Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023695

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023695
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023695
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CATGGCCGAAAAATATCCCGAATCCCCGGCGATCCTCCACTAGGCAAATC CAAACAGATACCAGACTCGTTTGCCACGCGTCCCGTAGGAGCCCGACCGG CGCACTTGGCCGTGGGGACGGGCGGGTCGCCGTCGCTGCTCCTGCACCGG TTGCTTCTTCCTCTCCCCTCCCCTCCTTCCCTTCCGCCATTCCCAGTCCT CCTCGGCTATCACATTTGATCCCCTCCCGGGAATCAGCGTATCCAATTTC CCCCCAAGAAAAGAAGGAACCGGCATATCGCAGGGTCCTGATTCCCTTCG CTTCCCCCCATCAATCTCCGTCGGCTGCCCGCGGTTGCTGGCCTCCGAGG ATCGTCCCTCCGGTTCCCCTTTACTGTAGGTGATTCTCGCTTAAGGTTTG CCCCCCTTGTTTGTGGATGCGCGCTTATCTTCTCCGTGTGTATGTGGTCT GCGCGTCTCTTCCGTTTCTGGTAGTAACTACCCGGCAGTACTGTTCGTGG AATGCAGGATTCATATGCCTGAACATACATTATTTACTCAGCCAGGCACG GCGATACCTCTGTCCGGGGTGCTGCCGTATTGGGTCCTGCCTTCAGCGCA GCTGGTTTCGTTTCCAGGCGTTATGCCAAATAGATCGTATCCGCTGGTTG GGTAGTGTCCTGTTTGGAGAAACAGATCCAGGAGAAAGTTTCTGACTCGT ATAGTGTCTTGCATAAATTTGGTGGAAGTAATAAACTGTGTAATCGAAAC AAGGAAATGGTCTACTGGATGTTATTAAAGCAGGAAACTGTTTCAGATCT ACGATAGAGGCAAACAGGAAACCAAAGAAACCAAGGAATAGTAGTAGATC AAAGTAGGAAACTAAACAGTCTCTAGGCCGAGCCAGCTCTGGTCAAAGTT TCAGAATTGTTTTAGGCCACTTCAGCTTCTTTCACCTCCTCTGACATAAC GTTTCTCTTAATCATGATAGCGCCCTGAGCCGCATCGTTGTCGTTTAATT GGATTGCGTAGAATTTGTTGATGTATCTTTATCCTGCAGAGACAAAGTCT ACGGGCAAAATTTTAAGTTTCAGTTCTTTATCGTTTTTGTATGCCATTTG CAGGTGGTGGTTGAGACAGGCAAATACTTATCTGAAGAAAATTTCTCCCT GACTTGACAGCAACATGGAAACATACACCACGGATATCGCTCTTTCAGCC ATGGGATTTGGGAAATTCCAAGCACTTGTTCTTGTTTACGCAGGCATGGG TTGGGTTGCAGAATCCATGGAGCTCATGTTACTGTCATTTGTTGGACCAC TGGTGCGGGAGGAGTGGAAAATCTCTGCCCAAGATGAGAGTCTACTCTCG AGTGTGGTGTTCTTTGGCATGTTAATAGGAGCATGTGGTTGGGGTTTTGT TTCCGACAAATATGGGCGAAGGTAGGTCTTACAAGCGAAATTCGATGTTT CAGTTTCTGAGTACAACCGTTTTCCTGTTCTCAAGAAGAATGTCATGACT GTAACCGTGCTTATGAATTTTGTTTTCATGTCCCTGTTGTACAACTAAGC ACCTTTGATACACTCAGGATGTTTGGAGTAGTAATATAATTTCAGTACTG TCCATAGCGCACGGCTTTATATTTGCGACAGTGCACAAATTAACCCCTGA ACAAAACTTGTATTTTTCTTGTTTCAGGACCGGTTTACTGTTTTCAACAC TGTTTACTACCGGGATGGGTTTCATAAGTGCTTTGTCTCCTAACTATTTA TGCTTGATGGCTCTTCGATTTCTCGTTGGCATTGGATTGGGTGGCAGTCA TGTGTTTTCATCTTGGTTTTTGGAGTTTGTTCCTGCACAAAATCGTGGCA CTTGGATGATTGTTTTTTCCTTTTTTTGGACTCTTGGCACAGTCTTGGAG GCTTCACTTGCATGGGTATCGGACTAATACATTTTGCAATTTTGTACATC TGGTTTATTTATATTTATTCTGACAAAATAATGAAGTATTATTAAATTTG CATGTTGCAGGTTGTGATATCGGCATTGAACTGGAGGTGGTTGCTAGTAT TTACCGCCATTCCATGCTTTCTCTTGCTTCCTTTCTTTGGAACTACACCT GAGTCGCCACGCTATCTGTGTGCACAAAATAGAATGTCTGATGCAACACT TGTCCTGGAGAGAATCTCTATGATAAACCAAGCAGCCCTTCCTCCTGGAA TTCTCACATACAATCATGAAAGAGAAGTTGATCACAGCACTCTCGCCTGT GAGACAGATCATCTTCTTCCAGTCAGAGAGAAGGAATGCACAGATGTTAA TGCCATGAGCTCCAAATCTGGTAGTGTTGCTGCATTACGGAGTCTACTGT CACGAAATTTGCGCAGATCGACGCTTCTAATTTGGTTTGCTTTCTATGCA AACTCATTTGCTTATTACGGGCTAGTCCTATTGACCGCCCAACTGAGTAA TGCAAATAGAAGCTGTGCATCTGGGCTGAGATATGTGAAGAGTGAACAAG ATACCAGCCTTTACAAGGATACATTTATTACTAGTTTAGCAGGTAGCAGA CAGTAGCCCGTCTCTTCACTCATTGTGACTGGCTACGGAATGTGTCACTA ACTCATTACTCTACTGCTATATCAGAGATTCCTGGTCTAATTGTGTCTGC TGTTCTTGTTGAATGGCTTGGCCGAAAAGCTACAATGTGGTGCTTGATGT TCACATGTTGTGGTTTCCTTGGACCACTTGTGCTTCATCAGAGTGAGCTC TGGACAACTGGCCTTCTATTTGGTGCCCGTGCTTGTGCAATGGGTAGCTT CACAGTTCTATGTTTATATGCCCCGGAGGTTCGTATCGACTTTTTATGCA TTGTAGTAAATTTATTTTTTGGTCCACTTGGTTTTCACAGCATGTTGGAT TTAATATGCTAAAAATCCATCTGATATACCTATGTGTTGCAGTTTTAACA TTATATCCACCCACGTGGCCAGCGTATTCAAATGGTGTAGTTTTGCTTCT TGAATATTCAATGTCTTTGTAGACCTACTTTACATTTCATAACAAAGACA AAGTACCCTGGTGTTTAAGAATCTAATACAAGTAAAATATAATAATGCAT CTGTCTTATTAAATTTACGGTTATACAGCGATTCCTTGTTACACTATCAT ATGATGATCACTGTGATTCTTTTTGTATTGAGTTACATCAGTTAAGATTC TTTCTTGAAAGATCTATGGAACCTACACTGTTATGAGCACGAGGGCAAGA ATATTTTCATAGATAGGGCATCCATTTTGAATTTCGTTGATTCATTTGCA AATCTGGAGTTTATTATTGGTTACAAGGAGTTCACCACAGAAATTTGAAC CTCCGTATTTAGCATTCAGAGTTCAGACAGGTTTTGATTGGTGGGTTCAA AACAGAAATACAAGATCCTGACTGTAGGTTTATACCAAATAGTACAGGGA AAAAGTATTCCAAATAATTCACATATTCTAAACATTCTGTTGCCATCACT GGGGTGCTTCTTCTTCGAATGTCCTAATAGTTTATATCCTAAATTGATTC TATTAACTAATGACCCATCAGAATCTTGAAGTGTCCACTAGTGTGAACAA AACAGACGCCCTGCTAGACAGATAACTCTGGTGTGATTTTTGTCCATTCT GCAGACGACAGGCTGTGTTAGTTATCTCATGTGGTCTGCCCATCTGACGG TTTTGGCTATGTTAAGTAGTCATTTTTCTTAGCTGAGACCGTCGTTGCAG CAGTTTTTATCTGAAGAAGTAGCGGAGAAGTTGCAGTAGATTTGTTTAAG CAGAATCTTTCGTATGAGCTAATTTATTTTGTTATTTTGTAGGTATATCC AACATCAGTACGCTCAACTGGTGTTGGAATTGCAACCGCCATGGGTAGAG TCGGCGGGATTGTTTGCCCCCTTGTAGCCGTTGGGATGCTGAGAAGCTGC CACCAAATGGAAGCCATCGTTGTGTTTGAGGTGGTGTTATGCCTAGCTGC GATTGCTTGCATGCTGTTCCCCGTAGAGACCAGGGGCCGTGATATGAACT AATTGGTGTCATGGTGCAAAAAGAAGAACACTTCAATTCACCAACGTTTC AAAAAACTTATCACGCTGCTACTCGTGAATGTTATGCATACATTGCAAAT ACAAGTGTAGTATTATGTAGTACTCCGTATAATATTTTTTTAGTGGATAT GACGATGAAGATTTCTCAAAATATATGGGGTTTCGGATGTTATTGAACAT TATTTTGTATAGCAGGACTATGGTATTACTAAGTGTCAACTGTCATTTGT ACTGGTATAATGAAGTCTCATGTTGATATTGTCCCAAGCCCAGTAGAAGT CTTGCATGACTAGGCATGGGAACTACTGGGTCGGATGTAGACCAATGGAT CATGCATCTAGGATTCCATCCCTCTCGCAGTCAAAGCCGCCGGTCCGCTC TGCCTCCGGTGGCCATGAACCCTCGCCGGTAGGGGTTTCATGTTTTTTGG TTGTTCTCTAGTGTCTTTCTTTGGGATGGTGAGTCGGTTGAATAAGATTT TTCCCGTCCTTTCTTCGATTCGATGGTGTGTCTAGCATTGGCAGTCGGTT TTCATGTTGGTTTGTGTGGTTTCAGGTCTGAATCTTCCGACAACGTGTCT CATCTTCGGCGATGTTTTTTTTGGCTAGAAATTTGGCGATGGTTGTTTCT TTTGTGCGCTGGTTCTTTGGAAAATTAGCACGGCGACTTCCTGTTTATCT ATTATAACAAGCTCTACTACGATAAATTTTGCCCGAATCTGGTGATAAAG GGGCGAGGCCCGAATCTGGTGATAAAGGGGCGAGGAACAACTTCGACTTC TGCCAGTTCGTGGTCGTTGTCAGGTGGTTCAAGGACACCTATTTATGATT TTTATTTACTTTAGAGTTTTTATACTATAATATATGGATAATTATTTGAC AGACCAACCTTCTTCAAAAAAAAGTCTCACGAGGCTGTCTATTGTGTCTG CCGATATGACTACTTCGATTTTCCATCAAGAGAAAATGGAACAAGTCACG ACTCACGAAGCTGTCTATCACGTGTGCCGATATGCACGACTCAGAGCCGT GTGGTGGTGGCCCGTCGAAGCGTCGCATATCCGTGTGGCAACAAAACAAG CGTCGCCGCTGCAGTGGCCAGTCCTAGTCGGACGGCCCTGTCACGCTTGA TCCGTGACCGAAAACTATCCCGAATCCCCGTTCGCCACGCGTCGCGCGTG AGAGCCCGACCACGGCGACCAGCGCGGTTGGCCGGGCGCGAGGGCCGCCA TCGCCGCTCCTGTACCACAAGTCCACAGGACCACGGTACCAGGTTGCTTG TTCCCTTCCACCTTCGCACCTTCCCTCCCTTCCGCCATTAGTCCCCCTGG AGTATTTAATTTGTTCCCCTCCCGAGAATCGGCGTATCCATTTCAAAAAA AAGAACCAGCGTATCCCAGTTCAAACCAAGAGGGAAAGAACCAGCACACC CTGGGGTGCTTCTGCTGCGGCCGCCGCCGTCCCGAGGCTCGTACGAGGGT CGCCCGCTTCCCCTTTACGGTACGTGCTCGCGCTTACTCGTCCACGGTCC GCCCCTTAATCCTCCCTCTGCGTGTGGTTTGCGCGCTTTTCTCTCTGGTT TCTGCTCGTAAAAACCGCCCCGCGGTACCCTGTTCGCGGAGCCATCGCGA GATGCGGGGTCCTCCGGCCACGGCCAGAGGCAGCGAGCCTCCTGCTCTTT TTTTTTTTTGCTTGATTTGGCCCTATGATTAAGTCGTGGGCATTAGTAGC TCCTGTGGCTTAGCAACGTGCCCTGAACCTAGTTAGTTTTCTCTCTCTGT GTTGGAGCTTCGTTACTTTTATTTTATTTCAGGTGTCGTGTGAATTAGGT CCTGGAACTGGACTGGACGGTGGTTGTGCAATGAGCTGCGTAGAGGAACA GATCCAGGAAAAAGAGTTCTATCTGTATGTGATAAATTTTGTCACCGTGA AAACCTGGTCAAAGCTCTGTTATTTCGATTTTCGATACAGCGTATCTGGT GAAAGCTTCAACACAGGAGAAATGCGTACTGGATGCGGAGAAGCTGTCAA AAACCATGGGCTTAACATTTTTTTTTGGCGAAAACGCAAAAAGCTTTGCG TTTCGAGGCATTGATAGATAAGAAGTATATGTTACAAGTCCTAGAGAGGA CCAACACCCGCACCATACAACTCAATCCAAGAAGCTGACAATTCTAAGGG GATATCTGGCGCAACCCCCGCGCTCCAACCTCAGCCCACGTCTTAGCCTC GGCTTTGATCATATCAACTAGGGAAGCCACCGAGGGGGACTCGTTGTTGA AGACTAGCCTCGGCTTTGATCATGTCGACTAGGGAAGCCACCGAGGGGGA CTCGTTGTTGAAGACGATCGCGTTCCTATGCTTCCAAATCCACCACGCTG TGAGCATGATCACAAAAGAGTTTCCTTTGCGCATCTGACGTGGGATGGAT CGCACCACCAGCTTCCACCACTCCGCGAAGGGGCCTTCAGCAACCGAGGA CCCAGCAGTAGATCGAGTCCATGACAGGACCTCGTGCCAGATGGTTTGAG AAAACGGACACCCGGTGAGGATGTGTGACATGGTCTTGTTGCCTGGTCGC AGAGCACGCAGGACGGACGATGGGGATGGGCTTAAAATTTTCTGACAGTG CCCTGAACTGCATCGTTGTGGTTTCATTGGATTGCGTAGATTTGTTGATG TATCTTTATCCTGCAAGAATGAACTCTATGGGCAAATTTAACTGTCAGTT CTCATCATATCTAGTACCAAGTCGTACTTATGATTTTGGCATCTCCAAGT ATGTGCTTATTGTTTGTGTGTCCCATTTGCAGGCGGCGGTTTTGAGAAAA GCAAATACTTTACCTGAAGAAAATTTTGTTACTGGCTTGGCTTCCTTTAC GTTGCTGAATCGACAGACGCTGCTAACATGGAAACATACACCACGGATGA TGCGCTTGCGGCCGTGGGGTTTGGGAAATTCCAAGCGCTCGTTCTTGTCT ATGCAGGCATGGGTTGGGTTGCAGAATCCATGGAGGTCATGCTACTGTCC TTTGTTGGACCATTGGTGCGGGAGGAATGGAATATCTCTCCCCAAGATGA GAGTCTGCTCTCAAGTGTAGTGTTCTGTGGCATGTTAATAGGGGCATGTG GCTGGGGTTTTGTTTCTGACAAGTATGGGCGAAGGTGAGCATTTTGTCTT ACAAGCGCATCCATGTTTCAGTTTTTCAGTTCAACTTTTTTTTTTACTGT TCTAGAGAATATTATGGCTGTAGCAATGCTCCTCAATTTTGTTTTCATAC TCCTGATGTACAGTACTCACCTTTGATGCGTTCAGCCTGTTTCAAATTGA CATAATTTTGGTACAATGGCGCGTGGCTTTATAATCGCGTCAGTGTACAA AATTAACCCCTGAACAAAATTTGTATTTTTCTTGTTTCAGGACTGGTTTA CTGTTTTCAACACTGTTTACTACCGGAATGGGTTTCATAAGTGCTTTGTC TCCCAACTATTTGTGCTTGATGGCTCTTCGCTTTCTAGTTGGCATAGGAG TGGGTGGCGGGCATGTGTTTTCATCTTGGTTTTTGGAGTTTGTTCCTGCA CAAAATCGTGGCACTTGGATGATTATTTTTTCCCTTTTTTGGACTCTTGG CACAGTCTTGGAGGCTTCACTTGCATGGGTATCCGACTAGTACATTCGCA ATTTTGTACTTCTGGTATATATTTATAGTTTGACAAAATAATAAAGCATT GCTAAATTTTTGTTCCTGTTGCAGGTCGTTATATCGGTATTGAGTTGGAG GTGGTTGCTAGCATTTACCGCCCTTCCGTGCTTTCTCTTGCTTCCTTTCT TTGGAACTACGCCTGAGTCGCCACGCTATCTGTGTGCACAAAATAAATTG TCTGATGCAACGCTTGTCCTGGAGAGAATCGCTAAGACAAACCAAGCAGC CCTTCCTCCTGGAATTCTCACATACCACCGTGAAAGAGAAGTTGATCACA GCGCTGTTACCTCTGAGATAGATGATCTTCTTCCAGTCAGAGAGAAGGAA TGCACAGATGATGATGCCATGAGCTCCAAATCTGGTAGTGTTGCTGCATT GCGCAGTCTACTGTCACGAAATTTGCGCAGATCGACGCTTCTACTTTGGT TTGCTTTCTATGCAAACTCATTCGCTTATTATGGCCTGGTCTTGCTGTCC TCTCAACTGAGTGATGCAAATAGAAGCTGTGCATCTGGGCTGAGATATGT GAAGAGTGAACAAGATGCCAGCCTTTACAAGGATACATTTATTACTAGTT TAGCAGGTACCATACAGTAGTCCATTTCTTCCCCCAGTTTGACTGGCTAC AAAATATGTCACTAACCCATCACTCTACTGCTCTATCAGAGATTCCTGGT CTACTTGTGTCTGCTGTTCTTGTTGAGTGGCTTGGCCGAAAAGCTACAAT GTGGTGCTTGCTGTTCACATGCTGTGGTTTTCTTGGACCACTTGTACTTC ATCAGAGTGAGCTATGGACAACTGGCCTTATATTTGGTGCACGTGCTTGT GCCATGGGAAGCTACACAGTTCTATGTTTATATGCCCCAGAGGTTTGTAT CGACTTTTTATGGCATGCAGTGTGTGTTTTGGTGACTTGGTTTTCCCAGT ATATTCAGTTTGATATGTTGAAAGTTCCATCCTATATCCTGTGAGTTGTG TTCTAATATTATATCCATCCATGTGGCCAGAATTCAAGTTGTAGTTTTGC TTCTTTAATATTCAATATCTTTGTAGTTCAGCTTTATGTTTCATAATGAA GATATTTAAGTACCTGGTGTCAAGAAAACCTAATGCAAAAAAAATCATTA CTATTGCATCTGTCTTACTGTACTAAATTTACCACAATACCATGATTTCT TGTTACACTATCATACCATGATCATTGTGATTTTTCTGTATCGAGTTACA TCAGAGAAGAGTCTTTATGGAAAAATCTACGGAAGGCTTCCAAACTAATG TATGCACGAAGACTAGAATATTTCCTAGCTAGAGCATCCACTTTGAATTT CATTCATCTTCATTTGCAAATGTGGAGTTTATTATTGATTACAAGATGTT CACCGCAGAAATTTGAACTTCCATATGATAGGTTTGCATTGTTGGGTTCA AAACAGAAATACAAGATCACTTGTTTTTGACATTGATTCTCCCGCAATCA CTGGGGTGCTTTTTTCTTCCAGTGTGTTAATTCAAATCTGTTAACTCATA AGGCTGAGCATCTTCATGAAACACTTGTCAACAAAACAGACATCTTGCTA GACATATAACACTGGCTAAATAAAAATCTGTGATTTTGATCCATTCTGCA GACGATAAGCCAAGTTTGCTATCTTATCTGGTCTGCTCATCTTAGGGTTT TGGCTATGCTAAGTGGTCAATTTGCTTAGCTGGGAATGTTTGATTGTCAC GATAGATATACCGCAATCATTGTAGACGATTTTTATCTGAAGTTGTAGTA GATTTTTTCTAAGCAGAGTTTTTCCTACGAGCTAATTTATTTTCCTGTAT TTGTAGGTATATCCAACATCAGTACGATCGACTGGTGTTGGAATTGCAAA TGCCATTGGTAGAATCGGTGGGGTAGTTTGCCCTCTTGTAGCCGTTGGGA TGCTCAGAAGCTGCCATCAAATGGAAGCCATCGTTGTGTTTGAGGTGGTG TTATGCCTCGCTGCGGTTGCTTGCATGCTCTTCCCTGTGGAGACCAAGGG CCGTGATATGAGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.