Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA008243

[Submit comment/correction]

Sequence
AA008243
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008243
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTAAGTCCTGACGAACAAGAACTGAACTGATGGCAGCACGTCGTCCTGT
CTATTTCTCGTAATCATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCA
CCGGCTGCCGGAGACCGAACAACCGCCTCGCCGTTGGCGACCGCCCCCGT
TAAAATGGCGCTCGGTGCGGCCTCCGATCAAACGGACGCAGCCCGCGGCC
CGGTGAGCGGAAGATCCGTGGAAGCGGCGCGAAGCGGAAGGGAGGGTCGA
TGGAGAAGGCGGGGACGGAGATAGAGGTCGGACCCGACGGCATCGCCGTC
ATCGCCATCGCCAACCCACCCGTCAACGCCCTCTCCATCGATGGTGAATC
AATCCCTTCTTCTCCTCCTCCGACTTTCCTGTGATTGGTTATTGGACCGT
ACTACGCATCCCGGGGATCAAATACCCCGACCCCCCAGGTCCTGGTGACG
ACACTTTTCCCATAAAACACTCAAATCCAGCCTTTGTTTCATAAATTCTC
ACATTTGCTGCATTTGTAGCAAAAACGGTTCGTTCTCAGAAACATAACAA
AAAGACCGCCCTCGCTGCAGAAACCCCTTTTTGCTAGATCATAAACACAA
TTGATCCTCTTTATGGATATTTTACCAATGTACACTCTACTTTAGGTACA
TAATCCAAGGTTAGTGAGAACTTTTGGGTAAGTGATCAATTTTCCCCTAA
GTGGGTGAATTTGGTTATTCTAGCTTGCTCGGTCATGTTGGGTTAAGCTC
CTATTCCTGGTGAACGGAGGCCAGCCGGCGGAGGGGAGTTAGCTCTGTGT
TCCAGTATTCTTTGCCTTTTTATTATTGGTGGACCAAAATGCCCGGCTAT
CTCCCACTTCACTTAGTATACTCAGCCAAAATAGTTCTTAGATACATTTG
GGTATACCAAGTAGGGTAAAAAGGATTGTTCATTAAGACACTGATTGTCA
TATTAAGTCGATTAACATGTTATTATAATAGCTTTTAGCTTCTTTTGAAA
ATTACGCTGGAGGGGGAAAGAAATCCCTCGGTCTTCGGCTATGCCCCGGT
TCACTTGTTTGCTTCTTTAAGACATTGTAGAATATTAGCAGTTAACTATT
AAGTTCTTTTGTCAAAGATGTTTCATGTGTGGTATATTTTCAGTCTTGTA
TAGCTTGAAAGACCGCTATGAAGAAGCGCTTCGAAGGAATGATGTGAAAG
CTATTGTTCTTACAGGTAATAGCCACTTTAAGATATAATTATCCGTCTTT
TATGGATAATATACACTTCAATTTTTTCCTGAAAAAAAATGCACACACCA
CAATATTGCAGCCATTTTTCTCCTCTTTACGCTTTAGCAGTTGATTTCGT
GTGAACATCTTGTTAAAGATAACTGCGGGAATCTTGAAAGAATCATTTTG
CTTGTCACATGGAAAAATTAACAGGAAGGGGAGGGATATTTTCTGCTGGA
CTCGATATAAGTGCCTTCGGTGATATTCAGAGAAAATTAGGTGCAATTAA
CCCCTATTAAGCAGTTTTTCTGTCAAGATTGTTTTATTCTCTCTCTAAGT
GTTTATACTGACATTGAGGTACAATATTTGTATTTCTAATAGCTGAGCAG
ATAAAGGGTGACTACATGTGGGTTGATGTCATGACTGATATGCTCGAAGG
TATTTGAGCAATTCACCACCTCTTCTACATACATTGGTCAGCTGCATACC
ATTGGGTTAGTAGATTTAACATTTTCATACTCCATTTTTCATCGGTCGTA
TTCTATCATCAGATGCTAGGAAGCCATCAGTTGCTGCTATTGATGGTCTC
GCTCTTGGAGGAGGGTTAGAGTTCTCCATGGTACAAAGTTAAACTGCTTG
TTTTTTTGAATCAAACTGCTTGCTCTGTTCTTCTCGGTATCAGACAAGTT
TCAGAGTGGCAGGTCTTACCAAGCTGGGTTTCTTCTATTAGGTATGCCAG
GCACGCATTTCAACTCCAAATACTAAATTAGGCCTCCCGGAGCTTCAACT
TGGAGTAATACCTGCATTTGGAGGTAGTGTGACTTTTATTTTTTCTTTCA
AATAGAAGGCTATACATAATGCGTACTTCACCAATATAGCAGAGAAAATG
TTATGTTTTTGTGTAAAATTCTAATAAACTGCAGACTGCAATTCGCCATG
TGCGTCATAAGCCCAAATTAAGTTAATTGTGCCATGCCATGCAGTGGATT
ATGAATTACTAATAAATATGGAGAACTACTATCATAGTATTATGCTTTAT
ACCATGCGTTTGGCATTGGTCTTACATTTCAGGAACACAGCGACTTCCAC
GCCTTGTTGGACTGACAAAAGCACTCGAAATGATGATGGTACGTTCATTT
TCTTTCTTTCTATTGAAAATTAACTTCTTATTTTAAAAACTATGGAGCAA
ACCCATTTTCACCAGTTCTCAAAGCCAATTAAAGCTGAAGAAGCTCATGA
GCTGGGTCTAGTTGACGCCATTGTTTCACCTAACGATTTGTTGAATGTTG
CCCGCCATTGGGCTTTGGATATCTGTGAGTCGAGAAGGCCATGGGTTCGA
GCCCTCTACAAATCTGATAAACTTGAATCCCCTGAGGAGGCCAGAGAGAT
CTTCAATTTTGCCAGAGCTCAGGCTAAAATGCAGGCTGCCAATCTTCAAC
ATCCACTAGTCTGTATCGATGTCATCGAAGAAGGTATTGTTTCAGGGACC
CGAACCGGGCTTCGGAAGGTATGTGACATATGACATTTGCCTTGCTGTCT
GGCATTTGGCTTGACAAGGAAACTCGTAAAAATTTTAGGATTTCACCTTA
GCCGTGTCTGACATAAATGCAGGAAGCCATGGCTTTCCAGGAACTCTTTT
TCTCAGACACATGTAAAAGTTTGGTTCACGCGTTCTTTTCACAACGTGCA
ACATCAAAGGTAAAGAACAAGGAAAATTCACCATCTTGTTACAGGAAAAA
AATAGCATGCTTTTTGGGTGCATTATTTGAACCCATGGCAGTATGAGATA
TATGCATGTTGCGTGCAGAATTATACCAACTTACCTGTAGCTATATTTTA
TTATAAAGTAGAATGTTAGTATTATGTCAATTGCAAGGTTCTACTAAGCT
CTAAGCGCTGAGCAAGCATTTGCACAATTAAGCGCACACTTAAGTGCAGT
TAAGCGCTAGCTACTTTGCCCCCACTCAGCGCTTAGGCACGCTTAAGCGT
GCGCTTAGGAGCACTTAATTTAACACTGATTAACTGCTGCAGGTTCCTGG
GATCACAGACTTAGGGTTGATGCCTAGGAGGGTATCTAAAGTTGGCATTG
TTGGTGGTGGGCATATGGGTTCTGGAATTGCAACTGCGCTGATACTGAGC
CAATATCCTGTCATACTCAAAGAAGTCAATGAGGAATTCCTAAACACGGG
AATTGACAGGATCAAAGGTAGAGGATGACTCATCTTGATGTCAGATCAGC
TTCAAAATAGAGGGGCGTGTTTAACTGTATTCCTTTGACCAGAAAACTTG
CAGAGTCGTGTAAGTAAAGGGAAAATGACCGAGGAGAAATTTGAAAATAC
GCTCTCACTTCTTATGGGTGTCCTCGATTATGAGAAATTCAAGAGCGTGG
ATTTAGTTATTGAGGCAAGTCTTATATCTATTTACCACACATCTGCTATG
TCAAGCTAATAACAGTAGGAGAGAGCCCTACGGAAATATATATTGGTTTT
GCCATTTTAGTTAACCCAGTTATCCGTTTGCCGCTTCTTCTATATATGAC
AGGCAGTTGCAGAGAATGTGAAGTTGAAGCAACAGATTTTTGCTGAATTG
GAGCGGCACTGTCCTTCCCATTGTGTTCTTGCCACTAACACTTCCACCAT
TGATCTTAACCTAATTGGAGAGAAGACAAATTCCCAAGACCGCATTGTAG
GCGCACACTTCTTCCCGTAAGGAAATGCTAATCATGTTCAGGCAAAATTC
TTCACTTGTTATTCCTGAACTTCTTATTTAACTCTCTTTTTTTTCCATAG
TCCAGTTCATACCATGCCTCTTCTTGAGATAGTCCGCACCCCTGGTACCT
CTCTGCAAGCGGTTGTCACCTTGCTGGATGTGGGAAAGAATATCAGGAAG
ACACCAATAGTGGTCGGAAACTGTACTGGTTTCGTGGTCAACCGGATGTT
CTTTCCATACACTCAGGCAGCACTCTTGCTTGTCGATCATGGAATTGATA
TTTACAAAATGGATCAAGCTTGTACCAAATTTGGGATGCCAAAAGGTCCA
TTCAGGTAACCGGGCAACACCAAATCTCTTTGGCAGTATTTATCTCGCTC
AGATATTGCAGATTGCGATGATTCAAAAGGGAATGCTCATTAGTGATTTT
CGATATTGCTTTACTTAGTTTATGCACTTATGCTAGTCAAACCACGTTGA
ATCACACTCCAGTTTCATTTAATTAAATATCTTTTCTGCAGATTGGCAGA
TCTGGTTGGTTTTGGAGTTGCTTTAGCCACTAGCATGCAGTACCTTGAAA
ACTTCCCTGAGAGGGTTTACAAGTCAATGCTGATTCCTCTCATGATTGAA
GACAAAAGGACAGGTAAAATTAGTCATGTACAGCTTACAGTGCTTCCTTG
GTTCCCATTGGTGAGTATGCGCACCTTGTGTTTCTTGCCGTTCGATAGGT
GAAGCCTCTGAAAAGGGATTTTACAAGTATGAGGGTAAGAGGAAAGTGAA
CCCTGATCCCGAAATCACGAACTATGTAGAGGAATCCAGGAGAATTGCAG
GAATCACACCTGATCCTGAGGTTTGTTTTCGCTTTATAGTGTTTTTACCT
ACATTCCTTTTAGTTCTTCACTTTAGCGATATGATCTTTTCTTGCGGATT
TGCAAAATAAAAAAAATATTAATATGCTATTCCTAGTACTCCTCAAAATA
AGGTTTCTTCATGAGGTTGATGTTGGCAAGATGGTAGATGCTATGCATCA
ATGGTCGAAGAAGCATCTATGGTTTTCAATTTTACCTGCTGTACTCGGTG
AAATCTTACTATTTTGGTGGACTACATAGGCTAAACTAGTTTTAGTGTTG
ATGTCAGTCTCAGGGGTGCAAACATTTATTTGGACTGAACGGGTCTATGT
GGACACCATGTTTCAGTTGAAGGAAAAATGTTGCTAGTTCTTAGAAACAC
CAGTGACCATTTCTATTCAGCATGTTGTTTTATAAATGGTGGCAGTTGCT
GAAGCTTGATGACAGTGCGATAGCAGAGATGGTGTTCTTCCCGGTTATCA
ATGAAGCCTGCCGTGTCCTTGGCGAGGGCATCGCCGTCAAGGCTTCCGAC
CTCGACATCGCCTCCATCTACGGCATGGGTTTCCCACCATACAGGTGCTC
TTTCTGAATCATCTGTAATTCGGAACGCTAAGATGATTCTCCGAGCTCCG
ATGAAACCGATCTGTGAAATGCAACCAGGGGTGGCATCATGTACTGGGCG
GATTCCATTGGAGCAAGGCGCATCCACGCGAAGCTTTCGGAATGGGAGGT
GAAGTGTGGCCAGTTCTTCAAGCCTTGCACATACCTGGCGGAGAGGGCAG
CTGGAGGTGTTCCTCTGGTGAGAAGAATGACTGGGCTTGTTTCTTCAGAA
ATCCCAATCCAATTTTTTTGTGACATTTGCCCATGTAGATCTATCATAAT
ATATCAAATGAATTTCCATTTCCATTTGCAGAGTGCACCGGCTACGACAT
CGATGAATCAGGCCAAGGGCAAGCTGTAGGTTTTTTCTTCACACTACTAT
CTTTTTTATTTTTTTTGCCGGAGCAGGCAGGAGTGTGCAGAATAAGAATG
ATGTGGCTTCAAATCGCTTCAGAGGCTGCTGAATCATGGAAGGGGAGAAC
CAGGACAATGAACATACAGATTTGTTTCTTTCGGCGAGGTTATTTCACAA
AAGATGATCACACGAAGTATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.