Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA017959

[Submit comment/correction]

Sequence
AA017959
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017959
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGAGACGAAACGCAAAGCACCGAAAGGCTAGTCCCCGTTCCCCAATCC
CGCATAGCATAAGCCCGCCGCCCGCGCCCAGAAGGGGGGAGGGGACGATG
CCGAAGCAATGAAGCAACCCAACGAGATTTTGGCCATGTTGTTGCGCCTC
GTCGCCACGCACTCGCACTCCTCGCCCGCCTATTCCTCCTCTTCCTATTT
AGGCACCGCCTCACGCCCTCCCAACTCCTCTTCCCTCCTCCTCCCCGGCC
CCGCTCCCTTCTCCCACCGCGCCGGTACCAGACAAACTCGAAATCCCCTC
GCCGGCCCGAGCCTTCTCCCTGCAATGCAGACTCTTCACTCCGGGGGCGA
CGCGCGCGAGGCGGCCGCGCTCCTAGAGCGGAGCAACTCCATCGGCCGCC
GCCGCCACTCGTCGCCGGTGCTGTCCGCGGCCCCGAGGCCCCCGGGATGG
GGCGAAGGCCTCAGGAGGCAGTCCTCGTCCTTCCGCGACGACGTAGGCCA
CGCCGCCTCCGAGACGTACCTCGTCACGCGCCTCGCATTCAGCCTGCTCC
AGTACCTCGGGTAATACTACCAATTATTCCTTCATCCCCGCAATACTATA
TTCAGTTTTCATGATGCTCTCGCCCCGTCTCCCATCCCCGAGAATTACCG
GTCCACGGCGCGGTTGGTGACGGTTTGGATGCTCTGGCAGCCCCCCCAAA
ACTCATGTTTCACCACTACTCCGGAAAGTTCTTTGTGGTTGGTTGTTGTT
GAGATGGCTGAGTTGCCAAGGCAGCTTTCAAATCCAACACCAGCCACGGT
TGTGTTGTGATGGACTCTAATTATGTTCCGGGGACCACACCACTGTTTTA
ATGTTCTTGTGTTTCCCTGCCGTGCGGTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTGTTGTTGCGTAACACATCACATTCCTTCAGCAAAAATGAAATACACA
CGGTTTATATATATGTTCCGTGCAAACTGCGATATCCATCTTCGTTCGAT
GATGACTTGCCAAATACTCTTTCATAATACAGAGATTAAAATAAAACAGG
CCAATCATGATGCAGGATTCTGCCCTGTGAAATGCGTTGGCCTCCAAAAC
CGTGTTTCGCATCTTCACTTTAACAATACTAGTACAGCTATTACTGGCTA
GAACAAGCTTTTAAAAATAGTTTACAAGAGTTGCAGCCAGGGGTGGATCT
GGCGAGTACTTTTACTGAAACAGAAATAAGCTCCTAATACACCCACGAGA
GTAGACAGCCACGTCCACTTGGTATACATATAAGTATATAATTTTAGGTA
TTGAAATTTACAGGGAGTATTTTAAGGCATTTGATTCTGAAGTTTGCACG
GCGAACCCATGCAAATTCTCACTCATTGTAGTTTAAAAACTGCATTTATC
TTGCTACGTTAACAACTTGGAATCTGTCGCTCTTTTTGTCACAATGTATA
GACGAATACAACTGCTGTTGACATTTTTCATATCTCTTCTATTCTTTTAC
TGTTCAGGTTAGGTTACCGCTGGATGAGGCAACTTCTTGCCCTCACAGTC
TATGCTATCTTACTTATGCCAGGTTTTTTGCAAGGTAAGTTACAGATAAC
CCGTGTTTTTTTTTTGACAGATAACCCGTAGGGGTTGTGCTACCAGTTTT
TATTATGCACATAAAACAGCATGCAGGTCGATATTCATTGTTATTTCTCA
TATTCATGTGGTCTCCTCGAATGGACCCTTGCATGGTTGGCTCATTTCAT
TAGAATACAGTAGCATCAATATCCTATAGCATTCTGAAAACGGAATCTTT
CCTTGTGGCAGTTGGATACTACTATTTCTATTCAAGTCAGGTTCGTAGAA
GTATTGTTTATGGAGAACAACCAAGAAACAGGTAACATTAACCAGACCCG
CACCACAACCTCCCAAGAGACTTTCCTATGTTTGTTTGGATTTAATGACA
GTTGTTGTACTGTACAGGTTGGATTTGTATATACCCAAAGATATGAGCAG
ACCCTGTCCTGTGATGGCCTTTGTAACTGGTGGGGCCTGGATTATTGGGT
GAGTGCTGATAGTTTTGCAACTAGTAATCCTTTGTGGTAGCTTCCTTTGT
TGACGAGCTTGCTCGAAATTTTCAGTTACAAGGCCTGGGGTGCCCTTCTT
GGCAGGCGGTTAGCAGAGAGAGGAATCATAGTTGCTTGCATTGATTACAG
GTGCTGCTGCTTTTTATCGAATCCACTCCATTTTATTTTATTGATAATAT
GAATTGTTTTACTTCTCATTTGCTTGACACTTTATACATAAATTTATTTT
CAGAAATTTTCCGCAAGGAACAATAAGCGACATGGTTACTGATGCTTCTC
AGGGGATTTCATTTGTGTGTAACAACATTGCTAGTTACGGAGGTGATCCT
AATCAGTAAGATAACCATTCTCATTTTGCAAAGGCTACTATTTAAGTTTC
ATACAGAGCAGTTTTTTTCTTATGTTATGTTTACGTGCCAAAGTAGATGT
GTGATTTAGTTAACCCATGACTGTCAACTAGATAACCACAGACTATTGAT
GAATAACCTGGAGAAGTTGACCTCTTTTGATATGCATGTCACTGAACACT
TTTTCGAACTTCACTTAAAGGTGCTAGATTAACTTTTTTTAAATATTTCC
ATATACTTGTGCGGTAGTGTTGCTGGCATATATTTACATCATTCTGTTTA
TTATCCTTACTGACTTAATGTTTGATAAGATTACTTCCAGAGTTATGTTT
TGTTATATATGGATGGAAATTCAGTTATTATAACTCTGTTTAACCTATTT
GGATTTACAATAAACCTGTAGGATCTACTTGATGGGTCAGTCAGCAGGAG
CACATATTGCAGCATGTGCCCTCATGGAGCAGTCAGTAAAAGAGTCTAAC
GGGGAGCCCATTTCTTGGAGTGTTACACAAATCAAAGCATACTTTGGTTT
ATCTGGAGGGTGAGATCTTCGGTTGCTTGCTTCTTTTAGGGGATCTTCGG
TTACTTGCTGATTAGCTTTTGTGGCATGATTTTTTGACTACGGCTCAAAC
TGAAGATAGTACAAGCATCAGAGTCCTGTAAGCTCTGATGGCGTTTTAGT
GCTTCCCTAGTCTTCTTAAAACCAATAATCAATGGTTACATATCACATTG
TTCACAGAATATTGACTGATTGCTTTGGAAGATATCATCTTCTTCCATAT
TTGGTCAGATAATGGGTAAAATTAGGTTGCTTTCTGTATATTCAAAAAGT
AATTGCAGGGATAGTTTCTATGTTTTGGATTAGAACTAGTTCATACATGT
CCATATGAGAACTAAGATTAAAATAGGATACCAAACCAATCTTAGTCATT
GTATTGCATCCAGATGTCTCATGTTTCTCTTCAAGAATGCATAAGCGAGA
TGCCTTACAAAGATCTTATGAATTACCCCTCGTTGTAGCCTCCCAGGTTT
ATCCTATACGTTATAGTCTCGCTTTCTTCTGCAAATAATCACAATAAAAG
TTTGGCCCGCAATATTGGAATGATGGCACTAACAACTGTCCAAACTGCTT
CACCCAGTTTCCATTTTGATATGTGCAACCATTAATGGTTATCTATGATG
CATTATACACATTATGATTTATCATCTCAACCTCTTGCGACCTGGATTTG
GTCAACTATCAGTGTAATAAGGTGCTTCTAATCTACAAAGGGGATACCAT
CATATCCCTAATATTACGTGGAGTATGATCGATTTGTACTTCAAAGTCTC
TTACAAATATGTTTGGTGATATTTCTTTTTGACTACTAAACCTTGGCCTA
TTTTGTGTTTTCCTTTCCGAGTATGTATACTTGACATTGTTTAGTAAGTA
ACATTAATGCTTTTGCAGATACAACCTCCGTAGTTTGGTCGACCATTTCC
ATCAGCGTGGTCTGAATCGTTCAATATTTCTCAGGTAGTGATATGACTAT
GCTTTAGTCCATTTATTTTATAGAAATCGATACGATTACCAAGCACAATA
TTGAATTACTGTTTCAGCATAATGAATGGAGAGGAATCGTTGTCATATTA
TTCTCCTGAAATTGCCGCCAAGGAGTCTAGTCCCCAGACAATAACTCTAC
TACCTCCTATTTATCTTATGCATGGAACAGATGATTATTCAATACCATCA
TCTGCCAGGTTTGTTCATATGCCTTTTGGAGATATTTATTCAATACAATT
AAGGATAAACCGTACACACCTACCCTTCAAAATTTCTTGATGTTGTGGTA
AAAGGAAATCCTTGTACTGCTGAAGTCCATTTGCACTCTACTAAAACAAA
CTCTCCTTAGCTTTTAATTAAGGCAATGTCTGTTCATCTGGTCTAAATTA
TATAACTTCAGTGAACTGAGAAGACTACAGAAAATATTGCTGTTGTGTTT
CATAAGCAATAAGCAAGCTGGGGTAGGGTAACATACTCTTCTGCAGTTGC
AGTGTCAAACTTTTCTAACTTAAATGTCCTCACATTTCCTTCTCCAGCAT
TAGGCTTTTAGTAGGTAATTCTTCAACATGAAATATACTAAAACCGGAAC
TACACAAAAAGGCTGGAAAGTTGAAAGATACCATTCAAAGCTTTCGATAT
GAAAAATACTAGAACTTTTCATACAACACTCTTCGTTACTCTCCAGATGA
TAGTATATTTGTCCAAATACTGGTAAATTAGGGGATATACTGGCTAGAAC
ACCAAATATGTGGGAATATTCAGCATTAGGTGTCGACTATTTCCCCTGTA
ACCATAGAACTATGGTTTGAGAATTCTTGTTGACTTCGTACTCATCTATA
TTTAGCTGCTTCTAGTGCAAGGTTGATCTATAGTTTGTTGTTTGATTGGA
TTGATATTTTTTTAATTGCTCACTTGTTAAACCAACATAATGTTTCCCAA
TTTCACGATTCAACTTAACTCTGCTTGTTTCATGTGCAGTCAAACTTTTG
TAGACGTCCTTCAACAAGTTGGTGCTCAAGCCAAGTTATTATTGTACGAA
GGGAAAACACATACAGATATATTCTTACAGGTGAAAAATGTGGATTTTGA
CAATGAATGAGTTTTCCATGTAGTGAGAAAAGGGGCATGCAATATTCTTG
GCAACCATTCAAATTCCAAACAAGGACCAAATTTCTGGTCCTGACCAAAC
TATTGGCATCACTGGTTTTAATCACAAACCAAACATACCTTAAATATTTT
TGCCTTTATTTTCTAAAGAGTTCTCTTGTACTGCTGTTGTGATTCAAGGA
TTTTATTGTGAGGCGAACGTGAGTGTTGTAGTATGTCTTGCCATAGCCAA
CGAAATACTGATTGTCTTAATTAGGCCACATGGAGTAGTGATTATTTTAT
GAAAACATTATTTAGAGTTACTAAGGTGTATTTGATAAATTGATGTATCT
GATGTTCCATACAAAGAGCTACTCCTACTGGTTTCTGAACAGTTCCTAAC
TGAAACGTAAGGGTGAGTTCCTTTGCTGCCCTGGGACCGTTAAAGCATTT
AAGGTGAACTAGTATTAACCGATTTTCGGGGATCAGGTTCAAGAAACCTT
GCACCAAATGTTTACCTGTATCAGTTACAGTATGATAATTCATGATCTCT
ACTATTAGTTACTAAAGCCAGATCTTATCATGTCTAAAACCTATAGCCCT
GTGCACTGGTAGCTGCAGAACTTCTGTATAACTTATTCAGTTCTGGGCTT
AAAACATCTTGCCTAATTATGAGCTCTTATAGTTGTTGACTTGTTACTCT
GAGTTTTGTTTTAACTTGTTTATTTAATTTTTTTTTGCAGGATCCTCTTA
GGGGTGGAAGGGATCCTTTGGTTGAAGATGTATTGTCTCTTATTCATACT
GATGATGTAACTTGTCGAAATATAGCTTCCGCGCCTACTCCAAGGCGCCT
GGTTTTTGAGTGGCAATTGCAGTTGGCCCGCTGGATTAGTCCCTTCTAAT
AGGTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.