Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA045448

[Submit comment/correction]

Sequence
AA045448
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045448
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGACTACGGCCTCCGATCAAAACTTGGCTCGCAACGCAACCACCCCCAT
CTACTAGAAAACTACATATACTTGAGCCCGTTCAACTCTAATCCACGAAT
TTGTACAATAATCACCACAGTACAGGTAGTCATCGCATATTAATATCACC
CGCACTTTTCCCTTCCTTCGTTTCCGCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCT
CCCACGGTCCTCCTGCCCCTCGCCGCAGCTAGGAGGAGCGCCGCAGCAGT
GCTTGGTATTTTCGCTCCGCCTCAGGCTTGGCTCCAGCGCCCACGCCTCG
CGTGGAACCACCGTCATCCCTTGGCGTCGTGGTGGTTCAGGGCAGTGGCG
GGCTCGGATCCCGGCGCGGGGTTATTCGGTAGAAGGCCCCGGAGGGGAAT
GCGGTTCCCAATTTGTAGTGGTTTCGCCACGGCAGGCTACGGTGAGTGTT
TCCCGGGCTGCGAATTGTGATTCGGGGATTTGGGACGGGTGCGCTCCCTG
TGGCTGGGGGTGGTTGGATTTGTTTCAGGGCAGGCGTTTGGAAATTTTCG
CTAGTTCTCTCCAGGTGGATTCGTGGAACCCTTTCGATTAACATTAGTAG
TGATCGCCTTGTGGAGCTTGCTCTGGCCCTTTTTATATTCTGCCTGATTT
TCTGTGTGGATTTGAAGGGTGCCAAGACCGCTTTGATCTTGTGGATTCCG
CCGTTCGGAGGACTAATCTTGTGGATTCCATCTCAGAATTGGTGTTTTTG
TGCTAAATTAATAGGATCGTTCCAACAGTTTGATTAACTGCGCTTGAGAG
CTGGCGATTTTAGGCGATAATTTCACGTTTTTATGTGCGAGCGTGCCATT
TCAGGTGCTTTTTTGAGCAACCCAATTCGTGAATTCCTGCTTGTGGCCTA
GCCCTCGCCATTCGCTGAAACCACTGGGTTAATTTAGTGTTCGATCGCTA
TATTTTCGGGAATTCTCTAGGTATGCTGTGGTAGAACTGTAGAACTGAGC
ATAATGTTGTACACAATTTATATTTGTGCTAATGATTTGAGTTGTTTCCA
GATTCTAACTGTTGCATATATTTGGCCAGTTTCTTGGGTGGGAAATAGTA
GATTTGAGAGACCATTTAAGTGTTTTTGCGCGTGTTTCTATTGTGAGTTT
CTGCTCTACTACATGGTAGGAGCTACATCTCTAGGTGCTTAATTTGGCAT
CTTTAAATGAACAGATTCATAAGTGCCCTGCTTAGTGATTTGACCGGTGT
GAACAGATCTGTCCTTAACTTTTTCCTGCGGCGTTTTTGTGAATTGTGAT
TGAGATGTCACTTTGCTGTTGGATTCCGGTAGCAAATAGGAGGGTTTGAC
TTGTTAGCACCCTACTACATGTACTTCTGGTCCTCGGAATTGGGTGGCTA
CAGTGTGCTGTTGTGTGAATAATTCAGTAAGATTGTGCCGTTAGGCATAT
AGAATGATCTGGAAAAGGAGCACAAAGTCGACACGACACCGCGCATGTTT
ACATTTGCATGTAGCATGTACTTTTGGATGTAATATTCGTTTTACATGAG
TTCACTGGAGATGAATCTTTTAATCCTGTCCACTTCACTTTAGTTAGGCA
TCTTTGTTTCGGTAGGCCACTTCTAGCTATAGTTTAGTAACGTGAAGTAT
ACAATAAAATGTTATAGCAGGATGAATACTCGTATATACTTTTTGTGTAC
ACAGGTCGAGTGGAGGCACATTTTATCGAGCTGAGGTTATAAATCATGGG
TGCCTTCAGCCAGTGAGTTCAGGATTTGTGGTTGATGACTTCAGGAACAT
GACAGGGAATGAGGAACTTGCTCCGAAACCTTTGTCATGCGGGGCAAGGT
TACGTAGGAGTCGTGATGCATCAGTAAGAGAAGAAGTGCCCATGAGGGAC
CCATTCTTGAAGCACAGAGTGAAGAAGTTTGATCTATCTAGCCTAGATTG
GATTGATCAGATTCCAGAATGCCCACTGTTTTGTCCATCTGTTGAGGAGT
TTGAGGATCCATTAGTTTATCTCAGCAAAATTGCTCCTGTTGCGGCAAAA
TATGGTATAGATTCTTGTCTATTTTCGTCTGTGATTATTTTCTTTGAGTA
AGGTCAAGGGCATGATAAAAATTGATTGTAATCGGGCAGAGAGCTAATGC
TTGCCAAATGTGATCTCATGAATTTGCGAGAAAATTACAAAAAACCACCA
CAATTCGGGTCACTATAACAGAAAACCACCACAATTCAGATTCGTGACAA
AAAACCACCAGAATTGGGGTACAATTTCTGTTATAGTGGTGTTTTTTTGC
CCCAATTGTGGTGGTTTTTACCCCAATTGTGGTGGTTTTTTGTCACGAAT
CTGAATTGTGGTGGTTTTCTGTTATAGTGACCCCAATTGTGGTGGTTTTT
TGTAATTTCCTCTGAATTTGCTCACAGTTCCCAACCATCCCTGCTACTTC
ATAGCCGTATTAAGTGCCAAATATTGAATTTTAGGGAACCACAAATATGG
TTTTAAAGTGTATAGACCTAAGTGATGCCAATGCACAAGTTTAGGAACAC
CTGGTGCAATTTACTCTAATATAAAAGGAAGCAATTGGAGTGGCTCTCCT
GTGGCATTCCCTTCACATTTTTAATCTTGTAGTATCGCATCCAAATCATG
CTGCACCTCCAGTTGAGCTTGTCTATGATCATAACGACTGCACATCTGAA
ATTTTTATTTTTGGGTTTTGTGCACATGCATGAAATAGACGAGCCACCCA
CATAAACCATTTGGCAGCAGCGAATGTCTCGGACCATATTGTTTGGCGAT
TGTGCTTTTTTCTTCAAATCACTGAGACAATCTGGCGATTTTGGCAGGTA
TATGCAAGATTGTTTCACCTGTATGTGCTTCTGTACCTGTTGGAACTGTA
CTTATGAAGGAAAAAGGTGGGCTGAAGTTTACTACCAGAGTGCAGCCTCT
CCGTCTCGCTGAATGGTCTGTGGATGACAAGTTTGCTTTCTTCATGAGTG
GAAGGTATGCTAGTCTACTAATAGTGCGTAACTGCTTCATAGTGATGCTT
GTCATGTATAACACATAACTTACGAGTTTGTATCAACAGAAAGTACACAT
TTCGAGATTTTGAGAAGATGGCAAATAAAGGATTTGTTCGAAGATACTCT
AGTGCTGCCTGCCTTCCACCAAGGTATATGGAAGAGGAATTTTGGCATGA
AATAGCATTTGGGAAGATGGAATCTGTTGAGTATGCATGCGATATTGATG
GTAGTGCTTTCTCTTCTTCTCCTAATGACCAACTTGGAAGAAGCAAATGG
AACTTAAAGGTACTTCATTTATGTACCGTATTTAGAGTTATTTGTGTGCC
AACCTCACTAGGTACATTTTCCTTGGCATTTCTGTATTTGAATTTGAGTA
AAATACACCACATGTCCTATAAGTATTCTGGGGGTGTCAAGTTAGTCCCA
GTTGTTTAGAAACGCACATTCCGGTCACTGACGGTCCTATGCTCGCTGGA
GCAGCTCTGACCAGCTGTTGACCGTTGCCACGTCAGATTAGGGGTTATTT
TGTGCCAAAACTCCCGCCCGAAACGGTTTGAGAAAGTTGCAAAAGAATCC
CTGTTATAATAGCTGGAGCACATTGCGAAAAATCACTTTGGAGGACAGGC
TCACTGGAGCCCGTTTTTTATTTTTTCAAAAAGCATCAAATATTTTCTAA
AAAAAACCTAGGCGTACCCAACAATATGAAATACATGTCTGCAAATTTTC
AATGGAAAATACCTTGTATTTCAGCGCAGAAAAAAAGACAAATATGACAA
TTTTTGGGAAAACGGAGGCCCATTCAAAATTGCACTGCTCACGCCCCAGA
TCTGAAAAATGCTGTTTTTTGCTGAGGCCAGAATACAAAATATTTTCACA
CGTTTTTTTGCATGCGCGTATTATAAATCAGTATCTACATCCTGGTATTT
TTTGTATTTTTTGAATCTTAAAATTTAAATTTTCAAAAAAAAACATAAGG
TCCTCCAGGGAGGACAGGCTCCAAATCGACGCTCTCCCCTTTCTTCTTTC
TCTCACGTATTCCCCTTCGCTCTGACAGAAAAAAGGGCAGAAACACAGCA
TTGTGGTTACACAAACATCAGAATTGACAGAAACATCATACATAAACCGA
TAGTCTGGAACAATCATCTCATAGTGTATGAGTTACAACTGAACTTGACG
ATGCACACCAATAGGTGCACTTAAATCTACAACAAAAGGTTCCATGCATG
AGGTTTAATTCAGTACACCTAGCAGGCATCATTCTCATCTATCTTTCGGC
CAAAATGAAACTAACTGTCCAAAAGGAAACTGCCCAAAAAGTTACAGTCC
AAGCTGGGTTCCATGCTACTTCTTTGCCTTCACAGCTCTCTTCTTGTTCT
GCTTAGTTGACTGCACATTGGCTGTTGTTTTTGTTGTCGCACCTGACTTC
GGCAAAGCAGATTTGCTGCCTGCGAGGAAGCTTGACCGAGGAATAGGCAT
CAACACTCGAGACTCCTGTGAAGCTTGTGACTACAAGACAACACAAAACA
CACTTAAGTTACTTTTCCTACAAACTTAAATGCATTAACAGGAAGAGCTT
GTAATGACTTACTTGGAGTATGAGTGCTTGTTGTTGTTGCACAGTTGATT
GGCTAGTGTTTTCTATTCCTTCATCAGTGCTTGCAGCGGGTTCCTACAAA
AAAGAGCATGAAGATATTGCAGCAACAATGTGATGTGGTTTGTGCTTGAT
CTTGTACGTGTGTAGCAACAATATTTCTCAGGTAGCTTTCTCTTAGCATG
AGCTTGTGGTTGTGCCTCATCACCTAGTGCTTGGCTGCTTGTCCTTGAAT
ACCTCTGTTTGGGCATTTCCTTTTGTTGTGCGCAGTTGAGTTGCACAGAC
TACAAAGTGACATAGTTCCATGTCTGCTCATATTAGTCCCATCTTGCAGC
TCAAGTGGATTTTTTCTCCTCTTCTTAGATGGCCTTCCAATGATTTTTTC
ATATAAAGGTTGTTTGACAGGAATTACATCCATCTTCTACCATGCTCTTT
TATCTCTACATGGCAGTATACCAGTGGCATAAGCTTTGCTTGAAGGCAGA
AATACTATAGGATTGACAGACCCTTGTTTCTGGCTTTATTCTCTCATGCC
TAAACACTAACATGCATGTCTGCAAGGAATGCCTCTTAATTGCCAACTCC
CACATTCACACTCATCTTTGTTGATATAAACAATGTATTTTCCTGTTAGT
CCACTCACTTGGAACACTTCTTTCAAGGATGGCATGACAATTCTTACCGT
ACTGCAGAGGAGGATCACCACGGGGTCGAACCAGTGAGGGCATCCTTGCG
GAGCACCCCGCAGAATGCTCGCTGCCGCCCCGCCGAATCTGCCGCCGCCG
TCCATCCACGTCACTACGCGGTCGATGAGTCAACCCACGTCGCCTCGCCT
CTGAGCTGCTCGATTTGGAGTAATGCCGCAAGGGGCAACTAAATGAGAGA
CAGGGACTCGAGGGGGTTCCTGCATAAATGTCTACGGTGTGGTTATGCCA
TAGTGGGCCCTACTGCATATGTGGCAACGGTCAACAGCTGGTCAGAGCTG
CTCCAGTGAGCATAGGACTGCCAGTGACACACTTATGGAACATTTAGGAC
CGGGAGTGTGTTTCTAAAGAACTGGGACTAAATTGAGACCCCAAGAATAC
TTATAGGACCTGTGGTGTATTTTACTCTTTGAATTTAGTAAAGTTATGCA
GTGGCTAAAATGTATGCTTTCTCTACATTCCCTTTTTTGTTGTATGGGTT
GGGTGTAGTGTATGGGGTTACACAGTTGAGCTCTTGCAATTATATGTTTA
TCAAGTTTACTTGTCCTAATGTACTAATATTTTGATCATTATACGATCTT
ATCTATTTATGTGCTACATTGCTTTATGATATGTTAAATATTACATTTGT
GCTCTGATCCAGAAACTTTCTCGGTTGTCCAAATCAATTCTACGTCTTCT
GAGAACAGCAATTCCAGTGAGTACACTGTATCAGTGAAATGTCCTGCTTT
ATTGTTTACTACTCACTGTTGTTTATTTCCTGGAATCTCCAGGGAGTAAC
TGACCCAATGCTGTATATCGGAATGCTCTTTAGTATGTTTGCCTGGCATG
TGGAAGACCATTACTTGTACAGGTGCATGATTAGTAGTTTTGTTATTTTC
CCACTTTCTACAATTTTTACCATGCTGCAGACTGAACCTTCTGTATATTC
TAATCTGATTTTATGATTTTGCAGCATTAACTATCATCATTGTGGGGCTC
CAAAAACATGGTATGCGGTTCCAGGAAAAGCTGCTCCAGATTTTGAGAAA
GTGGTACGTGAGCATGTATATGATCATAAAATTTTATCAGGTGAAAGGGA
AACTGCAGCATTTGATATCCTTTTGGAGAAGACTACAATGTTCCCTCCAA
ATATTCTACTGCATCATCATGTTCCAGTTTACAGAGCTATACAGAAACCT
GGAGAGTTTGTGATCACATTTCCTCGAGCATATCATTCAGGTTTTAGCCA
TGGTGAGGCTTCCTTGCAACTTTTGTGCTGTCAGTAATCTTCCAACTTCT
CTGGATATCTCTAGTGTCAATTTTATTGGATAATTTATGAACACTGGAAA
TGTTTATAATAATTTTCAGGTTTTAATTGTGGCGAGGCAGTGAACTTTGC
TGTTGGTGAATGGTTTCCTCTCGGAGCAATTGCTAGTCAACGTTATGCAC
TTCTAAATAGGATACCATTGCTGCCTTATGAGGAACTTCTTTGTAAAGAG
ACGACACTTCTTGCTCATGAATTTTCTATGTCTGGCTATAAAGATATGAC
AACATCAACTGGAGATACACACATTCAACAGTGTATGAAAGTCCCTTTTG
TGCAGTTGATGCGGCTCCAGCATCGTGTCCGTTGGTTACTTATGAAAATG
GGAGCTCGCACATGCTATAAAGCAGATATTGATGTCACAGTTCTTTGTAG
CATATGCAGACGTGACTGCTATGTAGCTCATGTTATGTGTAACTGCAGAG
TTGAGGCAATTTGCCTTTGTCATGGTAAGAATTTTTAACATTAAAGTGAT
ATCGACCTGCCCTGAAGCAACTTTTTCACTTGTTTGCGTTGTTTTGAAGA
GGAAGAGATTTGGAAGTGCCCTTGCAGCTGTGACCGTGCTGTATTTGTGA
GGAAAGACATCTTTGAGTTGGAGTCATTGTCAAAGAAATTCGAGGAGGAA
AATGGAATAATCAATGCATTCAGAAAGCAAATGTCTCACGGCTCTAACGC
ACATTCTTACTTCAACCACATTAATCATGATGCTGAATACTTCCCATACT
GCAAGATTCACATAGATGCATCTGCTGAAGTTCATAGCATTTCAGAGACA
CGTGTTCTTCCATATGATCTGAACAAGCCATATCCTGCTGTATCAACAAT
AACATTTTCTTTTGGACCCCATGATTATTCTACACAAAGTGATGTAAGGC
TCACTCCTGTGTTTCTTCTGTTGCTGGACTGTATTGGGGCAACTAAAATG
TGTTGATATTAGTTTGTATTTGCAGGAGTGCACTAGTTCTAACAAAAGAA
TCTTCTCTAGCTCTTGTCCCGAGATTTCATTTACTCCTGAAACTGCAAAC
ATTAATGCACACCCTTCGCGTGCACCTGATCAAACATGCTCTTCCGAAAA
ATTGGCTGCAGAAGATACTGATGATTTTGACTGTGAGGTATTTAGGGTGA
AGAGAAGGTCTGGCATAACTCCCGAGAGAAGGCGTACAGAAGTGACAACA
ATAACAAGTTGCACTAAGAATCAGGTATAGATATTTCTGTGACAGTGTCA
CAGTGCTGACTTATATTTCGTAATCATTCCTTATAAAATCAACATTTTTA
ATTCTGATCTAGCTTCACAGGATCTACTAAGGTCACTCCCTGCATGGATT
GGGCAATCAAAACTATAATCCTGTTTGTGTAATGGACCTAAGTGCATGGC
TTCAGTCCAGTATATACTAAAATGGTTATGAAACCTGAAAGAGTAAATTA
AGGATTTCCATTTCATAACTTATAATCATTTCAGAAATCCGAAGGGACAT
GATGCATCTGTTCATAATTTGTAACTAAAGCTATTGAGCGAACAAGTTCA
ATTCATGGATTGATTGCACTGATGAACAACGTTTTCCCAGAACATCCAAT
ATTAAGTTTTGCATTACAGCTTTGTTTACTAATGGCATCTCCTTGATCCC
AACTCCAGGTATTAAAACGGTTGAAGAAAATCCATACAGATGACAAACAT
CAGCAAAAGTTAGTGGAAGTATCCAGTGGCAAAGATGATCCTTTCCATGC
CCATTATTCTAGACATCGTCTTGACTTTATTTCTGGCAATGGAGATGACT
CAATAGCTTCAACCCAATTGAAGATGAGACATCACCTAGATGGAAATATT
TTGGAGGATGAAGTTGCTTCCAGACAAAATCCTAATGTCTGCACCTACCT
ACCTCCATCTGTAGAGCTTGGGCCAAAGCGCTTGAAAATTCTTGGCCCAT
CTTTTCCCAGCGGGAATAAAGCGTTGGAAATCTCTTATACATTCCAGGAC
AGTGACTTGGCTAGTCAGTATGATCAATGAAGTATAACTAGGCAATTGGT
GCTAACACCACGTATGTTAACAAACATCATTCTTAACTTCTGGAAGCTGA
GAACTCCTTTCTGCAGTATGGATGGTTCGGAAGCAATTCTTTCTGCAGGC
CTCCGATAGAGGCACTGTCGTGGCTGGATTCTTGATTTTATTGCCAGGTC
ACCTTTGTTGTAGGGAAACCTGAAAAGAGTAGGCAGACATTATCTGATGT
TCTTAAGTTGTACATCTCCACTTTCCTTTCTTCTAGACTTTCCACTGTGA
AGAGGTTAGTCCATAAATTTTACAGTTTCTTTCATTCTTTTTCGACAGAC
ACACATGTACCTAGAATGCTTATACAGATGGAAATATGAAATTGACGCTG
TACATCTCCTCAGGAGCTACTTGTCTTCAGTCTTTATGAAATCTCAGGTC
ATTAAGGTCATCATTTGTTTTGTCATTATTGTTTCCAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.