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GrainGenes Sequence Report: AA041041

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Sequence
AA041041
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041041
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGACTACAGCCAAGATCCTGCCGCTGTCTGCTGCCCGGCCGCACGACCA
TGTTGGTGGTGACCAGATGGAGAAGGTGGTTTACACGGTGTGGATGAAAT
CGCTGGTGTTCAACGGCCACGGGTGCACCATCTACGGCCAGGACGGCGGC
GTGGCCTACCGCGTCGACAACTACGCCTGCACCCGCAGCCGCGAGGTGTT
CGTCATGGACACCGCCGGCAAAGCACTCATCAAGCTACAGCTCAAGAAGG
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ATATTCCCCTAAGTTTGGTCAAACAAAGCTTGGAAATTAATCAACAAGCA
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CTACACTTTTTGAATTTCCTGCACCCAAAACTGAAAGAAAGCATAGACTT
TCTGACTTTGTACCATACACGCTCAGAGCCTCAACATGTATACCATCATT
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ATCATGGCCGGCCGTATCCTGATTTTGTTTCATGCCAGGGTAAATTATTA
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TTGCGATTCTATATGATCTTCAGAAGTCTCACGTTGGGGAAGATAGTTTA
TGCTCCATTATTAGCGGAGATGGAGCTCACAAGGCTCCCAATTTTATGGT
AGGTCGTGCTTTGTTCAACTCTGGAGCATTGCACTTGTCCCTGATTGCTG
GAAACTAAAAAAAATAGGAGTAGTTGATTGGAGAATAATGCATATCCACT
TTGTGTCGTCACTACAAACTGCCATTCTTCCAAGGAGCATAAAACGGATT
TCATTAACAAATGAAGCTAGTTCGTATGGTAATCTGTGCCATGTGTAGAT
AAGTGATCTTGTAAAGAATTGTTGAGGGTGGCCGACCCTGACATCAGAGA
AAGGGGAACAAGAACAACGACGTGAACTGGCCTGGCTGCTCGCTTATTTA
GGTGCAAGTACTTATCCTTGGTTTAGTGTGGGTGCCAGCTTTCTTTCCGA
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GTAAACGTGGCGCTAATTAATTGCATGCTGACCAGCACAGCTCTAGATCG
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ACCATCCCAATCATCATTCATCTCATTTCTACAGCAGCAGAAGCAAGCAG
TCTTCCTGTCTCTCTCTCGTCAATGGCCAAGATCCAGCCCCTCCCTGCCG
CCGCCTCGCCGTCCACCAGCTCGTCCACCGACGATCACCAGATCCAGCAG
CGCAAGCAGGCGTACACAGTGTGGATGAAGTCCCTGGTGTTCAACGGCAG
CGGCTGCACGGTGTACACGCCGGACGGAGGCGTGGCCTTCCGCGTGGACA
ACTACGGCTGCAGGGGCGGCCGCGAGGTCTTCTTCATGGACCGCGCCGGG
AACACCCTCATCAGGATCAGGAGGAATGGCTTCGGGATGTTCAGAAGGTG
GGATGTCTGCCGGTACACCCTCAACGGCGGCGAAGAGGAGGCCATGCCGT
GGTTCAGCGTGCGGCGGGCCGAGAAGGGCGGCGCCGCTGTGACGATGCAT
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GGAGTACAGAGTCAGCAGCGTGGATGCCGCCGTCGTGGCGGAGGTGGCGC
GGAAGCAGACGGCGGCAGGGCTCGTGCTGGGAGAGGATGTCTTGTCGCTG
ACGGTGGGGCCGGAGGTGGATCACCTGCTCGTCTTGGGGTTGGTCGTCGT
GCGTGGCCTCATGAACCGATCCTTGTGACGGATTCACCACGAGCTTATAT
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AAGAATCCCTGAGTTAAGATTTGTTAGAAAAAACAGAAATATTTTTTAAC
ACATTCCGCTAAATTGAGAGCTCTACACTCTTATGGTCAATGGTTATTTG
CCCCTTCATCTCTGATTGTTTGAAGAGTATGCAGTTGAATAAATTGTATG
ACTACACCAAAATTTAACAAATCATGACTCTGGTTATATTAAGTGTTTGT
TTACATGTATTTATATTTGTTATTATAAGTTTGATATTTTTTGTCTTTTT
TGGAAGATATTGTTTGTCTTTGTTTATAAGATTACTTTTGCTTGTATAAA
TTGTATGACTACACCAAAATTTAACAAATCATGACTCTGGTTATATTAAG
TATTTGTTTACATGTATTTATATTTGTTATTATAAGTTTGATATTTTTTG
TCTTTTTTGGAAGATATTGTTTGTCTTTGTTTATAAGATTACTTTAGCTT
CGGTCCCCCCCCCCACCCCCCCACACACACCCCACACACACTTCTTTTAG
AGGACCGTACGAACCCACGCGACGTTCGTATGCTCCTATTAGACGTATAC
TCATATGCCTGCGGAAGGCGAAAACCGGAAGTTATACAACAACAACAACA
ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAATAACAAACAACAA
CAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA
ACAACAACAACAACAACAACAACAACAAAATTTAAAACTTGACATTCAAA
GACGTAGATTGCGATAATGGGAGGTGGGTTCAGCCGGCTGAAACATGGAT
TATACCTAGTTTGACTGAGTACACATATATGAAAATATATGTGGCCTCGA
TATGGGTTTCGACGGGTCAAAAAATAAAACTGCCCATGCAGCTTAAGTTT
AGGGGGGGGGGGGGGGGGGACCGAAGCACACCTCAATCCAAATGTGGTGT
CATTTTTTCTTCTTCCATACCAACTCTATACATGCAACATTTTACATAAA
AAATAACAAATCCGCCATTTGAGAACTTTAGAGATACATGTCTTCATAAA
CATGACAATCATGTAGGAGCTAACCTGGCTTTTTACCCAAATGACCATGT
TCAAATACTAGCGTGAGCCGAAGGCGCGCTGTCGTCCTCTTTCCTCCATC
AGTATAGTCGCGCAGAGTTTTTTTTATAGCAGAGCTTGTTGTAATAGATA
TACAAGAATTCATCGCGGTAAGACCGGCTTATGACCAACTTACCAGAGCA
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ACATCGCTAGGTGGTCCAATTAGACACGGAAGAAAACCCTCATGTAGGAG
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TGGAATGGCGGCGACACCCTTGGGTTCACTGACATGTGGGTCCCACATAA
ATCAGTGACCCCAAGTTAGGGTAACGAATGCCTAGAGGATCCTCTATCCA
TGATGAAACTTTAGAGATGGCACTAAGTTTGGAGTAGTAATTGAGTTGAA
CTTACTATGTATTTAGTAATAAGAATAAAATATGCATAGCATTGATTAAA
CCTTGTCCTCTGTTTGGCTTGCCACTTTATCAATTATTAGACTTTGCATT
GCCTAAAAGCCGGTCAAGTAAAGATAAGGGATGATCATCAGGCCATAGTC
TCCTTAATTAAGGATTACCCAAAAAGTTTCACAACGGGTTACTTTGGAGC
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CCCTTCACTCCTTTTCTCTGTCTATCTGGAAAGTGATCGACGATGCAACA
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TGTTTTTATTCTCTTTTGAATCGTAGTATCCACTTTCCTTTCCTTTAATG
TTTTCTTCTAATTTCATTTTCCTTCCATGTTTTGTTGACATGAGCTGTTA
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GAAAATTATCCGTGCGTTGCTACGGGTGATCCAGAGCTCTGAGATCAGCA
CCATCTGATTTTTACACTTAACCCCCATCTTTCACCCACGATCGGTTCGT
CTTCCATAGTTCCATCTCGCGTGTGTAAAGAATGGACTCACAAACTATAT
ATTCATAGTTTAAAAAACCGGACCCGATCGTCGGTTGAATTGGAAAAAGA
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CTGCAAGGTCTAGTTTCCATCATCATTTTGGCTCCAAGCTCCATCGCGCG
CTGTTGTCTTGTATGCATGTAGCAAACTCAATCTGCAATAGACTGTGTAT
ATATTCTTCTGTATGTCTTTCTTCTTAATCCTGCAACTATACAAGGCAGG
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CTGCTGTTTCCGAATTGGCTTGCTGATATCATATAATTTGGTAACGTATA
TAGACTGGGCAGGCAATGGTCAAAGAAGCAGGGTGAGACTAAACCTAAGT
GGTATCAGGTCTTGACAGCACTTATGTCTGCCATTTATTCCATCGCTCAA
AGCAAACCGGGCCTATTTGTCCTTGTTTCAGCCGGCTTGGACGCTCGTTT
GTATCGGCCCATGGCACAATGGTAGCAATGTATGTTCGCAAGATGGTCAG
GCTATAATTTAGAGTTCTATTTTCACATGTTCTAACTGAGTTGAGTTGAG
TAGTAATTGAGTTGAACTTACTATGTATTTAAATAAAATATGCATAGCAT
TGATTAAACCTTGTCCACTGTCGGTCTGTTGGCCTGCCACTTTATCAATT
AGCCTTTGCATTGCCTAAAAGCCGGTCAAGTAAAGATAAGGCATGATCAT
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TGGACTGTACTAGCTCCCTTCACTCCTTTTCTCTGTCTTTCTGGAATGTG
ATCGATCGATGTGAGACGTACCTTATGCACGAATCTCTCAACCTGCGCTT
TTTTCCGTGTATATCTACAGCTTTTATTCTCTTTTGAACCGTGGTATCCT
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TCCTTCCAATAGGGACGTAGTGTACTTTCTGAATTTTCTGCCCTCCAAAC
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TGTCTGAAGGTAGTGTTGTCATTAAAGTAAATGAAGATACCGGCAAATGT
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AAGGGGATAGTAAGAAAAATAAGTATCGACTGGCCAGATGAAGGGCCTGT
TTGGTTGAGCTTAAATCTAGCTTTTAGAGTTTGGCTTATAAGCCACAAAA
GCACCAAAATAGGTGCTTTTGGCTTTGGCTTTTGGCTTTTAATTAAACAT
GGTAGTACAATGGTATAAGCCAAAAGCCAAAATAAAAAGCAGCTATTTAG
GTGCTTTTATGGCTTATAAGCCAAAAACAAAAAGCCATAAATAAGCACAA
CCAAACAGCCCCGAAATGTGGTTTGCCGTTCGAAGGAGTATGGTGGACTA
GGCATACACGATTTGCAAGTTTAAAACACCGCACTTCTAGGCAAGTGGCT
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CTGTGGCTTTGTAGAAATGACAAGATTTTAATAACGGTGTGTCTTCTCGT
CTGCAGGTAATTTATCGAGCCATGGCTATTCTTCGATCATGGACTACTCT
CCAACGCATGGAGTTTCGCGACTTATTTATGGAGGAATGTACGCGATTGG
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ATGCATGCGTTCATTTTAAAAAATATCAAGTCATGAACTGTATCAGCACC
AGGCGCATCATCGTTCTCATCCAAACGTTCTGGAGGTGTCTCATCTCCTA
TTCGGAGAAAATCGATTGATCCGGTGAACAAGTTATAAAATACAGGAGTA
TAAACTCCTCTACACGTGGTTTTTGCGCGCTCGACAAGAATAGTTGAGAT
TACCATATTATCTTTAGAAGTCTCATGTCCTCGATCGCGACGATAGTTTA
AGCTCCATTATTAGCAGAGTTGGAGTTTCTAATCTGCACGAGGCTCCCAA
TTTTATGGTAGGCCGTGCTTTGTTTAACACCGGAGCATTGTTCTTGTCCA
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TTATTTGAATGGTACTCTGCCATGTGAGATAAGTGATCTTGTAAAGAATT
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GTTCAGTGTAGGTGCCTACTTTCTTTATGCTCTCCGGACAGAACAAGCTA
TTTCCTCATCATAAGGGTTCTAGATAGAAGAATCTGTGGCACACATGTTC
CACATTGTGGTTTAGTTAGATCAAATCAAGGTTTTGACTTCATTGGATGA
ATTCTCTCAAAATAAGCTTTTACCCAGCTTTATAAATAAAGCCACATCGT
CCGAACTAATACAAGGTGATGTGAAGACCTCTTATAAAGACGATCAAGAT
GAACAAGAAACACACGAAAGACCACAACTTGCCACCAAAGACAATCACCC
GAGAGAGGGAAGAACCAGGGCTCCACGACGACGCCCTAGGAGAGTAACGC
GCACTGCGCCACCGTCGCCGAGACCGATAGTCAAGGGTTTTCACCCGGAG
CCTTATCGCGCAGAAGGTAGCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGGGTCACGAT
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AAAAACCTTCAAGCCGCTCCATGTCACCCTCCCACGCTCGTTGTCCCCGA
GTCTAGCCTCCAAAACACGATCTGGGAGCTGCCGAAGACGAAACATCGCC
AGCACCGAAGTCCCCCAATGTCCGCTCTACGCCACCCACATGACCGAAGA
TTGAACCATCGTACCACAGCCGCCACGTCCCTAGCCGAAGAGTCGCCCGT
GCAGTACACCTTCCGGGGCCGCCGCCCCGGTGTCCAAGAACTCGAGCCAA
GTCTCAAACCAACGCCACATCGCACCGCCGCCAAGAAGGACGGGGTAGAT
CAAGCACAGACCTGCCGGAAATGAGCCACCCGACAGCCTAGGGGAGGAGA
AAAACCTTCCATCACCCGCGGTGCTTGTCGTTCGGGCGCAGCAGTACCGA
CTAGGCCTAGATCAGGCCCAGATTAGGCCCCGCCAAGCCTAGATTAGGCC
CAGATCGGCCCCTGTCAGTGCCACCGCCGCGTTGTTGCAGCCAGGCCGTC
GGCGTCGCCGTCCTCCTGCGCCTCGTTCTTATCTTCCAATGTTGCTGCCT
TGCGAGCTAAGCTGCCATGTCTCGCCGCTGGAGACTCCACTTCGCTGCTG
CTGCAGCTCCCGCCACTGAGCTGAGCGCCGGTCGAGCCAGGTGCGCCGCC
GGTGTGAGGGGCCATTGCCGCGTCGCCTAGGGACAGTCTGCCACAGTTGT
GCCACCCTGCCGGACGAGCTCATCGCCACGCCAGTCTGCACCGCCTCCAG
ATGCCGCCGCCCGCGAGGGAGCCCTAGCGCCGGGTGATGGAGGTCATGCC
ACCGCCGACACAACACGGTCTTTGTCGGGCGGCGCTCACCGGCGGAGGCA
AGGGAAGGAAGGAGGAGGGAGGGGGAGGAGGAGGCGGGCTAAGGAAATGC
CTCGGTCGCCCTCGCGCGGCGACGCGAGACGTCCTTGTTTTTTTCCGTCC
GATCGCTTTACCTTTGTGTTTCATCTTCAAATATGCAGCTTAGCTATGCA
AATTATTGAGAAAAGGTACCATGACACCTAAGCAACTTAGCTGTGCATGC
ACATTATCGAGAAAAACTAAATTTCGCCATACATACTCCAAACTTGCACT
ATGTAAACGTGGCGCTAATTGCATGCTGACGAGTACAGCTCTAAAACAAG
AACGAGCATAAACAAGTTTTGCCACTGACACCTACCATCCCAATCATTGC
AATACCAGCAGCCGCAGAGCAGAGCAGAGCGCCTGAACAATCTGATTTTT
TTACAAATATAACCCCCTCCAAATATCTATTGCCAAAACTGACCCATGCT
CAGCTCTATTGTCAAAAATAACCTGGCGGAAAGAGGAAAAGCTGACACGT
GTAACATTCTGCCATAACCGGTGGCGGACCTCACATCCCGCCACAGGGAC
AAGCGGAAAGAACATACCGCCCATGCCAACGGCGGGAGGAGACGTGGCTG
CTGATTAAAGAAAACATGCCGCCATGTTTGCCCAAAGCATGCATTTACTA
ACTAATCTAGGCTGGAGGCTTACGTACTTTGTGTTTGACTTGAGGCTAAT
TAACTACTAGTAGTATCTAAACCTACATACTCTTCTCTCTCTGCTCCCAA
CGGCGATGCATGCCTCGTATTCTCTCTACAGGCCATCATCTATGTAGTGC
TTAATTAGTGAATGCAATTAAGAATTGACTCTTCCCGCCAGCTTACATGT
CACATACCGCCCATGGGACAGGCGGTATGTCCCTTTCGCCATTGTGGTTG
GCGGGAGGTTAGCTCCGCCGGCTGTTGTGGCGGGACGTTATACGTGTCAC
CTTTTGCCAGCTCCGCCAGGTTATTTTTGACAATAGAATTAAGTAAGGGT
CAGTTTAGGCGATGAGACTTTGCAGACGGTCGTATTTGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.