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GrainGenes Sequence Report: AA005704

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Sequence
AA005704
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005704
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCCCGTGTAGCTTGTATGCACCCGACCCAACCGGAAACTACATAATTCC
AAAAAGGACCCTCCGTCGAGGCAACGCCATTACTCCTCCTGTCCAACGCT
AGTCCAAGCTCCCCACGACTCCCCCTGACCGGAGACTCGGAAAGAGAGGG
GCGCGCAGATCGGCGCAGATGGCGGCCGCGGCGACCTCGCTGTTGCTCTT
GGCTGCGATGATGATGCTGGGCGCCGAGGCGGTGTGGCTCGACCTGCCGC
CCACGGGGACCAAGTGCGTCTCCGAGGAGATCCAGCCCAACGTGGTGGTA
GTCGCCGACTACGCCATCATCTTTGAGTCCCAATCGACCTCCCACCCCAC
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TGGTATAATTTTTGTGACATATGATTCATATATTGTTGAACAAATTTATG
GTAAAACTATTTTCTTGAAGTATGTATTTGCCTTATAAACCGGAATGGAG
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TAATTAGTGACAATCAAGGTGATAATGAGCATATCATGTCCATGGGTCAG
TCAGTCATGAAATATATCTTAGAAATGATGATTGTTGAAGATATTATGTT
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GCGCGGAGAAAGGATCAGGGGTATCTCTAAATCTTGATTGGAAGATAGGG
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TTGGCCATCGATACTTAAATACAGCCTAGTCCAAATGCCTTATACTTCAA
TATAATGCATTGTTTTTTTTTCTGAACTATGTATAATACGAAGTTTCTGT
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TCTAGGGTCGCCTGGTTCAGCATCTTGTCGCTGGGCGTGTGCGTTGTGGT
CTCGGTTCTGCAGTTATGGCATCTGCAAGGGTTCTTCCATAAGAAGAAGC
TCATCTGAATTCACTTGTTTGACCATGTACACATGTGTTAACTACCTTAG
CAGAAGGACAGTTTTGTCATATTTATTTGGAAAAGACTCATGTGATGGAC
AAAACAGTTGCTTGATACTCATATACATGCTCTCAAAACAATTAGCAAGC
AACCAGTACTATGTGCAAAAGAAATCTTTTCGTAGCTGCTACTCCTGGCA
TTATTGGGCCTATGTAAAATATATGCTGTGAAAGTTTTATCCTTCTCTCG
GTCATCTGAAGTTTATTGCTGTGAGGTAGATTAAATTGGAACGTTAATTT
GGCAAAATATGTGTCTTTCTTGTCGAGAAACCTGAGTTTGGGCCTTTCTT
GGGTTGGGCTGGGCTGGGCTGGGGCCCTCTGGGCTTGCCTAGAACTGGCC
GTGGTATGTCAGACACTGTGGACGAACTCAATTCAGCGCTGGTCAAACTA
GCAGTCCGAACACTCCGCAGCCACTCGCCACTGACCACAGCGACTTTCAG
CATGCGTCGTCTCAACCACTTCATCCTCGTCGCCGTTCTGCTCGCCGTGG
TGCCGCACCCAGCCCACCCTCTCACCGAGCTCGAGTCCTCCCAAATCCGG
CGCTTCCAGGACTACCTCCGCATCTGCACCGCGCACCCCACCCCGGACTA
CGCCGGCGCCGCCGCCTTCCTCGTCCCCTACGCCGCGTCCCTGGGCCTCG
GCACCGCCACGCTCCACTTCAGCGCCTGCAAGTCAAAGCCCCTCCTCCTC
CTCACCTGGCCAGGCACCGACCCCTCCCTCCCTTCCATCCTCCTCAACTC
GCACATCGACTCCGTTCCCGCGGAGCCCGAGTACTGGATCCATCCTCCCT
ACGCCGCCCACCATGACCCCGCCACCGGCCGCGTCTACGCCCGCGGCGCG
CAGGACGACAAGTGCCTCCCCATCCAGTACCTCGAGGCCATCCGCGGCCT
CCAGGCCGCCGGCTTCGCCCCCACCCGCACCGTCCACATCTCGCTCGTCC
CCGACGAGGAGATCGGCGCCGAGGACGGCCACGAGAAGTTCGTGCAGTCG
GAGGAGTTCCGCGCCCTCAATGTAGGCTTCATGCTCGACGAGGGGCAGGC
GTCGCTGACGGACGAGTATAGGGTTTTCTACGCGGACAGGCTGGTGTGGA
AGCTGATCGTGAAGGCTACCGGGGCTCCAGGGCATGGGTCCAAGATGTTC
GACGGTGCTGCTGTGGAGAATTTGATGGATATCATCGAGACTGTGGCTGG
CTTCAGGGAGGCGCAGTTCGCGAAGGTGAAGGCTGGGAATAGCGGTCCCG
GAGAAGTGGTGTCTGTGAATCCTGTCTACATGAATGCTGGCACGCCCAGC
CCCACGGTATGGATACCGCTACTACTTCTTAGCAATTTAGTTCAGTGCAG
GCTAATGCAATATACTTTGAGATGGTCTGAAAACATCATTTATAGTAGCA
TCTAAATAATCAGCGCAAATTATACCAGCTCTTTCACCGAGTGCATGCCG
ACGAACTTTATAGTCTCCTTCTAAGTTATACTTTTTTTTATCTGCCTTCT
AAATTATACTACTGTCCTTGTAAATTCTATTGCAAATTTTACATCACTTG
ACACAAATTACATGTTAACCCGTTTGGGGTTACTGTTTCCTTTACTGGTA
GTCTTAATGTACAGAGGACATTGTATCAGCATTCAATGCTACAGAGGAAC
AAAATTACATACCTTAGCAATATATGATTTCGAACTTGAGGATTATCTGA
TTTTTTTTATCCTCTTTTAGCACATTAACATGCAAGCAGTGATGCATATA
TTCTATATGAAGTGATATATCGAATTAATCTGTTCAAGAGACTAGCACAA
GTGTACAATGAAGACCATCAATCATGCACTCACTCACTCAGTCAATACTG
TCGGAGATGATTGTGAAACAAAATATGTTTTAGAAAAAATAGTGCATGGA
TGCTAATGTTAAATCCCCACGTGTATACGATGAGGATAACTCTAAGAGGA
AGCCTAAACATCATGACTTCAAGGGAGGGAGGAGTGGTAGAACAATGATT
GTAATGAGACACGATTAGTAGAGAATAGATTAATTCTCTTCACTGATCAG
GCTTGATTCTGCTCATGAAATGTTTGTGAGGTGCTGTTGCATGCACATGA
ACTGTGGGCTATGGGTGTAGCACTGAACAAGTGCACTTTCGCTCAGATTT
TATGGCTAGGAGCATCCAACTGCTTGCATAGACCACACCCTATTCCAAAT
TGCCAAATTAACTGGTCACCCTTGGCCAAGCTGCAAGGTTAAGACCACTT
ATTTTTACCCTTCCAATCCTTCTTTCAAGTATGCTCGCCTAGATCAGAAA
TAAAACTATATATAGCCACTTGTGAGGAATGACTATAAATAATCACAATG
GATTATATCGTTTGGAATCCTATCTTTTTGTGTATAACCTAATGTTTATA
ATATTTTGTGCAGCACCAACATTTCATTACCAAATTGATTTTATTTTTTC
TTCCTGAATTTGTTGAGATTTGCTTCATGAGCAAGGCTATCAAAGCTTTT
GTAGTATGTGAACGGTTGTCCTTCTATTGCAAGATTTTGGGACGGGTTCC
TAGTTCCATATGCAGGAGAAAAGGGTGAGCTAGAAGCAGATGACAACAAT
GCGTAGAATATTTAATTGTTTTGAAGTCCCTTGTTTTTAGTGTAGTTGCA
TATGCAGTCAACACATAAGTAAATAGGTTTTTCTTATCAATGGAAGTTAA
AAGATAATGGAATTTTCTTCAAAACAAGTACTAGCAAAAGGACTCTACTG
AAATATTCTCATTATAATCAAAGAGGTAGGTCATGGCCATCCTCTGCAAG
ATCACCAGGGTACGTGAATCATAAGAGTGCTATTTGATAGCATGTGAGGC
AGGCTTAGTGACATTAGTAGCTAGTCTGGTGGTGATGATTGACGAGCTGG
TAGATGAAACTTATGATATGCACAAGTTAGAAACAATGCAACACTTCAGA
CTAATCTATCCGTGCACAAAGCTTAAAAGCAACCCAAGTTGATTATAAAT
TTTGATGAAAGCACTCCTAAGATACTGTTACAATCAATATGGAGATTGTG
ATAATAATCCCAGAAGGAACAAATGTTTCAAAATGAGAAGGCAAAGGTAG
ATGTAACTCTTTTCTGGACAGTCTATGTTTTGATAGTATTCAAATGTAGT
ACGGAGTATGAGAACATGCCTTGTGTGCATTCACAACCTATAAGATGGCG
GAGGTACAGTTTCAAATCTGCAACGAGAAGCGTGTAGCACCCTAAGCATG
AAAAGAGCAGCTAGCGAAAGCTGATTATGAAATTACATGGAACTTTACTG
GTGTTGCCATGTATTTCAGATAATTGGCTGCTGCAGTCTCTTCTTGTGAT
GTTGCAAGCTTATCTTTGGAGAGTTGAAGCTGTATGTCATCCGTTTATCT
GCCATGGATGCTCGTATGGCCTATTTTTTCTAGCACACTCGAATATCATC
ATCAGATAGACTGCGCAAGGAAGAGTTTGTTGCGCCTTTACCTTTATTTA
GGCGCCTTTGTTCTTTTGGGTGAGTTTCTTCTTCAGTGTCCACAGAAGCT
CTCTCCTTACATACACTAGTATGAAGCACTTCTTTTTTCTGTCTTGTACA
TATCATGAGTTTTGTCCATCAACTGGTTGTCAGACTAGATGCTAGAGCAC
ACATTTAGAAGCTGCACCACTTGCCATTGAAAAGCGCGATCTTACAGTTC
ATTGTACACCAATCATCCTTGCAACTTGATGGCCATGGCTTTATTCCTTT
GATGAACGAGATTATTATCGTTGGACATTTCCATTACTTGTCTGCAATAA
ACTTCCATCTGTTTGAAACTTTTGTTGATGGGATCAACTGAATTATATAA
CTGTGCACTTATCTGCATAATGCAACTACATCAGGAACAACTATAATTGC
AAGTTACTATCAATAGAGAAAGTGAGTTGTTCCCTTTGCAAGCGTGTACA
TGCACTTTCTTGTCGTTTGCATTTTCTTTGTTGCTGTTTCTTAAGTAGAA
TGACTATGGTTCACACTACTGCCAAAGCTTTGATAATTACGTTTATACCT
AAATGATGTGAAGCTCAATCAATTCTTGAAGCCGAAAGTAGAATCATTTT
CATCGTGTAAGTCGGGTTCTTCATAAACTATTAGAATTATTAGACTATAT
ATAGAGAGGTAGGACTCCTTATGAGCTTATTTACCGCGATTATTTCTCAT
CTTGCATGTAGGCAGTAGAATAATCTTATCTGTTTGATCTAGCCCAGCAA
TAGTGGAAAGATGCAGTGAAGCTCTCTTGCACTTGGGTCAATTGTGATTC
GTTAATCCGAGGAGGAATCTATGCACGTGGTAGTTGCTCCTAGCCATCAA
ACCTGAGCAAAAGTTCATTTCCTCAGGAAGCAGCAGCTCACCAACCATTT
TTTAAGCAAAAGTACACTCGGTCAAAGTTCAAACTACCAGTGTTGAGCTC
ACAGCATGCATTAGTAGCTGAAAGAAATATTCTAAGCACTCTGTGAACAG
TTGGACAAGAGTTGAACAGTTAAGTTTGCTATCACTGATGAGGCACTGAA
CCAAATGGCACACTTCTCTTCTCACCCTTTGCAAGTAACCAACAAATATG
AGTTTTCCCCCACTTAAAAGCACTCATCTGAACACCTGTGTTGGCAGCAT
TTGTGCCTTGGCAATTTTATCCCGACACCACACTTTCGTTTCAGTAGTTC
TCAGTATGTTATTGTCTGCATTGAGATAGTAATCGAGTTCCTTCTAGTGT
AGACAATGGCATACGCCAAAAATCAGTAGTGTCATATTCTTTTGCATGTG
ACTTCAGTATGGTCTCTAAAGACTAATTGATGCAGGGCTTTGTGATGAAT
ATGCAACCTTCAGAAGCAGAGGTGGGTTTTGATCTCCGCCTTCCTCCAAC
CGAAGATATTGAGCAGATCATAAGAAGAATCAAAGAAGAATGGGCACCAG
CTCATAAAAACTTGACTTACCAGGTGAATGTAATTTTACTGCTATGTTGA
TAATGTAAAATAAATCACATTCTGCACTGCATCATCTTGTATTACTCGAT
TTTCATAAATTCCTCCGTGTTTGTATTGTACAGCTGATGATGAAAGGACC
AGTGAGGGATGTGGCAGGACGTCCGTTAGTTACACTAACGAATGAGTCAA
ACCCGTGGTGGTCTGTGTTTGAACATGCTATTGCCTCTTCAGGTGGAAAA
CTAGCCAAGCCCGAGATCTTATCTTCAACCACGGACGCCCGATTTGTGAG
GCAGATGGGTGTTCCAGCCCTTGGGTTTTCCCCAATGATAAATACTCCAA
TATTACTTCACGATCATAATGAGGTAATTGGTCTATGCCTGTTATCATAC
TTCTTTTTTATACACAATGTGGTGGCCAAGCTCAGTGCTATCTTGAAATT
GCAGTATCTGGAGGATAAAGTGTTCTTGAGGGGCATCGAAGTCTATCAGC
ATCTTATTAAAGCGCTAAGCTCCTTCAAAGGCTGATTCAAAATATCCAAC
ATGAAGTGCACCTCTGTTGTATTCCCATACCGTGTCAATTGAATGTACTG
TAGTTAAGAGAACCTAGATACACATAACTAGTATAATGCTCCAGCCTACA
GCTGAATCGGTTCGGGCTCAATCACATCAGAATAAACTTGTTTGAAATAA
GGGAAATCTGCTAAAGACCGATGATTATCTCAGCAGATTAATTTGTATAT
AATGTACAGTACATATGGAGTTATGGGATGTAACAACATGATGTAAAGTC
CACAGTTGAATTGATACGGAGTTATTTGGACTCTACTGGTTTCATGCTTG
CTGTTAAAACCGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.