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GrainGenes Sequence Report: AA038179

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Sequence
AA038179
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038179
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGACTAAGGTGATCATCATTTCAGTATTCTTGCAGGGTAGCATTATTTC
CATTTAGCCCTAGAAAAAGTAATTGGCACATTGTCAATAACTGCAGCTTG
TTGGGAATATGCCATAGAGGCAATCATGTATGACGATGTTTCCCATAGTA
TTTATAAATATATTAAGTTGTCTTTGTGTAAACATCTTATGTGTATCATT
GAATATGTGATTCAGTTGTGGAACTATGCATTAATGTTGTTTGTACTAAA
TATCCTTGGTCATCGAGGTTGTGCTAGACACACAACTTAGACCAATATAA
AAGTCGGCTGATGAGTCGGTTCCACTTGTCATGGGCATGGAGATGCTATT
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ATTGAGGTACAACGAACAAGTTGTTATTTGTATATCTCAATCAATGTAAT
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GACTGATCGATTGATAGTCAGACTCCAATTGTGTCCAAGTAGCCATGAGC
ATGCGGGGTCACACACTTAAGAGCGGGAGAAAGTTCGGATTGGACCCGAA
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CCAGGAGAGTTGATCGGTTAGGTCATTCCATGTGTTGGAAACCCTAGCTC
CACAGAAGTCTAGCCATCATATCGAACCTAGCAGGTCACCGCAAGTGCTT
CCACTTGTACGTGTGGATACCATTAGAGGTGTTGTACGATCAGCACCAGG
ACGATCGTGATCGGATGGGATCTTGAGGACTGCACTGCATCAACTGGCGC
GCTTCATCAGTAATCCGCAACCGCGCGTCTAGTGGTAAACCTCGTGGCCT
TCTACCTCAGTTAGATCTTGGGATCACCGTGTTAGAGGAAAAAGTTTTGT
TTTATCTCTACGTGGCCCAACAGTGGTATCAGAGCGATAGCTTCTGGTTT
TAGGCTCGAGACCGCGCATATGTGATATGTGGTTGGTTGTAGATTGGATC
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TCATACTGCTGAGGTTGTGGAACGACATACCCCTACCGGTCGGTTTCCGC
CATCGGGGTAGACTGTAATACGTAAATCTAGAAGCGGTGATCAAAGATCA
AAGAGTTTGATCGAATTGGAACAATGGTCACAATCCATGTCCAGATCATA
GATGAGATCTATATTTTCGGAAAAATCATCGGGCGCTTCCCGCACCGTTG
TCGCTGCGAGTTTCACAACACCGTTAGATATCGTATCTATGCATAAATTG
TTTTAAAGGAAGTTGTAAATGGTATGGTTCATGTGCATGTGATGTATGTG
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GTAATTTACTTTACTAAGCTAGTATAGCAATTTGGAGAACCCGAATGGCA
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GACGGGTCTATCACAACGGTCGTGGGACTCGGGAAAAGGTCCGACGGGAG
TCGAGGCATGTGATGCCACCTGACCAACAGGAGTCGTATGATGATTGACA
AGGAGTTGTCTACCTAGATCACTTGGCGGGTAGCGGTGATTCTAAAGCTC
ACTACCCGACTTGTTTATCTAGGATCCTGAATCACTAAGTAACCATTAGA
GGGGTGTTGGTTCTAGTGAGAGCATAAAATATTAAAGTGTTTAATATGCT
TGCTCTTTTATGAATACATGTCTTTAGTGTTTTGCATATTTTCTGTTGTA
GATCTTGGAACCAAGTAACAGTCACTCCCAGATATTCGTTTTTTCTTTGA
GAATCATTCTGGAGAAACATAAACTGAACGACACTAATTTTACCAACTGG
TATCGAAATCTGAGAATTGTTCTCAAACAAGAAAAGGACCATGTCCTAGA
CACCCCACTTCCAGATGAGCCGAATGAGAATACGATTGTCGCTGCCACCA
ATGCCTACCGTTGGGCTAAGGATGAGTCCACGGATATTAGTTGTCTTATG
CTTGCTCACATGGAACCGGACTTGCAAAAGTAGTTCGAAAATGTTGAGGC
CTACGATATGATCGAAAGCCTCAAAAGTATGTTCCAGGCTCATGCCAAGA
CTGATAGGTATCAAGTCTCTCAGGCTTTGCTGTGTTACAAGCTTAAGGAT
GGTGATCCACTGAGTCCGCATGTGATCAAAATGGTTGGTTACATGCAGTC
TCTAGAGAGGCTTGGCTACCCCATTAGCGAAGAGTTCACTACGGATATAA
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ATGCATGGTATGGATAAGAATCTCACTGAATTGCATGGGATGCTCAAGCA
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GCCATCTCCTTAAGCCGGATCCACTTTCTTCTACTGCAAGGCGGATGGAC
ATTGGAAGAGGAACTGCAGCAAGTATTTGGCCGACAAGGCCAAGAGTGGA
GGTATGACTTCCGACTCGGGTACACTTGCTTTCAATGTTATAGACATTTA
TCTTGCCGATGCACCTAATAGTTCTTGGGTATATGATACCGGATCAGTTA
TTCACATATGCAACTCGTTGCGGGGACTGGTAAGAACTAGGAGCATAGCA
AGAGGCAAGGTTGATATTCGAGTCGGCAACAAAGCAAGAGTCGCTGCATT
GGAAGTCGTCACGATGCAACTTCATTTACCTTCCAGATTCATTATGGAAC
TGAATAATTGTTATTATGTTCCACTGCTCAGTCGAAACATTATTTCTGCT
TCATGTTTGATGAGGCAAGGCTATGAGTCGAATATCAAGAATAATGGTTG
TTCTTTATATCTGAATGATATGTTTTACGGCTTTGCACCCGTCCAGGATG
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GCTTGTTCATATAAGTTGGAAACGCATGAAGAAGCTCCATGATGATGGAC
TCCTAACTTCGCTCGACTTGGAGTCGTTCGAGACATGCGAATCTTTCCTA
CTCGGCAAAATGACCAAGACACCTTTTGCAAAGAGTTGTGAAAGGGTGTC
CGACTTGTTGGGACTAGTACATAGTGATGTATGTGGACCAATGAGCACGA
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CGGTATGGATATATCTACTTGATGAAACATAAGTCGGAAGCCTTTGAAAA
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AGTTTCTTCGGTCGGACCGAGGAGGCGAGTACATGAGCCATGAGTTTGAT
GACCATATGAAAAGTTGTGGAATAGTTCCTCAACTTACTTCGTCGGGAAT
GACGCAGAGGAACGGTGTGTCGGAAAGGCGGAATCAGACCTTGTTGAACA
TGGTGCGATCAATGATGAGTCGGACAGATCTGCCTTTATCATTTTGGGGT
TATTGTCTAGAAACAGTGGCGTTCACACTAAACAAAGTACCATAAAAATC
GGTAGAGAAGACAACGCATGAGATGTGGACAGGCAAAAGTCCAAGTTTAT
CTTGTCTTAAGATTTGGGGTTGTGAAGCATTTGTCAAGCTACTTCATTCG
GACAAGCTTACGGCCAACTCGGATAAGTGTATTTTTGTGGGGTATCCAAG
GGAAACTTTGAGATACTACTTCTACAACCGAGAAGAGGGAAAAGTGTTTG
TCGCTCGGAACGGTGTCTTCCTAGAGAAAGAGCTTCTCAGTCGGGGAGTC
AGTGGGAGCACGGTATAGCTCGAAGAAATTCGAGAGGAACCGGCTAGTAG
CGAGTCAGCAAGAACCTTGGAGGTTGATCCGGTCGTGGTAGCTGAGCCGG
AAGCAGCACCTGTACTACAAAGATCGGCAAGTTTACGAAGTGTTTGTAAT
GTGTTACTGTTAGATAGTGATAAGCCGACAACTTATTCGGAAGAGATTGT
GGGATCTGATTCCGAGTCATGGCTTGGAGCCATGAGATCCGAGTTAAAGT
CCATGGATGAAAATCAAGTTTGGAACTTGGTTGATCTGCCAGATGGTGCA
AGACCCGTCGAGTGAAAATGTGTCTTTAAAAAGATAACTGATATGGATGG
AAATGTTTCTGTCTATAAATCACGTATTGTCGCGAAGGGGTTCCGACAAG
TTCAAGGAGTTGATTACGACTAGACCTTCTCGCCCATAGAGATGCTTAAA
TCAGTTCGGATCAAGTTAGCTATAGCAGCCTATTTTGACTATGAGATATG
GCAGATGAATGTCAAAACGGATTTCCTTAACAGAAATTTAACCAAGGACG
TGTATATGATACAGCCCGAGGGTTTTGTCGATCCGGATAATGCTAACAAA
GTGTTCAAACTTCAGAAATCCATATATGGGTTGAAGCAAGCATCTCGGAG
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GTGATCATGATTCTTGTTTATACAAGAAGTTTAGTGGGAGCAAAGTAAAC
TTTCTAATCTTATATGTGGATGACATATTATTGATTGGAAATGATGTCCA
GATGTTGCAAGAAACCAAGGAATCATTGGAAAGGAGTTTCTTAATGAAAG
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GAAGAAGTTCAACATGAAATTTTCTAAGAAGGGGTTCTTACCGATGTCCC
ATGGTGTAAAACTTAGCAAGACTCAGTGTCCTTCGACAACTGATGAGCGA
AGTTGGATGAGTGCGATTTCATATGCTTTTGCAGTCGGATCCATCATGTA
TGCTATTATTTGTACTAGGCCGGATGTTTCCTAAGATCTAAGTGTTGTGA
GCAGGTACCAGGCTGATCCTGGACAAAAACCACTAGAAAACGGCTAAAAA
TATCCTAAAGTACTTGAGAAGGACTAAGGATATGTTTTTGGTTTATGGTG
GTGAAGATGAACTTAGTGTAAAGGGTTACACAGATGCGATTTATCTTACC
GACTGATGATTCTCGTTCGCAATCCCGGTATGTGTTTGTAATAAACGGAG
GGGCTGTGAGATGGAAGAGTTCCAAGCAAGAGACTGTGTTTGCATCTACA
ACAGAGCCTAAGTATATTGCTGCCTCGGAGTCAGCAAAGGAAGCTGTTTG
GATGAGGAATTTCCTCATGGATCTTGGTGTTGTTTAGGGCTCGTCCAATC
CGTTAGACGTGTATTGTGACAATAATGGTGCTATTGCACAAGCCAATGAA
CCTATACAACACCAGAAGAACAAGCACATACTCATGAGGTACCACCTGAT
TCGCCAGTTCGTGGATCAGGGTGATATCAACTTATGCAAGGTACACACGA
ATGCAAATATTGCGGATCCGTTGACAAAGCCATTACCACATCCAAAGCAT
GAGGCGCACCTGAGAGCTATGGAATTAGATGCCTAGACATGTGATGTCGG
AACATTGACTCTAGTGCAAGGGGGAGACTGTTGGGAATATTCCCTAGAGG
CAATCATGTATGATGATGTTTCCCATAGTATTCATAAAGATATTAAGTTG
TCCTTGTGTAAACATCTGATGTGTATCATTGAATATGTGATTCAGTTGTG
GAACTATGTATTCATGTTGTTTGTACTAAATATCCTTGGTCATCAAGGTT
GTGCTGGACACACAACTTAGACCAATGTGAAAGTCGGCTGATGACTCGGT
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TAAAGAGTTTAGCGAGTTGGATTGACCCATATTGAGGTACAACGAACAAG
TTGTTATTTGTATATCCCGAGTTGAGGATCACCGACTTAGGTTCTGTCAA
ATGCTGATCCATAACTAGGCAGTTATAAAGGTAGAATTCGGGTCGACTGA
GAATCAAGCTGCGTGATGTGAATAACCAAGATGGGATTTTTCCCCTCCAC
TTGGAGAGATATTATCTGGGCCCATGGCCATTCACGACTTGGTTAAGTGT
TAACCGAGGCGATCGACTAAGAGTTAGTCGGATGAATCACTTATCTCGGA
TCGAGAAGAGAGTTGGACCATTTAAGGGATGACAGTTATTCGCCTATAGT
CTGACAAGGTATATCGTGAGGCAAAAGGGACTCGGACGCAAGTCGCATTG
GAAAGGCAAGTTGTCATGACTCTTTGGTACTTGGGAGTCGGCACGTTCTG
CTAGGAGCCGCTACCAACTGATCGATTGAGAGTCGGACTCCAATTGTGTC
CAAGTAGCCATGAGCCTGCGGGGTCACACACTTAAGTGCGGGAGCAAGTT
CGGATTAGATCCGAGCCGAAAATCTGGTTGGGTTGGATCCGAGCCAGATT
TGGACTGAGTCAGTGATTCAGACTCACGATGACTAATATTATATGGGCTT
TAGTGAATGGGCCACGAGTGAGTGGATCCCATGTTCACTACCTATATATA
GTGGGGTGCAGAAACCCAGGAGAGTTGATCGGTTAGGTCATTCTATGCGT
TGAAAACCCTAGCTCCACAACAGTCCAGCCGTCGTATTGAACCTAGCAGT
TTGCCGCCGGTGCTTCCCCTTGTACGTGTGGATACCAGCAGAGGTGATGT
ACGATAAGCACCAGGACGATCATGATCGGATCGGATCTTGAGGACTGCAC
TGCATCAACTGGCGCGCTTCATCAGTAATCCGCAACCACGCGTCTAGTGG
TAAACCTCGTGGCCTTCTATCTCAGCTAGATCTTGGGATCACCGCGTTAG
AGGAAAAGGTTTTTTATCTCTACGTGGTCCAACACAGCTAATATTTACTT
TTTAGTTAAATGCTAGATGTCAGATCCATTGACATCCCTGATGCATGTTG
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CGTGAGGATCTAGTTGCTAGATATTACACTCCATACTCGTCTCCAGCATA
TTTTGATCGGCACTCTGATGTTGAATACTATAGCAGTGAACGGGAAATGA
TGGACGGTTCTTCTGAGCTGAGTGATCTACACAGCCAGATCAACAAATCT
AGGGAGAGGTGGATTATCTCATGATTTACAATACTTGTTTCAACAACAAG
AAAGGGGTGCATTTCTTCACAGAATCTGAAGACATGTTCTTGGATAAGCT
AGAAAGCCAATTAGAAGATGATAAACCAGAGGGAAGTGCAAGCAAACAGC
CTAAAGTAAGCTCAGAGATAGCTACGGAGGGTGTTCATCCTGTGCTGAAA
TCTGAAATCGAGGAATTAGAGGACATATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.