Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044270

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044270
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044270
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCCCCCAACCAGTGCCGGCAGTTTGGACCGCCCACAAACTGTACGGCA CCCCCTTGCCGCCCTTGGCAACCAGTGGCTAGTCTGGGGCTGCCAGCAAC ACGCACCATGCTGGAAACCCAGTGTCGGGTCCGGATCCTGCGGGTCTAGA ACCACCACGCAACGCCAGAACTTCCCCACCGCCTGGCCGCACCGGACGGC GTTGTCACGAGCCACCACGACCCGAGAAAATATAGGAGTGCTGCCGTCCT TCACTCAAGATCACGCCCAGCTGAGGCCCTGCCGCCACCGCCACGGGGAT TTGCCCGGCGACCCCTCTGGCAGCGGCAGAGAGGAGCAGAGGAGGGTGGC GAGGCCGGGAGAGGGGCGGCGGTGGAATCCCCCGGGCGATGCAGCGTTGC CACCAGAAGGAGGGTTAGGAGGAGGCCGGTGCGATGCAATAGGAGTTTCA CTTCTTGGCCGGATAGACACCTCTAGAGACTAGTTGTAGTTCTCTATTGC TCCCTCTTTTTAAAAAGATATATAAGCTGTTTTTTTCTTTAACCCACGTA TCTAGACGTCTTTTAGTACATATGTTTGGAGAAAAATGATTGAGCCTATA CATTAAAAAATGTCTAGATACATATGTGTTATCTCGACGGAAATCGATCT CCACCAGAAATCTTTCGCCCCTGACCTAGCCGCCAGGCTCCAGTGAGTCG ACGTTTCTACCACCTGATCTCCACCGGCGTTCTTGCTAGTCCCCTCTCCC TCTTCCTGCTGCTTCGGTGGCAGGAGGAGGGGGATCCGGTCTCTCCGCTC TGTAGTTAGGGTTTGGTTTTGCAGGTCGTGGAGCGTCGTTGGGGTGGTGG GAGCGGCGCCCAGGCGAATAAATCTGCCTCAACTTCACTCCCACACCGAT GACGTCCCTCATGGCGGCGTCTTGGAGTTGATGGCATTGTGTGCGTGCCG ATTCCTCGGATTGGCGGGATAAGATTTTTTGGATGGTGTCATCGAGGCGG AGGTGGCGACCCTATAAGGTGTGTCCCTCCTTCTGCTTTGTCCCCCGTTA CTACGGTGTTTGCTCCGACGTCATGGTGGAGCAGGGAGGATGTGTTGTCC AGGAGTACGCGCAGACGGCCGTCTGCGTATGTGTCTGATTGAAGATGGTT TATCCTATTCTGGGTTTGTGGATGGAAGCTGGCAGTTCTGATTTCCTCTC CCGACGTTGTAGTCATGTGGGGGTGTCAGTTATGGAGTTTGGTCGCGTGT CCGGGGACATGTTGCCCCGGTCTGATTCGTTTAACGACAATGGTTTTGCC TTTGGCAAGCTACTTTGTAGGTCTAAAAAGCTGCTGATCAGCGATGGGGC CGCGTCAAGTTCGGGTGTTGTGGTGATCTGTCTTTCGCCCCTTTGGTGAT CTCTTCGATGGTGCCGAAGGAGAAGGATGGGCGCTGGTATTTTGCATAGT TTTATCCTATCTTTTCTGTTCTGTAAGGTCGCTTCGTTCGTATCTTGTAA CTTGTTTTTATCTTATTAATAAAGAGCGGATTACAGTGTCAAATAAAAGA TACATGTGTGTTAAAAAAGACTAAAATATCTTATATTTTGGAAGGAGGGA GTACTTGCTTGTATTGACCCTTGTTGTCACAAGATTGTGACTGAGCGCCC TGGCCTACACCTAACTACGAGAAAAATTGGGAAATCCCTACAAGAAAAAG AGAAAAATAAGTAAAAATAAGCACATGTAATCATTCCACATGAATTTTCC TCCATATAAAACGTACTAGCTACCTCAGTCTGCAAGTAAGAATTAGTTTG TCGCATCTGATCAATGCAGCAAGTTTCTCTTGATTTCCCCCGAGAGAAAT TAGAAGCTTCCATTTCTGTTGATTTGGACTATAACTTGAAATGAGTGCCA TCAGGAAATGTTTCTCTATCTGTCTGAGTTTTATGGGCTACAATTTAACC TTTTAGGATCCTTATTCAACTTGTCCCACTAGCAAAATGCATTGTTGCAT TATGTGACACATCTAATTTTCAGTGCATCGACTAGTAGGTCATCCTCTCA GTCTTCCAGTGCCTCCTGAGCGATGCTGAGCATGAGCATATGGGTTTAAG GTGCCGGCCCCTATTGTATCTAAGGCCCCGTTTACTTCTCAGGGATTTGC AGGATTTGGAGGGGATTTTCTCGGCCCATCCCATGATCCCGAAATATCCC GGACAGCCCGTTTACTTAATTCCGAGTATTATCCCGGCCCATCCCTGAAA TTCCACCCCGAATCGCTTCCAACTCGTGTATTCTAGCATGCAAGCCCACC CTCGTGTATCGTCAAGGAAATAAGCCACAGATCGTTCGCGTCGAGGACGG AGGCGGCGGCACGGACCAGAGGCGATGACGCAAAGGGCTACAGGGGGACG CCGCCGACGGACACCTCCTGCGGCTACGGCTGCGGCAAGCCCTTCTCACC GGTGAGTCGCTCCCCCGCCTCTTCCCCTCTCTACACTCCCTAGGGTTTCT CGGTCGCAGCCGCCGTCCACCTCCCGCCGGACGCGAGAGAGATGGCTTCC ATGGCACTTCTTTGTTCTTTGGTTTTCTTCCTCTTGCTCCCCTATTTGTC GTTGGGGGCAGAAAATGGGCCTCCGGATCTAAATTGTCATGGCACGCAGG TCCTATCCATGTTAGCACGCAGGTCCGATCAGACTGACTATACACGAGGA TTACTTCATTCCTAAATTCCTTTGTTCCTTGGTGAGAATCACTACTTAGC CTCTTAATGGCTACTTCTTGGCTACCTAACACTCCCTAGGAAATTATAAG AGAAAACACAGATTCAGTTTTGTCATAAGAACATATTAATTCTACTAATT TTGGAAGGAAAAAATAGGAGATGGATGAATGGTCGAGCTACCTTGTAAAC TTTACCAAAGCCTGCCTGTCCAATCATACATTCTTCAGAGAAATTATGTG TTGCCAGCGCAATTTCCTCAAAACTTACAAATGTAAATTCATGATCATGG GGAGAGTTTCCTTCCCCAAATTCGTAAGTGGTACTCATACCAATCTTCTT GTGTCTTCTCAAATTTCTGTTCTTAACTGCAGCCAAAGTGTTGTGATGAT TTATTCTCTAATGACTATATCATAGACATAAAAACAAATGAGACTGTTTG ACCGCTAGAACTATTGGTGTCCATTTACTATGTTCTCTATGAACTGAGAA AACCAGAGCAAATATCGAAGAATATAGCACTATGTCACCACTGAAAAGGA CAGGCTTGATAAGAACCCCACATATAAAATGGGATACCCTCCCTTTTCCT CCGTGTTTATATAGCAGGATAACCATTGCGATGGTCAAAACTCTGCACCA ACGTGGTAACATCGACTGCAGTGCGGTTATAAGAAGCCCACGTGCTAGCT AAACAGTTGTTAAACTCATCCAAGGGTATATTTACACCAGTTTTGCTTGT TCAGAGGGTTTTTAGGATTTGTTAGCCCAAAGGAACATTACACAATAGTA GAGGAAATGCAAGCGCAGGGGATAAAACGTACCTTTGATTATGAACCTGC ATCTATTTCGGTCCATGGCTGCATCTATTCTTAGCATATATATATGGCTG CAGTGTGTAATATATACCCAGTTGTTAGTCACATAATAAATTGCTGCAGG TTTTGCTTGTGCTGAATCTGGTAGTAGTGATTTGTTCCTTGTGCGCTTGT GGTGGTAAATAGATGCAGATGTATGATCTTTTACTTGTACACATGTTCAA AGATTATCCGACAGCACTCAACATGCTCATATGATGTAACATCCCAGATT TTATATTAGGGTGTTATTAGAAGCATGCATCATCCTTGCATCATTGGATC CTACAAATGAAGTTGCAACAAAACCCTAACAACAAAACCTACCAAAACCC TAATGAAGATTTTCCCTATGTGAGCAATAATGGTGCAATCATGCTTGACC CCTCCAATTTTTTTGTAAAAATATTAATCTACGGTCCTATGATGACCACC TTCTTTTTACAGAAATTTAGAAGTTGGTTTCATCACTTTTGGACTTGTTT TGCAAAAGTTATTAGGAAATTAGTAAAACAGAAATGGAAAAAAAGAAGAG TACAAAAAAAACCTGTCTAACCTACTGGGCTGGCTATGCCAGCCCACTAA CGCGCGCGCGTCGCCTAGCGCTACCAGCCGCCAGCACAGCCCAGCGCCAG CCCGCGCTGCCGCTCCCGCCGACACCCGGACCCCACCTGCCATCTCTCTC CTTTCCCCTCCCGACGAAATCCTGAGCAGAGTCCCCGCCGGCCACGCCTT TCCCCCGTCTCCGTGTCCATCCAGGACTTCCCCAGGCAGCATATAAAATC CCGACCCCCTCTCGTTGTTTCCCCCTCAAGAAACCCTAGCTCAAGCCTTG CCGAAACCGTTGCCGCTCTCCCTCGCCGTCGTCGCGCTCGGGAAGGTTGA GGATCCAATGTTTCACGCCACTCCGAATCCTCTTTCGTTGTTAATCGTCT TCCCCGTGTAACACCGCCTCACCCCGACCTCTTCTTTCCTTCCCTTGTGC AGCACAGCGTCGGGGATTTCTCGCTGACGTATCGCCGGAGCTCGCGGGAA CCGGCGGAGCCGTGCGGCTAGACGAGGAAGAGAAGGCCGAAGCCGATCTC GCACGCAAGACCGTAAGGAGTAGCCGCGCACCGTCGTCCTCTTCGCTGCT CCGAAGAGCCACCGTACCACCGCCGACTACCACGCCCGACAGCGCCGCCG CCGTCTCGCCATCGACGTCGCCACGGTAAGTCCACCCTCCTCCCTGTCCG TTGGATCTGCTGGCTACGGCCCAGATTAGAAGGGGGTGGACGAAGGGGTA TGCGCCAATAGCGTTGCGCCGCGTGGCCGCCACGTCTGCCAGCCCACTAA CGCGCTGCGTCACCACCGCCCTGCCTAGCTGGCCCAATCGGGTTCTGCCA CTTGGCAAGTTCTCGAATTAGGACTAGGTCTAATTGGCAGATTTATGTTA AAACTTGCGAAATTCATAGAAAAATAATTACTTGGCCAAATTTAGCATAT AATATACCGTTGGATTCATAAATTTATGTAGAACACAGATCTGCAATAAA TTTCAAGTTACAGAAGGGTTTTTGGTGTAGAATTTAACTCTATATTAGAG TGTTTAATCTATGGAAAAATAATTAAAATTCCGATTTATTTGATTCTTGT TGTGATGACTTTCTTTTCGCAACACCTACCGAACAAAATTATAGAACCTT GCTTAAGAGCATTAGTTTTGATTCGGGGCTAATTAGAGGGTTGGATCTCC TATTAAGCCTATGAATTAGATTATTGACTCAAATTAATTTAAACCTATGG GTAATCAATACTAAAAATTAACACAATTGCAATCCAGTTATAATACCTTG GTCAATTTAGAAAACCAATCTTGCATAAATACCATGTGCATGCATGCATG TTATCTCTGTGGCATATTTTGTGCAAGTTGTGATCGGATCTATGTTTGTG ATTCGTTACATTGTTCGGAGTGCGCTAAGGAGTGCTATTGTGTAGAGTGC TGCTCGGATCAAGGCAAGTTACACCACTTATTCATAATTTTTGTCCTAGT TTTGATTCTATGCATGTGATTTTCAAAATTCTATAGTATGCATGTATAGG ATGTTCTAGTAGAATTTTTCCTTAGTATTATTTTGCAAGTGCGATGATTT TGTAGTATGCCATGAGTAGCTCTATACTTAGGATTTCCCCTCCTAATAGG TTACCCCTGTTTTTGCTAAGTATTGCTTGCTATGCTACATATACAAAGTA CCGTTGGGGGGTTCGAAAGACAAAGAATTTTTCTAAGTATAAAGGCTTTC TAGAGCAAACTTTTCTTCTCAAATCCACTTCAAAATAAAACAAAGTTTTC TTCTGGGAGGAATGGTTGTCGGGTCAACGAGTGAGATTTTGGTGGAGGAC GGCCGCCCAGGAATCAAAGAAGTCTGCCATGTTTTAGAATTCAGAAGCTT CCAGTGCAACCACAATACATATGGGCTCTGTCTTGGCCTAGTACTTAGTG GGAAACCTCACCTGGGTACCAACATTTGGAGGTTCTTCGCACGGTTGGAT CCAGAAGGTAGAGGGGCTAATAAGGGAAAGCCTCGCCATGGTCTTGTCTG TAAAAGGACTTGATCGTGAATTGTGGGTAAAGCGCACAAACTCTCGAGAG TATTGCAATCTGATCGATCAGCCGTGTTCACGGTAACAGAACAATATTGA GCATCTGAATGATGGAGCCTCTGAAGGATCTTCCTCTCTCTTTTCTAAAC AAAGGTTTGAAACCTCATGGCGTGAGTAATATCGCCAATGGGTGGGATTT TGGGAACTTGGTGCGTAATATCCAAGTGTCACTTGGTGAGTAATATCCAA GTGTTTGGTTGTTTGGACACTTGGTGAGTAATATCCTCGTGTGCCATTCG ACCCTATTTTATCTAAGCAAATGTTTGCAAAGTAGGGAAAATCTTCTCTT CTTCTCTTTACTTAAGAAAACTAGCTTTGAGCAAATGAACTCTACAGCCT AAACTAGCCTTGCATGTAGAGATAGTCTTTTCTCTCCTTGGTGTAATTTG CCAATACATTTAAAGTATTGACCCAACTTGTTGGCTGCACGTCTTATGTG CAGAAACCGAAGATTGAAAGGTGCGTAGGGATCGCGAGTCTACACCCGAC AAGCCTGGGACGTTGATGGACTCAAGCTGCTTTTATGTTTCCGCTGTTAT TTGAGCTAGCTTAATGCTAAGGATATTTGTAATAAATTTATACTCTGGAT TCTCCGTGTAATAAAGACTTTGTGTTTTACATGATATTCATCGACTGTGA GTGCTAGCTAATGATCCAAGGACTAGCACGTTAATCACAGGGACTTAGGA TCTTTATTGATCCAAGGTCACTACATATGACTAAGAAAGATGGAACTTAA AAGTAGCTCTATCGTTACATTGTTGGGAGAGAAATAAAGTTGCCATGAGT AAGGCACTGGGCAACACCATTAGTACATTACACATGGCTTCCGTGGTAAA TGAACTTTTCTTTCTTAAGGTAACTGAACAATTGCAAGTATCTCGTACAT ATGCCTACCTACTTGTCTAATTTGATTAATACTCACTGTACCAATATTAT CCAATATAGAATTACAAATTGACTACTGCTGAACGCTAATTAGATATTTG ACAAATGCTTGTATGGCTCCAATTGATGTGTGTTCACTGTACCAAGATGG TGTTGTATATTAGTATGCTTGTTGCTGCCCCATACTCGTACCAAGATGGT GTTGTGTCTAATCTGTTCAACATTGTATATTACCAAGAAATCATTGCATT GGATTATATTAAGCTGATTTCTTGAGACAAGAGAGCTAGCTAGAGTCGGC CTGGTGTTCTCTATGTGTTCTGGCATCAAATGAAATTTAATTTTACATTA CTTTACTTTTTTGTTGTGATGTTGACTACTCAGCACATGAAGTTCTATAT CTCTACCTTTTCATGTGAACCTCCTATTTCGACACTTGAGAACTCTCTAT ATTAATCATTCATGAATAAAGCTAGTGATCCATACTTGTAGTTTGGGTGT TCTATTCAGCTAGGGACTTGTGGCAGTTTATACTACATCACTTATGTTTG TTTCTCTCACTGTTGTGTAATAATTTGCTAATGCTGGCAAAGATAGCTAG CTCCAGATTTTTCTCTTCATTTTGTAGTCTGTAGTATGTCTCTGATCTAG CTGGGCAAACTTTGTTGTGTGCTAGCTGGACAAACTTCTTGAGACAAGAG AGCTAGCTAGAGTCTAGTCTGGTGTTATCTATGTGTAGATTGTGCTTAAT GTCTACTTGATAACTTGCTAGGACTTTAGTTTGTGTATTTATAGTTGGTG TGAGAAAAAAAAGATCTAATGCATGAGTTATTAGTTAGTAGTCTATTCCG GAAACAGACCATGATGTCAAGTGAGTTGATTAGTAGATATGTGCTAGTAC GTATCTATATAGATAACATGGGAAGAAAAACTATATCTGCTCAATGCTTC ATGTTTGCATGCCCAGGAAATCGTGTATTGAGACTGTGATATCTAAATTC CAGAGAACTAGATGTACTTTTCTTCTATAATCTGTTCTCCCCCATTTACT TTTAGTATGCAACCTGCTAGCAATTTCTATTCACATATACTGTTCTTCCT TGTTTTTGTTATATAACCTGCTAGCAAAGATGATGTTTCCTGTTTATTTT GTTAGTGCTGAACCATTTATTTTTTTGGTGATATAATAGGGTGTCGATGA AAGCATCTGGCGGAGCTGGACAAGGAAATGATCGCATCAACTATATTTGG AATGGGCATGCAAAATATTATTATGGAAATAATTAGGCAATTGTTTGAGC TTCGGTCTGTCGAGAGCACATATTTAAACTTGTATTCATGAAGTCTATGA AGAGATGTTAACGCTCCTTGCAAAGATTCGAATTTTACTTGAGTGACTTG TCAATTAACATGTTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.