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GrainGenes Sequence Report: AA016781

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Sequence
AA016781
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016781
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGACAGCCTCCACGGGGCTCCCACCTGGCCATGAAAAGCGCACCCCTATC
CCACTCGCTCCCGTAGGCGCATCTATCCCATCGATCCCCTTTCTCTCAGT
CGCTCGCCTGTGCCAGTTCTGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCAGAGGA
GCCTCGCCGCCTCAGATTTCTGCCAGTGTCCTGGTCCCTGCCGGAGATGC
CCCTAGTTTCACGCGCTGTGCCCCTAATTCGAGCGTCACCGAGCTGCCCC
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GCTTCCCGCGACCGGCCCGCTGTGCATCCCTGTCCCATGAAGCTCGGTGT
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CCCGAGGTATCGTCATGAGAACGGCTGGCGATCGCCAGCGCGGTCTTTCT
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TTGCACATTCCTAAGCTTGTGGTTCTAACTAAGTTGTACTCCCTCCGTTC
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CAGTGGTTGTGGTTCTAACTAAGTTGTAGGTTTCAGAGAACCTAGCCGTT
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GTTTCAGATTACCTAGGAGTTGTAGTTTGTTATGCACTAAATTGCACTGT
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GGACCTGACCGTGTCGATTACCACTAATTGTTTGTGTTAATCGTTTAGCC
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ATCCGTTAGCCCGTCCCAATGAAGTAGGTTTTTCGAAGATCCCTCTCGAT
CCCTGCCTCCAGGAGCTTGATTTCTGCCATCACCAGTCAGTTCCTTGTCA
TTATTGACCAGTTCCTCATAGTTGCCGATCAGATCTTAAATACAAGATCT
CGAGCGCCTTAGGGATCTCATCTGGGAGCTCGAGGATCCCTTTAATATGG
TAGGTGGTTGGACCGATTAAATCAATTAATCATCCGTATTCTGATTATCG
CTACTCCCAAGACAACCGAGCAGTTAACGATTACCGATTTTCTTACCATT
GCTAAATTGTAGTTGCCGGATTGCATAATTGCTTTTCGTGTGCAAATAAG
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CAACTCATATGTTAGCGGGTTGCTTCTATCATAAGTTGTAATTTGTCATG
CACTAAGTTATAGTTATCAGATTACCTAATTGCTTTTCGGGTGCATTTGA
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TTGCCGTATTACTAGTTGCTTTTCGGGTGGATTTGATATGTTGTAGTTTG
TCTTGCACAAAGGTGTAGTTACCATATTACCTAGTTACTTTTCGGGTGCA
GTTAAGTTGCAATTCTTGGTTGCGCCGTGTTGCTATTGAGATTGCTGCAG
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ATTACTGGGATTCTGGATCTAAATAAGTTGTAGGTTTTCATGCCACCTAG
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TACTAGATTACCTAGTTGCTTTTTCAAGTGTGGGTAAATTGCAATTTTGT
TCCATTATGTTGTTGTTGAGATTGCCACCTGTTTAGAATCATCCCTACTA
TAATATAGTAGTCACACCGTCTCAAAATAGATGTTGGAAATTTTTCTAAA
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CAAATTTATGACATCTATTTTGGGAGGGCGGAAGTATAATATAATTTTCA
CTTTTAACACTAAGTTGCTTACCAATAAATATTTGTCGGAATTCCGAATT
TGATTTTGTACTGAAGTTTTCCATAGTTTTGACGTTCAAATCGAAACATG
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AATCTTTTGGTACTAATGCCTTTGAGTTTTGTGTTTTCTTGCAGATTAGT
GGCTTTGGAAAATTAAAGCATTAGTTTGTCAATCAAAGTACTTACATATG
AAACCTGATTTGTGCACAGTTGCTAAGTAGATTTTAGTTTGCAGCTGGTC
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ATGCTCTTTGAAATTTTGCAAGCGTGAAGTGATTTCTTGCCTGTGCTTCA
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TGGATGTAACAGATTTTTTTGCATGTGCAACAAGCGGAAATGAAATAAGA
GTAGTATTTTATATACATAAAATAAACGTGGTGTAACCATACAAACTGGC
GTATTTTTGACAAATCTGACTAGTTTGACCAACTTCAACCGCGTCTGCCC
TTCGGGCGAAACTAATTTGGAATCTGACCCCTCACTTCGGCGTCACTTCA
AACGGAACTTGCCACTGGGGCGGGAGCTTGGCTGACGTGGCCGTTATGTC
GACGCCGTTTCAACTGGCGCCGACCCTAGGGTTATACTCAATCGAGCAGT
TTCCTTTCTCCCCGATCCAATCAAACCACCTCCTCCCGCCGCCGCTCCTC
CGCGACGCTGGCCGGTGCACCACCTCCCGCCGCCGCTCCTCCGCTCTCCA
CCACCTCGCCGCCCATCTCCGGACCACCTCCCTCCGCTCCTCCACCATCC
CGCAGGCCGGCTGCCGCGTCCGCACGCACGCAGGTGGGCTGCCTCCCTCC
GGCGGGTGGGCTGCCTCCCTCTCTGGCCATCTCCTCGTCCCGCACCTCTC
CCCTCCGGCCGCAGGTACCTCTCCCCTTCCCTCTCCTCTCTCAAATCCCC
TCCCCCTATTCTAAAATGTTTGTTTGTGTGTGTGTTGTATGTAAAGTAAT
GTTGTATCTAAAATGTACAAACTAATGTTGTATGTAAAGTAATGTTGTAT
GTAAACTTCGTTAATTGTAATCATACAATGTAATTATGTTGTATGTGAAG
CACATGTTCTAGTTAATTGTAATTATTCAAGTGTTGCTAATGTAGACATT
TTAATTAGATGATATTGCTACAAGTTTGGCCAACACATGATGTAACATAT
TGCTAATGTAGATAGTAATGTCGATATTTCACTTAGATGATATTTTGTAG
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GGTATTGGCTAGTTTGTTTGTGTGTGTGTTGTAAGCATGTGCAACATATA
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TTAGAGCAATGGTATTTTAGGGTGATTGTAGATGGCATGGTATTATTGTT
TGAACATTGTCGCATTTTGTTCGGTATTGCATTCTCTAATGGATGCTTTG
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GTTGTTGTCAAGGTTAGAGCTGCCCTTGGATGGAGTGAAAAAGGCGATGA
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AGATGATCCCGATCAACGGTGACAACGAGTGGGATCTATACAAAGAGCTA
GTGGAGAACTCGCAAATAAAATCTTTGGTCGTGTTTGCCGTCAAGGTCAC
CGGGCATGCCCATCTTCTCATCGACTTGAACAAGCGGCCCTCGATTATCG
AAAGAAGCAATGATGACCGTCCTGAGGATGTGTATGATGCGGGTCCAAGC
CAACCGCCTGTGTGGGACACAGAAAATCAACAAGATGAAGATTACTTGGA
GGAGATTGTGGAGGAACCCATTTATGTTGAAAGAGAACGAGTAGAGATCA
TCGAGGAGAAAATGAATGTTGAAACCTTAGAGCCGATCGAGGAAGAGTTT
GTAGCTGTCTCGCCAATCAACATTCCATCATCGCCTTGTGTACCTTTGGT
GGCATCCTCGATGCTTGAGGGAGATCCATATACCTATGAAGATGACAATG
AAGAGGACGAGGGGTATGAACATGCTTACGCTACGGACTCGGACGATGAT
CGTTCGGTTCCCAAGTTTTCGGAGAAGGAGACCGATGCATTTGTCAAGGT
GTGGGGCAGAGATCCTATTGTTCATGAGTTCAAGGATGTTAGGCAGGCTC
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GATATACCCGGGGCTAAAATTCAAGGCTATGTTGGACATGCAAGTATGGT
TCCAGGAGTACGCCGTAAGTCATCATCGACCCTACATAGTGTTCAAGTCC
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GAAGGTATGGGCAAGGAAGAAGAAACCTGAAGGTTGGTGGAAGATAAGTA
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TACCGGCAACTGACATCTACTTTTATTGCACACCGGTGTGCCAATGCCAT
CAAAGCTACCCCTACCCTTCAAGCGGCCTCTTTGGTCTAATTTGTGAAAC
TCATATTTGACTATCATATCAAGTATGGAAAGGCTTGGAGGGCTAAGCAA
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CCCTAGGTTGTTGGCGGCGATGGCACATCGAAACCCTGGTATGACGCACA
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CAAGTGTTCCGTCGAGCATTTTGGTGCTTCCGCCCTTGTGTTGAAGCATT
CAAGCATTGTCGTCCATTTCTTTGTGTGGATGGAACGTTCCTTACAGGTA
AGTTTAGGGGCACCCTTCTTGTTACTATCACTTGCGACGCGGACAACCGA
TTGGTCCTGCTTGCCTTTGCTCTTGTGGAAAAGGAGGACAACGTCAGCTG
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AAGTCTGTGTCATTTCTGATCGCAATCCGGCCATATTGAATGCCATGAGG
GCAGAAATACCTGAGCATCCCCTTGTTAAGCACCGTTGGTGCATAAGGCA
TTTCGCGGGTAATTTCTACTGTGCTTGTCGTAATAGAGAAATGACTGAGT
ATCTCCGTAGGCTTACCTTGGTGTTCGAGCCGGCTGTATTTGAAGAGATG
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GGAGAATTTGCCGAAGAAACACCTATGGGCTCAAGCTTTCGATCAGGACG
GGGTTCGGTATGGTCACATGACAAGTAACATGGCCGAGATATTCAATAAG
GTGCTAAAGGGTATCCGCACGCTACCGGTAGCTGCCATCGCATCCTTTAC
TTCTGACAAGTGCAACGAGTATTGGGTCACGAGGAGCGACGAAGTGAAGG
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GGATACCAAGCCACGAAATCTCATGACCAAACATGGACTTGTTTTGATAA
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TGCACGTGCCAGATTCCTTTACATATCCATCTACCATGCTCTCATATAAT
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AGATAGCAAGCTAATGATCGACACAAAAGGGCGAAGAGCGACTAAGCGGT
TCAAGATGGACATGGACCAAGCCGATGGAGGGACAACCTTCAAGCGACCC
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ATGCGGCGAAGAAGGTCACAAGAACACAAAAAACTAAGTTATGAGGATCG
GAAGAAGAAACTAGCCGCGGAAAAAGTAACCCTTCATCAAGCGGGCGTGG
TAGAGGCCCTAAGAGGCCTCGAGGGACTAGACATATGAAAGGTTATCGCC
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AAGGTTATATTTTGTCCTATGCTATAAATTATTCTTGTTAGGTGTCTTTA
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AACTCACAAAAAAACCTTGTCTTTGCAGGATGGTGGCTCGGGCACGGTAC
CATCTTCTTGAGGCGGAGTACGAGGAGAGCCACCGAGCTCGCATACTCTC
GGAAACCAGGTATGCACGTATTGTCTAACATGATCATCACTAAATTAATT
ATTGTTCTCTATTACTGTTTATTACTTGCTTAACTAATGCTAATCGCTAT
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TCTGATTGGCTTTGTGACCATGATTGAGCGCGGGCTGCCGACCTACAACA
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CCGTATCACGATATGCTCGAGCGTATGTGATGTATGTGTTTGGGAAGGTG
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GGCTTACTTGTATCGCCAACTTGATGAGGCTTGTAGGAGGAGCAAGGGTA
CATCAAACATGGGTGGTTGTGTTCTGGTCTTACAGGTTGGTTTACTTTGA
CCAACATAATTATTTGCATTACCATTTAGCTTTGCATAACCATCTAGCTT
TGCATAACCTATTTGCTTATTTACAGGTTTGGAGCTGGCTTAGATTTCCC
ATAGGCCCACCCACCACCTACGCACCCAGGGATTGGGAACACACGGAAGA
AGACCGTGCACCCACCATTGTGTACTTTTATGAGGATGTATCTACCAAGT
GGGGGCCCTCCGATAATCTGTATCGATCATACACCGAGGATTTTGACTCC
TTGCGTCGGGGGCAGGTGAGTGTCATATCGATTTTGACTCCTTGTGTACT
TTTATGAGGATGTATCTACCAAGTGGGGGCCCTCCGATATGTTGTCATTG
TTGCCTAACATCTTCTTTTTTCACTCATAGGTTACATGGAAGCCGTACAC
TGTGAGTGAGCTAGGCGAGGACTTTAACTTAAACCCGATGTGCACTCAAG
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GAGTACCACCTTCCACACCGAGTCGGGATGCAGTTTGGTAAGCTTCAGGA
ATTGCCCCCGGAGCACTTCTCCACCTCGTCTGATCTGCACAAGTAAGATT
CCTTCAGCGCCAACCCATTTATCCTGTCACATATATGTTTCTCCTTTGTT
CTTCATTGTCTCCTCTATGTGCTTTTTGATAGGCTTGATAGAAGGAAAAA
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AACAATAGCCGAGACTACGAGACATGGCTGCAGAAAGCTACTCGGGTTCA
TCTCAAGCCCAGCTGGACCAACATCGATTGCTTAGAAGAGGGGTCCGACG
AGCCAAATGAGTTTGATGAAGAGGTCCGGATGGACAAGCGTGTCGACCAT
GGCTCCGTGCGAAACCATGTGGTAAGAACATAGTAATATCAAGCACTGAA
TTATTTGCTAGTTCTCGTTGATGATGTTCATATGTGTCATGCTTTGTAGG
CCGGTGAGCTTGTACGAGGTATCAAAGAAGCTGAAGTGGCGCTGAGGGTT
ACTCCAGGAAGTCCAGCTGCCGATTCTACCCTACGGAAGTGTCTCGAGGT
AACGACTAGCAAAGTTCACAAGTTTGGCAAATGTACATATGTTTCCCGCT
CATGTCTACAAATCTAGCCAACACTTACATTGTTCTATTATGCAGAAATT
GGTCAAACGTTCCCACTCGTTGGTGTCTAGACTTGGATGCCGGGATCCTA
CCGCTGACATGACGAGTCTCCAGCCGAGCCCTCCAACTTCTGGTGGCAGC
GAATCCATGTACAATTCAGGTGACGGGACCTCCATCGACTCTGACACTCC
GTTGTCCATGTTCCGTGGAGCTTCGTCCTCCCAAACTGTCCATGATGGTC
CGGAGCCAAGCCAATCACAAGGTATGCCTCGTAGGGGTTCTCGTGCATGC
CACGCACCGGATATTACAACCCCCGGCACTGATGCTCTCAAACCACGCCG
TAAGAAGGGTGTCGTCAAGAAAAGGAAGGCGCAGAAGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.