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GrainGenes Sequence Report: AA008443

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Sequence
AA008443
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008443
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGAAGACTACTATTAGTGGATCGGACCGATCGGGGCGTGTCGTCGCCGC
CGCTCCCCCATACCTCCTCGTGACCTGCAGCGTGTTTGCGTCACCCCCTC
CTCCTCCTCCTCCCCTCTCAGGCTCTCCTGTCCCCATCGTATATATCCCG
AAACCCTCCAGGCGACGGCGGCGGTGCTATTTCCCCCGGAGAAATAGGTC
AGCGGCGGCGACTCGCGTCCTCCCCGGCCTCTGTCTGCACGCATCCTCGC
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GTCTGTTAGATCATGCAAGTACTGACCATTGTTTTTTCTGATGTAGGATT
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GAACACTTTCCCTCTTTATGTTCTGTTAGCTACTCCTACTACTAATATCT
CGCTTGAAGGAGTAAGTCTATCATCTTCAGTTCCATGCAACATTTTCTAC
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GTATGGTCTGCAACATATGTGATTATTTCTGGTTTACATTTCTTCACCAC
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ATTTCAAAAAACAGCAATAGGTCGATACGGTGAATATATATAGAAAAATA
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CCGGAATCTCACTCCCTGTCCAGCCCCAGAAATCAAAGCATCAGCACCAC
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ACAGAAGCAGTTACCTTGCTGCAGGCGACGGGCAGCAGCGGAGGCGACTC
CAGGTGACGGGGAGGGCTGACTCCAGGCGAAGGGGAGGGGCGACTCCAGG
CGGAGGCGGCATGATTCTGGGCTGAGGCGGCACAATTCCGGTCGGCGGTG
GCGCGATTCCGGGTGCTGCGACTCAGGGTGGCGGCTGAGCATCAATCCCC
TTCCGAGCCAATGAAACGAATGGAGAGAGAGGGCATTGGGGATTAGGTTA
GTATCGACTGGCTCGACCAGGCTCTCTCGTGTCACTGGCCGTATCGCCGC
CATCCCAGCTGCGTATCAGATTTGTTTTTTAATTCAGGAAAACTCGACGC
GCGAGCGATACATGTATCGGAGGTGTATCGATGTATCAGAGTATCGCTAG
GCGTTTTGTATGCGGACACGCCACAGTTTGCTGCTTTGTAGACTAGAATA
AGCTTTAAGCGCAACTAAGACATTAAGAGACATTTTGCTTTGAATGCTAC
AACTGTACCGAACCAAGTCCTCAAATTTCAACCATTGTCGGACAGCAAAA
ATGTAAGAATCCTTGAGGCCCCTTACCTTTGAGAAAATTGTATGTATAGG
TGTCTCTTTCTTTTGTATGACGGAATGTTTTGAGCTTTTACGTAGTTTTC
CGATAGTATATGGTCTGGTTTGAGATTATGTAGGGCGTACCGCCACTGGC
TGGCCACAGGGAGAATCAAATGACTGCTGTATCATTAAACATTGATGATC
AGTTTTTGACTGGGGAATTTAGGATCTTTTGGTTGATGCCTACCCATGCC
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TTGTCAGATTCATCATTAGGCAGTATAGCTTAACACATGTGCCTTTTAAA
AATAAGTGTAAAGAACACTTTTTTTCTTGTACACACGCTAAAACGCATGT
TGTAAGGAGAACATTAAGTGTAAAAAACACATTGAATCTCAGAGACCAGT
TATATTTTTTAGTCTTGTTGGGTGCAACTGCTTACTATCATATATGTGAT
GCATTTGACAGAGCTTGAAGGCAAATGTTTCTGGGGTAAAATACCAATTG
ATTTACTTGGTTCGTCTTTGGAAAATTGTGTAACTCTAAACTTGGGACAT
ACAGTGGAGTTGGCTTCTGCAGTTACCATGAGCCCAAGCTTCTTGGAGGT
ATATCAGTTGAACTTCTCCATAATTTTAAGTCTTGATGTTCTAATTATGT
GCTACAACTTTTATATATTATACCATATGTTTGACGAAGCACAGCCCTTT
GCAGCACTTGAAGCTTGTTTCTGCCTAACTAAATTACCTTAGCCACATGT
ACTTCAATATTGATGATCTACCCCATTTACTTAGTTCTCTAGAAGGCCAG
AGTGCTTGCCATTAATTAGCACATCCTGTTCCAAAAGTTCAGATGTCAAA
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TAAGATCAACACCAAGAGTAAATGTTGGAATCTGTAGTTTATGGAAGTTC
CAGTGATTGTGGAAATGTGTTCTCCACTTTTCCTTCAGTTCCTCAGATTT
GGCTATTTATATTATATTTTAATAGAAACTTTAAAATAAAGAGAAAGAAA
GAACATGGGTCTAGTGGCAACCAGCTGCCAGTTTTACTTCCATCTGTAGG
TTGACCTACTTGTCTTTCATTTGTTACATGCAGCCAAAACTTCTAGAGCA
GGACAGTTGCTTGACATTTTGCTCTCATAAGGTTGATGCTATGGTAAGAT
TATCCTTGCATTGTTTTTTAATCTAGTCACGGAGTAAGCACTGCTGATAT
AAGATGGCAATGCTTTATATTGCACAAGTTCTGTCAGTTACTTCCGTAGC
TTCTCTGAATTTGGTAATACTGTTGCAGGGTTCATATCAACTTCAAGTAG
CCATATCTGCGCAAGAGGCTGGTGCAAGAGACATGTCTGAATCTCCGTAT
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AAGGTTAGGCTACTATATATTAGCTCTATTTATCGTAAAAGAGTTGTTAA
TAATTGCATGGTTTCCTTAGGAGTTTTGTTAGAAAGTTTCTAATTTTTTA
CCAAGTCGGGTAGGTTGCCACACTTTGCAGTCAGCGCAGCTGAGGTTGCT
CCACGCTGAAGACATTTTGTGCGTGTATGCGTGCAGGTGGTGGGGTCATT
TTAGCTTATACATGTGATGGCATGTGCTAAATGTGGGAAAACCAACATGG
GTAGTTTAGGGTGTAAAATGTCCTGTTTCATAGTTGAGGGTGACATTGGA
TGTTTGTGATTGTTGACTGCATTGTTAGGTGTAGTACTGTAGTAGTTATA
GAATGTTGGAGTCTACCTTTTAAACTGGCTGATACCATTGATCAATATAG
TATTTTTCATGCTAAAATGACATCACTAGATTTCTCATCAAAAGCACTTC
TAGATTATTATTACTTTTAGTGTTTCTCCTGAAATATAATGGAACAAAAT
TATGGTAATTGATAAGGCATTATGTAAAATGTAAAAAAAGCATGTTGCAC
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AAGAGATGGCGTAGTGGGGTCAGCTGGGGACGTAGGCGTCCAAGTTTGCA
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AAAGATGTCACCTTGAGAGCGGAGGACGCGGAGCGAGTGAGTGCACAGAA
GAAAAATCAGGGTGATTAGAATTTCACATATGACCAAGGTAGGAGAAAAT
TGGATGGAGTTTATTAGAGGCTTAGTTAGTGTGCGACTAAAGCTGAATTT
GCAGGATCGCAACTAAATTACTAAGTGATTGGATGAAAATTAGATGAATG
GTTTAGGGTCTATTTGCTTGTTGCCTGAACCTGCCTTGCGAAAATTGGCG
TGCCAAGTATTTGGCGGAAGATTCTCTCGCCCTGGGATGGCAAATTATTT
GGCAACAGTTTGTGAAGGCAGCACCAAAAGCTCCATAGGGAGCCAAAAAG
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AAGTTTTCTTTCACAGGTTAAGAGCTGGCAATGTGCTTTTCAACTTCAAG
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ATTTGGTCTCTGCCTTTTCAGTTTCACTCACATTCGTTTGCTTCATGCAT
TGACTTGGGTAGCGTAAATTAACTAAATGTGTAAGATATTTAGTAATATC
ATTATGGTACTCTTTACAACATCAGCCATCTCCTTTGGACTAAATTATGC
GTTTATTTCTGTAATCAAGTTTTGTGTCATTAACATAAACTAAAAATTCA
GCATGTTTCATCAAACGAATGTTATTACTGAAATGCTTGTACATAAAACA
GAAAGCACACACCTTGATATGATTTGTAACATTCCAGTAGAATAGTGTAA
AGTTGAAATTGGAATCAAAGTGGCTATTGTTTTTTGAAAATGTTCAGTAT
GAAGACCAAAGAATCTGAATGTTGGTCTTAAAAGATTGCTGTGTGCTGTA
TTTGGTGGCACATTTTAAGGTGTATGTTAGCCCACGACCACATGTACTGA
TGTTACATACTGCTGACAAAGCGTTTGAAATCTATGGTACTTTGTTGTGA
ATACTGACAAGGTAAAAGATCCAGTTTAGAGGGTTTGAGATTGCCAATGT
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TTCTGTCTGCGTCGCGATTCATTGCTCTTCTTTTTATATATTTTTTCAAG
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TTACTGAAGATTTTGCTTGCCCCTTCTGCTTGGTGAAATGTGGTAGCTAC
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GCGATTCTGATGATAATAGGGTCTCGGGTGTCACTTGAACTCGTCGCATG
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CGATAATGAATGATAGATTTAGTCACTGCTAGACGGGTGAGGCCAAGTGT
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GAACTGGCTGAGTGTGAGGTTAGTGCTTGGGGCCTGTTGGTGCCTTGGTG
GGTGCGACTAGGGCTTGGGCTGGAAGCCCAGGTTTAACCGTGCAATGATG
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TTGTTTGACTTGACTCAACAGATTGAAATTTGTATAGTATAGTACCCAAC
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GACAGGTGAGAGCTGATACCACACATAACAAGAATTTCGTTGAGTTTTTA
GGTAATTAGATTCTCACATTCGCTCTTAGCTTTTTGTTTTGTTTTCTTGA
ATGCAGAGGCCATGGATGCACCCATGATGCATCTTACTAACAATCAACTC
ATGCTTCCCTGCACAGAATCTGCTTTTCATAGCGTTTTGCATAGTAACTC
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GTTATGTTCTTTGTTTCATCATCTTAACTGTGTTCCATTGCATCAGCTCG
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TCATTTTACGATTCTTTTTCCCTTTTCTTCGTTCCTAGCAACCATTTTCT
TGGTCCTAGACTAATTCATTCATGCATTTGGACAAAACTGGTTAAGGGTC
CGTTTGGTTCTGCTTTTCCAACCAGCTTCCGAGAAAATAATCTAAAAGCT
AACCAAAGGGATTATTTCCAAAGCTGATTCTGCAAAAGCAACTTGATTCC
TGTAGCTATATTTCCACAGCAGGCCTACCCCTGCTTCTACCGCGTTGCGT
TCTAAAGGTTCGTAGAAATTACCTACACTGCCACCAAAAAGTCGTACCGG
TTCGGCGTTATGTTTCCATCCTCATCCCGATCGAGAGCATCTTCCGAACG
TTATTTTTTCTTTCGTGCTCCTGCTCCCATGGCACCGCCCAGGCAGACCT
AGGGTTAGCTGTGCCCCATCCTCCGGCCGGCCGATGGCGGTCGGCGGCAC
ATTACCTGAAGCAGGGTGCCTCGCCGACTCCATTGTCTACCCCCGTACGT
GCTGCCGTCTCCGCTCTTTTTCCCGCACAAAGACCTTGTCCCTGAAATCC
CATCGCGTCACCAATCAGGAACAGCAGCGCCGCCGGCCGGACTGTCAAGG
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GCTGATCAGTTCGTGTATGCGATGGGCCCAATTGCGATTAACATGTAACA
TGTGCCTGCCATGGCTGATAGGTGGTTGTGCAAGTATCCTGCTGATCAGT
TCATGTGAAAGTATCCTGGTTAGAATACTAATGCATAAACTTTCAAGGTA
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GCCTTTTGGCTTGTTAAACTTGCACATTACAAGCATTTTACTAGATGGAT
GGAGTGAATATATCAGAACTGCCGAGCCATTTGTGCATCGACCATATGGT
ACAGTCTTGTGTAGATGGATGCACGCATTCCAAAAGGGGCACAAGGGACT
ACCACTTGCTGAACTTGCAAAGTAGGCTATTACGTAAAGTATATCTATTT
TGTAAAATATATGTTGTACAATCACTTAAAATATAAACAATCTCTTATGG
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CTCCAACCAAACAACTTTTAGCTTTTCCACAGTTCATAGCTCACAACAGC
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TACCACTCCAATTTCCACCGGTTGCACATATGCCATTACAAAAACAGAAC
ATGACGATATGCCACTCTAATTTCGTCATATCTCCACATATGCCGTTATG
TACAATACCAGGACGTATACAGTCTATATATGGATCAATTGGGTCAAATT
CTGCATCCCAGTTAGGCAAACTCAGGTGGATTGATTGGGTCAAATCCCGC
GTCCCCAGTTAAGCAACTCACGTGCGCTCCCTACATCCCCCGACCTGAGG
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TGGATGCAGGGAGGCAAGTGAGGGCGACGCAGCTGCCGTGCTCGAAGCGG
CCAGACGTGCGGCACTATGGCTTGATGAGGCGAGAGGTGTGTCGCTGCGG
TTAGACGCGGAGCCGCGCTTGACGTGGCGAGAGGTCCACCGCTGCTGCTT
GACCTGGAGGGGCGATCGACGCGGCTAGAGGTGTGCCGCTGCTGCAGCCC
ACGATGAAGACGACCCTGACCCTGAGTGCCCGTGCGAGTGATTCTATGCA
TTCCTGTCCAACCTTCAGCCCTGAACACACTGTTATTACGGTAAATACTG
CAATACACGCTGAAATACACATATTTTCTGTACCGTTATTCTCTTAAGTG
TAGAGAATGGTATATGTGGAGGTATTACAAAGTTTGTGGCATATCCTCAA
GTCAAGTTTTTGTAATGGCATATGTGCAACGGGTGGAATTGGGAGTGGCA
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TCTACCCCTTTGAAATATATACTTTAGGGAGCATGCTATTTGACTGGTTT
CTCATTGCATTGTATTTTTCTGTAGGCTTGTCTACAGTAAATCTTAATCC
TAATTTATTTTTTCTTCACCATTTCCTGCATGTATGTACAAGTTTAAGCA
AATATAAAGCACCAGCCCCCCCTACAAAACAGCAAGTGGGAACATTTATA
TAACTTCAAAAGAACAAAGACCTGGTTTAAATGAAAATGAGTAATCCATG
GGCTTTCTTTTGTTGTCTGGCCATATCTGCATAAAAATGTGAAAAATACA
CTAGTTAATTAAACAACATTACAAGGTCAAGTGATAGGAAAAAGATAATT
CAAATGTACTGACAGAATCATGAGTGTCAACCAAATCAGAGAAGTTCACT
AGTTCAAGATGATCCTTAACTTCTAGGTCTAGCGATCCATACTCTGAACC
ATATCTATAGTTTTGTTCATTCTTTGACGGGAAAAGCAAACCAAAATGAT
CCAGAGAATTAGCACCCTTCTGGCACTTTAGTACGGCATGACAGTAAAGT
TAACATCGAATTTTAAGAAAAGAAAAGGGACCGCACGGTAATCATGAGCC
ATGCAAAAAAGAGAGTAAAAGAATGTAACCTGCAAATTCATGAGAGCAGA
GTCCTCTAAACTGTTCATGGGTGATCCAACGCTCCATATGAAGGTGTGTG
TGAAGCACATCAAGACAGTCTGTGTGTCTGTGTCATCTCTTCAGAGCCTT
GTTAAGAATTCACATAGTACATCCTGAGCAGAAGAGAGGAACTCAAGATC
CTTGACACTGTATTGTTTGAACATAGGCCAGATGTGTTGCTCTGTATCCA
AAAAGCCACCGTCTATGTGACTCAGGATCATTGCTGAAATTCATATCAGA
CGGAAGCAGCATGCCGAACAACTGCTTGCCAGTCCACGGTGAAGCTGGAG
AGTTCATAGATTTAATTATTGATGGCATTGTGTCGTTGAGGGTGAATGGC
ATAATGTTTGAAGTCGCTTAAATTCAGTTTCCTTAAGTAAATCATCTGAG
CTTGTTAGCAGAGATGTGCAACAGCTAGAGAGTCATGTGTTAAGGACACC
AGACTTCGACCATCTTGCACATTCAATACTTGGTGGCTTAAGCTAACTAG
CTCAACTCTTGATCGTATAGACTGGGACATATCCATGCAAACAATCCCCA
TCAGAATTTATGCTTTTGAAGTTGTAAGAATTAACATGCTCAGGAACAGC
CAAGTTTGAAGCTAATCCATATATATGCGAACAAACCCCATCAGAAAGTT
TTATTCTTACTAATATCTCACTTCTACTGTCTAAAATTTTCAGATATTTC
TGTAGCACATGCTTCTGTTGATCCTGCGCACTCATTACATGGTAGCAATC
TTTCACCACCAACAGTACTACAGTTTGGGAAGACAAGAAAGCTATCTGCG
GAACGAGCTGATCCCAGAAAGTAGGCCTTCTATTTATATGCCGATATTTG
TTATGCATCATACAATTGGGTGTGTTAAACTAACTTCTTTATGCCCATAA
TATCTGGCAGCCGGCAACTCCTGCAGAAACGTCAGTTCTTTCACTCTCAC
AGGGCACAGGTGTGTGGATTACAAAAGCCGTTCATTGTTTGCATTGTATT
GTTCTATTTTTCATACATGTTTGCATCATGACCTATTGCAGTTTGGTGCA
TGCATTGTTATGGTTTAGTGATAATTACATGCTCTGTGCCACATCGAAAT
CCTGCTACCGAATTCTAAGCTTCCATTCCCTAGAATCTGATTACTCCAAG
TCTCCAATAGCATCTAATCAATCCATTAACATGATTGCGTAAACTCCTTT
TTTTTTTATTACCTTCCTTGTGTATGTATGAGACCGAATCTATTCTTTTT
CGAAATAGATTTCAAAAAAGAACTACTAATCCTTATTTTTTCGAGGATGC
TGATTTCTAGTAGAGCTCTAAAATGCCAAGTTCGGTTTCCTTAGAGGCTG
CTGCCAAATAGTACTTGTTTCCATTCCTTGTTAGCTCTTGAATTAAAATA
TAATGAGCTCGAAGAGCTTGCATATTTATTTTATACAAATACCAGACTAT
GCCAGTCTTGTAGATTTATTTTATACTCGTTTCCATTCCTCCGGTCTTCA
TTGTCTTGCTTAAATCTATCTTGGCTGCATTTACTTCTCCTGTAGCCGAT
GGCAGTGGAACAAGTTTTCTCAGATCGTGATAGTGAAGATGAAGTGGATG
ATGACATTGCCGACTTTGAAGATAGGCGGGTAAGATATTAATAACATTTT
TTCTTAGTGCCAATATTGTATATGTTGCCAACACTTGAGCTCAAGTCAGT
CTCTCTCTAACAAGTTGTTCCAGACATTCTCTAATTTTGAAGTTATTATC
TTTGCTGGGTCGCAGATGCTTGATGATTTTGTTGACGTCACAAAAGATGA
GAAGCTTATTATGCATATGTGGAACTCATTTGTTCGGAAACAAAGGTCAG
CATTATTCCAACTTCAAGCAATGTGATTTCACATTCAAAAGTCGAATCCA
GAATTAGAAATTTATTTCTCTGATCTCAGTTGTAGTCAACTTTTGGATTT
GAAAACTTGAAGTACCACACCTCAGTATTTTTTATGCATATATATTTATA
TATTCAAGACGTGTTTTGGGATATGTGTTAAGTTGGATATCTTTCCAGAC
ATAAGGGTGTCATTGTGTCTATCTTGCATGGCACACATTAATATTCACAA
TTCTTTTCACTTTGATGATTTTCAAAGGGCTGTTTTGTTATGGGCTGAGC
ATGTGTTTCTTCCATGTCTAGCATTTTGTTTTGTTTATCTGCATTTTTTT
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TGTGTTCTTGCCACAACAAGATCCAAATAGTTCAAAAACAAGATCGATTC
AATTTCATTTGACTGTATGGGCAACCATTATATAGAACATTTGTCCTAGG
GAGTAGATTGCATAATTGTCTATTTTGATGATATTTGCAGCATCCTATGT
GATTTTCGACCTGCATAGTAGATTGTGGGAGATGCAGAGATTTTGTTTAC
CGCTACTTGTTGAACAGTTCCCTTACTAAATGCTAAATTGCAGGGTCCTA
GCGGATGGTCATATTCCTTGGGCCTGCGAGGCATTTTCCCGGCTTCATGG
ACAGCAACTTGTACAGAACACCCCTCTACTATGGTGGGTTGCTGAGTTTT
AGTTCTTTTATAATTGCTTAACACTTTGTGGTTGCCTGCACTGCCTATGG
AGGCACCTTTTGTGCAGATCTTTCATGCACAGCTGTTTATTTGACATGCA
ATTTAATCCTTGGGTGAACAGGTGCTGGCGTTTTCTTATGATAAAACTCT
GGAACCACAGCCTACTAGATGCCCGTGCCATGAACACCTGCAACACAATT
CTTGAAGGCTACCAGAAGGAAAGCTTGGAACCCAAGAAAAATTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.