Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA020179

[Submit comment/correction]

Sequence	AA020179
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA020179
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTACTGTCCCCACTTCGCTCCCCACTCACACAAATCCAAAATCCCCACCC CCCTCGCCGGCTCATCCGCCGTCGCCGTCGCCGTCGTCGATCATGGCCGG GCGGCCGGTGTTCACCAACGTAGACCCCGTGACAGCGGCCGATGCTCTGC GCAAGGGCTCTGACCCGCACAAGCTGGACCAATCCACGGAGTTGATGCTA ACGTACACCTACCAGCTCCTCCCCGACTTTCCCGTCTACGACGGCCGCCG GCTCCCCGACGCCATCGCCGTTTCCGACCGCGTAGACCGCATCAGCCGCC TCCCCCGCGTGCTCCTGGGAAACATCGTCTCCCGCCTCCCCGTCAAGGAC GCCGCGCGCACCACCGTCCTCTCATCCCGCTGGCGCACCATCTGGGTCTC CACGCCCCTCGTCCTAATCGATATGCACCTCCCCCCCAAGGGCCAGGGCT GGCCTCCGACGCGCGCCAGCTCGCCGGCCATCACCGCCGCCGTCTCCCGC ATCCTCGAAGCGCACCCGGGGCCTTTCCGCTGCGTCCACCTCGTCTGCAG CCACATGGACAAGTACCGTTCCCAGCTCGCGCGCTGGCTGCAGCACCTCG CCGCCAAGGGCGTCCAGGACCTCGTCCTCGTCAACCGCCCCTGGCCGCGC GACGTCCCTCTCCCCGCCACGCTCTTCACCATCAACACCCTCACCCGCCT CTACCTCGGCCTCTGGAAGCTACCGGGCACGGCCGTCCTGCGTGGCCCCT CCTTTCCCCACCTCCGCGAGCTCGGCCTCTGCTGCGTCGAAATGGAGCAC GGCGACGTCGACTCCCTCGTCGCCAGGAGCCCCGTCCTCGAGATCCTCAA CATCATGGGATGCTTCAAGGGGCTGCGACTCCGCCTCGTCAGCCAGAGCC TCCGATGCGTGCAAATCTGCATGTCGATTATGGACAACATTGCAGTGGTG AAGGCTCCACGGCTCGAGCGGCTCATCCTGTATGGAACTTGCAACACTGC CACCGGTCATGGCTTGTGCACCCGAGTTAGGATTGGTAATGCCCCCAAGC TGCAAACATTTGGATACTTGGAGCCAGTTCACATCCTAGAGATCCGAGAC ACCATCATCATGGTACACCTCCTATCCCAAGTCTTTCAATTAACTGATGT AGATCCATGACTCAATGTGTGATATTCCTTCCTTTAATTGGGCGAATTCC AGGCTGGGATAAAGCCGAGCACAAGTACCATGGTCACAAGTGTGAGGATT CTTAGTATGCGTGTGTGTTTCGAAGTTCGTGATGACGTCAAGATGGTGCC CACCTTCCTCAGATGTTTTCCCAACGTGGAGAGACTTCACATTCTGGTAT TTGCCACCAAGTCATGTCTTGCTTACATTTGCATGGATTTCTCACATGTT GTTGCTGGTAGATAGTTCTTCTGGTTGATTGCCTAGGTTTACTTCAAGTG AGTTATGTCGATAGTTCTCAACGGACATTTGGTTTCTTGCACTGTAATGT GAATGCTATGCAAGCTAGTACAAGTAAATTTTCCATGCATTAATTTATAG TGGCAAGAACATCTGCTGGAGGACTAGGCATACTTGCCAATTATGACGTG TAACATATGTGACCAGTTATAGGTTAAATGACAAGCCTTACGGTTTATTC TCAGCAATCAGGTCTTCTCTACCATCTGCATGCATAGACTACGATACAAC TTTATCTAGAAAAAGACTAGAAAACAAATTATTATCATGAAAGGTTTCTT GTTGTACGATGATCATTGTTCCAGTATCTTGTTTTATAGTTTTGCTTCTT TTGGTATGTCCAAATTTCCTTGTTCTATTGTTTCTTTCTTGTGTTCATAT GAGCTACTAGTATTGATTGTTACGGCAGTAAACATGCATTGCTTATTACA GTAGCTACGCATGAACTAGCACATTCATGTCGACTGTTCTGCATTGGTAT ACCATAATAACATTAGATGCTAGTAAATTAGTTTCCTCATATCAGGAGCA TAAGAACTTATCTAACTAATTTATATAGAAAGAGGCTGTCTTAGCTCACT TTTGGAAGTTTATATTAAAGCTGGCAGAATATGGTTAAGACTTAGCATTC ATTATGGACTCATCTTTGCAGCCTTTACATCAAATTGTTACTCATGAATC ATCGTCATGAGATCTTGTTTAGTGCATATGTATTCTTGTTTTTTTCTCTG CTCTGCTATGCTATTTGCTAATTAGTACATTCTGCCACTTTCATCTATTT GAAGTATAGACTTGTCACTTCTACGAATCTGACTATCATTTACTTATGGA CCAGTATAATTTGCAGTACTTAGTATTGAGCAGTTATCTGCTGAATCTTA TCCACATAAATGCTACATTTGCTTATAGAAATGGACTTTGATAATGGTAT TGCCTTTTCAGACATTTTCTTTCCAGAGAGGTACTGGAAGCTATGGACCA TTTCATTTCAGCTTATTCATACGCTGCTTAGATTGTTACCAAATTCGTCT ACTTGCTACTTGAAAATTTTGTCCTGTTCTTGCAGCAGATTTTGTTGCTT GCAGTTTTCTGTTTTATTTTCATAGATGCATCAAGTAAATTATCATTACC GCGATTGCATGTCCATGTTTATGGATTTTTTGTTATGCTTTAGTTTATTG TTGTGCCTTTATCTTGATTCTATTGCTTTTCTTATTTATTTCTGGTTTTC CATATTTTCTTATTCTAGTGTTTCTCATTGTGTACATGTGTACATTCAGG GTAGCAATTATGGTATGAATGATGCAAGTAGCATGCAATGCTTATGCCAA ACTGATTAAACTTACACATAATAAACTAGCACATTTGCTGCCTACAATTT CTTGGAGAATGTATGTATACCGCTCATTCCAAATTAATGCTACTAAGTCA ATCTCACAATATCAGGCTCTTATCTGCTTAATTAGTAATTACTAAGTTGT CATGACTCGCATCTGGAAATTTTCCTTAAAGAATATTTCTGGCAGACCGT TCATGGGCACAAGACCTCCACGATAGACCGACCTATGTTCCCTCACTTTC TATTTGTTATATACCTGCGGGGCTGCACATACACCAGTATAGTTGTTTCT CTGTTCTAGTAGGCTACTTGATGCATGAAAGTATTGATTTGTCATTTCTC CCAACAATATCAAATCTGGCATCTAGGTATGCACAAGTATAACATAGTAT GTGTTCCATGACATTATTTGATGCTTCCTGTACTCACCAAGTCTCCTCGG ATGCTTTCCCGATTGTTGACTCGTTGAATCAATTTATGCAGAGTGCAATG TGTGATAAACCCACTGGTAACCTCCCCCTCAAGTTCTGGGAAAAGTCTGG ACCCATTGACAACATCATCTCGCGCGTCAACGTGATGAGTCTCTGTGAGT TCAGAGGAGAGCCAGGCGAGGTTAGCTTCCTGGAGTTCTTCTTTCAGAGT GCACGGGTGCTGGAGGGCGCGACTATCGTGACGGCCAATCCAAGTCTCAC GCCATTTTTGAAAGACGTGGCGTTTTCCAAAGTGAGAAGGAGTTCCAGAA ACATGGCAAGTAAATCCTGCAAAATGTTCGTCTTTGAGAGTAACGGTCCG GCGGGAGGTAAAGTTTGGAGCTTCAAAACTGGGGCGAATTTTTCTTTCCC AGACCCTTTCTCGGCAGCAGAAGTTCTCAGCCGAGCTTAGTTTCTGTGGA GAAGCGGATTGGTTTTTTGAATGCGGACTATAAAGCATGGTATCTGCCTT TGACGTTGGTCTGTTAAATCTGTGGCTTTACTACAAGCCTGTTCCTTGTT TTTGTAGTATCGGTTAATTCATAGTATATCTGAGGGTGTCACTAATTACC TCCAATATATCAATCAATATATCTGGGAGAAGTTTAAGTTTATTTTCATA ATTCTTCAACCTTACGTGTTGATAGAAATAGAATTACAGATCCTGCTATG TTCACTGCTCAATGGTCGTCCCCTGCTTGAAGTCCCAGTTGTTCCTGTCA AAACACAAACCAATTGCTCTTCAACTTGATGAAGCAAATTGTCAATTGCA AATACCAACTAGATAGATACATATTTCAAGTTTAGTAAAATAGTATACAT TTACTTGGTCCCTGCGGTAAAAAGAGGGCATATCCTTATTAATGCTATTT AGTTAAGCACGTTTGAAAATGCCAAGATTGTTGTTGTGAGACTTAAATAG CAGCAACTAGAGTTGAAATAGCCTGTAGTGTTTTTTCCAATCTGAAAGTT TATTGGTCTTGCATCCCACCTTTGATACTAGACAAGATTTTAACTGTGTA GCAGCTGAAATTTACTTGCGGCTATGGACTATCAGCGCGGATTCTACAGA ACTTTAGACCAACATAATACAGTGTGGCTCTATTTTTTTTTTGTTTCTGT ATGTTGCGATTCTAGTTCATCATATTTTCTTTTAATTCTCTAACGGTGGC AAGCTAGTCTTAAGTCTTAGCTAGATTAGTATGAACACATAATTCTGTTA CATAATGGTATCTCGTCCACCAGAATTCATCTTCTTGGACCGCTGATTCA ACATATCTGTCGAGATTCATGTTTTAATCTGCCACTAGAATGTCGGTTTA GTTACTTGGCCTGCTGAGCCATTCTTCCATGGTAATTGAAGGGTGAGTAT TTTTTTTCTAGAATATCAATTAATAACATCAAAGAAAAGAAAACAGGACA TATTTACTCTATATATAATCTACAGTCAGTTCCGTATGTTTGTTCCTTAC ATCATCTGAGTAGTTTGTATATTTATCTAGCTTGTCGATGATCTGTTAGT ACACCACGCATATCTTGTTATTGCTTGCCCACGTAAGTACAGTGGAAGTA AATAGAATCGTCCTGTACTCGGGTGTTCTTTGCGGTGTTCATTGAGTTAG AGGTCTGACGCACGAAGGTTTTATTTTACTTATTGAAGAGAAAGGTTATT TGGTTTGTGCTGCCATCAATGTTTATTCACATAATTAATTCTCTGAATCG TTCCTTGCTGAATTGTTCTCTGATTTTCTGCAAGCAGACTCCGGCAATGC AGAATCTCAGAAAATCTGTGAGCGGAATGCTACTCTATTGATGGTTCTGA ACACCATTATTTGTAGAATACTACTCGGTTTTAGGGATTGTCGAAGTCTC TGTTTGGTTGAGCCGTCTGGGAATCACTGTCTGTTGTAGATAGACTGGCA CTTTGGCAGCAGCAAGACTTTTGTGATCTCCCTGGCCTGGCGTCTAGACT CTAGAGCATGTTAGAGTTAATCTTGCCTAGGTATTTATTGGCTAGTTAAA CCTGGTAAGTTGCATATTTGCATGTGTTGTGGTTGGCCTTCATGCCATGG CGTGGTAGTAATTAAATTATTAGTTAAAAATTGGTGGTAACAACTAATTT TATTACAATTTTAGTGACTTGTCTGATTTTAAAATATCGTTATAGAATTT TTCATTTTCCTGAGTTAATGGATTGTATGTGTTTCAATTGTTCAAATTGA TTAGTAGTAATTTTTTAATCTCTGGATGAATTATCTTCTAAGTTTCTAAA GTTCACAGATTTTTTGCTTGTACTTGTAATTTTTTTAAAAAAGGCAGTAA ATGGTTAACTCTTCTTATTATTTTGTGAGTTATCTGGTTTTTAAATATCA CTATCACATTTTCTTCTTCTTACAGTTTGAATGACATCCAATTAATATAG TTATACCTCACATAAGCCAAAACTCGACCAACTTGAGGCAGAGAAGGTAC CATAAACGATTTCGGAGTTGGTGAGTGGCGTCTAGCTAACTAAAATTACG ACAAGAATCATAAATGGTGGGAGTAGCTTAGTCGCAAAAAAAAGTCAAAT ACTTCAAAAAAAAAAACAGTACAAACAAAAATTCCTCTAGTCACGATCAT TCCATGCCTCGGGGCTACCAATCTCCGTGTCCACACTACCGGGGCACCCT TGATTCCTTCTCCCATTTGGCGCCCTCTTTCCTCTTGCAGCAAAGGTTGT GCCTTACTGCTCCGAAGGTAGACCAACAATGTTGCGAATCTATATCACCA ATGGCGCAAGGCTATTGATAGCGTTACAAATGGCACACCACGGCTACCAA GGCCTCACTTGCTACTATAAAGATCACTCGCCACTGTTGTTGCGAAGGTC AGTCGCTAATTTGTACGTTTGTTGTATACTTCACTAGCTACATCCCAATT TGTTCTCAGAATTTTTTGGAGCTTAGAAATATGATGTCCGTTTTTTAAAA GAGAGTACTGGTCACATGTGCATCAAATCTATCAAATCCCAGCTCAATAA AACAAAAATAAACAAATGACTGAACAATGGGCCCTCGAGAAATCTTTGTC GGAATTTGGCCCAACTAGCCACCACGCAACCGAGCACTATATAATAGCTA CCGCCTACCATCCGCCTCCAGTCCCCCGCATCACTCGATTCCCACTCCGC TCTCCACCGAAATCCCCAAACCCTCGCCGGCGTCGACCATGGCCAGGCGG GCGCCGTTCACCAATCTGGACCCCGCGACGGCGGCCGACTTGCAGAGCAA GGGCTTTGACCCGCGCGAGCTGGACCAAGCCACCGAGAACCTGTTTGCGT ACATCTGCATCAAGCTCATCCCCGACTTCCCCTTCCCCGCCACCGAGCGG CTCGCCGCCCTCCCCTCCCCCGACGGCGTCGACCGCATCAGCCGCCTCCC GCGCGCGTTCCTGCGCAACATCCTCTCCCGCCTCCCGGTCACGGACGCCG CGCGCACCGCCGTGCTCTCCTCCCGCTGGCGCACCATCTGGCTCTCCGCG CCGCCCGTCCTGGTCGACTCCTACCTCCGCCACGGCGACTACGTCTGGCC CCCCACGCCGGCCAACTCGCCCGCCATCACCGCCGTCGTCTCCCGCATCC TCGAGGCGCACCCGGGGCCATTCCGCCGCGTCCACCTCGTCTGCAGCCAC ATGGACGCGTACCGTCCCCACCTCGCGCGCTGGCTCCAGCTCCTCGCCGC CAAGGGCGTCCAAGACCTCGTCCTCGTAAACCGCCCCTGGCCGTGCGACG TGCTCCTCCCCGACGCGCTCTTCACCGTCAACACCCTCGTCCGCCTCTAC ATCGGCCTCTGGAAGTTACCGGACACGGCCCGCCTGGGAAGCTACCGGAC TTTTCCCCACCTCCGCGAGCTTGGCTTCTGCAACGTCGTCATGGAGCAGG GGGACATCGACGCCATCGTCGCCAGGTGTCCCGTCCTGGAGGTCCTGAGC ATCCAGGGAGGGAACAAGGGGCTGCGTCTCCGCGTCGTCAGCCAGAGCCT GCGGTGCGTGCAAATCTGCAGTTCTCTTGTGGAGGACATCGCCGTGGCCA AGGCTCCATGCCTCGAGCGGCTCATCCTGCATGGCTGCCGGGACATGGCT GGTGGCGTCTGTACCAAGGTCAGGATTCTTGATGCCCCCAAGCTGCACGC CTTCGGATTCTTGGAGCCAGCGAATCATGTCCTTAAGATCGGAGACACCA TCATACGGGTAAATATCCTCTGTCTCCTGTCTATCCAGTTGTCCATGAGT TCAAATGTGTGATCTTTGGTCCTATAAATTGGTTGAATTTCAGGCCAGCA TGAAGGAGAGCACAACCGCAATTCTAACAACCGTGAAGATCCTCAGCTTA AATGTGCGTTTCGGAATCAGGAGTGAGGCAGAGATGCTGCCCGTGTTCCT CAAATGCTTTCCCAATGTGAAGAGACTGCATATTATGGTATTTGCCTTGA CACACCAATTCATTTTGTAGTTGCTTGCATTCATAGCAATACCTTGCATG TAGACCGTGTGTTCTGAACTTCTGATTGGCCACATATATAGATCTTTCAA GTCAATTGTTAGCAGAGTTCTTTACGGTGAATGCTGACAGTTATTGAAGC TAGTTTAAGTAATTTTACCACATGTTGAGGACATGATAATATCAGCTGCA TGATGACTGGACATACCTTCTCAATTATGCTATGTAATACCCTTGACCAA TTATTGCTTAAATGCAAAATAGAACCTACTCTCAGCTATCACGTCTCCTC TACACATAGACTAAAGTACACGACTAAATTCTGGGGGCTGCGTGCTCATC TGTTTATGTTGTGACATTTGGTAATAAAATTCTATGGTGGCACAGAGGCA CACTGTTTATTACATCAGTAAATTCACTTTTATTGCTTTGCTTATGCCCA GAATTTTTCTTGAACATGCATCTAATTTCTGCATTTGCATTTGAGCTGCG GCAAGCTAATAGCATTCCTGGTATAGCTATTGTGAGAGGCACGCATTACT TATTTCACGCCGATAAAATATACACATTAATAATATGGCACATTGTTGTC TATGGTAGAGGTCTGTGTGATACATCATAATAGCGTATCTATGCCACTAT ACTAGCTGCATCATTTCAGGAAAGTATCTCTCTGTTAAGTAATGTTCCAA GAAGTTGTCATGACTCCCTTCTAGCAATTCTTCATAAGGAACGTATCTGG CAAAATGTGGACTTAAGATCCTCCATTATAGAGTATAGACTGGGCTCTGC AGCCTCATTTCTTATTTCTTTATGTGTAGATATTAATCATGAGAAGCCAA ATAACACATGCACCACCTGAGTTCTTGTGTTTTCTGACTGTTAGACTACT TGGTATTCTGCTAGCTTCATCATGCATATGAAAGCATTGACTTGTCACTA CTCCCACTAATGTGATCTAGCCTTTAGTTATGCATGAGTATAATGTTGAG CACTGCCTGCAATTTATGAAAATTATCTGCCGACAAGGGCACCCTTTGTT CAGAAAAATGTACTCCCTCCGTCTCAAAATAGATGCCTTAGGTTTTTCAA AATTTAGATGAATCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTCATCCAAATTTT GACAACTCTAAGACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTACTTCGGTGTACT ATTACCTTTATAGTTTTTTTCTAAACATCTAGCAACTATGGACCAATGTA TCTGAGCTAATTTTATTATGTGGAGATTTTTTGTTCTGATTGGTTTGCAT AGATTTCTAGTCAATTATCATCAGAGGTGTTTATGATACTCCCTCCGATT CATATTAATGGCCTCAGCTTTGTCTAGATTCGTATGTATCTAGGCTAGAT GCATCCGTATCTAGACAAAGTTGAGGCCATTTATATGGACCGGAGGGAGT ATTTCTGTTTCCTTCTACTGTGAAAAGTGAATCCTGTATGTAGTTATGCA AGAGATTTTAGTAACTAGGACAAGAATATGGTGACTGTAATATCAGCTAT ATGAGTGGGCCTACTTAAGTACTTGACCAATTGTAAATATGTGACATTAT TGAGCAGTTGCAGGCTTGCAGCTTAAACGCCAAGCCGTGCCATTTATTCT CAACACACATAGACTATATTACACAATAAGAATTCTTGGTGCGCATGTTG ATCTGTTTATGTTAATGGTATTTTGGTAGAAAATTTCTTGTTCAGTATTT TATCATTCTGTATATTATGCCATTTCTTTCACATATCAGATCCAGCATTC ATAGGTATGCCTAAGTATATTGCACACTCTGGTCTTCATGATATATGTTG AGGCTTTCTTCACTCTCCAAATGTTCCCGCCTTCCTCAGATGGTCTGTTG ATCGATTTAATCTATTTCTTGCAGTCCGTAAAATGTAATCAGTCCACTGG TACGCTCAACCTCAAGTTCAAGGAGGTCCCCATCGAAAGTGCCATGTCGG GCATCTCAGAGATGTATTTCCATGAGTTCCGAGGGGATGAAGGCGAGGTT GCCTTCCTCAAGTCGCTCTTCAGGAGTGCAGATGTTCTGGAGAAAGCAGT AATTATGATGGCAAACCCAAGCTTCACACCGTTTTCAACAGAGGACACAA TTTCCAAACTGAGGAATGCTTCTGAGGTCAGTAGGGCCCCCTGCCGAGTG GTGGCTTTTGAGAGTAAAGGTCCTGAAGGAGGGAAACCGTGGAGTTTCCA GAAAGGTACCGATTTTACATCCGAGGACCCTTTCTTGGAAGCGGAGATCG TTGGCAAAGTTTAATGCCTTGGGAGTGTGGAGCAGTTGAAGTTTTTTTTG GCCGTGAACTATGAAGCACGCATCAGCTTCTTTCTCTAGTCGCACTGGCT TTGGTGGTCTTACATTGCAAACTTTGTGGCCTGGTTTCTGGCGCAAACCG GAAAATACTATGTGTTGGTATTTTGCTTGCTGTGTAACCTGTGTTATCAG TTTCACTAGGTTTGCTCCTTCAAATATTTGTTCCATCTGGCAACATGTCC CGTTCCTTGCAGATTCTGTATGTCTCATCTTGATTGATCTGACAAACCAA TTGTCATGAGAGCACTCCATGGTCTCAAGCATGCGATAGTGATCTTATAG TATTATCATTGAACTGCATGAACATATTATCTTGACCAACTATGACTTGT AGCACCAAGCCTTCCCAATTCGTTTGCAGACCTGCATACATGTCTAGAAG AGCTTTTGCATGTGAACTCTGAATCTTATACTACAGCAGTTCTCACAATC TAAGACTATGGGTTGCATGCTTATCTCTTCTATTTATCCTTTAGTACGAG GTTACATAATCTTTGTTTGCACAATGCTATGATGCCATTTCTTCGGATTT ATAACTGTACATTGCATTGCTTCTTACATGTTTCATATTTCATTCATGCA GCACTTTTTTCTTTCACCATCTGCTAGTACTACTTTCTTTGGTGCTGCAT GTAACTTTCTGCATCATTTGCCAGCTTCACATAGAAGTGGACCTTCCATC ATGAAAAGGTTCTGTCTAGAGTTGGAGTATTGCATGGACTGCATCTGCAA GAATAACCTGGTGAGAACACTGATGGCACTGACTGCACGAGCATGTAATC GAAGCCGCGGGTTGGATCATTTCCTCATATGTGTGCTGTTGTCTCCTCCG ACGCCAAGCGAGTTCATGGCCATGGCCGCTGCTGGTATTTATCTGAATAT GCAGATCGCGAATAAGGGCAACCAGTGCTCACATGTACTCTCTCATATAA CCTTCTAGGCAAGCTGAGATGGCCAAGTTTATTTACATACTTTTGAGTTC TATGAAAATTTGAAGCAACTGGACATTGGGCAAAAGAGGGAAATAACTGG ATAGAGAAGCTTGTGAACCTACATGAGCAGCTTCTATGTAATCCACCGCG TCTATTCCTAAGCTGAGTAATACTACTAGCAAGCAAAAGTCAGTTCATAG TTTTGTTGAGCTCCGTGTCTCAAGCAGGGCACAGAACGAAAATACAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.