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GrainGenes Sequence Report: AA002074

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Sequence
AA002074
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002074
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCTAAACCATCACAACGGAGTCCTGCTGTTTTCAAAAAAGAAAAAAAGT
TGCTAGGTGTGTCAGTATCAGCATGCCCTCCTCCTAACCTGAACCTAAAC
CCCCAAATCCCAGAGACGCCGCCGTCTCGCTTAAACCCTAAGCTCAACTC
CGCGCCCCCTCCATGCCAGGCCGCTACCACCTGCTTGGCTTCCTCCGCCG
CGCCGCGGCCGCCTCCTCATCCGGCGCCGCCCACCGCGTTGACCCTCTCT
GCTACCTGCACTCGATCCCACTGCGAAATGGTGCCGCCGTTCCAATCAGC
ACCCGATTCCTCTCCTCGCGCGCCGGCGGCGCCGCGAAAAGCCTGATCGA
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TCCACCTCGGCGTCAGCAGCGGCGACGAGGGCGAGGGCCCCACCCGCAGA
CCCGCTGCCTCAAGAGGAGGCCGAAGAGGGAGGGATTCGGGGGGACCGCC
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GCGTGGTGGTCCGTTCGGCAGCGACAGCCGTGGTGGTCGGTTTGGCGGTG
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GGGTCTCGCAGGGGCAGTCGGGGCCGTGGTGGAAGAATGTCAGGTTTGTC
AGGCAGAGGAGGCAAGGAAATTGATTCAGATGACCACGAGGACGACAGCG
ATGATGCAGTTGAGTTCAGAGCTTCTGGTGGAAGGCATAATCGTGGTGGG
AGAGCAGAGAAGAAGGGAAGTTTGGGCTCACGCAGAGGAGGTAAAGTCGG
GGTTGTGGATTTTGGTGACCGGCAGTCAAGGGGCGGGAAAGCATTTGATT
TTGGTTCGTCAGAGAGTGATAGCGAGTCAGGGGAAGTTGACGAGGATGAT
GGGCCATCAGGCTTTGAGGATGATCTCTCTGGTGATGATGGTGGCGACGA
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GGTAGTGATTCGTATTTGAGTCAGAAAAGGTAGCTCTTGCTCAAGTTTTT
CTAATTCAGAATAAATAGATCCTGCCATTGTTATCAAATGTTTCTCTATG
CGCTGTGTATTGTTTTTTGTTCTATATGAAAACTAGTTAGATTTTTTTAC
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ATATTTGAGTTGTGAAGTGCACTGTAAAACTGCTTGCTATCTCTGTAGTG
GGTCATTTTATTTACTTTTGTTATCTTTGACTAAATGTTTGTTTAGTAAA
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TATGCACACATTTGAAACTTATGTAGCTGCCTCCAACATAGATGAAAAAC
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TAGAACCTCTGACTAACTACTACCCAAGTATCATGTCACTATCTCAATGA
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TTTTCGCAATCATGCCATTATTGCTTAATGAATATGTTCTTGTTTCTTAA
ACTATTACTTATAAATCCCACCGTGAGTTTCTTTGAAGCATCGTATGTTG
ATGGAAAAGTATGACATTTGTAGCATAGTATTGAGGGCACTTATACTGCT
TGTACGGCAATTATTGTATATTACAATTAGAAATTTGTTGAAATATGTTT
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TGGCTTATTACATCCCTATGCTCTATAAGACTACAAGTGGCAATCTGCAT
TGTGTCCAAATAGTCGTGAATATGAAAAGTATTAATAGCATATGTGCTGA
TAATGCACCTATCAACCTATTAACCTCTAATGCCCTATCCTGTTGGAACT
TCGCTCCCTTTGCATCACAGGTTTGATGAATGCGCTCTCTCTCCCTTGAC
ACTAAAAGGTGTCAAAGCTGCTGGGTATGAACGGATGACTGCGGTTCAGG
AGGCCACTCTTCCTATTATACTTAAAGGTTAGCGCAGTGCTGTTTATATA
TGTTAAAGTAGTTATGATTTTACTTTATGCTATGCATATTTTCCCAACAT
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CTGTTACCACTCTCTTTTTAGTCTTTTTTTCCGATAAAACACAAAAGAAT
TTGCGTTTCATTTCCTTGAACAGGAAGAGTTAAAAAACGAGGTCACCAGG
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CTGTGATCTTGCCACTAGGCCTCTGCCTAGTTCTCAGGAAGAGTTTAGAG
GTACAACCTCCATAGAGAAGGGACACATGCACGCAGACACGCGCCCACAC
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CCCCAACTTCAGACTGCAGCGACGAAATGCCTCACCCAGCCTGGCCTCTA
GCCATGAATTGCGAGGCATCGAGACTCAGAGCAACAGGGCTGTGTCACAT
CTGTTACCAGATGCCTCCAAAGACGACCACATCTCCAGGGCTGCCCAGGC
CAACGTACCTTGCACCCATGTGAGGAGAGTCGGCAGGTGGAAGGCAGGAC
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ATTGCACCCTGAAGGTCTGTGCCCTGTGCAGCAGCCCAGGACAGAGCAAC
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GATATCTCTTCCACTGTTTCTCGTTTAAACCTTGTTATTTTACTGGGCCC
CTGATGTGCGAAGTTCACCTATTACTCACCCAGTTAGCTTCATTTCCTTT
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TGCTTCATGGTGTCCAACTGACCATGTGTTGGTGACTCAAAAGGATTTAA
TAGGTTAACTTTAATAACTTGTAGAAGGATCAGGGTATTAAACCCTGTTT
GTAGTGTGGGAATTTGCAGGGTTTGCTCTGCTTGTATTCAAATTTCTGTG
TTTCAAACACACCCTTACAGAAAATTTTGGAAGTTTGTTGACCTCATATT
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CTGAAAACCTTCCTGTTTATCGCTCCACACACCCACCAGTCACATACTCA
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ACCCACTTCTGCTTCCTGTGCCTGCCTTCAGTCGTCTAAACCTTTGTCTT
CTCCGTCCCTTTGTCAACCTAATTACTTTTTAGGGCAAAAGCACAATATT
ATGGAGTTCTGAGCATGCATGAGTGACTCCCCCATCTCCTTTATTGTTCA
AGTTAAACGGAATTTCTTCAAGCTTACCGTGAAAACCAAAAAGTATAGTT
AATATGAAAACACATCAGTGGAATTGGCAGTGGTCTTATAGTGCTGATAC
TTCCATATAGTTTCCCTAAAGTTGTAAGCTCTCGACCGTCTTAAACAAAC
ATGATCCATGTATAGATCCTGAAGTTTTGAGTTATAAATTTTCGACTGGT
TTTAACAGCATGGGTATAGGTTCCTGAATTCCAACAATTAGTTGTGAGCC
TTCTGAAATCTGAATACATATATCTGAAATAATAAGTAGATGAGCTCACT
GAACTTGAGGACTGAAGATGGATTTGGTGTCTTAGCAAATAAAGTTGTTC
CGACGGGGTAAATTTGGAGATAGTGGGATAGAACAAATTTGGCAAGCTAT
AATTATCATCAATATTCTTATGGCTCAAGGTACACAATAAACCTCTAGTT
GATTTAAGAGGGGGATCTGGATAAAATTGTGAGTGGGACGGGCCTGCCGC
CAAGTCCGCCTCCCTTCCTGCCTGCAAACCCGATTATCCTGCTTGTGGCC
ATTCCATTTTGCACCGGCGGGATTAGCGGCCGCGCCCATTTGTCCCGTCT
GTAATCTGCCAGTGTAGTTATCTGCAGCAAAACAGCCGATGGAAGTGGAC
GTGATTCACAGGCAGCGTGTGCCTGATGGCATGAAGACGCGCAGCCGACC
AACGATGGAAATCAATTCTTGAGAAATCGACCGTGAAAAGAAAATCTGAG
CAGAGAGCCAGAGACCGATCTAGGCGGAGAGAAGTTCAAAGATTAATCGG
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CCGTGCCGCCTGCATTTTTTAGATCTGGACGATATTTAGTTATGAACTAT
GCTTTTGGGGAATAAAGTCAGATACTATACATACATGTGGAAATATGATA
ACCTGAATTGCATCTTTATAGTCATTGCCGACTATCTAACATGCCTTTTT
CTCTTTAGGGAAGGATGTTCTGGCCAAAGCAAGGACAGGAACTGGAAAAA
CTGTAGCATTCTTGGTGAATACCCTGCTTGAGTAGTGTTTTTCTTCTGTT
TACTTTTGAGGCTTCTATAAGTTTCAAATTGTAATTCATCATTGTTTTAT
GTTCAGCTTCCGGCCGTTGAAGTTATCTCCAAATTGCCCCCTACTGACCA
TGATAAGAAAAGACCTCCCATTAGTGTTGTTGTCGTGTGCCCTACACGTG
AGCTTGCTGATCAGGCTGCTGCAGAGGCAAACAAACTTCTTAAATTCCAT
CCATCAATTGGAGTACAACTTGTAATTGGTGGCACTAGGATGGCTCTTGA
GCAGAAACGCATGCATACAAATCCTTGCCAGGTGATTGGAAATAACTTGT
TGAATCGTCCTTGCTATTTCTATGGTCACATGTTGTGATCTGAAAGTAAT
GCTAATATGCAGATTCTGGTTGCTACACCGGGAAGGCTTAAGGATCATAT
GGAGAACACGCCAGGATTTGCGACTAGATTGATGGGCGTAAAAATTCTTA
TTCTTGACGAAGCTGACCGCTTGTTAGATATGGGGTTCCGAACTGATATC
GAGAGAATAGTAGCTGCACTACCCAAACAGCGTCAAACACTCTTATTTTC
TGCCACAGTTCCAGATGAGGTACATCCAGTAAACCTGCTCCAGTCATCAT
CAGTTTATTTTGTCCGCATATACTAAATTTGCTCTACTTATTCTAGGTTC
GTCAAGTATGTCATGTTGCCATGAAAAGAGATCTTGAATTTGTCAACACT
GTTCAAGAAGGAAGCGAGGAAACACACTCACAGGTATATTTTAGACCATA
TGTATGTTGATGGCTTCTACTGCTTTTATCCAATGTGATGCTTATAGTTA
CCATATTCAGGTGAAACAAATGCATATAGTTGCACCACTGGACAAACAAT
TCTCTACCCTGTATGGTCTTCTAACGGACCATATTTCTGAAAATGTTGAC
TACAAGGTAATTCCATTTTCGACTTTGCAGTGCCTTCTCTAGTCACTGCT
CTGTATTATACAGATTAATGATAAGACAACGAATGCAGGTGATTGTGTTT
TGTACAACGGCAAAGGTAACTAGTCTTGTTGCTGAACTGTTGTCTGAACT
GAAGTTGAATGTACGTGAGATTCACTCCAGAAAGCCACAAAGTTACAGAA
CCAGGATATCAAAAGAATTTAAGGAATCAAAGGGTATTATTCTTGTTAGC
TCTGATGTATCTGCTAGGGGTGTTGATTATCCCAATGTCACACTAGTTGT
GCAGGTAACCAACCTCTTGCACTGTATTGTCTATTTGCTTAATTTATTTA
TTGTACAGATAAGGATTTTTCTGTTTGCTCTTTATAACCACTCAGAAAGA
TCTTTCCGCATACAACTATAAATACTTAGTCGTAACTTGTAATTAAATAT
GAACATGCTTATCTTTGTGTCCTTACACATCTTCGAGTTATAGATTAGAA
TGAACTGATACCCTATCATGGTCCTTGCAGTTGGGAGTTCCTTCTGACAG
AGAGCAATATATCCACCGTCTTGGTAGAACTGGTCGCAAAGGTAATGAGG
GGAGCGGAGTCTTGCTGTTGGCACCATGGGAAGAATACTTCTTGAGAAGT
ATCAAAGATTTGCCTATTACAGAGGCTACGCCACCATTAATTGATCTGGA
CACTAAGCGAAAGGTACATAAGCTCCTTCAGCAGTGCACATCTTATAGTC
AATGGTCATTTTTTCATTTCTCAATCAATGATAGAAATGACACCTTTGCG
GAAGTGCTATTCAGAAACCAGTTGGTTTTGTTGTTTTCCTGTTTGATTAT
TTCATCTTCTGATGTTTTTGCAAATTTGTGTTTAATTCTTCCTCCACATT
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CACAATATCTTGAAGGAACATAATAGGATGAATCCACCAAATAAGTTCTG
TCAGCGCAACTGTAGATAACAGGTCTCAGGTGACGGATTAGCTTAGAGCT
ATATCATACATGGAGTTCTATACTCCCTCCCACTCAAAATAGACGTCACA
GGTTTTCCAAAATTTGAATGAATCTATATGCTAAATAGTGTCTAGATTCA
TCCAGTTTTTGACAAATCTGCGACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTACA
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATTAATC
TATTTAAAATATTTGATAAGTTGAGACGTGGCATGATACTATGTTTCACA
TTTTCTTATTTTTATAGGTTGAGAAGGCTCTTGCACATGTGGAGGTGAAA
GATAAGGAATCTGCTTATCAGGCATGGCTTGGGTACTATAATTCAAATAA
GCAAATTGGCCGTGATAAGTACCAGCTTGTATCACTGGCCAATGAGTTCA
GCAGAAGTTTGGGGCTCAATAACCCTCCTGCGTTGACTAAGCTTATCCTT
AGAAAGATGGGGCTGAGCAACATTCCAGGCCTACGGTCAAAATAGTTCAG
CAGCGAACAAATGTCGCGTATTCACTTCCGTAGCATCTTCTTGCCGACAT
GCTATATTGGTAAGAATATTCCAAGTCATCTAGCTAGGTAAACAAGATGT
GGATCAAGTTGTCAGGGCATGCACTCATGCTTGTATTAGTAGTACGACAA
GCCTCCACATTAGCAGTTTTCATTCTTCTCCTCTAATGTGGAAACACATC
GTGAGTGCATGTCCCCACTATAATATAACTCTGTTGCATATCGTGGGCAA
TGGTTTGACTACGATAATGCTATAAGCAAGTTTACCAAGCATTTGTGAAA
CAATGTCCGAGTTATTGTCTCTTCACCTGTTCGTGTGGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.