Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA020549

[Submit comment/correction]

Sequence	AA020549
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA020549
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGACACTTTGCCCGCCAAATGGCACGCCCGGTAATTTGCCCGACAATAAC AGGGGTAGAACGGGTATCGCCGATAAAACAAAGCGAAGGCATGGGCGTGA TAGGCTAGCACCAGTAGCCTAGCCCCGTTTAAGAACAACTACTCGCAACC AAAAACCACTGCACGATTCGTCCGTCCGGATCAAGCGGCGCGCCCGTGGG AAGGAAAAAAGCGATTCTGCTCTGTTGGTCGCCGGCGTCCCCTCTCGGCT GGCCGGCGGCGTAGGGTTCGATCGCGGCGGGGTTGGTGAGCGGGTGGTGG CGGAGTTGGAATTCGAATTGGATTTTGCTGGGGAGGCTCCGGCGGAAGGG GGGCGGCCCGGTGGAATTTCTGAAGTCTCCGAGGTGCGGGGCGGTGGTTG CGCCCGCGGTGCCGTTTTCGTGGAAGGGCGGCGAGGTTCTCGGTTCTCAG TTCTCCCCCCTGCCATTGCGTCGGGAGGCTGCGAGGTCGCTGCGGCGGTG GGAGGATCCCTGGAGGACGCCGCCGGAGTAAGGTGAGTCGCCGGGGTCCG ATTCCGTGGGTGCCGGTCTGGATTGGGGGCGATTTCGGCACGGTTGGTTT GTTGCTGTTGCTGTACGGGTGGTTGGGGTGGCCTGGTCGTGGTGCGCTGG GGTGGTGGGGCCTTCGTGGCCGTCGCCCTCCGCTTCCACCAGATCCTCCT CGGGACTCGGGAATGCCAAGCTTCCCTGCTGCGCGTGCGGCTCCCGAGGC GGAGCTCCCCAGCGTGAGCTGCTTGTCTGATTTCTTTCGGCTCGATTTCT GCAGGTCGATCCGAATTGTGCGGCCGGGGGATTTGGGGGCCGCGGTTTAT GGCCGATTAGATCGGGGAATCTCAGCTGGCTCCCGGTGCTGCGATGGCCG CTGATTCCAGCATGGGGTTCCACCACCAGGGGATCACCGCCGCCGCATAC AACAACCACCACCACCACCACATGCTCTCCTTCCAATCCAGCGGCAGCGA CATAAGCATGAGCGGCGGCGGCGGCGGTGCCGGGATGGGATTCGCGACTC CAAGGACTATGAGTGGGACCAGCAGCAGCGCCGGCATGTACCTCTCCCCG AACAATAGCAACAACGGCGGGTTCGGCAGCGCGTCCGTGGTTGGGCCCTC GTCGAGGAGCACGTCGGGGGACGGGTTCCGTGCCGGCAAGTATAAGTTCA TCACCGGCTCGCCTTCGGAATGGAGTGAACGTGAGCAGAGTATACTCAAG GAAGGGCTTGCCAGGTAAACTCGAGTTTTTAGCACCTCCTCTCGCTGAAT TACTGTTCCTTGCTTCTGCTGTGCCTATGGTGTTGCTTGTGCTCATGGAG CTTGCCAATTGGGTTATGCGGCAAGCTTCTTTTCCACCCCATGTGATGTG CTTCAGTTAATGGAGCATCAATCAACAAGTCTAAAGCAGGATTTGTGCAG CTGAACCTTTTACCTTTTCGAGTTTTTAGCACTGCCGAGCGCATCTCCTA TAGCATCGCTTTCGTCATTATTTGGCAAACTGTAGGACTGCACTTGGTTT CTTTCAACCATATGCAATTAATAGCCACACTTTTAAGTACTCTGTGACCC GATTTTGCATTACAAACAAGACCACAAAATTCTAGCGGATTGATTCGCGT CAAAGGAATCTGAGAAAGAAAAGAGAATCATGTCAAATGTCACCATATGG CTCAAGCACCATGTCGATTAAACAAAGCCGATTCCTTTCTGTTGCTAATT CTTTCTCCCATGGTCATGGCAGACATGCTCGAGAACCTAATATGATGAGG TACATCAAGATAGCGCGTATGCTGCCCGACAGGACCATCAGGGATGTTGC ATTGCGGTGTTGGTGGGCTACAGTTAAGTTTCTTCCAAATGTCTTAAGTA TCTCTTCTCCGTACTTATTCGGTTCCAATGTTAATGTATGTTCTTTACTT GCTTGAGAACGTCATCTTGATTAGCTAAAATTCTATTTAGATGGCACTGA AATTTAACACAACTGGTGACTTCACCACAGTCCCCTTCCTTTATACTACT AGATGGCCAGTTACCAACATGTCGATGAACTATATAAGGGGTGTAATAAA CTAATTGTGTCTTCTCCTGGACAAATTTTACATATCTGCTTTCTCTAAGA AGAGCTGTGTTCATGTGATTCCAACCTAGATATAAGTATTGTGATGCTTG GCATTTTTTTTTTACTGCATGCATTGTTTCTTTCTGATACATATTAGTAT AACAGTAAATGCATATAAACAACTATGTTTTGCTGACATGTGCTTATTGT AACAGGGCAAAGATAGAAGGAAGAAACCAGATGGGTTTTTTACAGGAAAA AAGATACGAGACATGAAGGTACTTTTCTATTTACTGTTACATCATTCATA ACATAATCTGTTGGTTGGGGCAGCTTTTGAGTTGTGCTGTATGTTAGTAC TTTTTCTAGTACCAGTCAGTTCTTTGTAATAAATTTTTTTTGACAGCCAA TGCAGGACAGAATGGCTGCATCGGCGCCAGTGGCTAATTTTCACATGGCA CCTGCAAACAACTTGACCCCTTTCTCAATTTCGATGCAAAGTCCAAACCA GCAGTGTCAAGTTCCCAAAGAAGGTCAGCCCCCATCTCTAACCTCTATTT ATTTTCTTGTTTTTGTTTGGTATTTCCTAGTATTATCTTCACTCTGTCTG ATAACGTTAAGGTTTGGATTCACTGTTTGGTACGGAATTCTCAAATAGCA ATATGATTTGGTTTTGAATGGTGTCAACTATTAGAAAGGGATCCCTATTA GAAACTAGCTAGCCTCAATGTACCTTTCCATTGCCTATCTGATTCGAACG TCAGATTTGAAGAAGTAACACAAATAACGCTAATGGTTGACGATTCTCTT TAGATACTCTTATGATCTGAGTGGAATTGAAGATTTCTTAGAATTCAAAA CACTCTTGGTTTGTTTAAGTTGATGTTTTGCTTGTTACCTTCGTAGTTAG TACAAGCATCATCTGGAAGCAATCTTGCGATGCCTTCATTTGGTGTGTTT CTATATTTAGACTGAATTTTCTAGATCCCAATGTAAAAATGAGAAAACGC AGCACAAACTCAAGCTAGATTATGGAACACTTAGCACGCATTCTAGAACC TTTTGGATATGTAACCCTCTGAAGGTTGTCAAGATCATGTAATCATGTTA AACTATAGGAATGGAAGGTTCTTACTATGTCTGTACGAGGCAAAGGTTCC ATTACCTTGCACATTCCTGTTAACATTTATTTTTTGTCATTGTATTTCAC TTCATTTAACTTCAGTACAACGCTTCATGGAGACATGTAACAAATCATCT TCACCTTTAATGTTGCTGTGTGCAACTACCTCGTGTTGATCCTTTTTTCA TCTGACTACAAGTCTTGATTGTTTTCATTCTGAAGCGTCGACAGCCACAT GATTTCCTTTTTTCTTCTAAAGATCACCCATTCTCATCCTTTTTGAAGCA GCTGCTATCCTGGACAGTGCAACCCAGCAACTACTGGAGCAAAACAATCA GTTACTTAACCAGATTGCTTCAAATATTGAAACATTCAAGGTATGTTTGT TGACATACCTCCCATTTTTGGGTCTTAAACTTCATCTTGTAATAGTACCC GAAGTGCCAGTCAAGGAGCACACGGTCCCTGCCAAATGTCTGGATTTTTT TTAAACGGGGGCAAAAAGATTTGCCCCAATCTATTAATTAAGAAGAGAAT TGCCCAGTTAATTAACGGAAAACCGGGCAAAAACCGCTACAGCAACCACC AAACCACAAGAGAGCACATCTAAGGAACACAACCTCCATAACCAACAAGT AGCCATAACCTACTACAACTGCAAACTGACGACACATAGAGCACGACGCC ACAAAGAAGGCCCACCTAACAGGGACTCAAAAGCTCAAACGTCTGAATTT CATTGTGCCTGTTTGTTTTACATATTAAATTTCTCATGATCATTTGTGTT CAACTAGTCCTTCCACCAAAAAATGGACATCCTATTACTGGTATAGTAGT AGTGCCCTACTAGAATTTTCGGAAAAACTGAATCCAAGATTTATGTAAGC ATCTTTCACAAGCTTTACGCCTGATACAGTGGTGCCTTTCATATTTAAAT TACATGCTTCAGCAACATATGCTATTGAAGTGCCCTTTGTTCTGGGTGCA CTGCCTGTACTCTCTTGCCATTAAGTTTCCTTCCTTTCTTGGATAACTTT AGTCTTTAGTGATTCTTGATGTATCAAGAGATATGATAGGGACTGTGCTT GTGCCTCGGAAAATCTGGGATGGGTGTACTGCATCAACAATATAAATAAC AGAGGAGTTCATGCAAAATGCCATCCGCCGTTGAGTACTAATACAGGCTA GCATTTAACTATGTTGGAACTTGTCGCTTTCATGGCCAGCTTTCACAACT TTAAAAAACGTGATGAGCATGACAGGGGCACATTCTGCAGTTATTTCATG CCTGAAGTTCTTAGTTTCTTGCAGGCGGAGGAGAACACGGGTATCTTTCT TCGGACAAATAACAACATCAGAACAATTTTAACCAGGTAAGGCCACATGA TATGTGCAATTTTCCGTACGCTGCTCATAGGTCTTTTCACTGTCATCATT TGGAACATCTGCTTAGGGAGGGATAGTTTGCATTTCCTCTTGTCTCCTTC GATTTAACATATTCAGGTCATATCATGTGTTTTATTAATCTGAATGTATC ATATTGCTGATGACTAAAGGAGCTGATATAGTGCAATAAGTAATGGTGGC CAAAGGACTATTTAAGTTCAGAAAACTTTATTTGTTGCTCTCCTGAGATC TATATTTTACTGATCAATGGTCTTGCGTAATGTTCTACAGAAGAATATGA TGATCATTTCAATTACTAGTAGTTTGTTAAAATTGTAACTAGCTTATGCT TAATGCTCTGCTTAAATTTATTTCTTAATATTGTTTTGCAGAATGAGCGA GACACCTGGCATCATGGGTCAGATGCCTCCTCTGCCAGTGTTTGTACATG AAGACAAGCTCAATACACTTCTCCAAGTTGACAGAATGGTAAGAATATAC AGCCTAGCAGTTGTAATATGCACAACACTTTATAACGTGCTGCGATGTTA TAAGTATTTATTCACTTGAAGTGGTAGCAACAATGTCTCAACTGCGCAAA ACATTGTTTTTATCGTGAAGGTCCAATCTTATGGCGCATCACATGCCTCT CATATGAAGCAAGAACCTCGAAGCTAATGTGTGGCAAACACCCGAGACGA GAACGACCTTCTTTCCCTCAGTTTCATAGCCGTGCCGTGAGGAATTCTTT CAAGCTGTTATACTGACCGAGCGACGGGAATAGTTGCTGTGATTTGTACG AGATCACTTCCTACCCTTCCTGTTGAAGCTTGCTGAAGCTCAGGAAAGCG TATTTGGAGCGGGTTCTGCAGTTGTGCAGGCTATGCGAGCGGATTGCTGC TTTTCCTCCAGCGGCCAACCACCCAGATACCTGATTCGGGACTATAGCGA AGTGACTGTAAATATTGGATGGCCGGAGGCATTCCGTGTTTTGTTTTCTT CCCAATTGGTCGTGAATACATTTTTAAAAAAGGGCAGTATTTGAATTATT TC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.