Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA001739

[Submit comment/correction]

Sequence	AA001739
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA001739
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TGCCAGTCCAAACGTAACCATAAAAAACAGTGATCAGTGGATTCTAAAAA AAATCGTCGTCTCTGATCAGTTCACCTCCCACTTCTCGAAAATAATCATA TTGCTCGGCTGAGCGCCTCGTCATCTCGCTCTCAGTGTCACGTCGCTATG CGAGCTCTGCTCTCTCGCATCCCGATCTCCACCACCGCTTCCTTCTTCCA CTCCTCCTCCCCGGCCAAAACCCTAGCCCCGACCCCTAGCTTCGTCCCGC TCCGCCTGGTCCGCCGATTTGCCGCCATGGCCGCCGCCGCCGCGGATGAG TTCGTGAAGGGCCGCGTCTTCCCCAACGGCGTCGCCGTCATCACCCTCGA CCGCCCCAAGGCCCTCAACGCCATGAACCTCGGTGCGGATCGCCCCTCCT CCCTCCTTAACCTGCCTGGCTGGGTGTTCCTCGTGGCGTGATTTGAGCAG GAATACCTCGATTTACTTGCGCGATCCTCGCTAGTTTATTCAGTTGCGGA GAACTAGGTGAAATTGGTGTTGCAAGTTTGGTGAAGTTCTTTTAATTTCT ATTTGTGTTTAACTAGTGTGCCTGTACTGGATTCTAGTTCGATTTATAGA TCCCAAGTAGCGACCAGACTACATCTGAAATAATTTCGCTGCTAGTCGAG TGATGTTTGAGATCAGGGTATTGACACTCATAGTGATAAATTACTTGTAT GTTTATCCTGTAAACTCGCAGCATACAACAGAGGCCTTAGTTATATACAT TATGCTCCAGTTATAGCATTCATCACTCACAAAGAAATCATTTTGCATTT TCCTGTGAGCAGCAAAAATGACTTCGAACTAACATCCTTAGGTTTCTTAA CCAGTAGTTTTTGGTGTGTTTGTTCGCCACTAAGTAAACCTTATCTTTAC ATGAACTGACTTGCAAAAATTTGAGTAGAGTGACACTGACTCTCTTACCC CTGTATAATAAAAAGCTGACCTGTTATGAAGGGAAGAATAGGATTGAAAG CAGATGGCTTATCTTAACTAGTCTTATCTAAATGAAACTAAGGGTATGAG GAGACATGATTTGGTAGCTGCTACTGTACACATGCATAGCATGTATACAT CCATATTAATTGTTTGCAATAGAAATTCTGATTGTGTATGTCCATAAATG TTGTCTACTTACATCCTCCCCACAGATTGTTTGTCTGATACCTTACTGAG TTCTACTCACATATTTGTTACCTTAAATGGTTGCAGAAATGGACCTTAGA TACAAGGCATTTCTTGATGATTGGGAAACAAATCCAAATGTGAAGTGCGT TCTTGTGGAAGGCAGTTCTTCACGTGCTTTTTCAGCTGGTATTTTCTCTC ACCATTTTGTCCCCCTCTTTTGTGGTGAATAAGCTATGCCTTTGAACATG TTGTATTGCCTTTTTATATCCGGAGCATTGGAGATGTTTTCAAATAAAAT TCATGGCCAATGCAGGGATGGATATTAAGGGTGTTGCAGCAGAAATTCAA AAGGACAAGAGTACATCACTTGTGCAAAAGGTCTTTATTTTCATGTTTTT TCTGATCCAACTTCATATTTAGACTGGATGGTTCTTTTCTTGTGAATACA TGTGGCAATGGTATATGTTGTTGTCTCTATGTTGGTAAAACTTGCACGAG ATAGTGACTACTGCTTAGTGTAAATTGCAGGTGGGGATGTGAAGAGACTT GCTAATGATTGCGCAATGCCAGAGATAATAGAGGTCTAGTATAAGACCTT GTTGGTATCCGAGAAATAAGTTGTACTGTAACAAAAATATAGTTGAAACT ATATTCCAATCTGAAGGGACAATTCAACAGAGTTAGATTTTGAAATTCAC AACCAACTTTAATAAGTAATGCAATATTTAAATAATTGTGCGCCATTCTG AATTGCAATGCAGTACCTAATTCATTGTATGAAGATATGTTTCAAAATTG AAATTTAACCATTGATTCAGCCATATAACAGAACATATGAATTCAAGGTC CTATTGAGATAGGAGAATTGAGGTATAATTTTGAAGATCAGTTTGAGGAC AAATCCAAACAAAATGTTAACTCCAACAATTAGTTGGCTGCTGATCTCTA AATAACTTGACAATGATGGTGTTTTTTTTTGTGGATTCATATCACGTGAT AAGTAAAAAACTGAGCCATTGGCCATTGCCATTCTATCAGTCGATTATCA TAACATGAAAAGCAAAAAGACAAAACCAAGCTACATGCATTCTATTTGTT GATTCTGATTACATGGAAAATGAAAGAAGATAATGAGCTGTAGTTTACCA GACTGATATTTCATTCAGGTATATCTTAAAGAAGGTTCAGTTATATGTCA TCTTTAAGTCACTATCTATTGTTTTAACACTATCTGCTTCTTTAACCCGG CCTCTACAATCGCATAATAGTCTGCAGTGACCTTAACTGCTCGTACGTTG TTGAGAACCCTATCTTATCTTATTTTCGAATAACTAATGTTTAATTGACA CAAATCTGCTCGTCTTCCTACTAAATTGTCTTGCACTTCTCACTGTGTTC CTTTTTCGTTGCATGATTAAAGAAAATATGCAGTGCTAAGATTTTGTACC CTGAGAATGTTTAATATACATAATTCTGCATGCCTTATACTCTTACTAGT ATCTTAGCTTGTCCTCCTTGGTGTGTTTCTTTTGAGTTGCATTGGTAAAT GAAAATAGCCGATTGTTTATGCACTTATGCTGTTCTTTGTCCAGTATGTC ATATGAATCATTACGAGATACACTATTCCTTTTCAGGTTTTCACTGCTGA GTACTCTTTGATTTGTAAGATACACGAGTATGCAAAACCTTATATATGCT TGATGGATGGAGTGACCATGGGGTTTGGAATTGGATTGTCTGGACATGGC CGCTACCGCATAATTACCGAGGCAATTGTTTGCAACTTCATTTCTCTTGA TTCTAATGAGTTCTGCTTTCAGCTTTTGCTTTTTGAAGACTGATCATGTT TCTCCAATGTGCTTCTATTACAGAGAACACTCATGGCCATGCCAGAAAAT GCTATTGGCTTGTTCCCAGATGTGGGCTTTGCTTACATTGGTGCAAAAGC GCCAGGAGGGGGTGCAGTCGGTATGCTTTTATACCCCCTCCCTCTTGTTC TAGTAATTCGTAGGTGGTATTCTGCTCCTAATTTATTGTTTAATCACCAT GCTTTTCTAGCCTTTTTTAATTGCATAGATGTTCACACCTCTTTTTGTTT CTCTGTTGTCTCCATTTCTGTTGTTAGTGTTTTAAGATGAACATTTTTAG TGGATCATAGTCAAGTGAATGTTTAGTGGAAATTCTCCGTTTTCTGTATT ATGGAAGAAGTTCAACAGTTCTAAAATCTGACTCTTGGAAGCTATGCAAT TAATGTTCTATTATGGAGAATGTGCAATTGTGCAGTATGCCGGATCATTG CTTATGGCTTTTATCTCTAGTTGATGTTTCCGTTAATACTATGACATTGC TGTGGCTTTCTCTGTCCCCAAATGGGTAAACTGTGTTCAAACCATATAAC AGTCCTCCTTACTTTCCTTTTCACTAACCACATCTTGCTTCTTTCAGGAG CTTACCTTGGGATGACAGGAAAAAGGATATCTTCACCTGCTGATGCTCTG TTTATAGGTCTTGGAACTCATTATGTACCTTCCGTGGACTTGGGCTCCCT GAAGGAATCCCTCTTGAGTGCCAACTTGTATGTCTCTAACTTGGTGAAAA CATAGTAAACACATTAATAAACAATTCTAGTACTACCTCCATCCAGAAAC AACTGACGTGCCTTTGTCCAGATTCGAATGTATCTATACACTAAAACATG TCTAGATGCATACAAATCTAGACAAAGTGAAGTCACTTATTTCTGGACGG AGGGAGTAACTATTTTCTGTAGTTTTCTGTCTATGTATTCATATCTTAAG TTCCATGACACAATATGCTTGCTATATTACTGTACCATTTTGGTGGTATC TTGACATATGTAGCTTTCTTTATCTTGCAGCACTGCTGATCCTCACAAAG ATGTTGAGTCACTTCTGACTGGGTACAAGAAGGAACCTGAGTCAGTGTCC CAGTTAGAAAAGCTTTTACCAAATATCGTTTCTTCTTTTGGTGCTGATAA ATCAGCTGCTGGATCCGTCGAAGAGCTAAAAAAGTGTAGTCAAAGTGGTG ATACTGAAGGTAACCTTTTGTTAAGTTCTTCTTTCAAGGCACCAAGACAA CCCTTATAAAATAAAACAGTGTCAACTACATTTTTGTTTGAAAATGACCT GTGCTATATACAAATTAAATCCAGTACAGTACTGATATGTATTGTAATTA GTCTTTCCTTTGTTGGCTGCAGTGGCAGAATGGGCCAATGATGCTTTAGC AGGAATTAAGAAAGGTGCTCCATTTTCTCTTTGTTTAACACAGAAGCATT TCTCCCGAGTTGCATCATCATATGGGAATAATGAAAACCATCTATCTAAG GTAGTCTCTGGTATCTTGTGCAATTGGACATTTATGCTCGCTATTTCTGT AATTTTCTAATTGTGGCGCTTGGTTCATTCAGTTGGCTGGTGTTATGAAG TTGGAATATCGCATTGCCTTGAGATCGTCAGTTCGAGATGATTTTGTTGA AGGTGTACGTGCTGTCTTAGTTGACAAGGACCAGGCAAGTTACCCATTTC TTAATTTGTTCTATCCGAAAGGGTTTTAAGGTTCACCAGAGGCACGGACT CACACAGTTAGATGTGTGTGTGCATGGTACATGTGTTAGTCACCACTTTT TCCATGGGCCTCCATCTACTGATCTTTGCTCTAAGACTATAGGAGGTCCG ACTAGTTAGAACATTTAACTTTCCACTACCACTGTTAGGACCATAATAAG TGCTACAAAAGCCAGAATTGTACATATAGTTGCATTCTGCAGTGGGGTGC AATAGTAAGGTCCTTCTTTGTGGGGAGGAAGTTATTATTGTTTTCGAGTG CTTAAGTTCAGAGTTGCCATAAGCTTAACCCTCTTAGCCTGAATGTAATC TTGTCATGGTGTGATCTGCAGACATAGGTTGTGTGCAGGCTGTAGAGCAC ACATAGGTTGTGTGCTTCCTGTGTGTGAATAGGGCAGATGAGTTGTGTCC TGTGTGAGTAAGTAGTGCACATAGGTTGTGTACCGAATAGATAGGCATGC TGCAGTGTGTTTTCTGTTAGAAATAATCTTGTCAATGTAGTTGGCTAGTA GAAGGAGCTAGCTAGGTCATGAAGTATCCAGGGCACATAGGTATAACTCT AGAATTAGGAATATTCTAGAGTAACATTTTTAATAGTATGAAATGTCTAG AGTTTGTAGAGTATTCTAGAAGTATGGTGTAGGGTTTAGATTGTGCCACA TGGCAACAATCTACAGGGTCACGTACAAGTATAAATAGGTCCTAGCATAG GTTACTGGGGCAAGTATGGGCTGCTAAGTTCAGTAGGCATTTGTTGCTGA GTAGTGTAGCATCCGTTGCTGCAAAAGCTAATAGAAGAAGAAGGCATCTG TTGCCTGAAACTTCTGTTTGTTCTCCTCTATAGTGCTAGTCCCTCATTTT CTGCTTTTACTCAAAAGAGAGAACAGAGAGAAGAGAGAACAGAGAGAAGA GAGAACAGAGAGGGAACTCTAACAAACCCTGCCAGATGGGTTGTATTGGC AGTAATAAGCTTAATTATATGCTTTTTTCCGCACGCCAGCTTATCAACAT ACAGCAGGAATATCTAGCTAAACAGTTTGGTCTTGTTCAGCTTGTAATGC TGGGAGCTACATCCCGACTTTGATACAGCTGTCAGTTGTGCAGAAGTATG TTCTGGCAAGTGGTCCTGACTCATGAGAATCAGTTGCCTGAAGGTTTGCT GGCTGTAGAAGTATGCTTTTTTGCAGTGTGGCTTTTTGTGGGCTGGCTGG ACTAAAGAATGAATTTTCTGAAATGCCCTTGGTCTTGTATATCATGATGA TTTCCAATACTGCCTATATTACTGTAAATGATTTGTATATTAAATATACG ACACCATTAAGAAGCTGGGATAACAAAAATCTAAACACTGCCACATTTGT CAGTTTAGCTCCTTTTGCAGAAGTCTGCAAGAAGAGATTTATATCAAGGA GAAGTAAGTCAGAGTTACATTTGACATTTCAGATGAAAAATGTTCATGCA TATGCGCTCATGAAATAACCGTAGCAAATATGCAATCAAGAAATTGTACA ACCAACTCTTACATATACCATCTAAACCAGGGGAGCAAGGGAATACAGAA ACTCACCTCTAAATCATGGGAGAAAGAAAATCTCAGCACATGTGGTTTCA GCAGCCAAAGGGGCATGAGGATGGAGAGATTTAGCACTGGCTCAAGGGAG GTGATGCCGGAGTTGGGGGAGGGCATGAGGTGTTTAAAGTGTCACCGCTT CTTGGGAGGCGATGTTGTAGGTAGGCAAGTAGAGGAGTCCGTGAGAAGAA ACAATGTTGGGCTGTAGGATTACTTCACCTTTACACCGGTAGCAATCCTG GGTAAATACCACGAGCATCCAGTGTTAGTACCTCCTTCACAAAATCCCGC AGAAGCAAAGATGAGCCGAGGTGTCTTGTGTCATCTTTGCTTCTGCGGGA TTTTGTTGTGACTACTTGTGGCTACAAGTAGTCAGAACAGGTTAGTTGTG ACTACTGTGGCTTTTGTCAAGCAAAAGCTGTGCCAAAGGGTGTGCTTAAG CTTCTACATGGAAATGCGGCCTAGGTTTATTAGAGCCTAAAAGGATATTT TTTTCTCTGCTATTGTTTAGAAGTCTCATTATTCCTGCCTGTCCCGAAGG AGGTGCCTTAAGCATTTTCATGATAGCTTTTATCTCTCCAAATATGACTC AATTAGCTGAATGTGACCTAATTAACTATGTTAATCATCTACATGATGTA CGCTTTTAATCATTGGGCATAGAGATAGAGCGGTAGACACCATCATTGGA TGGCATCTTTAGAAATGACGGCCCTACTCTGTGTGTGATGGTAGCCTTTT AAAGCAGGTAAGTTGCAATGACTACTCTCTTCACATATAGATTGAAATTC TCTTAATCATATTATGTAGGATACCATGTTCTATTGTTAAAGCTTTGCAA GAGTTTAAGGAATTTTGAAATATTAATTCGAAACAGTAAAATGTTAGATC CTGGTATCATTTTGTCTTGCAAACTGTAATGCAACTCGGACGTTCTTTCT GTTTTTCATGCAAGATGTAGAAAGCTAACTTCATTTTCAAGCTAGCAATG ATAAGCCAGCACACATTAATACGCATTTTTTTTGTACATTTTACTCAAGG GTATGACATGTATCGGGCATTTATATGTTCATTGTGGGGAGTTTTATATA TTCAATGTGGTAGTGGTTCATTGAACTTAAAGGGGATCAGTTGCATGCTG CTAATCTTTATTGTGACTGCGCAGAATCCAAAATGGAATCCACCAACTCT GGAAGAAGTAAACATGGATGAGGTTGAATCAGTTTTTGAACCATTAGCTG CCGATGCAGAGTTGAATGTATGATTTTCTGTAGCAACCCAGAGTCTTATG ACTACCTGAACATCCTTTTTCTTCGGTGATGTAATTGGAAATTGAAAACA TAAATACGCTGTTCAGTGATTGAGCCGCTAAATGCTTAAAGTACGTTATC TGAAACAAATTGGAGTGTAACCATTTGAGTTGGTGACCGATTTTCATGTT GATGTTGAGCTGAAACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.