Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA006780

[Submit comment/correction]

Sequence	AA006780
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA006780
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCGTTGTGGTGGAGTGCATGTCCTCCTCCGCCTCTTCATCGTCGTTGA GGACGCCAGCCAGCAGTGCGACAACTTGTCCTCATCCGCCTCTTCTTCCA AGGAAACCTAGAGGTTCTTTCTCTCGTATTCGGTTCGTTACAATTTGTGC ATATGTAATATGCCCAGCAAGAACCAAGGAAAAAAATACTAACATTTTCC TCACATAATAGAGCTCAAATATTTGATCCTCTTTATTCATGGTGGAAGCA CAGTTTGAAACGGACACTAGACCATTGCTTTCCTTATAGCGAAAAGGATT TCTTGTATAAATGAAATTCTGAAGTTACAGACTATATTATTTCTTAAGAC AGGAACTCTATAATATTTCGGTCTAGGAAGTTGGTTGGTTGCATTCTGTG TAGAGCTTCCTGTAAATTTTCATCAGTTGCATTCTTCCAATACTACTTAG CTAATCTAATTGTTGCTGCTCTACCTCTTCATCTAAGAGGAGAAAGATTT GAACCTTCTATTTGTTCTATCAGTTCATCATCGTTCGTGATAGTCGATTT GCTCTCTTTTCTTAACTTCCCGTATTAACCTTTTTTGTCTTTCAAATAGA TTTAGGAGTTGACACAGAAACAGATCCATCTATTTGGTGCAGGTGAGCTT CTTTACGTTTTTTATCCTGTCTATTTCTTGTTTTCAGACATCGGTTTGCA CATGTGTCAGCTATGTTATGTTTAGTTGAAATTTTCAGGGGCTGTTTTGG GCTATGATCTGTGATTACATCAAACCTTTGCACTCTTGTTTTATTGTAGC GTTGATTAGAAGAACAAACCAGCGAGGATGCAAATCGTCCTCGGCAACCT TGCCTAGCTCCGCCTTGATTGGACGAAGGTATTTTCTTCGCTTATACAAT GGTTGACTGGATATAATAAGAGTGGAAGAAAGTACAACCGTTCTCCTTTT TTTGGTAAGGAAGTATATGTGATATTTTACTGGTTATACCTTCTTATGAG CCATATTTTGGTCTACAGATCTTGATTTTTTTTACTTCCTATAGCTGCTT ATGAGCAAAGAAGATGATATTGGCTTGTAGTTTCAGTACTATTTGGGAAC TTAAATACCATTTTGTATAATGTGAGGCATTTTCTTATTTGTTTCATAGA GCACACAGGGGAGCCGCCGCGGAGCTCCACCACAGAGCCCACTCGTACAT TGACCTAGATGTGCCACCGGCGAGAAGGGAGAGCACAAGGCCAAGGCTGC TGGTCCTCTCCTACAGGCCTGCAGCGATGAGGTTGTTTTAAAAAAATTGT GTAATATATATGATGATAATATCTTTGCATGCCAGCAGAAGGTCGTGTTA GATTACACTGACTGCGGACGCCAAAATGACAGTTCATGCATACCATTGTT ATTTATTTATTAGTTGTGGATTAGTGTGACTTAAATTATTTTCCAGATCA CAAGGGGGTATTTTTCTGAAATATGTATTTTGTTTCTTTTATGAACAGAA CTGCAGCCTTTGAACTAATCTCCAGTTCAGTGACTCTTATTGTTGTTTGT TTCATTTATGCAGCTTCATTCAGGACAGTTACCAATGTATTATTTTCATT ATTTTGTGTACTATAGATGTTGATGAGTCATCTTTATATATGTTTTATTT AGTTTTTGCTGCTATTGAGCATTTCTCTGCTGATGTTTTCATTGCAAAAT GACGGGTCTCCTTCCGTAACTTTCCAATTACATGTTAAGTCTGCTAGGGT AGATAGAGTCTAGAATGGCCTTTCTTGAATCATTGTTTCTTGAATGATCT CCTCTATATCATGGCCTTACAAGATACTTATGTTCCTAGAGCTCCGAGCT TGTCACAAATTAGGATCCATCTAGTGGTGACATATCTCCATGAACATGTT AATCCCGTGTCAATAGTGACCAGGATAGTGGGTTACGTCCACGATTTATA GAAACATGGGATCACCAAAAGTTGCCGCCATGAATATGTATTTTTTAGGT GGATCAGTTTTTTGCTTTATAATTAGATAAAGCCCGAAAGCTACAGCATT TTGTGATACACAAGTTTGAATTTTGACTAGGTGGATAATTTCTCGGTGAG CTCTATCTCAAAAGCCTAATATTGGAGGTTTGTGTTCTTTTTTTGACGGG CCAAGGCAGGAGCTCTGTCATTTTCTTTCAGTATGGGGAAAAATTGTACA ATGCAGACTAGAGGTTTGTGTTCTCTTTTAGAGCTTTAGCAGCAAAAGAA TTTTGAAGTTTGACGGATGTGTTCAAACTAAAAGAGATCCACATTGACTC AATAGTTCATGATAGTCTGTAGCTTTGAAGTTCCATTTATAGACTAAAAG TGATAATACAAATGTGTGACCTTCGTTTCAAGAAAGTGTTGGATGTACTA AAAATGCATTTATGGGAGAGAATTCTGCAATATGCAATGGTATGAGGTAT TTCGTGTTTTTGATGATTCCCACACATCTTGCAGATTCAGAGACCATTTG TGTATTGCAGAGACTGGAGTGCAGATGCCATCTTCTTTCTCATATTGGGT ATCTATCTACATCAGGAATGAACAATGGTAGCACTCTGGAGGATTAGCTA TTGATATGGTTTGGATTGTCGATGCAGACTATCTTCATGTTCTGCATGTT TTGGTATCTTTTTTCAGGTGGAAACATAGACAAACCAGGTTGTCAAGCAA CAGGGGACGCCGCTCTACAATCTTCTAGAGATGATTCTGTGCAAGATCAT AAACATCTGAGCTGAAGGTCATTTACTCTTTCTTTCTCATTTAATGGGTA AATTCAGGTTTAGTGGGGCTCTTCAGGTTGTGTAGGATAAGGTCCTTTTT AGAGAGCATAATCTCGGTCTAATGTATTTTTTTATTTTGTGTAAGCAATT GAATCTGATGGATATGAGTACTGTCTTTTTGTCGCTTACATTGGTCATTA ATACTGCATGATTATCATTGGAAGGTAACCTGGCATTGTTATTTCTTATT TAGAATATGCGAGCTAGAGGTTGAACTCTTACACTACTCGGTTAGTCGCA AGGTAACGATGCTATTTAGGCTGCTCTCAAAGCAAAAATCTCCCATGGAA GCGCTAGAGGGTGTCAATGCCCACCTGAGCTCCTCCATTGTGATGTGAGA CGGCGAGTCTTCAACACCGATGCTTGTGAAACATGGCTGGTAGTAATCTG AGCTTATGATCACATGCATGTAGTTAAATTCTGCTTCAGGTCATGTTGCT ATCCTAATCCCCGCTTCTCATTTTTAAAATTATAAATTATAACTACATGC AATGGTACTTGCGTAATAAGTTGCCACATTCTGTAACTTTGTAAGTGCTT CCTGAGACTTTTTGGTTCTTTTAAGACGATTGAGTATAACTATAGTATTA TTTTGTTGTAGATTACATTATCAAAGGTCCACTGTTTCTCATCTCCATAC CACCAGGGCACAATTCAGATTAATGTTTAGTAATATTTGCTGAGGTGATC CAGCTGATCCTTTTTTTAGAGAAAAGGCAACTAGAACTTAATAAAGTCTG CACTGGCCTCATCACCTACATCAGGTGTTCCGTTTTGGAATTTCAGGTAA ATGGATCATATCTGCCGTAATGCTCATATACACATTCTTTCCAATTTACG CAAGTACATTGTGGAATATTTGCTAGATTGCTATCTCAGTGGATGTTCGA TCTTTGTTTTTCTGAATTTTCAGCATAAAGGAGATAAAGGAGAACATTGC ACATGTATGTATTTAACACAATATGGCACTGAATTTCAGTTCTACGTCTG GTATCCTTCTTACATAATGTATCCTCTTTGCTTTTCAATATCCTGAACAC TCAAGAACAAGATGTTATCATGGGGAAACATATGGATTTACTTTGTATGG TCATGGAACTCGAGGCTGATTTCAGGCTGCTATGGAGTATGGCTACAAAA CTGGAGTTTGTATTTATCAGGTGTGGTCTTCAGTTTGAAAATCAAATCAG TATATTCTTACACTCGAGGCTGACTGATTGCTACAATTCTTACTAAGTTT CTTTATCGACACAGTTCTTCTTACGAATCAAACTGCATGTAATTTCATTT TCCTTATGCTTCACATCATTATTATGTTCTGCATGAGGCATTGAAGCAAC AAAATGGAGGTGCTGATTTTTTGTTGAATCTCATTCATATCTAAGTATAA AG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.