Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018532

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018532
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018532
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCTGATACAAACGCGACGGCCACGCCCGCCCCACCGCAGCCGCTGGCTGC TGCACAAACCAAACCTGAGAGAAAAAAAGCACTCGCGCGATCGGCGGAGG AAATGGACAGCAAATCGCCTTGCTGCTGCTGCCAGTGCTAGTGCCAGCGC GCAACCAACTTGGCCCCCTCCTGAAGACCCCTGTTGGATTTTATGCTCGC TCCTCTCGGTCTCTCTCCCCCCATTTGTTTACTAGCCTCCGCGGCCCGCA CCGAATCTTCCACCGCCCCCCCGCCCACTCAGCCGCTCCCGCCTCTGCCT GCGCGTGCCGTGCCGTGCCGACCGGAGTGCGCAGGCGCCGGCCCTTTTCC CGAGGTGATCGAGGGCGCGTGATCATGGTCATGGCCAGTCCGTGCGCGGT TAATACTTGATGCTGACGGCGTCGATTCGGGAGATGGGCCGGCGCTGGTG GGGCGTCTGCGGCGGTGTCTGCGCCTGCGCCGCCTTGGTCGTCTCCGCCG TCGTCATCCTTCGGGGTGGGGGTATGTGAAATCTCCCGTGTGGCCGTGTG CTGGTTTCCGGGTGTTCGGTTTGCTGGTTTCGCGGTTTCCTGCTGTTGTC CTAGTCAGTATCATGCGTGTCTGTATGCTAGAGTAGCTTTGCTCGTGAGA ATTTTGGTGGGCTCGAGCTGCCAAAACCTGAGCCTCGGCGTTTGTTTGGT ACTACTTGCTCTAGTTTTTTGCAGTGAAAATTTGGTGTGTAGATTCTGCG CGGCAATTCGAGTTACTACCGTTGTCTGATGCTTTGATACTTGGAACTGG ATGGCTAATTAATGGTCTGCCTGGATGATGCATACTCTAGTACTACTAAT AGAGGCAGGGCATTTATTTGCATATAAACCGAGTTTGCTCTGTTCTAAGC TCTAGTCAGTACCTAGATTTTTTTTTTGCGATCATAGTCAGTACCTAGAT TAGTGCTGAGCTTACATATAATGATCATCAACGTGGCTAATTGTTACTTT TAATTAGCACTTTTTTTATATTTTTAGGTGGCATATGCCACGTCATAATC TATCTAAAAATAAATTAAAAGGAGTGCCAAATAAAATACAGTTATTGGTA GATCAAACACTACACGCTGGCCCGGTATCTGGATGTATTATTGACTAAAT AAATAACTCGATCATGCGCGTGGCTAACTATTTAGCTAGTCAGATTTTCT GTTAGCACTTTGTTTTCATTGTTTATCAACTGTTTATATACTATACAGTG GCCAGACCGATTTAGCTGTATTTCCTATTTACTTAATATTGATTTGCTTT GTTTCCAAGATCATCAGCATTCTCATGCCCCTGCCTTTGTGCGTAAAGTT CTTCTGTCATTAACAACTGCCCGTCCACAAAATGACTTGGATAGTATACT TCATCCTTCACAGTTGCAAGCTCCAAGATTCCAAAGCTTAGGTCTGTAAC TAAACACGCCCATGAACCAATGAATTTGGATATATCATCTGTGTATTTCT GGTCTAATTGCAGTTTACCATTTCTTTGCTAGGACTAACTGCAAAATTAT CAGCATCAACTAGCACAGATGTTATTAAACAGCATGATCAACATGCGGCC AGCCCAACAGTCGAACACGAAGGTACTTTTCCTAACTATGATATATTTTA TATAAACCTCAATCCTATATGAAGCAAATATCTTCGTTAACCCTGTCGAT TTTATTTATGGAAATGGTTTACCCTTTAGCTTCCTCAGATGAAGCTGTGC CACCATTTAAACAAACAGTGCTGCCTACAATGGAGCCTAGTCCTCTGCCT GATCATTTTCATCAGCTGCCAAACATAGAATTATCTCCATCTATACAGAG TCGAGGTGAATTGCTCTTCAGCACAATGCTGAACTCTACCTGTAACTATG CAACATCAAAATCTAGTTTGGAATGACGATAACCTTTATTTCTCTATTCA CAGGTCAACATGTCTCTCCTTCGCAAATGGTTTCTCCAGCTACTCAAACT GGCAATCATCATCGTGAAGAGCAAGTGCCTGCAGCTTCACCATTTCTTCC GGTTCAGACACATCCACCTCATCCTGAAATTGCTGTGAACACTCCAGCTG TTGCACCTTCTCTACAACATCCACCCTGGTGTAAGTACTATTTTGATCCG CGCTATGTTCCCAATGTCAAAAAAAAAAAATTAACACTAGGTCAATTATT TGCTTCTGTAATTTCATATAAGGCTTCTGTAATTTCATATAAGTTTGCCT TTGACCAGCATCTCAGCCTCCTCCATCTCCATCTTCCACTGGAAGTCAAT CAACACAGCCAGCTCCTTCACCCCGTATCAATGGCCATTGTAAGATTGTT GGATATGATGTTATGCCATGTTATTATTTTATTAGCTACTGAAATGGATT CATATTTACCTAACTCAGAATCTGTTGCAACCTGTATTTCTCATGGCAGT AGCTCCTTCGTCATTCCAGAACCCTCTAACAGGCCAGGACACACCAAGAG TACCAGTTGCTTCACCTCCACCAGAACTACCAAGCAGAAAAAATCTACCA CCGAAAGGTATAATTTCTCTTGTTATGTAGTCATCGAATTGGTCTATATG TTTCAGTTTTTTCTCACCCAGATTTTGTTGTAATCTTGGGCGTATATAGC AGTTGCACCACCAACGCCCATCGCTCCTGCATCCAGTCGGGATGCCGTAT CAGTTGCTAGACCTACAAATAACCTACCAAGTCCCAGCAGCTCACCACCG AAAGGTTCAATCTCCCTGATCCAGTCCCAAAAAATATACTCCCTCCATCC CAGCAGGGACATTAAAACATGTATCTAGACAAAGTTGAGTCACTTATTTT GGGACGGAGAGAGTATATATAGCATTTCTAAAGGAGCTATTTTATTGGGA ATAGGTACAAGGGAGACTAATCACCATTCTCCTCCTGCCACTCCACCTTC AACGCACCGCGCCATTCAAATTCCCCCGCAACAGAGGCAGCGCCTTCATT CAAGTGGTACTGAACTCAATCATGCCATGATGTAGATTTTGTTCTATTCA TTTATGAAAATGTATGATGTACAGCGTCTTCTGTTTCTCCACCGCCAATC ACTTTTGACATCCACGAGACTAGGTATAGTGCACATGTTGCTGTATCTCC AGAGCAAGCCCCTTGACCCTTCATCCCCTGCACACTATCCACACCTAGGA GGTAGCCTTCTCATTCAGTTGGACCTTAACAAAATTCATTTCTAATTACA ATATAATCAATATTTCTGAGGAGAAGGCGCATGCCACTTGAGTTGCTTCC GATCCATAGCATTTAGTACCTTTAGATTATCAACATAAGAAAAGCGTATA TTCCCTCCGTTCGGGATTAACTGACTCACATTTGTCTAGGTTCGCATGTA TCTAGACGCGTTTTAGTATGTATATACATGAGAATCTACACAAATGTGAG TCAGTTAATTCCAAAGGGATTAGTATATTCCACTCAGTTGAGACTTTTTT CAAAAAGATATACTATAATTTGTTCTAAATTTAATCCAAAAACTGTATGT TCGATGTAGGACCTTCTGTTCCTCCAGTACCGAACTTCACCTGCAGTTTC TGCACCCACCATCACATCTTACCCTTCATTTCCTGCAAATAATCCAGAGA CACAAAGTATGCTTGTTAAGCAGTATTCATACATGAAATACATCTGCTAG GGAGTGGATATCATATATTTGTTCTAACACATTGTGCAGGACCAGTAGCT TCTCCAACAATACATCCTGGCAACCATGGGAACGCCAATGGCGTACCGGT TGCTCCACCTTTGAAAGGAAGGGATCACCATTCCATACCTGTAAATAATA CACATGGCATGATCCATGGAGCTCCAGTTGTGGCACCTTCAAAGGGAAGG CATCACCGGTCCTTGCCTGTAAATGACACATCTGTAAAAGGTTTTCAACC AAACCATATGTACTAAGCTATAACCATCAACCTTTTGCTGATAGTGAAAT GATTCATGAAGTTATATTGCGCAGGACCTGTCGTTTCTCCCCAAAATTCT CCCAGCATTCATAAGAGGGGACATGGCATCCATAGGAGAGGACATGGCAT CCCGACTGCTGCGCCTACAAAGGAACCTTCCAGCCATCTATCACCTGCAG ATCATAAACACCACAAAGGTATCCACAGTTTTTCATAGAAGAAATATAAT CAGAAATAAGTGCATTCATCTCTGTAAGTGATATTTGGTACAGGTTCCTT TCCTGTCATAAGCCCTGCTCCACATAGAACCAATAATGCTTCTGCAACAA GCCATGGCATTGCTCCATCACCTGTAGTCTTGCCCCCATCAAAAGGAAAA GAAGGAATTCCAGCATATGCTCCGCATCACCATCATAAATATCATTCGCC TTCATATTCTCCAGGTTAGTTGTGCTGTTTTTAGGAAGATAAGTGATAAT TAACAACTACTGATGATCTGACGTCCTTGAGAATTTAGACATGCATGACA TTGATAACTACACATACGACTCAGCACTCAGCAGTAGTGCAAGAATTGTC TGCGGTATTGAAAGTTCAATATTTAGTTCACAAATATCGGTTGAGACTCA TCCTGATTCGAACATGCGAAGTTTATCCTTGTTCTAGCATGAGCATTTGA CTGTATGCATATTAGTCATGCAGGTCCCCAATTTCCCATCCTGCATTAAA TTTGTCAAAAAATATCTTCTTTCTCTATTTATGTTGAATCCAATCGGGCC ATAATAAATCTAGATTTACCTGACTGTAATATGAACTAGTCGAATTTCCC ATGCAATTGTGCAGCAATATACTTTAATTTTTTATTTGCTACATGACTAT TTTAGGAACCATGCAGGTGCTCTGTCATTCATATAGCAGGGATAGATTTA CAAGAAACAAAGGCCTGGTTACAATCTATATTTAAAAAAAATTGTATTTG TAATACAACAGCTTCAACACATATCTGATTGATATGTACTGTTACAATCT GGACCCACTTTAACAGACGGTGTAGGTCATCTATTTTTCATCTGATTAAT GCAGTAATTTCTAGAACTTGAAAGTGGATGTGCTATTTTCCGCTTAATGA ATGGTAAAATATATATAATTGAAGTAATTATGTAATATTATATTTTTTAT TCGGTATATTTGTGTCTATGCAGAACCTGCTCTACCGCCTGACAGTCCTG CATATAAAAAGCCCAGGGCTTTGGCACCAGCACCAAGTCGTTCCTTGCCA CCTTCACCTCCAAATTCATGTATGATATGGATACATTCTGTGCCATCTGA ATTTATCAATTCAAACGTTATGTGCATTCAATTTTACCCAGCTGGTAGCT TTTGAGTATGTATCGCTCAGTTGTTTATTCATCCTCTTTTTCTTCTTTTT TAGACTGCACACCGTTATATTGTCAAGACCCTCTGACCAATAGTCCTCCA GGAACATGTCGCTGTGTATTGCCAATAAAAGTTGAGCTTCGTTTAAGTAT ACCACTGTATACGTTCTTTGGATTGGTCGCAGAACTTGCACAAAATATTG CATCTGGAGTGTTTATGAAACAAATTCAAGTTCGTATTATGGGAGCAAAT GCAGCAACTGAAGACCCTGAGAAGACAGCTGTCCTTATTGATCTTGTGCC ACTGGGAGCAAGATTTGACAATACAACAACACTTTCAGTATTTGAAAGGT TTTGGCACAAACAGGTCATCATAAACCCTATGCATTTTGGAAGCTATGAT GTATTATATGTTCTTTACCCAGGTGAGAGTTCATTATAACTCATTTTTGT GTCACTCAACTTACCTGTTTCCTTGTGTTAACATCTTCCGTATCTTGATG ATTTTTTCGATGTCTGATTTGACTGAATCTCCTTGTTCATCATTCATTAG TCAATCTTTTTCTCTCCCATAAATGCTAATGGTACTTTTTTCATCTACTC ATGAAGGTCTTCCTTCATCACCGCCACCAGCTCTCGGAAGTCTGAACAAT GGTCTTAGCAATGCAAATGATCCAAGGTTACGCCCACTTGCTGTTGATGT AGGAAACCACAGAGGAACAAAAAGCAGGGGCATAATTGTGATAATTGCTC TATCAAGTGTCTTCGCGGTTATTTTATGTGCTGGAGCTGCATTGGTGATT TATTTCAAGCTTAGAAACCACAATCTTCTGACCGAAGCTTCACTTATGCC AGCAAAGTCTGCAGGTAGCAACACATTCTTTCTATGGATTATTCCTGTTT TTCATCATTCCATGTGGCACCATCGAAGAAAGTAGAGAAATTAAGCATGT TGAATATCTTTTGCTAAAAATATAAGGCACTCTTTTTTTTCGTAAAACCA TGAACTGCTCCTCCTTCTGAGTTTTGGTAAGGCATGCACATTTTTAGGTC CTCAATTTGACAAACGAATATATTGTGCCAAAAAAAAGTACTATATCATT TAATTCGTATTTGAAAGAAGTTTCTAATGGTATACTTTTTGTGGCGTATA ACTAATATTTCATTGATCAAATTGATGATCTCAAAATACGTGGAGCCTTA TACACCCAGAAGGAGAGAGTACCTGGTAATATGGTGTACTGTACCATTAT ATGTTTAACTTAGCTGCTTAGGGACAACAGGATTGGTTCACCATATTTTC AATGCATGCATTTTAAGCATTTGAAGCCACTATTCATGCATTTGTGTAGA AAGCTAGTCCACTTAAGAAGAATCTTCCGTTTTTACCTTTCAGAAGCTGA GAAGTTCTGTTTCATGTTTCTATCGCTGAAAAAGAGCTTTTTATGAAAGG ACAAGAGTTGTATTTCATGCTTTACTAGTCAAAGCACTCAGAACTTCTTT TGAGCACAGTGGGCTAAAGCTACAAAAAAAACATTAGACACCGATTTGCT TTCTTTCCTGCATTTTTTCATCAATGCTTTGCACTGGAAATGCAGGTCCT GGTTCAGCAGTAGTCGAGAGTAGGTTAGAAAGCAGACCTATTTCGGCATC ACCCTCATTCAGCTCTAGTATAGTGACATATAAAGGATCAGCAAAAATAT TTAGTTTGGTTGAGATGGAAAGAGCTACACAGAGATTTGCTGAGTCCAGG TTAATCGGTGAGGGTGGTTTTGGACGTGTTTATGAAGGTATTCTTGAGGA TGGAGAACGGGTTGCTGTCAAAGTTCTTAAGAGGGATGACCAGCAAGGAA CGCGGGAGTTTTTGGCTGAGGTTGAGATGCTTAGCCGATTGCATCATAGG AACTTGGTCAAGTTAATAGGTATATGTACGGAGGAGCATATGCAATGTTT GGTATACGAGCTTGTTCCGAATGGAAGTCTTGAATTTCACTTGCACGGTA AGACTTTGTTCATTTTGCCACTAGACCTTCAGTTTCAAAGATTTTTTTTA TGAGAATTTCAGTTTACCACTTCATTTAGTCTATTTTTTCTTGTAGTTAG ATGCATCCAATTAGCCAGGCACTTCATTTACAAGAAAAAAAAGTAGTTTC TGTAGTGTTGTACAGCTGTAATAATGAAGCTGCACATATTAATAACACAT GATATTCTAAGACATAAAATAACTTTATTAGGTTCCATTATATTATATCT CTCCAAACCTATCCTTCCAAACTCTTGGTATGTCTCACGGGCTGCGTGGT ATAACTCTGTTGCTCAATTAGAAAACTTAGATACCATGGATCTGCAAACT TCTGAACACAATATATGTTAATGACTCCAAGCAGGATCAGATAAGGACAC TGCTCTGCTTGATTGGGAGGCTAGGCTTAAAATTGCCCTTGGCGCAGCAC GTGGTCTAGCTTATTTGCATGAAGATTCAAGTCCTCGTGTTATACATCGT GACTTCAAGTCAAGTAACATTTTGTTGGAACATGACTTCACCCCCAAGGT TTCAGACTTTGGCCTAGCCAGAATTGCTCTGGGCGAGGGGAACGAGCATA TTTCAACTCGGGTCATGGGAACTTTTGGGTAAGCTGGATGCGAAACTATT ATCCTAACTCTTTCATAGTTGATTAAATATCCTCGGCATATTCTAAACTC CTGACGGTTTATTTTTTAGGTATCTTGCTCCTGAGTATGCAATGACCGGG CATCTTCTAGTAAAGAGCGACGTCTACAGCTACGGCGTTGTCCTTCTCGA GCTTCTTACCGGCAGGAAACCTGTAGACATGTCGAGGCCTCCAGGGCAAG AAAACTTGGTCGCGTGGGCTTGTCCGTTTCTGACAAACAGGGATGGTTTG GAAACACTCATTGATGTTTCCCTGGGAAGTGGCATCCCACTTGACAGCAT TGCAAAGGTAGCAGCAATCGCTTCGATGTGTGTTCAGCCTGAGGTGGATC AGCGCCCATTCATGGGAGAGGTCGTTCAGGCCTTAAAGTTGGTGTGCAAC GAAGGCAGCGAGTTCAACGAGTCGAGAAGTTTTAGCCGAGATATGCATAT CCAAGATGCTGAGATCATGAGCAGAGCAAGCCTGGATATGGATGCAGGCC CGGTGCTATCTGCCGAGCAGTTCGCTGCGTCAGCGCGATATGACACGCTG GACGCCTCTGGTTCTTTTCGACGGTATTCGAGTTCAGGTCCTCTGAAGGT GGGTAAAGGTGAACGAAGTAGGGAGAGAGGCTTATCAACAGGTAGCTCGA GTGAACATTGTGGTGTACAACGATTTAGGATAGATTCGGAGTAGTCAACA ATGCAGGCTCCTTTTGATGACCTGGGAACTGAAGAAACACACATGGCTTA TTTTGTGCAAGCCAGACTTGATGTCTATTGCAAATGTATCTCGGAAATGG AGAACGATGTCGAAAACGGTTTACAGATGAGTGCCCGGTGCCATGGTTAG ATGAGGAGTGATCCGGTGGCACGGTGGTGGCAATGGCGCTCGGCCTGACA TACTCCCTCCAGAGGAGTACGCAGTAACTATGCGGCCTTCTAGTCCTTTT TGCTGACTAACTGCATCCGGCGCGAGCTGAACATCAGAACAAGAGAACTT CGTTTGCCTATGTGTACAGTGCAGAGATGTGTAATAGGCTACTAGCCGGT TCTTCGACTGCAAGTCCTTGTGCGGGTTAGAGAAAATGTAGAGGGAGTGG ATTTTGTGCTTGAGCTCAGTAAGTCCTTTCCTATTGTTTTGGGGCAAAAG AGAGAGAGAAAAAAGAGGCAGTGATATTTATTTGGAAGCTCCGATGCAAT ATTCCACCTTATATAGTTTAACCACATATTGTGGCGTTTGCTTGTGATAT AGTCATATCATATTGAGGCTAAATGACATTACCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.