Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA007539

[Submit comment/correction]

Sequence
AA007539
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007539
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAGGCCCCGCCGCCTCACGTCTCGCCCAAACCCTCCGCAGAATCTCGGAA
CAAACAAACCCGACCACGCTCGCCGCCGCCGCCACCGGCACCACCGGCTA
GAGTGCGCGGTCGATCTACCACTACCGGCGAGGCGACGATGGCGGAGCGG
GAGATGCTGACGTACGTGGAGGCGACGCTGGCGGACGAGGCGGAGGGCCC
GAGCGCGCACGCGGCGGCGCTGGACGTGCTCCGCGATATTCTCATGTTCA
CCGACTCGGACCTCCTCCTCTCCCTCGTCAGGGTCGACTACTTCGCGGCG
CGCCTCCCCACGCTCGTCTCCGCCGCCGGCGCCGACCAGGGCGACGTGCC
GCTCCTGGCCGCTCGGGCCGTCGCCGAGGCCGTCGAGATCCTGCCGCAGT
GGGCCGACAACTTCGTCAAGGGCGGCGCAGTACAGGCGCTCCGCGACCGC
CTGCTCGCCGTCGACAACCTCGAGCTCGCCGAGGAGGTACGCACTGCGTG
GCGCGCGTGTGGTGCTCGTGCGTATGTACATACTCCTAGCATGTGCATCT
CGTTCGCGCGACTCTCCGGGCACTAGTATTTAATTAATTTAACCTAGCAT
GCATGATCTTAAAACCATGGTTAAACCCTACTTGGACATTACTTAATTGG
CATATATTATTGTTAATAATGTTCTTGTTTAGTAATTACATGGCTTGAAC
GAAAACTGAGAGCAAAGTTTCCATGTTATGTTGTCTTTAGGCCTTTGACA
ATGAGAGTTTCTTCTTAGCACAGGATTATAAGCAAAAAAATTGATGTGGC
ACCATATTTATTGATGAGAGCAAAAAAATGATGTGACACCATATTTAGTG
ATGAGAGCAAAAAAAAAAGATGATTTGCCTAATCACAAGCCTACGTGTCA
TCAAAATCATTAAATATACCGACAATATTTAAGAAACAATCTATTGGAGA
GGTTATCTTTTAAGTATTTATTTGTCCTACGACAACGTGCTAAGAGACTC
TGCATTGTGAAAGGCCGTATAGTACAGTACTGTACTTTATTAATTTAACC
TATTAGCATGCATGATCTTAAAACCATGGGTAAACCCTACTCATGCATTC
CTTAATTGGCACTATTATCGTTAATAATGTTCTTGTTTAGTAATTACTAC
ATGGCTTATGAAAATTGAGAGCATCAGTAGTGACACTTTAAATTCTCTTT
TTTAAGGACTTCAAATTCTCTTAAACTTACCGTAGTCCTTTTAATTTGTT
CTCTTACGTTCAAACAGAGACATTATATATCTGGTTGAAAATTGGTGTGC
AGTCGGTGGTATCAACTGTTATTCACTCATTTGTCATTAGAATTTTCTTA
TACATCACTTTTAACACCATGTACTCTTAGCAGTATACAAATTGTACACA
ATACTAGTACAACAGTTCCAATTTGTTTTTGAGAAAAAATATCTGTACAG
TCATACTTATTTCCCTGTGCCTTTTTGCTCTCGGCAGTGCCTGCGAGCTC
TCAAGTTTATAAGTGCGGAACGGCCGACCGATTGCCTCCGCCTGGGCGTC
GCCGCCGCCGTGCTGCAGTTCTTCGACTTCTTCTCCACCAGCAAGCAGGT
CAGCCTTCCTCCCTTCCCGCACCCGTCATGGCTTTTGCGACCCCGCCCTG
CCCGTAGACCCGCTTGAACCCCGCCGTGCTCATCACATGTTTGTGGAAAT
GCCGACAGAAAGATGCGCTCAAGATCGTCGCGGAGCTCGTCGAGGAATGC
GAAGAGGCGGACGTGCCCAAGGCCATGGAGGCCGCGCCAGCGCTCTGCAA
CCTCCTGCAGTCCGTTGACAAGACGGTACGTACGCGCGTTTCTGGTTATT
GTTGCTGTGGGCTGTGCATGCTCTGTTTTCCGCTTGAGCTGTTCTGATCG
ATCCGTGTGACCAATGTCAGATACATGAGTCGGCCCTTTCTTGCCTGGGT
ATGCTCGCCTCCGGTGCTCGTGGCAAGGCCGAACATATGGATAAGCTTTG
CGAGTCCAACATCGTCGAGACGGGCATGAGATTGCTGGAGAAGGATGGGT
GGAAGAACCTCGGTGAAGAGAGGTTGCATGTATGTGACATGATTCCTGTA
TTCTCTTGCTGTTGCCAGTTCACATTTTACCACTGCTATCTACTTGTCTC
ATCTTAAGCACATGAGGATTCATGGACGAATTGGCGTGTGTTGCAGGACA
TCCTTGGGCTGCTAAAGAGTCTTTCTTCAGCCTCAGCCAAGGCTGTGAAG
TCCCTCTTCGACTTGGGTGTTTGCAATTTACTCCATCAGATGATTACTTA
CTACAACTCCTTGCACAGTAACAGTGATAAGGTACTATACTTGTTCTCTA
AGTGTTTTTGTTTGAACTTGCAGATTTCATGATCCTACTGATTTACAGCG
ATGTTCTCGTCAATTTACTATGCATTTAAATGTAGCAAAAAACATGTGTT
TATGACAGATTAGAGCAGTTCGTCTACTTTTGAATGGTACAAAAATGGTG
CCCTTTTGAATTTGGTTCATATTTTAAGAGTTATTATAGATGTGCGTTTG
ATATATCTCGGTAATAATAAATATGCGAATGAACCTCTACATTCATGCTG
CTCGTGCACATTTTGGTGAAATGCCTTGACACTCTTCATTTCCAAACTTC
AGTTGCAGATGCTTGTGGAGTTCATCTATGAGCTTATGCGGCCTCTTGAG
GCATCTGACACTACAAAGAACAATGCTATCTTGGAACATAATGCATACAT
TGATCAGATTTCTAGCATTGCAACACTTATTATACAGGTATATATGAGCC
CATTGACATTCATTTCAGTCTGCTAAAATAAGGAAGTGACATAGATATTT
CTGCTCCTAATGTAGGTTGCAAAGTGTGGCGCAGTCTCATCAGTTTGCTA
CAGATGTATTGTTATCATCGTTAACATTGTTGAATTAAGCACACCTACTT
TCCTGATTGAGTTACAGAAGACTGCAAATCTCTCGAGGTGAATTTCTGCC
ATAGTTAATTGTATTTTAAAGAATACTTGATAGACTTAAGACCGATGTTT
ATTGACTAAACGTATTTCATCTTACATGTTAGTCATGATTGTCTCTTTGT
TCTTATGTCAGCTTCCTTACGTGTCTGTTGGCTCGGAAGGACCGCCATGT
CGTGTTCCAAACGCTCAAAGTTTCAAAGAGCCTCCTGCAAAAGCACCATC
AGTTTTTCCTTGAGAGCTTTACCAAAGAGGGTGTAAAGCATTCAATTGAG
GCCATGCAAGCACAAGAAAAAGATAGGAACTCCATTCAAAAGTTGAAAAG
AAAAGGCAATAAACAAGAATGGTGTGTTTGCTTCGATTTAGACTCAGATT
CTTCCTCCACAGATGGGTGCAAGATTGAGAAGAATGATATCCTGAATCTA
GCAGAAGAGATAAAGAAAAGCTTCTTCATGGTGAAAGCAAGTAACAAATC
GCCACATAGATTTGGATGTGTTTTTACAATCGTCAAAGAGTTTTTTGCTA
GGTTGAATGGTCATACCATAACAACCCCCACGCAGAATTTGGATCTCTGC
AGAGAGTTGTCTGAAGTTTCGAGGAGATTTTTATCGGATGAACTTCCAAG
TACCTCTACTTTTGCATTTGCGAAGAGTGGATCATCCAAATATTTATCAG
ATTATCTCTCCAACGGGGCATACTTAAATCCAAATCTCAATAATTGCCTG
GACTTATTAGAGCGGATTAAGGAGGTGCATCGTCGATTGCAGAAATTCGC
CCGTTTGGCTCTCACAATGACCAATGAAAGCTCTACCAAGCCCCTTGAGA
TTTTGGTGGAGAAGCTCCTAGACGCTCTGCATATGTCTTATGACAGTTTT
CCTGTAATACTATCTGACCATGAACAGTTTGATCGTGAGAGCACGATGAT
TCCTCTGAGGCATTCAGGAACCGAGGAGTCAGAGTCACTGGATATAAAAT
TTGTGAAGGCACGCAGGGAGAAAGAGTTGCAAGGTTATGGTGGTGTTCTC
CCTGTTACTATATTGTCAAAGCCAGATGAAATTGAAGAAGTCCTTTGGCC
TAAGATTTGTTATCCCGGGAAAGGGCAGGGATCCTCAAGATTGTTGTTCT
CTTACAAAGGCACACAACTCAAGCCATCTGCAACATTTTTTGAGTCACTT
GTCTGTTTAATGTATGAGGGACAATCTGATATCATCATTGACGAATCTTT
CTGGGACGAAGAACACAAAATATCGTATAAGAAAGACAAAAGCAAGGAAA
TCTCGTCTGCGAGTTCATCTAATACTAATTTATCCGCTGTGTATGAAAAG
CTTGGACAGTCACTGCTGAAGGACCCATTTTTCGACACCATATTCCTTGG
GAAGATTCCTGGTGATGTGGATGAATCTGATCCATCCTACAGCTTGTTAT
TCACGCTGAGAGTTCTTGAAGGGCTTAACCGTTTTTCGTACCAACTGTCA
ATGGATGAGAAGATACGCTTATTTGCAGAAAGCTGCCTACGAGATTTCGA
CGATCTTAAGGTGACAATTTCTCCAATCCCGCAGCTTCAGTTCATGAGTA
GCCTTCTGACCAATAAGCTGGAGCTGCAAATGAAAGATAGCTTGTTTGAG
GATGGGCTGATACCCTCGTGGTGTATCTACCTGGTGGAAACTTGCCCCTT
CTTATTCTCCTTTAATGCACGATGGAAGTACTTCTGCCTGACTCTGCATC
GCTCATTCACGGGAGATAACACAGGTGCTCCTGATGAGCCAGACGAAGAA
GATGAGGCAAGTGATGCTCAAAACGAGGCTGCTAAAAAAACTAAGAAGTA
CAAAGTAACACGAGGGAACATTCTTGAAAACGCTGTACCAATGATGGCCA
AACATGGGTCAAGTACCAAAACCATTGAGGTGGTATTTGAAGGAGAGGTT
GGGACTGGGCGAGGCCCAACCTTGGAATTTTACAGTACAGCTACCCATGA
ACTCCAGAGGTTTGGGATTGGGATGTGGAGAGGTGATAATGCTAGAAAAG
CAGAAGGAGAAACTGGATTCGTTCATTCTAAATTTGGGCTATTCCCACAG
CCATGGTCGTCAGCAATGACTTCATCACGAGGGGTCGAATTCTCTGACAT
GGTACAAAAATTCAAGCTTCTTGGACATATTGTAGCGAGAGCGATTCTCG
ATGGAAGGATCCTGGACATCCCGCTCTCAAAAGCATTCTACAAGATCATG
CTTGAACAGGTAAATTTTCAGGAATTATCTAAATATAAACGTTTATGTCT
TCCTTTTCTTTTCTCAGTTGCATCTCCTATGTTCTGATCATGGCTCGTTC
TTTGGTTTTAGGAGCTTGATATCTACGACATTCCATCATTTGATCCTGAG
CTGGGCAAGACTATACTAGAGTTTCAAGCACTTGTTAAACGGAAGAAGTT
CTTGGAGACATGTTCAGAAAATACATCCAATCCCTCTGCAGCTTTGTCAT
ATAAAAATATGAGATTGGAAGATCTGTGCCTTGATTTTACTCTTCCCGGA
AATCCTGAATTTGAGCTTGTTCCTGGTGGCTCAGAGAAGATGGTGACACT
TGACAATTTGGAGGAGTATGTACATTTGTTAGTCGATGCAACCTTGAAGA
GCGGGATCGCCAAACAGATGGAAGCTTTCAAGTCTGCAATTAATGAGGTC
AGTTTGGTGTTCAATGTTCAGTAGATCAAAATTTAGTTGAATCGTTTTCT
GGGAGAGGACGAGTATACTGATAGATTTCAACAACTTGCAGGTTTTTGCT
ATTAAGACCCTTAGAATGTTCAACGAGGAGGAGATGGAGCGCATACTTTG
TGGTGAACAGGATGCTTGGGCTGTAAGCATATCTCCCCATGATTTCTTAC
GTACTCCCTCCGGTCCATATTAATTGACTTTGATTTGTTAAAATTTGGAT
GAACCTATATAGTAAATAGTGTCTAGATTCATTCAAATCTAGACAAATTG
GAGTCAATTAATATGGGCCAGAGGGAGTACCTTCATTTATAAAAGAAGAT
TTTCTGTTTCATGGTTCTCACTTGGTATGTTTCTTGCAGTCAAGCAAACT
TGTAGATCACATCGAATTTGAGCATGGCTATGATGCGCACAGTCCACCAG
TAGTTAATGTAAGTAGAACCGAGTCACAAGGCTAGCTCTCGAATATTTGT
CTTTTGAACAGCTAGCTAATAAGAAACTGGACTCCAAATAATGAATAATG
CATTGCTGCAGTTCCTGGAGATCCTGCGGGAGTTTGGAAGAGAGGAGCAG
CGGGCATTCATCCAGTTCACGACAGGGGCTCCTCAACTCCCACTTGGTGG
CCTAGCTTCGCTCGATCCAAAGCTCACCGTTGTGCGAAAGGTTTGCAACT
CTTTTCACATAAGGAACTAGTCTACTCTAGTATGGCAAAAGCCTAATAAT
AAACAGATGGAAAACTTACCTGACCATGCATTGTGTTGTGCCACAGCAAT
GTGATTGCGGTGTCGACAGTGAGTTGCCAAGCGTCAATACTTGCCGGCAC
TTCATCAAGCTTCCTCCGTACTCCTCGAAGGTACAGTCCCTTCCACGTAT
ATGTATATATATAGTTATTTCTTCAACGCGATGCATAGTCGGGACGATTT
CTCACCTGTCTGCGTTTCTGGATCACAGGAGATAATGAGAGAGAGGCTCA
AATACGCTCTCGCCGAGGGCTTAGGCTCCTTCCACTTGTCATGACCAACA
GCACAAGGGTAGAAGCACAATGTACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.