Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA006378

[Submit comment/correction]

Sequence	AA006378
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA006378
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAAGGCCGCGGCCGTGCCGTGTCCGCCGCGGATCTGCAGAAGAGGGA GGAGAAGGGAGAGGCCGTGGTGCACGAGGTGGAGGTGGCCGTGGTGGTTC CGGAGGAGAAGGAGGCGGGGGTGGAGGTGATGGCGCCCGCTGCTGATCTG GAGCGGAAGCGGGCGAGGGAGGAGGATGTGGGGGGCTCTTCTTCTTGCAA GAGGAAGAAGGAGGCGGGACACGAGCTGGAGGTGGTGCCGGAGGAGGGCG GTGCCGAGTCCGCTCTCGGTGCTGATCTGAATCAGGTGGTGTCGGAGGAG GACCGGGCGGTCGTGGATCTGGTGGTGGGCGACGATATCCTGGCGGGCGG CGATCTCGTTGTGGCGGATGTGGGGGAGCAGGTGGCGGTGCAGGACGTGG AGGTCACTTCCGTGGTGGTGCCTGGCGTCATGGAGCCTACCATCGTGGAG CCTGGCACCGTGGAGCCTGCACTGCATGTTGGCGAGCCTCAGGTGAGTTA AATTTGACGCTCTCTTTTAGATTGTACGGTTCATATTTATGGTTTTGATT TGTACTTTGGTTTGTGGTTAGGGTTTTGATTTGTAGTTAGGGTTTGTACT TAGGCAGGGGCGAATCTACCGGCTATGCATCATTTTTCTAGATTGATTGA AACCATAGTTTTTCCCTTTCATCTTGTATTTATCTATTAGCCGCGTGATC CGGAATCGATGATATGTTAGATGATGGAATTTCCTGTTGTAAGGAAATTG GTTGGATTGGATGAAAGCCAGATATTGTTAAATGATGTAATGTGATATAT TTATCATTTAGGAGTTCACAGTTATTCTTAAAAATAGCGTTTGAAGGCCA TTTTCGGCTATCTCTGCATTCACAGAGGAGCAAATCTCACTGTTGAACCC TCAGTAATCATAATTTTCCAATTTACCGATAAACAAAACCTTTTTGATTA TCCTATTTCCATATGTTGCTAGCTATCTAGTGTAGATACTTGTGATCTGT CTATGTAAAGTTAGATGAACTGCTGCTACAAACTTGATATAGCTAATCAA CCATGTTGTTGAATTGTAGCTTGTTTTTTTGGATGTTGAATAGCCTACCT TTTAAGGTTATTGTACATCCCCTAGATATTTGGCATGTTTCCAAGTTTCT CTAGCTCACCATCTTGCTGTAAATCAATTCTTGGGTGTTTCTAGATTCCT TGTTTGTGTGTAGATGTGAAACCTTGCTTTCAAAGTCTCCTGTATGATGG CCAGTGTTGCTTATATGTTGTTCATGATGTTTTCTCTTGGTTGATGCCTA GATAAGTTGCATGGTGTTTGTGTGTTTCTACCGCATGTCCTAGTTGTATC AAGTTTGTAGCAACAGTGGTTTACTCATGTCCTAGTTGTATCATGTTGCA TGGTGCTTATATGTTGTGATAAACAAGTTACCACATGTCCTAGTTTACTC TTTCCTAGTGGTTTGTTTCATATGATGCATGTTAATCCATCTTCAGCTAA ATTTTGTGGGTTTTGAAGTGGAATATGTTATTGGTTTATTGCTTAAAGCC TGTGATTTTATCTATGGGCTTGTCAATATTATCCTTTGATAGGAAATGCA TATTCTTGACCAATTATGTCCATATATATTTGTGTTATCCATTTGTTTTT TCATATATATATAGTTTATTACAAAGTCTGAAACAATTAACTTTGCATCT GTTTGTTTTAATATGGATGTACAGTACATTGATCCATATGGTTTCCAGGA GGATGGAAGCCCACTTTCGGTGATACATTCAACTTTTTACATATTATATT ACATTGCACATTCATTTTGTAATATTTTTTTTGCATTTTGTAAGATTGAA TGTTTGTTGTGTGCATTGTAGTTTGACTCGCAGGACAGTGATGAGTCTGT GGACAAGAGGAATGAAACTTCCTTCATTAAGAAGGAAGTGATCCAGCTGC TAGCAAACAACCGCGGCCCATATGTGGTGAACAACAGGTACAGGTGCCCA TACCATCCTAGGAAGCCTAGGGGTGGGATGCTTGTGAACCTGCTGCAGCA CGTTCAGCAGCTCGCCATTGGCAGTTCGGATGCTCGTGAGAAGGCTCAGC ATAAGGCTCTGTGGGAGGTGCTTGTCCAGGCAGACTTGGTGTAGTTAGTT ATTTGGAATGTTATGTATGGTATGTAAACATCTAGTCTGTGTTTGCTAGT TCTGGACATGGTAGGTATGATCTTCTGGTGCACTTTGCTGTGATGAAGGT GCTCTTTTGCTTTGGATGTTGTGAACAATCTAACGTTTTAGTTATCTATG ACGGTCTGAATCTGTGCTGTTAAAATGTGTGTGAAAATAACTTTTAGTTT GCACTTTTGCCATTATGTTTGAATTTGTTATTTGAAAAATATGTAATGTT TTTTGAGAAACACATATGAGTTTTGAAATCATTTGATTTGAATTGAAACG GAAATTAGAATTGAAAAAACGAAAAACAAATAAGAGGAAAAAATAAATAA ATCGTACCTGATAACCAGGCCCAGCGAGACAATCTAAGCACTGGGCCAGC TCCCGTTCCCGTGGCAGCTCCGCATCGCTGTGGGCCGGCAGTAAATCGGC CCGTTTACGCGTGCTGCCCGCGGTGCCGATGTGGGTGGGAGTTTTAGTCC CACCTCGCTAGTTGGAGGCGAGGAGGACCAGCTTATATACCCCGTTCGAT GCTCACCCTCGAGCTCCTCTCAAAAAACAACTCCGATTCACCTGCTATCC TGTCCCTGTAATGGGCTGACCTCTGGGGCCGCCAGGCTGTACTACTCTGG TCTAGTTCGCTTGTAATGGGCTTGAGCTAGGCCAGTGTGTGGAACCCAAC CTCCAGAGAGTTAAAAGTTTTTTCATGATTTTTTTGCCAATTAATGTACT GCGTATGTCGGCCAAAACGGGGCCTTTAGGGTCGTTTTCACATTTTTTTT AGTCATGCGCGCAACGACAAATATGAATTTTGAACAAGAAAACTTATAAA TTTTGAACAAGCAAAATTTTGAACTAAAGCTACATAATTGAACAAGCAAA CTTATAAATATTGGCATGGCATACATTTCATCTTTTGGTGTCTGTCAGCA AGGATGCCTTTAAATACCATTTTCCATTTTTAAATTCAAAATTCAGCTAT ATTTTGTGAAGGAAGTACAAAATTTATAGTTGAAACCTTTGTTTCACCAG CATGTTTAGGTAGATGGGGACATTTGGTGGGAACATAACCACTTTGGTGG TCTTTAATTTCTATCTTGGTCAATTTGTAGCACAAGTCAAAGTTTGGTCA AATATGAGAAAACATGGAAAATTTGAACTATAGCTACACAATTGGAACCT GTAATATTTTGGGAAAAATCATTTTTAGGCCCACGGGATGTGGTTTAACC ATGGATCTATTGGTAGATCAGCTAGGTTCATCCCTATGGCTACTCGGTGT TCGACGCAAAATTTGACCAGACTTTGACCTGGCAGTATAAAATCACAAAA ATTCAAAAAATAGTGAAACCTTGTCCATTGGTCTTAGATTGTACCCTATT TAGAATGAAAAATATTAAACCTTGAGTTTATGGAAGCAAAGATGAGTTTG TTGTCTCACTCTTGGTTCCAAGTGTGAGTCTCGTGGGTGTGTACCCAAAT TTCATAGGACATGGCCAGCTCCATGTCATACTTTCTCAGAATTGACTCAA ACTTGGCAGGGAGGTGTGTCTTGGCATGGCATACATTTCATCTTTTGGTG TCTGTCAGCAAGGATGCCTTTAAATACCATTTTCCATTTTAAAATTCAAA ATTCAGCTATATTTTGTGAAGGAAGTACAAAATTTATAGTTGAAACCTTT GTTTCACCAGCATGTTTAGGTAGATGGGGACATTTGGTGGGAACATAACC ACTTTGGTGGTCTTTAATTTCTATCTTGGTCAATTTGTAGCACAAGTCAA AGTTTGGTCAAATATGAGAAAACATGGAAAATTTGAACTATAACTACACA ATTGGAACCTGAAATATTTTGGGAAAAATCATTTTTAGGCCCACAGGATG TGGTTTAACCATGGATCTATTGGTAGATCATAAAGGATTATTTGGAAAAA ATTATATGGGTTTGAATCATTTTAAATGTAACTTGGAAAAAGAGAAAATA CCTAATCATAGATAAATATTAAATAACAAGAAAATTATAATTGAGTGGAT TTAATAACACAGTAAAAAATAATATGAAACCTACTTAAAAGGTTTCGTAA AGGTTTAAAATCAAATTGAGTTTTGAAATCATTTGATTTGAATTGAAACA GAAATTAGAATTGAAAAAACAAAAAACAAATAAGAGGAAAAAATAAATAA ACATACCTGATAACCAGGCCCAGCGAGACAATCTAAGCACTGGGCCAGCT CCCGTGCCCGTGGCAGCGCCGCATCCTGGTGGGCCGGCAGTAAATCGGCC CGTGTACGCGTGCTGCCCGCGGTCCCGATGTGGGTGGGAGTTTTAGTCCC ACCTCGCTAGTTGGAGGCGAGGAGGACCAGCTTATATACCCGGGTCGATG CTCACCCTCGAGCTCCTCTCAAAAAACAAATCCGATTCACCTGCTATCCT GCCCCTGTAATGGGCTGACCTCTGGGGCCGCCAGGCTGTACTACTCGGGT CTAGTTCGCTTGTAATGGGCTTGAGCTAGGCCAGTGTGTGGAACCCAACC TCCAGAGTGTCAAAAAAAATTTCATGTTTTTTTTGCCAATTAATGTATAC GACGGCCTAAACTGGGCCTTTAGGGTCGTTTTCACATTTTTTTTATTCAT ACGCGCAGCGACGTGGTGGGTCAGATAGACACGACCGCGTCGTGGCTACA TCGTCGCCCTACCGCCGTCTTCTCTGTCCCAGTTTACAACCGTGTTTCGC GTTGACTCCTTCGAGGAGCGACCGTCTGTACGTTGCGGCGACTCGGCGGA GTGCGCCATTCGTATAACGGCGGCGGGCAGGAGAAGTACAACGGCGACCG TCTCACGTATGATCGCATGGATCTATGATCGCATGCACCCTATCGCTTTG TGCCTAGATCTATGATCATGCAGATCTATGATCGCATGGTTTCGCGGTGT GCAGAGAGGGGTTGGCGGGGCCAGGGGACGTTTTGATCTGTGGCGGCGGA GGTAACATGGTAGGGTGCAGCGGTGGTGGGAATTACTAGGGTGCCAGGGG GACGTTTTGATCTGTGGCGGCGGAGGTAACATGATCGCATGGTATGATCG CATGGATCATGAGCAGCTGATTGAGTTGGGAGTCAAGCCTAACGACTCTT TTGGTTTTCCAATATGACCATGACGATAAGTTAGAACGAGCATACTTATT TTTTAAATTGGCATTTTTTACACTTGTTTTTAATGTAGACTTTTGTTCCA TTTTTTCTTTATGCCAACAATTTCCTTTACATAGTATAAACACATGCATG CACTAAGTTGACAATTGTTTTTTATTGTCATGTTGATTTTTCATGCAGCG TGATGGAACTGGATGGTAATATTGCTTGCTCTGTTGAAACATGGTGTAGA CTTGTGGGCAATTTTACAAGTCAACAACGTAGCAAATTTTTGGAATCAAA TATGCGAAGTATGTTACAAATTCCACCAATTCGGATGCGAGTTGTCTTAC TGCAGTACATGTTTCATATTTATGATCATGACTCTAGCACTTTTGTCCTG CGTAATAAAGGCAAATTTGCATTGACTGCACAAGATGCAGAGTGCATTTA TGGATTACGAAACTATGGTCTGTCTGCTAATCGTATAATTGATGAGGAAG GTGAAGACGGAAAGTCCCGTATTCCACCACATTTTCTCAGCGCAACTACT GGCAACATTGTTATTGAAGATTTAATAGCTGATATTGTCATAAGCAAAGC TGCGGACGATGACTTCCTCCGCAAATCTGCCCTTGTTCTCCTTGGTACAG TTCTGGCGCCTATGACTAAGAGGATTGTACCGAAGGATTATTGGGTACTA GTGGAGGACATAGACCGTATGTCCACCATTAATTGGAGTGAGTTGACGGT AGATCATCTCATGGTATACTTCAGGCTTGTAACTAGATCTAAACAAATTA GGAAGTGGCCTAAGGGAAATTTGTCTTTAATACATGTATTAAATCTGTTC TTAACATTATTTTTAATATGGTAGTCTTCTCATTTTATGATGCACTAACA TTACACTTGGTTCACATGCAGTATGTTTATTGGGAGAAGGTCAAGCATGT AGATGATCCTTGTAGGATAAATCCAAGTTTGTCCTTGAGACCACTCATGC GTAATTGGACAGATGATGCTGCTAGGATCAGGGATACAATGGACTGTGAT CATGGTCGGGGTGAAGGACCTATTCTGGTAACGATCCATGTTTCTAATAT CATCTGTATATATATCATGTGGTTATGTTAACAAACTTACGCCTCTAGTT TGATTAATAACATTGAGTTCTACTAATGTGTATGTATCAGGTTGAAGATA ATATAACGTTGGAGTATAGGATTGAAATGCTAAATAAACCGGCGCTTGTT CTCAAGCCAAAGGCAAGTTCGGCTAGGAAGGCTGTAGCCAGAAATTCAAA CCAAAAAATTACTAAAAACATGCAGGAGGTCCTGACGGAGTCTATGATGG AGCGAGTGATGGATCGAGTGATGGAGCGAACAATGAATAGGATGGAGTCA ACAATGGAGAAAATCGTCAAAAAAATGATAGACTCATATGCACATGTAAT CACCATGTTATTGCATGTACTATTGGGAGTTTCTATTTTTATATCTGATA GCTTACTAGTACATTATATATTTCCATTTAATTTTTCAGGAACTAATTGT CAAGTTGAATAAAAATGGCATTATGTACAAAAGCAAAGAAGTTGAAAATG GAGATGACAACCTATCATTGAATAATGGATCCTCTAGTACGGGAAAAGAA TTTTGGTATGGGAAAGAGAGTGCAGGTGCTTATGCTGATCAGATTATTAA GGAAACTATTGATTCAATGAAACACACTGGGTTGAACGGTAATGCAACGC CCGACGATGGCGCACATAAGGATGGTTGTAAAGATGCAATAGGCAGCACA CCTTCCAACCCAGAGTTAGTGCTTGATATTTCTACAAAAGCCGTGTCAGA CCTTCCATCGGAAATGTACGGAATTAGCAAAAATGGGAAAGAGCTGGATG GAGCAACTGCGTCAGACGATTCCAACAGCATCGGTAGTAAGTTGGATGTT AACAATGAGCCGGAACAAGGTTTGGGAAACGTAAGCGCAAAATTTCTACA AAACTTGAAGGTTTCGTGGGATATGAGCCCCCCAAACGTCGTGCACTTAA GAAAGGTACTCCCTCAGGTTCAGTTTACACGACACCTTTTATTTTTCATG CAGTTTCACTAGGAATGCTGGTTTAGGCGCATAGCCATTTATTACTGAAT AATTGTGGCGTTTTAGCCTAGTACTCCCTCCGCTCCGGATTAAAGGGCCC CTAGTGATTTTGGGGTTGTTCCGAATTGTATTGCATGGAAGGCGAGAGAA AAATTAATTAGCTAAGTTATTATCCTCCTAAAAACGCTCCTGTCCTCTTC TTTTGAACTCGAGCATGCATTGTCAGCATGCAGAGGTGGAAACTATCGCA TGCAATGTGAGAAATCAAGCGAGCATGCAACACACTCCATTTACACGAGC ATGCATTGTATGTGTACCTAATAATTACATCTGTATGTAGTTCTAACGAG TTTTTTTAACCATTTTCGTAGGATTATTTGTAAACCAAGATGATGATACA CGAGTCCTGAGTGCTAAGCAAATACAAGCAGCCGTGACATTGGTTGAAAA CGCATGTAAGGATGAATCGAATGGTAAAAAGGTTGTTTACCAACATGCAA ATGGAATTATGTTGAATTCATTAAAGCTTAAAGATGTGTTGGACCATGAG TGGGTTAGCGATCGTGTAAGTTCTACTGCGTTATGATTATTTTATATCAT GCTAATACATAATAATGTTACCACTCTGATAAAATTAATTCCTCTTATGG TTACAGTTAATAGACAGTTACATTGGAGATTTGTCACTTCGTGTGGTACA TGATCGGTACCTTTTCAGTGCATTAAGAACAACGTTCCTTGTAAAGAAGG GTACAACTTTGGAAGAAGCGAAAAAATCCAAGCATAACATGGACTTCACT ATGTCCAAAAGTGGCTCAATTGAAAGAGTCATGGATGAATATTTCTTGCG AAATAAGGTAATTAGAACGTACATCATTTGTATGTTGAAAAGTGTTTTGT TGATTACATTCTTCAATTTATGTAGGTATATTTCCCTCTAAATATAAATG ACGCGTATTGGACGACAGTAGTCATGCACATACCGAAACAAGAATTTCAA GTTCTCGATTCTTTGTACTCTTTATCTACAATGAAGAAAATAATTGAAAC AATGGTAATTTATTATCTTAACTTTATCATGTACTACCTTAATACTTGTG TACATTACAATAATTTTTGCATTTTTCAGAGATATCAAATAGCGTATGAC ATAAAACAAACTAACATGATTACAAAATCACAATACCCTGACGTATCAAA ATGGCCTATGAAACGTTATGAATTGGCTCGGCAAAGAGATGGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.