGGACCGTGATTCTGACAGTTTGCGCTATGCTGT
GGATGATTCCCACTCTTCAATGTTCTGGAAGTTGAGATATTAGAAGGAAA
CTCAAGGAGGCCCAAACATAGTTGCACTGAAGCTCTATCGTTTTAGTTTA
GCGGTTAATCTCGGGCACTGTTGTTTTTCAGTTAAGTACTAGCATCCTAG
TGGTTCCGGTTGTAGAGGTTCTGATTAGTAAACCGAGAGAGTAGTCATTG
TTTAATCCTGGTTGACACCCAGCTCTAATACTCAATTGGTTGGCTGTGCA
ATTAGACATTGTTCCTTCCTGCTGCGTTGTGACTACATTTGATACTTTCT
CCGTTGTTATTTACTTCGTGTTTTGGGTTTAGTAAGAGTCAAACTTTGTC
AAATTTGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.