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GrainGenes Sequence Report: AA039253

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Sequence
AA039253
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039253
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGAGGCCCACGCAGACGCCCAAATCCCGCCCCCGCCGCGCCCCGCCCGG
CCCCGCCGCCCGCACACCCGGCGCACCATCCAGGTCCGCCACCGCGCGCC
GCTCCCGTGCCCGCCCCACTGCTCGCCAAGCCCTCACTCTCCGGATCTCC
AGCCATGTACGGCGGAGGTAAGATCTCTCGCCCCTGCCCCCGCTAAACCC
TAAACCCTTGCTGGAGATCTCACGCGCAGTTTCGCTCGCTCCCCCCGCAG
ACGAGGTCTCGGCCATCGTCATCGACGTGGGGTCGCACAGCTGCAAGGCG
GGCTACGCCGGCGACGACACCCCCAAATCCGTCTTTCCCTCGGTGAGAGA
AAATGCTCCTTCTGAAACTGTTCTAATTATGGTTGGTATTTCTTCAGAGT
TTGCCGAGAGTCTCTCTGTGAAAGGCTGCTTTAGTTCGTTGAATTTGGAG
TGACGATGGACGAATTAGTTCGTCAATTGGGAGTGGAATTGACAATTTGA
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GTCATTTCCAGCTATTTTAGGACGATGACTTCAGACTCTGGTTCTAACAT
GGTGTGCTAGTGTATCAGTTCATGCTATGTTGGGCCACTTCAGTATTAAG
TTGAAATCAGGCATTGAATAGACCGTGGTAAGAGACCTGCACTTAACTGT
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AGGCAGCAAGAAGTTTTACAATATCTGGCAGAGAAAAGAGACACCACTCC
AAAACTAGCAAAAATCTACACTCTCGTTATGAATGTTAACACCCCCTCCT
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GATGCTTCCAAATGGACCATGCCGTTTGGACTATGAGGGCATCCAGACGC
CTCCTGTCTTTCTGCAGTCCTGCACGTTGTTCTGTCCACCAGCCCTGGAG
CGTATCCGTGATCTCTGGAAGCATGTCTTGCATCTGCAGACTGTCATAGC
ATATGAACCAGACTTGTCAGACATAGCTGCATTGCACCAGGATGTGGTCT
GCATTGTCTTCTGTAAGCAGACGTAGCATGGTGCTGAGCTAGCTTGCAAA
CCATGTTGATGACGGTGATCGGAAGTCCAGGTTCTGTATTGTAGTGCTAG
CCAGCAGAAAATCTTGCATTTGAAAGGTGCCTTGCATTTCCAGATTTGTT
CTGCTGGTTCAAACTCAACATTCCCCTGACATAGCAGCTTGTACACCGAG
CTCGCCGTGTATTGGTTGGAGGCATCCCATGGCCAGCTGAAATGATCCTC
TTCTTCTGGCCTCCTGTCCGCTCTTTGTATTGCTAGCCATAGCTGCACGC
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GTGTTGTTTGAAAAACTGAATTTCAAGTGTTGAAAGTTTGATATTAGTTC
AGGAGGTTAACTTTAGATCTCATGGGAAGCAGTACTGCCGTGTTGAAATT
TGGAAGTTCAGTTTTTCTACAAGCTGTTAACTTTTCCTGTCTCCCTTATG
GTCTACTGTCAATGTTTTATTTTTCTTGTGTGAATATTTTTCCTCTTTAT
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TTCACTATGTTTCTGATGAAATAAGAAAACTACTCATGTAATAACAATCA
GAGTAAACTAGAAATACTGGGTGATTAGCACTAAGAAGATGGTCTGAATT
TGGCCACCTAACCATTTGTTTGGGTTTAACACCTTTTCTTCTCCTTTGCC
TGAACAGTTCTTGGAAATTATGTTCTTTTGTTGGTTCAAGAGTATGTGAG
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TGCACATTCTAGGGTAATTTTTGCTCATGATTTTGTTAACTATTTCTTAT
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AACAGTTACTGATTGGGATGTTCTTGACAACATATGGAATCATGCTTTTA
GGTACTTTTTTATCTACTTGGTGCAGCTCTGATCAATTTCTCCTCTTTAA
CATGGTTCATCGATAATCAGGAATGCCATTATTTGAACTAGAATCAAGTT
GCCACTTTAAGCTTAACAAAAAGTGGCATTCTGTGTTTATTTCACATAAT
TTTCTCAGTATACTAATTATGATTTTCTCTTAGTTTGTGTGTTCATGAGA
CATGATTCATTGTTTCCCCTCTTTTTTTATTTAATTCGTTGGGATGTTGT
GACTTCTGTAACGGCTAACGTTGATTAAGTAAGAGTTCCTCGTTATGATG
CTATGTAATATATTGGAGTTACTATTGCTTTCTTCAACTGTACTATCACA
CTGGCTTGTTCTATATTTCAGATCTCGGCTATTGATCAATCCTGAAGAGC
ATCCTATGCTGATAGCAGAACCATCTACAAACAGTGGACAACAAAGAGAG
AAGTATGTGTATATGTTTTGTGTTTAAAATATGTATATCACTGACCCATG
GTTCTATGGAAAAAGTTACCTTCAAGCCTGAATCTTATTTTCCAAATTTC
GTAGAGCAGCAGAACTTATGTTTGAGAAGTATAAAGTGCCAGCGCTGTTC
CTAGCAAAAAATGCAGTATGTATCTCTCAGAAGTAATCCTTGATGCAATC
AGTTTATTATTTTTAATTGTTCATGATTTGGTTGTCAGGTTCTCACATCT
TTTGCATCTGGACGTGCTACATCTCTGGTGGTTGACAGGTCAAAATTTTC
TTGATGACGTCTTACCTGCAAAACCTGCTATTTTCCTTATAGATTATTGA
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TGTTGTGGACTTGTGGTGCCTGCTTGGTTCTTAATCTCCTACTTCATGCC
TGAAGTATATTGTTTTTCGCCAACAAGTTGCACATAGCACACAAATATTG
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TATTTCTGAACTTGTGAAACATGTCTTTCTGGGAAGACCAAAGGTCATTT
TAATGAAGTTAAGACCTGTCAAACTTGAGATCATAATGTTACACCAAACT
TTTTTTTGGGTTCTAGGTGCTGTTTGGTGCTTAGGTGACCATTTCAATTC
CTCGAGCATTTTATAAGCTATGTTATTAGACTTTAACAAGCTCCTATCAA
ACATCTACCGATAATTTACTTTATCTTAATTTCATCTCTTTGGGTCTTAT
GTCGTGAGAGAAATTGCTGGAATATGACAGTTTGATCATGTTTGGTGCAG
TGGTGGAGGCTCTACTGTGGTTTCTGCTGTGCATGATGGTTATGTTTTGC
AAAAGGTATGTTTTGCTATTAATATACTGATTTTAAGGCGAGGTGTACTT
GCCTGTATCTAATAGTGATTTGCCCATTTTTACTTTGTACACTTCACTTG
AAAATGTGTTTAGTCCAAGCTGCTTCTACATTTGATAAATTAAGATGTCA
AGTTGTATTATATGGTCTCTGGCATATGCTGACACCACATTTGCCTCGCC
TCTTCTGAAGCCTTTTCTTCATCCGCTAACTTGGTTTCTTGTGGCAGTCT
GTTACAACTTCTCCAATTGGTGGTGAATTTTTAACTGACTGTATGATGAA
AAGCTTGGAGAGCAAGGGCGTTGTGGTAAGCATCTATCTTTCTTGACATA
GCATACTAGTTCTAGCTGTGTTTTCATATACCATTTGTTCACTTCTCAGA
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AAGGTGTAGTTTCTGTAACATTATGTTTGACATTGATTCTTTTCTTGTCT
GCTTATGATTTGTTTGGACCAAAAGATAACTCTTTATACCATTTGAAGTG
CCCCTGTGTTGAAACTCCTGGTAACACTGAATGTGAGCCGAGCCATTGGT
TTGAAATCAACACACCATTAAAGAAAAGAGGGACAAAATATGCAATATAT
TTATCTGACCATTAAAAGACGTTGCCAGGTGGTATTTGTGTTGAAATATA
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CATGAAATTCTACAATCTGATCTCTAGGAGCTCCATGCCTAACAAAAAAT
GTGAGAAAGCCTGCGAGGTGGTATCACTACCTCCCCCTTGCCTAATTCTT
CGCTGGCACCCAGTTAAGTTTTTCCACATGGCATTGGTGTCTAGATAGAC
CCTGAATATCTGAATACGATTTTGGCATTTCGAATATCATGAAGTAATGC
CTTCCTGTCCATATCAATATTCATAGATACATGAGCACTTGGTGGTCCTC
TGACTATATATCTGCCCCTTCTGAAATTCTTTACTCCCTCCGATCCATAT
TAATTATCGTTGAAGTGGATGTATCTACACATGTTTTAGTGCTAGATACA
TCCGAATCAGAGACAATTAATATGGATTGAGGGAGTAGTATTTTTCTTCG
TATTTATGTGGTTTACCTAAGGTTCTGAGTTTGCCATGTTAATCAATTAA
TCATGGTTATATTCTAAATTAATATGCATTATGCAACCGATTACTGACAT
TCTTATACAGTTGAAAGCCTGAAACAGTACACTAGACAAATAGTATGAGG
GAAACTGTGTGGTGTATATTCTGTGAACTCTTGTTTGTCTTTTCAGGTCG
TAGAGCTGGATTTTCCAAACACGACGGATAGTTACAGGTTGTACTGCATG
GTATGTTTATTGGCAAATCTGTAAATCTTGTTTTGCTTTATTGATTACTG
TCTGGATGCTTTTAATCCTGATGCTTACTCAATATCACAGAGAGCTATTG
CTAGCGACATCAAGGAGTCAGTTTGCAGAGTTCCAGATACTCCCTTTGAT
GGTATAACATTTAGAAAATACATTATTTCTGAGATTTCTTAGCTCTCACA
TATTAATGTGCAAGTTTGGATAATACTGTTTCCACCATATTAACCTGTAT
GCCAATCCAAAGAATATGCCAGCTCAGATGATCCATTAATGAATCTTATA
TATGCATAACCACAGCTTGCTACCTTTTATGCATGTTGTATGTCCGTCAT
CATTACTTGTATTCATTTGACTGATTTGACACATCTCTCTGTGTGCTTTA
AGCATGTCTTGCTTTATGTTCCCCTTTTAGGTTCTGCTGTTTACTTTCCC
TGTTTTATTTTCATGCAGAAGTGGCATATGCAAATGTTCCTACAACTTCA
TACGAGCTCCCAGATGGGCAGTAAGATATCAATACTATGTAGACACATAT
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GGTGGCCTGACCAGAAAAAACCTGAACCGATGGCCTCACCAGTTTTTTAA
GAGACACCGATCCAAACAGCAAAAAACCAAGAAAAAATAGATGTTGCGAA
AGGTATAGAACTCGTGACCTTATGCTAGGTAGAAATAGTAACACGTAAGG
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CACTGTATATACCTTTTATGGTCTTTTTGTTATGAAATTTGCTTAAATTT
TAGTTAAAAATAACGTTTTTTTGTCGCTATCAAACCGGATGAACCGGTGG
TCTGACCAGCAAACCAGTGAACCAGTTGCCTCACTGGTTCACTCACAGGT
CTGGTTTTTAAAACTATGCTCTTCAGTTCAACGTACAAATGGTCATGAAT
TTTTTTGTTGTTTACCAGTTGACATAAAACCAATATATCGCACCACTGAA
AAATTGCAGTTCAGCAACCACAAAGTTTCAACCCAAAATCCGATGAAATG
GAAGCCTACAAATAGAATGGGGAATCTACAAGTCACAGTTTACTGGGACC
TGCTCACGTGCCACACTTTAGTGGAGTCTCGAGTTGTAATTTTGCAGCCT
GGTAGACCATACCATGATTCAGCTACTACAGTAATTGTAGATTCTTTTCA
TGCCTAGACATGGTATTTCGATTTCGGAAGCACAATGGACCTATAAGATG
TTGGGTTGCTGATGTCTCCACTATCTCTGTTGCTGTTACTGCAATTTTGT
GGTGAGAAAACCGCACTGGCGGTCCTAATTCTTTGGCTGCACCTTCACTT
TGGTCCCAGTTCTTTGAAATCGCGCTTGTTGGGAGAGTGCACATCATCCT
CGGCTGCTAGCTGTGCTCCGACCCGTGCTGCTGCTCGCGGTCCTCGGCTA
GACCATGCGGGATCCTCGGCGCTCACCCTCCGGTCGCGCCCCATGCGTAC
ACCGCCTACGTGCCGGTGCAGTTCTCCAACATATACGCATGGTACGTGCA
CAGATGGGTGTTCGGCAGGGCTCTGTCATGCTTTGCTACCGCGTGGTCTC
AACGCTGCGTGCTAGCTGATGCATGTGTTTGCTTAGCTGATCCATGCGCT
TGCTTAGCTGCTGCAAGCATCTGTTCCAGGATCGTGTTCGGGAACACATA
CAGTTTCAAGGGGCTATTGGCAAATATGCATGCCACACTACGTTTCTTGG
GCCTCAATATCGACTTGGCATCAGTCAACGCCGGTTAGACCCATTTAGGA
CCTCGCGTGAATCACTTATAAAAGATTTAGGACCTAGATGTGCAATTTTA
AAGAAGTAGGACCAAACTGAAGGTATGAGAAAAGAATTAGGGCCGCTAGT
GCGGTTTACTCTTTTGTGGTAAATATGTTGTTTGTGCTTATACCGTTTAA
GAGCTTGTGACTTATCTATGTTATATCTGAGCAGAACTATTGAAGTTGGT
GCAGATAGATTCAAGATTCCTGACATTTTGTTCAATCCATATCTTTCTCA
GGTGAGTGGGATAAGTATAATTTGCTGTGTCCATGTACGTTAGTTGGTGA
TAGTGGTAGATCACACTTTAACAGGACAAGTTCATTGCTTTCTCCTTGAG
TATATGCTATTAATATTCGAGAAGTTCTTTTAGACCTAGTTTACTTGTCT
GCACCCTCCCTCACGCACACTAACATTGTGATCAACAGACCATTCCTGGC
GTTGATGGATTTGGAGATTCCACTTCAATTCGGGGACTTCCACGGATGGT
GAGTTAAGTTGTGGGTGCTATGCTGTTGTGCAACTTGGACAGTTCTTCAT
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AAATAGGTGTGATGTTGACATTCGCAAGGAGCTACTCAGCAGCATCTTGG
TAAGGACATTAATTCCAGTGCTACATTGTGCTACTTCTCTCTCGTGTCCC
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ATTCTCCTGTTATGTTTTGTTAATGCAATTCTAACGTGTGCAAACTTGTT
TTATAGCTTTCTGGTGGCTCATCATCAATTCTGCAGTTAAAGGAGCGCCT
AGAAAAAGAAGTAATGGAGGTAAAAATAATAATTAACTGAACAAGTTAGG
ATAAATGTCGCAATATTTTGTATTCTCACAGCTTCCACGTACATTTCATT
TTAGAATATGAATATTCAACCTTTAACCACCAGCGTACACAAAAGCATTT
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CCTTGAAAATAGAAGAATAAAATGGATATCATTTATTGTTTTGGTTAGTG
ACTAGTGATTACAGGATAGTTCATAAAAAGAAGAATATCTATGGTAAAGG
CTGTTGATAATGTTTCCTTGGCCTAGATTTTGCTGGTTAGTGAATAGCAA
TTACAATTTACCGAGGAAAGCTGTTGAGAATGTTTCCTGAATCTCTGCAA
GTCTGATTCTTATTTTTAACCCAATGGTTGCAGGCGTCCCCTCAAAATGC
TCGTGTAAAGGTTTTGGCAAGTGGAAATTCAGTGGAGAGGCGTTTCAGGT
TAGACTACTATATTTGCTTGTTTTTGTATCTGCTTGCCAAATTGTACCGC
CTATGCTCAATGGACACCATTAGCAGCAGGGCAGGTTGAATGATTGCTAT
GTTGCGGCTGGAAAGTTAAACTGATTTTTTCTGTTTTAATTAAATGAGTA
GTTGAACGCAAGAAATTGTTGTGGACGTGAAATTGGTTTAAGATTGGCTG
AAAGCATGATGACCGCCTAAAAGCATGTTGATCGTGTTGCGATATCGTGA
CCACCAGAGAAAAAATGCATGCTGTGTGGGCGCCAGTGCTGAGATTCATC
TGTTAGATGTTCATTGACATGACTGATAATTGAATGCAGTGTTTGGATTG
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AAGGCAGAGTAAGTTTGATATACTTGAGATTCTGTTTCCCCCTGCTTGTG
TCTCTGACGCCTAAAAATATCTGCCATGTATCTCACAAACAGGTATGAAG
AGCATGGCGTTTCCTATATCCAAAGGAAATGCCCATGAAATGGTGGAACA
AAGCTATGTGTTGCCGAAAGAATGTATGTGGGCGACATTTAGATGCAGGC
GACCAAGGCCACCTCGTTATGTCGGCAGCTGTTATCTTGAGATATTTGTT
CATGTCATGGCTAAAATTAGTTTTTAGGGCTGTGAGTGCAACTGACTCGG
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AGACTCGAGTGCATCCTGGAGTGGTACCTGAAGCTGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.