Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025646

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025646
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025646
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAAAAGGAAAAGGAAAAGGGTACGCACTAACCTCGGCCCGCGCCTCT CCTGCTAACTCACCCAGCGGCGCTGCCACCCCTCCCGCCGGCCAACGCTG CTACTCCCCCGTCTCCCGACTTCCGGCCCTGTCCCGACCTCTGCCCCTCC GTCCCCAGACTCATCCCGGAGACGATTCGGCTCGGCACTGCCATAAATGG TGATTACCCGCTTCTCTCACAGTGCATCTGTTTCCCCATTTCAGAATCTC CGCGGCGCACGTTTTGTCCTGCGTTTAGATCTTCTCATCCATGACAAGAA TTAATTAGGCAGATTATCTTGTGCATACCTCAGGTGGGGACGCAACGCTA GCTGCTGGCTTCCGGTGAAGACGGAGAACGATCCTGACTCCGCTTCGCAA ACATGGAGGATCCCATCACTGCTACGCTCGGCCCCATGGGTCGCCTCCTC CGGCGACTCAGTTCATTCGAGGCTTCCGGCCACCGTCTGCCACAGGGGGT CAGTGGGAATGGGATCCGGCTCCTCAAAGAAGGTCTAGAAGGATTATACA GCTACCTCAAGAATCTGCCGGTGGCAGACCTGGACCCTAGCTTCACGCCC AAATGGTGGATCAAGGAAGTCCGGGAACTTAGCTACGACACAGAGGACTT CTTTGATGAAGTTATGCAATCCGGTGCCAGTGATGATGTTGGCGGCGGCA GAAGCGCTTCTCTTAGTACCATCTTTGGAATTATCAGTAAGCCGAAGCAG CGCCTGCCACAGATTGCAGAAGATTTCTCATGTTTAATGGTTCGTGTGGA TGATGCGAGAGAGAGATGCCAAAGTTTCCAGTTTGCTCAGGAGACACCCA TCAAACCTGATTGTGGCCAAGGCGGTATCAGCCGCCGTCGCAGGCCTGAA CTGTCCCTCGACCTGCCGGTGTCGACTGCACCCATCTCTGATGTCCAGGT GGACACCGTCGGCCATAGCATAGTTGGTATTGAGGAACCCATGAAGAAGC TTGTGAGCTTGCTTGCTTTCCGCGATGACAACCAGAAGCAACTCAAGGTG GTACCTATATTGGGGTCTACAGGTATTGGGAAAACTACGTTTGTCAGAAC AATATATCGTCAGTACGGAGGGGAATTCCAGTGTCGGGCTTTTGTACGGG TGTCCCGAAATCCTGATATGAGAAGGATTCTCACGAGCATCCTCTCTCAA ATTAAGGCACCGGGGGATCACGCCTTCTCTGATTCACATGACCTTATTGA GCGTATCATAAAACATCTTCAAGGGAAAAGGTATTTATTGTTTTGAGAAC AAACTGATATGTTTACGTGTTTACGCCGGGGTTCTTAAATAGCTGGAAAT GCATAGGAAAAATAAGTCTTGCTTCCATGCACCTCCTTAGGCAAGTTTAC TGATCTCAAAGCAAAAAAAAAATTATTAATGAGAAAAGGGTAAATATTTA CATGTTCTTTGAATCCAGTTCCTCTATCTTATCATAAGTATGATTCCCCA TTTTCTTAGGCCAAACTATTAGCACCGTGCTTTATTAAGAACAGAATTGT TTCCATGGTTCTAGCGCCGGGCAGATGCATACCTTGATACACATCATGCT TTCATGAAGGAAAATCATGCTCAATATCTCTTCCGTTGACGAGGAGGACA TCTCGACTTGCTTGGGACAAAAAGCTTTGTGGTTGTCGTCGTTGTTGTTG ACGAGGATGACTTCACAACATGGCCCTTTGGATGCTTAAACACACGTGTG CCTCACGGAAAGGAAATCATTGCCGGCTGGGCACAATAAAATAAACGGAC TAGGGTACTTTCACATATTAGGATGCATTCACCAGGTTGATTTGATCCAT TTGTTAGTTTTATGAAAAGACATGAATTTAGAATAAATTGGGGAAACCCA AATCAGAAACACATTTTCCCTTTTCCATTAATAGCTTCTTTTTCCTTTTC ATATCATAAACTTAATTTGCAGGGAGGGGTGGGGGTACATGAGCAAAACT CATTTATGTTTTCTGTAGGATTTTCAACTTATTAAGCCACGTCATTGAAG TCAATGAAATGGGACAAATTAACAAAATGAATGTTTCCTTTATTTCGTAC ATTTTTCATATGGAAGAAAGGATGGATATAAAGAAATCCTAGGTGGTTAT TTGGACTGTGAGATTTGTTTATGTATTTTGCTAGAATGTGCTTTCATATT TGTTTTAGTAAATATAATTAGATCATAAGCCGATTAAAATCTGATACCTT GGACACTTTATTTGGCCAAACATGGATTGTAGTAACTTATCTTATTGCGG GTTTTATGAAAAACAGGTACAAATGTTTTTCATAAAATAACTCATAATTT ATCTTTTCTTTTTTGTTGTAAAGGTGTCCCTGTTATGAATATCTATGAGT CCTGTGACAGTCTTTTTGGATGCACGATTGCATCCTAAACTCATGGACCC ACCCTTTCGTATAATTACCTTATGCATTATCTTTGGAAAAATGCAAAAGT TAGGAGATAAGCCCAATGTTTATTTTCTTCTGCCAGAAAAAACACTATTT ACCCTTTTCTTAGTTTTATGTATTTTCATTCTTATATTTTCCTTCTAGAG ATAAATCATATTTATATTGATTTTGTTTGCTGAAATATTTTGTGTGTGTG TAAGCTTGACCAAATATACTCAAAATGAACAAATATGTCTTGCAGGTACT TAATTGTAGTTGATGATTTATGGACAGAATTAATATGGGATGTTATTAGC CGTGCTTTTCCTTATGGTGATTGTTACAGCAGAATACTAACGACCACTCA AATTGCGGATGTAGCATTGACATGTTCTGGTTATGAGTCAGAGTACATAT TTAAGATGGAACCTCTTAATGATGGTGAATCTCGAAAATTATTCTTCAGT TCTGTGTTTGGCTCTGAAGCTGAAGGTTGTTGCCTTAAGGACTTTGAAGC AGTTGCAGATGGGATTATAAGGAAATGTGGTGGTTTACCGTTATTAACTC TAAATATAGCAAGCCTCTTGCTACCAAACAAAACAAACCCTGCAATTCAG CAATGGGAGAAGGTTGAAAGTTCCCTACCGTCCACTTTGAGGACAAATCC TACTTCCCAAGGCATGAAAGATGTTCTAATCCTTATTTACAACGAGCTTC CACTTCATTTGAAGACATTCTTGCTGTACTTTAGTATGTATCCAGAGGGT TGCACGATCTGTAAGGATGATTTGCTGAAGCAATGGGTTGCTGAAAGTTT TTCTATTGGTGACATTGAGCATGGTTACTTTGACGAGCTTGTTAGAAGAG GTATGATTGAACCTGTACACACGAACTATCACGGGGAGGTGGTGTCATGC ACAGTTAACCACATGGTACTGGATCTTATCAGGTACAAATCCATGGAAGA TAATTTTGTCATTACTGTGAACTATCTTGAGTCAACTCTAGGGCTTCCTG ACAAGGTTCGTCGATTGTCCGTCCAGTTCGGAGGTACAAAAGGTGCAAAG ATACCAGAAAGCATCAGAATGTCCCAAGTTCGATCACTTCTGTTTTCTGG ATTCTCCAGATGTGTACCTTCCATTCCGTATTGTGGCCTTCTTCGAGTTC TGATTCTTCATATTTGGGCTGATCAAGAAAACACGAGCTTTGACCTCACT ACAATTGGTGAACTATTTCGACTGAGATATGTCAAGGTTGAATGTAATAG CACTGTCAATTTGCCAAACAGGATCAAAGGTTTACGACACTTGGAAACAC TGCAAGTAGATGGAAGACTATCTGCTGTTCCATCGGATATTGGTCATTTG GAGAAATTACGGCACCTCCGTCTTCGAAGCCAGTCTGATGTGAGGGACCT TGGCGGGCTGGTTAATCTCCACGATCTTCATCTCACCTGTTGTACAGTGC AGCCTGCTGATAATCTGGAGGACAACATGAAATACCTGGGCTCAGTTCTC GAGAAACTCAGCAACCTCAAATCTGTAATTCTGACATCTGGAAGCTCCTA TCACGTAAATACTTCAAGCATGAGTGTTTCGTGTAATGGCTTGGGCAGCG TGTCTCCTGCTTCGGCCCATCTTGAGAGACTTGAATTACTGCCACGGATT TGCATCTTTCCCAGCCTCCCGAGGTGGTTCGAAACACTTGCTAAACTCTG CAGTCTAAAGATAGCAGTTAGAGAGTTCTTGAACAGTGATGTTGATATCA TGAAAGGATTGCCTGCCCTAACTGCTCTCTCGCTGTATATCCAGACTACA CCCGCAGAGAGGATTGTCTTTGGCAGGGCGGGATTTTCAGCTCTCAAGTA CTTCAAGTTGAGGTGCAGGGAACCTTTGCTGAGATTTGAGGCTGGTGCAA TGCCTAATCTCCAGAAGCTCAAGCTAGTCTTCAATGCCCAGGAAGTACCG CAGATTGGCATCGCACGTATTTGCATCGAGCACTTAGCAGGGCTTAGAGA GATCTCCACAAAGATTGGGGGTTCAGGTGGTGCTTGCACACAGTCCGCCT TGTGGATTTCTAATGATCCAAAAAATCCGAAAATCAATGGTGAACTGGTG AACTGGAAGTTCTATGGGGCCGAAGATAGAATTATGGCAACACAAGAGAA TGCAGGTGGGATTGTAGAAGAACTTGGTGAGATCCTGGAGGAAAACACAG AATATGAGTACAAAGGGGGAGATGGGAACAGACAACCTGATAGTGGGTAT GAATTGTTGACCCCTTTAATTGATTGATTTTTTAACCCTTTTTAATCGTG TGACACTAAACGGGTGCTGTAATCAGGATTTCTACGTTACTGGAGTCCTC GCTCGCGTCACCTTGGGGACCCCCTGACCGGCGATATGGCTGGAGGCTCC TCTCTGCGTGTGCCAGGGCTAGGCCCTCCTCGAATGCTGCCTGTGAAGGC CATGATGGACTCCCCTGGTGGCACCACCTTGCGCCATGCAAAGCCGGTGA GCTCTCAGCTGCTATCGTCTAGGCTAATAATATCTTCATGGATCCCTGCC ATGTCTAGTCATCTCCTACCCTCGGCACCTTGTCACCGGCACACCGCGGC CCTGAGGCCAACTGCTTGTGGGGGAAACCATCTATTTTCAACAAATACAC TCATTTTGCCACAGTGCTGATGCAGATAATTATTTTATCTTTTGGGTCCG GATCATATCACCAGTTCACCACACGTAGGTAGCAACATTTGTGCTATGTT GCTTTCTATGCTGTTCAAAACTGTCTTTGTATACTCCTGGGGTACCGGTT TATCTGTTATCGCTAGAATTGTGTCACACAGATAGTAATGGCTAACTTTG TCACTCTCAGGGCTCATATCTATTTTCAGATAATAGCCAAATGAATATTG CTTTCTTCATCCAATCCTAATTGCTTTGCAAAATTTCCTTCAAAAAGTAG AATCGAGCACTCAAAACTTCCAATACATGATTATCAAGCTATGTTCCTGG GACAGATCAATGAAAAAAATCATCAGATAATACTCCCATTTAAGATAGAT GCCTTGATTTGCAGTTTTTATGTAAGTTTCATTCAGTACAATTTTATTAA AGATCTAATGTACAGGAATCTTCTCAAGGAGTAGTGGTAAAGATGGAAGT AGGCTTAGCGCCCACCACGTTCAATCATCTTCTGCTTCCAAGCCTCCAAG TGCAAAGACTGAATGCGAGATCTTGCAGTCAGCCAATGTTAAGGTCTTCA GTTATAATGATCTCAGGTTAGCTACAAGGAACTTCCGTCCTGACAGTGTG TTCGGCAAAGGAGGGTTTGGAACTGTCTACAAAGGATGGATTGATGAGCT TACATTGTCAGCTTGCAAGCCTGGCACTGGAATGGTTGTTGCTGTGAAAA GACTCAACCAGGAAGGTTTGCAAGGGCACCGAGAGTGGTTGGTGAGCATC ACTGGCATTCCTTTATTTGCTGTTATCATTGATGCCATGTTTGATCCATG TTTCTTTTAAGTTCATTTTGGTATACGCTACCTTTATGTGATGCCGTTGA TTTCATTAGTTATAACTTCAGATGTGTTAATCAAACACTTGGATATCTTT CTGACTTTGTTACACGTCCATTTATAGGCGGAAGTTAATTACCTTTGTCA ATTTTGCCATCCCAACCTTGTCAAGCTAATTGGGTACTGCTTGGAGAATG AGAACCGGCTGCTAGTGTATGAGTTCATGCCACGTGGGAGCTTGGAAAAT CATCTTTTCAGGAGTAAGTTGAACTAGTACTTGGTGCTCTACTAGTGTCC TAGGAATACTAATTTGTGCTGCATACGATATAGCTGAAAACTTTTCTATG TTTTAGTTGTAACTTGCTTTTATGAATCCTTTATGTAGGAGGCTCATACT TCCAACCCCTTTCATGGAACCTAAGAATGAAGGTTGCACTTGGAGCTGCA AAAGGACTAGCCTACCTTCATAGTGCAGAGGCTAAAGTTATTTATAGGGA TTTTAAGACATCCAATATTCTTCTTGACACAGTAAGTGAAACTGAATCGT CAATTCACCATAGTTAACCTCTATAATCATGTGATCTCTACTGAAAGGAG GAATTCATATATTGCTGCCCAGGACTATACTGCAAAACTCTCTGATTTTG GATTGGCAAAGGATGGTCCTGTTGGCGAGAAGAGTCATGTGTCTACAAGG GTCATGGGAACATATGGTTATGCAGCTCCAGAATATCTGTCAACAGGTAA CCTTTCTCTTGAAATTTTGGGTTTTTACGACACAGTATTGCACATTTGCT TGTCCAATATACATCAATTCCGTTTGAACCATTTAATGTTACTAGTGCAT TAGTTAATAGCAGGCAATCTAAGCTACAGACTCATTAAAATTGTGTAAGT TGTATTTTATTTTTACGTGCATCCCTTGCTTGGCAGATCATATCTATTGA ACGACTTCTTCTTGGTTGAAATTGCTACACATGCAATAGAGATGCATTCT GTGCAGGATCAGATATTGAATATCTGACGCTGCAGTGCCATTCCATGAGA TTTATGATTTATATAGACCTTTTCTTTGTCACCTATGTACAAAGGTGTGA AAACAAATTATAAGAGGGAATTTATTATGCTTATTTTAATTGCCTAAAAC CATAAGTTGTTCCATGATTTAACATCAACTGTTATAGTTTTGAATTCCTT TTGGTTAAAAAATCACATTAACATTTTATAAGTTTACCTAGAGCTCATAT TCAGCATGTGGTAAACATCCATTTAACAAGTCATTATTTTCAGGCCATCT TATGTTTTGAATCTTAATATACTTTGTTGCCATTCATCTTATACAGTATT TGATAACATTTATCTGAGAGTTTATATTCAGCATGTGATAAGCATCCATT CAACATTTTTCAGGCCATCTTACTGCAAAGAGCGACATCTACAGCTTTGG GGTAGTGCTTCTGGAGATGCTATCAGGGCGTCGCGCCATTGACAAGAACC GGCCCCAGGGAGAGCACAACCTTGTGGAATGGGCCCGGCCTTATCTCACA CACAAGCGCAAGATTTTCCGTGTCCTGGATACCAGGCTAGAAGGGCAGTA CTCCCTCAGCGGGGCGCAGACCATCGCCGCCCTTGCTGTCGAGTGCCTGA ACTTCGAAGCAAAGACTAGGCCGTCCATGGACGCCGTTGTCTCTATTCTT GAAGGGATTCAGGACTCCAGCGAGGCCAGGAAACCGGCAGCAGAGAGGCA TCAGGACCCCAAGGGTGCTGGGAAAAAGATGACCAGCGCGAGTGTTGGCA GGGACAGCGACAAACCTCGCCGGAAAAGCTCGAATGACCTTCGGAAGGAG GCAGGTCGTGATCCAAAGCCGTCGGTGCTTCACTCAACGTAGCAGACATG GAGTTTGGCCCGGTAGCTAGCTAGGGTGGTAGTTTGTAGATGTCCTGTGT ATATTCCTGGGGATCATCTGCTCAACTTTAGTTAACTGGGTGGATTTGCG TGTCAGTAAACTCGTGGCATGAAAGTCAAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.