Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002645

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002645
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002645
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAAACCACATACCTCACTCACGACCCTTTACCCGCCTATATATAATACC
TTCATTCACCGAACTGAAGCGCGCAGTCGTATAGGTATCCCGCGCTCGGC
ACATCACAGACTGAGAAACCCAGCAGCTGACTAATGGAGGCTCTAATGGC
GACATTCCCAGCAGCTGGCGTGGCCGCCGTGGTTGCCGTGGCGGCCGCTG
TCGTGCTGGTCGCGATCACCATCGTCTGGATGGACTCCAAAAAACGCCCC
AACGCTCCACCAAGTGAGTATGATCGATAGTGTAATGCCGTTGTTGCCGT
GATTGCGCTAGCTGCAGATCTTGCCCGAGAGTGAAAATCTGGGTACTCTG
ACCCTGGAGTTTTGCTCTATTTAGAAATTATAAGTTATTTGACTCGGAAA
ACTGCTCTGCATTAAGTTATATGTTCTTATCATTAAGTTACTAATAACTA
TTTTGAACTAAAGTTGTAGGAAATTAGGAAGACTTGAAGAAAACATTCAT
ACCGTTCACTGGGAAATTGGTCATTTTCACATGATTTACATACTTTCGAA
TTTAGGAGCAAAACTTGACATCCACATGCATGTGCACACCCTCTACACAA
GAACTAAAATTTTGTATTCTTAGATTTTTTTTCTATTTCTTGTGATCTTA
TTGTTCACTCGAGATAAGGAGTACCGGTCCGTGACCAGTCTAGTAGTTCT
GATCTTGTTGTCGTTTTCTATATGTACATGTAAAATTGTAGCTTCTTTTT
TCTCTTCATTTTTTCTTTTTTTGGGAGTTCGGTGTCAAACCTTTTCAAAG
ATTACAAAAATAAAATAAGTACCCTCCGCCCGAAAATATGTGACTTCGAT
TTTTTCGTATGTATCTAAATGTGTTTTAGTGCATATATACATGTGAATCT
AGACAAGTTAAAATCACTTATTTCCAAGTAGAAAGAGTAAAAAGTTGTGA
TCCTCCTCTGGTTTGATCAAATGTTGTGCAGAAGTTCCTGGTTTACCACT
CATTGGCAACCTGCTTCAGCTGAAAGGAAAGATGGCCCATAAGACCTTTG
CAAAATGGTCTGAAATTTATGGTCCAATATACACTACAAAGTTTGGCGCG
ACACTTGCGGTCGTCCTCAACTCATCTGAAGTAGTCACGGAGGTAAAACA
AATATTTGCATTTTCTCTGTCTTCCTTAACATACTTGATAGTGTGCTTTT
ATGTTGGACTACATAATATATTTTTCCCTTCTTAGTAATTTTGAAATCCA
GCCATGAAATTTACAACACTCATTACCTAGTCTACCGGCAGGATTTTAGT
TTCATGGAGGCCACTTCCACAAGTATCTATTTTTAGATAGTGGGATATGT
ACCCCTATATAGCACCGAATTATTTTTTACCTAACATATTTTACGTTGTT
TTATTTAAAAAATTATGTTTTTATATAAATAATTATGTTTATGTTGATAT
GCAACAACAAAAAATGACATAATAAACATAGTGTATAACACATTATAATG
TGAAAACAAAAAATATGTATTTTACATCATATTTTATACTGCACTAATTT
TTTTTAACATGCCTATACTTTCTTATGTTCTTGACTTCTGAGATAAGACA
AAATTGACCTGACATAAAAATCATATACAGTTGGAAAGATATAGAGCAGA
TATAGAATAACTATTGTACTACCTTGGAGTCAAATATATAGAAATACTAT
TTAACCACTAAGGTGCTGAAAATTTATTTTGCACCCATCATATTTTTATG
TTGTTGCATTTAAAAATGTATGGTTTGTATTCAAATAATTATGTTAAGAT
TGATCCACCATAAAAATCGACATGAAAAATACTCATTTTACATCGTATTT
TATCCGGCGTGTAATATTTTTACTCCATGTCTATATTTCCTTATGTTCTA
CTTGTGTTATGAAGTAAAAAAAATGTACCATGACATAAAATCATGTGCGC
TTGAAAAAATAGAGGATAAATGTAGAATAACTATTTTAGACCCTAGGGAT
TAAACACCACAATATTATATCTAGACTATTATATCATCATATATAGAATA
ATATTCTATACATTGTCTCTCCCTATAGGGCTCGCATCCCCTATAAAACA
TCAGACAATATTTTCAGAATTACTCTTAAACTGTTTCGAAATTGATAAAA
AATTCTAAACGAAAAAGTAGCGCCTACTCCATACCTATCCAAGGAGATAA
CATTTGCATCATTCCAAAAGTGTTTGAGAAATAATTATAAAATTACTGTT
TGGGCATTTTTGAATACATCCAAAATTGAGTAAATTCAAAATTACCTTTA
AACTATAAAGAATTTGAAAAAACTTTCTGAACGAAAGAGATGGGAAATTT
CATCAGCTTTCCAACATATTACCATTTGTATCATTACGATAAATGGTTTA
GAAACTGAATTTCAAATACATTTTATATGGGTTTGTGAAGATTTCTGGTT
TTTAAAATTACTTTTCAATGGTCAAAAATTTGAGAAAAGTTAGCTTCAGA
ATTTCTCTAACTTTCCAACAATATATCATTTATGTAGTTCTGATAAGAGG
TTTAGAAATTGCGTTCAAAATACGTTCTGTATGGGTTCATGATGATTTCT
TATTTTTTAAATTAAATTTAAACGGTCTGGAAGGTGACAAAGTTACAACA
TGAAAATGTTGCGGGTTTTCATTATCTTTCCAACGATATATCATTTATGT
AATTCTGAGAAGAGGTTGAGAAACACGAAGAAAAATCGCTCACAGATGCA
TTTTGATTCCGTACATAAGTATGAATCAGACAAAGAAGTAGTGCAACAAC
GTGGATAACGATAGTATATACATCGAACCGAGGGATGTACGGATCATGTA
TAGAATATTATTCTATCATCAATGAAATAAATGCATATTAACATTAATGT
TTGGAAAGTACCATTGATGGTATTTTGGCAGCACGATTGCTCGTATTTGA
GCAGTACATTCATTTGAGAAACATATTTATTTAAAAATAAGTAAGTATGT
ATGATAAAAACAATGAAAGTATAACAGGAAAGTATATATTATGTATACGA
GAAGTATTGATTAAAGCAGTTTAAAACCAGAAAAAGGGCGAACCAGAAAA
CATATTTTCAGTTCGCGTTTCGTGGTTTTTTCAGATCGCGAACGGCGGGG
CGGAACATAAACCAGAAACCCGAACGAGAAAAAGGAATATTTCCTTTTCC
CAGTTTCACGCATACGGGAACTGTCGAACTCGTAAATTGAACTATTTTCT
GTCAATTTCACCACATATCTCGCATTTGCAAACAGAAATATGATACCAAC
GTAAAGTAAAAGCCCAAAATTATTAATTACAACAATTATCCAATTACAAC
AATTGTCCAAACAAATTGAATAAACAATAATCCAATTACAACGAATGACC
AGATCAAATGAATAGTTCCGAATGCAAATAATGTTTCACACACATGAATG
ATAAAATATGGCAGCCTAGTTCCTCCGAAATAGCTGTCAGTAGTGCTTAA
TGAGGTCATGTTGTAGCTGATCATGGGTGGTCATGTTCTCAATGTCTCGG
TAGGTTTGAAGAAGGATTGGATGGCATTTGGGTTTCTAGATGCTTCACAC
GGCTGCCAACATAGTCGTAGAAGATGTCCAAGTCTAGACCCCTCTTATCC
TCAACAATCATGTTGTGAAGAATGACACAACATTTTATTATGTCATTGAG
AGTTTTCTTGTCCCAAAAACGAGCTGGACCTCGCACAACTGCAAATTGAG
CTTGCAAAATACCAAAGGCTCTCTCAATGTCCTTTGGGGCACTCTCTTGA
GCCTTTGCAAATTCAATCTCTTTCCTAGTTTGAGGATCCGAGATGGTCTT
GACAAATGTAGCCCAATGAGGATAAATACCTTCATCTAGATAATACCCTT
TGTCATAATTAGAACCATTAACAATGTAGTTGCAAGCGGGTGCTTCACCA
TTAGCTAGATTTGCAAATAAAGGAGATATATGGAGCACATTAAAATCATT
TAGGGTGCCAGGCAAACCAAAGAAACAATGCCAAATCAACAACTCCTCTG
ATGCAAAGGCTTATAGCACAATTCTTGCATCTCGGCTTTTGCCAAAATAT
TTCCCGTGCCATGCCTTCGAATTTTTTTTCTAAGTCCAATGCATACAATC
TAGGCTTCCTAGCATGCCCATCTATCCTCTTCTCTCATTCATCGCCATCA
ACTTAATTGTGCCATGCTCGTTCGGTGCTCGCAGAATTACACGGGCCAAA
AATGCAAATACTAGCCTTGGAAAATCTACGAACACTCTCCATAGTAGTAT
CTTCGCCGATGCGAAGATACTCGTCGGCATAATTGGCCGGGATCCCATAT
GCGAGCACTCTCATGGCCGTGGAGAGTTTTTGGTACGGGCTGAATCCAAG
CAACCTCGCGGCATTTCTTGGACGCTCGAAGTACCACGTCTTCGCCTCGC
AAGCTTTCACTATCTTCACAAAAAGCGAGCCGCGCATTCGATAGCGTCTA
CGAAAGAGGTGAGGCGGGTATGTGGGTACCTCGGCGAATTAATCTCGCAT
GAGCATGTCGTTGCCCAACTTATGGTTGCAAGGGATGCAAAGGTGGCTGA
ACGTGGAGCCTCACTACCTCTTCCTCATGCCATCGTCCTCCTCCTTGAGG
GCGAGAACGGACACCATCATGTGTTGTCGGTGGTTCCCGAGAAGTGTCTC
CACATCTGAGTCATCCAACAAAAATTTCTCACAAGGGTCCAAGTCCATCT
ACTTATCACGGACGATATTTAGAGCTTGCAGAGAGGAGATCTACAAGCTC
GAACTCGAGCGGCGGTGGATTTTACCTTGTACGGGCGGCGGGAGGACGGC
AGCGGTGGGGCGTGACCGGATCTGCGTCGGGAGGAGTTTTCCGACCCATA
GCGGCTGGGGAACAGGGTCGGCGGGCTCTGACGGCCTTCTGCGCGCGAGG
AATCGGGCGGGGGCGACCTAAATCCACGGCGGCGATCGGCGACGGGTGGC
GGCTATGCGGGCGGAAGGGAGGGAAATGAGATGAAACTTCCCTCCCGTCA
ACAGAAACAGAGGATATGGTTCACGTTTAGGTCGGGCTCGAAACCTGGGT
TTTTCCGGTTTCACTGGTGTGTTTTCTTGACGGCCCTAAAATTTTTGGTT
CGGTCATTTTTGGTGTCTGTTTTGGCCACTTTTATCGCGCGAAACCAAAA
AGTGGAGGTTATTTTTATGGTTTCATCCTTTTATGGTGTCTGCTAGAGAT
GCTCTAAGATCATAAAAAAAGAAGTATAGACTTAAAAAATATAGAAGTAT
AAACTTACTGAAAGGAAAGTAGACATTTTAGATAGGGGAGTGTAGAAAAT
TCAAAAAAAATGTAAGTATGAAACCGCATCAAGAAGTAAGAACACATAGA
AACAGAAGTATCAGATACAAATAAAAGTAGTAAGAAAAATATAAAAAATT
AGAAAAATTTAATTAAATATTGTTGTGGGAAATATGCAATCTTCATCGTG
GAAGTATAAAAGGAAAGTATATACTATATATACAAGAAGTTTGATATAAA
AAATTAAAGGTGCACGTCGAAGGGAAGTACAAGTTTGATATCTTCACAAT
GTTCATAGCAATAAGATCATAGAGAAATTTTGTTGTTTGTTCAGACTTAC
ATGTAGAATAAACCAACCATATAAAGTTTATATGAACAAGTTTTTTTTTT
CAAATTACCTATGGGGCAATGCCACCGACATTAATGCTTCAAAAGTGGTG
AGATTTTGGACAGTGTTGTTAACTTTGCCGGAATTGTGGTATTTCTTATA
AATTTACTCCTTCTATGTATTGATGTGCAATCTTAAATATTCTCTAATAG
ATGAGAATTTAAAAATAAATCTTGACACAAGAGTTCATTTTTCTAATCTA
GAATATGAAATTTTCCAAATGTTAATGATGTTATTTTTATCTATTGTTTT
CTGATCTACAGATTTCTGTGGTGCAAAAAAATTTCAATGGCCACTTTTCG
CGTAGAACTACTCAAATACAACTAAACTAAAATTTACCATGGACTAATCA
CGAAACATGCAAATAATTTTCCTGAAAAGGATTAGCTACGATGAAGAAGT
AATGGAAATGACAGAACCATGGTAAAAACATCTTGTATTTCATCAAATAA
TTTCAAGATTATATATTATTTTGTCCTTTTGCAGGCAATGGTTGACAAAT
ACTCATCCATATCTACTCGAAAGCTATCTAAAGCATTCTCGGTGCTTAGT
CATGATAAAACAATGGTTTCTATGAGTGACTATGGTGACTTTCACAAAAT
GACAAAGCGTTTTGTTATGGCGTCCTTGTTGGGTCCTTCTGCTCAGGTAT
AAGTCTCGGCATTTTCAAATCATACTGTTAAGTTAGCACGTCTTCTTCGA
TACATTTATGTTTTTATTTAAATAAGAGATAATCATCATATTCTTTTAAA
TATTCAGAAACAATTTCAAGACACAAGAAAACACATGATGGATAACATGG
TAAACATTTTTCGTACATCGATGATTGATGCCCCACATGCTACTCAAAAC
TTCAGGAAAGTTTACAGGGCCGAGATATTCCGTGTAAACATGATCCAGGT
TAGTGTACAAATACCAAGATTTAGTGTGCTTATACGATATTGCCATGATT
TTGTTAATTTGAATCGTCGTGGTATGAGCATGCTCCATTTTTAGTGTTTC
GGTGAGGATGTAAGTTCAATTTATGTGGTGGAGTTTGGGCGGGAGGTGTC
GGATGAGGAACTATGTGATATCATGGTGGTTGACACGCTGACGTCCCTAG
CCGAGGTTGATTGGAGAGATTTTTTCCCATACCTTGGTTGGATTCCAAAC
AAGAGGTTTGATGCAAAAGTTCTACCAAGTGAAGCTAGGCGAACCGCTGT
GACGCGAGCTCTAATCAATTATCGAAAGGAGAGAATTGAGCGCGGTGAGG
TGAGGTGGAACCAACCTATCCACATGGAATCTTTTAATGATTATATGTTT
CTTTTAAACCGGTTCTTACGTGATATGTAGCGACGGGTAAGCTATGTGGA
CTTCTTGCTGGCAGAGAGCACACTCACGGATGAAGAATTAATAGTGCTGG
CTTGGGAGAATATCTTAGGTGGTACAGATACCACAACGATGACGACCGAG
TGGGCTATGTTCGAGCTTGCCAAAAACCCTGAAATACAGGCAAGCTCACC
TAGTGTTGTTTCTTTTTTTCCTGATAAAGAGATATTACTTGTTGTTGCTA
TATATTTGTCGATGTTCTCATGAATAGTACTATCATATATGTAGCCATAT
GCATTTCTTAACACGCCAGATTTCTTGTGCCAGGACCGTCTCTACAGTGA
GATGCAGGAGGTGTGCGGCGATGATATTGTCACCGAGGATCATCTTCCTC
GGCTGTCGTATTTGAAAGCTATTTTCTTCGAGACGTTGCGGCTCCACCCC
CCTGGCCCGGTTCTGCCTCCTAGGTTTGTCCACGAGACCACCACACTAGG
TGGCTACCAAGTCCCAGCTGGAACAGAGGTAATCGTACTTGCGTGAACAC
TTGGCATCTTAATAGAAACTCATACGTCTCCTACCCGAATATGTGTACTA
CATGCTCACAAGAGTGGCTATTTATTTTCAGTTGATCATCAACGTGTACG
GATGCAACATGGACAAGAAGGACTGGGAGGAGCCTGAGATGTGGAGGCCG
GAGAGGTTCATGGACGGCAGGTTTGACGCCACATACAAGCCCATAACATT
TGGCGCTGGGAAGAGGATCTGCGCCGGAATGGCACAGGCGACGAGCATCG
CGTGTACCTCCATCGCGAGGTTTGTGCAGGAGTTCATCTGGAGTCTCAAG
CAGGGCGACGAGGATAAGGTGGACACGGAGCAATACGTCGGCTCTAGGCT
CCACCCCCTCTACATGCATCTCTCACCAAGAGGAGGGTGGTAACTGGCAA
GCACATCTTCGCAACTTGTCCAAGCAAGAAGAGATATATAGTGGTAATGA
ATAATGTGTATTGCATGAGCAGTATGTTGGGAATTCATGCATGAATCCCT
TTAATTTCTTTTTTTACATGATGTATGTATCCCTATTTGTGGCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.