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GrainGenes Sequence Report: AA001503

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Sequence
AA001503
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001503
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGTAGCATTCCCCCCTACGCCGCTGGGCAGAGCACATCCGCCACATCACA
CCAGCCAGGCAATTCAAACCACACCAGGGGCTCCACGCTCGCTCGCTCGC
TCTCACACCCACGCTGGCCGCGCTGCTGCTTCACGAACTCCCTCGATTCG
CCCGAAGCCCCGGTCCGTCCAAATCGCCCACCCAGAAAGGGGCAAAGGGG
CCTGGAATCCGAAATCCCAAATCCACCCGGCGCGATTCAAACGACCCACC
CCCGCTTCTCGCCCCTCCCCCCCTCCACCTCCCGTCACGCGGCGGCGGCC
CTCGCGGTGGCCGTGGGGAGAGCGGCCCGCGATGGAAACCCTAATGGTGG
ACCGCGTCCACAGCAGCCTCCGCCTCTTCATGAACCGCAACGCCGTATTT
CTCTGCGAGCGCCTCTGCGCCCAGTTCCCCGCCGAGGTAACCTGCCGCGC
TCCCCTCCTTGTCTCGATTCGGTGCGCTGATTCGTGGGGAATGGCCCGGA
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GGCTTTGCATGGTGAGCTCGACATATGAAGTTTAATTCGAGTGGCAACCC
CTAGGTCCAGGCCAGGGAGAATTTGGAACACGCATGCTTGTAGGGACTGG
ATGGTGAGCTCTGCATACGAAGTTTAGTTCCGAAGGTAAACCTTAGGTTT
GGATAAGTGGGGATTTGTAAGGCACACACAAATCCAAAGTGTTCCGTCTC
TTCTCATGGTTCTGTGTTGTACAACCACATGACGGAACATGCCACCTTTC
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GGTTTACACTGGACAGGACATCAAAGATACATGCTTGTAGGGATTGCATT
GTGAGCTTTGCATATGGATTTTAGTTCCAATGCCTAACACTAGGTTTAGG
GCAGAGGGAATATTGAGGGGCATTCAGAGCCAAAGTGCAGTCTCTTCTCA
TGCATTTGTTCTGCACAACCGCATGATTGGACATGGCACCATCGTCTTTG
GTCAATTGCAACACCTCCCCTATGTGTTGTGGGCCTTGGTGAACTCTTTA
GGATCCCAGGACTTCCATGCATCTAAAGTCTCGTAGGCTGTTGCACTGTG
AGATGCCATTTTGGCTGTCTAAAGCAGGTATTTCCTCTACGCCTCTTGGA
AGAAGTGCAATCTGCGAATCTCTGTAAATTATAGGACAGCCAGTTGGAAG
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AAGGGTCCACATGTGTAATTATTAAATATGCAATCCAGTTCCTCATTTTT
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TAACACATATTTCCTCAAGAGATATAGCAAAACCATTTTCTAAATCTGTT
TGCAGTTCTATGTTGTACTAAATGTCCTTCTGCTTTCTCCTGGTTACAGA
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GCTGCATACCACATATTGAAAGGTAAATAACACCTGCTCAGCATGTGATT
GCTCACCATCGTGTAGAAATGTTGTATTGCTGTTATATGCTTTGAAAATA
AAAAGAATGCAGGCATACTATTTGTTCATCCATTTGAATATATTCTCTGT
CCTTCCGTTTTTGTTCAAATTTTACTCTTTTCCGTTTTAGCTGCCAGATT
ATTTTTGAGTGATTTTTCCTATATGCCATCTAGGTAAGAAGCTGCCAGAG
TCTCGATACTTGTTTGCTATATCATGCTTTCGAATGAACCTCCTGCGGGA
AGCTGAAGAAACTCTATGTCCAGTCAACGAACCAAATGTTGAGGTATATA
ACAGGATTGTAAACATGATATGCTTCCTGTTTATCTGAAACTATGTCATA
TGGTGGTTGTAGATTTATCATAAGTTCGGCTAAAAACTCTAGTTCTTTTC
TGGTTACCATGAAACAGCATTGGTTCTAAGAAGGGCATTTGTTCCGTGTT
GTCTTGTGGTTGCCAAACGGGAACTAAAAAAAAGGGATGCATTGTGTTTT
TGATGATTTACTGAGTAAGAATTCTAAAGCTTACAAATGTGCACATCTTG
AAAGTAATACTTGAAAATTAGACCTGTTTGATATGTATTGTCTGTCGAAG
CAATTGTACCAACTATTTCATAAATGAACTTAGATTTGTATTGATCCCTT
TCAGTCCTTTCACATCCTGCATTTATGATAAACATTGACTCTGCATGATC
AATATTTGACACTGCATGGATGGTGCAAATTGCAAAGGCATTCTTTTCAT
TCCCTTCAGTGGGGCATGCTATTCTTCTAAGATTGCTGGAGAAGTATTTT
ATTCTACACGGGTGAAGTAACTAGTGAAAAGAAAAATCAGTCACCGTCCC
TTCGGGGACATCCGATAAAATTGGAACGATACAGAGAAAAATCAGTCACC
TTTCTGCCTGCTTTATATTTTTGGCCATATTGTTAATTCTGTTGATTCTC
ATCCTTTGTGCAGGTTCCAAGTGGTGCGACAGGACATTACCTCCTTGGAC
TAATTTACAGGTCTGTTATTCATGGCAGAACTGAATCATGTGTGCAGCAT
CTTTTGATTTATGGCACATTGTTCAGTTTATATAGCTCATATCCTTGTAG
GTACACTGGCAGAGTGGCACCTGCAGCTGAGCAATTTACACAAGCTTTGA
CTCTAGACCCTCTTTTATGGGCAGCATATGAAGAATTGTGTATACTAGGT
TGGTACATTAGACATCCATAATTGGATTTTTCTTACTAGGTTGGTCTATA
CTTTTTTTTTATTAGAAGCCTTCACAACGAATTTTTCAATTGGTTTGGGA
TTAGAGAATGAAAAATACAATGCAGATTTTCTAGAGTGCACCTTCCAAAA
CATGGCATCGCAGGTGTCTGTTTCTCATACCCTAACATTTGGAAATATGG
GGAATCTGTATACCAGAATGTTTGTGTGTCGCTGTGGTAAATTCTGCATG
AAGGAATTGGAGTGCATACAATCGTTCTTGATTAGCTTCATGTTATCAAT
TAATAGTTATTCTTTATAAATTATCATGCAGAACATTAATGTTGCGATTA
TACTCATTTATATGCCTAGTGGGCTGCATTCCTACTATCTCACATTTCTC
TAGGATTTACACAATACCTCAACACTCATTGGCCAAAAAAATAAAATAAA
TTTACACTTTGAAAAACAGGAAGTTATAAACATGGACTGAAAGTGTGTTA
CCATCTTTTAGGTGTTGCTGAAGATGCAAATGAATGTTTCAGTGAAGCAA
CTGCTCTACGTCTCCAGCAAGAACACACATCCACATCAAATTTGGAGAAG
TCAAACTTTGTCAATGAAAATCGAGTTCTATCTTCCAATGTATCAGCAAG
CCTCATGGATATCAGCCCAAAGCAAGTAAAACAACTGCATGCTAACAACA
CAGCCGAAGTACCTGGTTATCCTCATTTAAGAGCAACCTCATTGCATGCT
CAGAACAGTGTATCATCTAATTTAGGACAGTTTGATAGCCCATCACCAAC
TGTAACACAGGTTAGTACTGGAACCTATTTGATTCTTTGTTCTGTAGGTT
ATCTGGCAATATAGATTTGAACCACTGCCTGTAGTCAACAGTTATAAGAA
GCATGTTAAGCAGCCAGGAATGTCTTATGTTTCATGCTTGGTGGCACTGG
CAAAGATGTCTTATGTTAACCAGAGATTTTTTTGTTTGATCTATCCGCAT
CCTTTTCGGTTCATTCCAATTATTATTTTGATATCAGTTCATTTTCAATA
TTTTTTCTGAGAAGAAATAATAGTGTAACATTATAACTTGGACTCAATAG
CCCTTTGACAACCTTTCTTCATTTTGAAGATTTAGTTTGTAACTTGTCTG
ACTTTTCTCTATTGCTAAGTTTTTTTTTTTACTTAATTTCATTTAGCAGA
CTTCTGGCATTGTTCCACCTCCACTCTTTAGGAATGTCCATGCCTATCAG
AATACAATAAGTGGTGATGCTCTGGCCAAACCAAAGGTTAATGCAGTGAA
CCAACCACTTAGAAGAAAATATCTGGATGAAGCAAGGTTGAAGAAGGTTG
TTTATCAATTGCAACATATTCTCTTTATAAACTTTGATATATATTTTTTA
CTTTTGTCCCTTACTTGGAACTTCTAGGGGTCTCCCTTACTGTGAGATAC
CGGAGACACCTCTTTTTCGTATTTTAATTTAAACACAGTAGGCCCCTCCC
ACTTTACTATTCTCTGAAAAGGTATGACGGGTGGAGTAAATGCACATTGA
AATCAGCTAAGAAATGCTGATATTTTACAGTCACTCACTCATGCTGCTTT
CTTCAGTATTAATTGTGAAGATTGTCTTCACTTCCTGGCTGTCCGAGTCT
GTAAAATTCCAGCCATGGTCCTTGATACGAAGATTCAGGATTTCAGATCT
TTGCTGTGACTTAGTGATCCACAGTATCAGGGTTGCAGTCGTGTTTTTTA
GATTCTTTGCTGTCACATGGTGGTCTGTATTGTTCATTAATTAATATAAT
ACCCATATCGTGCAAGTAGTTCCATTTTCCAGCACCAGTCAATTATGTAA
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GCAGGTTGCCGTGTAATGGATATGTGAGGCTTTCCCGTAGTGGAGAAATA
GTACAATTTTTTCTTAAAAGAGAATCATTGGCCCGGACTGTCCAACGCAC
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GTAACAATGTTACTATGCCTAACAACGTTGCGGGCGTAACATTGTTATCA
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AAGTTGTTTACATCACATTGCAGTACTGCTATCTACAATAATAGCTGGCA
TAAGGAACTGAAAATATTGCTATAATCTTTCCGTAACCTTCTCTCATTTT
GTTGCCATAAGTTTGTCCACGATGTAATACCCAGTGGATATGAAACTAGT
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TTTTTATTCTTATTACCCTCTGTTAGAATGACCCCGGCAATCTAACATAG
GGTCTATATATGTTTTTTTTGTAGCTTCATGGTCTGGCTGCACCCCTTCT
TTTATATCACTTCTAATAGTCAGCATATATATATTTAATTTACATTTCTT
GCTTCATTTTTTGCTTATGATGATATTAGACATCTTTTCAGGTTACTGGA
AGGCTATTTAATCAGAGTAATGATTCAATACCTCGAAGAAGTGCAAGACT
TTCTAGGGATACACCAATAAATTCAAATTCAAATATATCTCAGTTTGGAG
GGAATGGAACAGATCACTCGTCAGGTAAATTGCGAGTAAACTCGTCCACA
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TGGATGATCCATCTAATTGTCACGTATCAAAATGTGGTTGATAGTTGTTA
TATACCTGTGAAGTCTGGATCCATCTGCATATTTATCTACACGTTTCTGT
TCTGTTTATGAGTTTAAATTAGTTATATTAAGTCATTCTGTTATCCTGTT
TCTTGTTGCCTGTACCTATGCTATCTTGCGCTTCCATTTGAAAATTGTGA
TTCCGACACGAACTTTTGAAATCCGTTTAGGTTGTTACATGACATTAATG
TGTATTTTATCATATCTCCTAATGTCAGTTCAGTACTTAAGCGTACCGGA
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GTTTTTTTAGGTATCGTATAAACAACAAAACTGTGTATTTTTTTATATGA
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TGCCTCTGTTTCTTTGCACAGGGGATTGGGATAGGGTGTAGAAGGGACGG
TGAAATGGGTCAATGAGGGATTTCATCTGGGTATTGGGATTTAGAGCAGA
CTGGCTGAATCCCGAGGGAAGCTGCAGTAAAAGCCACCTCATTACGCCCA
CGGAATGGCTCTGCATGCAGAATATCTAACGTGTCCAGGGTCAAGGTGTG
ACGTTTGGCTTTCAGGTTAGCAAAGCCCAATTTCCTTGAAGCGGTAATTA
CCCACTTAAAATGTTTAGGGCAGAAATAGCAATTTGCATTTTGAGGACAT
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TTCCGTGATAGTTCACACTTCTCACTACATCACATGTAGAATTTTTTACA
AATCACCATGATTAACTGTTGAAAGCAATTTCTTTCTGTCTATAAACACC
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ATTTCTAGTAAAATCTTTGCATTAGATTATGCTATATGGATGGCATAGCA
TGTTCTTCTCAGTCATCTTCACATGAATGACGCGAGTTGTTTTTCTGAGT
CTCAGGAAGCAGGTATGAAGCTGTTGACGAGATGTGGACAGATAATATAG
CAGCAACCTCATCTTCTGTAAGTATAGCTGAAGGAAGATGCTTCGAGCAA
GATAAACCTGAGCGAATCATGTCGCAAGACTCCAAAGTGGCGTCTGGTAT
CAGGGAGCTATTAGGACTTTTACGGACACTTGGGGAAGGCTATCGGCTAT
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TTACTGCTGATGTTAGATATTTAATATACACTTTGTTAAAAGATAAGCTC
TACTTTATGAAACCATGTCAATTTTTCTTATCATTTATATAAATGAATAG
AATAGTATGCAAATATTCTTTTTTGCTTATTTTTGTTTTGGTCCACCATG
CAGGTTGGGAAGGCATATTTTGAATTGGTCGATTATTTAGAAGCTGCTCA
CTTCTTTGAGTTAGCGCATAGATTATCACCGTGCACGTTGGAGGGAATGG
ACATCTACTCTACTGTTCTTTATGTAAATGAGCTCACCACTGTTGCGCTT
GCCTACTTTATAACCACATTTAGCTCTAACCTCAGATGCTTCTTTTGCAG
CATTTGAATGAGGAGATGAGGATAAGTTACCTTGCTCAGGAGCTTATTTC
TGTTGATCGACTATCTCCTCAAGCATGGTATGCTGGTTGCCTTGAATTAT
CATGTTGGACCATTATCTTTTCACAGTACAGAAGTTCAGGATTATGAAAA
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TTGTCTCAGCTCAGTTCTAGGCAGCTAGACTAAGTTACAATTGCATAAGT
GTGACATTTTCTACTGTATTCTCTTGGAATGTGCAACAGGTGTGCAGTGG
GAAATTGCTTTGCCCTGCGGAAAGATCATGAGACTGCTTTGAAAAACTTC
CAGCGTGCCGTACAGATTGACCCGAGAGTTGCATATGCTCACACTCTATG
CGGTCACGAGTACGTTTTTCCCTCCCATAATTATTGATTTGATATTTTCA
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AACATCTGACACTTTGACTCATGTAAATCCAAAGTCTGACCATCTGTTGT
ATTAGTTGTCCAATGACATGTGGAAACTTCCTTCACACCCTAAACAACGT
GGTTGAATTGCGATTTTGATTTAGCTATGAATGCACTGTAATTTCTAATC
GCCAACAAAGTATGTTTTTAACATTTTGTTGATGTAAGAAGTGAGCTAGG
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TAAAGTCATTACGGACGCGAACTTGGATTCTTATTACTTGAAAAAAAAAT
CATCAAAAGAACATTTTGTTGATGTACATGGAAAATTTCCTTTTTAGTTG
GTGGACTTTACTCTTTCTATTGCATCATGTATTAATGTTTGAGGCCACAT
GTTAATTTATTTTAATCCTACTGCCATTCCTTTGAACTGTAGATATTCTT
CATTGGAGGATTACGAGAACAGTGTTAAATTCTACCGATGTGCACTTCAG
GTGGATGAAAGGCACTACAATGCCTGGTATGGGCTTGGAGTGGTGTACCT
TCGCCAGGAAAAGTTTGAGTTTGCTGAGCATCATTTCAGAAGGGCATTTC
AGATAAATCCTCGCTCTTCTGTTCTTATGTGCTATCTTGGGATGGCCTTA
CATGCTCTAAAGGTTGACATTATCAACAACTATAACTAGTTTCTGGTTCC
ACTTTCCCTCTACAAACTTGTCTCATCGTCTTCTGGGCAATGCATAACTC
TGAACCTCCTGATTTTGAGCTTTGACAGAGGAATGAGGATGCACTGGAGA
TGATGGATAAAGCTATATTTTCTGATAAGAAGAATCCACTTCCCAAGTAT
CAGAAAGCTTTAATTCTGGTAGGTCTTAAAAAGTATCTGGAAGCTCTGGA
TGAGTTGGAGCGTCTAAGAGCGATTGCACCTCGTGAGAGTAGCATGTATG
CACTTATGGGGAAGATATACAAGCAACTCAATATTCTTGACAAGGCTGTA
TTTTGCTTTGGCACTGCCCTGGATTTGAAACCTCCTGCTGCTGACCTTGC
TATAATCAAGGTATGACACTATCATATTTATTACCTGTGTTCTGCTCCCA
TTATTCTTTTTGTTTTGTGCACTACTTGTTATTGCTATAATTAAACCAAC
CTGTGTTCCTAGAGGGGTCCAGTAAGGCAGTAACCACTGCTACATAAACT
ATTGCACTTTTAATCCCTTCCCATTACTGTGCGGGTCTCATCGGTGGGAA
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CTGCAATGGAGAAAGTACACCTTCCAGATGACCTGATGGATGATGACCTG
TAAGTTCACTCTAGAGCACAAACCGAGAAATGGACATGTACTCTGATATG
ATTTTCTGCTCGTGCTGTTCTAATCCTGGCCTGCTTGCGCTTTCCGAGTG
ATTCGGAGCTTTAAGGAAGAAACGACATCATGTGGAATCGGAGTTTGCTG
CTCCTATGGATCATCTTGGGGCATTAGGGTACTATTAACCATCCAGTTTT
GTAGCATTAGCTGTAACCTGTAAACTAACAGCACAATCACAGAAGCTGTA
GTAGTTTAGGTGTACAAGTTTAGTGTTGGCACTGAGGCATGTATCATTGT
ACAATTGTCCAATCACTAGAAGAGATAATTCAGAAATAACAGAGGTTATC
CAAGGATAAGATCAGGCTGAATCAAACAGATTATGAATTGCATGAAGCAT
TTCTGTACAAGTCAAAAGCATTGGAGAAGGCGGGAGGAAGGACGGACGCC
TGTAAGTAGTGGGGAGAAGTTAGGGAATACATGTGGCTTTGCATCCGAGG
AAACTGTAACAGTTTGTTATCTCACCATGCTGGTGTGGTAGTAGCCTTAT
GATTCCTGGTGGGCCTGCATCATTAGTAAGTAAATTGTCAATTAAATTAT
ACTGCTGTAGGCAATATGTGAAAATTTTCAATGTAATCTCGCATGCTGCA
GTGTATCCTGTTTCTCAGAACATGAAAATGATGATTAAGATCCAACTTTT
GGTCCTCAGAATGTGGCTGCTTGTCTCAAAACACGAGGTGTCTACCATTT
GAATCTACAATATTACGAATTTGCTCTTAGTAATTTGTACAGTTAGATCT
CACTCGGTACTCCACGTTCCTGTAGTTCTCATTTAGCAGTTTCTGCTCTT
GCAATGTGCTGATCGTGCTACTATTTGAACCTGCGTACAATTTTTACCTG
ACATGTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.