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GrainGenes Sequence Report: AA015906

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Sequence
AA015906
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA015906
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCTTCCATGCTAGTACAGGACTCGCGTGTCTTGGCAAACGAACCGAAG
AAGCAGGGGGGAGATCCCAGCCCAGGAAGAAACCGGAGATACTACCGAGT
TGTGGTTCCCAGTCTCTTCTTCCTCCCCGATCCCCAATCTCCAGCCTTCC
CAACCAAATTTGATCCTTCTCCTTCGAAGAGGCTCTCGCCTCCTCGTCCG
TTATCGGGTCTCCGGCGGCGGGGACGCGAACGCAAGAGCTCACCTCACGC
GTGGCTGCCGCCCCCGCGTCCTGTCTCTCGCCGCCGTTCGTGACCAAAGC
AGCCTCAAGTCCTCCTTCCACCGAAGCACGCCTGCTCCCTTCGACGCGGA
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GGCGCGATCCATTTTGCTGGTAAGATCACAGCGAGATCTCTCTTCTTCAA
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ATATCAGGGAGTTGGCTGATCTTGACATTGATGGCAAGTACTACTTCTGT
GAAACGAGGGATATTACCAGGCCATTCCCAAGTCGGATGACTCTTCAGGA
ACCGGATGAGGAATTTGTGTGGAATGGGTGGTTATCGAGGCCTTTCAAAG
ACATTGGTTTGCCAGGGCACTGTGTCATTCTTTTGCAGGGTTTTGCTGAG
TGTCGAAGTTTTGGAGGTACGGGCCAGCAAGGTGGGATGGTTGCTCTCCT
TGCACGCCGTAGCCGGTTACATCCTGGAACCCGCTATTTGGCTCGTGGGC
TAAATGCGTGTTCTGGCACCGGCAATGAAGTAGAGTGCGAGCAGCTTGTT
TGGACCCCTCAAAAGGGTGGACAAATAATCCCTTTCAGCTCATACATCTG
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TGTCAGTTGAAGCAGAGATTTATGTTGCTGATGATCCTTATAATGGGACC
TTGCAATACTACCAACGTTTGGGTAGAAGATACGGTAATAAATCATCTGA
AGTCAGTGCGGCGAAGCAGAAGAAACCTGGAATGGTTCCCATTGTGTGTG
TTAACTTGCTAAGATATGCTGAAGGAAAACCTGAGACAATTCTAGTTGAA
CATTTCAAAGAATCTCTGAAGCACATAAAGTCTACTGGTAAGCTTGGAAA
CACCTGGATTCAGTTGATAAATTATGACTGGCATGCCACTGTGAAGTCAA
AAGGGCAACAGCAGACAGTCGAGGGCCTCTGGAGACATCTTAAAGCACCA
ACAATGGCCATTGGCTTCAGTGAAGGGAATTACTATAGTGTAAAGCAGCA
GCTTAAGGAATGCAAAGGATCCATTATCTGCAATGATGATGGTGGGTTCT
GCATGGAATCGATTCAAAATGGGGTGGTACGTTTTAATTGTGCAGACTCT
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GATTGTCCGCAAGCAGATATTCTGAACATAATGGTCGCAATGCTCGTTCT
TTGCCCCTTGGATGGGAGGAACGCTTTGATTCTGTAACTGGTAAATCATT
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AAGAGCTCAACAATGCTTACCCCAGTGAACCACCTTGCGGAGATTTTTCT
TCTGGCTGGTGATATCCATGCCACGTTGTACACTGGCTCAAAAGCTATGC
ACAGCGAGATTCTGAACATATTCAAGGAGGAGACTGGAAAGTTCGGTAAA
TTCTCAGCTGCTCAGAATGTCAAGATTACACTGCAAAGAAGGTTCCACAA
TTATCTGAACGATAGTTCCCGTCAAAAACAGTTTGAGATGTTTCTTGGAT
TGAGGCTATATAAGCATCTCCCATCCATCCCTATTTTTCCTCTCAAAGTA
GGTGAATTTGTTCATTATCTTACAAAGTAATCTTTATTTCAGTTTTATAG
GATAGCTGAATAGTCAATTCTCTGCATGAACTATGCAAACATTCTAGTCT
AACTTAACTAGAATGCATTATCACAATTAGAATGGAACCAATTTTATAAT
TAAAATATAGATTTTCCAGTTTAGTTTAACTTTAATATCTCTGGACCGTT
GTTCGGGAAAATTTCCGTTCACTGTAATTATCACATTTAGCGACATGCCA
ACTGTTAATTTGTTTCTACATCTCAATTTCACTACTGACCAGCGGTGCAT
TTCCCTTCAATGGGCCCTACTCGTTCTTGGTTCCTTTTATGCATTCCATA
CCCGAGGGAAAAAATAAAGATGCGTCCTGAATGGGAGAAACTAACTGTAT
ATTGGGACAGAGGGAGGAAAGTGCCTCCACTAGCCTTTTATATTATCTGT
GGATTTATGAGATTGTATGTTCCTGTTGAACATTATTTTGACCTGAAAAA
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TCACTGGTACAAAATATAACTCAGAATCGAAGACAGCATAATTCTTTGAA
AAAGATCATACGTACTTGTATTATTATTTAGAGCATAACTCCATCTACAT
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TTCCCCACATTATGTACAACAACAACAACAACAATAACAACAACAACAAC
AACATCAAAGCCTTTTTCCCAAGAAAGTTGGGGTAGGCTAGATGTGAAAC
CCAAAAGAAACATAAGGAAGCCAAAAAGAGGAGAGAAAAAGTAAACAAAG
AACGAGTAAACTAAGATTCTTTCACATGGATTGCTGGTTTCCATACAGTC
CTATCAAGTGTCGAATCTCTAGGAGCATTCAAATCCCTCAAGTCTCTTTT
TACCGCATCCGTCCATGTCAACTTTGGCCGCCCTCTGCCCCTCCTAGTAT
TTCCCATACCCTTTAGAATACCGCTATTAACTGGTGCTTCTGGAGGCCTC
TGCTGGATATGCCCAAACCACCTTAGTCGGTGTTGGACTAGCTTCTCGTC
GATCCGTGCCACCCTTACCCTATCACGTATTATCTCGTTCCTAATTCGGT
CCTTTCTTGTATGGCCACACATCCACTGTAGCATCTCCACAACACTCATT
TGTTGGATTTGTTGTCTTCTAGTGGGCCAACATTCTGCTCCATATAGCAT
CACAGGTCTGATTACCGTCCTATAAAACTTACCTTATATCTTTTGTGGGA
CCTTATTGTCACATAGGATGCCGGATGCTTGCCGCCACTTCATCCATCCT
ACCTTGATCCTGTGGCAAACATCCTCGTCGATATCGCCGTTTTTTTGTAG
CATTGATCCAAAGTATCGGAAGGTGTCCCTCTTAGGCACTATTTGTTCTT
CTACACTAACCTCTCTATCTTCGCACCCAACACCACTAAAGTCACATCTC
ATATACTCGGTCTTGGTCTTACTAAGTCTAAAACCCTTATGTACTTGTAG
TTTTTTCTATCTGGGAGCATGAGCAGTCTATATTTTGGTCAGGCATACCT
AAGATGGTCTGATCCCATGTATATCCTTGGTAAAAACTCCACAAAGTTTG
TATTGGTTCCATCTGACACGTGCTCCAACTTTTTTCCAACCTCTGGAGTC
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ACAGCCAGTACCATATACAAAAGATTTCCTTAGGACATCCCCTTGAAACG
ACATCACAGATGCTGTGAGCGCAGTTCATATTCATGGCTTCATGCCATTA
CTTTGTATGTGTCTAAGGGATCTATTGGTACCAATGAATATATATGCGAC
AATTTATATGCATAGGCTTAATACATGCTGTTACTGTTTCTAATTTAGAT
TTTCATCTTTGTGTTGAAAATTCAGGTGCTATCAAGGCCACCTGGATGCA
TGTTGAAACCAGTCCCTAGTATAATCCCAATGGCTGATGGTGGTTCCAGT
CTTCTCAGCTTCAAGAAGAAGGATCTTATTTGGGTATATTGCTTTGATGT
TGAGCTAATTCCTGATAGTGACCTGATCTATTTGAATTAGGCGGTAGCTA
TTGTACATTAAATATTTTGTCCCTAACATACCCCACCACTCCCGCTTGGA
AGACGATTAGTTGATGACTTGATGGCTGGAAGAGTCTAAATGATGTAGAA
TGCACTTACTCTTACATCTCAATGCTTACCGTATATCATGTTAAGATACT
TTACTCATGCAGGTATGCCAGCAAGGTGCAGACTATGTTGAGCTTTTTAT
ATACCTTGGAGAACCTTGTCAAGTTTCCCAGCTTCTTCTTACTGTCTCCC
ATGGTGTTGAAGATTCTTCATATCCAGCTATTGTAGATGTCAGAGTTGGT
TCCAGCATAGATGCCCTTAAGCTTGTTCTTGAGGTTTGTCTTCATCTTAC
TGTTGTACTCTTATGATTTTTTACGCCTGGTGTATTCATCAATTTTTCTT
TTAATAACAAGTTGGCTTATTATAGGATTAGGCTTGATGGACTGACATGT
GTAAGTTAATGTCAAGACTAGATCACTAGAAACACATTAAAACTACAGTC
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GAATGGTTGTCATTACAATTTTTGTATTTTCCTTGCTTACTGTGACAATT
TCAGTATGCACCCAGCTGCTTTCAATTTGATATTTATTTTTGTATGAATT
CCAGTTAAAGCCTGGATGCATTGAACTATTCTTAATGCTTTACTATCTTA
ATCTGGGTATGTCGGTCGGCTTATTTGCTGCATGCTAGTTCTTTAATTGC
AAGTTGCCTCTCTTAATGAAATAAGTACATTTGTTCCTTGCTTCCTTTCA
TCTTTTACAAGTCTTGTAGCAAGCTAATGTATAACTTACTGCGAGTTTAC
TTGTTTAGGGCGCTTGCATTCCACAGTGCTCGAATGGGACAAATTTGTTG
ATCCCTCTCACTGGAAGAATTGATCCAGAGGACTTGGCTGTTACAGGTAA
AAGTGCTCGACCGGACGTTCAAGAGAGTACTTATCTTCCTTTGTTATACG
ACTTTGAAGAGCTGGAAGGAGAAGTCAACTTTTTAGATCGGGTTGTCGCA
TTATCTTTTCATCCGTCTGCCATGTCGAGAACACCCATCACGCTTGGTGA
GGTAAAAGGTCGACACGATCATTGGGTTGTAGATGTTTAATGTTTTAACA
AGAAGCTTTTAACAATTTGAAATATTTCCTCTGTGTACATTTTCTTTGAC
TAGATGAGTAATGTTTTGAAACAGATTGAAGTACTTGGTGTTTCTCTTCC
ATGGGAGGATATGTTAACCAATAGCAAATGTGTTGCTCAAACTTTGGAGC
TCATCCATGAAAAACCATATGCTCTAGGTTTGAAGGATGTTGCAAAAATT
TCCTCTCCTGAGAGTGATGTTCATGGTAGTGAGAGGATTTATGATAGAAG
TTCACCATCAGTTCAATCAGGTGGTTCTGGAAACTTTGTGGATTTTCTCA
CTGGTGATATTGTCATATCGAACCAATCAAAAGTCACTGTAAATACATCA
TTTGGCAATGAGGAACGGGTAAACTTCTTTGATGATGAATTTGATGTTAA
CCCTTTTGCCAGTGCATCAGAAGAGCCTGTTGTTGAAGTGAATAACCAGG
TTGAAGATCGTGGCAGCACACAGTTTTATCTCGAGTTTTTGGAATTACTT
TCTGGAAATAATAAGGTATTTGTTGGTGCAAATTCATTTCCATTCTCTTC
CTATCTAGTTCATTGATAGGTTTTCCTTAAATCTGTTGAGCTAATTTTAT
TTGCAAGTGATATCTGAAATTGGTGTTTTCATGCTTTAATTTTTGGAAGG
TTTGAAACCAAGAAAAGACCCTACCAACTTATGACTAGAGCTTATTACTA
GATACAGTATATATTGTGCTTGACACTGCTTAGTGCTTACAATGATCCTG
TTCTCAAAATTGCCTATTTCGCAACAAGAAAGTGAAAATGTTGTTTTTAC
CAAATGTGTTATGCTTGGTTTCCACATGTTTCTGTTGGGTTTCATATCTA
TTATCTAGCCTACCCCAACTTGCTTGGGAAAAAGGTTTTGATGTTCTTGC
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CTTTTCAGGGAAAGACCCTTAACTTTGAACAGATGATGAAGCTTGAAATA
AAACGTCTTTATCTTGATCTTTCTGCTGCTCAAAGGGACCGTGCATTGTT
ATCGGTTGGCGTAATTCCTGCCACAGTAGATCCAAATCGTTCAGTTGATT
ACTCTTACCTATTGAAGTTATCCAGCTTTGCTGATAGGCTAGCATTGCTG
GGGCATGCTGTCTTCGAGGATCGTGCTAATGCTTCGATTGGTCTCGAAAA
AGTCAATGGCCATGCTATAGACTTCTGGAATATCAGTGAAAATGGTGAAT
CATGTTCTGGTGGGGCATGTGAAGTCTGTGCTGTATCTTCGTTAAAAGCT
TCAGCTACTAGTGGAAATGCATCTCTATTTGTGGAGTGTTCCCAGTGTGA
AAGGACAGCTTGCAAGGCTTGCTGTGCTGGGAAAGGGGCCTTTCTTTTGC
TTAGCAATACTTACAGAGATCTGAAGATGTATGGTGGGAGTCAAGGTGGT
GGCTATTCAGCCCTCGCAGATAGTTCTGTGTGCAAATCATGCTGCAGTGA
GGTGATCAAACATGCACTCTATGTGGATTATATCAGAGTTCTTCATAGTT
TGCGAAGAAAAGGTCGTGCAGAGAAAGCAGCGCTGAGAGCGGTGAACCAG
GTCTGCCAACTTGAGCCCAGTAGAATATCTGATTCAGTACATAGTATTCA
ATCTGGTCAGGAACAATTGAAGAAGCTCCTCGATGATGAAGAATCTCTTG
CAGAATTTCCACATGCAAGCTTTTTACATATGGTACTCCTCGACATTGTA
CTAATTTATGATTAACTTCTACCCTTTATGAGCTGCTGCCACACTGTTGC
ACATGGACCATGGAAAGACACTCAAATGCACTAGACTTGAGCCTAACATA
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GGGCAGCACATCTGTGGAGTTCCCGATTGTTCTTAGCGGTTTATCAGATG
TTTCTGGAGTTGCAGTAATTGTCAGTTCCTGTGGTTACTCATCATCTGAC
TGCCCAATTGTAAGATGTCCTAATTTGTGGTCTTTCTTTTTCATGGGATG
CTTCATTTATGTACATAAGTGTACAAACTAAGCTAGTGAGAAATTTTTTC
ACTTTATGTATGGGAACTCCTAGGCTCCTAGCTATATTCAGTTTTCTTGA
TAAACTTAGTAAACAGGACGTTTTAATATAAGTCATTGAAATCATTGATG
TATTTTATTGAAGATTTCCTATAGCTTGATCAAATGCACTAGTTCTGAGC
GAGCTGCATCTAGATACAAGAGAGGCAATACTTTTTTCCTCTCCTGAACT
TCATACCAAAACATATATATATCAGCAGATCAGCCATGCTTTCACATATA
GCCTGGGTATCTCATAGAATGCAAACCCAAAGAGAGGTAAATGAGGAACA
CACAAATCGGTAAAAGATCCCAGCGTTGCAGAGTGTATATGCAAATTCTC
CTTTCCTAGTTAAAGTGCTCAGTTTGGGTATTACAATTCAAATACTCCCT
CTGTTCCAAAATAAGTGTCGGAGTACAAACTTTGTACTAAAACAATACTA
AATCACCGACACTTATTATGGACCGGAGGGGGTACTTGTTATTTTGTCTG
GGATGTACTTGTAGCGCTTTACAGTTTCTTATAGGGATATTGACACCATT
TAGGCTTAGAGAGACTGTTTGCAGTATTTGACCTTTGACATGCCTATGTA
CATTGATATTAGAGAGCTCATTGAACATTCATTGTGCTGTAGAGATTGTT
TCCTATAGTGACAGAGTTAGCTACCTGTATGAAACAAGAGTATTTGAACT
AGCCTATTGAGCTATATTCAGTTCCCCTGTTTGGTTGTTTCTTTTAGTGC
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GATGGAAGCTCATTTATTGATTCTAAGCCAAAAAGTGCACAGAATTCTTT
CATCCATGCAAAAAGGATTGTTGTTTTTGGTAGCTCTTTGCCAAAGGAGA
TGGGCCCTGACACATCTGCGGGATTAATGAGGATGAAAAGTTATTTAGAT
GGATCACCATCATTGGGCAGATTTAGGGTAAATCCTGTCTTTTTTTACCA
AGCACTTCTGAGCTCTGCTTCGAGTTATTTGCTAAAACTTTCCCCTCCTA
TTTTACAGATTCCAGTTGAGGCTGAGAGGTTGAGAGACAATGATCTTGTT
CTTGAGCAATATCTCTTACCTAATTCTCCTGGAATAGCTGGATTTCGCCT
TGATTCCTTCAGTGCTATAAGGCCTCGAGTAACCCATTCACCTTTCTCAT
CAGAGTTGGATACGAGAGATTTTTCATTGACACATATAGAAGATAGACAT
GTAAATCCTGCAATTCTTCATATACAAGTCACAGTTGTCAAGGTAATAAG
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TTTTATAGTTCTTTTGATCTATTTATATGTTTGTTTTTGAACAGTTGGAA
CTTTCATGCTTACGTAGTTCATCACTTCTATTCTGTCTTTACAGCATTCA
TTCTTTGGAACCCTTTTGGGGGTGAAAAAGGTTAAGGAAGTTGGTTTAAA
GTTCTAGGAGTTGAGTTTGAGAATTAATTATGGCCACTTTGGATTGTAGG
ATTTTCATAGGTTCCCAATCCTTATGGTTTTTTCCCTTCAAATGTCCTTG
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CATAATTGTTCATCTGTGTGCTGCTGCTCTTTTCAAGTTTGCTCCTAAAA
GTAGCCAGTTTCTGCTACACGACATTGTTATTTGAGGGTTTGAGAAGCTT
ACAGCTGAACTTTCTAGATGGATATATAGTTCTTGCATGCCTATTTACGA
TTTTTCATGTGCTTATGTTTTTTCTACAGGAGTCTGGCAAGCTGGTTGTA
GAGGAATACCGTCTACCAGAAGTTAAAGCAAACACACCACTATATTTTGA
TTTTCTGGATTTACAGCAAGATTGCCGTTGTGTTATCTTTAGATTACATG
GGGATGTCACTGCCTTTGTTGATGATATTGCTGATATTGATGGCTTAAAC
TTGCGAAATCTTCCTTTGGCTTCTGGATTGTCTTTGTCAAATAAGGTCAA
GCTGTACTACTACGCTGATACCTATGAGATGGGAAAGATTGGCAGTCTCT
CAGCAGTATGATATATACGAGGTGTGAGTATACACCGACCTGACATTTTA
ATTGCTGTTATATACTAAGAAGTCATTTATGCTACCACCAAAAACTGCAG
TTGTACCAAGTTTCAGTACTGTTTTCTTAACCCTTAGCCTGGTTTTACTC
CCTTGTTTAGCTGATGTGGGCATTTATAGTGTTTTAGCCACATCGAATTG
AAAATGGACAAGTATTGTCCCTCTTTCTCTCTTCCTTTACCCCATCTCCT
TGTCTGTTCAGAGTTAGGGAAGAACATGGCAGCACAATATAGTTTGTCAG
GTGGGTAGCCTTCTCCAAGAAACTGAGCAGGGTATCTTGGAGTACGTGCA
CATCATGGGGACATGAGGATCTGGTGTTGCACCAGCATTGTGAGGAGAGG
CAGAGGTGGCATTGGTTTCCTGAGAGCATGGCGCTACAGTCGTGCAACCA
CAGAATCAATCATACTGGGGCAATGAGGCTTACATTACACAGAGGGAAGG
AGCAACGGAGCATGGGTGGAGCTGGGGAAGGTTTCAGTGGTTTTAGGCTT
TTAGCAGTAGGGCACTTACATGCTATGATATACTGATATTAGCTGCGTGA
GCTGCTTCATATAAAAAATGTTTATAAGCTTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.