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GrainGenes Sequence Report: AA040199

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Sequence
AA040199
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040199
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGCTACAGCACCTCATCTCAGGTGCTTAGAATGATGATATATGTTC
TTATAGCGATCAATGTTGATATATTGATATTAGCAGGAAACTGATATGAG
CAGGTCAAGACTCTTTATTGTCTTATTTAATTGGTGCTTTTAGTCAGAAG
TCACAACCGATATGGGTTTTTGTTTACAGAAGTCACACTAGCTAGCTGCT
AGTTAGTAAGATTGGTCATGGGTTGTTACATGGTATAATTGTAACGCGGA
TATGTTGCTGAGTAATCTCTCTTGTATTTCTCTTCAGTTTTCTAGTACTT
TTGCAGCCATGCAGATGCTATTTCTTTTGAAATACAATCCAAATTAAACC
ACCCACTTGAATAGTTGTGCAATAGAAATTGTTTTATAGTACTCATTCTC
AGTTTCAACCTTATCTTCCTTTTGTGTTGATCACAAACCATGGAGCTACA
GCACCACATATCTAGGGCTTAGAATGATGATATATGTTCCTATAGAGATC
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ACGAAACTCGTTTTCGGCCTAGCAACGCCGAGTTTCCCACTCGCCTTCCC
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CGTGGTCGACGCCGGACACCGCTTCTACAGACCGAGGCGGGGGTGGTTGC
CGGCCTGGATGTGCTCCATCACGGCGGCGAGAGTTTGCCCTGGAACGCTC
CACCAGCGGCGGCGAAACGCCGCATTGTGACGCGTCGGCGGCGAGCCCGG
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GCCTCCAGAAGACCAGGTGATCCTCAGCGAGATCCCGGTCTTCCATGGCG
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TAGGGATCCCGCCGGTGCTGAGATTCTAACCGACGAGGAGACGAAAGTCT
GGCGGCGCGGTATAGCCCGCGTCGTGGAGCAGCCGGTCTTCCCACGTCTG
CAGCGTGCGGCGGCCGTTCGCCGCCGCGATGTCGCCGGGAAATCTCTCGG
CCATGGCTTTTCGGCGGAGTTGTGGAGGTGGAAATGTGCGAGCGTCTGGA
GTTCGCCGAAGTTGGGAGCGGTGTGAGAGTGTGAAGGGAGACGACGAGAT
GTACGTCTTTTATAGGCCGGGGTCGGCAGCGAGGGCGGGAAAAGGGGAAA
CGGTGGGAAGGATGACGACGACTCGGCTTCTGTCGCTGACAGGCTGGTCC
AGTCGGCGAATTCGCTTCGTTCGGCGTTCCCGGGGCGTACCCGGGATCCT
GGGAATGGCCTGGAAAGTTCAGACCAAAGTTGGCCCAAATCCGGACGAAA
AGAGGTTCCTGGGAACACGATTGGGCCGATTTTCGGCGTCCGGACCTAAA
TTCGGCGTCCTGGGTAGCCGAGTGGAGATGCTCTTACAACCAATGTAAGC
TTTTGTTTACTGCAGTGTTCTCCTCAAATATATTTTATCAACACAATTAG
TGGTTGCTTTTAGTCAGGACTTGCTACCAACATGAGCTTTTGTTTACTGC
AGTGTGCTTGTCAAAATAATTTATATGCACAATTGATGGTTCCTTTTCGT
CAGGAATTATTGTGGACATGAGATTTTGTTTAGTAATCTTGGTCATGGGT
TGCTACGTGGTATTAATTGTAACGCGGATATTTTCTTGAGTTATCTTATC
TCATTTCTTTTTGTCTTCAGTATTTGTAGTACTTTTGCAGCTATACAGAT
CTATCTCTTTTGTGGCACTGGAACTTCTTAAATTGATGAAAGCCCGGAAG
CTTCCACCTTTTGCAGACCCCTTCCCTCCTAAAATTGGTGAATATGGCAC
GCTTGAAGATGCTAGGGACTTTCTCAAGGCCCTGAGAGGGTCAGTGAATA
CCTATCCGGCATACACTGTCTATCTGCTTGTGTTCCAAGTCATTCTTTGC
GGAGGGGAGATATTCTGAGGCTGAGGATTTACTGTACAAATGCCCTTTCC
ATATCCGCAAGCATCATGAAATCACCAAGCTGTTTGAATCAATAAAAGAC
AATACTCCCTCCGACCCATATTACTTGACCCAAGTCAGCTAATATGGGTC
GGAGGGAGTACTACTTCTTAACTGAAGCACGGCAAAGGTTGGTGAGATTA
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GTCATGAGTTGCTACGTGTTATTAATTTTAACGCGGATGTTTTAATGAGT
TATCTTTAATCTCCTTTGTTCAGTTTTCCTAGTACTTTTGCAGCTATTCA
GATCCATTTCCTTTGAAAGACAATCCAAGTTAAACCTGCTGAGCAAAAAT
TTGAACAATAGTGCAATGGTTTTTTTATAGTACTCATTCTGAGTTTCAAC
CTTTTCTTCTTGTTTTTGTGTTGATCACAAACTATGGAGCTACAACACCT
CATCTCAGGTTCTTAGAATGATGATATATGTTCTTATGGCGATCAATGTT
GATACAAATTGAAGTTAGCAGGAAACTAAACGAGCAGGTCAAGACTCTTT
AATTTCTTATTTAATTCTTGCATGTAGTCAGAAGTCACAACCGATATGGG
CCTTTGTTTACCGAAGCGTGCTTGTGAAATTAGCTGCACAATTTTTTTAC
TATATTATAAGCTGCTATAGTGTATAGTCTAGTACTAGAGTATATAATTA
AAATAACACTTCGTTGATATATTTTTAGGTGAGATATTGTTGATCACTCA
CTTGGCATAGTAATCCTCGGATAAACGGGAAGTTTGTGAACAATTTTCTA
TCATGGGATTATGTAGTTTAGTTAGTTTGCCCCCCTCCTCCTTAAATATA
TGGTTAATAGAAAGACCAATATAGCACAGAATGTGTATGCTTTCACATAG
TAATGTAGTATTTCAAACCGAAAGAAGTTGCACAGAATCATTGTAAAACC
AGATATTCATATATAAGAATACCATACATCAGTGGTGCAAATAAAAGTAC
AACATATTTACATCACTCTTATTTCATATCGCAAATAAGAAGATCATAGC
AACACAACTTAGGGATATCCAGATCCCCTACAAGCAGCACCGCTTATTTG
AAGTGTCATACTTGACAAAGCATGAGCAGGTAATACCATGACAAAGGGGG
GCCCTGGTGCTCTTAAGAAGCGGGATACATGGTTGTGCTCTTCTGGAGTC
CCCAAGACATGTGCTTACGCTTGATGAAGTCAGAAGCCACAGTATCCACA
TCCTGATTCACATCTTCTTTCTTGATAACATTGGCATGGTTGTCCTGAAA
CTTGACTTGCTTTTGGCGGGTTTGGGAATGGGTTGTTCCTACTGCTGCTT
CTTTCTTCAGAATACTGGTATGGTTGTCCTGAAATTTCGCATTGTTTTGG
TGGGCTTGGAGATAGAGCAGACGAGTGTGAGACATGATTGGTCTGTGGCT
CCTTGCTTCAAGGTTTGAGGAAATGCTGAAAGGGTAGGGAATTGGGTTGC
AGCTGTGGTGTGTTTTCTTCTCCTCTTTTATAGGCCAATAAGGATTCTTA
TTCTGAAACGGCAAGTGGGCATCATATTCTCCACTTTTGACAATTTTGAG
CGAATCTCTTGTGTTTTCTTTCTTTTTTTTCTCTTCTTCGTTCAAATATA
TTAGGCGCTGAATGACTCCAAGCTAGGGTTCTAACTTATCATATACGCAA
GGTTAGTTCCTTTTGCAGTTTCTTGTTATCTTCTTTTTAGTACTACGAAG
CTTTGATTTGTTTTCCCCTTCTGCTGATAGACATAAGCAATCTTCATTTC
TTATGCTGGCAGTGCCAGTTATGATACTTTTATATTTTACTCTTTTGGTT
AATTGTGAATAACAAGACAAGTCCCAGGCATCTTATTTAGCTTTTGTTAC
CAGGGTAATTGCACTGTTGTTAACTTAATTTCATCCTTATCCACAGGAGC
TCTGATAGTTGTGCCACAGTATTTTCAATATAATATAGTCCATGCATCCA
TCAAACTACTAGAAATATTAACTTGCTTTTCTTTTTTTTCTTGAAGAGTG
TAACAGAATTGCCATTGATGAACTGCTTCTAAGTCGTTTCTTTTTTCTAA
AGGTGCACAAGAATTTAAAACCATGCTCTGGTGTATAGATGCTTCAACTA
TATATTACATTATACGTGTACAATGTTTGCTTGGAGCGAAAAGCTACTAT
CATCATTGTCCTCATTTCCTTTGCATATGATTCTCAACCTATCATCTTTC
TATTTCTCGAAAAGAACTGGATGCTTTTCCTGTTTCTTTCTCAGTCTACT
TTTCACAAGGCTGAATAATAATATCCTGTAGCCACAGAGCGGCCCCAACT
GCTGGGTTCCGTTTATCATCTGCAGAGTTGTTTCTTGAGACGGATCTGTT
GCACAATCAGAGGAAAAGTACACTGAAGACTCTGCCTGGTGGCAGGGTAT
ATCAAATGTGGTGGCGTTTTCCTGACGGAGTTTGGCGCGATAGAGATTGG
TAACAGAAAGCAGTCACATATGGAGATATGCTTCTCGGAAGATGCTTAAT
TCATCCCATGCCCCAGCATTATTCATGGAATGTTTATCACATGGGCATCT
TGATACTTTTATATATATCCTTTATTTATACGATTGCAAATGTACCTGTT
TAGATTCTACACATAATGAGTGCTTGGTTTTCATATTTGACTGTGCCTGT
CTGAATTGCTATCTTCAGTCAAGAACAGTTGAAAACTTGCAGATCTTGTG
CTGGTAGTATTCTCATATTTCTAGAATTTCAGAACCATATGATAATGCAC
AGCAGTCTGTTTGTTTTGGTTGTATTTTTTCCTGGCACACCTGATTATAT
GTTTTATCAGTTTTGTTAAATGCAAGTTTCTAGTTTTTCTTCTTCTTTTG
TTCTTGAGGGAATGCATTATTATGTGACCATCTGATTTGTATTGAGATGT
GTGCCCCCTATGATTGGATATTTGTATAGAGTGCATAAGGTTTGTTTCAA
AATTTTAGTGTAGTTTGCCTCTCAGGTGAATCTTTTTTTTGCGTAGATTG
CTTGAGATCATGTTTTTTTACCAAACCCTGGAAGATGTATACAACACTCT
GTACTGTAATAAATCATCTCTGAATATAGAAGTTAGGCATAATTCCAGCC
ATGGGGAAAACTTACATAATTTTGATCCCTGAAATTGTGTGGACATAAGT
TGACTTATTACAGAAGCAATCTAAGTAGTAATACATAATTATGAAATCAA
CATACTCATCTAACGTGGTAGGCTAGCAGATGACATGAAGTCTCCCTCAA
AGCTTCCTTGTGACTGCACGTTAACTCTCTCGCCCAATTCTGCTGCAGGA
GATCGGTGGGCAGCTCTTCTCTGAGGTTGCATCTGTTCTTCATTTCTTGG
ACCTGCTTGACATGAGTTCACCCGTTTTGTTACCAGTGTTTGCAGTTCTG
TCTCAACATGTTTCATGGTGGGTCTTTCTTCACCATGTAACCTTAAGCAC
ACCTCTGCAAGAGACGCGACGCGGTTGATCTCTTCCTCGGTTGCCTCCTC
AAGGACCTGAGAATTAACAATACTTGCGATTCTCCCCTCCTTGAACTCCT
GGACAAAATAACTTGAGAGGTTCTGGACTGTTCCTGATTCACTTGTAAAA
ATAGGCTTCATCCTGCAAAGCAGCTCCACTAGGACCACACCAAAACTATA
CACGTCGCTCTTCTCGTTTAGCTGTCTCGTGTGGAAATACTCTGGATCTA
GGTACCCAAATGTACCTTGCACATTCGTAACAATGTGTGTTTGATCAATT
GGAACCAATCTAGAAGCACCAAAGTCTGAAACTTTAGCTGTGTAATTTTC
ATCCAAAAGTATATTTGAGGACTTCACGTCACGATGGAAAATTGATATTG
AAGCTGAAGAGTGGAGATAAGATAAAGCTCCTGCTGTTTCCATGGAAATC
CTCAAGTAATCCCCCCAAGACAAAGAAAAACCATTACTTGTATCAGCATG
AAGAACTTCAGACAGTGAGCCACTGGATACATAATCATACACCAGCAATG
GAACCTCCGCTTCAAGACAACATCCAAAGAGCTTCACGATATTTCTGTGA
TTTATCTGAGTGAGGACAGCAACCTCATTGATGAATTGGCTGATCTCAGA
CTCCTCAATGACCTTAGACTTTTTTATCGCGGAGACACGTTGATCAGATA
ATATGCCTTTGTAAACCATGCCATGCCCGCCACGGCCGATTATAAGGGTA
AGGTCGAAGTTGTTTGTTGCTATTTCTAGCTCTTCTAGCGAGAAAATCTT
TGTTTTGTTATTTCCAGTAGTTCCATCAGATGATATTAACGTTTCCAGAA
GAAGACCTTGGTTTTTCCGGAAATATTCCTTCCGTAGCTGATTTTGAACA
TTTTTTTTCCTCCTACGAATGAGAAATATTGTACTAAAGCTCAGAAGTAG
AATGCAGAAGCCACAAGACAACCCAATAATAGTACCTGCAGGCATAAGCT
CTTTAAGTTTCTCTTCTCCCCAATCTAGCCTTCATATTCACAAAAATAAC
AACAATCTTACCTAAAAGAAGTATTTGTTGTTTTTTCATCATACACTGCA
TTTTTGCTGCATCATATTCAGTCTTGTGGGGACAACTAGTACAATAGAAG
CTTCCTTCGGTATTATGGCAGATCCCTTGACAAATGTTTGGTTCACGACA
TTCATCAACATCTGCAATTAGCAAGATGTAGGTAAGGCATGTCAACAAAA
TGTATAACATGGAAGAAATTAATATGTCCAATTAAATGAAATATACAATA
AATTTTCACTGTCTAATAATATGTCCATTTTTTATTTTAAAATGACATGT
GCCTAATAGTATATTTGTACAACTTTTTCTTACTGAACAAGAAATAGCTA
CTAGTTTCATTCTTTTCGAATGGTACAGTATAAGTTAAGGTAGCTTGTAA
CTTGGTAGTATCTCAAGCAAAGTTTCAACATCAAGTTATGCATGGGGACA
AGGGTGCAACATGCTCAAATATTCACTTACTAACGATATGGGTAATATTT
TGAACTAACAACTTTTCTAACAAAGCAAAGCTAAGTTACATCTCACAGTC
AGAAATAAATTCATTTAATCTTCCACCAGCCAATCACATAGTCTTAACAA
CGGAATTGTGTTATAAAACCTAAACAAATTATGAAAGTATTTTCCAATAC
TTTATCCTCAAAATTGTTTCCCAAGAATTACCTACTCTTATTGCTTTAAC
TTGTCTGGTCAAAACTATCATCAAAATATCACTGGTAAAAGTTCAAACAG
TTTGAACACACACACACATCCTAGGACAACTTGCTTTTGACCTGATAGGG
TAACATCTTGGTTATCCCGTTATGTAATATAAATGAAATGGTATGTATAC
ATGCTTTCCTGATATTGATTAAAGACAGTTTTTCCTCCTAAATAGCACTT
GATGTTGTTAGCCTTCATATTTCCAGTATTACAAATACTTGAAGAATAAA
AAACATGAAACTTAATGAGTGACCCAACTGTAAAAATGCGGTTTAACTTT
TTCGAAAAGATCTTTTAAAAAGGTCACGAAGTGTTGCGCTCTTCACAAGT
TACTACTCAACAGGCAGTATGTCCAGGCTGAACTTTAAGAAGACTTTCTG
GAAGACAAAGGCTGCAATTCTATGGAGATATCTTTCTACTTTTTTTTATC
ATACTCCTATGAAAATAAGTGAAAGATCCATGGATATTATCTGCAATACA
AAGAAATAGATTGTCTACCTCTATTTGATTGCCCATAACATGAGTAAAGT
TGACAGGGCCCTGAACTTGTAACTAGTAGATATTAATTAAGTGCCCAGGA
TTTGCAGATTATAGTTAGCTTAAACTAGAAGCATTAGCAAATTACACATA
AAACAGTGATGTACAATTGTGCATGCATAGTTAGCTAAAATTGGTGACAT
GTTAGTTGAATATATGAGTTAAATCAATACCAATCATTTATTAGGTGGAC
AGCCAATTCAGCCATTTTGGGTCACAGAATAACCAATATCATTGTACATA
CCATCGTTTCAATGTAACCTCTGAATTTTAGCTATGTTTACAGTGGAACT
GA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.