Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA017119

[Submit comment/correction]

Sequence	AA017119
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA017119
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCGAAGCCCCGCTGTGCTGTGCCGCTCGATCTGAAACGGCCGAGCCCGAA ACTAGCGAGGGGAAGAAAGGTATAGACAGCTCTCCCAAATTCGCCTAGGG TTTCCGCCGGCGGCGATGGGCGCCCTCACCGACAGCCGCAAGCGCGTATC CGCCGACCACCGACTCATACCCTCCTTCCCGCCCTCCCCTCCACCTTCCT CCAAGAGGTCCAAGCTCGCGCCCCTCCTCCCCATCTCCTCTACTCCGCCT CTGCAGTCGTCTTCTCACACCCCCCCGTCGCTTTCATCTGCCGCGCCGGG CCCCACTTCCTCGACCGCCGCCACTGCCTCCACCTCCTCCTCCCCATCTT CCTCGCCCCCTCATCGACGCCGCCGCTATCCCCCGCCACCGCAGCGGCCG CGCCACATTCATGGGCCTCAGCGCAATATCCGCGCCTTCGGCCTCGGACA TATCCGCTCCAACTCCAGTCCATCGTGGTATTCTCCGTCCCCGCCATCCC AACCTCTCGGCCTCGACCAGTACGTCGACCTCGTCAAAAGTGTGCCGCCG GCGCCTACTCCCTCTGCTGATGTGCCAAGAGGGGCTGAATCTACCGCTGA GGTGGTCGTCGTCGATGACAGGGAGGATATAGAGCAGGACGACGAGCGAG ATGATGAGGACGAGGTGAAGGCTAAGGTGGTAGAGAGGAAGGTGCTTCTA TACAAGGAGATTTACCAGGCGTCCAGTCGGCAGCGGAACGCCAAGCTCAA GGTACTTGAGTTTGAGGTCCGTCTCGCCGAGAAGGGCCGACTTTGGCTTG AGCGGCTCGAGGAGGTCCTCCCGCAGATCACACCCAACAAGAAGGTACAA CTTCTTCAATCTTCATTTATCTGTTAATCATAAATGAATTGCATAATGAA GTAATGATATAGCGTAAATAATTGAAATAAAAAGGGTGTTGTTGCTGTAA AATTGTTCACAACTTAGATACATTTGATTAACTTAGATACATAATGAAGT AATGATATAGTCAAATTGTGCGGATTTGTCAGATCCAAGTGTTAGACCAT AGTCGGAACACGCTCTCTTTTCTCCCCTTTCTTTCTCTCTCTTCCCCTTC CTTGAGAGTCTCCTCTCGGTCTGCTCCTCCCTCCCTCTTCGCCGGCTGGA GGGGGGGAGGCTGGCCTGTACAGCGTACCTCTAGGTGTAGTAGTAGCGGT GTGCGGGCTGTGTCCTGGTTTGGTGTCATGCCGGTGGAGATCTGGTGGCC GTGCCCTACGGGTGGCGCTCAGCGCCCGGGTGTGAAGCTTCTGCTGCTTG CGGTGCTCCGGTGGATGCAGCCGAAAGCAAGCAGCATCGTCTTATTCCCC TCCACGCTAAATAAGCTTGAGATGGCTCTAGAACTCGAAGACCCGGAGAT CCCTGCCCAAGATCTTGCTGTATTGGTGACAGGAAAATCTGGTGGAGTTG GAAGGGGGGGTGGTTCTTCCTTAGGCTGGCGATGGCTGCGGCCATAATGG AAAAGAGGTGCTCCGGTTGCTGAACTGGAGGTCAAATACCGGTCTTCCTC AACAATCCCTTCAAGGTCAGCCTCGGTGGTGTTCTGATCTGCAATTATGG GTATGAGATCTTTGCTCCTTTTTATGAATTGGAGATGTTGGACTCTGCTT AGGGACAGTTCAGCATGTTGCCCACAACTTGATCTGTTTTTATTGGAGTC AACTTCTATGTGTGAATCTATGGAGTCAAGGCAATATTAGCACAATTCAC ACATATGTATTATCAGTTAAGGACAGGACTAGTAATTCAACTGTCACCAA TATTGGGAATGTCCTGATTGCTGAATTGAAGCCATGTGAGCATAAGTTAT ATATGACCCTGAAGCAAATCGATGGCAGTGCTATATATTCAATTCAGCAA GATCTTTTAAGGTTTAGCTAGAGACGGTTATATCGGTACGATGATAAGCA TGGTGTTGGCACCGTTCTTGTTGTTCGGGACTTCGGGTTGATCCACCGGA AGTGGATGACAACACTTTCGCTGTGGTTCCTCAGATTCAATGGCAGGGAC ACCTGAGTTTGAGCTCGGAGATGGACATTCAATATCTACAAATCTATACT CCTCTTCCTCAGATGCATACACCAGATAGACTGCCGGGAGAGCCACCCGT GGGACATCAACTGGTATACAGCATAGATGCCTCTGAGGACTGCAGTTGTG GCACTTTTGGATCCGAGTTGTTGACGGATGGATCGTTTGGTTCCTCTTGT AGTCTTCGGTGTCAGCATCACGTGTTATCTTCATTTATATTTGGGTTGTG CCACTCTTCTCGTGTGTATCTTGCTCTGTCCTTAGCCTCGATGTACTGTA TTTGTTAATGTTAATATATCTTCATGTTCAAAAAAAAGACCATAGTTGTC AACCCTGATATGCTCTGTTCATTTTAAACTTATTTTTGAACTAAATATAG TAAGCTTACATTTAGGTTTGAGTTTCTGGAAAGGATTATCACATTTTGTA CTAAAAAAAGGGTGGTTGCTCTTCATTGTTTATACTAGTAGAATATACTT ATTTAAGGTCTCCTGGAAAACGGTGTTTATTTGTGAACTACTCCCTCCGT CCAGGAATAACTGACTTGGGTTTGTCTAGATTCGAATGTATCTATACACT AAAATGCGTCTAGATACATTTAAATCTAGTCAAACTCAAGTCAGTTATTT CTGGACGGAGGGAGTAATTATTTGCTAATAGTAGTGGTTAAATGAGAGAT ATATTCAGAGAGTTAAGATAATTGGGTTGTTTCAGCTTGAAATAAAATTA CATGACCGAGTTGTATGTAATTCTAGTATGCTTGATATGATGTTAGTGTA CCATAGTTTATGGGGGCATATACGGCATGTCATTTGTTGCTTGGCATGCA TTGCCTAACCTGGGAATAAAAAAGGTAAGGAAATAGTTTACCATAGTTGC TAATTCTTAGTCCCATGTGTGATGAAGAAAACAAATGGGGCATATGTGAG AGTTAACTATTTTTTTGTATGTCTGTTGACATAGATATTTCTCTTCTTGT GTAACAATTGACTGAAAACTAATTTTGGTTATTGTTACTGCCATCATCAT TCGGAGTGTTAGAACCTACCGAAGGTTGATGAGCTCATTCTGATGCATGT ATTTTTCTGAAAGTATTTTGGGATAGTATCTGTGGATTTTGCAATGTCAT CAACACTGGAAAGTGGAAAAGGCTGCTTCATGTGTTTGCTTCCGAATACA AAAGCTGCACTGCAGTTATTGTTACAGTGAACAAAGCTAAATGTTAGAAC CAGACTAGTGGTTAATCTTCCTTTTGAAGAAATGTACTCCACTGTTTGTT GCTAAATATCTGGACTCACATGTGTTTCAGGGGGTGTCTGAACCTTTTGT TCCTCTAACAGACGAGGATGAGGACAGAGTTCATCATGCTCTTTGTGGCA GGAAAAGGTGTTACCTCTTTCGCTCTTGTTAAGACATAGTAGGCTGTAAA CACATTTTTGTGTGCAAATATCTAGCCTTACTTAGCACTACCTAAAGTCT GTCCTTTTTCTTCTAGGCGGGAGAAATTATCAGTGCATGAAGCTTCAAAT ATTGTCATAACAAGAGAGATATTGCAGTGCTTGAATGATAAAGACTGGCT AAATGATGAGGTATTCTATTTTTTCTGCTATATGTTTAGATGTTCTCTCT TTCCGGACTCCAGAGATATTCTATTGTCATAGAATGTGGCATTAGTATAT TAACTGTTCCTGGTATTTTCAGGTCATAAATTTGTATCTTGAACTTCTGA AAGAGCGGGAACTGAGAGAGCCTAATAAGTTTGTAAAATGTCACTTCTTC AACACCTTTTTCTACAAGAAGGTCCGCTACTATGTCCAGTGACTTGTAAC ATCATTTTGGCATGGCTTTGCTTTTGCTTGCAATTGTATTTGCTTGAATC CCTGTAGAGTTGCATTCAAGTAGTTTCTGTGTAATTGTTTAGTGCGTGGA TGCTGTCCTAAATCACTTTTTCCTACAGTATTTCATTAGCTTGTGTGATT ATCGTGTTTTTGTCATTACTAGAATTTTGTACCTGTATAGTATAGTTTGG TTATTGGTGTAATATCATTCAATTATTATAATGATACCTTATTCATAGTA TTTAATGGCAGTGAAGTTAACGATATTGATACATCGTACCTAGCTCGTTT TCTCATTAATAAGAACTGATAATAGGTTGTTAATGCCACAAGAACAAATT AGTCAGCACTATAATTTTCTCTTGTTTCTGTTATCAGCTGATTAATGGTG GGTATGATTATAAAGCCGTAAGGAGATGGACAACAAAAAGGAAGTTAGGA TACAACCTAATTGATTGTGATAAGGTAAATCCTTATTTTCAAGCTTTGAT TGTCATGTGATTTGACTATCATTCTAATTGGAACTAGTTACAATGTCCAG ATTTTTGTTCCGATACACAAGGAAGTGCATTGGTGTTTAGCAGTCATCAA CGTAAGGGACAAAATGTTTCAGTATCTGGATTCACTTGGCAGCATGGATA TGAAGGCCCTGAAACTATTAGTAAGTGATATCTCCCTCCCTCAGCTGTTC CTTTTCCTTTTCTGTTCAGGACATCAGAGAACTTTAGCTTTTCCACCTCT GCCAGGCCACATATCTTGTAGATGAGGTAAAAGACAAGAATGGCAAACAG ATTGATGTTCTTTCATGGAAGCAGGATGGAGTCCAAAACCTTCCTTTGCA GGAGAATGGGTATTTTCTCATCTTTGGTCATAGAAGGGGGCTATCATTGT TTTTCTGCTTGTACAATAAAGCTAGGTGTAAATATTGAAGTCTCTAAAAA GGGGGATTCATGAAATGTTTCTCGATGTTAAAAGAAAAATACAAATTCCC ACACTGTGTACTACTCCCTCTGTTTCAAAATATAAGATATTTTAGGTTTG TGAAGCAAATGTATCTAGACTACTTTTAGTTTATAGGTTCATTCATGATT GGAGTGAATCTACACACTAAAACAAGTCTAGATACATTCTCTTCACAAAC CTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGTACTTACTGAGTTTT TTGTCATCTTAGATGGGATTGTGGCATGTTCATGCTCAAATACATCGACT TCTACAGCAGGGATATGGACCTTATTTTTGGACAGGTACCAATGGGGCCC CTGGTTTACCTTTTTGATACTCCATCCTTACCAAAATGTAGAGCATATAA GATTTTTAAAAAGACAAACGATGTAAAGTTTGACCAAGTATGTAGAAAAA ATATCAACATATAGAATATCAAATGTGTACCATATGAAAATATACATCAT GTTGAATTAATGGTACATACTAATTTGGTATTCTAGATGTTCAAAATTTT CCTACATACTTGGTGAAACACTACATCGTTTGACATTTGAAGAATCTTAT ATATGCACTACACTTTGGCAAGGAGGGAGTACATATTATGTACTGCCACC TCCGTTCATATTAACTGTCGCAGCTTTGGTCAGATTTGGTTTAGATACAC ATGTATCTAGATGTGTTTCGTGTAGGTTCGCTCATTTTGGAAAAAGCTGA GATAGTTAATATGGAACAGACGGAGTATTTAGTACTCCTCTGTCCTAAAA AGGATGTCTCAAGTTTGTCTAAACTTGATTGTATCTAGACACTATTTAGT ATATAGATACATCCAAATTCAAATAAATTTGAGACATCCTTTTTAGGATG GAGGGAGTATTTAGCAGAATTTAAACAAGATTTGATGCTTCATTACCTGC TAAATAAATTAAAGTGTTGTTTTGAATGTGTTGTCTTTGATAGAAACACA TGTCTTATTTCCGGAGGAGGACTGCCAAGGAAATATTGGATTTGAGGGCT GGATAAATAAGAAGGGCATCATAGGTAAAACTAAAGGAATGTTCATCCTA GAGGCTAGTGTAATGTATTTGGTAGAATGCAGCTATGTCTTTCCTGGAGT GCTGAATGCAAGGATTTTCGGAGCTCCCTGGTTGCTCAAATAAGTCATCA TGTAACAGTCAAGCTCTAGGCCCTTCAGATTTGCTTGTATTAATTAACAA TTGGCTGCCATGACGGAGGATCTTGGCGCAGGCGCGCAGACGAGCCATTG GTGGAAAGAAGGCATGTCCAAACGTGGTTTATATCTGGCTATTAGACTTC AGAGCCACTGAGTAGTATGCTATGGCATTTTAGCATCTGGCCTTTCAGCG GTACGTTATGATTGTATAATCTGCTGTAGTGCTGCTACAGTTTTGTGGGA CGCAAACATTAATTTTTTCTCCTTTTCTTATATGATTGTAGTTTGTAACA CCCCAGATTTAGTTAAATAGTAATTAGGGTTGATTGTGCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.