Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006546

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006546
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006546
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CATTACTGCACTGGCGTACACAGCTCGCACGCTCCCATCCTCAGCATCGG
TCTAATCCTCGCGCTCGCTCGCACGCACGCTCCACCCTCAGCATCGGCCT
ACCGAGCGAGCCGGCCGCGTCGGGCCTAGCTAATCTCACATCAAATCACC
AATCTCCTCCTCCCCCACCACCACCTCCATGACAGCTACGGTACTTACCA
GAGAGTAGAGAGAGAGAGACGCGACAACACCAGACGACGGGTAGCCGAGC
TAGCGATCAATGTATGCTTGAGTGTGTCTTGCTTGAGAGAGAGAGAGAGA
TTAGGTGGAGGGAAGACATTTCTAGAGAGAGAGAGCGAGGGGGAGAAGCC
GACTTAAAGGCACACAGCGAAAGCATATGATCAGACATCGTCTCTCTGCT
GGCTTAGTAAAGTAACAGGAGAGAAAGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAAAGA
TGGGTCGTGGGAAGGTGGAGTTGAAGCGGATCGAGAACAAGATAAGCCGG
CAGGTGACGTTCGCCAAGCGCCGGAACGGGCTGCTCAAGAAGGCCTACGA
GCTCTCGCTGCTCTGCGACGCCGAGGTTGCGCTCATCATCTTCTCCGGCC
GCGGCCGCCTCTTCGAGTTCTCCAGCTCTTCCTGGTAAACCTACCACTCT
CCGATCCTCTCCTGCGTGCATACATCATCGCCTGGTGAATAAATTCATAG
TGTGTGTGGGCTAATTAACCTTTGTTTGCGGCTACTGTGCCAAGGTTTCA
TGGGCAGATCGATTTGGCTAGCTTGGGTTTTAGATCCGCAGCTTGTTTAT
AGATCTATATCTATTTATCTCATAGCTTTGTTTCCTTTGCTTGGTATCTG
TTCTCACCGTCTTCCATCGAGTTTTTTCTTCGTGCCAACTTATCGGCGGC
TTCATATCAAGATCTGGCCAAATAAACCTGTCATCCTCTTCCCTTCAAAC
AACATAGATTTACTGCGGAAGAAGAGTTGACTATCAAAAAGATGTGGAAA
TTAGCAAACTAAACCGGATAGCATTTGGCGTTTTATCGATATGTTCACCA
CCTGGATCCCGATGTAGATTTTCTGGAGCACCTCACCATTATTGATTTCG
ATCCCTTTGCTACATTGGGCAGGAACAAAAGAGCCACCCATCTCCCCTTG
CCGCTTATTCCTTCCATCTTTAGAGAGTCCTGTTTCACTAGCTATATACT
GGTCCTTGCAGCACCTTCTCTCTTGTGTGTACACATGTACACGAGGAGTT
ACATTTGTGCGACGATCAAAATCTGGGATTACACAGTTCATCAAAATAAA
GATCTGGAATTACCCGTCCAGGATGTTCTCACAAGTTGAAATGGGATCCC
AAACTTACTGTTCCATTGGTTACTGTTCCATCGAAGGCAGAAGCTTAGCT
CTCTCCCAAAAAATCTCAGCTATCCTCATTGAGCCCCGTGTAGTACAGCT
AGGTGTTGCGTGGTCTGACTCTGACCGCCGAACCCCCAGTCGTGTCAGCA
AAAAAGCAGCACGGCTTGCATGCAATATGCTAATCGGGATAGAGTAGTGG
TTTCACCCATGTGCCACAACTGGATGACTGATAGGTCCACACTGCATGAA
TGAGTGTACGTGCATGCAAGACAATCCTGGACAATCCTTGTTGGAGTCGC
AAAATTTAACAGTAATCCTGTTTATTCCGTTCGAAATTATACTGCTGCAA
CGACAAGTTGAGTAATAAAGCATGAGCAATTTTATTGGGAGGAAGCTTAT
TGGAAGAAAATACAACCTCTGTTCACAATTATAAGATGCTTTAGATATTT
CAGTGTGGACTATATACAGAGCAAAATGAGCGAAACGTGTATAGATACAT
GCGATTCAGAAAATATCCTTTTTATATTATTTTAGAAAATATCTAAAACA
TTTTATAATTATACGGAGAGTAGTCTTAAAAAAAGTTGAGATACATTATA
CTATCTAAAGAGGATTTGTATTCAAGAGTAGAATTTACCGGTGAAAAGAA
AATTCACATCTTCAACTAGACTTACAAAGATAATCAAGTTGTTCAGCAAC
CAACGTCATGTAAACTGACAGGTTAAACCGGATCCAGTTCTAGAGGTCTT
GTAAAAGCTGCTGCAATATAGTCAAATTTTCTTATATGGTTTAACTTGCC
ATTGGTAGAAAATACATGATCCATGTACTCAATTTATTTTCTGTAGCAAT
TTCAATATCTAAAGCAACTACTTTTGGGGCTTCGTTGATTTGGAGTCGCA
AAGGTAGGAATAAAAAACATAGGATTGCAACGTCGTGGTCATTTGAATTT
TAAAGTATTTTTGCTTTGTTTGATGGCTACACAGAAACAGAAAAGGAGGA
TACATTCCTAAATTTTGAGTGGATGCGAAATTTCTTAGTATACAATGTAG
TGCAAAGAAATCCTTATGAAAAAATTCTGTAGGATTTAATTTTAGGAACC
AAACAACATACATTGTAAAAAATCTTAGGATTCTAATCCTCCATAATTAC
TATGAAAATCCTTTCAATCAAAAGGGCTGCCATGTTATCTATTCTTGGTT
AGTACCTGAAGTATCTCTAGTGTTCTCTTTCAAATTTCTGAGGTATGATT
GTCCTTCGATTAATGACACCATAATGGGAGCATTATCATCCATAGTTTTT
TATGTGCTTTGTGAAAATATAATATAATCAAATTATTTAACAAAAGATGT
TATAATAGATGTATGAAAGCTCTTACTAGTTTGCGATACACAAAGATGGT
GCACAAATAGAATAAATCCCCACACACAAAATACATGACTAATTAAATTA
TTACCATGCAAAAGAGACTCAATGTAATAGAAACAAAGGAAAGAACATAC
CATCGCAATATCATGAATTAACACAACACATCTAAGACTATGTGATCATA
CACCTTACGGCCAGGAAAACATAAGATCATCCACAGGCGAACAATACCTC
CAAATCCTTGAGGTGTATAAAAAGACTAGTCATCAAAGTGACCCGCATTT
TAACTCAAACTAAATTAAAATTTGTCAAAGTTCATCTTATTCCAATGATT
TGGTGGAAGTGATTTTTGAAGTTTCAGATATCTGGCTGAGGTAAATAGGT
GATTTCCAAAATTTCAGATATCTAGCCGAGGTCTTAATATGTTTGTTACA
AAATACTAACCCTAAGCGGCACTATATGAACATTCACACATGTAGCGCAT
TGAGATTTACACAATTTAGGAGAGATTGTTCCACTGAAGATACTCGATTC
TGCCCATAGACCTGAATTTATAGCCGAGGTGTAATTTTACCATCCATGTA
AGAGCATATTCACTCGGGGGCCCTAAAGCCCCCCCCCCCCTAAAGGGCTA
TCAGGATGACGGCGCTCAAAATTACGCTTAGCCAGCCCCTCAATCCTTTT
TCAAGCTGGCGCGCCCCGTTTTGATATCCGGCGCCACCAGGCCGAACCCA
ACCCACGGGGGCTAGCGGGAACACCGCATGGAGATGAAAACGCCGTGGGC
CAGCCCTGGCAGTGAGATAGACGGCTCGTCTCCCGAGAGTCGTCCCATCG
ACGACCATGCGGCGGCGAAATTGCTCGCCAATGTTCTCTGCCATGCCCTT
CCCGCCTTTTCCACCACTTCCTGCCCGGGCTTCCCGCCCTTTTCTCGCTA
TATGTAGACGCGACAGCCATCGCCATTGCCATTGCAGATCTACACCATGA
CCATACCTCACACCCTCTCCCGCGATATCTAGGGCGGTGGAAGGAGGTGT
TGTTTTCGCCAGTAGGGCTGGCGCATAGCCATGCCTGGCCGCTATGGTTC
CACGCCTCGCCCACCACCTGCAAGAGAGCCGTGGCACCCGTTTCCGCCTC
TCCCTAGACCCAACCACACTGACTCGGAGTGCTCCGACGTGGAGTGGATC
GAATATGATGACTCCGACATAGCCAACACTAAGGACTTGCGCTAGGCCAG
TTCCGACCCCGAGTCTGGCGAGCCACTTGAACAGTGGGTGACCAACCGCC
GTATTCGACATGAGCGCCGATGATCGCTTTTGCGGCCGCCTATACCCCAC
GGGTCGGCTTATCGGACCACCGACGAGCCTTACGGGTGGGACATCTTTCG
CGAAGTTTTCCTACCGGAGCACCTCCTGTCGCAACAACTCGATAATGTCC
AAAAGCGTTTCCTCTGTGTGTCGCGCAGATACCCCGGCGACGCTGACTTG
CATGCCGGGCGTGACCGAGCTAAGGAGGAAGCCGAGACATAGTCTTGTGG
GGTGTCACCAGAGGGCCGCCGCCACGCCCTATGGCGAGAGCAGCGCCTTC
GGCCGCCGGAGGCATTAGTTTTTATCTTTTCCTTTCTATGTAAATAAAAG
TGTCTGAATGAAAATTGAAGTGTTTGAATGTTTGATTAATTTTTGTATGG
GGGCAGGGCTGGGATCCCCCCCCTCCCCCCCCCTCAAATCATGAACTTAT
CCGGTGCCCCCCTCCCATACGGCTCAAAATCAGGCCGTGCCGGACGCCGT
ATGGGGGGGGGACGAGTGGAGATGCTCTAAGGTCAGGTGTCGATCCCCAA
AGAAGCTCAGAATCACATGCAATAAGGAGTAGTAAGGAGTAGTATTTTCA
TCCATGCATTTGCATAGACTCTGAACCAATGCACACTTCTGGCCTAGCAC
ACTTACAATAAATCATACTCTCTTTGTTCTCTTTGTCCGCCTTCTCTAAA
CTGAATGGATGCACTTCGATATCTAAACAATTCCCCTAGGGTTTTTCTCT
CGAGTTTTTATTACCTTACATTTTATTAGTTAAAGATATTTGGGAAATTC
TAATTAGCATGTGGAGGAAAATTAGACTGCCCATGATGTGTCGTATTTAT
TTTTCCTTGTAGAGAGCACATGTATTCATGCATGCATAAATCTATCCAGC
TCATATTGAGATCATCACATTAATGGATAAATTCGAAAATTCAAATTATT
TATCTATGAAATCGTTCATCCCATTTGCGATCCCTTTACACCAATGTGTT
TGATTTGCAAGGGTTTCGAAACTAGGTCTCATGTTGCTATGTGTCGATGA
ATTTTTTGTTCGTCTCACTTGTTGCTAGATTATAATAATCCTAATGTTAT
CAGACGAACAATGAACAATCATCAAGATAAAATCCAAAATTAGAAAATAC
TTTTTATATGTTTCCTCAGATTTTAGGTCAACTCCAAGTAAATTTCATGT
TAGCTTTAACTATTGTTTGATAGGATTTTACAACCGACTCCAAATATTAA
TTAGGTTAGTAATTCATCCAAACTGCAGGGAAATATTACTATTGCAATTA
TGTGCCGCCGCACTGTGTAGGTATATGGCAACTATGCATCCTCGGGTCAT
ATTTCAATCCTATTAAGATTTATTCTAAGCAATGTGGTGTTCTATCATGA
TATTCTAAGCAATGGATCATTTGTGGGTCACCTTCATACATAAACTTTGA
ACTAGGCTAGGAGTGCCATCTCAACCAGTCATTTGTTGCGGCGTCACAAT
ATGTATACATTTTTTGTGTGAAATCCACAATATGTACACATACAAGCTTT
TTTTTTTTTGAGTCTTTGAGATACATGCAAGCTATTTCTGCAGGAGCTTT
GAGCTATATAAGCACCCTGGAGTTTAAGTTTTGCACTTTTCCAATACTTG
AACGATCATTTTCAAATTCCTTTATTTTTTTAAATTTTCTGCATATCCAT
TATTATATGATTAAACTGATCCCTTGGCATTTTTTATGTCCACAGCATGT
ACAAAACACTTGAAAGATACCGCACCTGCAACCACAGCTCACAAGAAGCA
ACCCCTGCATTGGAAAACGAAGTAGGCATCTCAAGTTCTTCGAGACCTTC
CTGAATGTAACGCAATTATACCTCTATTGGATGGATGGGGCAAATATCGG
TTCATTAGAAAAATCTACTGCAGTTAATGCAGAGAGTAGACACCAGTGTC
TCTATTGGAGACAATAATCTCCATATAGTTAACCAAATATATTTTCTGAC
CGGACAAACGTTTGCATTTCTCTCTTCAAGATTAAACGACATAATGTATG
TTTGCTTCATCGGAGGCATATACCTAGTTAGGTTGCAGAAGTGTTCCCTA
GCCTTAGTCAAAAATTCCTTTACTTTAAATTCAAAACTTTATTTATTTCA
AAAAACCCTGCAATAATAATTATTATCTAAAGCATTACCACAAAAAAATA
TAGTAGAGTCAGGGAATTAGTCCACAGAAAACAATATACTAGAGTCAGAG
AGCAATGAGTCCATGTCGCTAGTAGCATATTTTTCTGATTTCCTGACCAG
GAATTTAAAAAACAAAATATACATTTAACAATGGCATAGGAAAATAAATA
AAAGGTGTTCCATTAGTCCTTGGAAAATGATTGTACTCCCTCTGTCCACT
AATGTAAGACCTTGTTGCCTTTTTCTAGAACACATGTATGTAGACATGTT
TTAGTGTATAGATTCACTCATTTTGGAGTGTATCTAGTCAACTTTGAAAT
ATATAAAAGGTCTTATATTAGTGGATGGAGTACATTTTATGAAATTTTCA
TTTCACCATTCCTAAAAAAAGTTTGACCTCTCTTTTTTGGAGAGAAAAGT
TAGACATATTTGTCATTCTAGTACAATAGTTTACCAAAATGCATGTTGTA
ATAAATCTACCTAGCCATTGAGAAGTTGGTATTAGTACAAGACATTTAAT
TTCACAAATATGTAAGCCTATAGTGAGGATTCACCATGTGTGCGTAATAA
ATAACCATTTTATATTTCAGTAAATTGTCCAAGGCTGCTTCCAGTCAAGT
ATTCTCTCTCTTGAACTAACATGTACCTATGGCTGCATGCATCAATGAGG
CAGACGCTGGGATTATCCCTTTTCTAGAAAGAAAAATAACATGTACATTT
CCCCCTTTTCTTGTTGAAACTAGATTAATTACCAGGAGTATTTAAAGATG
AAGACCAGACTTGAATTCCTTCAAAGTTCACAAAGGTAGTATTCAGAGAT
GGGGCTGAACAGTTACTTTTCTGCATATATATTATTTCAGTGTTGCTCTA
ACACATACCATCCCTCGTTCTCATATATATCTTAGAAATATTCTCGGTGA
AGATCTTGGACCACTTAGTATGAAGGAGCTTGATCAGATTGAGAACCAAA
TAGATGTATCCCTCAAACATATCAGGTCAAAAAAGGTAAGAAACTTCATC
ACCGAGTTACAGAAGATAAGTTTCAGCAGTTTCTTACATACACATAGTGC
TCCAGATTGATGAAAAAGGATAATGGAATAAAGCTTTTTTTTAAACGAGG
CATTATTTGAGATGATGAATAATGGAAGAAAACTCTCCGGTGTCAGTGTG
CCTTTGAATCCGAGGATGCACACAGCCGAATTATACATAGATGTATAACA
ATGCTATCACCATATGACCATATAGGGACCGAGAAGCCACATAAAGTTGG
ATACATAACGCGTTAATAGATTTATCTTAATGAAATCCTCTCTACTTCAG
ACCGTTTTTAAATGGTACTATTTCCGTGGTTGTTTATAGAATCCACTGTA
TGATATTTTAAATGAGTGTTGAATAATTTAAGCTTAAATGTGTATGAGAA
TTCGACCGGTCACTTGTGTCGCGGATGACAAAGTTGTATGTTTTGCAGGA
TCGAGTATTACTTGATCACTTATTTGACCTGAAAAATAAGGTAAGGCTTA
ACTTCTGATTATCATCATGCTAAACTGTTGATATTGTTTCCTTCGTGGCT
CACTAAAATGATGTTGTGCAGGAGCAAGACTTGCTGGATCAAAACAAGGA
GTTGAGGAAGAAGGTAATATCAATGATCTTACTGGTTACAATGTTTGCCC
CTATATGGAATTTCAGTAACTTTGTTCTTAACAACAATTTTCATGCCAAA
ACTTGACTGAACATTTTAAACAACCCTGCATAATTCGAGCCAATTATTTT
TCATTCCAGTTTTTGTCTATAAGAATTGTTCATAATGTTTTTTGTAAGTG
CCAGTTGCAAGAAACCAGCCTGGGAGAGAATGCAGTTCACATGTCCTGGC
AAGATGGAGGGCAGAGTAGCTCTAATCTGCATGCCATTGAGTCCTATCCG
GGACTCCAAAACCCGGATCATGAATCCTCCATGCAAATTGTTGGGTATGC
TGTGAAAGCTCTCCATCTAGGACCTGTTTTTTTTTACGGATGAAGTTGAG
AATTATTTGTCTATATTAACCAGTCTATGGTTTAATTCGGTTTTTCTTTT
GGTGTGAAGGTATCATCAGTCCTACGTGGACCAGATGAACAACGAAGACA
TGACTTCTCATCAACACACAAATGGAGAGCCTGGATCGTCTGCAGGCTGG
ATGTGATAGATTGGTGTGGGGCTGCGTCCGTGTGTAGCCCCAGTGTATCA
GGAATTGCCAAACAGTTGTTATATTTTTGTGTGCTCGAGTGCTTGACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.