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GrainGenes Sequence Report: AA009654

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Sequence
AA009654
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009654
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGACGAGGTGAGCAAGTTTCCCCCGCTGCGCCTCCCTCGAGATTTCGG
TACTATCACCTTGCTGGTCGTGCAACCCTAGCCAGTGTCTTGGGATCGTT
CACTGGGGTTAAGTGCGGCGATATCTCAGAATTTGGCTTGTACTTTGACT
TTCGCATCGCGTCCCCGCTGGTTGATTTGGTTGCCGCGCGGTTGAAATAG
CTTCTGTTTGCCTTGTTAGTCTGAACTGAATCGTTTATCTACTGCGTGCG
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GGTACTTACTTGTTCTAACTGGGTTCTGTGCTGTTCACGATGGGGGAGGG
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ATATTATGGTAAGGAGGGAGTATTGATTAAGTATGGCTCTTCTTAATTAT
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TTCATCTTGGCTGATAAGTGATAAGTTTCAATGCATAGTACATGTAAAAT
ATAATGTTACTAGGTCCCAAGGTCCCAGAATCTATTTTCTGCAAGAGTTA
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CCCTCCATATCAGGTGGTGGTGGAAAGGAAGCTCATGCGTGAGAGAAAGC
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TATAGGTTAGTTTTCCATAATAGAATGTGCTGCCATTTTTGGTACAATGG
TTCTGTTGACCTTGTATGTCTATTTGGAATCCTCATGTTAGTTTATTACC
TCTTGGATGATTTATCAATTTACAGGGATATTCGAATTGGGCACTGGGAT
TGCACACTTCGTACAGCAATTTCTGATATTGAGGTGCATGCGACATGAAA
TTTGGCACTATGCTGGACAGTTTGTTTTCTAGCATGTGTGTAGGAATATA
GGATTATATCTTACATCTCAATCACTGTTTTCCAGGTTGACTATTTGGAA
CTTAAGGAAGAGACTCTGTTGGTGGTCCCTGGTTATAACACTCCAGTTCA
GTTTGGTGTTTTGATATCTTTTGCCTATCCTCTAGAAGAAGGGTTGGGTG
AAATTATCGTTGCAACAACAAGAATAGAAACAATGCTTGGTGATACCGCT
ATAGCTGTTCATTCTCAGGATGAAAGATATAAGCATTTGCATGGAAAATA
TGCCATCCATCCCTTTAATGGACGAAAACTTGAAATAATTTGTGATGATG
ATTTAGTGAAAACCAATTTTGGAACTGGAGCTGTAAAGGTAGGTATGCTC
ACCTGAACAGGTGGTTTTGATATCTTGATCCATAGTTCAGTATTTGCACT
AATTACTTTCAGTAACCAGCACCTACTCTTATCTATATTTTGTTTCACTC
TTATCTGTATGCAGATCACTCCAGCTCATGATACCGAGGATTTCAAGGCT
GGGAAACGGCATAACCTTGAGTTTATCAATATTTTCACTGATGATGGGAA
CATAAATGAAATTGGAGGTCCACAATTTGAAGGAATGCCACGTTTCACTG
CTCGAGCTGCTGTTATTGATGCACTAAAGGCGAAGGTATTATTTCAAATA
TTCATCTTTACCTTTTTCCCTCTAATTGATTCTGTGGTGTTCATGCAGTG
TGCAGTTTATGCAATTCTATGATTATCTTCAATGTTATTGAAAAGGTGTG
TCAATGTATTGTCATAATACGATAAAAATGCCTCACTAGAAGAAACCTAT
GATAATAGAACAGTGTTAACTTATGCTACCATACCTTAATTTGCATATTA
ACTGGTACATGCATAGCTGGCTCTGTTCATGCCTCAGCTTTGTTTTTGAG
CTGGCATTTTCCATCATATATGAAACTCTATTTCCTTCACGCTACACTCG
GTACCTGCATGAAGATGGTTGATCACGTTATTACTTTAGTTCAAATTTTA
GCCTTTGTCACCAAGTTATTTACTTTTCTTTGTCGCTTATCCTTTTCTGA
AATGTATTATATTAGCATTTGCCAAACTATAATCAATTTGTACTTGTCGA
TGGTCTATACAGAGGAACGAAAAATAATGAGATGAAACTGGGTCGTTGTT
CCAGAACTAATGATATCGTGGAGCCCATGATCAAGCCCCAATGGTTTGTT
AATTGTAATACAATGGCAAAGGCAGCTATCAATGCTGTGAAATCCAAAGA
GATTGAAATCATTCCACCACAATATGAGCAAGACTGGTATAGGTACATCC
AATTTATTTTAATTTAGGTTTAGGAATACATCTTTTCTTTATGCATCATT
TTTTGTCAACACGATTCCTAAAAAACGTGAATAGACGAATAATCCACCAA
TACTCTGCGTGTTGCAGATGGCTTGAAAACATACGTGATTGGTGTATTTC
AAAGGCAACTTTGGTGGGGACACCGTGTACCTGCTTGGTATGTAACATTA
GAAGACGATGAAGAGAAAGACATGGGTTCATACACTGACCACTGGATAAT
CGCAAGGAATGAAAGTGATGCAATACTGGAGGCAAAAGAGAGGTACCCAG
GGAAGAAATATCAGTTAGATCAAGATCCTGATGTGTTGGATACATGGTTT
TCATCTAGCCTTTTCCCATTATCCGTGTTTGGTTGGCCAGACGATACAGC
AGACCTTGGTACTTTCTACCCTACTTCTGTCCTTGAAACTGGAATGGACA
TCCTCTTCTTTTGGGTAGCAAGGATGGTAATGTTGGGAATACTGATCGGC
GGTGATGTGCCATTTCAAAAGGTAATATGTTGGTTATAGTTTTAGTAGAT
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TGTCATCATCCACTTGAAAGCAGCACATTTTATCAGTATGATATGATAAC
ATAGCATTGACATAAACTAGATGCTTCTTGTGCTGGATCATTCACACGTA
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GAAGCTTGGGAGAATGATAAAGGAAGAAAGTCAGGTATAAACTATGATTA
TGAATGCATTAAATCTTTTATGGTAACTGATGACTTCTGTGATATTAGTA
ATGAGTTTGGACTTGATTCCCAAAGTATTGTCAACTGTTTTAAGGCCTTT
GGCTCTTACATAGAAATTCCCAAGAAGAAGTGTAATAAGTACCATGCACC
TTATAAAGATGTTGTTATTCATGTTCCTGTTAGAAGTACTGAAGTTTGTA
CTACTAATCATATTGTTCCTAAACCTCATGTTGAGAAAATACCTTTCCCA
GCTAAGGTAAAGGAGTATTCTATGATTATTAGTGCAAATAACAAATGTAC
AAAGGAAACTGTGGAGCCTGATGAGCAATTGATTATTAAACCTGTGGTAG
CTATTGTGAAAGATCTTCACGCTAGAAATATAGAGGATGAGCATATTGCC
TTATGTGAAGACGCTATTAATATTATCTCTCATCCTAGTAAAGCTAGAAA
AGCTAGTATTTCTGTGCTTTATGTTAAAATTGGTGATCATTGCTATGATG
GTTTATTAGTTGATACCCCGCGCGTTGCGGCAGGCATTAGAGATGATTTT
CTTGTATGCAAAAAAATGACAAAGAATCTCCTAAAATAATGCTTATTTGC
ATGAAGTACAACCATATAGCTATTTACCTAGCTTTGGTTGTGCGTTGCTG
GGGAATCATATATGAAAAAAATAGTATGAAATCGTCTTTGGTTGGTATGC
AGTACATTCGAATACATTAAACATGTGGCAGGAGTTAACCAATTATAATT
TAGCAAATAAAATGCATGTGCATCATTAATGGCAGGATAATAGCACTGTA
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ACACCAGGAACCAACAGGCGTAAGTGAATAAAAATCACAGGATTCTTCAC
ATGTATAAGGAGAATGTAACAACAACTACCACTCGCTTGCCATCATGGTG
ATCTTTATTCATCGGAACACGCCCGGGTATCTGCAATCTCAATAAAGATT
TCATATTTTAAACCGAGGAGTCATCTAATATATGTTCTTTAGTATTGCTC
ATATAGAGTTAGTTTGGTTGGAGGCCTGGGCTCCATGCCTAGAAAAAAGA
GCTTGACCGCGGACAGGAAACTTCCAAAAAAAGAAGTATCTGGCCAGTCT
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TTATTTTCATTAGCCCAACAAAAATATAACTTAGAAGTACACTACCTGTA
AATACATTTCTTATGAATGGCAATGTCTTCATTTACCACGTGGGAATTAG
CATCCATGTATTTTCCTGAGATGGGCCTATACATCTGGTTTCCAGATATG
AGATACAGACATTGAGCTAGTATATGAACAATAGTGTACTTGTCACTTTC
TCAGCTATGCCGAGAACCCCTAGCAGTATAAACTGCTGTTTTGACAGAAG
GCATGCAAATAATGAACCAATTAAGAATTTTCAAAAAAAAAACTAAGCAG
TATGAGGTACCAGTCTGTATGCATGTTATCTGCTAGCAAGCATGCAACGC
TATTTTTAGAGTAAAAAGAACCACACAAATCCGAAAAAACTTGTACCGGC
AAAATGCTCGGGAACGACCAACATGAAAACATCCTAAACTACTAAGCTAG
CAACTACTAATTTCCTGGCTGGTACTACTAATATGGTGGCTGGTCTCAAG
AAACCTCCAGGCCAGGCAATTTTGTCCCAGGTCCAGAACCAAAAACGCTT
GTAGTAGCCTACTGGCCAGAAAAAATATATATTGCATATAGGTTTTTAGG
TGCAGATTACCTCTAATTATTTTAGACATTGCTGAGAAGATCGTTTATTA
AGCGGCTGGATCTTCAAGGTTGTATGCGATGTGTAAGTCAGAATATTTTG
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TATGTCTCTCTGAGGTAGAGTAACAGGTGACGATTTGGCGTCGACGTGGG
ACTCCATGCTGGGGTATAAAACATGAAGAACTTTCCCTTGCATCCATGCT
GATATAAATTGTAAAGAAAACTATTGAAAAGAACTAATATAGGGCGCTAT
AATTCTAGGTGAGCATGATTGTTTAATCATGGGAATTGGGAAACATCAAA
ATTCAAGGTAAACGCTAGCATGTGAAGTACAACAATGGAACTGTTAGCAG
ATGCATGCTGGATACACATACAGTTTGGAATATTCTTGCTGGTACAAACA
AATTCAACTCAAGCAGGATAACTTTTAGATAGACTTCCTAGAACAGACAA
ATTAAACTCGAGCAGGAAACCTTCTTCTCTGACGAAATGGCTGCAAGGGA
AATTTAGAAGAAGAAAAACACCACAATTAGAGTTGCAAAAACTATCTAGA
ACCAATAATGAAATCGAAGTCAAGATGAACAACACAGATGAGATGTGCGT
AGAGAAAATAATGAATCAAAGTCAAGATGAACAACACAGATGAGATGCAG
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GACACCAGCAGACGCGGGGCAAGAAGGTTGCTCGACAGAAGCAATTTGGA
GGATTCAAGAAGAGGTCGCCGAGGGGTTGAAATACACGGACTGCAACACT
CATCTCAGGGAAGCCATTAAAATTGACAGATCGCATCGTGGGAGAAGTCA
TGACACTGACAGTGGGCGTTACCATCCAATAGCGGGAGGAGTGAAAACGA
CAACATGTGGTAGTTCAGGAGGCATCCGGGAGATCGGGAGGCACGGCCGG
TGGTTGAGCGAATGGGCATGTCGATTTGTTTTCCTTCGCACTGCGGGCAA
GGCCGGTGAAGGGAACGTGCAGTTTTGCTCCTACCAAAGGTAATGAAAAC
CACATGCGATCAGGACTGGGATAGGTAATCAAGACCACATGTTCGAAATC
TGACGGACATGGATAATTAGAGTGACATGGCTGCACAAAATTTCAGCTTG
CAAACATTAAATGCATGTTAGTGGGGATGAACTTTATAGATATTATAGAT
AAAGATATCTAGGTTCTAGTCCAATTTTGTCGGCTTTACTCACACTGAAA
GTGAAGCACACCAGTTCTCCACTTACTGGAAACTTCATTCACACTTGGTG
AATCATGATGCCGTAACTTCAAAATTACTTGATTAAACCTTGCCTCATGA
CTATCTTATATTTTTTCTCAGATTTACTTGCATCCAATTATTCGTGATGC
GCATGGGCGCAAAATGTCCAAGTCCCTTGGGAATGTCATTGATCCCATTG
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CCCTGATATCCTACACTTCTCAGGTTATACTTATCGCTATTTTCTATCAT
TATTTTTATTGTTATTGCAAATATCTAGTTCTAAAATTTCTCATATTTGC
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GAGATCAGTACACTCCACCAGCAACTGTTGCGGTGTATTCTATGCCACCT
CTCTGCCAATGGATACTCTCAGTACTTAATAAGGCTGTTGGCAAGACTGT
GTCGTCATTAGAAGCATATAAATTCTCTGAGGCGACATCCTGTATATATT
CTTGGTGGCAATACCAGCTTTGCGATGTATTTATAGAAGCAATTAAACCG
TACTTCAATGAATCTCAAGAGTTCGAAGCTGCAAGAGGTGCTTCTCGAGA
TACATTATGGTTATGCCTGGACATTGGTTTGCGTCTGCTCCATCCATTCA
TGCCTTACGTAACTGAAGAGCTTTGGCAGCGCCTTCCTCAGCCTAAGGAG
GCTTGTAGGAAAGATTCCATCATGATATCAGAATACCCCTCAGCTGTACA
GGTAAATATTTCTTTTCAGGACAACTTAGAACTTGATGGTTACTATTTTC
CGGATAACAGTAGTGTAGAGCCTAGTACATATACATTTAAAAGGAAGCCA
CTTTATGACGACTATATGCAAAATGAGGCGAAGAGAAAGGTTGATGTGTC
ATCTCAATTTGAGAAGTACTAAGTTTCCTTGGTTGACAGGAATGGGCAAA
TGATCAAGTCGAGAACGAGATGGAGATTGTGTTAGATGCTGTGAGTAAAC
TGAGATCTCTCCGGCCACCAACAGATATACATGAAAGGTGTGTTTCTTTT
CACCAAATATGTTCTTATTTGAGTTTCACACTGTATGACAGATGCTATGC
TCAAATGCACTAAGATTGCCATTTTATTTTACTTTTGATTCATAAGAATT
TTGCTCGTTTGTTGCTGATACCTTATTTTCTATTTTCACCTCAACAGGCG
CCCATCTTTTGTACTCTGCCGAAACCTAGAGATTGCAGCCACTGTTCAGT
GCTACCAGGCTCAAATTGCAACGCTTGCTTCTGTGTCATCTCTTAAGGTT
TGACAGATCATGCGATGTCTATGCTTATTTTTGTCTTCTCTTGAACTTTC
TTGTCCGAATCTAATATCTATGTACCACAAATAACCATATGATGTATGCC
TCTTGCTGTATGCACATTTCCTGTTCCAACTCACCTTCCTTTGTCAGTAA
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AATTAATAAATAAATAATGGCAAAGTTCTGACCAAGTGACAATTTTTCAG
ATCCTGACAGAGGATGATCCAACTCCACCTGATTGTGCCACAAATATTGT
AAATAAAGATCTAGCAGTTTATCTCCAGCTACAGGGAGCTCTCAACACGG
AAGCTGAACATGAGAAGCTTAGGAAGAAGAGAGAGGAAGTTCAGAAGTAA
GTTCAATTACGCTACCTACGTCTTGATAAATTTGCGAAGCACCAATTCTG
TTGATACTGATTTGCAGATCACCAATTCTGTTTGTACTGTATTCTTCTTT
TTGAACGTTTGTTCGCATTTTTTTTTATCTCAGTAGTAACATGCTCCGTT
ATCCATCGCCAATGCAGGCAATATGACACCTTGTCACAGAAAATGAGTGC
TTCAGGTTACCGTGAGAAGGCCCCACAGAGCAAGCAGGACGATGATATGA
AAAAACGCTCCTCTTTAATGGAGGAGCTCGAGATCATCAGCGAAGCTGAG
AGTAAACTGGACGCTAACAACTGACGATGTTTTGTGACTCAAATCTTTTG
AAGTCCCGCTACACTGATTTACAGGCATTTTAGATGGATGATCCTCTGCA
ACCTGATGCACTGACTCCCACAGTCGCAGATTGAAGGCATACTTGCTGTT
TGTAGAAATCCTTGCTCAAGCATTTGAGTATATAGGATTTTTTTTGCATG
TGTAACGTGATTGGACTTTTGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.