Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA009317

[Submit comment/correction]

Sequence	AA009317
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA009317
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TGAAGATTAGAGCAGGCACCGTAGAAAACCCCGTTGAAATCTGCAGGTAC ACACCTAGGCCTCCTTCGTTCTTTCCTCCCGTCGAAAAAGTTCAGCCTCC CCTTCCCGGCTTCCCCTCTCACCATCTTCCTCGCAGCTGCGCTTCTCCCC ACCACACCCCGCGAACACAACTCAGCAACAGCAGCAGCAGCAAAAAGCAC TAGCCGAGAGAGCACGCGCGCAAATTTCATTCGGGGACTTTGCTTCGATC CGACTAGGTCCAGTCGAGCGACCCGGTCGGTTTCGCGGCTGCGCCGGATC GGTCCAGAAAGGACGGCCGTCGCCGGCGGCGGATCGAGGCGCAGATTCTC TACGAGGAGCGGCTCAGGGGCTCGGATCCACGAGCTAGGTAGGAGGAGCT CATGAGGCGGCCTGCCACCTGTGGATCTCCTGGTTTCGTCGCGGCCTCCG GCTCGGGCCTCCGATAGGCGGCGGGGGACGCGTGGCGGACCGGGCGGGGG TGAGAAGGGAGATCTCGTGGGATTGGAGGGTGAGCGGAGATGGTGAGCGG CCACCTATTCCACTGCCGTAAGAACTCGTGGCCGCCGGAAGAGTACGTGG CGCGGACCGCACTGCAACTGGTGAGGCGAGCTCTCGTCTCGATCGCGAAG AAATTTTCTTCATCTGCTCCTTTGGTGCTTCGTTTGGGCTGTGGTGCTTG CGTAGCACCGGTATGATGTACTGATGTTATATGGGTACTTTTTGCAGTTG GACTTGGACGGCGGGGCGCCACCGGAGCAGGCATGGCGGCGGCGGCTGAA CAGTCACGCCAACATACTCAAGGAATTCAGCGTCACCTTCATGGAAGCAA TGAAGATGGTATGTTGCAGGGATTGAGTTCCATGCCTCTGGTTATTACAG TTACAGGTTTCTGTCACTAGTTCAATTTGCTGCCGCAGTTGCTAAGTTTT TGCCTTTGCGATGCCAAAATTTCAGATGACCCTTGGGGTGAGGCTCTGGT CATATGCACGCGAGGAGGCTTCCCATGGAAGGGTAACATTGTCTAGTCTT GCACATATTCATGTCAAACACCTATTTGTGTATCGGATTCGAAGGTTGTA TGGTCACAGAACGGTTTTTTTCCTTTTGTGCTTGCAGAAAGCTCCTATTG ATCCGTTCAGAAGAGAGAGCTGTAAGCCATCAGCTTCACAGGGCGTGCCG CTCGGAGGGATGGGGTATGATGCCTGGGTTGATGTTTCTGTCTTAATCTC TTTATCTGTGTTCACATCGTGGGTGCTTTAGATTTTGATATCAGTACACT GCTTTCCCAGGAGTGGTAGCATTTCAAGAGGATTCAGGGGAGAGTTCAAG AATTGGCACATCATTCCTGGTTTGTGTGATAATTCACCGGTCATGGAGAA CCAGTTTTCTGTAAGGCTTTCATCTTATCTTATTGTTGTCAGCTTAAGAA CCTTCAGTTTATTATTCCTCATGAAAGGAAAAGATCAAGTCGGATGACAA TGTTTGTAGTAGGACAGGAATGTATCTGAATGTATTTATTTTGAGTTTTG AGTGCCTTGGTTCTTACTTCAAGGAAATCTTATAATGCCCACTCACGATC AGTTTATCACCTTCTATTTGTTTCGCTAAATCTCATTCAAATAGCATTCT GTGTGGATTGCCTATTGAACTGAAAAAGTTACTTTCCCTTTTGCTGCTGT TAGCAAATTCTTGACAATCGGTGTTTATCATGTTTTTTTGACATGTCAGT ATAGACCAGCTACATGTGCTATTTTGTCAATACCCTTGCATTTTTACTCT CATAATTACGCTGTGAGGCTTGAGCTACCTAAATATCATGTTTTTGTTTT CAGATATTTGTATCACGAGATGGTGGGAATAAAAAATACTCATCGGTATT GGCCCCTGGACATCACGAAGGTTTGAAGTAAGTCCTTAGCCTCTTTTATT TAATTAGAGCTCACTACTTCTGAGCAAAGTATCATTATGTAGTCTTGTAT CTTGCAGTAGTCTCACTTCAGCATGTAAAATACTCATTTGCTATTTAAGA GTCAAGACTGAATATTTTAAATATTTAATTCAGTGTCTTCCAAAATCACC TTTTAGCTAAGCCACTATATACCATGTGTTCTACTGTGTCTTGTATCTAT TGTTCTGGTTTGCCTTGCCTTTTCCTGACGTGTCCTTACTCCTTTCGGAA TGTATTTGGGTAGATCAACTTGTACAATCTGCATCAGTTGGTTGCATTTA TTTTTCTATAATTTGTTATCCAAGAGCTGACAATATCACATAAAAATTGT AAATAAAATGTTCGAGTTTGTGGAGTTTAGTTATAAAATAATCATATGGG AGCAGAATCGCCTACTGCATCAAATGAACTTCCGCCAGTCTGTACAGTCC GATATTATGTTTATGTTATGCCATGGTCTGTGCAGAAGATAGTACTTTGT TAATGGATTGATGCCCTCCACGATTTCAGGAAATATGGGGACTCTGGAAT TTCATCATGGGACTGGAATTTGAGTGGTCAACATTCGACTTATCATGCAT TGTTCCCTAGGGCCTGGACTATTTATGATGGTATGGCACTATGGAGCTGT TGGCATGCGATTTGCATGTTGCAAATTTGTACCAAGAATTATCTTTTATT ATATATGGGAAGTTTGTTTACCAATTCACTGTGATACTTAGGTGCATTGT TGCCAAGCCAGCTTATGTGTTGATTGTAGAACGAATATATTCCCCAGCTT GCTATTATAGATTTGATAATAGCATTTCTCTATTCAATGAGAGACATGTT TCATACTGAAGATTATGAAATTTCCTATTATGCAGGTGAGCCAGATCCCG ACCTTAAAATCTCATGTCGCCAGATATCGCCATTTATTCCTCATGATTAC AAAGATAGTAGTCTTCCGACATCTGTATTTGTGTACACTGTAAGTTGATT TACTCAGTTTTTTGTGCTAAACTGGCAACTGCAGTAGATGCATTCTCATA GCTTCTTATTTTCTATTTCCCTTTGAATGTGTTATTTGGATAATGCAAAC TTACTACGACGGCGACTCCAGACAAGTTATTACATCAATAATAGAATTTT ATGTGGTCAGTTGTCCACATAAAATAGCACTTCCATCACAGGATCAATGT CAATGTTTCAGAACATAGTAGATGCAATATCTCCAATTACAGCTGTGGTT TGAAAGAAATTGGGATATCACACCACACTGAGTTAAATGTTTACGTCAGT GGTATTGGAGGAAATGTATTTTAGTCGAATTTCATGTATATTTTACACGT GGAGATGTTCTTAAACAGATTAACGTTTTCAATCGAGTATAGTTAATTGA TCATTCATTTTTTTGCTCTGTTGATTATAGCTGGTGAATACTGGGAAAGA CCGTGCAAAAGTAAGCCTGTTGATGACATGGGCGGTAAGATCAACTAAAG TTTCTGTAGAATTTATATCGTGTGAACATCAATACTTCATCACTATTATG GTTTCTTATAACTCGTGTTCTGTTTTAGCTTTATGGCCCAGATCACTTTT GATGTGTTCATACCAGTTTATTTAATCTGTTACCCCTGGTACTCAAAGTC ATAGCATCAACCTGGCAGAACTTTTTTTTAATATGTAAACTGGTTAGCAT CACCAGTAGTAACTGCCACCCCTTACATTCTGGCGTTTCTCTATAAATGT TACCCTAATATTCTGTTCCTGAGTTTCATGATCAGCAGTGCTCAATGTTC ATTTGTGTGGGAGACAGCTAATTTGTTGAGTTTGATGTAGAGACACAGAT AGATAACTGGTTTTATAGCTGCTACCACTAAATTAATATCAGGACTATTT GTTAAGTTGGGACTTTGTGGAAGTCAAATCTGACTGTACATTAAATTAAT CATGATGTACAAGAATGGATAGACAACTGTTTGACATAGCTTCTATCATT AAAAAAGAGAGTTAGAAAACTTCTCTGAAGATACAATTATGCAAAAGGCA GACCCCTGTTTACATTAAGTTATTATTTGTCCTTCAATCTTTACTAAGGT GTAGTTGGTGGTGGTTGTTCATTCCACATCCCCTCTTCCCATCTCCCCAC AGAAAGGAAGGCAAGAAAGAAAGGATTTTTTTTTGGCTTAGATGGTAGGG AAAAAAGGAAAAAGTTGTGATTCCTTTCTTTTTAGAAAGGAAAGAAGTAA TCAGCATAGTTTGGAAACGTGGATAAAAATACGAAGGTTTATTTCAGACC AAAAAACCCTGCAAAACATGCATATGCATACTCATGGTGGTCGAACAATT CTCCAGGCAGGCTAGGTACATGCATATAACACCTTGAAATGCCTCTACGC ATCTTTTTTTCCTGAAGCAACTCAAGCAAGATGCTAATATTTTTTTCTTT CCGTAGTAATGCTTGGTATTTAGTTAGTTTTCTATAGAATTGAGAATATG CAAAAATTTAGATGCATTCTTAACGACATTTCTGATCAAACACAGAATTC CATTGGAGGTTTTTCTCATAATTCAGGAGGCCACTTCAATGAGCCCTTCA TGTAAGTACAACTGCTGACTTTGTTTATGTCTATTAAACCTTCGATGACC ATTGGTACTCAGGCTTGATCTCATTATGTTATCAGTGGGGATGATGGAGT GTCAGGAGTGCTTCTGCATCACAAGTGAGTTTCAATCCTTCTGCTTTAAA TGATGACATCAGTTTTATGGATTTATTGCATTACGATGTCCATGTACAAG CTAACAAGCTGGTATTGCAGAACAGCAAAGGATAATCCTCCAGTTACATT TGCTATTGCTGCCTGCGAAACTCAGAATGTGAGCGTGACAGTCTTGCCTG TTTTTGGCCTCTCTGGAGAAAGGCATGTTTCAGCGAAGGAAATGTGGGAT ACAATGTCAAAGGTACTTTCTGATTCCTTATCTTTCAAGGACGCAGTCTA GGTGTTTTTTTCATACCAGTTGTCCCTTGACTTATTCTCTTATGAACAAT AGTACTCCCTCCGATCCTAAATAAGTGTCACGGTTTTGAACTAACTCTAG TTCAAAATGGCGACACTTATTTAGGATCGGAGGTAGTAGCATTTTTATGT TTCTGTATCAAGCTAATGATTTTTGTGTATTCTCTTCCATTTTTCGACAT TATTTATTCCACAGGATGGCCACTTCAGTCGGGAAAATTTCAGTGCTGGT TCTAGTATGCCTTCTTCAAGGGAGAAACTTTGTGCGGCTGTCACTGCATC TACTTGGGTGGAGCCACATGGTAGGTGTACTGTTGCGTTTGCTCTGGCTT GGTCCTCACCTAAAGTGAAGTTTCAGAAGGGGTGCACATACAGCAGGTCA GTGCTCTCCTGCTTCAGTAAAATGGAGAACACCTTCGTCCATCCTATGTA CATTGTGCTAGCCATTTATCTACAAATTCTACTTATGAAACAATACCAAC ATGGTCAAATGCTTTGTTGGAACAGCACATAAGGCTCTTTAGTTGTATGT TCACATTGGACACAACATGCCTTCCCTTTCTATTTTTATAGGGCTGCTTA GGAAATATATAGGATTCACTGGTGCAGTGGTACTCCCTCCATTTGGGTAT GTAAGTCCCCCTCGATTTTTGAGCCCAACTTTGACCACATATTTAACTAA CAAGATATAAATTATATGGTGAACCAAGAGCTAGCTTGGTGGCTTGACCT CAAGGTGGTGAGCTCGCCCACCTGGGTTTGAGTCGCAGGTGAAATGGGGT ACTATCTAGCGCGTATAATCCGCTGCTGGAGAGGTCTCATCTTCTACCTA ACAACGGACAGCCAAGGGAGGGATCTGTCCCCCTTTGGTCAACGCTTAAA TATAAATTATATGTCATAAAAAATATATATCATTAGATTCATATTTGAAA GAATTTTCCAACAATATTTTTTTTGAGAAACAAATAATATTATGTTAGTT AATTTTATGGTCAAAGTTAGGCTCAAACCTCGAGGGGACTACATATCCAA ACGAAGGAACTACCTAGCAAGTCAATTTGTTAGTTAAGTGTGTGCATTTA ACTGCTAATATGCTGTAATACTTGTCATGATGAGATAACGCATTTATGTT CTTTTATGTTGCAGGAGGTACACTGAATTTTATGGAACTTCTGAAAGATC GTCTATTCATTTGGTACATGATGCATTAACAAGTATGCCTTTTTTGTCAC TTGCTAGACATAATGAATCTTGTATCTGTTCAAGCGCAGTATAGCTAATT AACAGTGTGTTGATAATCTGGCCATGCATTGAGAATAGAACTGTTTTAGT GTTGATGTGATAGGTGCAATATCTGTCTTAGTGTTACTGAGTCGCTTATC AGTTATTTATTTATTGTTTTCTGATCAATGCTGAGTGTAGGATCGTTTCT TGCTTTTGCAGAATACAGACTTTGGGAAGAAGAGATCGAGAAGTGGCAAG ACCCCATACTCAAGGATGAAAAAATTCCAGAATGGTATAGCTTTTTCTCA TCCCTATATAGATATTATCACCGGTGACCTGGTGTAACTTCATAACTTGT TACTTATTTACAAAACGGGATCAAGTTCGAATATATTGTGTTATTTGCAA TTTGTCTGTGTCGGAGAAGGGCACATGTTCCCTTAATTCTTATGCTCAGC TGTAAAAGCACCTCTATCGCGACTCAGAGGGAGTAGGTCAACTGCCAGAT ATGTCTATCATTTCTCTGTTGTGCTGGCATCAGCATATGATCATTTCCAC CTTAGTTGGTTAACCTGGTAATGCATGTATTTCATTTTATGTAAGCTGCT TCCAGTTTATGTAATAGTCTGATCCCTTCCTGGTTGTCTTGACGCATAGG TTGAACATAAGAATATTATTTGACCATAGGTGCTCTATGCTTCTACGTCA CATTATGTATTTTTTGTTTCTCCTTTAAAAAAGGTTGTTAGCGTCTTAAC TTCCTCTTAAGCGAACAACTAAATCTTGACTAGTGAACGTCTTGTCTGCA GGTACAAGTTCACCCTTTTTAATGAACTTTACTTTCTCGTAGCTGGGGGC ACTGTTTGGACAGGTATTGCCGCATCATGGTTTTCTATGTTCGAATTGCC TCAGTTCTGGTTTAGTACCCACTCTGAGCCTTCCATGTGCTATCCATCCT TATATATGTGTTTTATTCCTCTTAATCATGTAGATGGTCAACCTCCAGCG ATCGAGGGAAACACAAGCCCTGCTTGTAACCAACAGAGACATTCAAAAAA GGGCACTAAATTGGAATCAGTTAAAGATAACCATGTCAAGCCAGCCACAG AGCAAGTCTCTACTGGAGATGACATGCCTAATGGTGAAGAGCGTAGTATA TCAATGTATGCTGCAGTTCATGGATCACAAATGCCTGCACAAACAAACGG ACTTAGGTTGCAAGAACCAATTCTTTACCTAATTTCCAAGGATGGCCCTG AAAATGTTGGTAAATTCTTGTACCTGGAGGGAGTGGAGTACATCATGTGG AATACATATGATGTGCATTTTTATGCTTCTTTTGCTCTCCTGGATTTGTT CCCCAAAATAGAGCTGAGCATTCAACGTGATTTTGCTGATGCTGTTCTGT ATGAAGATCGGCGGAGAGTCAAATTTTTGGCTGATGGTACCTCAGGAATC CGGAAAGCCAAAGGCGCTGTTCCTCATGACCTAGGAACACACGATCCATG GCATGAAATGAATGCCTACAACATACATGATACAAGCAAATGGAAAGATC TAAATCCCAAGTTTGTACTCCAGGTATATAGAGACTTTGCTGCCACTGGT GATATGTTATTTGGTAGAGATGTCTGGCCTGCAGTCTGTGCAGCGATGGA CTACATGGATCAGTTTGATCGTGACGGTGATGGTCTCATTGAGAATGATG GATTTCCTGATCAAACCTATGATGCTTGGACTGTTCATGGAATTAGCGCG TACTGTGGTGGCCTCTGGCTTGCTGCACTTCAAGCTGCAGCTACAATGGC TCATCGCCTTGGGGATCGTCCATACGCTGAAAAGTACAAGCTGAAGTTCA TGAAAGCTAAAACAGTGTACGAGGCAACGTTATGGAATGGGTCTTATTTC AACTATGACAGTGGTACAAGCAGCAATAGCCGATCCATTCAGGCTGATCA GCTTGCAGGACAGTGGTACGCTGCATCGTCAGGCCTGCCTCCAATTTTTG ATGAGCACAAAATAAGAAGTGCTCTGCAGAAAATATTTGAATTCAATGTT ATGAAGGTAAAAGGAGGACGGATGGGAGCTGTAAATGGTATGACTCCCAA GGGAAAGGTGGATGAGACATGCATGCAATCTCGGGAAATCTGGACGGGTG TTACATACGGTGTTGCAGCAAACATGCTTCTCCATGGAATGGAGCATCAA GGTTTTATCACTGCAGAAGGAATATTTCTAGCCGGGTGGTCAGAAGATGG ATATGGGTAAGCTCTGCCTTTCATTAGAAATCTATCTTGCGGTGATGCAA TAGTCTTGATTTAGCTTTGGAAATTTCATTTTAAGTACTACTCCCTCTGT TTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAATGTATCTAGACTGC TTTTAGTGTGTAGATTCACTCCAAAGCTGAGTGAACCTACATACTAAAAG AAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAA TGGAGGGAGTATCTCCAATCCATAATAAGCGTCGCAGTTTTGAACTAACC GCAGTTCAAAACAGCAACACTTATTATGGATTGGAGGGAGAACTAAATCT ATACCATGCAAATGAGCCCTGTCAGTTCAGCTAAGAGCAGAGATTATATA CTGTTTGTTTTTTCATTCTAAACTCCTTGCTTTATGCCGCTATCCGTAAT CAGTGTTGTGCCGATGGCTGGTACTTTGTAACCAGCAATTTGCAACACCT ATGTGCCTGCCAAAAGCATGTGTTGTTCTGAACGAAGATTATCTGCTATA GGTGACATGATTTTCATGTGGCACTGCAGGTATTGGTTCCAAACACCAGA AGGATGGACCACAGATGGGCATTACAGGTCTCTGATATACATGCGGCCTC TTGCTATTTGGGCAATGCAGTGGGCTTTGTCACCCCCAAAGGCGATTCTC GAGGCACCCAAGGTAAATCTGATGGACAGAATACACATATCCGCTCAAGC TGCAAGGGCAGCCAGTGAGATAAGTGTTCGGAAGATCGCGCCTGATAATC GATGTATCCCCAGCTCAACGTTCCAGTGTGAATGCTAACTACGGGCGAAG GTAACATGCAACGACTGATGAGTAACCTATGTTCTTTTCTCGGCTTTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.