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GrainGenes Sequence Report: AA030390

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Sequence
AA030390
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA030390
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTAACAAGTTGAAGCAGCTGCGTACTACCCACACATAGAGAAGCATACCA
ACATACACAAAGATGAGCACGGCCATGGCATTGCTCGTCCTTGCAGCCTT
CTTGTTGCCGTTGGCAACGGCAGCTTCCGCGGTGACTACAGCTAGAAGAA
ACTGCTCCACCTGTGGTTATGATGACATACCTTACCCGTTCGGAGTAGGT
CCTTCCTGCTCCTTGCCTGGTTTCAGTCTCACATGTGCTGTCGACACGGA
CAAGAGCCGTTATCTTCTGCTGGGCAACTCATCCATGGAGGTAGGTGGCC
CTTTGAGCGCATCCTTCCAGTTCCTGATGGGAACCAGTATCTCCTACTCC
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ATAAGAGTCAAACTATCAAACATAACATTTATTTTCTACATATGCAATAT
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TTTAGTAGATATAGGTGGGTATCAAGCGACCGCATAGTGGGTATCAAACT
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CAGGAAATGGAAGTATGGCGAGACATCGTGTGCATGACCCACCTTGTCTC
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ATACTAGTAGATTTAGCATTAAAACTTAGATCTTTCATATCTTTTGAACC
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TTTTAAACATGATTCATTAGAATTAGAAAATATTTGCCATATTGTCTTAG
AGTTCAATTTGGATACATAACCTTTTGCATCTAGTTTCATCGAGTTCTAT
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TTTAGAGGGTCCAACATGTTTAGGGGATAAATTGCTTATGAGGTGGTCAC
TGACTTGGTGAGAGCCACCCTACCGGTGGCGGTGATAAATTTGCCTTGCC
CAGTTGGGTGCTTTTATTTCGAGTTTATCCATAATGAGTTGAAAATTGAC
ACTTATAGGATGACGGACTAAGATCGAAAGACCCAAAATCCCATGTGGAA
GTGCAATCGAATGTCAGGGAAATCATGAAGAATGTCATCAAGATCGATCT
CAGCGCATCTAATAGGAACTACCATGATCTTTGGACTTTTTTGACAAGCC
TGATAACCTTCGAAACCTTAGAGAATGCGCAAGAGGGAAGCAGTCCCCTT
TGTTAGGCTCCAAGAAAATGGATGCATCAGCAACATAGAGAGATGTATGA
ATAGAATTAGCACGCTCGCGAGGAAGTTGAAGGCCTCCATTGTCCATAGC
TAGATCAAGAATGAATTGCAAGGGATCAATAGCAAGGACGAATAGAAGTG
GAGAAATAGTATATCCTTGTATTACCCCCGCCCATGCTTAATGGGAGAGC
TCGGCACCCCATTTGGGAGCACCCGAGAGGAAGCGCTTGAGAGTTCCAAA
ACCTTTAAGGGAATCCACACCTTTGAAGTAAATCTAGAAGGTAGTACCAT
CTCACCGAGTCAAAGCCTTCTTAATGTCAAGCTTGAGGAAGAGTTCACCA
CTTTGGTGCTTCCAAGTGCATGCAAGAAGGAGAGTGTATTATAACTCAGA
TGACGCAATACTCTCCTAGTATCTATATTGGTGGATCCTCTGCTACTAAC
AAACAGCAAATCAATAGTCAAACAAACAGTCGCAAAATAACCAACGGTTA
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AGTTCCATCAGTCTCATAGAATTTTTCTTGTCTATTGTTTCACCCTTTTG
TTTGCCTTGACAATTGATTGGTACAGGCTTCTCATCTCTTTGGGATCTTT
GTAGTGTGGGCTTCAAGATCTCGTATATGCAATTTTAACTAAAACTCTTG
GAATGTGTACATGATAAATTGTGTTGATCGTCTTCACCGGTCACTTAATC
ATTATCTTCAAAATTATGGGTTCATATTACAGAAAAACGACCTTGATGAT
CCTGGATCATCAACTCAACAAAATTTGTAATCTAAATCAATCAAAAAAAT
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ACATCTCACAACTCGGAGGGGATTTCTCAGTTAAGCAATCTGTTACTGGA
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AACCACAAATAGAAACTACTTTGGAACTGGTTCAGACCTATTCTCTTGCA
ACTTCCTTGCTATACTAAAAAACTGGCTAATTGCGCATGTCTTGCAACCG
ATTCAAATCCAGTAGGATACACTAAAATATTTACTCACTTGTTATTACCT
TTTAATTGGTTCAAACCTACTCAGCTGCAACTGCCCTTACAACTATGACT
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CTACTCAAGTGCAACTCAACCTCAAAAACCTACTCACTTGCAACTGAACG
GACCCACTCAGGTTCAAACCTACTCCGCTGCAACTACCTTGCAATTGTGA
CCCAAAAAACTACTCACGTGCAAACTGACTTGCAACTGGCTGGAACAACT
CAATTGCAAGTGACTTGCAACTGACCCATTCAACTGCAAATGGCTTGAAA
CTATGAGCCAGAGACTTTCAGTTGCAACGCAACTCAAAACAATACTCACT
TGCAATTTACCCGAAACCACTCAGTTGCAAGTGGCTTGGGGACCAAGAGT
TAGTTGCAAACTAACTTGCAACTACATGAAACGTAGATAGTTGCAAGTAC
CTTGCAAACTGCAGCTAACTCAAAAATCACTCAACTACGGGTAGGATACA
ACTGAGCCATACCTCGCTCAGTTGAGGGTAGGCCACACCCGGAATTACTA
AGCTGCAAGTGTTTTGCAAGCGAGGGTTATGAAACTTACATTTTTAACTT
AGATGCAAGAAAATTAAAAAATGTTGTGATATACACAACTTTATATGGTC
AGGGTTGTTTATTGTATTCCTTGGGGAGCCGTTTTTGAGAGGATCATTTG
GTTCCTTAGAATTATATTTACAAAAAGCTTGCAGCAAACTAGTAAAGCTT
GGTTATAGTTCTGCAAAAGTGTGAAAAAGAATGTTGTATGATTCATCATC
CATCTCTAGAGGGCGCCACAACTCAGGCTCCACAATTGTGTTGCCTTTGT
CATTCTGAGATTCGAGCAACCTGAAGAATTCTGTGTAAGGATCAATGGAT
CATTGAAATACTTTTTGAGTCCAGAAAATGGATTTGGAGCACTTGCTTCG
GTTAGCCCTTTTTTACTTTTTTTAAGCATCAAATATTTCTGAAAATATAC
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AAAAAATGCTAAAAGATTAAATGTTAAAAGTAGCGACCTGTACTGAAAAA
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AAACAACAGCTATATTTGATAATAAAAGTAAAAAAGTGCATCCATAAATT
AGAACAAACATTAGGAAAAAACAAACAGAGATCCTTCATACAGAAATACT
TGCAAGGTGAAAATGCATCCATAAATTAGAACATCATTGTAGCTTCTCAC
AGAACCTATAGAAAGGCGTGTGTGACCGTCTACACAAATTCGCTGCGGAC
AAAAAGTTTTCATCGTAAGCTTGATGATATGAAGATGTGCAGACAAACTC
TTATTTATGAATATTTTCACATTTTCCATACTTTTATTTGCAACTTGCAT
ATTTGCCACAGGCTGTGTCACTGACATGCGGTGGCCATGTGGCAAATTTG
CTAATTTCAGAGAAAAGTGTGGCAAATATGCAAAAAATCCTATTCTCTAT
GAGTGTCTGTACACATCAAAAGCTAAGAAAAGAACTAATGACACTTCAAC
TTGACAACTCTTTTTTGCTGACAACACTTAATTGATAGTTTGTGTTTAAG
TAGATAGAAGCAGAGTGGCACAAAGGCTGGAGAGATGAAAACACTATGAT
TAGCTCCTGGAACCTCAACATGCTCCTACACAAGGATTCAACTGAATCTC
TAATATCTTCTCCCACTTGTCCAGTAGCCGTAAACTTATCCGTCTCTTCT
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GTGGCGACGCAGCCGCACGCCACGCCCTTCGCCCAGCCGACCCGCCCGGC
CAGTCCGTGTCTCACCGACCTCCCATCACGACTCCACCATTCGCCTACCT
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GGTAGCAACACATTATATACATATATTTTCCTTTTTCCCAGAACCAATGT
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GTTTGCTATTGCTAGTCGTCGCAGTCAAGCAAGGGGAGCACTTACACCGA
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AATAACAGAACAACCATTCCAGTTTAACCGCCGGATGCTGCACAGAACCC
AACTAGCAGTGGTAACTTTAGCTCATCTAGCTTAATATTTTTATTTTCCG
AAAAGGAGGTAATGCCCCGGCTGGCTTCTGCATCTCATACTAGGTTAAAT
ACATTGTTCTAGTTTTTTTTTGTTTCCAAAGCATAGTTAGCTTAAAATCT
TTTGACTATGTCTATATCTCATGGGTAGATTAATCTATTTCATCTGTATC
TTTTTCTAGTTAATATAGGGGTTAAGAGGATAAAAGGACAAAGGTTTTGA
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ATGTGAACCCACATGATTACAAAATTTTAAGGGCTTAGATTTAAACAAAA
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AGTAGTATATTTAATTACATTTTTTTGAATGTTTTATGTGATATATTATC
AATTGATATTTATTGTTTATTTGCAAACAAAAATTGGCATGATCTCTCCA
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TGCATCGTGCGGGAACATAAGCATCCCGTTCCCCTTCGGTACAGAGATTG
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ATCTATTGATGATGGTATCTTGCAAGTTCGGGAGGTATCTGGGAAAGATA
ATTTCATATCTGGTTCGGACTCATATTCCACCCTCTACGCATTATCTGGG
GGCGTGGTGAAGTGGGTAATTGATAATGTGACATGCGAGCATGCAAAGCA
AAACAAGAGCGATTACAGATGTTTCAGCTCCCACAGCGACTGCCTTGATG
TCACCGATGATGGAACACTTAAATATCTCGGTTACCGGTGCAAGTGCTCT
TCTGGTTTTGAAGGAAATCCTTACCTTAAAGATGGATGCACAGGTATATT
ATCTCTCAGAATACTCCATAGTTTGACTCAAAAGTAATAATTTGGTGCTC
ATTTATGACGAAAGTTAGGAACTGCTGAAAATAAAGTAGTTAAGACTTAA
GACCCTAAGCCGGTTAGGTTTTCCATGGATCACCACTGATGTTTTTTGCG
GTTTACAGATACTAACGAGTGCCTACAGCCAGATAAATACATCTGCAATG
GTATTTGCCACAATAAGTTTGGGAGCTATACATGCACCAGCGCTGTAATA
TTGGGTAAGCGATTTATACCACTTGTGATCTTATCAACATTGTGATCTAT
TTCTTGAAAAAAAAAAACTGTTTGTTCCATTACTGCTTCCATAATTCCTG
AAAAAAGCTGTCAAATGATACAGGTGTGACCATTGGAGTAAGCAGTGGTG
GAGGCATTCTGCTTCTTGCGGCGATTGTTTCTATTCTTATTCGGAGACGG
AATAGATTCATTCAGAAGCGGCTTCGAAAAAGGTATTTTCGGAAGAACAA
AGGCATTCTGCTAGAACAACTGATATCTTCCGACAGAAGTACCAGCGACA
GCACAAAGATATTCTCCCTGGAGGAGCTGCAAAAGGCAACCAACAATTTC
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TGATCAGCGAGATCGATCAGTTCATCAATGAGGTGTCCATCCTGTCGCAG
ATCAACCACCGGAACGTGGTGAAGCTCCACGGATGCTGCCTCGAATCCGA
GGTCCCTCTGCTTGTCTACGAGTTCGTCTCCAACGGCACACTATATGACC
TCCTGCACCGCGCGCAGGACGGCAGCCTGCTGCCGCTGTCGTGGGAGGAA
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AGCGGCTTCCGTGTCGATCCTCCACAGAGACATCAAGTGCATGAACGTGC
TCCTCAACGACAGCCACACCGCGAAGGTTTCGGATTTTGGCGCGTCAAGG
TTGATCCCGATCGATCAGACACACCTGGTTACTGCCATCCAGGGCACGTT
TGGGTACCTGGATCCGGAGTACTACTACACCGGCCAGCTTAACGAGAAGA
GCGATGTTTACAGTTTCGGAGTGATACTTGTAGAGCTTCTGACGAGGAGG
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CTTCCTATGGGCTATGAGGGAGAGGCCCGTTGAGGAGATAGTGGACACGC
AAATCCTGGAGGAAGAAACAGAGGAAGGGATTCTGTGCATTGCTCGGTTG
GCGGAGGAGTGCCTCAGCCTGACCCGAGTGGAGAGGCCTACCATGAAAGA
CGTGGAGATGAGGCTGCAGCTTCTCACGGGGCGCTGTGTTGCTCCGAGGG
CGAGGCGGGACGAACTGGCGCGGCCTCGCTGTGAAACTCAGGAAGACGAT
GGGCATGGTTGTGTTGTTTCGATGGTTGGCCAGCACGGCTCACGCCAGTA
CAGCCAAGAACAGGAATTCATGTCATCGGTGCGTGTACCACGCTAGATAG
CCGCCGTATCTTAAATTATTTCTGCCCTTGCCTGCATTTTTTCTCGTCTG
TGCATTTCAATTTTCACCTAAACGTTGTAAGAGTAAACTGTATTTTAGAA
TATTTATTATTGTGTGAATTGTAATTAACTGAAAATATGGAGGTGCTCGG
GGGATCTTCACTCCACCACTTAACTCTACTCCACTGCCGAACTCTGGTAG
TTTGCTACCTCACCAGAATAATAGCTTGTTAGTTTGTCTAACCCTTACAT
GTTACGAGATTGCCAAATCCCACCAAAGTTAGAGCTTGGTTAAGTCCTTA
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TGCAACTGATTTTTCTAGTTGTATATGGATTGCAACAGGGGAGCACAGTT
AAGTCCTTAGTCGTGAGATTTGCAGTGATTTGTGCTGATTGGGAATTGCA
AATGGGTCGCAACTAAGTTTTATCCAGTGACACATGGGTTGCAACCAAAG
TTTTATTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.