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GrainGenes Sequence Report: AA019877

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Sequence
AA019877
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019877
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGTCTATTCCCCAAAGGGGCGCCACCCGTTCGTCGTCCGCGTAGCAAA
CGCTTCTGCGGTTCTGCCTAGCTGCCTCCCCTCCCACTCTCCTTCCCTCC
CTCTCTCCCTCCCTCCTCGGCAGCGAGTCAACCTCCCCTATCCGGCAGCC
TCGCGGTTGCACGTCCCTCTCTGCCCCGCTCCGAGCCGGCGGCGCCGCGC
GGCCAATGCGAGCGCGGTGCAGCGGACACCAGTAGCATTCTCCTCCGGTC
AACCCCGCCGCCGCCGTCGTCGGCCACGCGGGCAGACAGGGGTATGGGGT
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TGCTTACCACAATATGGTAGATTAGAGCTTGGCTTTAGTTGAGAAGAATC
TGTGAACATCCAGGAAGCAACACTTCCATGTTCTATCCCACGGGAAATGG
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GCTTTGTTGGATTTTAATCTGTTTGGTCCTACTATGTGTTAAAGCTATCT
CTTTGTTGTTTCGTCTTTCAGATGAAGATATTTGAGAAGTTGGTAAAGAT
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ATACTTTTCTAGTATGCACTTAAGTTAATTGGGAGTTCTTATCATTATTT
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TCTACTGCTACGGTTACTGATCTGCGGCTCTGCCCAAAATTTGAATTGTG
CAACATTTGTGTAGCACTACTTTTACATGCATAAAATGCTCTCTGCGGAA
GTTAAATAACGGCCTCGTCGACTTGTCATAGTAAAAAAGGAAAAAAAAGA
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GTGCTCGCTTTAATTCCCCACTAGTTGTTCATGAAGAAGAAAGAGACAAC
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TGTATATCTATTGGACAATAACATACTGACTTTAGGTTACCAGCTTATAT
GTACATTTATCAGTATATGTTCTTCCTCATAACAAAAGATAATGGTATTT
TTGCAGGAATTTGGTCACCATGTTAGATTGGCATCTCATGCCAACTTTCG
TACTTTTGTGAAGTCAGCTGGTGTTGATTTTTACCCATTGGGTGGTGATC
CCCGTATTATGGCTCAGTGTATGGTTTTGCTGTCTATTGCCCTTATATTA
TGTATATTGTTAGAATGGCACTGCATATGATAATCCAGCCTTTTATTTAA
TGATGTAATGGTATCGTTCTTTAAGAAACAAAATACATGCGATTCTTAAG
CAAGTTAAATGTAGAAGAATGTTTGCACATACTCTTCGATTTGTAAGGGG
TGCATTTTCAACTGCAGACATGGTAAAAAACAAAGGATTTTTAATGGTTG
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CAGAGCTCAGGCAATAATAGCAAATCCTCCTGCTTTAGGTGGGTCTGTTA
GTCATTATACTCATTTACTTCATATTATAGGTTATAAATTTTCCGTAAAT
CTTTGCTAATTTAATCAGCATGTTCTACCAAAGTACATATAAATTCTCTA
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TCTTTACCTGTTTGATACTTATCATCGTTCGATTATATATCTATATGTGC
AGATTATTAACTTCTTAAGTAAATATAGTGCCTCTGATTACCCCATTTTG
ATCATAATGTAGGGACTACTTTGTACATTAATAAACTTGGTTGGCTTGTA
ACACAGAAATTCTGGTTCTTTAAGTTAATGAAACTATGTAGTATTTGCAT
CCATTTAAAGCCAATAAGTCTGCTGCACAGTTGTTGATTTATCGGGCACA
CCAATTTTTATGATGTCTAAGTTTACTTGCTTTTACCCTTAGATCTTTAA
TATTTTAATGAATGCCACAATTGAGAAGTACCAATATGTAATTTTTCTTG
AGACACAAAAGGAAGACACGTCATTGTTGTCATTACAAGCAAGTAAACAG
GGGGAATCCTTGCTACTTGCTCGGGTTTAAAAGTTTTGTAGGAATAGCTA
AATACCTGAGCCATGTATACTCTAAACTGTTGAGACAAATGGTTGATTGA
CCTTATGGTGTAGGCAATAATTACCTTTCTGGCATGAGTATCTTGTGGAT
CATACAACACATACAGTGTAACTGAAAATTGCATAATGCTGTTATTTCAG
GACATCTCCATATTGCTGAGGCTCTTGGGGTACCTCTGCACATCTTCTTT
ACTTTTCCATGGACGTAAGTCTGTACTCCGACAGCAACGAAAACGTTTCA
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TTGTGTGTGTGTTTGTGTCTCAGTTGCTATTGATTGTGTTAGAATAATAC
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ATAATCAATTTGACCAACAAAATATATGTTGAATTTCCATCAAATTTGCA
TTGAAAGAAGTTACCAATGGTAGAATTTGTATGGCACATAACTCATATAT
TATTTGTCTAATTGATGGTCAACGTCAATCTTGAAATGCGTGGACGCTTA
AAAACTGAAAGGAGGGAGTATTTCTTACTACGAAATCCCTCTGGAACTTG
ATATTGTACCATCAGAATATAAGCACAGTTATACTCTTTGTTCTGTTTAC
TTGTCTAACCAAGACTAGTTTTTTCCCATCCCTTGAGAATGCTTCAACAG
CTATCACAGTCGACTCTTAGGGAAAGTCCAGTAATTAGTGAGGACTATTA
TTTATAAACTACAATTTCAGTCAAGAAACTCACTTCCGTCTGGGATATGT
ATTCCTAAGCTGGTTGTTATACCTTTTCTTCTACAGCTGTTAATCTAATA
TCTACGTAACCTATCATCAAGATTCACTAATTTTGAACTCTGACCAGAAA
TTACGATTTACGCATTTCTCTCATGCATGCCAGCTTATCTCTGGCTACAG
TGCTAACAATATCATGTATTCCAATAGAAATTATAGTACCAGTGTATCAC
ATAGATTGAGTCAATGATACTGTAAAAAGTAGAACATCGCTCTGCATTTT
ATTAAATACTTTTTTTTACTATTTCTTGAACTGATATTTATGTTTACTAT
TTAAGTGAGGTTGTTATGTATGTTTTCCTAATTGCTAATATTTGTAGGCA
GTCCAACTAATGAGTTCCCTCATCCATTGGCACGAATGCCTCAGAGTGCA
ACCTACAGGGTACAACCTTAACTTTTTCACTATTGTGTGCATGCAATTTA
AATATGTGAATTTGTCCCCTTTCGTACATTAGGGTGAAATTGTTCTATCT
TGGCACTAAAGAGAATTCAGATTCTGACATCTTTACCCTACCTCTCACAT
TCAGCTATCCTATCTTATTGTGGATCTGATGATCTGGTGGGGCACAAGAG
GATTCATAAATAATTTCAGAAAGAAGTTAAACTTGGCCCCCATTGCTTAC
TTCAGCACATACCATGGATCCATATCACATTTACCTACAGGATACATGTG
GAGTCCTCACCTTATGCCAAAGCCAAAGGGTATCCTGATATTACTTTATT
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TTATCCTATGTGTCCTCAATTTTCTGCTCATGTTAGGTGTAAATCCATGC
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TTTGGGCCGATGAAAGGTCATGTACCCAAGGTTCCACCAAATAAGAAATG
CTGGGAAGATTATTACCAACAGAATCGGAATGGCTGAAATCTAGATTTCC
CAAGCAGATGATTGAATGTTCGTCTAATTGGATGGGTTCCAGCACTCAAA
GTTTATTTTATATGCTTTACATTGTGGAGGAAGAGGAGTAGTTGGTCATG
TTTAAGGACAAGTCAATATGAGTCAGTTTGTCCTGCTTCTTAGCTGGGCC
ATTTTTGGACTTGTGTTTGCAGATTTTTCTTAGCTGGGCCCCTCCTGACT
TGCATGTAGCGCCGCAAATGATTATTATAGAGTACTCCCTCCGATCCAAA
TTAATGGACTCAGATTTGTATCTAATCTAGACAAATCTGAGTCCATTAAT
TTGGATCGGAGGGAGTAATATATTTCAGTACATTTCTTCCCCAGTGTTTA
CATAAAAAGTTTATGTTTTAGATTAGTCATTTGTTAGCTCTACCTGATGC
AAACAGCTTTTGATTACAAATTTATTCTTTAATAATTGGATTTACTAACT
ACATTCTTGTTTACAGACTGGGGTTCTCTAGTGGATGTCGTGGGATATTG
CTTCTTGAATCTTGGAACAAAGTATCAACCGCCACTAGAACTTACACAAT
GGCTTCAACAAGGGTCCAAACCAATATACATTGGTTTTGGTAGCATGGTA
CGGAACCTGTGCGAAAATGTCTTACGATTATTAAGTTTCATGCACCAACC
AGTAGAACCGAAAGTCTGAAGTGATGGAGAGGGTTGGGCAATCCACATAT
GCTTAACACTCCCTCTTATGGGTGGCTCGATAAGGCCTAAACGTGGACAG
GAAGAGGGTAATCGACTTTTTTTCATCTACATTGCGAAAGCTGAGACTTA
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CTCCCTCTCATGCGTGGCTCGATAAAACCTAAACATGATAGTAAGAGGGC
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ATAGTAAACGTACTATATATAGAAGATATATATTTATATTCCCTAAAAAT
AGATATATATTTATACCTTTACTTAGTTTTATTAAGGATGATAACATGCT
TCACCAGTCTAACCTTCAAGAACTGATGCCAGTGGCCATACTTAATTTTA
TGAAGGACCATACTTAGTTCATTATGATATCATTACCTATCATGTAAATG
CATCTGTTACCACTGGCGGAGCTACGTTAGGACCAAACTGGGCCATGGCC
CAGCCAGGATTTCTGCAAAACACAAATGTGTGCCTATGTATGAGTTGGCC
TTGCCCCCAATACCTATTCCCCTGGACCTTGCCACTGCCTCCAAACTTCC
AGAGTCCCAGTATCGTGTCGTCTCCCACAAGGCCGCGTTCAGTTCGTCAT
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AATAGGGGGGACCGGAGGAAACAGTAGAGCAGCGGTGGCACCGCCCGTAG
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AATTTCTCATCTACAGTTAGCAATTTGATAGATATATATGTTTATGTGCT
AATCAATGAGAGCAAAAGTATCGATTAGTGACTGATTTCTAGTAAAGTGG
TATGTTCACAATAAAAAAAGTGTTCTCCTTTAGCCCGGCCCGCCCATATT
TTCTTTGAAGCTCAGCCACTGTCTGTTACCACTTAAATATTGGATAACCT
GGCGAGGGAAGGTTCAATCTTCGCATGTATGCACTCTTTTTTGGCACAAA
TTGAACTAGCTCTGACCTTGGCTCCCTTCCCTGCCCCTGAGCTCACAATA
GCAACAGTTCTGAATCTGGTTTATTATCATCATCATCATCAACAACAACA
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TGCACATAGACCGCTGATTTCCATGCAGCCTTGTCAAAAGCCAAATCTCT
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ATTTGGTCGACCTCTACCGCTCATTGCATTATCGATACCCCTTAGAACAC
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TCATGTACCACTTCATTCCTGATCCATTCTTTTCTTGTGTGGCCACACAT
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CCATAAAGCATGATAGGTCTGATTGCGGCCCTATAAAACTTACCTTTTAG
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TCCAAGGTTTGTCTCCACAACTCCAGTTTATCGCCCACCCTACTCTCATC
TACTAGTACCACATCATCTGCAAAAAGCATACACCAAGGAATGTCTCCTT
GTATGTCCTTAGGTGATCTCATCTATCACCAAGTCAAAAATGTATGGGCG
CAAAGCTGAACCTTGATGTAGTCCTATAGTAATAGAGAAGGTATCGGTCT
CACTATCTCCTACACGAACACTTGTCACAAAATTAGTTTACATATCTTGA
TAAGGGAAATGTACTTTTTTTTCATGTCGAAAAAAAAAGAAATGTACTAC
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GGCGACACTTATTTAGGATCGGAGGGAGTACTTCTTTTGAACTTTGTGTT
TCTCTAGTGCCCACCACATGATCATCCTTGGTATATTGTCATGTGCCTTC
TCCAAGTCAATGAAAACCATATGTAGGTCCTTCTGCTCCCTATATCTCTC
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GAAGAATGTGATTGAAAAGTTTAGTTAGCCATACTATCGCTATGCCTCCA
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CCTTTCACCACCCCAAGCACCTCTCTAGCTACCTTCGGAATGTGCGTTGC
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CTGCTATCATCCTCTCCTTAAAGGTCTGCTGGGCTTCCCCTTTAAGCTTC
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GTGGAATCTAAAATCGGCCACCACAAGCTTACGTTGAGCCACAACACACT
CTCCGGTTATCACCTTGCAGTCCAAACAAGCTAGCATATCCATCCTCCTA
GTAAGGACAAAGTCAATCTGGCTAGCGTGTTGGGCCCTTCTAAAGGTTAC
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AACCCAAAGCCCCCATGCACCCCCTCAAACCCCTTGTTAGTTGTGCCCAC
ATGACCATTGAGATCTCCTATGAAAAGCTTCTCATTTGTGGGTACGCTAC
TAACCATGCTCTCTAGGTCCTCCCAAAATTGCCTCTTAGTGCCTGTGCCA
AGCCCAACTTGTGGGGCACAAGCACTGATGGCATTCAAGACAAGATCCCA
TACAACTACCATGACTAGGATTAACCTATCCCCCTTTCTCCTAATTTCCA
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CTACTAACTAAACCAGAAGACCAAAGCTTGAAACAGATGTTCTCTACCTC
TTTGGCCTTTTGACCCGCCCATTTAGTCTCTTGGATACAAAGGATATTTA
TACACCTCCTAATCGCTGCATCCACTAACTCTCCGAGCTTTCCTGTTTGT
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CTTTCCAAAATTAAAATGGGTTAATAGAATATTGCCAGGCGTTTTTTCTT
CTTTGTTTTTTCGACATAAGAGTAAATTTATTCTTAATATGTGGTTTATT
TTGTGTTTGAAGCCTCTCGATGACGAAAAGAAGGTCACCAATATCATTTT
GGATGCACTAAAAGAAACAGGACAGCGAGGAATCATTAGCCGTGGTTGGG
GTGATCTTGGAAGTTGTAAGTACCTATTAATCAATTTAAAATTGGGGGAC
AACCAATATTTATATTGTGCATACCATATAGCATGCCAATAGTGTGTACT
TGAACATATGGGTGCTCTTCTATAGCATTGCTGTTGTAGGCTGATGCTTC
TTACATCTTGTAGAAATTTATGAAGGTAGTTAGAAAAGAGTTACTAGTAG
TCCACTTTTTTTTCCATCTGCCTTGTTATTTATTTGTGCAACTTGCAGTT
TCAGAAGTTCCAGTTGACGTCTTCATTTTGGATGATTGCCCTCACGACTG
GCTGTTTCCTCGCTGTGCTGCAGTAGTGAGTTTACTATTTCAACACCACA
ATCTGTTGACTTGTAGGAGTTTTCATAAAGTGATACCAGCTTGATATTGA
ACTTCATGCATTTTGTAATGTCAAAGAAAAAAGGAACTCTTGGAAAAAAA
TCTCTACATGTCAGAAGTTATAAATAAATATCATGTCAGCAGTTCCAACC
ATTTGTTAACATCATATGACTCTTTCTTGCTTACAATTGTTTTGGTTGCT
GGAGAGTGTCTCTAATGGATGAGATCTTGCAGTGAATGAGAATTTTTCTT
CTTCTGTGTAACCATGACCTTTCCGCTATGTATGGTGTCAAACATCACCT
ATGTGTAGTAAGAACATTTTTCTGAGTGACTTACAAACTGACTTGACATT
CTTAAGCAATAACCGTAGTTTCTGAAAATCAAACTAGTGAGACAGACGGT
TTGCTGGTTGGACCACCATCTTGGGTGGCCTGGCTGTGTTTTACTAGTAG
ACTATGTCAAAGTCAAACACCTTTTTGGTCAACACAGTGCTTCACCACAG
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TCCTCTTATACTATAAAATTCAAATGCTGTTCGGACTGTTTTCCAAACTA
TATAGTACTTCTGTTTCCGCATGCAATATACCGATCATGTTGTATATTTG
TTTACCAGGTGCATCATGGTGGAGCAGGTACAACAGCTGCAGGCCTGATA
GCTGGGGTAAGCTACTAGCCTACTAGTATGTACTACTGATAGAGGTTCAA
AGAACATGTCTTAGCACATGATGCCTTTCGGACTTTTTAGCGCAAAACAT
GGCACTCACCAGTCACCACTGGAACAAAACCAGCACATGTAATATCCATA
TTGAAAGGTTCAGCTGACAACATAGTCTCCAAATTTTATAAATAGAACAC
TTGTTATCCTGATGCTTGTATGCACAGCATCCTCAATGTACAAGACCTTC
AATCTACACTAAGCAACTTACGTTTTCTTATCATTCACTATCACCATTCT
TTTGTGAATGTCCTGATTATTTTTCACGCTCTTAACAGTGTCCAACCGCC
ATAGTGCCCTTTTTTGGGGATCAGTTCTTCTGGGGCGAGTTGATTCATGC
GCGTGGTGTGGGTCCTGCACCTATTCGTGTAACAGAGCTTACTGTGGAGG
CACTTTCAAATGCAATAAGATTCATGCTTGATCCTGAGGTAGTACTACTT
TTCATGCTCTTGTTCCGTTCTCCTTTCCTAGCCTCTTTGATGTGTTCATT
TGTCATCTTTCACTACATGGGGGAAGTATATGCTACTAATCTGCTAATTT
CTATGGGGATATTTTTAATCCGTTAATCTTATGATATGTGAACACGTTCT
TTGGTAATGAGCAGATGCAATATTGTTTTAACCGATCCGTTAATGGTACT
CTGCTGAAGGTAAAATTACGATCGATGGAATTGGCAAAAGCAATAGGGAA
TGAAGATGGTGTCGCAGCTGCTGTAGATTCGTTTCATCGACATCTGCCTT
CAGAACTGCCACTTCCTCCACCACCCACGCCTGTAGAGGAAGAACGGCTG
GACCTGTTTCAATTGCTTTCTCGATATCTTGAGAAGTGTTGTCTCCCATT
CAATTTTTAGTTGTCCATAGTGTAGATATCAGTTCAATTTATTTATTTAT
TTTGTCTGGCTAGGAAAAAGAAACAGGTATCTTCTACAAAGTTGGGAAGT
GAAATAAACTCTGGTTCATCGCCCTGGGCCAATCCCCGTTTTCTCTCTTC
TGTTTTGAATATCACATGTAAGGGCGTGTTGTGGCTTCATTGTACATGGT
CAGGGAAGCTTGAAATTCGCATTGCGAAGAATTATTGTACACATTCACCC
TTTTCCCTTTTCTTATCTTGCAATCAAATACTTTCTCCGTTAAGAAATAT
A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.