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GrainGenes Sequence Report: AA018599

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Sequence
AA018599
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018599
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTGCAGTGGCTTGCCTTCTCTTTCCCCAGACAAAAGAAGCTGATCGATCA
GAAAAAGGTGATCAAGCCAGTGCGGGAAAGCAGAACATCACGGGAGGTCG
AGAAGCCTCTCGAACGTTCCAGATTCCCTCAAACCCTAGCTTAAACCCTA
GCATTCTCCCCCAAATTGGTGCTGAATCCGTCCCGGTGGCTCCTCAATTA
ATCCCACCCATGGCTGAAAAGGGGAAGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGA
GGAGTACGTAAGCGACGTCGACGACGCGCCCCTCCCGGCGTTGAGGCGTC
GCGCGGAGGCGAGCGACGATGACGAGGACGGCGGCAGCGAACCCGACGCG
CCCCTCCCAGCGTTGGGGCGTCGCGCGGAGGCGAGCGACGATGACGAGGA
CGACGGCAGCGAACCCGACGCGCCCCTCCCAGCGTTGAGGCGTCGCGCGG
AGGCGAGCGACGAGGACGAGGACGGCGGTGGCGGAAGGGGTTCGCCGCCG
CCGCTGATGGTGGCCGGTTCCGATTCCGACTCCGACCGGCTGGGCGCGGC
CGAGGTATACGACGAAGATGAGGGTTCTGAGAAATGCGAAGGGGGGCAAG
AGGATTTCGACTCAGGGAGTGGTGATGGTGGTGATGGTGGTGGTGATGAT
GATGGTGGCGAGGCCAAGGAAGTGGCGGATGAGGTAGTTACGGCACCCGA
GGAGAAGGGGAAGTACGAGGAGGAGGACCAGGCGAAGTGGGGAGCCGCAG
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AGGATAGGTGCCTTCTTCATGCACGATGATCGCTTCCAGGACAAGGAAAA
CGGCAGGCGCGGGCGCCAGAGGTTCGAGGCTTTCATCTTCCACTTGTTGC
TTGCTTCCTCCTCTGTTATTCAACAGAGCTCTCTTACAGTACAGCTAGTT
AGAAAGCACGCGCCTTAGATTTCAAATTTCCTTTCAGCCTGGATTTTTGT
TCAAATTGACCCTCTTGCGTGAAAAATTATGAATCATCATAATTGGAGTA
CCTGCATACTTAGAGTGGGTGAATTCTTTCATTGCAAAATTTCACGATTG
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CATGTATTACTCACTGCCATCGACTGCTTGGCATAGGCTCCTGGGCATTG
GTAGAGTTTGAAATTGGCTCCCTTCTCTAGAATAATCTCCATATGTACTC
ACTACGAAATGTGGCCCATAGTTTCTGCCTAATATACCCATCTTATTAAT
TCAGGGAGTTTTTCAGTGGCCAAAAGTTATCGCGTCCTGAAGATGATAGT
GTATGGGTGCATGATCGGTTTTATGAGATGAATATCCACGATGTTCAGCG
TGACAATGTGCGCGTTTCTCCTTTCCCCCCTCTATCTGTCTGTTATGTAG
TATTTTACCGACTCTGTTGCTTTGTTTTTGTACTGACATTGTACTTATAG
ACAAGGAGGCCAACAATTCCTTTTAGAGCATGGGCTGGTGATAGAACTCA
TGGCATTAACCATGGTTATCTTGAAGGAAACAAATCCCCTTCATACTATC
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TATCAAAGCAGCAACAACTATAACAGATTTCCAAAAGAAGCCCACACTTC
CTATGACAACAATGCCAAGAACTACAGAAGTGTTCCAAGAAAATTCCACT
CTAACTACTACGACAAGAACTTTGATAATGCCCGAAGAGAACATCGTATT
TATCATGTGAATGCTAAAGGTTACAGCGATGCACCCAATGTTTACAGAGG
GAAACCATCTAGGCCCTACCAATCTCACTGGAAGAATACTTTTGGAATCT
CTTCGGTGCAAAGCAATAGGTAAGTGGAAATCCATTTTCTCCTTTTGTTG
ATATTACTCGCAGAAAATCCGAACTAATGATATTGTTCCCTATGCTTAAT
AGGACATATTCCAGATCACAAAATGAAGATGCTTGTTCCGATGCAGGCGA
GGGAAAGCATTCCTATCAGACTTTAAATTTACAGAATGAACAAGATTTTC
CTTTGAAGCAAGAGCTCCCCTTTATTCAAAGAAGAAGAGCCCGGCCTGCA
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GAACACACAATCTCGTCCTGCTTCTGGAGTGAAGGCTTTTGTTCCATCTG
GTGGGCATGGAAATGCTGGTGATTCTCTTAGTACAGCTTCCATAAAAGAC
ATGCCCAGCCTTGGTTTTCATTCATCTGTATCAACATCAAACAGCTACAG
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CTGCAAAGAACGAATTTTCTTCAACTAGTCAAGCAACTAGATCTTGTAAT
GACTTCAGTAATGCAGTCTATCAGCAAATCTCAGTTCAACAACCCCAAAC
GAGACAAAGGGCATCTACTCAGATATTCCATCAAAATATTGGCAGTATAA
ACAGCATTCAGTCTCATCCACAAGCTATGCCGACAAGTTCAACTGAAGAT
GCAGAGACCAGCCCGCCTCCTGGATCAAAAAAGTATGTTGTAATAGGCCC
AAATGATAAGGAGGAATCAACGAGCACCTCTTCTCATGATGGTGGTCACG
CTCTTGATGTTACAGAAGCAAGGGGCCTTAATCTTGGTGAACAAGGTTTC
ACTGGCATTCCAGCAGTATTGCCAGGTGCGTATGTTACTTGAGATATATG
AATTTAATCTTAAAAATGCAAGCAATAGAGCAATTGAACCACTTGAAGTG
TGTTCTTACTTGTTGTGTCAATGACTAGTTTGATTTCATCAACAGAGAAA
GTAGTTGTAAACATGATAACTCAGATGTTTTCTTCTTTAAGACTTGGAGC
TCCAGGTGTGGATTTGCACAGTTTTTCTAGCCTAGCCTAGCTGCTAGAGA
ACTTTAGGGGATAATATTGTTTGGTCATTATAGTCTTCTAGTAACATAGT
TGCAGCCTTGTAGGTTCTACAAAGTCTTGGTTCACATTTTGATATTGTTA
TCCTATTTGTATCTCGTTGTCTGTACTGTTTATGATTTTATATATGTTTT
ATGATATATATAACGGGTTACTCTTTTACTTGTCCTTTTTTTTCTGAAGT
GTGCGTATTTGAGGCTGTGGGCTTGCACATTCTCTGTTGACCTGACTTCC
ATTGCATTCTCTCTATAGTTATGCAGTTCAGCGGCCAGCATCTTAGCGGA
TATGGTATCCCTTCCATTGGTATGGCTTTGCCCGAACTTGTGGCTCACCA
ACTTGGTGGCAATTCTGAGATGAATCGAATGACTTGGTGCGTAGGTCTTA
ATTTTCTGTGAAGCTTGTGGAAGAACTATTGCTTCATTTATCTAATTGAT
ATCTTGAAATTAAAGTTGTGAAATCCATTTTAAAAATTTGTAAACAAGTA
CTTAAAGTTATTGACTAATTTCTTCATGACTACAGATTATTGTGATTGCT
ATTGCTTAGTGGAAAACTTTTTGTCTCGTCAGTACTGTTATTTTGGCCAA
GCTGTGTCTCCAACATGTCCTACACATGTCCATACCATGCCATAAATGGA
TATCCTTCCCTGCACAGATATAATCAGACACACAGTCAGTACTTATCCGT
AGAGTTCTGAAGGCTTGTCTGTGTTTGGTATATTATCCAACATGGATAAC
ATGCCTCCCTTTCATGTCCTTCACAGCAGCTGAATATGACAAAGCCAAAT
GTTTCTAGGAAGAACATCAGCGTATGAAACTAGTTGGTTCTAGGATAGTT
ATCAATAGTTGGTTTGAAAACCAGTCTGATTCCATTTGTGGGATACTGGG
ATTCTCACATTCTTGTTAAGATTGGTTGAATGTGCTTGTTGGCTACTTTA
TGTAATGGCTGACCTGACCTGACAATTTCCTTCACACAATTCTCTGAAAC
TTTCGCAGTTGAAAAATGTGGGAGTAAATATAACCTCACAGTGATTGGTT
TACAACCTGTTAGTACCATCTGTTCTATAGTCTGCAGTTGGCCAGCGTTC
AGTTCTGGATAAATTTGTGGCATGGAATTTAAATTTTAGGAACTTCCTGT
CCATTCTGAGTTTCTGACCAAGATGCGGTTAAATATTGGGATACTGAAAT
TGAGGACCTCCACATTTCTGGTGCGTGTAGTAATGCGCGTGCATGTGGTG
GCATGAGTATGGTAGACGTGGTTGTATGTGCATTCACCTTGGTTTATCTA
AAAAATATGGAATATGGCTGAGTTTATAATCAATAGCTAGCAATTTTAGT
TAAATGTGGTATCCATTTAACCATGGCTGGATTGCATTATCTTGTTCCTT
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AATGAAATTAGGCTGCCAACATTGTCTGGTGCTACTGGGGCTTTTGGGAC
AACATATCATCCTCCTTATTTTGGCAGTTTTTATCCTGAACCTTCTGAAC
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TATATTACATGGTTTCAGTTTCATGTTCTCAGCTGTATTGGTGTATCGTT
TGCGACAAAGCTAGATGTTGTTTTTCCCAGCCGCAATTGTAGTTACATCA
GTCGAGTTAGAGTTTAACATCTTAACCGTGAGAACTAATACCAAGGATTA
TCATTTCCTGGTCAGATTGATGCTAAAATTTCTGTCTGTCTTCAATGTAA
TCACATTAAGCATGCAGATTATTGATACACCTTCATCTTAGAGCTAATAT
TGTTCATATCATTTTGAGCTCCGTAAGATGCTCCAACTTGCATTCTTGGA
GGCAGGAGATGTTTTCGATCATATAATTGTGACGTATAATAATTGCTTCA
TCTTAGTAAATACATCAAGGTACATTGATTGGTCAATCACACGTCTAGTT
CATTTTACTTTTATGCGTGTAGTTTTGTCAAGGTTAAACGGTGCAAGGAA
ACATCAGTACATATGCATGATATATGTATTACTGTTACTACTTTATATTC
AAGGTTATATATTTACTAGTTCTTTTGTATTTGTTATATCTTTTGTCAGA
AAGGACAAATAAAACATTCATGACTATGAGTTAGTCAATCTTGACATTTG
TATTTGAATATCAGATCCAAAAATTTCAATTCTGAAGCTTTCACAAACTA
TATTGAAAATGCTGCAAGTTCGGTAAAAATTTGGGTTATGAAAATTTAGG
TTCACAACCTCATGCACTTACTGTGTATGTTCATCTCAAATAAATTTATA
TGGATGGTGATATACTGGAAATAGAAAATAAGATTACTATCATATATTTC
CTTCAGAGAAGATTCTGGCAATTAATTATGTTGGAATCTAGGTTAGCATA
GTAGTATTGTCCTAGGAGAGTCTAGAGTATTCCAGTGAGTGTTGGAGTCT
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AGAGCTAGGCTCCTCCTCCTAACCCTAGCTACCACCGTTTCACCATTGCA
ACACCCATTCTGGCTCTTGTTGTCAACAACACCGGGCACATTGTAGTCAC
CTAAGCGGCAGGAGGCCGCATCCCGTTGCTCTCTACAGGCAGTAACCAGC
TTATGTGCTGCTCTCATCACGATGTGTTGTGTGAGGCTTGGTTGCTGCTC
TGTACGGAGGTTGCTTAGTGAGCTAGTTAGAATGGTGCAATTGAGATGTT
GATAGGAGGATGACAAGTTAGCGAGGTTGGATTTGGGGACCAAGAGAAAC
TGGATGTTGAGGAGGACCTCTGATCTGGTCAGAGATGGGAAGATGCAGAG
GTGATGCTGATGGCTGGAGCTGTGTGGTGCTGGGCTGTGGTCATGGAAGG
AGACAACTGGGTGAGGTCTCCAGTTTGGTCGTTCTTGGCTGAGGGAAGAG
GTGAGCTGCAGAGCTGCAAGGTCTGGAAGCCTGAAGCGGAGGTACAACCA
TACAAGGGAGTGCTCCCTGCAGGTGGTTGCTATGATGTTGCTGGAAAAGA
TTCGGTTTCAGGAGGAAGAAGGTGTTGCTGCTGTGTTGCAGCAGAGAAAA
GAGGAGTCCAGGAGGGGGCAGCTGCTGAAGCTGGTGTGAGAAGGCGGCTG
TGGATGGTGATGTTGATGGTGAGGCGGCTGTGGCTCTGTAGGAGTTGTTG
TTGAGGTGAGACAGCCGTCTGTGGGAACCAGAGGTGATGAAGAGGCAATG
ACGATGCTCAAGCTGATGATGGAAGGCGTGTGGTGTCGCCGGTGTAGGCG
CCGGTGTGAGAAAGCGCTTGGTTGGAGAGGCAACGGTGGACCAACGCGAG
AAGGATTGGAGGTGGCCAGCTTGATGCAAAGTTTGTGCATGGTGATGTTG
ATGGTGAGGCGGTTGTGGCTCTGTAGAAGCTGTTGTTGAGGTGAGGCAGC
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GCTGATGAGGGAAGGCGTGTGGTGCCACCGTTGTACGCGTCGGTGTGAGA
AGGCGCATGGTTGGAGAGGCAATGGTGGACCAACACAAGAAGGATGGGAG
GAGGATAGCTTGATGCAGAATAGGCGTGCGGTGATGGTGATGGCTCCCAT
GAGCGGAGCTGGATGGTTGGAGTTGATTGGTTGCTTGACAACCACTGGAG
CAAGAGCTAGAGTAAAACGCTCTCATGTATCTTTGTATGCTTGCAAATTA
GGAAGTGTAGTGTTCCTATTAAGTGTCATGGAGTTGTAGCAAGATGGTCA
TGGTGACTGACCCATGCCCATCTTGAGGGGGAGTGTTGGAATCTAGGTTA
GCATAGTAGTATTGTCCTAGGAGAGTCTAGAGTATTCCAGTGAGTGTTGG
AGTCTGAGTTAGTGTAGTAGTACTACTCTTGTAGAGTCTAGAGTATTCTA
GGGAGTGTTATATAGTAGTAATGTCCTACTAGAGTCTAGATCATTCCAGT
GTATGAGTGAAGATGTAAGGCTAGATTGTGCTATATATAAGAGGGTGTGG
AGGTCCAAGGGACTAAGCCAATCCAGAAATTGTCCTCAAAAACCAACAAA
TTACTTACCTTACTATGGTCATGCGCTTCATCCAATTTATTGTGGCATCA
CATGTTTCCTTATTTACCACATCGTAATTGAGTTTTTTTAGCCAATGGTG
AATAGAAGAACTATTGGGTCCTATGTGGTAAGATGGATGTGAGCTCATAG
TGCCAAATGTATGGTCTTCCCTGTCCGGGAGCATCTTAAAATTCCTCTGT
ACTTTCGTGTACCCTGTGCAAGTTGCACCTTTTGTTTTAGCTGCCTTCCT
GGAAACTCCAATATAACAGTCATACAAACAGTTAAAAAATGTATCATGCT
CAGGAAGTCAGCATATGGTTTCCTGGATACTGGACAATGGAAATGGGATG
TGGAAGGTTGTTTCCTTGGTTTACCACTTCCTCCATTCTTTTGTAGGCCT
CAATGCCGAGCACACAAATTTATGCAAATTTTTACCTTGTGTCTGGTGTG
TGTGTTTCTTTTCTTCATTCTGGCTAGTTTGTCCAGATTCAAGGTTTTCT
ATCCATGTAGTGCTTGGTAAAGGTCTGACTATTTCAAGTCAGATTCCATG
ATGTGTTGCTTTCTGAACTTGCATTGTACTTGCTCTCTTCTTGGCAAACA
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TTCTTTTCCGTGCAGAAACCACAGTGTGACTGAAGTTCCTGTTTCATTGA
ATTCCCATGAATTACCAGGTGAAACCACTCAATCTCCTTTTGTGTTTTGT
TTATTATTTTAGTCTTGACTAATGTTCAAATGGTAATTATTCTCCTGCTC
TTATTCCAAAATTACATGAGTTGTTTATGTTATATTTTCTACCCTTTTGC
AGAGGTTGTAGGTCATGAACTTCGCCAGCGCAAGAACAAACCTCGCAGGT
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TTTGCATCATTAACATAATGAGTTTGGTGACAACCAAAGTGAATTCACAG
AACCAGCTTCCACTCTGCATAGAACTAGCAGAACCTATTGCCAGAGCGGT
CTATTGTATGGGAGCTCAGTACTTTGTCAAGTCCTGAGCCCCCTTGTTTT
CTTCTCCGAAGCGCTCCATTTTGCTCGCTGTAACAACATACATCAGGTAT
GAGTAGTTGTGATATTGGAATCCTAGGGTGGTGTCTTCTCCATTATTTAC
CACACATACCTTAATTGTGTTGACTTGTGAATCTGCATGGTTTTGTTATA
TTAACATGTAGACTCTAGATGTAATTACTGCTTAGGCAGTTGGTACTATG
ACTGCCAAGAGAAGAAAGTTCTCCTTTTTCCTATTCTGTATCATTTCATA
TTTTAGAACCTCCTGCAACAACCCAGCCCAGTTAGGCCATGATTTGTCCA
CCATATCATTTTTCTTTTTTGAGACCGTAGGGTCAGCATTGGGCTCATCA
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GGTTTTGCATTGTTTGTTTAGTCATATACGCCCACATGAGGCCATGATGA
TGTGGCATGCAGAAGCCCAAATTAGGGGATATGTGTTCACTAGTGTAAAT
CCGTAATAGTGCCACTCGCTGACACCTTGGCAGGTTTTACTGTTTAAGTA
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CTGGTGCTCCTTTGTTAGGTGAAATATCTGTGGTATACAATACACTATAT
TTTTCTTCTTCTTCTTTGTTACTTCTCATGGGTGTGCTATTTTCGATTGC
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TTTTGTTAGCGTGACCATTGTTCGACATTTCCTATATCAGCATCTTACAG
TGGGAAAGCAAACCAGATCGTTTATTGCTGTTATTATTACTAGCATTTTG
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AAATGTATGCTGCTTATGGTTCTCTGTTCTTGTGGGCTGCTGGTACATGT
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CTGGTTCGAACTACAGAATTTTTCTCAGAACTGCACAAAGCCGGTAAGAG
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CCACCCAACATCCTCGTCTGGCTCGGGATGGGACATGGCAAAGTTGTGCC
CTGGCTTGTGAGTGTGAGCTGGTCCCAAGCAGCATCCTACCTGGCTATCT
CTGATGCGCGTGGTGTTTACGTGCCGGCAGGGAATCCAGAGCGCCATCAA
GCATATCTCGCAGCTCATTTCTGGTTGCGCGCCCACCTGATTGCCTCAGA
TTGCTTGAAGAGACAGAACAGTGGCCTTTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.