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GrainGenes Sequence Report: AA013318

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Sequence
AA013318
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013318
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGCTGCGCGTTAGAGTATGTCAAATGTCTAGACAAGTGGTTAAAAA
ACAAAGCCATTGTACTGACCGAGGAATATAAAAGTCCGAAGGGCACAACA
TCCCAGAAACAATTAAAAACTCTAAAAGAAACAAAAGATTCTCAATTTTA
TAAAATACACAGAAGCTTACTCCCCAAACAGTCAGTCACATCAGATTAGC
AGATCTTGAGATCGATTTGGATGGTCAACCCGCATTCTCAGACCTAGCCG
CGTTGCCGAAACAGCGCCTCATCAACCACTACTGCTCCGTTGACGGTGCC
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TTTTTTTGCATTGGATACATAGTATGTCTACATATGTATGATGTGTCATG
CAGCGGTTACTTACCACCAGAATACATAGAGCAGAATGTACTCTCAAACA
AGTTTGACATATTCAGCTTGGGTGTTGTTATCATAAAGGTAATGGCAGGA
CCTACGGGCCACTCCAAATGTGCTGAAATGTCTTCCCAGGAATTCATTGA
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TTGTGTGAGCCAGAGTCAGAGGCATATTATGAACAAGTAAAGACATGCAT
TGAAATAGCTTTAAGGTGTGTGGAGGTCGATCGCCGCAAAAGGCCAAGTA
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TGGTCACCCCTATCACAAAAGGCACATTTTTTTGCTTCTGCTATAACCGG
CCATAGGAGATTCTCCATAGATGGTCAGCCATCTGTTCCGAAACGTTTGA
AGATGCAGCCTGCATTACACAATGTTCCAGAACATGAATTACTTAGAGCT
TCCAATCCTAATGTGAACCCTGGGTTGGTACTACAGGAAACACATTCTGA
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TGGAGAAACCTGTAAAGATTGATTATGGTACTGATGGAAATGTGCCTACA
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TTACTTGGAAATAACCTGCTTTGCCTTGTGTATTTTTTCCCAAAATCACC
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CATAAATTACCAGGCGGTTGCTTTTCCAAACTTTAATTAGTTGCATCATA
AAGATTCTACTTATCTTCATGATAAGTGTTATCTGTTTTCATTGCATGCG
TTGTGTTTCTGTGCAAATACTCCTATTATACAATTTTCATTGTGAAACTT
GTACTGTAACCCTAATATTTATTTTCGAAGGAACCATTTTACATGTTTTA
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TCTGAATATGTAAATTTATGTCAGCTCTGCAAAGAAGAAAAACTTACTTT
TGTGCCCCTGCCGATATATTGTTCCCCTTGTGGTGCTCGGATAAAGAGAA
ATGCACCATACTATACTGTTGTTACTGGCAATACCCGCCACTTTTTCTGT
ATGCCCTGTTACAATGAGTCCCGTGGTGACAGCATTGAGGTTGAAGGACA
GAATTTTCTTAAGGCCCAATTGGAGAGAAAAAGAAATGATGAGGAAATCA
AAGAATGGGTTAGTTCTCATTTATGTTATGTGTAAAACTATAGTTTTAGT
TATATTTGTTGTGTACTAAATTTTTCTTAATGATGCATCCAACAGTGGGT
TCGGTGTGACATATGTGAATGCTGGCAGCATCAGATATGTGCTCTGTTTA
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CGTTCTTGGAGCAAGCGATCTACCAAGAACTGTGCTTAGCGATCATATAG
AAGAGCGGCTTTTTAAACGGCTTAAGCTGGAGAGACATGTTCGGGCATCT
CAGTCAGGACGTAGTTTTGACGAGGTTAGTGGAACCAGGTCTTGTTGGAA
GTGCATGTGTACTTTGCTTATTTTTCTCAACAGTAAGTGGGACCTTATGC
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CCATTTGGGTCGGGCCGCGGTCAGTATGGGTAGGGGGTCCGGCCTGTCCG
GCCAGCCGCGCCTAGCGGCGCGACCCATTTGTCCGCGCTTGGCCAGCGCT
GGCTAGGGATTCATATGTTTGCAAATTTTGTCATAAAATTAATTTTTGGA
TGCAAATAAACTAGACGTATGTGGCCACCTTCTCGGTCGCGCTCCTGGTT
GGCTTGCCGCCGCTTGGACGAGCCACCTCTGCGTGGCGGCAGGAGGTAGT
GGTCGTGCACCATCTGTGCAGCCGCCAGCACAATCTCGGTCTCACCATCG
GACTCCTCCTCGGAGGATGACTCCACAAATTCTTGTAGAAGAACTCCATT
GCCCTTTGGCTGCTGCCCATCTGCAAAGTATGCGGCCGTCAATGACGATG
GCAACTCCAAAAGCGGGCTGGACAAAACCTAAAAAGGACCGGCGAACGTA
CCTCAGGCAAATGATCGAGCAGGCTGTGCGCACGCAGAGGGTGTCGCGCG
CCCAGTCTAATGGCGGAGACCGAGGGCGACGAGACTGCCTGTGGAGCTGC
CAGACAACTCCGGCAACGCGCGTGGCCTGCGGTGGCGCTCGATATCGCGG
GGGGCGTCGGCGGCAGCGAGCGGTGGCGGTGGCGGCGGCAAAGACTGCTC
CTGCTCGAGACCGAGCGATATGGAGTGCGCGAGGGTTTGGGGGAGGAGAG
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CCCCGCGCTGTTCGAGCTGTCGAGGCCGACGCAACCGAGCCCCAGATTAG
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TGGGGCGCCGCGCACGCCGCGCGCGTCCGCGCGGGCAGTTTCGGACACGC
GCAGACCGTTTGGGTCGCCCCGGTGGAGATGCCCTAAGTGCCTACACACC
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ATATATTAACCATGATGAACTAGCAGTTTATCTAAACGTGTACTCCCACC
TGGTATGTAATCAGGTGTACCATGTTGGAGAGTAAACTAATCGAATGGCG
ATATATTGTATGAATTACCCATATATTGGTTGGAGGTGGTGCTTCATCTT
TAGATAAAGGCTTATATGAAAATATACCAAATTGTATTCCCTTTGAAGTT
TGCAGTGCAAACTTGTTTCAGCTGATTTTCACGACCCAATAAAAAATACA
ATAACAAAAATGAGGGATGACATGAAAAGTCTTTAACTATTGATTTCTTT
GGAGTAGTTTGAAGCATATTCATATATCTTAGTGTTTTATGTGCATGTCT
TTTTGAATTCTGATAATGTATTAAGAGAGACATGAACTTGGTTTACAGAA
GACACCATTCATTTTGGTATCGTTGTGTACTATTTTGGTAGGAATTTTCC
CTATATCACTTATAAAGTAACTGTTCCGTATTGTTAGGTTGCTGGGGCAG
AAGGTCTTGTGGTCAGAGTTGTTTCATCAATGGATAGGATGGTTGAAGTT
AAACCGCGTTTTTGGGAAAATTTTCAAGAAGATAATTACCCGACAGAGTT
TCCATACGAGTCCAAGGTAAGAGTTTGTACCTAAAGTAACAATTTGGTGA
CAAAAGACTTCAATTATCCATATTCCGTTCCTATGAATGTTTGGCAGGCT
CTTCTTTTGTTCCAGAAAATAGAAGGTGTAGAAGTGTGCTTATTTGGAAT
GTATGTTCAAGAATTTGGTTCTGAATGTGCTTATCCGAACCAACGTCGTG
TTTATTTGTCATACCTGGATTCTGTGAAATACTTCAGACCTGAGATCAAA
GCAGCCTCCGGAGAGGCCCTGAGTACATTCGTCTACCATGAAATTCTGGT
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GCCAGGTTGTCAGAAATTCCTGTATGGGATTATTGGATATGGCCATCCTC
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CAGATAGGATATCTTGAATATTGCAAGCAGCGTGGATTCACAAGCTGTTA
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ATCCAGAGATTCAGAAGACTGCAAAATCTGAAAAATTACGAGAGTGGTAA
GACCTTAGAATGACACGCGTGCTACCCTGCTTAAATTTAGCCCCTGGTTG
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TTCATTTCTGTGGGAGAGTGCAAGGCTAAAGTTACCGCTTCCCGTTTGCC
TTACTTCGATGGAGATTATTGGCCAGGAGCTGCTGAAGATATGATCAATC
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AAGGTCATTACAAAAAGAACTCATAAAGCTGCTGGCCACACTGATCTCAG
TGGGAATTCTTCCAACGATGCTATGCTGATGAAAAAGGTAAGCTGATTCA
TTTGTACTTGCTGTTCCGCTAAAGTGGTAATCATTACATCGAAATCCCCT
CTGTCTTTGTGAAAAAATAATTGATTGTTTCAGCTGGACGACATCTTCAC
ATGAATTTGATTTTTATGCATACAGCTCGGGGAAACTATTTATCCAATGA
AGGAAGATTTCATTATGGCCCATTTGCAGTATTCTTGCAGCCACTGCTGT
ATCTTTATGTCATCTGGAAAACGTTGGGTGTGTCATCAATGCAGAAGTTT
TTACATCTGTGACAAGTAAGTCAATTTCTTGAACCCTATGACAACTGTGT
TATACAGCCCAGCGTGCTTGATCTATATGTGATCAGGAGGAACCCCACCC
ACCCTGCCGTCTACCACTCCGGCAGCGGTGTCCACAGCCACTCACCGGAT
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ATCCATGACCCCTGCGGACAGCTCTGTCACAATGGCTATCACAATGTAAA
TGCATAAGTAGTGGAGCTTGGATCCCTGCGGTTTGAGCGTTTCGCCTCCG
TGGCTACTGTTGGTTTTTTTCCCAACACTCATGACCCCGCCTTGTTTGTC
CATAAGTCTACTCGTGGTCGGACTCTTCTTCTATATGTTGATGACATGAT
CATCACTGACGGTGACTCTGAGTATATTGCCTTTGTTAAGGCTCATCTTC
GTGAGTAGTTCTTTTTGTCTGATCTTGACCCTCTTTGCTACTTTCTCAGG
ATTGAAGTTTCTCCTAACTCTGATAGCTCTTACTGATGAGCGCACCGTTG
AGGCTCCTATGGAGCTCAGTGTTCACCTTAGTGCCTCTGATGGTGATCCC
GTGTCTGACCATCATGCTACCATCATCTGGATGGCAACCTTATCTATCTT
GTCACTTTTTAGATATCTCCTATGATGTTCATATTTCGTGTCAGTTCAGT
TCTGCTCCCACTTTGGTGCACTAGTCACCTTCTTCGCATTTTACGATTAA
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TAGGTCTAGGCCTAATTGGATGCTACATGGGCGAGTGATCCGTCGGATCG
CCGTTCACTCTCTACTTACTTCGCTTTTCTTGGCGGTTCTCTCATTTCCT
GAAAGACGAAGAAATAGACCGCGGTTTCCCTCAAGTGCAAAGGCTGAGTT
GCGAGCTATGGCTCTTTTAACGATAGAGGTGATTTGGTTACGCTGGTTAC
TGGAGGATTTTGGTGTTTTTGTTACTGCACCGACTCCCTTATTGTCAGAC
AGTACATATATTGTCAGCATTGTGCGTGACCCAATGAAGCATGAGCTCAC
CAAGAACATAGGTGTTGGTGCCTCCTTTGGCGCACTATTGTGCATGATTT
GGTTCTCCCTCTTCAATATGTGTCTTCTGAGTTACAATTGGCAGATATCC
CTGCGAAGGCCCAGACTAGTGCATGATGGTTTTTTTCTCTCCAAACTCGC
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CCCACACAATACATTCCAACATCACCAATCATGTGGCATAGGCGATGAGG
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ATAGGAAAAAACCATAATATACATGTATAGGTGGGAGGCCAAAGGCCAAT
ATGCAGGAGGCCAAAAGCCATCATAAATATAACTCTAACAAGCCCCCTCA
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ATGAAGCACCAAGACCAATATGCTTGGTGAGTTCTTGCTTCATAGGGTCA
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AGCTGATGTGCACCCCAACCCAGCTGTACTTGCGATATTGTAATGAAATT
AACTAGATGTGCTTCAAAAAGGTGATATACAAGCAATATCTTGTTGATCT
AAAATTAGCAGTATCTTTTGGATGAGTTATTTGTAAGTATATAGACAAAC
AAACCTTTAGGTGTTTTAAAGTTCTATTTGTGAAATTAGTATTTTCCTGT
TTGCAGGTGTTACGGTAGAGAGCAACAGATTGAAGAGAGTGAAAGGCATC
CGAGTAATAGTAAAGACACACATAAGCTCCATCCGGTAAATAACTAAAAC
TTGTTTTTTCTGTGTGAAAAAGAGGAATCACTAACATATAAGTTGATGTT
TGTCATTTAGGTTGACATTGTTGGGATACCTGCTGACGATACAAAGGACA
GAGATGATATCCTAGAGGGTGAGTTTTTTTACGACAGGGGGGCATTTCTG
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GCATTCGTCAATGATGATGTTGTACCACCTGCATAATCCTACTGCACCAG
CGTTTGTCACTACATGCAATGTCTGTGCTCGTGATATTGAAACTGGTCAA
GGCTGGCGGTGCGAAGTTTGTCCAGATTTTGATGTCTGCAATGGTTGTTA
CCAAAAAGGAGCAGTCAATCATCCTCACAAGTTGACAAACCATCCATCTC
CTGCAGACTGTGATGCCCAGAACAAGGAAGCCCGGCAAATGCGTGTTTCT
CAGGTACGCTAATTTGTTCCTGACCTGCCAATGTTGAACTCGTGAGTTTC
TCTTATTTATACAAAAAGGAGGTGCAAAAAAAGAGGTGCTTCAGTTTCTC
TTGACAGCTGTCTAATCTTAAATATTCTTTCTAAATCTATGGAAAATAAT
GGTATATTAGATGAGCTAGTATACATTCAGTTTCACTTGTTAGGACATAT
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TGGCCGGTTTGTGCCATTACTGTGTAGGTCAACTTTCAATCTTTCATCCA
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GTTATTTTTCAATACTTGTATATACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACT
CAACTTTGTCTAGATTCATATATATCTAGTTAAGTATCTAGTCTAGATTC
ATCCGTATCTAAACAAAGTTGAGTCAACTAATATGGATCGGAGGGAGTAG
TAGAGAGGCTCAATTAGGATTTTCCTGTTGCAGTTTTATGTTTGCAGTAA
TTAAGTATCACTTTTTGGTTTTTATTTTTATCATGGTTCTGCAGCTAAGG
AAAATGCTCGATCTTCTGGTACATGCCTCGACATGCCGCTCTGATAGCTG
CCAGTATCCTACCTGCCGTAAAGTGAAGGGGCTATTTCGGCATGGGATGC
AGTGCAAAACGCGTGCTTCAGGAGGGTGTGCCCTGTGCAAGAAAATGTGG
TACGTGCTTCAGCTCCATGCTCGAGCTTGCAGGGATTCAGGATGCACTGT
GCCGAGGTGCAGGTATGTTTGGTATATCTATCATTTGTCCTGCTACGTCC
ACCTCTCATGTCCTTATGCTGTTAAGCATATAGTTTTTTCAGTCCGTTGA
GTAACACCTGACCAGTGACCACCACTTGTGGAAACCATGCAGGGATCTCA
AAGAGCATATAAAAAGGTTGCAACAGCAGTCCGACTCCAGAAGAAGAGCT
GCTGTTAATGAAATGATGAGACAGAGATATTTTTGATCTTTGTCTAAGAT
CCAACAGCAGTCTGACTCCAGTGGTCTGAATTTTTCTCTATTCCAAACAA
ACCTTGTAGCTCCTTGCAAGACAAACTCAAATTATTTTACAAATTTATGT
CATTTTTCACAGGCATGCCAATTCTGTTTGCTGAGCTGTATGCAGTTTTT
GGATAACGATTGAATTCAAACAAACTCTTAAGTTTGATAACTTTGATCCG
ACGACGGACAACCAGCCTGCTGTGCTCGCTATTTATCCGTTCGCTGCACC
ATTGTGTGCGCCTCCTGACCCCTTGATGGCGATGGCAGCGCGGCGCCTCG
TCCCCTTCCAGCTCTGCCAGGCCGCTGTGCAACCTCTAGCTGCTAAGCAG
GACGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.