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GrainGenes Sequence Report: AA046458

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Sequence
AA046458
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046458
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCATGAACATCACCCGTGGCTGAGTACTCGGGCCCACCTCCTTCCCCTC
GTGCACCCCTGGAATCCCAGAATCACAGCCCACCTCGCACGGTTAAAATC
AAATCAAATCCTCCACTACTTCAACATCTCTCTCCTCCCCGAGTCCTCCT
CTCCTCTCTCCCCCCTTCGATTCGCCTCGTCTCCTTCCCTGTCTCCCAAT
CCTGCGCCAAAACCCTAACCCTAGCTGGTCATGGCGACGCAGCCGCCTTC
CTCGGCTGCGGCCGCAGACCTCTACGAAACGGCCTCACAGCCGGACCCCT
CCGCCTCCGCCGCCGCGGACGCATACACCTTCCTGGAGTTCAACACGCAG
GGCGACGACTTCGAGTACCCAGACTTCCCGGAGCTCTCCCAGCCCGCCCG
ATCCGCGCCGCCGCCTCCGGCCCCCGTCACTTCCTCACCATCCTCGTCCT
GGCCGGCTCCGCCCCCGCCGCCCGACGCCTCACCGGACCCCGATCTCGCG
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GTCGGCGTCGAAGGCACGGGCTTCAGCGGCGGTAGCGGACGGGCTCGCCA
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GACGGGTACGACTATGGCAAGGGCGACTTCGTGGAGCACGCCTGCCGGTA
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TTGATGCAGTGTGGACTTGTCAAAATTCTCATATATAATTTTTCTAAAGT
CAAGTTACTTCTCCCTCCCTTTAGTGTACACTAACCCAGCTTGAAACTTA
ACAGTATTTGTAGTTATATTTTTGGTAATGTTTGTCATGAGGTCGGCAAA
ATGGTGGACGTGCTTTATAGGGTCCACTCTTGTTTCTTTTGGTGTTACTT
CTGTATTTTTAGATTACAGGAATAGGAAATCACATTTCTTTCTCCAATCT
TGCAAGCACAGTTAATTTTGGCAGTGGTTCACAGTATCCATAGATCATAG
TGTACAATTTTCTATGAAATATATTCACTTTGTATGCAATATCATCACAG
ATTGCCTATGATTTAGAAAAATGGTTTAACATTTTTAGTGATATATTTTG
TATCCAAACATTGTGTCATAACCTGCATATTGTCTGATTATGAACTTATG
TCACAACACCTGTCAGTTAGTGTGAAGTTGAAATGACAGTAAATTTTATG
TTCTTCCTGTACATCTAGCTATTGTTTATTATGACCCCTGTGGAGATACC
TTTTCGTCTGTATAGAGTGCACATGATTCTGTACGAAGCATATTTGATGC
ATTTCTGTTATTTGCATTACACCTTTCTCCTGTCATATATGTGGATGATG
ATTATGATAAGTAAGCTCTAATTCGGTTATGTGTGTTCTGGAAAGAATTG
CTTGTTTGTGTTTATGAAATAGCTACACTAATCATAACAATTAACCTTTG
TTTTATCCACCAATAAGCATTTGAGGGTAAGCAACATTTGTCAGTCATAA
GCGTTCCACAAGAACATGCATGCTTCCACCTACTTATACTAAGTGTTATG
GATTTTGGCTATCTTAATACAATTATAACTTGTACCTAAATGTGTATATT
TTTTTTTCACAGGTTAGAGCAAAACATAAGGAAGTTTGCCTTCACAAGGA
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ATGTATTCCTTCTTGGTTTTATCTCAGCAAAGGCAGAGAATGTTGTTGTT
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CTGGGATCTCAGTCAGTGGTGTCCTCTTATTGACGACAGGTGTTTCTTGT
CATGGCTTGTCAAGGTAAGATTTTTTCTCCTTTTTATTTTGTTTGGTGGT
GTGTGTGTCTGTACATGCTTGCCGGTCACCTTTCCTTCTTTTCCTAATAA
TAACTGGGACAATTTTACTTCCTTCCAGGTTCCTTCAGAACAGGAACAGC
TGAGAGCCCGTCAAATTAGTGCCCAGCAAATTAACAAAGTGGAAGAACTC
TGGAAAACAAATCCTGATGCTTCTCTTGAAGATCTTGAAAAACCTGGTGT
AGACGATGAACCCCAGCCAGTGGTTTTGAAGTATGAAGATGCTTACCAGG
TTCTGAAATTGTCCACAGGCATTTGTTCCTTGAGTTTACTTCAGCTATGT
CGTATCTTATCTTAGTGTGTCAGTAATTACATTAAATCTTCTTGTGTACA
CTAGCACTGTAACTAAAATGCCTTTATTGTTTCTGCCAGTATCAAAATGT
TTTTGCTCCGCTAATAAAGCTTGAGGCTGACTATGACAAGGTACTGCATT
TCACAAATATTTTCTGTATGTGCTTGTATTTCTTTAGCAGGACCTGTGCC
ACACACACAAAGAGAACGGATTTATTTCGTTTCATTTCCTCTTGTTTTAC
TGTAGATGATGAAAGAGTCACAGAGCAAGGACAGTCTAACTGTGCGTTGG
GATGTCGGATTAAACAAGAAGCGTGTTGCCTATTTTGTCTTTCCAAAGGT
TTGATCGAGAAAGGAAATGCATATGATTGTGAATACAGAGCCTCCTTGAT
TGTTAGATTTTTTAGTTTTCTAATTTCCATGACTGTTTTTTACTGCACTT
GTTACCAAACAACACCAACTAATCTTGGGGTATCAATTTTAAATAATAGG
AAGATAATGAATTGAGACTTGTCCCTGGAGATGAGCTGCGTCTGAGATAT
TCTGGTGGTACTTCACACCCTGCATGGCAATCTGTGGGGCATGTGGTATG
TCTACTATAAACATGATGATTGGTATCTATACCCTAACCTTGGTAGGGTT
GTTTCTATGCTGGCACCCATGCTTAGTATTTTCCCCACAGATTAAACTCA
CCGCACAAGAGGAGGTAGCTCTTGAGCTTCGTGCTAGTCAGGTATAGTCT
GTTCACTATTGTTCTTTTAAATACACTCAATTTTGTGTAGTTTCCACCTT
AGGCCTTTCTGGATTGCAGGGTGTACCTGTTGAATTGAACCATGGATTCA
GTGTGGATTTTGTTTGGAAGAGTACTAGCTTTGATAGGATGCAAGGGGCA
ATGAAGACTTTTGCTGTAGATGAGACAAGTGTCAGTGGGTAAGTTACTAA
GTTCTATGATTACTAATGTATTTTTTGTTTTGTGGGCATCGATACATGCT
TATTTTGTGTCTGTCTGTGAGTTTGAGTTGAAGGGAAATCAATATGAAAT
CCAACAAGTAATTCAGTTACCCTTGAAGTTATTTCAAAAGTTGTTAGAAA
GTTGCAATTAATGCAAAAGTAGGTAATGAGAAATCATAGTCATATTTTGA
ATCCTCTAAGGCTCCAAGCTACCTTGAAATAAGACTGACTACACATTTAT
CCTCGCTTAACCAGCATTGTGAAGACAAGGAGGTGTTTAATTGTGCTTCC
ATTGGTTGTTCTCTTTAAGTAAAACTTATTGCTCACCTTAGTTGGATATG
GTGTTGAAAGCAGGGAATAGTTTTTAGGATGTTTTCATTTGTAAGTTTGT
ATTTGGATTCTTGGTTAATTTGCAGTATATGTCAGTCGTACGACTATAAT
CTTCAGCAAATTCTTAACTTCTTTTACATTCCTTCTACACAGATACATAT
ACCATCACCTTTTGGGGCATGAAGTTGAGCATCAGATAATACGCAATACA
CTACCGAAACGCTTTGGTGCACCCGGACTTCCAGAACTAAATGCTTCCCA
GGTACTCTGCTGTTTGGCGTGTTTAATTTGATATAGAGTTCTTATTAGTT
GAGTATAATATGTGACCTCTGTCATGCTACTTCTAACTAGTGCTTCTTAT
AGCAACATGCCTTCATGGCTTAGATTGGTAAACTTCTCTCCTTGTTGTAG
GACGTTTCATGGGGTTCTTATGGACTAGATCTGTTCCAAAATAGATGATG
TCCTAGGAACTTGGAAGCATGCAGTAGAACTTTTCTATCTTTGACCACTA
TAAAAATATAGCTTTATTGATTAAGTGTACTGATTTTTCATGAAGAAGTG
GTTCACAATAATATTTTATAATATTTATTCTCGGAGGCCATGCAAAATGT
AAATATCATATAGTTTGGATTGGAGGGAGTAATTATGTAATTTGAACTTG
GGGTGGAGGCACACAGCTGTTGCAATACTATAGCTTTATTGAAGTTAAAA
TACTTTGAACAAACATATGTTTTGTTGTTGATCTGATGCTCTCTTTTGGG
ACTGTGCCATGCGTATTCAGGTATTGGCAGTTAAAAGTGTTCTCCAGAAG
CCCGTTAGTTTGATTCAAGGTCCACCTGGCACTGGGAAAACTGTTACATC
AGCTGCAATTGTGTACCACATGGCAAAACAAGGTCAAGGACAGGTAAAAG
AAGACATGGTGTACATTTGATGTGCTGGTATGGCTTGGAAGTATTATTTG
ATCCCCCATATCTGTTTCGAAATCTTAGGTCCTTGTATGTGCACCAAGTA
ATGTTGCTGTTGATCAGTTGGCAGAGAAGATAAGCTCGACAGGTCTCAAG
GTGAATGATGCATTTTACTGTTTAAGCTGATTATATGTTGTTTAAGTTGA
TTATACTGTTTAAGGTGAATGTGGCATGGTGTACATTTGATTATATGTTG
TATCAAGAGACTGAGTATGACGTCTACAGAGCACTGCAACTATTATACTG
TTTAGTTAGCTCTCATAGGCTTCACCTGAGTGCAGTAATAATTGAAAAGG
GCATATCAACAGTTGGATAGAGTACACATTACACAAGTGCTCTCATAATG
TGTATTAGACTACACAATGCAATTGATGATGCATTAGTTGATTTTTTTTC
AATGAGTAACTGTGGTTGAATACTCAACTCCAGGTTGTTAGGCTCTGTGC
GAAATCTAGAGAAGCGGTTTCATCACCTGTTGAGCATCTGACACTTCATT
ATCAGGTCCACTCTTGATTCTTATCTAGTTCTTGCATCCAAATTAACCTT
TTTTTGGATGTTAACCTTGTGCTTTTGCAATGCAATTATATAGGTTCGGC
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GATGAGCAAGGTGTTTTTATCCGCTCTCAACAAGCATGATCCATGATTTA
ATATTTTCCACAAAGAGACTTGATATGTCTGCAATTTGTTAACTGAGAGC
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GTACAAGGCACTAAAACGAGCCACTGAAAGAGAGATATTACAAAGTGCTG
ATGTGATTTGCTGCACTTGTGTTGGTGCTGGAGACCCTCGTTTGTCAAAC
TTCCGTTTTCGCCAAGTACTAATTTATCTACTTCTTGCACTCTTTAGGCC
AGTGCTTGTATTTATTCTGTATTATATCCTGAAGCGGTTTAAATGGTCAT
TGGCAGGTTCTTATTGATGAGTCTACACAGGCAACAGAGCCCGAATGTCT
TATTCCGCTGGTTCTTGGTGTCAAGCAGGTAAAAACATAATTAACGAGTT
CATTTAGGTTAACTTGATTATCTTTATTCATACCCTTTTTATCCATTTAG
GTTGTTCTTGTTGGAGATCATTGCCAATTGGGTCCAGTCATCATGTGCAA
AAAGGCAGCACGGGCAGGATTAGCACAATCTCTCTTCGAGCGTCTTGTTA
TCCTTGGAGTCAAGCCATTCAGGCTACAGGTACTGGTTGCTTTTTTTCTT
GTCTTAGTAGTATTATCATGTTGTTACTATTTTAGTATTTTTCTTTGTCT
TAGTATTATTATCATGTTAGTACTACACTTTCTGTGCCTTGTCATTGTCC
TGCATTGATTGTCAAAGCTGTATATGCTTTGTGATCAATATTGCTGTAAC
AATGTTGTTATTCTTCTCAAAGTATGCTCTTTTGTAAGGATATACATTTA
CTCTTGTAGCTTGTATATCCTACTACCTCCGTTCAACAATATAAGACTTT
TTAGCAAACTAAAACAGCTTGCTAAAAAGGCTTATATTGTGGAACAGAGG
GAGTACATATTATCTTATGTGCAGCAATTTATTATGTATAGCACATCCAT
TTAAGGCTCCTATTTATGTTGTACATTACATTATTTTAATAAAATATTTA
TGTTGTTTGATGCAGAAGAAAATGGCATTTACTTTTTGTGAAAGAACCTC
CATATAACATATTACTTCATGTACTCTTATTTGCTTGAAGTGTATATAAT
TTCCTCCCGCTCCTGTTATTTTGGATATATTGAATTTGGTGTAAATAAGT
TTCATGAGGAACGTAGAAGTTTGTGCCTGATTTGCTGCAGAATGAGTTGT
CAAATCCACCAAGTTATATCTGAGTTTTAAATCATGATATTGTGATGATT
AATTGTTAACATTCTTTGGTAAGATTTTTTGTAGTTAGTGGAAGAATACA
TCCCCCAGCATCTACATCCTTGGTTGCACACAACCAACCAATCATTACAA
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TTGATCATCCTGATTTACAGGTCCAATATAGAATGCACCCTTGTCTTTCA
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TGTAAATGAAAGACAAACATCTGGAATTGATTTTCCTTGGCCTGTCCCAA
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TGGTTTTCTATAGATGGGAGTAGAAGAGATAAGTGCTAGTGGGACATCTT
ACCTAAATAGAACTGAAGCTGCAAATGTAGAGAAAATTGTAACTACATTC
TTAAGAAGCGGTGTTGTGCCAAGCCAGGTGTGTACTGAGTAAATATGACT
ACTTGTCATCTAATTGTTTTTGCACTAGCCCCTTCTTTGAGAAGACATGA
TAAATTCTTTTGGAACTGGATGTGTACCCCTGGATCTTCTAATGTGCAGA
TTGGAGTTATCACACCTTATGAAGGGCAAAGGGCGTATATTGTAAATTAT
ATGTCAAGGAACGGCTCTCTCCGCCAACAGCTTTATAAGGAAATTGAGGT
TAACCATAAAACATGTAACTATACTGTTTGGCCCTCATGATGGAAGTTTT
TTGCTATATTATCTGTATTTGTTTCAGGTGGCAAGTGTCGACTCCTTTCA
GGGAAGAGAGAAAGATTACATTATTCTGTCTTGTGTTAGAAGCAACGAAC
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CTATTGTGTGACATGTTGATAATTATAAGTAAAGCATATTATCATATATA
TGTGCCATTCAATCTTGAGTTCGTCATTATAAAATATTTTTGTGTATGGC
GATATCAGATGCTTTTTAATGCTGAGTTGTTTAGTTGTCTGGTTGTATCA
ATTTGTAATGGCATTTGCTTTCTATGTAGAGAAGTATATATATTGGAACT
TGGAGAAGTTGACACTCAATGCTGTAAAGGAACTGCTAGTATATTGTTCC
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GATGAGCAACTGTTGTACACCGGTTTGTTTAACTGAAGATACATACTGTG
GTTTTACGCCATTTCAGGGTATTGGGTTTCTCAATGATCCACGCAGGTTA
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TAAAGTTCTAAGCAAGCAGCCTCTTTGGAATAGCTTGTTGACCCATTACA
AGGTATGCCTTTCCCTCAATACATATCTCTGTGAATCTGAAAGTTCTAAG
CAAGCAACCCTCATATTTCGTGATCAAACTTTGACCATCAGTTTGACCTG
TAATACATGGGTTATGTGTCATACAAAACTGTTGGAAAGTGTTTGTGAAT
ATGAATTCAGTGATGTAACTTTTGTGGCACACAACCCATGTTTTATTGGT
CAATTTAATGGTCAAAGTCAAACCTCAAATAAATTGGCCCCATGTAAATA
GAAAAGGAAGGAGCATATACCATTATAAGTTTATAACATCTGTGTTTTTA
GGAGCACGAATGCTTGGTAGAAGGACCTTTGAACAACTTGAAGCAGAGTA
TGGTGCAGTTTCAAAAACCCAAAAAGGTGAACGCATTGCCTCTTGAAGAT
AACTATTGGAAAACATTCCGTCTTCTTTTCCTTTAATTTGTTTGTCAATT
TTATTTTTGTGGGTAGATCTACAATGATAGAAGACTGTTCCTGGGTGGTG
GTCAAGGTGTGATGCACGGATCTACCTTTGGCACAGTAGGCTCAGTAGAT
AAGAGAAGTGGTAGGGGAAAAGGTTGGTACAGTTATATTTTTTCTTATTA
TTAACAATGGCTCTATATTATCTCTTTTCTTCTTAACACACTCTTCCTTG
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CCGGGGATCCCTGCATGGAGCCATTGGAGCTGTTCCAGCGGTGCCTCAAC
CTGGTAACAGAAACTTTGGGGCTCCTCGTGCAAATACTGGTGGCCCTATT
GGTGGGCACCTTGCTCCTCATCAACAGAACTCGCAAGCTATGGGAAGTGT
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TGTCTCCACTGTACTATTCCATGAAGTAACAGTAGATCAATATTAACATT
TTGCCTTCCCAAAATAGATGCCTGTTCAAGGTCTCAGTCAAACATTCCGT
GATGGATTTACCGTTGGTGGGATGTCTCAGGTATAGGCAATTAAAGCCGC
ATCATTACTACTACCTCCATCCCAAAATAAGTGACTTGCATTTGTCTAGA
TTTGCATGTATCTAGACCTGTTTTAGTATATAGATACATGCGAATTTAGA
TAAACTGAAGTCACTTATTTCAGGACGGAGGGAGTATTTTACTGCTCACC
CCTTTGACTGAATATAATTTCTTGGTCACTAGGACTTCTTTGGAGATGAT
TTTAAGAGTCAAGGATCTCACGTGGCATACAACATTGCAGATTTTTCTAC
TCAGGTTTGTTTCCCATCTGTCTAAGAATGTTCTTTACTGTTTTTCGGAT
TGACAGATGGTTCTGTAATTTGTATAAACCGATGCATCGTAATGCAGAAA
TTTAAGCTCACTATTATTCTGGAAGTGGCTTCTGAAAAGAATGTAACTGT
CATTGCAGGCTTCTCAAGGAGGCTATGGTGTTGAATATACACAAGGGCCC
CAATCTGGATATCCTGGGAATTATATGAACCAAAGTGCACATCCAGGATA
CCCTCATATGGGTGCAACAAATGACATTGTATCTCAGGTACGTTCTTTGC
AGTTCTTAACCATTACATTGCATGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAGATGT
CTCAGATTTGATAAAATTTGGGTGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGG
TTCATCCAAATTTTGATAAATCTAAGACATTTATTTGAGATGGAGGGAGT
ACTAAATTTACTTTTGATGCCTTTCCCTGAATATGTTTATATTCTCTGGA
CTAAGCATGTTTGTATAATCCAGGATCACATGGCCCATGGTTCCCATGGA
ATGTTTACACAAGCTGGATACAATGACCCATCACAAGACGAGTCTTCTCA
GATGCATTATGGGATGGGTGCTCCTGGCCATCTTCAGTCGCAGGTGGTTC
ATCTAATTTCAGGTGTTCTATGTTTTCTTTTTCTGAACAACTGTTACAAC
TGGAGCTAACGTAATGATTTTGCAGAGCATGATGAATCCTATGTACTCTC
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CAGTGATCAGGAAATCTTGTGACATATGGCTGAAGCAGCGTTAATTTTTG
GAAGTTACATGACTTGTGCATCCCTTTGGCCCATGGCAGCTTGGTTATGC
TTTTGTGAAGTACCATGCAGAAGTGTTGGTGCATAGATATCAGTTGCAAG
CAAAGAGGACAGGCATATTTTGGCGCACTACATATCGAATGTTATTGGGT
CAGGCTTGTACAAGATGGCTATGGCTATCGACCATACACCATTGGTAAGG
AGCACAAGGATTGCAAGATATCTCCTTGTCGTGGTAGTTGGCAATGGGGC
TTGGCAACAACAGGTCTCCACTCGTGCATTGAGAGAAAAGGGTGTCGTTA
CCTCCAGACCATTCACCTGTATAGAAGGCAAAGCAGGGCTTGTAGTGGTA
CGATGTGAATATGTGCTGCCATCCAAGTCAAAGGTGCAGCAGCTATCGTC
TACCTCCATGGTACCACGAAGACCGCCTGCTGATTGGTTTTGCATAGAGG
TGCTATAGGTGGGGTGGCTAACCTTCAGATCTCGCACATGGCCAAGATAC
TTGTCTGAACAATTATGTATGATTTCTATATAGTTTCAATTTTATGACAA
AAATGATGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.