Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA014528

[Submit comment/correction]

Sequence
AA014528
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA014528
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGGCGGGACGGAGGACTGGAGGCGGCGTTTTTCCGCGCCGTCGTTATCG
CCGATGATGCCGCAGCCGCAGGGAGCGCTGTCCCTTGCCGTCTAAAGCAC
GGAGAACGCCGCCGTCGCTCCTTGGTCGCGCCTCGCCTCGCCGGGAATCG
TCAATGGCGGTACGCTCTCCTCCTCTCCCCGCGCGCCCAGATTAGATTTT
GAATATATAGATCCCTGCCGCGGTCAATCTTCAAGGCGTTCTACTTTAAG
TTTTTTTCATAGATCCCTTCGATCCGCGACCATGTTGTTGGCGTAGAATA
TATAGGTTATTTCTTGACCTTGACAGGTTCAGAAATTTAAGAAAGCTTTC
ATGTGTGGTCTTTTCATGTTTTACGGTGACGAGCATGGAGGGAATTAGAT
AGCTTATTATTACCCACTGAAAAACGATGGCCCATCTTCCCTTAATTTCA
CCATACAAATTAACTTTTATTGTGATGTCTCATGCATTCTTGTTCTTGGC
TTGTGATGCAATATTAAACTCCGTATATCTCTTGCATCATTTTCTTCTCT
TTACATGCTATATATATATATATATATATATATATATTGGTCATTTAGTT
TCAGTATTAATCTAGCGTGGTTAACTCGTGTGTCGCAGGACCGGAGTAGC
GAGAGGGATGATGGCGACAAGTTCGAGTGGGGAAGCGATGGTGAGGCTGA
GCCTTTGTCGGCTTCGGCCTTGAGTAGCCTCCGTGTCTGTAGCCAGTCCG
CACTGGTTCGTCAACTAGTACCTTGTGGAAACAGCATACAACCTTGTTAC
TATTATAATGATACTAATAATAATGTGGTTTTATCTCTGCAACTACCTAC
AGGATGCTAATAAGTGGGCCCTCGGGAAAGCAACATCATCTACTTCATTA
AGGTTTTTACCTTGTCAAACAGCACAGGTACAGAAATTTATGAAAGCTTG
GACTGTAAAAAAGGTGTGATCTTATACTTGCTGCACCATATTCGGAAACA
TGGAGTATATGCTATTTTATAAAAATAATACACTTTTTAATCAATTTCAT
GAATAATATATAAAATTGGAAATTTCGGAATCTAGCGAAGCTTTGGATGC
TCGCGCTCCAACTGGAACTTTTCGGAGGCCTGTCCACTGATAGCCCTGCC
AGTCGTGGCAGGCCTGTAGTTGGAGGCCTGTACACCGAGGCCAGCAGTCG
GGGTTTGAGCCTCCGATTGGCTTAGAACCACACCAAGGCCTACATTGATC
ATGCAATGTAGCTATCATTGATCTGTTAACCCTAATATCACGTAATCAGT
TTAGTGTATTCTTTTGACCCACTCTGTTGCAAGTTATGTTTAAGTGTTTG
TCGAATAAAAATGCGAAATAATAGAAAGGTGTGGCATCACATAGATAGAT
ATATGGCTCGCACATAGAAAGATATATGTCTCATACATAGATATATATGT
CTCATACATAGGTATCACAGTTGTCGTTCATGACGAGGTTGCGGAGGCCT
AGGTGTACTCCATCCGTACCTGTTGGGCGCCCCCACATTAAAAGGAGGCA
GCCGTGACCCGTCACCCTGGGTGTATGTATCCTTTGTGGGGAATGGTGGT
GGAGTCTGCCGAACCAGTCAACTTGATCCTGCTATGTATGATGATCCTCC
TCCTCATCGGTCGCCCACGAACCTATGCATGACATGTTCGGTTGTCCATA
TCCTCATGCTCGTAAAAAATTTAAGTACTCAACAACTCATACTGCATGTA
AAAAAAATAGATAGGAAAATACTTACTCTTAGGCCGGGATTGTGGTCGAT
AATCAAAGTTCATGAAGGGGGTGTGATGTTGCTGCCACCGGTCAAAATTA
AACCACGGATACAATTACACTGTGTTAGACCATCATTGAAGAACAAAATG
AAGTAAGACAATCTGACTACATATATTAAATTGCGTGTGCATGACATCTG
GAAGGGGGACCTTCGGGCATGGAGGATCTATCAACTGGCAAAGACCGAAT
TGCCTCATGACCCTCTGTTGAGACATCTCCTCGACTTGAAAATCGAAGAT
CAGCCAATACTCTTGATATCTAGTGCACAAAGTAGATATCCCGTCGAGAT
ACCTTTCGGCTCTCGCAAATGGCGTGTATGGCTCCCAAATGACCACATCC
GCTCTCAACAAGTCGAACTGCTCGCTAAACGGGAGTAGTAGCTCTTGACT
TGATTTCCCGCAAAACGACATTGTGGCAAAAATAGTTAGTTTCCTCCGTT
GTTTAGTAGAAGTGCAATGTATTAAAACGTTTCACTTACCTTACCACGGG
TCCAATAAGTACCAAAGGTAGGCAAGTTAGTACCAAAGGTAGGCAAGTTA
ATTCCCTCAAAGTCAAACACCATATTAGACTCATAGAGAACGAGTTCCTC
TTCCGGTGCCACAAATGCTTTGTTGGGCGTTACGTCTAGGCGACCGATAG
GGAACCTCTCCCAAACCACAACCGCAACAACATTGGGCATCCTAGTAAGG
CAGACCTATCTTTGGTTAGCTGGCAAGCAATGCACATACCTCGGTATGTA
GCACGTCGCCTCTCTCTGTGGCAATGTTGATGTAGCGCACATTAATGGTT
GAACCGTGGTTCTTGGTGAACATTGCCTTCTAGAGGAGCCACATTATATA
TGCCTCTAGGCTGCGCGTAGTTTGTGGCTCGGTCATCTGATTGGCTGGGT
ACCCGAACTTTTGGAGCTACAATTGGTTAACAGAACAATTTTGATCACCG
TGTGATATGATGAATGGTAGGACAAAGCTGAAGATACAAAGTACCAAACA
AACCTGATAGTTTTGCAACCATTCAAATTTTGGGCCATGATTTTCGAACG
CAAAGGTCATAACTCCCTCATGGACACTACTAGAAAAAAGGCTATAGGAA
ATCGCACTATAGGAGACATATCAAACATATGCGCCTCGACTAAACATACA
CAGTGCACCAATATGACATGCATGTCGAAAATTTACGGACCAGATCGAGC
CGACCCCCTTTATTCGAGACGCATATGGGTTGGATGCGTCTTGTATAGTT
TAAATATTCGAGACGCATCCTGCCCATATGCGTCTCAAATAAGGGGTAGA
CCCGAGGCGCGCAGGTGCCTAGGTGTTCGAGACGCATCTTGCCTATATGT
GCCTCGCATATTTTTCCATACTCGAGACTCATCCTCTAATGGTGCGACAT
GTATATTTGAGGTGGGCTCGGGGGTGGTAGGTGCCAGATATTCGAGGCGC
ACCATTCACATATGCGTCTCGCATACTTTAATTATATTCAAGATGCATAC
TTTGATTATGTGTCTTCCCGGATCTTTTATTTGTCAAAAAATATTTAAAG
TCTTTTAAAAATAAAATAAATAAATAAATAAATAAAATACATTTTATAAA
ATGTGGAGAGGCAACCGCCGTCCAGGCCTAGCCAGTAGCCACCTACTACC
CAGCACCCCAAAACCCTAGCTAGACTAACCTGACCTCACCCTAAACACAA
CCTCACCCTGTCGCATGCCGCCGCTACACATAATTATTATTCTATATGCG
TCAGAACATAATTATTATTCGTGATGTGACGGTCGAGACGCACTAGGAAT
GCGTCTGGAATAGAAAAACCGTACATCTCGAATAACCCTTTTTCTAGTAG
TGGGATGCCAAGGAAACGTTGGGACATGTCCTAGACCCAATTTGCCGGCA
GATCCAATGGGCCAATTGGCACGCCAGCCAACGGTAGTCTCAGTAAGAAT
GAGACATCCTAAAGCTTACGAGTCGTCTCTCCCTAGTGAAAGTGGAAAGT
GTGAGTCTCGGACCTCCATCGATCTACTAAGAAGGTGAGCAATGAGTGGT
CGTAGTATTATCGAGTAGTCTGAAAGCCATGTTGTCGGTTGTCTATCTCA
TTCATACGAGTGGCCTCAACCAGACACACGGATGTTAAAAGCCTAGCCCA
CTTCAACCTGCATACCAAGATAGCATCACAGTTCATTTAGTCTGGTCCAA
AAATATTTAAAACAACGGGAGAAATAAATATGACAATACCTTTGAATCCA
ACCAGAATGTATCCACCAGTTCACGTGAGGAGTGCGAGTCACTAGGGGAT
TTAGGGATCCTGGACAAGTATCCAATAACGTGGACCGATGCTTTCTATCT
ATGTCAGCGTTAAGCAAAGATCATGTTCCTACCATCTGTACATATCAAAT
TATAAATTCCATAGTTCCACACATATTATAAATTTAATATCAATGCATTG
AAACTCACCCAAATCAACTCCGTGCTCTTTTGTTCTGACGACACCATTAC
CGTAGTAAAACCTAAACTATACATTATCTGACATAACCGTCGACCTAAAA
AATACCGAAACTCGTCAAATTTAGGTACCATGACACATTATAGTCTACAA
ATATACTTCTAATCTTCTAGCCCAATATTCTTACAGCTAACAGACCACAT
CCAAGTCTATCCATAAACATAAACAAATGATTGTAATTAGCGAGAAATTA
GGATGTACCCTTGAAGCGTGTGAAGTCCTTCCATGTAGCAACGTCCAGTA
ATCGGATCGGCCACTCCACCATGCAACTATCTCAAGTTGCAGCTCCAGTC
TCCACCATAGCCATTGCTCCCCAAGAACACCACCACCTTCCTCCACAAAA
ACACCCCAAATCACTTAACCAAGCTATCCTATCAGTAGATCGGGCCTTTC
CTACCTTCTACCTTCCAACTATATTTTAGCCCCAAGTTTTGGTGAAAATC
ATAGCCAAAATTAGCTCAAAATGGAGCTGGAAATGGTGGAGGTGAGTTGA
GGAGGAAGAAGGAAGAAGAGAAAAGAATGGGCAGAGAGAGGAGCGAGGCT
GGACGGCGCGACGCGAATAAGGAGTAGTCGCAGGCTCAAGCTCCGAAGGG
GCTGTCGGGGTCTCAACCCCCGACGAGTTCTTGTCGGACGATAGGCCAAC
CTACGGGCCTCCCGAGCCCTACTTTTTGGAGCACCAACCCCAGACAAGGA
GAGGGCGAGGTTTCAGCTCCCGATTTGTTCTCGTCGGAGCAGCGGCCTCC
AAGGTCGCCCTACATTTCAAAATAACTAATTTTGTGTATTATTTGTCAAA
TTGATTAAAAATGTATTGTGGGCATTAGCTGCTTGATATGTTATTGTCAC
TGGCATGGAGGGAATCTGATGGCTTATTCGACAAAAAAGATGGCCCATCT
TCCTCCTTGATTTCATGATGATTATATATGTTGGTCATTTGCTTTCAGTA
TTGATCTTGGGTGCTTAACTCATGTTGCAGGATTGGAGTAGCGATAGCGA
TGATGGCAACAAGTTCGAGTGGGGAAGTGATGGTCAGGCTGAGCCTTTGT
CGGCTTCGGCCTTGAGTAAGCTTCGTGTCCCTAGCCTATCTGCACTGGTT
CGTCAACTAGTACCTCGTGGAAACATCTTTCTTTCAGCATATAACCTTGT
TACTATTATGATTATAATAATGTGGTTTTTTCCTAACTACCTATAGGATG
CTAATGCGTGGGCTCGCAGGGAAGCACCTTCATCTTCTTCACTAAGGTTT
TTACCTTGTCAAACGGGACAGGTATAGAAATTTATGAAAGCTTGAGATGT
AAAAAAGGTGTGATCTTATATAAGTTGTGTTGTTGCCAATTTACTAGAGA
ATCTGTAGATTGTTGTGGGTTGCATTAGAGTGTGCTTGCTGCACCATATT
CGGAAGCAAGGAGTGTATGGCTGAAAAAGGAGTGTATGGCACTGGATTAA
TGTGTTATTGTGACGGAGATGGGGGGATTTAATGGTTTGTGTGCAATAAA
AATGATGATCTCGATTTCTTCCTTCTTCATAGTGCGCTAGAAATTTTGAT
TTTCGTGTCTCATGCTTGTTCTTGGGTTTTGATAGAATAGAATCCATCCC
TTGCAATATATTCTTCTCTACACTGCAATTTAGGTGATTTTCTTTTAGCA
TTGATCCGATTGTTGTTAACTCGTGTCACAGGACTGGAGTAGCGATAGCG
ATGGTGCTGAAAATTCTGAGTGTGGAAGTGATCGTGAGGCTGAGCCCTTG
TCTGCTGTGGCCTTGAGTAACATCAATGCTTCTGGCCCATTCATGTTGGT
ATGTCAAGTAGCAATTGATAGAACAATGCGTTATTTTACCTTGTTTATTA
TGATTAGATTGTGGTGTTTTTCGTGTAACTCTATACAGGATGCTAATGTG
TGGTCCCACGGGGAAGCACCATCTTCTTCTTTAGCCAAGGAATATGTAGA
AAAGTATTACCCAAAAGAAATGGTCTTCAAGGCTATCAACACTATTAGAG
AAAAGCCTATAGGAGACATGGTTATAGGAGGCGCATTCCTCAGACATGCC
ACTCCACTAAATATACAAGGCGCATTTCTAAACGGTGTGACTCCTATATA
TTAATACTAGAGGCACATTCTTGATGGATGTGTCTTCTATATCGCATGTA
CGAATCAGATCTGGTTTCCTCCCCTTACTCGAGGCGCATCTGCTCTATAT
GAGCCTCAAGTAGTTGGGTGGGTCCAGTGGTTGTAGGTGCCATAATATAG
GAGGTGCACCAGCAGATATGCGCCTCGAGTATTTTTTAATATTGGAGGCG
CATCACTGTGACATGCGCCTCGAGTAAGTGATGTGGGCCCAGGGCTGGTG
GCAGGCGCAGGACACTCGAGGCGCATCTACCAGATCCCCCCTTGGATTGC
ATTTTAAGTTTTCTAACAAATAAAACAAAATGATAAAAACTTTTAAAAAA
TAATTTCTCTGAGATGTATTTATATTCTAGGGTATAGTTGTAGACAAAAT
TGAAAAACATGAATTTTGATGTATTTTACAAAAATAGGTCATGGATCGGT
AAAATGATCATTACTTTTGCATACGATGTCAGAAAAAAAGTTTAATATAT
TAAAATGATCATCTCGAAATTTCCTACTCAAATTCAGTGGCTTTACAGAT
TCCCCAAATTTAAAAAGAGTAAAAATTTATGGCAGTAAAAATAATTCTGC
AAAAAATAAAATAGGGAGAAATTTTGAATCCCGCCAGCGCACCTTCTCCC
TCTCTATTCTCCTTTACTCCTCTCCTCCTTCCACTTCTTGTCTCCTTATC
CTCGCCTTCTTCCTCCCCTTCTCCTCTCTCTTCCTTCTCCTCCACTCGGT
GAGCTCCTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCACCCCGGTGAGCTCCTCC
TCCTCCTCCTCCGGCGAGCCTCCTCGTCCACCCACCTCCGACCTAGCCTA
GCCCTCCTCCGGCGACCCCCACCTCCGGCCAGATCTGGCCAGCTTTTTTG
TGAAATTTGAAATTGATATTTGAGGCGCATCTGTGAACTTACTAGATTCG
CATTACATGTGCCCCTTGTATAAGCTACATATGCGAGGCGCATATCAATA
TGCGCCTCCTATTATAGGAGGATAGGAGGATATGCGCCTCGCATATGTCG
CTTATACAAGGAGCACGCAAGATGCGACTCGCATAACAAATACTTGAGTC
GCGGCGCTCGAGGCGCATCCCAAATGCGACTCTAATGGCTTTCCATATGC
GCCTCGAGTAGGATTTTCCCTAGTAGTGTAAGGCGATTGGTAATACTACT
CTACTTCTGACTGCCATTTGGTCGATTGGTAATCCCTGTTAGAATTGGTC
ATGTGAAATGCAGGCCATAGCTGATTGCCATTTGGTCGATACCTTCTACT
TCTGACTGCACCCCCCTCCCCCCACACACACAAAGTTGAAGATTATGAAA
TGCAGGCCGTAGCCGATTGCCGTTTGTCGATTGGTAATCCCTGCTAGAAT
TGGTCATGCGAAATGCATGCCATAGCTGATTGCCCTTTGGTCGGTACCTA
CTCTACTTCTGACTGATTTTGGAAATTGGGATGATGACGACGATGGCAAT
AGGGACGCCAAATCCGACGGTTCTATTATTGAGGTAGATGATTATGTATA
TTTAACTTGATAATCCAGTACTAGGTTGTTATGTGAGATGATATGTGAAA
TTTTTGCCTTGTTGTTTTTTTAAATTTTTGTTCGTACAAGTGGAACATCT
AACACGGTAGTTGGGATGTTACTCCCCATCGTTTCACATTTTTTGTTATT
ATTAGTTTAGCTATATCCCATTGGTTCAAACCATCACCAATAGACAGTTG
TTATATCCTACTTGTTTAGTCAACACACCAAAAAAGGATGTGTGCCATGA
CTTTTATCTCGGAGCAGGAAGCATTGGTTGGATCTTGGACATCTCTTGCT
TGACTGAATTGTTACGTGTTTAGAGTTTATATTTGCATCTCTTGTCATTA
CTCTTTGAGGTGCCACCATGAGCACTTGTTCACGTAATGTTTGATCATGT
CTGTTTTTCTTTTGCTCTAAGATTTTTATTTGTGTTAGTGTACAATTGTG
TTGTGAGGTTTGAGCACTTGATTTTTATTTACATACAATTCCTAATATGC
TAACTTTTTCATGTAGGTGTGTAATATTTTGTAAGAGAGACTGAATACTA
TAAAACACACACCTCCTGCAGAGTAATCAAGCAAACATTAAAAGAGTAGC
ATATTAACTTATAATATTCTTGGCCTATCATCTATCATGCTGAATAAAAA
ACATTAGTTATTTATGCATCTAAATATTAGTTGCAAGTGCCATATGCATT
ATATTGCAAATGAGAAAATCATATATGATAGTTTAGGTGGTTGTGTTAGT
TGTTCTCTTTTCTCAATTTCATTATCAAACAACACTAGAGAATAACAGTA
TGAGTTCCTAAATTATCTCATTAATTTGATTTTTGATTAATATAATTTTT
TCTTGTTTCCCTGATAGTCTACGATATTCATTTCATGATCACTAATGAGG
TGTACCCCAACCATTTTTCCTAGCATCGTAAACATCAACTCGCAATTGTA
TTTCACTATCAATGCACTGTCATTTATTTTTCCTTCATCAAACAGGTAAA
TGTAAGCATTCTAGTTAATATCTACTTTTTCTATGATGCAGGGTTTCAAT
CACGAGGTGGTAGAGAAGGACAAGAAGATCAAGTCCTTAGTGTATGTGGA
CTCTTCTAAAGATGAAGCCAATATGATTATTACCAGATGTGGTAACGCAT
CTATTCTTATAAAATTGTTGCTTTCATGATCTTTTTTTGTAAGGAAAATG
CACCGTATCTTATATATTTTTGTTTAAATTTTCTTTCCTCCTTTTTTGCA
TTAGATAATTCCAAGAAGTTCTCTGACCGTGAGGTACATTTTTGTTTTTG
ATTTTACAATGAACAAGACAAGTCTTACACTGTTTTTAATGCAAGGACAA
TAAGGTTTATGCATAATTTTGTAGGTTATGAACATGTTCTTCAACTCCTG
TGGAGGGAGAAAGAACGAAAGATTCAGAAAAGAGAACAAGAAAAAGAGGA
AGCGTTATGGAGATCATGAGCAAGAAAATCAATCCCCCATGGATGATGGC
CATAACAAGCCAATGGTTTTTCCAAATCCAATGGTTGGTTTTGGCTTGCC
TAATGACATGGTACAGCCAGTTAATAGAATACTTCCTAAAAAAGCTATTG
GACTACCATTCTTCTACTATGAGAATGTCGCCCTAGCCCCTAAAGGTGTA
TGGGAAACTATTTCAAGAAAATTGTATGGTATCAAGCCAGAGATTGTGGA
CTCCAAGTACTTTTGTGCTGCTGCCAGGAAAAGAGGTTACATCCATAATC
TCCCTACTGAGAATAGGAAGCCTCTCAAGTCAGGCCCTCCAGAGACTATA
TATGAAGCATTCCCTCATTATAAAAAGTTTTGGCCTTCCTGGGACTCAAG
AAGGCAGCTCAACTGCTTGACAACATGTGTCGGAGGCACAAAGCTGGCAG
AACAGATTGAATGTACACTTGCAAATGCTGACAATCCACTATCTGCAAGG
GTAAAAAAATATGTTATGGATGGGTGCAAGGCAAACAATTTTGTGTGGAT
TGGCAAAAACAAGGTTGCTCCTTTGGAGGCTCATGAGATGGAAAAACTAC
TTGGTTTCCCAAAGGACCACACAAGGGGAGTTGGCATAAAGCAGAGGTGC
AAATCTCTCGGTAACTCATTCCAGGTTGATACAGTTGCTTTCCACTTATC
AGTGTTGAAGGACATGTTTCCTAATGGTATTAAGGTACTATCCTTATTCA
CTGGTATTGGAGGAGCGGAGGTAGCTCTGCACAGACTTGGAATTCACTTG
AAGATAGTAGTTTCTGTAGAGATATCCAAAGCGAACAGGAGGATTTTCAG
AGGTTGGTGGAATCAGACCCAGCCTGAGACAAGCCGACTGATTAAGAGGT
TTGACGTGCAGGATTTCACCAATGACAAAGTTGAGTTCTGGACTAGAAAA
TTAGACGGCTTTGACTTGGTGATTGGGGGCAGCCCATGCAACAATCTTGC
TGGTAAAAACCGGTTCCACCGTGATGGTTTAAAGGGCGAGCATTCGGCTC
TATTCTTCGAATACTTCAGAATATTGGATGCCGTCAAGTCAGTTATGGCG
AGGATGTCAGTTCAAAAAAAAGAGTTATAGCGGGGTTGTAGCGTTATCAC
TGTAGTGTATGTCTGTCCATTTAGTGCTTATGTTTAGTAACCGAAACTTC
AAGGTCAAACACTGAGTCAATGTGTGGATTTTTATCTAGGAGACAAATCG
CATTTAGCCTTAATTGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.