Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA037034

[Submit comment/correction]

Sequence	AA037034
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA037034
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTTTGGAGAGTGAAAGGAGCCTTTGGCCGTCTTCTCGCCTTCTCCCCTC GCGCCGAGCTCAAATCCCTAGCCCGGACAAAGCCCAACCTAGGGTTTCAG CTTCCAGCATGCTCCCCTGCTGACCCTCCACCTCCCATGGCGCCGACGTC CTTATTCCTGCCATGAACACGGACCCAGGCCACCTCTTCAGCAAACGCCC CCTCCCGGCTGACGGCCGCCTCTCCGGCGACTTCCACGGTCCGCCGCGCA AGCGCCGCGTGCCCCGCGTCTACGGCGAAGCCATACCCCACTGTTTCCAC ACGCCGCCGCCGGAGGCGTCCACCGATTTCAACATGACAAACTTTCTTTT CAGCCTCTCGGACTGGGTGAGATCACGATTGGACAATGGCCTGGAACTGT TCAGGTGTTGGGCCTGTGTGCCGAAGGATGCGCGACAGCATGCTCCGGAT CTCACGTTTCTGACCAGGGACTACGATCTGGAGTCAGGGCGCGTGGTGAG GAGTTGGAGACTCGAGGACCCAATTAAGGTCGCCATGGAAGCAGCGGCGC CCCCGCGAGAGAAGAAGAAACAGTTCTGGGAGAAGGCCTACGAGGGGACG AAACAATATGACGCTAAGTTGAGTGAGAATGTGGTGCAGATAAGTCTTCT AGAGAAAGCACTCGAGGAGCAGAGGAAGCTTGCTGAAGTGCCTGAGGAGG TATGTTTTGTTAGCACTTATGTTGTTGGTGTTCCTGTGCTGCTTGAATAT GAAGATTATATGGTTATGTATGAGAGCTTGGGATGAGAAGAAAACCATTT TAGCTTTGGAATTGTCTCATTGTCACAAGTGTGGTCAATTTTATGATTCC TGACCTGCATTAGGCTTTTGATTGAGGAAACTAGTGTGGCTTAACCTGAA TACATTTTCTGAACTGACAAAAAAGGGAGAAGGACTTGTAAGAACATCAT AAAATTCGTTGTATTCCTAGGATTCAACCTCCTTTTAACCACTTCAAAAT TTTGAAGAGGTAAGATTCTCTGTTATAAAGTTATACAAACAGTTCTCTTT CCATTATATTTAGTGCATATATTAGTATACCTTGTTTGCAGCTCTGTACC ATCCTTTTATGCTCTAGTTCACTGTTGGTTTATGTACGTTCATTTGTCAC TCCTGCAGGATCTCTCTGGATTCTTTATACCTCTCACTGCAGAAGAGGAA ACAGTAGTTCATGACTGTTTGTATACTGGTTCAGGGTACTTTCAGTGACT ACCTTGTTTGTTTTTCGGATCTTCATATATAACTTGTTAATTTGTTATCA CAACTGAGCATTGCCCTTTTTTCCTTACAGTAGCGAAGTCCTAGTGCTGC ATGAGTTATCTAACATTGAGGTTAGCAGAGAGAAAATTCGATGCTTGAGA CCGGGTGGTTGGTTAAATGATGAGGTAAATATTCATCTAAATGTGTTAAA CAACCTTCACTTGTTGCTAGCATGTAAGCTTTACACTAATACATGATGAC GGTATTTCTATGCATAATGAGGAAACTGATTTCTCTTGTTTCTGCAGGTC ATTAATTTGTACCTGGAATTGTTAAAGGAGAGGCAAATAAGAGAACCCAA AAGGTTTTTGAAATGCCATTTCTTCAACACATTTTTTTATAAGAAGGTTA GAATATATGCATCTCATGCTTTCTCTTATTGCATCTGCAGAATGTTATAC TATTACATATTTGTGTATATTTTTGTCTGTTAGCAACTTATGTTTTTGCA TTTCTTCTAATCGTATTTTCTGCCATTACAATCCGAGAGTATTATGTACA ATATGTCCCTAGCTGCGTATGGCTGGCGATTTAGAAATTTTGCAACCATT TTGAAAGTGTTCCTTTGGCCACAAATTCTTAGAATTATAGGTTATCAAGG AGTCGAAACATCTTTATTAATATTAAACTAGCAATACACCCTTTGCCATG CTACAGAACAAAAAAAAGATGATGACCATAGTTTACCCAGGTTATATGTT AAGTTAATTCACTTTCATACTTTCGTTTATCGGGGGCGGCAGAGGTGACG GTAGCTTGCTGCAATGCTCGTGGGTTTACATGGTCCCACTTGTCAGGGCT GAGATAAAAGAACCAGCAAAGGAGTGAACAGATGAAATCTTTATAAGTAG GAAATCTGATTTGGTGGCGATTTATCCACGCCCCCTGTCTCCTATTTTTT ATCCTGATAGAAAAGTTAGCAAACTAACCAGCAGAAATTCTCAGCCTAAT TTATCAAACTATTTAATTATCCTAAGAAATCTCTTAACAATACTGGGCAC AACGAATATCACGCTGACTTGCCGTGTTCGGTGGTACTCAGACGAATGTG ACAGGGCAACTGAGATATTGAAAAACCAAGTCGCTAAAAATGGTTGACAT GAACTGTTATGTATGTCTTTTCTAAGCAAAGCACGAGCATAGCTAGTTAT AACATCGCAAGAGTATTGTATTATTCTTAAGTTCTGCTAGTAATTTATGG ACATGTATATGTCCCAACTCCTTATGCATGTTGCTTTAGAAATTATGCAG TCTTGAAATTGTCCCTTTGTCCACAAACTTTATAATTATAGGCTAGTACA GACTCACAACATTAATACATTATAATATCTTATGGAAATTATTATTTTTA AGCCTAATCATGCTATAACTTCCATGCGCCCAAGTTACATATTTAGTAGT CAAATTTGGAAGTTTGGGTGCATGTATACAATGTTTTCCCTCCTTGATTG ATTTGAATCATTACTTGGGACATCTGTTTTGAATATGTTACTCCCTCCGT TTTTATTTATTTCGCGTTCTAAGTTTAATCAAGGTCAATCTTTTTAAAGT TTGAGCAAGAATATAAGAAAAAATATCAACATCCATAATACCAAATGCAT ATAATATGAAAACATACTTTATGACTATTCTACTAGTGCAATAGATTTTA TGTTATATATTATAGTATTTCCTACATATTTGGTCAAACTTTACAAAGTT GGACTTTGACTAAACCCAGAATGCAAGTAAATGAAAAATGGAGGGAGTAT GTTGTTTAGTGGCATCTCTATGGCTATCATTTTTATTTGAGGCATCTGTA GTATTGTTTATTTAAGTTAGTAGTCAAAGCTGGGAATGTTTCAGTCCATG CATGCCAGGCAACATACATTAGTAATGGAGAGCCACATACATTTGTAAAT GTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTG GATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGGTTCATCCAAATTTTGACAAA TCTAAGACATCTATTTTGGGACGGAGGGAGTAGTTCTCTGTTCGGCTTCT TGGGTTGTATTGTTTCTTGATTTGAGACCTTATATCATGCATTTTAGTGT TCTGTTCTTTTTTGGATAAAACTGACCACCATCTAATTCAGCCTCATCGA TTCTCTGAATTTTTTCTCAGCTTGCTTGTGGAAAAACAGGATATGACTAC AAATCTGTTAAAAGATGGACTACCTGCAAGAAGTTGGGTTATGAGCTCAT TGAGTGTGATAAAGTAAAGTCCTTGTTGCAGTCTTTAGATTTCCTCTGAT GTTGTTGCCATCCTTGCTCTTTGACATGCTTATTTCTCATGTTCAACTTA TGTTCAGAATTTACTTCGCAGATCTTTGTCCCTGTACATCAAAGTATACA TTGGTGTTTAGCAATTATAAACATGAAGGCGAAGAAATTACAGTATCTCG ATTCTCTTGGTGGCAATGATCCTTGTGTAGTAAGTATGCTGGTAAGCTTA CCTGATCCATTGAGAAAAAAATCCATTTGGAGATGCACATTCTCTGTACT GCATCTGTTCTTCACTTGATGTTGTAGAATCGTATCGAACATTCCAATTT TTTCCTCGAAAACAAAACTTCATAAATTTCACAGCCTAGATTTATATTTT TTAGACTGGTTATAAAAGTTGAATCATTAGATTTATTATTGAAATGAAAC TATATTCTACTGTAGTACATTTTTATGGGAGTTCGTAAAAAAGAATTCAA GTAAGTATCTTTTTAGGATGAAAAGGGTGAGTAGCCTGCACCATTTAATG AAGGGTTAATTGGATTCATTCCACTATAACTTTCGCGATTTGGAAAAATA CCATTACAATTTTGCCATACCTCTACAGATGCCATTTTCTTCACTTAAAA TACAATAACGTTTAATAAAAAATTGAATTCAATTGTGTTTTAGTATTGAA TATACTACCCTTGTCAGATTTTGGCAGCATGCCCTCTTCCTCACAGGGAT CAAACAAGAGGAAAAAAGATGCCAGATTTTGGCAACATGTCCCCCTTCTC ACGGGATTTTTTGGCAACATTTGGATAGAATTTTGATAGCAATCCCCCAG CATTGTGGCCATTCTGGATACTGAGAGGGAGAGGTTGGAGAGAGGCTGAC CCGGCAGCATGGGATGTTAGTGGTGACTGCATCGAGATGGTATCGAAGCC TATTCAACATGCCCATCAGGGTAACCTATGGCCGCAGCCTCGCTCTCTTT CAGCCGCCGCTTCCCGCCGTGATGCTCGCATGAGAACTGGGGTCGCTGCT CTCCCTTCCAGCCGCCGAGTCCACCCGCTTCCGCTGGCCGCCAACTCGAG ACCTAGGTTCATCTTTCGTGCAGGGTAGGTGGGTTTTTAAGATTTCAAGT GGGATGGGTATGGGCAGCCCGTGTCCGCTGGACTACCTGGGTCATACGGG AGATTCTGAATCGGGATAGGATGGACTAGCGGGACCCGATTTTTTTTTCT GTGACATGAACTAGGCTGGAGCGCCAATTCTCCATGGCACCTCTGAGTCT CAAACGCAGGTGACAGACAAGCAATACACCGGCAGCACAAAGGAAGGCAT GATTATGACCGAGATGGTGGCGTTGGTGGCTCACGCTACGGCGACATCAG TTGTGACGTCCGTGGCCGAAGCTACGTAGTCCACGGCTGCACCTCGCCGG CTCGGAGGTGTCTCCTGGCAGACTGGCGAACAGCCGCTGCGACCTGAACC CCTGATGCGGTTCCAGTTCCCATGCCCAGCGGCGGCTGGCTCCGCGCCAT GTGAAACTGCACGGCAGGATTTTTTGGGATGCACGCGGGATAAGTGGGAC GGTTTGCTTCATCCCATACAGGTTAGTAGGAACTGATTAGAGGGATAAGT GAAAATTATCTGATGGGATGGGACGCTGGACAATGGCACGTCCGTCCCAC TTGAAATCTTATGGGTTTAGGTTCGATTCGAACCGGCTGGTGCTTTTAGC TATTTTTGGACAGTTGTATCCGGATACGTATAGAAATACGGGGCGGGTTG AAGGCTTTATTTGGTCCTGTATTGGAGAAAATGGCATCCATAAAGGTATG GCAAAGTTGTAATGGCATCTTTCCAACTTTGGATTTTGTAATGGCATTTT TGCAAGTCATGAAAGTTGTCGTGGCATGAATCCAACTAACCCTTTAATCA AATGAAGCCCCAGATCCATTCTTTGAGGGCTTATCTTCCGTTAAGTACAG AAATATTAGGCTTTGGGTGGTCTTAAGTAAACTTTTTGGTACGTCTCTTC CAATTCTCATACTATGTTAATTGGGGAAAACTATATGGTTGTGGATTTCT GCACATCTGGTTGCTCTGGGAGAATTCACATGATATTGGTTCTATCCAAC TGTCAGAAATACTAGATATTGTGTGTTTGTAGGCTTGTTTAATTTTATCA ATGTAATGGTGCTTCTTGTGTATGCCATATACAGGCCAGATATATTAGGC TTTGTTTAATTTTTACTCCTGGGTTGAGTTTAATGTAATGGTGCTTCTTT TGTATGCCATACACAGGCCAAATATATCGTGGAGGAAGTGAAGGACAAGA GTAATAAAGAGATCGACATAAGTTCGTGGACGACGGAAGAAGTAGTTGAT TATAACCCTTTACAAAGGAATGGGTATGTCTTGTTTATGCTAATATGATT ATTTCTTGTGTAAATTCAACTATTATGTCAAACATTCGCCTTTATAATTT AGTACACATTCAGCGATTGTATATCTGCTTTCCATGATATCCATGTTTAT CTGTGTGGTCGTGCACACACACAGAGTACAGATAGATATATTTTTATATA TTTAATAACAATAGACAAGTATATAATTTTGATGGTCACAAGCATCTTTA ATTGTTTCAGGTATGATTGTGGTATGTTTATGCTCAAGTACATTGATTTC CTCAGCAGAGGAGCCAGCTTATCTTTTGGCCAGGTGAGTAAATTAGATAA TCAGAATTTTGTACGTAGAAGAATGGACGCTCTATTGCCCACCATAATTT TTTGCCATCATGATTTGGGCCTATGTTAGTCGAACTGTTCAAGCATAAAA TGACATAACTGCAGTCTCTCTCAAGGTGATTGTACGTATATGGTATTAAT GCTTATGCACACGAGTTTTTCAAACTGCAGGAACACATGGGATACTTCCG GAAGAGAACAGTGAAGGAAATCTTAAGACTAAGAGCTGACTAAGTTTTCT CTTTGGGAAAAACAATCTGATTAAGTTTTGCCGACATTCATTACTGGGCT ATTCTCTGGAACAGTGCCTTCACTCTTGAACGTTGCTGTCAGAGACAGAC GCTGTCCGTTCACCCTGAGGAACTGAAGAGTTTGTCGGTTTGTGAACTCA AACTACCAGGATTGAAGGACGCAAATGCTAACAAAGTTCTGTAAAGTTCT CGTTTATATGGATTTGATTGGCAGGAGAAAGAAGAGGGAAAAGAAATCTT GAATAGGGTCGAGCAAAATTATAACTTAGAGACGCACTGCTGGAGATTTT CCTTTTGTTAACTCAGCTTCAGTTCCGAAGTTAGAAATGGTATTTTGTGA TAGCTCGCCTGTGGTGATAAACATGTAAATTTCATGTGCTTAGATTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.