Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA031973

[Submit comment/correction]

Sequence
AA031973
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031973
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAGGCTCGCGAAAAAAAACCCGGACGACACACTGTTGCAGACCTCATTT
TTTTTTGAAACAATGCAGACCTCATATTAACCTCTCCGTTTACACAAAAC
GGATCCGGCCCTCTCCTTCCTTACTTCTCGTGTCCCTTCCCCGAAGCCTT
CTCCGGTTCTCCCCCTCCAGAACCCTCTTTTTCCCTCCCATGAGCTCTGA
TCCGCCGCCGTGGGCGGCCGAGCCGAGGCGCTCCACGCGCAAGCGGTCCG
CCGCGACGCAGTCCGACCTCGAGCTCGACGTCTCGGATACCGAGACCAAT
GCGGGGGATGTAGCCTCAAGAGGCCTTGGGTGCACCTCAGTGGAGATCCG
AGACCCGCCGCGCCCCAAGCGCCAGCGCAGAACAGCCCAGGAAAAGGACG
AGGGTGGCTTGAAATCGTCAGGGTGTAGTTGCTCCAGGAAGAGGCATCTA
CAGGATGAAGCCATGGGGCCTTTGGTTAAGAGGAAGAAGGTATTTTTTTT
CTGTTTTTGGAATGTCCAGTCGGTTAAAATTCTCTCATCTTCCGGCAATT
ATTCTGTTACTAGGGCTAGGAGAATATATAATAATTTGACATTAATTATT
TTCATTTTGTGACATGCAAAGGATAAAAGAACGATTTTCTATTATGTTTG
CAATACTTAATTAGCAGGTCACCTCTCGTTGGATTCCCCTGTAGTAGTAA
AACGCAGTTGTTTCATGATCATTTAGCATTAATTGGTCTTTCTTGCTTTA
GGTCCAACATTGTGCTACACTTTATCTCGAAAATCTGAATTGTGAGGTTG
CTGTGGGGTACTCTGAGAAGGATGTGAAAGAATTTCTATTTGGATCATCT
AATGTGCTGCTTGCCAACTTGGAAGCAAGTCTCAGAACCTATTTATGTTT
ATAGAGAGCGTTATGTTTCCACATTTGAACTGAATCATTCTCTATCCGAT
GCTCACATTTTGAAGAACATGGCAGGAACCATCTGAGGTGCCTTTTGATA
TTTCCTTAGTGTCAAGAGAAGCTAAGTCACAATCACTTCAGGATAAAAAG
GCCCCTGGAAAGAAGCCACCTGCTGGTGCTTCTGCCCTTGCACCCGTTTC
AGCTGTTGATGCTTATCAGAAGGTCTTCTCATCCATTGCTGAGTTCTCTG
GGTTCGGAAGGCTCTTCAAGGTTTGCAGAGTAAATACTTTTTAGTGCTTT
AGGACATGATCACATGATAAATTCTTTTCTTACCCCAGTCATTAGAACCT
GTGGAGCTGACAGAGGCAGAGACTGAATTTGCAATTAATGTGGTTAAGCA
CATATACGAAAGACATGTTGTATTGCATTACAACTGTACCAAAATGGTGG
CTGCCAAACTTCCTTGTCAACCTCTAAATAAGTTGTTAAGATTTAGCAAG
TATTGGTCTTACCAAGTGTTGGCATCAAACCAAGCAGCCCTTTCATGCGA
AACCTGCTTCATCTGTCAATACAACTTGAGTAGGTTTTGGCCGTGTGCAT
CTGTAATGCTGCTAGGGCAATGTGTTGTTGCAGAGGCTGGGTGTAATTGG
TATCTCCAAGATATTAATATATACTCTTTGTCAAAAAAAAACAACTTGAA
TAGTCTATAAAAGAAATTAGGAATATAATATAGTCTGATCTGGACTTCAA
ACAACAAAGAGTTAGGAACATAATTATCCATGAAACAGGGGAATAACATG
TAACCTCAACTGGCATAGGCGCCAATTTTTCTATTCATCGAGTTAATGTT
GTTTTGCATTGTCAGGTTGACACATCTTCAGGGGAAGTCGATGAAGATGG
TGTGGAGGATGGATCCCAGATGGAAGACCTTGAAATTGTTCCAGCTGATT
ATATGTTGAGGATTGCAATTTCTAACTTTAGGATTGCCTTGGAAAATATG
GGCCCTGAAAGTGAGCATGAAAGTGAGCTTGTCGATGAGTATGGAATCGG
TGCTAGAGAGAGCTTGGCTGAGGCTGTGAGTGCTGTCACTGATATCCTTG
GCATGCAACCGTGCGAGGTGAGCTACCAATTCTCTAAACTAACATTGTTA
GGATGGTTGCTTATGTTTGTATTCATCCTTAGCTGTTTCTTGGAGCCTTG
TTTGGATGGTTGTCCATGTTTGGTCATGTCAATGCCTCTTTGCCTACCCA
GTTTATTTTTCCTGCTGGCATTGGCCAATCATGGGCAAGCGAAGCCTTCC
CCAAGATTTTGGCTTGGCCAAATTTCTTTCTAGGATCCACTCTGGTTCAA
ACCAAACACACCCCAAACTTTTTGATTGAAAGGTTGCTAAATCTGGGGCT
TTGCAGGGCCTTATTTAAGAGATGCTTGTAGATGAGGTAGTCTGGTAGAT
GTGGTAAAGATGGTAGTCTGACAGGTGTTTCTAAAAAAACATTTATTTCA
GAGGGCTTAAAAAACTGCATTAGTGTTTCAGAGGGCTTAAAAACCAAACA
GAAGTACTTCATATATGCAATCTGCTGGCTACAATGTTGTTATACATTTT
TTGGTGGTCACAAGTATTTAGAGGGCTTAAGCCTGGTAGGCCTCTAAAAT
AGTTAACAAAAATTTCTGTTCAGGCTGAACCCTACCTGACTGCTGGTTCT
TTGAGAATGGCTGTAATTATGCACAAGATTGCTCATTCAGACATACTGCC
TTCTCCACAGGAAAAATCTGCTTGTAGTGCCCATGCAGGTTGGTGTTCTA
GGGATTTTGAATTCAAGCCTCATCTCAATTCATCTTCTCGATCACTGGTA
CGTTACCTTCCGTTTTCTTCTCTATATGTGTCTAGAATAAATGTACTTTA
TCTTGTAGAACATCGTAATTAACTTCAAGCATTTAGTTTCTATATGATGC
CATAAATACAATTTGGCCTTCGTTTGCATATTCAACCAATAGCCTTTGTT
CAGCAAAGTTGCTGAATCGTTGCATAATTCTTAATCTTTCTTGTTTTTTC
CTCTCTTTGTAATGTGTCTATGAAGTTACCTATTTTATTATGATATTTTT
TGGACAATAGAAGGTAGAACTGTCCCAGATGCATGGTAGATTTCACTACT
GATCTCATTAACTATATTTGGGCATAGTCCACAGTGTTATTAGTCCATGT
TCCGGTCATTTGAAAGGTAATGCCAGAACTGGAGTGTACGGCTAGATATT
CCAGTTTGAGTGTCAATGAAAATGAACTAGAAATTCAAGTTAAATACGTG
TATCAAGTTTATTGGAAGTTTCATAACTGCAGCCGGAATTCACAGACTGA
AAAACAAGCTGTTTGTGGAAATAAAGAGATAAGATCCTTGTGACAATAAA
TTGGTATAGATATGGCAGTGCGCAAAAGTTGTGGAGGAAAAGTTTATTGT
ATAAATGAGGTGTGTTTGAAAAGGTACTTGAAATGATAGTTTGGAGAAAA
ACTAGAGAGCATATGTAGTTTAGTTTATCTATGCTTGCTACATTAGTCAC
ATTCTTTCTTGATTCTTGTCGACTGGATGCGTGTAACTTCTGTAATGCTG
ACATTTTGTACTGCAGCCTCCTGCTATGAGTGATTCAAAAAACCATGAGC
ATTCTATGCAGAATCAAGGTAAGAATCCCATATCACACTCTAGTAGTATG
GTGACTGAAAACAGACCTCCCTGTTCACGTGAGTCAACTCTTACAGTGAA
TGTTTCAAGTGCTCTGAGCCAACCTGTTTCAACTGAATGTTGGCGCAAAT
ATGGACAGAAAGTTGTCAAAGGAAGTCCCAATCCACGGTAAGTACATATG
TTGTTCATTAATTATCTTCTCTCCTTCTGTTGTCTACTTGTCTTGCATCT
GGACTTGTGTTAATGTAACGGTAAAATATTTACTTTGGTTACGTTTTATG
GATCAGCTACTATGTTAACTTATGCACTCTGCGCGTACCTTTTTGTTATA
TGCTTCGTCAGTCTTGAGTCATGTGTCGAGTTAAGTCTCTTTCTTAAGAA
ATCTCATAATCATGGTGTTGGTTAAATGTAATATCTTAACATGAATTCAT
TGAGTGGACAGATAGAAACAAAATTAAATGGCCTTTGAACTTGATTTGTA
CTTTGCATCTATGCTCTGGTTTAGGATGAAAATTAAGTGGACATAGCTGG
TGAAGTAATGCGTTAGATGAAATATCTGCTACTTCACCTTTATCACTGTT
GGTAATAAAATACGGAGATTGAAGAATTCCTGTTCCATATTACGGTCAGC
CCATACGATAAAATATATGCTACTTCACGTTACATTATACCGTCAAGGCA
ATTTATTGGTTGGTAGGGGCCTGTTTTCGGAAGGATGGCTTTTGGCTTGA
AGCTTGTCACAGCTTGATTTCTGGGAGCGTAATCTGTAGAGGAGGATCAG
ACCGGGAGAAACAGGAGAGCTCTTGGGAGCTGTAGAAGGGCAGATGCAGC
TAGGGCTTAGGTCCAGATATTGTGTGCGACAATGTAAAGGGCTGAGGGAA
GAGATAGGAGTACCTTTTAATTCTTTGGTTGATTCAGTCTCATGTTCGCT
ATCTCATTATATAGAGGATCTTCCTTACAAACAGACTCTGACTCCATATC
TAATATGATCTGACCTTTGATTTAATCAATAAGGACTGAACTGGTCTCCG
ATTGCAGTAGCTGTTCCCTTCCATCAATGGAAATCCTACTTGCTGATACT
TGCTGATACTTACCCTCAGGAGGCCCTGGGAGCATGTCAGATGGGCTGGG
ATCCGAAATCTGCTGCACTCCAAGTGCCAGTGCAGAGCAGAGGAGGAGGA
GGAGCAGGCGAAGGGTGGGGTCAAACCATATGGATCTGTATACTCAAGGA
AGAGGGCTGTACAGGAAGAGGGCATTGGTCGGTTCGTGAAGAGGACAAAT
GTATATAGTTTTATGCGTTTTATGCCTTCTTTTGAAGAAATATTGACTGT
GCCGTTGGCTAAAATGGTTCAATTTTTTTATTAAGATCAGTATTGCCTTG
ATTGTTGGCAGGTCAACAATTTTGAGCAGAACAAACTGAGAATGTCACCG
TGGTAAGATTTTCTGCACCCACACACTTTCTGACTTGAATGATCGTGTAA
CACTAAGTAAACTACATGCTTTATTTATATTCATTACACTAAGTCTGCCA
ATGAGAATAACTTGCATATTTTCTTAGTTATATTGTGTTATAACTGTCAT
CCAGATGTGGTTGCATTCTATTCTTTCTCAGTTTTATTATATTGTATGGC
TTTATCTGGAAGCAACTTCTTGCGCCCTTCAAGAATTCATGTGAATCTGA
TAAAAAGTTATACTACCAATTTGGCATAATATGCATGCTTTCAGTTTAGT
GCACTTTGGGTTTTTCTTGTTCCTATGGATGATTTCTTTTTCTTAAGATA
CAACATTTTAGGGAGTAAGATCCATGTTGCTGTATTGTGTTGGTTATGTC
TAGTAGTATTATAGTTTCTTGCAGTATGCTATTTTTGTTAGATGAATATG
CAAGTTGTGCATTCGATTTTTATACATTATACATACCCCAATGATTTAGC
CGTCAGACTGAATGTATTACCATTACTTTCATGAGTCATAATTTCTCACA
ATTCAAACTATTTGTTGTGAAACAACATTTTAGATGATTCTTTTTGTTTT
GCCATTTCAGCCAGTTCTTCGTCAATGTTGGTGGTTTTCGTATTTCCATG
CAGAAATATTTGAACAAAACTACCGTCAAGATGTTGGCCAAGTATGTTCA
AGATAGGGTGGGAGCAAATGTCAACGATTTCTATTGCACCTATGCTGGGA
AGTGCTTGAATGAGGAGAGGTTATTGTCTTACTACCATATTCAAAGAGAT
TCAACAATTATGGTTCAACATCGGCTAAGGGGTGGAGTCAGGTACGGAGT
CCAATAACTATCCAGTAGTACAATCAATCTGAGGGAAGCCTATGTTAATA
CCACTAGTCTTCCCTGGAATTCCAGTTGTGTCATTGCTCCCTGGAAGTGA
ACAATGGCACAATTGGAATACCGGAATGGACTATTGGCACTGACATAAAC
TTCAGTTGATCTTACAGTTTGAACTTTGAAGTAATGGTTGTCTCCTGTTC
ACAGGGAGCAAACAATTGAATGTTTGAACTGGGAATCGGCTATTGATGGT
ATTCCCCGTTTCCACACGGTCGCTTTGCCCCCTGATTTTGTTGATGCTGG
AACCAACAGGGCAACTGCAAAGTACTTATCCGAAGCTATCCAGGAACGAA
GCTGTCAAGTACTAATAGCCTTGTGCGAGGTTCATCTCAGAAATTTTTCT
TTGGATGGTAACTTTGGGCCAGAGCACATTTTGTTTTACAAGGGAAGGGT
GTTCTTTGATGATGCTGTTCGCGAGGTTCGGTTTAGTCCTGTGAAGGGCA
GAAGGGACTATTCTAGAGTATTTGACATTTTTCTTCCTGTTTTTCGTGAT
GAAGCCAATCCTGATGATTTTCCATTGCATTCCCCGGACCTGTTAGACTT
TTTGTTTGATTGCCCTCCTAATTTTGATCTAAGATCCCTAACAGTGGTTG
CATACTTAATAAATCATTCTGCAATACAAACTTACACCGAGAGAATCTCG
ACATGCAAGACCCTTGAAAGCATGGTAACAAGACTGTTTGGGATCCAGTT
ATGGCGTTTTCAGCACCTTATAAGCCATCCAGATTGGCTTCCTATTCAAA
ATGTTCCAGCATTGCACGCTAGATATATGTATGATCCCATATGGAATGAA
GTTATGCACGAATTTGTTTCCAAGTATGGGAATGATTGTCGGGAATGCCT
AAAATTGGCAGACAACTACTTCAAGCATGCCAATGACAATGTTAGTGCTG
CTTTTTGCTAGAAAAAAGTCCATATTGTTTTCCATGTCTTCCTATCTAAT
TTTATGAATTTTTGTCTCAATAGATCCACATGGAGGTTGTTGAGGCTGCT
TTCTCGTTAGCAATGTCTGAGGATAATTTCATGCCTCGTTTGTTACAAAC
TTTGGCTGCTTTAGATCCCCCACTGCAAGATCCTCGATTTGATGTGGTGA
AAGTGTAAGTTCATACTTCTCGCTTTTTTTTCACGTTTTATGTATACAGA
TATATCTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATGTAAGGCGCCTAAGCTTTAGT
CAAAAGTCAACATATTCTATGTTTGACCAAATTTATATGTGAAAATATAA
ACATCCACAATATCAAATCAATATCAATAGATTCACCATAAAGTATAGTT
TCCTAATATGTCCATTCGATATTGCAGATATTCGTATTTTTTTGTATAAA
CTTGGTCAAACTTAGAAGATGTTGACTTTTGACTAAAGCTTAGGCGCCTT
ACATTTTGGGACGGAGGGAGTAATATGTAATGATGCATTGCACGCTTGGA
AATTAATGTTGAGATGGAACTACAAACCATCTTTTTATCTGATATAAAGC
AGTAATGTTGCAAAAGTAGCATCAGCTCGCTCAGTGGATAAAAAAGTATA
CGTCAAACGAACTGAAAGCCTTTTACATGCATTAAGATATTTCATCAAGT
ATCTGGTCAGTTTTAGAGTATCCACCAGTGGCACTGTTAACACTTCAACA
TGCATACATTAAAGTATATAGGGTGCAACTTTCTGTCTCCTTATGGATTA
CAACTGAAGGTGGTTAATCTAGTGATCAACAATTCTTTATGTAAGAAACT
GAAGGAAGTCCAACTCTTAGTTGTTTCGTGTGTGGTCGATGATGTCCTGC
ATGTGATTAAGAAATTCAGTAAAAAGAAGCAAATGCTGCTGTTTTTGTCT
CTACATAATCAGCAGACAGAAGATTTATACTTAAGAGTACACTATATACA
TTGAGGAGTTTGACTAGGGCCTACAGTTTCAGATTACATATTTTACTTGA
ATAAAATGAGCTAGGGCCTCTATTTTCTAGATGACATATTTTACTTGAAA
AAAATGTGTAATTGATTACACAAGAATAGATATTTCTTGCAGGTTAATGC
TATGTCTACTTTTGAAATAGACATTATTGTGACACCCTGCATTCATGTAA
ACATCTTTTTTGACTATTTTTGCACCTTGGCATGCTTGATTGTCGTGACT
CTAACATAAGCTCTCGTGTGGCAGCTTTGGGACACATCGAGTATCTTGCA
GACCATTGCAAGTTGCCAACTGATCTGAGGTCATTTCCGTAGTAGCAAAT
TTATGAAGTAGTTGGAGGACTTACTGATGTATGTAGGCAAAAACTTAAGT
AAGCCCAGATTTCTGTTGGTTGTAATCAAATTTGAAGATTACCTTGGTAT
CTGGGATGCCAGTGGCTGAATATTCTAAGCGACACTAGGAGACGCTCTCC
TTCTGATATGTTGGAACTTAACGGTTCTACTTTTGGAAGAACTGGATGGT
TGCCCTGAATTGTTATTCAAACCCCTGATTCCCGTACAATTAACACAGTA
AACTTGAATCCTTTTTGTGCCATCACAACCCGTTGCAACTTATTGACGAT
GTAGCGTTCATTGCATACTTTGTTGATGATTTGAATTGTCATTTGAGGCT
GGGGAGGCCTTAGTAGATAGCCTCTGTAACTGGGAACTTTTTATACACCA
GTATATAGCATAAAATTTACCGTACCACTTCATGTTTGTAGAACAAAAAA
CCGCCAGATTTTGGTCCGATCTTTCTAAATCTATAGATCTTTCTATCTAT
CTATCTATCTATCTATCTATCTACTAATTTTTCTTAAGGTAGGTTAGTCA
AATATGTTTTCATCCGTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.