Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA021878

[Submit comment/correction]

Sequence	AA021878
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA021878
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAACGCGCTGCCTGAAGCCGCTGCCCCGCAGGGCCAGCTCGGCTCGGGTG CCAGGAGCTAGGCTCGGTTGGTGCTTCGTAGTTGTCAGAGTCTCCTCGGC AGGAAGCGACCTCCTTGGAGAAAAGCTGAAGAGAGATGATGGGGTCTACA CCGTGGTGGCCTCAGCTTTTGGGTTGAGACGAAGAAAATCAGTCCGCTGC CTCACCTCACCATGCCGACGTGGATGGGTCGGAAGCAGCATCTACCCCTG CTACCATAAATCATGCTCTTAGTAACAGCGAGGCAGAGGGCGTCGGAGGG TGCGCGAAGTGAGGTGGTCACAGGAGCGGGGCCCACTGGAAGGGTGGGGG CCGAGTGGGGACGAAGCACGCGAGCACGCGCTTGTTCGCAATTGCTTTCT CCCCTTCCCTTCCCTTTCCCCACCGTCTCGTTCACGGAGAGAAGAGGGAG AGCGAGGGTTCCGTGCTCCTCCACGCATCGAATCGGACCGGATCGGCCCG ACCCACCGCCGTTTCGTCGGCGCCCTGCCTGGTAAGATCGGGAACCTCCC ACCGCTTGTCAACACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTTTTTCGTT CGTCCCGGCGTGTGAGCGGATGGCGAGCCGTCGGCGATTTGGGGAGGTGA AGAGTTTGGAGACGTTTCTACTGCTTGGGTTGGGTTCCGGGGGTGCTCAG CGCGGGGTTTGGATATGGGAGAATTTCAGTTGATGTGGTAGGTAGGTGGC TGGGCCTCAGTGCGAACTCGTTCTTTGTGAAATTTAATTGGGGGTTTGTG TTCGATTTGATGCGAATCGGCCTTTGATTTCTTACAATTGGCCCTTTTCT CGCTTGGGAATTTTGTTTTGCAGCCTGGGAATTTTGGTTTTATAAGGTAG TGTGGCGCTGAGAGTATAGATTTAGGGGTAAGCTTGGATCGTGATTCGGG AGAACTGGGCGTTCCCGAGTAGAATCCAGTTCACTGGGCTGGGTAAGCTT GGATCTTGTGGGACAGTTTTATGGGTTGTGTTGTGGTTTTATTTTTGGTT TGATCTGAGACTGGGAGGTATTTAATTTGAGTGAACTGCAGCTGATTGAG CTTCTACTGACGAAATAGTGGTTCTCTTGCCATAGCGTAATTGTGATCAG TGATCACAGTCTTATATGATGTGAGTACTCCTCGAGTTGTGTCTTGTGGA CATATCTTTAGTGCTCGTCACATAGTGTGCGTTGAACTGCCTTGATATCG AGTAGTGCTCATTAACGAGGGTGACAAAAAGTATGGTCAATTTGGTGCAA ATATGTTTAGGAATACATTTGATTTTCTGATATATTATTTTATCTGAGTG ACATCTCTTGTCTTGGTGACACATATCATGGATAAACTTTCCATATTAAC CTTATTAAGATATCATTAGCAGAGACATTGCTCTACTGGTAGTTTCATGT GGAGGTTTTGTTTGTTTATTGATTTTTTAAAACAATGTGTGCTTCTGTCT AGTACCGTGTATGTTCCATGTGATAATTTTCTGGAATCATTTGGCTTCTC ATGTGGTATCATTTCTTGTCTTGAATGGACAACATACTTTTTGGCTGCCA TTCAATTTGTCCTGTTGTTGTGCTACTTGTATGGTTAGATTGTTCCAACA GAATGGCCCTTATTTTAGTTGAAGTTGTTTTGTTCCTCTTTTCCATATTA TAAGACGTTTTGGCAAACCAATTTGGATGAAGTTGTTGTTTAGCCTTATA ACATGGAACAGAGGGAGTAGCATTTTGTTAAAGAATTTGTTATGCAATAT GCAAGTACTTGGACAACATACTTTGCTCTACTTCTTTTATCTTTTGGGTG TGGAATGCAAGCTGGTATTCCTAGCGCACCATTGCTAATTTTTGTTGCCT GTTTGGCTTTCTAGTAAAATGAGGGACAACAGAGTTTGATCCAAAACTTG GCCAATTCTTATTGTGTAGAAATGAAACAAGGTGCCTGGTAAAGTGGATC TTGTTTTGCATATTTTGATTCTTTTACCTGGTATAAAGTACTCCCTCCGT TTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTAAAGAAAATGTATCTGGACTTC TTTTAGTGTGTAAATTCACTTCAAACTTAAGTGAACCTAATACTAAAATA AGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAAC GGAGGGAGTAGCTTTCTAATTTATCTAGTCTCACTAAACATAGTTGCACC AATATTTTTTTGAATACGGCTATACAACATGTATACTAACTTTTTTCTTC TTTTGTCTTTGCATTTTGCTGTTATGTTCTGGTTTCTTTCGTCACAGTGA ACATGTTCTCTTTTCATCTATGTCACTAGAGCTATAATGTATTCAAGTGT TAATTCTGAGCCCCTTTTTCTCACACATTTCTAGATATCAGGGCTGTTAT TCCTTTTCAATGGCTTCTGGAACTGATGAGAAAGCCAAGATGGAGAGTTT GACATCACCTGCAGCCTTTGTAGAGGGTGGGGTTCAGGATGCATGCGATG ATGCATGTAGCATTTGCCTTGAGGCTTTCTGTGAGAGTGATCCTTCTGCA GTAAGATACCATTTCTTTAATTTTGTTATTTTGTTTGCTCACAGAGGTCG GTTTATAACCATTTCCTTATGATTTGTTCTTTGCTACAGTTGACTGGTTG CAAGCATGAGTTCCACCTCCAATGCATTCTTGAATGGTACGGTACTAACT CTAATATGCATCCCACCACTTACTGTCACCTTATATTTATGCTGTGCGCT GTACCTATTTCCACATGGAACCCATATGCTCATTAATCTAATGGTATTAG AACTATGATATCTGCTCGTCTTCTGTTACATTCATATGGCAATGGTATTG ATCTAAAATAACCTTTACTGTTTTCCTTCTTGGTATAATGGGTTTAACAT GAACCACTATCATATATCACTTAATTGTTCAAGTAGGTTACCAAATTTTG GCTGTGCATTCAAGGTGAGATAGACTGACTCTTATGGGATTTGTTTGTGC ATTGGCAATAGTACGTGATGAATTGTTGAGAGGTCTGCCTGTTCCTGAAT AGATGTCTGTACTGTTCTCAGGGATCTTTATTTCCATCAGTGGTGTTGGA CACCGTGCGTCAGCAAATTAAAGAAAATATAGTGTTCAAATATTTTTGGT TACCTATCCACTGACGTAATTTTCACATGGCCAATTTCAATACTCCCTCC GGTCCATATTAATGGCCTCAACTTTGTCTAGATAGGAACACATCTAGTCT AAATACTTAACTAGATAGATACGAATCTAGACAAAATTGAGGCCATTAAT ATGGACCGGAGGGAGTAGTTACATTTGTGGTCCAAAATGAAGATCATAGA TTACATGCATACCATAACTCCATAGTTTTTGTTTCCTTTAGTGTGGAAGG ACTACTCTATTATGGAACCTTACCTTTCACATATTTTGTATGTATTATAA TATGAGGTGTACATGCCTACAATGTTTGCAACAGTTCTTCGGATCTTTTG ATACGACAAGTAAAATATGATGGTATGACTAGTCAAATTTCTATTTTATA CTTCACTGGAAGTTATAGCGGAAATTTTCCAGAAAATATTTGTCAACTGG AAAAATATTTCGCGTGGAAAATCCCACTGGGTGTTCTACAGTTCAGTTCA AAGTGTTTAAAACTATTTTGCAAAGTTATTGCTTAATATATGTGTCTTCT GTTCAAAATATGCGCACATTAATGATTTGTGGAGCTTTGCATAGGTGTCA AAGAAGTTCTCAGTGCCCTATGTGCTGGCAGCCTATCAGTATGAAGGATC CTACCAGGCAAGTGCTGGCAAGACATATTAATATTCCTTGATTATTCAAA TAGGAGTACCAAATATGTTTGTCTTTAACATGTAGAATTCTACTAACTCC TGTCCTACGAATATCTCAGTCAAGAGCTGCTCGAGGTAGTAGAGAGGGAG AGGAATATAAGAACCAATCAAACTCGAAATACAACCATATTTCATCATCC CGCGCTTGGCGATTTCGAGGTGCAGCATGTATGTGTTATGGAACTAAATT TATGTGACATACTACTTCTGCTTTAACCAGTGAAGTATTTTTTCCTATGT TATCCTGATTCACAAGATGTGCAGTTACCTGTTGCTGGCAATGATGCTGA ACTTGAAGAGCGTATACTGCAGCACCTAGCTGCTGCCGCGGCGATGGGAA GGTCACATCACCTTGGTAGAAGAGAGGGGCAGAGGGGCCGGTCTGGCTCT CATGGTCGCCCACAGTTCTTGGTTTTCTCTGCGCATCCAAACACGCCTTC TGCTGGCTCGATTTCGTCATCTTCAGCTCAAGGGGAAGGTGGTAACGACT TGAGGATTCTTGTCCCCAGGGCTGGTGACTTATCACCACGTGCTAATTCT ATTGAAGAGGCAGGCAACCAAAGTCCTGGGGTGCTTACCTATGATGCCGA GCAAGACGCTGTTGTTTCATCTGGAAATAGTACTCCTGTATCCAGTCCTA GGTTTTTCAACAGGTAAACTAAGGTTCTCTACAGTTATGTTAATGTTCTG TGTGATCAAATTATCTGATGGCTATGATGTTATCAGGAGACATTCCACTG GACAATCAACTCCAGTAAGTAATGACAGGGCAGGGCCATCAGATATTCAG TCCTTCTCAGACTCTCTAAAGTCTCGCTTAAATGCGGTCTCCACAAAGTA CGTAATTTTTTTTACCAAAATTCTTGTCTTAATGAATATTTATATTAAAT CTGCTGCTTCTTTTATGCAATTCAGGTACAAAGAATCTATTACAAAAAGT ACCCGAGGGTGGAAGGAGAGGCTTTTTTCACGCAACTCGTCTGTGTCAGA TCTTGGTTCTGAAGTGAGACGAGAAGTTAACAATGGAATTGCGTCTGTAT CAAGGATGATGGAGCGTTTGGAAACTAGAGGAAGTAGTAGAACAAGCGAT AGCCCAACATCATCTACTTCTGAAGTTTGTCCCACTGCAGAACCAAGCAA TGAGAGGGTTACAGAAAGCAACTCTAATAATACTACTAGTAGCACTAGCA ACACTTCTGCCCCTTGTGTGACAGCATCTGGTTCAAATTAGTGTCTGCTA CTGTTACTGAAGAAGGCCTGCATGTTCCCATTCTTCATCTTCAAAGGTAC TACATCTTTCTGCAGCACAAATGTTTGTGGTGAGCTTGTGATCTTGTTTT ACCTATTTAGTACTCCCTCCGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGT AAAGAAGATGAATCTAGACTTCTTTTAGTATGTAGATTCATCCTAAAGTT GAATGAACCTACATACTAAAACAAGTCTAGATTCATTTTCTTCACAAACC TAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTATGTGCGTATAATTTTAG CCTTAAGTCAACTAAGAAATGGAAGGATTTGCATTCCCAGGTATGCTCGG GTGGCTTGGTAAGGATCGAACCACATGATGGGGCCATCTCCTCGACTGTT GCATAAATCAGCTCCAGAAAATCTGAATGATAATTTGATGTATTGGTTTG ATAAAAGGGCGGTTGGCCTGAGGTGTTGCCTAGGCAGTCGATTTGTCTCC TGTTTCATCTCTGTAATTAAAATTCCTTCCTAGACTTTTGTTTACTGGTA TAAATAATGGATCTGGTAATTTCATAGCATGCCTTATCGTGACAAATATG ACTGGAACAGCCAAGAGTTCCATGCTGTTGCATGGCTTTTATCTACAAGT TGTATGTGTTTGCATTTAAGCAAACTGTTTTGGTAAACAAAATGATGTAA ATCCAATTTGGCTCAACTTGTGTACGGGCATAGAATGTCTGGATGTGTAT GTGAAATTTTTGTTACAGATTTTTTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.