Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA014260

[Submit comment/correction]

Sequence
AA014260
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA014260
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCCGTAAGCCCCACCGGGTTCCCTGATCCAAGCGGGCTGGACTCAAC
AACCATGGCACTTGCAACATGGCAGGTGGTGTGTGTTGGAACAAATCTTG
TTAGTTTGTAGCTCACCGTATTTGTTTGTTTGAGTTGTTCGTGTAATCAA
GTCGTCCGGCCGGAAAGCTGCAGAGTTTACACACATGGAGATGCGACCAG
TGTGTAGAGAAGCTAATGGTCTTATTTAGTTAGGAATAAGTTAGATGAGA
GGATAAGCACGTCTGTACCCAGCGCAAAACTAGCTCCAGAAGTGATCAAG
TTAGTTTAGAGGAGGTGCATGCGGTGGCTCCTTCAATGTAGTTGCATGCA
TCTAGCCTGGCCAGTGGGTCGAGTGGCCGAGTCGCGTGGCTGCTTGCTTC
AAAATAGGCCAGGGTGTGTTAGTGTTTATGCATGACGTTAGTGGGTTAGT
GGCTGCGTAATAGCCGTGTGAGTTTGGCTATATAAACCATTGTAACCAGC
TGACGTATGTTGAGGAGTGTGGAATACAGAAAAGAAAGCACAAGTGTGTG
TGCTGCAACCCTCGCGTGTGTTCATCTTCTCCACCATATTTATGTGTGTA
TCTTGGATAGCACCATCATATGTGTGTATATATAGATCCTTGGGCAAATC
CATCAGTGTGCAACATTTCAAGGGCCAAGAATGCCAAACCCAAGTGCTGT
GTCACCCGTGCGTTGTTAGCTCCTAGGACAGAGATGATGAACACACGCAC
AAGCTCAAAGGGAGAATGAACACAAGTAGTGGAAGTGAGGGAGTCAGGAG
AGTGAGGCTGAATGCTCCTTTGCATTGCATAAACTGATACATGGACGTAC
TATTTATACTACTACACACTACTACCAGATGCACTAGCTAATGTGAACAC
CGGACTTGAAGTCCAGCCGCCATTGCTTCTTGCCATGTATTTGCAACTTG
ACCTGCAACGATGCATGCTATCCTGAACGCTATCTAATCCTCTGCTAGTT
ATCCTGACAGCTATCCTAACATATCCTGACATTGTAGAATATTTGACTAG
CTATGGGTGCAATAGTCTCTTGTTCACACTCCATGCAAACTGATACTACT
ACTAGCACATGCACATACACGTACCGGTGCATTATTTCTTGGCTAAGCAA
CTTAATTAGAACAACATGCGTGTGGTTGTCCTCCAGCAAACCTCCGACGG
GGTTGCAGCACCACCGCTGAATCCATGCTCCTGCCACCGGAAGCGCTGCT
TGTGCCGTTCGACAACCGTACACTCAAGGCACAGGCTGGGCTAAGTTGAA
GCACTACAATGGCCCTAGGCCAACGCCTTGTGGCGATTTCTGCGGCGTGA
GCATCAACTGGCACATATCGTCAGACTTCAGCAAAGGCTGGAGTGCCCGA
GTGACATTGTTCAATTGGGGGGACGTCGACATGGCAAACTGGTTTGCTGC
CATGGTCATGGAGGACAGGCGTATGATGGGTTCGACAGGGCGTACTCTTT
CAATGCAACGACAGTGGGACGTCGGACTACCTCGTGCCCGGAAATAGCAG
CAATCGGTCCTGTCCTTCGACAAGAAGAAGAAGCTGACTCTTTCGCTCGC
TGCTGGAGAAGGGTTCCCATCAAAGGTCTTCTTCAACGGCCACAGAGGTT
TCCGATGAGCAGTGGGTTCAGTCTCAGCACCACCGCGCTTTCTAATTGGG
TCTTGCTGTTGGCTGCATCAACTGGTGCAACCACCCTATTCCATGCAGAG
TCTTTGATCCCGTGAGTTCTACTAATGATAATAGATGAGCCAATCTATAC
TACTGAGTTATATGTAGCACCCTGGGAAACCCTGAATAATAAAAATGCAT
GTTGTTTTTTACTTTGTGCATTGTTATGACATCATCATGTATATTTTTCC
TAAAATATTTATGCTAAAAACCTATTTTGATTTCTAATTAATCCCCTACT
CTAATTTCAAATTAAAACTCTAGGTCTTTCTTGATATCTTATTTGTCTAA
AACTATCTTACAAATGGCTTTTAAATAAAATAGACACTAGTGGAAAACGG
GTCTCTAGTCCCGGACCATAACGGGCACTAGTCCGGGTTTAATCAGATTT
TTAGAAACAACACAACAATCATCGTGCAATGCATTTAGTGCAGCTTGCCT
GATTTTTTACCCTCCTCTACCATTTTTGCAGACATTTTCTATTTCTAGTC
GACTGTAAAATTACATTTATTGGAGTCGGTTTATCTTATGGAGACAGTTT
TATGGGTAAACCGTCCGAGGAGGGTAAAAAATCAGGCCAGAACCGACTCC
ATGCATAGTCAAACCATATTTTGTGTACATCCTGTGAATGTTAAACCATA
TTTTGCTTTATACCTAGACATAAAGAATCTGGAATGTGTCCCCCTTCAGA
ATCTAACATATTCAGTGGAAAACTGCAAAGAGCACTATGTAGAACATATT
CTCGTATGGAATATCTGAAAAGAGAAACCTAATTTGTATGGTAGAGATGT
ATATCTATGGACATAAGGTAATTGAGTTGAGAACATTTGCAAAATCCGTG
CAGATACTCAAGCTCATTGTGACCATATCTAGGAGCTCATGCGATGAAAC
CTGGACAACCAATAACAAGTGTACGAGGAAGAATGATTAATTAATAACTC
AAACTCACTACGGAGTAGTATAGATTGGTTCTTCTATCATACTTATCCTT
GGGATTCTACACCACGAGAGGACATATAACGTTTTTGGGAAGGATCTTCG
CATGACTTCTCGCTACTTCTCCGTCACGCAGAGTTCTTCACTCGCTCCAC
TTCTGCTTCATCTTCAACATCTGATTTTGCACCTATGTTCTCCATGGACA
TAGCTCCCTTGCATCGCACACACACTGGCGACTATTTCTCGTCGTTGATC
CGTATTTTTTTGTTGGTCAGCATGGTAGAAGTCGTTCATGTACACATAGT
ATTTAGTTCATTAGTAAGTATGATATGATTCTAATTATTGTTGCTGAGTA
TGTTATAAATATTTTAATTATTAATATGCCTGACTTTTAACATGTATAGT
TAGTTAGCATCTACTTGAAATGCATTAGAGAAGTTCTCACGTCCTCAAGA
AGGTATAATAATTTTTTGTTGGACTGTGTGTTCCAATGATCTGCACATGA
TAGATACAGCCAGAGAGCAAACAGTTCGTAACATACTAGAGGTATGCCAC
AAAATATTAAATATAAGAGAAAAATATTCTTCCTGCTGCTATATTGCTAT
CTTTTGTGCCATCTCTTGTCATTGATGCTATTTCTTATTCCATGAAACCG
AAAGGTGTAGGATTCCCCATGGGACCCAATACTTTCTATATCGCGTATTC
ACAACGCAAGCTATAGTACTTCAATCCGGTGGGTTTTCTGATAGGACTCC
ATCTATAAATACGTTACATCGGATGCCCAATTGTATCTTCATCGAGGACA
ATTTCCAAGACATCGTATCCACAACGAGGTAATATATTTTGATTTCACGT
TTCTTTCGCTCTCCTTTAAATTGATTTCATTCACAGTGGTAATCGATATG
GCCTTTTAGTTATTTTATTGTGCTCCAGAATAAACATATGCTTCCTTCTG
TCATACTTTAATAGTTAATAATCTTAACTGATACTCGAACACAAATTTTA
CTTTGGACATAATTTCATTCTTGTTAATTATTTCCAACCAAGCTAACTTA
TTACATTGATCTTCATACATCATCAAACTTCAGCTGATGTTGCGGCGCAC
CAATGCCAAAGAGTATGTTAGGCCGCCGCCAAGACCATTAGTGTTGACCG
CGCATGAAAATGCGTCAAACTATCCACAACAGGTAAGGGTTGATCCTCCC
TCTGTTCTTCTAGGTTGTGGGGACTTTGCAAGATATTTGAATTAGTTGCC
TTAACATGACAGAACAAAGAGTTTTTATCGACTGATACTTAAGTTCTTCC
ATAGTTCATTGGTGTTTGAGCTTTATTTTTTATTTATTTTAGAAAAATAC
TACAGTTTGCCTTTATCAGCAATCTACTTACAGGTTTTTAGAGCCAGACC
CTTTTTTGTTAAACTATTTTAGAGGTGGAAATTGAGGGAACTCATTTCTT
TGTTTGTTCAACTCCCTTTTATACTCATTGTCTCTAGTGGATCGTCGCAC
TATGGACAGAAATGATGTTCCTTGTAGCGACTCAAACTCAAGTTTTACTT
AGAACATAGGATTAGCTTCATTAAAAAAATACAAACATTAGTGTCAATAA
AAAAGTGTGATCATCTCTTGTTAGAAAAAAATCTGTAAATCATGCTAAAG
TGGCAGATTACATAGTATAACTTAATATACTAGCCACGAAAACTATGTGC
AGATTAGCACAGTGATTAATTCATAGTAACCTAACTACATGTCAATTATA
CCTAACATAATCATAAACAAATTGGCATCATATTAATCTAAAAAAATGGC
ATCATCAGGACTAGGGTAAAACATGCTTTTATCTATCAAAACCAAAATCA
GCCTCCCTCTAGAAAGGAAGTTCAAATAGATCCCTGCGACAATCAACTAG
TCTTTTCTGGACACTTATCATCAAGAATTACTGATGATTTTCAAAGTGAC
AGATTTGGTATTGAGATGAGAGGGGGATAGATGTGATTTTTTCGTAAGGA
CACATCAAGTATATAGTTGCTTGCTTTGTCAGGTGAAATACGAAAACTGA
TTTTGTTAAAAATCACATTTCACAAATTTGAGAAGTTACTCAACTTCGTC
AAAACATACCATATGTAGGGAGGGTATTTCCAATCTGTATATGTTTTTCC
ATTTGTTGTTTACGGCCTCTACTGCAAAGGATATTTCTCTCCTTGACATG
GTAACTTTAATCTAGGTGCACATTTCAACGGTGGGAACAAACCATATGAG
GGTCTCCTGGGTCACCGATGATCGTAATGTGCCATCCATTGTGGAGTACG
GCACATCTCCGGGAAGGTACACATCGTCCGCGAAGGGAAGCCACACTACA
TACAGATACGCCATGTACCAGTCTGGCGCGATACACCACGTCACGATCGG
GCCGCTCAAGCCCAACACGATCTACTACTACCGTTGTGGGAAGGTCGGCG
ATGAGGATTTCCGCCTCAAGACTCCTCCGGCACAACTGCCCGTTGAGTTT
GTTGTCATTGGCGACCTAGGGCAGACAGACTGGACCAAGTCGACGTTGTC
GCACATCGACGCCTTGGACTATGACTTGTTGTTGCTCCCCGGCGACTTGT
CATACGCAGATATGTATCAGCCATATTGGGACACGTTCGGGCGGCTTGTG
GAGCCGCAGGCGAGCACCCGGCCATGGATGGTGACGGAGGGTAACCACGA
TATGGAGGCGAACCACCAGGATGATAAGATTGCGTTTCTCGCCTACAACA
AGCGGTGGCTCATGCCGTACGAGGACAGCAACTCCAAGTCCAACCTTTAC
TACTCCTTCGATGTAGCAGGTGGCGCGGCCCACGTGGTGATGCTGGGCTC
ATATGCCGGTTTCAAGCAGGGGTCGGAGCAGTACGCATGGCTGAAGAGGG
ACCTCGCCAACATGGACCGGCAGAGGACGTCGTGGCTACTGGTGGTGTTG
CACACACCGTGGTACAACACCAACGAAGCGCACCAGGGCGAGGGCGAGGA
CATGCGCGTCGCAATGGAGAGGCTTCTCTACGATGCTAGAGTGGACATCG
TCTTCGCCGGACACGTCCATGCCTACGAGCGTTTTGTAATCCTTCTGTCC
CATTTGTTCTATAAATTAATCATCCATTCATCAAACTAACCATGCAATTT
TGTGGGTGATCGATGACCTAGACGAGGATCTACGACAACCAGGCCGACAG
CCGAGGTCCAATGTACATCACCATCGGCGATGGCGGCAACCGGGAAGGCC
TTGCAAGCAAGTATGTATATGTGATTGACATCACATCCAACTGCTCTTGA
TTTTAATGGATCTTGCTGTAATTTTGATTATTATGTTAATCTTCTTTTTT
TGAAGCTTCATCGAGGATCACAAGTCGGCTCAACTTTCGGTGTTCCGACA
AGCAAGCTTCGGCCATGGGCCACTAAGTATCGTCAACGCAACAAGCGCTG
TCTGGAGGTGGCACTGCAATGACGACGACAATGCCACCGTGGCCGACGAG
GTCTGGCTGGAAAGCTTGGCTAGCACAAAGCCGACATCCCTAGTAGCCGC
GCGCAGGTCGTGGTACCCATGAGTACATTCTAGGGTATTTGCCCGGCCGG
TGGTTCACTACTACACAAAATAACTCTAAATGCAAGTTAAAATTAATAGC
TCTGTCGTCCGGTTTTGTCACCGACTTTACCAGTAGCAGCCATGGGTGTG
ATAGTAATAACGCAATTTAGCTGGTCCTCTAAATAAACCGACTGAGCAGT
CAATATCTCAATCATATTTGCGTTCCCAACGGGTTGAACTACTATGTATT
ACCACCGCTGTATTTGAAATAAATAACGGATGTAATATGATTGGAAACAA
AGAACCTATGTCCGTACTATAATATAAAATGTAATATGTAAAGCTATTGT
GCATAACTGGTTGCAGAATATTATTTTATACATCAAATTGTACATTATGA
CATGAATGTTTGTACATTCCAGATTAAAGAAGTACAGTCATAGTCATCCT
CTGCGCCTTGTGTCTTGCTCACTCTATCTTCGCATAATAATTTCACATAG
AGTTTGTAGCCAGATGCCAGAATAGCACAAATCATGCACTGAACATACGG
GAAATATGCAACTTTTTTGTATGTAAACTTTCAGATTTGCTAGTTCTCAA
GCGCATAAGAACTTTCTATGCCTTAGTCACATCTCTTATCATTAGATTTA
TCTTGTGATTCGAGCAATGTGGGAGTTACACATGAGTTGCAAATAGGTTA
CTTGAGTTGCAAGTAGGTTGCAACTGAAAATTAGTACAAATTTTATAAGT
TGTAACTAGGTTGCAACTAAGAATTTATATAAACAGTAGGATGATATGAG
CATACTGAGACATAAAAAGTTCTCAGCCGTCAGAGATCTATGCACTTCCA
TAAACTTTTCGCAACTTCTGCACCATTTATATTTAATTTAGGGATGCGAT
AGATTTCCATAAAATGGCAAAAAACATACTTTTAAATAGTTTGTGAACCG
TCCATTCATGTCTATCAGATGATCCAGTTTCACCCGCTTCCCCCATGCAC
AACCCCTAAAATACATGTTACTTTGCATCCACGAACATCCACTAGTACAG
ATTGGGTCTATTAAGGCCCTCCTTCGTAAACGGTTGGTTCCGTGCGTGGT
GGTTCATTATTACCACATTTTGTCCAGTTTCCACCTTTTTTTGCCCCTTC
TCACATGGTGCATCATAAATCATAGTTTGTATAGTGAGTTTTTGATGGCT
CGAATTCCTTAAAAAACCTAACTACCACCTGTATTAAAACTGTGTCTTCT
TCCCAGATGCTCGTACCATAAAGCCCAGTTTCACTACCCTCCTTGTCAGA
CCACCAACTCTACTTTAGACACGCGCCTATAGGGCTCGCACCAAGAATAC
AACTTTCCTCTCTTGCTTCTAGCAGTGTCCAAGGCGCGCATCAACGCCAT
ATTGAGCATGCATCTCCTATGATGAAGAGGAGAATGTTTATTGTGTAGTG
AGTAGTTATGAATTAATTAGCTGTCTTCTGTAAAAAAAACCATGGCAACC
ATGCATGATTAGTTTCCCTTCCAATCTTCGCTGGTTCTGACTCTTTTTTT
TGTTTTTCTACGTGTCTGCGATGTTCTCCTCAAGGATACCCTAGGGTACC
TTTTATTTAGGCGTTTTTATGTCAAACCAAGTCCGTGGGAGAAAAATTGA
CACAAATCGGATGGCCGAAGGAGAAAAGAGGTAGGGTGGCGCTCCTAGTA
GGGTTGGCCACGTCACCAACCCTCTCTTGGGCCTCCAGTCCCCTCTTGTG
AGGTCCAATCACTCCAGATCATTACTCTTCACGAAATATTGGCTTTTTTT
AGAATCTTAGCTCCATTTGACTTTGTTTAGGTCCCTAAAAGATAAAAATA
CACGAAACATGGTTTTCCTGTCCTGCAGAGTTATAACCAACATAAAGGGG
ATCACTGGTAAATCCCCAAAAATCAATATAAAACATGCATATTACATTAT
ATTTGTTGCAAATATGTGGTAATATGTATCAATAAACTACAAAGTTCATG
TATGCATTTTACATGCATCAACATCCCCAAGCTTAACCTATACTCGTCCT
CGAACATGAAGGTGATAAAACTAAACATGAACTTTGGAGATTGTTGCTAT
GTTTCATGTCAGACATTATTAAACAAATTTTACAAGGTACAATCTTTAAA
GAATAGTAATAAGCAAATGAGCTATAAAGTGATATCTCTTTTACACTATA
AACATGCTTAACAATAAGTTGTTTTGTAATTAAACAATGAAAGTACCATG
AAAAATTAAGCATGCTTGGATGAACCTATGAAATTATGGGAGACTCTTTT
TATTCTTTTGATCTTTTGGAACTTCTGTAACAAAAAGTTAGCAGGGAACA
TGTGTAGATCAAGTCAACGGTATTCATAAGAGTGGGGTTTCAGGCATTGT
TTTTGATAGTAGTATGTATAGTTTATGTGTTTGACCCTTTGTAAGTTAAA
TGTTTCATGCCCCTTGACTACAAATACCCAGTTTATCAAGATCACGAGAG
ATATGCCATCATATGCATACAGCTTCAAACAAGGTGGCACTGAGATACCT
CCTACCCCTTTGTATGAGTGGTCCTTGCCCCCTGAGTTCCAAGGTAAACC
ATCCATAGTCCAATGATAGGACAAACAAACTTAATGAACTTCACAACACT
TTGTTTACTCTTCTCATAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTTT
TATATTGCGAGAGTTATTCATAGAATATTCATGCTGTAAACTTTCATCCA
ACCATGTCTGGCTCGACAGCTTTGGTCGTCCTCGGCGTAATCCTGCTCGC
GGCGGCGGCGCAGACGCCCACGGCCGACCCCGGCTGCAACGACATCCAGC
TCAACTACAACTTGCAGACCCGCACCAAGATCCGCCACTTCGCCTCCGAC
CCCGACCAGAGCAAGCAGCCCTACTCCTTCATGGCCAATGCCTCCATCAC
CCGCCCGCTCAACTCCTGGGCGATGCTTGTCACCTTTGGCCATGACGAGA
ACCTCGTCGGCGTCGATAGCGCTGCTCACCGTCGGGGCCGAACTGCCCTA
TGACACCACCACCGAGAACGCCACCTCCTTCTCCGGGTACCCGCAGACGG
ACCTCCTCACGCCGATTGCCACCGCCGGGGACATCGCCCAGATCCAGGCC
TCCGTCGCCCTGCGTGGCACGCTCTTCGCTAGGCCGATCGGGATGCCGCT
CCCCACCGCCTTGACCCTCGACGACTCGGACTATGACTGCCCACCGGCGA
CCAATGTCATGGCCTCGCTCCTCTCCACCTGCTGCCTCCTCACACCCATG
GCCTTGGCCAACGCCACAATGGTCATCGACGAGACCCGACCAAGCAGAAC
TTCCATCGACGACAACGGCGACGACAATGGCGACGGCGACCTTGTCATCA
CATACCACGTGATTCAGGCGTACCCGAGCAGCTACCTTGCGTTGGTCACG
CTCGAGAACAATGCCCTTCTCCGCCGCCTCGAAAACTGGCGATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.