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GrainGenes Sequence Report: AA012410

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Sequence
AA012410
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012410
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGCGGAGCCGGGCAGGTGGTGGTAGCGGGCGGCTGCTACGTGCGGG
GTCTCGCGCCGCCAGCAAGCGAGGTTTCTCCCTCATCTGACTGTCTCTGA
TCGATTCAGTAGGCCGTTTGGAACCCCTCCCCGAGCTAAATCAAGAGGCC
TCACCGGTAGAGACTGAAAACAATAACCGACTATCATTTCTAGTACTACT
GTATACCTAATTACCCTGCTGGCTAGGAAGAGTAATTATTGTACCTCTGG
ACAATAAATAATGCTCTGTACCTTCCAATTATTTGCTCTTACATTAGGAT
TTTTTGGGGTGCAATTTTGAGGCTATGTTTATGTTCTTTGCATATGTCTT
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CCTTTTCCAACTGATAATGCTAGCTACTGAGTACTATTCATATACTAGAT
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ATTATACTTGACTACTGAATTTAGTTCATACTATTCTTGGAAGTGCTTTG
ACATGTTGTACTGGCTAATCCTTGAGTGCATCTGCTCTATTTTACAAAAC
TTATTGAAGACCATCATGCATCAAATTTAAGGAAATATCTTATGACAATG
GACCCCACATGCCTCTGTTAAATGACATACTACAACTACTCTACTTTTCT
TATAGCACTAAAAAAATATCGCAGCATACTGTGTTTGTTATTTTCACATT
AATATCCATACTTGTCTCATTTTTGTACTGTTGTTTTATAAAGCCAGAAC
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TTAAGTTTGTGCCAAATAGGGAATACCGGCAGAGTGATTTCCTGAAATTT
TCACTGCTTCCTGATCCGGAAGATGACCATCAGACGAAGGAATGGGAAAG
GTTTTTGTGTTACCTTTGTTCAAGTGGGAAGGTAAATTTTGTTTCCCCTC
TAACGATGTTTAGTTATTTACTCATAAATAACTATGGGGATACAACATAT
GCAACATCTTCAATCTTTAAATCACCCTTCTAAGAAAAGAAGGGTGAGGA
TTGGGCAACCGCCAAGTTAATGTCCTCTGATATTTTGTTCGTAGGGTATG
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TCGTAGTTGCCAATTAACTAAAGTTAACTCCGGGTAGGGTTTCTGTTCCT
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GTATTGTTAAATTCAGGTCTGGCACCTTCTACATTCTTGCTCCTAAACCT
CGTTCCTTCTCTCATGTGGTGATCTTGTATGAGACTGGACTAAAAGAGCC
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ATTTCAGCTGGCTTCTGTATTATCCCCTTGTTTAGAGTGGGAAGGTCATT
GACTAATGAAAACATCTCTAAACTAGCAGTTTATTTATGTTGGCGACATC
AAGTCGTCTCCTAAGAGTCACACTGTTTTTATTTTTACTTTCTTCATCTG
TATCATTCCTTGTGCATGTTGTTGAGGAAGTTCTATCCACAGTTAAAAAT
GAAGCCATGCTTGCCATTAGATTTTTGTGGTACAAATTATTTTTTACGCC
TATCTGCTGTGCCATCAGGACGATCCAACAGAAATGAGGAGATTTGTGAT
AACAAACCACATCCTAATCTAGCAGTGACCAAGAGAGAATCTACTCCTAC
AAGAAATTTTGTCAGCACAGACCCTAATTATATACAAACGCTTAGTCAGA
CACATGCTGGATGGATATTTGGAGCAATTGCAGAGCTCATTGATAACTCC
AGAGATGCCGGTGCATCCAGGTACGTCCATGCCTTCAGTAAAAGAGATTG
GTCGTTTATTATTTACATCATTTTTGGGAGTAGTTAGGTGCCATGTGATC
TGTGTGCTGCATTTTGTAATCTTGGTTAAGAGATAATCTAGTAATTTAGT
AATCAGACTTTACGATATTATCTCTAAGAAAGAGCCAGATTTTTTTATTC
CGTAATATTTCGAAGCTGTAAATAAAAGGGTAGATTAAAATGCTCACTTC
GTGAGAAGCTAAGCATTATTTTAACATTTTGCTTCTTTTCCTTGTGAATA
TGTAAATTGTATTCTGCTTCTAGTGGTATAGGGTTGTTAGGGATTTTTCC
TGTTTGTACTTTTCACGACCTGTAGTGATTCTCCTAAACAATTCCTCGCT
GAGGCTAGTGTCTTCGAGATGTTTTGAAGATTATCCAGATTTCGTGCCGT
TTATTTGCACTAACTGATCCGTTCTTTTTTATCTAAGGTTGGATATTTCC
ATCCAATATATGTTTTCAAAGCAAGCAGGCGGAAAAGTTCCAGTCTTATG
TGTAGTTGATAATGGGCATGGAATGACTTATGCTGAAATGATGAGAATGG
TCTCATTTGGTCACAAAAGACCAGATGAACACAGCAAGGATCAGATTGGG
ACGTTTGGAATTGGATTCAAGGTAAATATCTGTCATTAAAAATTGTTGAA
TATTTTCATTCCTATGTTGTCCTCAGTTCCTGATCATTGCTGTGATCCAT
GTTATGAATGAGCTTTTAAGTGTTTTGATCATTTACATCCATCATATGTT
GGCTTGCTCTTATTTGTCCGATTTGTTTGACATGTGTGACTGAAACCTGC
ATGAATGAGAAACATATAGCTTGTATTTAGTATTTACCTTAGCCTACAGT
TCAGTTCACTAATTAGATGTGTAAATGAAGACAACACAGAAGAATTCCAC
CGCATGGCTACACAAGGCAGGAAACAGTGTGTTATTCAATATACTTGCAA
ACATCTTAATGTTACAGTTGTTTATTAGTATCATGTGCTATGTTTTCATG
TACAATGCATATGCCATGCTCCCGTCGCTTTACCCTCAATCATTTTTGTC
CTGCAAGCAAGTATGACTATTTATTAGGAATTTATATTGTTAATTCCGCA
AATAATAAGAAGTTGTGTTGTTTTGTAGACCGGTGCTATGAAACTTGGGA
GAGATGCAGTTGTGCTTACCCAAACTTCAAATTCCAGATCAGTTTCCTTT
CTATCCCAGTCTTTTAATAAAAATAAAGATGTAAGGATGGTTCTACTTAC
ATCTTCATTATTTGTCTATTGACTATCTTAAGGGTATAATAGTATGATTT
TCTACAGATACTTGAGATTCCTGTAGTGACATATTGCAAGAAAGGGCAAT
ACATGCAATTTGACTTGAATATGCAGTCTGAAGTTACTGCAGAGTATAAC
TTGAATGCTATCAAGGAATTTTCCCCATTTAATGAGTATGTCATTGGAGA
AAAGGTCGCTTTATTTGGTGAAGAAGGCACTGGCACACAGGTTTATATAT
GGAATTTGGATACATGGGGTACAGGTTACACCTTGGAGTGGGATTCAGAG
AAGACTGATGAAAATTCTGCTGGCCATGGTAACGGAGACATATTAATCCG
TTCAAAAAGAGTCCGATCCCGTCCAGGACAAACAACTGGCAATGTATGTA
ACTTCTCATCAACATGTTTTTCATTATTTTCTTCTGTTTTTGAAACAAAA
GAGAACCTCTCAGTTCACTGTAGAAGCCAGAATTTTGTTGAATAATGCTA
TACTTCTGCACACTATCCTTAAAGTTATATTTGGGAGCTTTGATGAGCGT
TCAACTTCCATTGACATACCGTTCACAATATTGTCCATTGTTTTTCAATG
TGTTAGTGGAAATAGTTCTTAATTAATTATTTTAATTTCGATCTCTAACA
GTGATTTATTTCCATATTATGTAAGGTACCATTGGATTATTCACTGAAAG
CATACTTAGAAGTTATGTTTATGAATCCTCAGATGAAAATCACTGTCCAA
GGGTCTCAGGTAAATACTTGTACGCCTTTTTGTTTGTGTTGTAATATATT
TTATTTATGCTTTCATCTTTCTGCTTTTTTTTCTAGGTCATAATCTGTCA
TTTGGAAAAGACTCTTCACAATACTTCGGTTTTGTCTGGGGAAATAATGG
GAAAAACCATTCAGTTGACTCTGGGAAGGAGTGATGTAGAATGGGGCCGA
ATGAACTGTGGAATTTTCTTGTATTGGCATGGTCGTCTTATAGAGGTAAG
ACTAGTTGTTCTATTAAATCACACAATCTTGTTCATTTTCATGTTGCTAT
GTTCCGTACATGGTCGTTCCTGTTAGATTATATTTACTTGCATATCAAGT
TAGGGTTTAGGCCGGTGCGTTGCACCTCCTCTCCCCCCTCTCCTATATAA
ACCATTGTATTCTCTCATTGTAATATTATCAATTATTATTATTATCACAA
ATTTACATGGTATCAGATTAAGATTAGATTCTAGGGCATGGCTCCCACGC
TTCCCACCCCGCCGCCGCCGCCCCCTCCGGGGTTCTTCGAGTGGCGTGCC
GCCATGGCCGCCGTCGCGGCTGCCAAACCATCCACCTCATCCGCCCACCT
CCTATCGCCACCACCATCAACTTCACCGATACAATCTCCGACGTTACTCC
ATTGATTCCCAGCACTTTAGATCTCCCCAAACACAACTACTACCATTGGA
GGCATCTTTTTGAGGTGCACTTGGGCCGCTGCAACCTCCTGGCGCACGTC
GACCCCAACATCCCGCCGTCTCCCTCGGATCCCCGCTGGGTCAAGGATGA
TCTCGCTGTGATACAGTGGATCTACCAGCGGGTGAGCACCGAGATTTTCA
ATCTCGTTTTCAGGGCTGCCACCAGCGCCGCCGCCCTTTGGGCAGCCCTT
CGTCAGCTTTTTCAGGACAACGCCGACGCCCGTGTCAACACGCTCAACAC
GGAGCTTAGGAACACCGCCCAGGGCGACTTGCCCGTGGGGGTATACTGCC
AGCGCCTCCAGACCATCGCCGATGAACTCCGTGATCCCGGTGAGGAAAAA
CAGCTCATCAAGATCCTCCTCGTCGGCCTCAATCAGCGCTTCGACAAGCA
GCAGTCCTTCATCCCCATGATACGGCCGTCTCCTTCCTTTGCAGAAGTCC
GCTCCATGCTCTCCTAGGCGGACCGCGCCATGACCACTCAAGAGTCTCGC
CCTCAGGCCTATGCTGCTGCTCCACGGCCTCCTGCACCGCCACCGCCTCC
GGCGCCGCTTGCGCCTCTTCCACCGCCAGGTTGGCGCCCTAGCCCCAACT
ATAGGGGCACCCGGCCTATCTATCGGCCGCCTGCACCACGGCCTCCTCCA
ACAGCACCGGCTCCTCCACCTGCCCCGGCACCACCACCGGCTCCACCTGC
AGCACCAGCTTGGCGATCTTCTCAGGACCCTTGGACTGGCATGGTTCAGG
CTTGGCCAATGCCTTGGACCGCTCTCTCTCCTGTTAGCACGCCACCTACC
TACACTGGTCTGTGGCAGCCCGACGTGCATCCTCATGCAGGCTCACCTGG
CCTCCTTGCACCACGGGTCCCTGCACAAGCTCATTACGCCGCTCCTTCAC
CGCCCATGTATGGTGCACCATCGCCGGCTCCCTATGCCTCGCCGATGCAC
TCGTCAATGCCCCTTGCTATGGGTCCTTCTGGCCCTTCGGCACCGGTCAC
TTATAATCCTGGAGGCTACTACTCGCCATACACCATGTACTCGACTCCTG
CTGCACCGCCACCACCTGCGCCAGCCCCTGCTCCGTCAACTGCACAGACT
CCCTCTACTCCGAGCTGGGACCAAGCTGCGTTTCTACAGGCCATGAATAA
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CTTCTAGTCACATGTCTTCATCGAATACTATGCTGTCAACTTGCATACCA
TCTCATTTTTCATCCATTACATTAGGCGATGGTTCCTCCATACCAATTTC
ATGTGTCGGTCATACAAACCTTGCATCTTCCACTTCCAAACCACTCCTAC
TTAAAGATGTCTTAGTTGCACCAGCCCTCATTAAAAATTTAATCTCTGTT
CGTCGTTTCACCAAAGACAACTATGTTTCCGTCGAATTTGACCCTTTTGG
CTTGTCTGTAAAGGATTTCATGACCAAGGCGGAGATCGCTCGCTTCGATA
GCTCTGGCGACCTCTACTCTGTTCATGGCGCTCCTGCGGCCTCGTCTCCA
TCATCCATGCTCGCCTCCGTAGATCTATGGCATAAACGCTTAGGCCATCC
GAATAAAGCCACGTTATCCTCTCTACTTAGTGATTTTTCGATCCCTTGTA
ATAAAGAGGTTCATAATTTCTTTGTTTGTGAGTTTTGTCAACAAGGAAAA
CATGTTCGTTTACCATTTGCGCATTCTACTTCTCATAGTACTTATCCCTT
TGAACTTTTGCACTGTGATCTATGGACCTCTCCAACTGTGAGTCTCTCCG
GTTTCAAATACTACTTAGTTATTTTAGATGATTTTACACACTTTGTTTGG
ACTTTTCCACTTGGCAAAAAATCTGATGTCCACTCACTTTTTATCAACTT
TAAAACCTATGTCAACACACACTTCTTTTTACCCATAAAATTTATCCAAT
GTGACAACGGAAAAGAATTTAACAACTTTGCAAACCGTAATTTCTTTCTT
CAACATGGCATTCTCCTTCATTTCTCTTGCCCTTACACTTCCCCACAAAA
TGGCAAGGCTGAGCGCTCACTCCGCACCATCAATGACATAGTTCGCACAC
TCCTCATTCAATCATCTATGCCCTCCACGTTTTGGGCTGAAGCTCTTAGA
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GCGTTTTTGGTTGCCTTTGCTTTCCAATGTCTATGCAACTTCCCCAAACA
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TAGGCATGTCACTTTCAATGAAAACACCTTTCCTTTCGCCACTAGAATCC
CTACATCTCCTCCCACCACATCCACCCCTCGCCCAGCCAATTCCATAAAA
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CTAACCCTGCCCCGGCCGACTCGGCTGCCCCGACAGCCCCATCAGCACCC
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GCAACTTGTTCCCCGACCTCCTAATGCAAATGTTGTTTCTGGAAAGTGGG
TGTTCCGTCAAAAATTTCATTCTGATGGCACTCTCTCTCTCGGTATAAAG
CGCGTTGGGTTTGTCGTGGGTTCTCTCAACAACACGGTGTCGATTACGAC
GAAACTTTCTCTCCAGTAGTTAAACCTGGCACCATCCGAACCATTCTTAG
TCTTGCTGTTTCCTCTTCCTGGCCCATTCATCAACTCGATGTAAAAAATG
CTTTCCTCCATGGTTCCTTAAACGAAGTCGTCTATTCTCAACAACCTTCC
GGTTTCGAAGATTCTTCTTTTCCTGATCACGTTTGCCTTCTCCAAAAATC
TCTCTATGGTCTCAAACAAGCACCCTGAGCCTGGTTTCAACGTTTTTCTA
CCTTTATTCAAACTATAGGATTCATTCCCTCTCGTTCTGACTACTCTCTT
TTGTTTACCACTCTAACACCCAGGTTGCATATCTCCTACTTTATGTTGAT
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TGCTCGATTCAGATGCAGATATATTTCTTTCATTGATTACAAATGAGCAT
GTAAAACTGTTGCAGCAAGTTATTTGCAAACGCATCCCTAACTCTTTCTC
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GGAATAAAATTCTTTGTTTGTTTTGCAGGATGATGAAAATGGTAATACAT
GGGTTCTTAACAGTAAACAAGGGTTTCAAGATTGTGAGATATATGCCAAA
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TGACCGTCTTAATTTGGTATGTATGTATGATTTAGTTAATATTGAAAAGC
ATCGTATATATCTGGTCATGAAGTACTTCAAGAAATATCTTTAAGCGCTA
TACAACATAGGTTGGTAGCATACTACTTCAATCATACTTTTATTTAGAAA
AAATACTCTCTGTTATCATGAATTCATTTGACAAGTGTGAAAAACAAAAT
GTTAGCCAAACTGATGAGTAGGAAGAGCAACATAGTACATGAGTTACCCA
TTCATAGTATTTCACACCATCGTGATATGTAGATAATACAATTGTTTTTA
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ACATCGCCACATGTATGCAATCATGCTATCACGGGTTTAACATGGGCTGT
AATGGGTGTTGCTCTTCAATCCTTGTTTCTACTTAGTAGTCAGGAGCATG
GTATTCACTGTGCTCATTAATTGTTGAGATTCTTCCATGTTGTTCTAAAG
TTTGATATTTACGCATTTCAGAAGTATTCATTGTACTTAACTATCTTTCA
AGCAGAGAAAAAGTGGTGATCGCCTCGAGGCTGTTGATGACTGGGTTCAG
TGCTATAGCTGTCGTAAATGGAGAATGCTGAACGCCGGCTTCAATATAGA
GTCTCTACCGTCTGAATGGTTTGTATGCAATCAAGCTCACTTTTATCATA
AAGATGTACACTGTTGATGAAATGCGATGATTTTATCATTTTAATAATTG
TGTTTAGGGATCCCCCAATTTACTTGGCAAAATTTAAAGTTTTCAACTAG
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CCCAGCCTGAGAAAGGGTAACAGACCAAAACTGAAAGTTGCTGTGACCAA
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CAAACCACTTGCAAAATCTCACTGCTTACCTTACAAGTTTACTGTGCTAG
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TTGAGCTTACTGGATGGATGTTTTCATGTTACCTATTTTCATCTAAATAA
TATTTTGCACCGTTAAATCTATTCACTGATCAGTCAAGTTAATTTCGAAG
TAGCCCTGTATCACCAGAGGTATAGCGCTTCCAGCAGGAGCATCAGTAAA
TTTATTTTAAGTAGACAACAGAATTTGAATATCTTTTTGACAGTTCTGAA
GTGTTCACGTTGTGAAATTTCAGGTTTTGCCACTTGCCACCTTTCAATGG
GAGATGTGAGATTCCAGAGGAGCAGATGGAAGTTGGTGTTATCACTGTTG
CCGAGAAGAGATCTGGACACAATAAGGCAGCCCAGCCGGAGGTTCAGAGA
TCTAGGCAAGATGAAGATGCGAAGGTAACCAGAAACCCAAAGCTTATGTG
TAGTATTCATCTTTCCTGCATGTCAAAAGTCACTGAATGTAAAATGGTTA
ATCCTGTCGTGTGCTCAGAATGTCAGGTTAATTCAACCAAATGCCAACAA
GGGAAAGAGAGCTCCAGACGCCACAAGCTCAGGTACGCTGTTGTGTAACA
GAACAGAAGCTCTGGATAGATCTTTCTTACGCGAACTAATGATCTGCGAT
CTGACGGTTCTGAAGACGATTCATCGCGAGCTGTGTCGGGCACCGTTCAT
CCCCCTCTGAAGAGGCCGGCGAGGGGCAGAAGAGTGGTTGTAAGCGACGA
CAGCGAATGAGTGTGCGGTAACTGTCGTGCCTTTTTTTCGTTTCTTTAGT
TTACAACCAAGGAAGATTGCATGTGTCATTTGGCTGCTGAAATCCTTTTC
CTGCTGCAGGGACAGGTGAGGGAGAGCGAAATGGAAGCTGCGGCCCGAGT
GGCTACACTGCTCTGAATCTCCACGTGAGGTTATGAGACTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.